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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0362300 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0362300.1 |
Related isoforms 5 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Calcium-transporting ATPase; TAIR: AT1G10130.1 endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9SY55|ECA3_ARATH Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type; TrEMBL-Plants: tr|K7KI34|K7KI34_SOYBN Calcium-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0362300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:83717205..83741511) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGCTTATTCCCAAGAAAAAATTTTGTAGGGGCTTAAACCAAAGGAACCCTATTTTATAGGGGCCTCCAACATATTTAAGC CAAAGTTTACTTGTTTGAGCAACAAATCTCCACTTTCGCCACTTTGTCCCTCACTTACGCCTCCGCGGGGAAGTAGAAAA CAAAAACCACCGCATCCGCAACTGGACCCAGATCGTAACCACCACTCACCGCCGTTCTACCCTCCCTGTGATTCCGAACC CTTCTCTTCCACAAACCCTTACTCCGGCGAGCTTCGGCGGCACGACACGTCAATCAGAGGTGCACTAAAATCTACTCCTC TCTACTCTTTTTGAATCTGCGATTCACTACTGGTTATGTATCTGTTTTTGCATGTTCATTTTGAGGTAGGGATTCGTGTA ATGGAAATAGAATAAGAAATGGATTCATGGATCCCCTAATTTGTAGTTACAGGAAGAAATAGCATTTGCTATATAAATTT AAGAGCTAAGAACATTTGATCGGTGCTATTAGATTTTTTTTTCTTAAGATTTCTAGTCATTAAAATTCCAAACGGTTATG AAGATTTATTGTTGACGAACATGTAAAACATCTGATGTTAACTTCAAGTAAGGATTGAACTAGAGAAAGAAATGCCATTG GCGCGATTATTCGATGTCAATGAGGATCGAGTGACTTTTTGTTTGCTTTTTTACTTGAATTAAAGGTTAGATAGCTTTGC TTGGGTGGAAATCGCGTCAATGATCTGACGGTTCTGTTTAGAAGTGTTGCATGTTCAATTATTTGAGAATTAAAAATGTT ATTCTTCGGCGAGCTATTGTGTGTAGTGTGTTGCTACATGGTTTTTGTTTAGTATAAATGATGTAAATGGCTGTGATAGA AATTTAATGTTTGAGGTCTAAGCTAATTGAACGGTACATCTAAACTAGCATAACATACTTGGGGGTGTTGAAAAATAGCG 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TTTTTTAGAATACCACTTATTTATGGTAAGCTATTTCAAGACAGAATTTTGTCTATATTGTACCAAAAGAATGCTTTTAT GTATTAAATTACTGAGAGTTATGTAATGCTTGAAAAATTTATTAGATTGATGGGAATACGATATTTCGCATAGCAGTAAA ATAATCATAATAGGATATATGTACAAGCTTAAATCTTGACTCAAACGAAAAAGTGATGTATCAGTGTATCACAATCACTG ATAATAATGAATTTCAGCCTTCATACAAAACTCTATAATTTGCCAAAAATGGCATAATGTCATGACTCATGACTGTTCTG TCATTAACAAAAACAATTCAGTCACCCTCTTATTTTTCCATTTAATTCCATTTTGACTGTACAGGTTAGTGAAGCAGTTG TTACAGGTTGGCTCTTCTTTCGTTATTTGGTAATTGGAGGTAACCACGAAATCTCAGTCTGATTTTTTTTCTTGACTAAT TGTTATTCATCCTATTCGTTTCTTTCTTTCTGTCAATAAGATTTCTTCATTGAAGAAGAAAATTGCTTTTTATGTATTTG TATAATGTTAGTTCAGTATGCTAGTTTCACCCGACAAGAGGTGGATTATGCCAATCCCTTGTGATTGTGCTGGGATCCAT TAGCTAAAGTGATGGTAGGAACTTAATTAGTTTGAGAAAGTTTAGAGAAAATGTTCTTGTTACAAGGGATGTGATTGATG CACCAGCATAAAGGACACAAGGATCCTAGGAGGGCTATTGAAATAGACCAACAGAAGAATATCAGCTGTGCAACAGAGGT AATGGAACTTGAAGACTCTCGTTGCTCTAACCACTTTTTAAAATCCATGTAGGGCTAGAGATGTCAAAGATTTATTTGAG GGCTCAGGTGTAGGTGGTGGAGCAGTCCTGACAACATTGGTTTGTCAGGGGGGAGCCCATGTATAATCCAAAACTTGTCA ATCGGATCGCCGGAGTGGTTGCAATGATCATACTTAGGATGGAGTTTATTACTTACTTCACCAGTTCACCCTAGCCTTTT GTTTGACTGACAAGTATAGACTATAGAGGTATTGGCAGGATTAGGGGTTAGAACAACATCAGAGGGTTGCTTGGCTGGAT CTGGAGCAAGGTGGGCAAGCTATGGACAGAGTAGGGACAATATGTAAACCCAAGATCTGATAATGGTAGATATAGTACAC CAAGGTAAACCATAAATTGCCAACAGCATAAAAAGAGTACTTCATGGTCATGTTTCTTTGCCAGGATCTCTCTACTAGAG GCAAATATTATAAAAATCATTCGGTTTTTTGCTGAACCTTCCCCAAATAAGCAGACCTAGGACCATCAAACTTAAAGGTG ATTGTCTTGAGAGACACTAAGTGTCTTTAGTTAGAAAAAAGGCCTGCTCCTAAATAGATTTGCAGATAAAATGAACGTGG AAAATTTGCGAAGTGAGGGATGAATGATTGACTTGATATCACTTCACAATCAAGCAGCAATTCTTTCCCACTTGAATCAG TCAGCTATATAAAAAAATGACAACTTTTATGGTAAGGTGGTCTATGTACCTTTGACTTTCAAGCCGCAACTTGATGTCTA AGGCCAAAGTATCATAGTTTCTTTCACCTGATTTGTTAGTAGAGACAGGAGACTGACATAATTGATGTCAATTGGTCCTC AGGCACAAAGATAACTTTACGGTGAGGTGGTATTTAAAGCCTTGGCTGTGTTAAGCCACAACTTCATGATAGAGAGCGAG GCCCAAGTATCATGGTTGCTTCCATCCAAACTTTCGGCGGAGAGAGAAGGGTGAGAAGCTCTGTGACAAAAATGACACTG ACAGTTTCTTGGTGGAGAAAAGGGTTGTGGGAAAGACAACATGGAGGGATGGGTGTTAGACTTAGACTATAGTCGAAACA TGGTGAACCACCAAAAATGTTCACCAGAGGACAGTGGATCCACCATGTATGCACGGGTCTTGTACTTTCCTACCTTTAGA TACAATTTAGATACTAGAGAGAGGGGGATATTTATATAATGCATGTGATAACTGATAAATACAAAGCTTTAATTTTCCTA GTGACTGTTTATTTGATACACTGTTCCTAGCCATTTGTGTAATGTTGTAAATAACCTAGTTTTTAAGTTGAGTTAGGCCA AGCCATAATTTAAAGATGTAATATGCTATGTTTAAGACATATAGTGGAAATAACTAGTCATTATTCTTCCCAAGATTGCT GGAACTTAGACTCATGTCTTAAATATTATTCGTCTTGCTTCATTTGTCTTTGTGTTTATATGATGTTAAATCGTTTATGT TGATGCAGCTTATGTTGGCCTTGCCACCGTTGCTGGTTTTATTTGGTGGTTTGTTTATTCTGATAGTGGCCCTAAACTAC CATATTCGGAATTGGTAAGATATTAGCCTATTCTCACTTATGGCGTGTGTCTGCGTCAACATTTGAGATTCTAAGAATGC ATGATATGTATTCTCTTTGTAGATGATAACTTCTGAGGAAATGTGACACAAAAAAAAATTGCTATCAGGAAATACCTTCA TATCTTCAAAAACTTCCGTTTCAGAAATCAACAATCTAAACTTTGACAACTTCAATTACAAAATAAAAATTAATCAAAAC TGGTGAAAATAGATATTAGCAGATGAATCTATTTCAGGTATTCTTTGTTTGATTTTTTATTATTTTCTCCTAGATGAATT TTGACACCTGCCCAACCAGGGAGACAACTTATCCATGCAGTATATTTGATGATCGACACCCATCGACTGTATCCATGACT GTGCTTGTCGTTGTTGAGATGTTCAATGCTTTGAACAATCTTAGTGAAAATCAATCTCTCCTGTAAGTAGTTTATTCAAT TTAATTTCTTTCAAATTTTTGTCCCTTGCTGGTTCTTGCAAATTAATGGGAGAATATCTGCATGACACTGTTAATTATCA AGTCAATCAACTGCTTTCACCCATCAACTTGCTTTTTGGATAGTTGATTATGATATGATATCAAGGCTTCTATGATCAAG TGGCCATAAGTTCAACACTTCATGCTTTTATTCTTCTAAATAAAAGTTATTTCTGCAAAATATAGGTGAACCTGTGCAGT GCTCTCATTTTTAATCTAAAGGGCTTTTGTGTGAAGGGACAGTAAATATAAAATCATTCAAGTGCCCCATAAACTTAAAT TTTGAGGATAGTTGGTTTATGACAGTTACTTAACTAGTATGATGTGAGGTGGGGAAAAGGTCGATGATAATAGTAAAAAG ATAAATGTAGTATGTCATGAGGCAGCATCTATGATTCTCTATATTGGAGTACGTGGAGGAAATTTTTCTAGGGGGGAGAT TATCTCATGTAAGTATGTAACCAACTGACACATAGGCATCATCCATGATTTACAATCTATAGGCTGACCGCTGACGTCAG TTATGGAAAATAAATGCTGAATCTTTCCTTATAAAAGAAAAATAATATGACATCAATGAATTCACGACAAATATGTCTTA GAGCTATTTACATTATTTATAACACTCCTCAAGATAATGGATATCTATGAAAATGCTCAGTTGATAAACCCTTAGTTAAT ACATCTTCCAGATGGTATTTAGAAGGAAAATATGTTCTTATCAAACCTCTATCCAATTTCTCCTTAATAATGTGCTAGTC TATCTCAAATCTCAATGCGTCATGTTGAAATGTATTAAAAGCAATGTTAACAGCTGATTAATTATCACAAAATAGTTTCA TGGAATCTTTATATTTTATCTTAAAGTCATGTAATACAATCCTCATTCTCAATAATTTACAGACTCCATGTGAAATAGCT CGAAATTCAAGTTCTGCACTTGTCTCAGAAACCATATATTGTTTCTTATTCCTCCATGTTACCAACTTTGCTGTAATAGT TTTTAATTTATCATTTGACAGTAGTCATTTCTCTGTTTCAGGGTCATCCCTCCCTGGAGTAACTTGTGGCTTGTTGGTTC TATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAATATTATATGTTCGCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAAGTACTTTTC TAAAGCAGTGATTCCCAATATATTTTCTTGAAGTCACAACTCTATCATTTGTGTCCTGTTCGCAAGCAATCAGTATTATT AAGATTACAATTTGTTTTGGCAGGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTTTCACTACCGGTA TGTGGTTTTGTTCATCTTTCCCCAGAATTTTATTTGGGCCTTTGTGCCCCATCCCTGTGCCAATATCTGGGTATATGATT TCCGTATGGGCATTATGGCAGGTGTATCATGTCTACAGTTTTGTAATAACATTTTTTGACTTCAAACATTTTAATGTATC ATTATGGCCTAAATTGATTGCTTAAAGTTTGCAATGCACCAGTAAGCACTATCTACATTTGATCCACTTGTAGAGAGTCC GATTATCATACTGTCTTAGAATAGTTAAATGATAACGTATGGAGCATTTGATGCACTAATTTGTTATGCTTGATCAGAAA TCAATGTTAGATTATATTTGGTTTGGTATCTGTTTGGCTTTCTTTTTTTGAATTAAAAAAAACTTGGGAGTCTCGATTTG GGGTAAGAAAAGTGCATTTTTTAGTTTCTGCATTTTTTTAGATTTCTTTTTTTTGTTCTCGAAAAAAAAATCTTTTATTC TTTTTAACTTGTAAAGGATTGCTTTTTGGTTTGGTAACCACATAAGAAGAATAAATCAATTAATTTTTTGAATGTAACAT ATTGAAGAATTCCGTCATTTTCTCTAATAATATCAAAGTACTTATAGTAAAAAATCGCTAATATGTCTTTAGCTCCCCAA AAAGCTACTTTTTAATTTTGATTATTGGGATCTCTCATTAGGAGAAGCTGTGTTTTCAACCATATAGGAGTCCTGCTTTT TTTCAAATTGTCTTTTAACCTGTTGTTTTATTATGCAGGTTATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGAAAC CCTATTGGTAATCTTTTATTCCATCATGTTAAATTTTCAGCTCAATCTATGATACTAAGGGCCTGTTTATTTGAAAAAAA ATATTTATTCTCATTTCTTGTTTTCCCAAATAATATACAAAAATATTATTTTATTTTCATTTTGTTTTTGTTTTTGAATA CTAGTTCAGGAAATAGTGAAAATACCAAAATGTTGTTTGACTTGTTTCTACCATTTTCTATATGAATCGTTGAAAATATT CACAAGAAAAACAAGTACACTTTTTAAAATATTGATGAAAACTAGATATAGAAATCAAATATTTTTTCTCAAACTGAATA GACTTAATTCTCTGTTTTGGGGGTTGGGGGTGGAGTGTTCAATGTGGCGTAAGATTGGTAGTCTCATTTTCAATTTGATA TTAACAATAATCATGGAAAAATATCAGTGGGTACATTTTCGACAGTGCTTTGACATGGGATATATACAGCATTAAGTGGT GTAAGCAACATCTCTATATTAAATATTTTCCTCATAGCTGATGTGAAAACTGTTCCTATGGTTTTAGGTTTGAGGTTCAG ATTATGGTTCAGGAGGTCTGATTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAAGATGTGGAGTACTATTTTAGCAAAT TCTGCAGTTGCAAATCAGATAGTTACAGTGGTATCCTTGATTGGATCTAAATCATCAACATATGCATGGAAGTCCAACAA TGACCAAAGGTACCTTAATAGATACTGTACAATATTTGTTTTATTTCATTGTAAAATTTATATTTCCTGAAAATGCTAGT GATGTAAAGCAACAAAATATAGGTATCTTTATTCTTTAGGCTGTTATTATCTTCAATTATCCATTTTTCTTCACCGTTTG TATTTGATCAATTTTGCTAGCATAATTACCCAATAGGCACGTATTTCCCCCTGTTCGGATAACGTTGTAGATTGTCATTT GTTTACCTTAAAAGAAGTGACGCAGAGATTTATGTAATAGGTTGCGTGGAACCCAAAAAAAGGGATC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACAACGCATTTGCTAGATCTATTACCGAGGTCCTTGATTTCTTCGGAGTGGACCCAACAAAGGGTCTCTCTGACAC TGAGGTGGTACAACATGCTAGACTTTATGGTAAAAACGTGCTGCCCGGAGATCAAAGAGCCCCGTTTTGGAAATTGGTTT TGAAACAATTTGATGATTTGCTTGTTAAGATACTAATTGTAGCTGCACTTGTATCATTCATTCTGGCGTTAATTAACGGA GAAACAGGGTTGATGGCATTTTTGGAGCCTTCTGTTATTCTGATGATACTGGCAGCAAATGCAGCTGTAGGAGTGATTAC AGAAACAAATGCTGAAAAAGCTCTTGAGGAGCTACGCGCCTATCAAGCTGATGTGGCAACTGTCTTGCGAAATGGTTGTT TTTCCATACTTCCTGCAACTGAACTTGTTCCTGGGGATATTGTGGAAGTTTCTGTGGGGGGCAAAATTCCTGCTGATATG AGGATGATTGAGATGCTAAGTAATCAAGTGCGTGTTGATCAGGCTATTCTTACAGGTGAGAGCAGCTCTGTGGAAAAAGA GCTCGAAACTACCACAACAACAAATGCTGTATACCAAGACAAAACAAACATTCTGTTCTCGGGAACAGTTATGGTTGCTG GTAGGGCAAGAGCTGTTGTGGTGGGAGTTGGTCCTAACACTGCCATGGGCAGCATACGTGACTCAATGTTGCGAACAGAG GATGAGGTGACACCATTGAAAAAGAAGCTGGATGAGTTTGGTACCTTTTTGGCCAAGGTTATTGCTGGAATATGTGTATT GGTATGGGTTGTAAATATTGGTCACTTCCGTGACCCTGCTCATGGTGGTTTCTTGCGTGGTGCAATTCATTATTTTAAGA TTGCAGTTGCTCTGGCAGTTGCAGCAATTCCCGAAGGGCTCCCTGCTGTTGTTACAACGTGTTTGTCTCTTGGAACAAAG CGTATGGCTAGGTTGAATGCCATTGTTCGCTCTTTGCCATCCGTTGAGACCTTGGGCTGTACCACCGTAATTTGCAGTGA CAAAACTGGGACTCTAACTACCAATATGATGTCAGTTGCGAAGATATGTGTGCTTGAATCTGCAAATCGTAGTCCTTTTG TTACTGAATACAGTGTCAGTGGAACGACATATGCACCTGAAGGCACAATCTTTGACACGACAGGGGTTCAGCTTGACCTT CCTGCTCAATTGCCATGTCTTCTTCACATGGCTATGTGTTCTGCTCTTTGCAATGAATCAACCCTGCAGTACCATCCTGA TAAAGGGAAGTATGAAAAAATTGGTGAGTCCACTGAAGTGGCACTACGAGTCTTGGCAGAAAAGGTTGGTCTCCCTGGTT TTAATTCTTTGCCATCAGCCTTGAATATGTTGAGCAAGCATGAACGTGCTTCTTACTGTAACCATTATTGGGAGGAACAA TTTAGAAAGTTAGATTATTTGGAATTTTCTCGAGATCGGAAAATGATGAGTGTTCTTTGCAGCCGGAACCAATTGCATGT TTTATTTTCTAAGGGTGCCCCAGAAAGTATAATATCTAGATGTTCAACCATTCTGTGCAATGACAATGGTTCCATTGTGC CACTTACTGCTGATATTCGAGCCGAGCTGGAGTCGAAGTTCCACAGGTTTGCTGGAAAAGAAACATTGAGATGCCTAGCT TTGGCCCTGAAATGGATGCCCTCAGTTCAACAAGCGCTGTCCTTTGATGATGAGAAAGATCTTACATTTATTGGACTGGT TGGGATGCTGGATCCACCAAGAGATGAAGTAAGAAATGCGATGCTTTCATGTATGACTGCTGGCATACGTGTTATAGTTG TCACTGGGGATAACAAGTCCACTGCTGAGTCACTTTGCCGCAAGATTGGAGCTTTTGACCATTTGATAGATTTTACTGAA CATTCTTACACTGCTTCTGAGTTTGAAGAACTTTCAGCAGTAGAACGAACTATAGCATTGCAACGAATGGCACTTTTTAC CAGGGTTGAACCTTCTCATAAAAGGATGCTGGTTGAAGCATTACAGCATCAGAATGAAGTGGTTGCAATGACGGGTGATG GAGTCAATGATGCACCTGCATTGAAGAAGGCAGATATAGGAATTGCTATGGGTTCAGGGACATCTGTTGCTAAGAGTGCA TCGGACATGGTCCTGGCTGATGACAACTTTGCTTCAATTGTTGCGGCTGTGGCAGAGGGAAGGGCTATATACAATAATAC AAAACAGTTCATTAGATATATGATTTCCTCCAATATTGGTGAAGTAGTGTGTATATTTGTGGCTGCCGTGCTTGGACTAC CTGATACTCTGGTCCCTGTCCAGTTGCTTTGGGTCAATTTGGTCACTGACGGATTGCCCGCTACTGCTATTGGCTTCAAT AAGCAAGACTCCGATGTGATGAAGACTAAACCTCGAAAGGTTAGTGAAGCAGTTGTTACAGGTTGGCTCTTCTTTCGTTA TTTGGTAATTGGAGCTTATGTTGGCCTTGCCACCGTTGCTGGTTTTATTTGGTGGTTTGTTTATTCTGATAGTGGCCCTA AACTACCATATTCGGAATTGATGAATTTTGACACCTGCCCAACCAGGGAGACAACTTATCCATGCAGTATATTTGATGAT CGACACCCATCGACTGTATCCATGACTGTGCTTGTCGTTGTTGAGATGTTCAATGCTTTGAACAATCTTAGTGAAAATCA ATCTCTCCTGGTCATCCCTCCCTGGAGTAACTTGTGGCTTGTTGGTTCTATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAA TATTATATGTTCGCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTT TCACTACCGGTTATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGAAACCCTATTGGTTTGAGGTTCAGATTATGGTT CAGGAGGTCTGATTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDNAFARSITEVLDFFGVDPTKGLSDTEVVQHARLYGKNVLPGDQRAPFWKLVLKQFDDLLVKILIVAALVSFILALING ETGLMAFLEPSVILMILAANAAVGVITETNAEKALEELRAYQADVATVLRNGCFSILPATELVPGDIVEVSVGGKIPADM RMIEMLSNQVRVDQAILTGESSSVEKELETTTTTNAVYQDKTNILFSGTVMVAGRARAVVVGVGPNTAMGSIRDSMLRTE DEVTPLKKKLDEFGTFLAKVIAGICVLVWVVNIGHFRDPAHGGFLRGAIHYFKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLSLGTK RMARLNAIVRSLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNMMSVAKICVLESANRSPFVTEYSVSGTTYAPEGTIFDTTGVQLDL PAQLPCLLHMAMCSALCNESTLQYHPDKGKYEKIGESTEVALRVLAEKVGLPGFNSLPSALNMLSKHERASYCNHYWEEQ FRKLDYLEFSRDRKMMSVLCSRNQLHVLFSKGAPESIISRCSTILCNDNGSIVPLTADIRAELESKFHRFAGKETLRCLA LALKWMPSVQQALSFDDEKDLTFIGLVGMLDPPRDEVRNAMLSCMTAGIRVIVVTGDNKSTAESLCRKIGAFDHLIDFTE HSYTASEFEELSAVERTIALQRMALFTRVEPSHKRMLVEALQHQNEVVAMTGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTSVAKSA SDMVLADDNFASIVAAVAEGRAIYNNTKQFIRYMISSNIGEVVCIFVAAVLGLPDTLVPVQLLWVNLVTDGLPATAIGFN KQDSDVMKTKPRKVSEAVVTGWLFFRYLVIGAYVGLATVAGFIWWFVYSDSGPKLPYSELMNFDTCPTRETTYPCSIFDD RHPSTVSMTVLVVVEMFNALNNLSENQSLLVIPPWSNLWLVGSIVITMLLHTLILYVRPLSVLFSVTPLSWADWMVVLYL SLPVIIIDEVLKFFSRNPIGLRFRLWFRRSDLLPKREVRDK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Phobius | 1 | 59 | 59 | - | – | |
SMART | 3 | 77 | 75 | 9.3E-16 | ||
SUPERFAMILY | 3 | 976 | 974 | 1.7E-129 | ||
CDD | 5 | 976 | 972 | 0.0 | – | |
Pfam | 8 | 72 | 65 | 2.2E-16 | ||
Gene3D | 9 | 59 | 51 | 1.5E-5 | – | |
PANTHER | 21 | 992 | 972 | 0.0 | – | |
PANTHER | 21 | 992 | 972 | 0.0 | – | |
TIGRFAM | 53 | 846 | 794 | 1.1E-293 | ||
Phobius | 60 | 78 | 19 | - | – | |
TMHMM | 60 | 79 | 20 | - | – | |
Gene3D | 60 | 127 | 68 | 6.3E-17 | – | |
Phobius | 79 | 83 | 5 | - | – | |
TMHMM | 84 | 106 | 23 | - | – | |
Phobius | 84 | 106 | 23 | - | – | |
TIGRFAM | 92 | 367 | 276 | 2.2E-39 | ||
Phobius | 107 | 255 | 149 | - | – | |
Coils | 111 | 131 | 21 | - | – | |
Pfam | 122 | 324 | 203 | 9.6E-49 | – | |
SUPERFAMILY | 124 | 235 | 112 | 3.14E-28 | ||
Gene3D | 128 | 231 | 104 | 3.5E-24 | – | |
PRINTS | 173 | 187 | 15 | 1.6E-41 | – | |
Gene3D | 239 | 976 | 738 | 0.0 | – | |
TMHMM | 253 | 275 | 23 | - | – | |
Phobius | 256 | 274 | 19 | - | – | |
Phobius | 275 | 293 | 19 | - | – | |
Phobius | 294 | 317 | 24 | - | – | |
TMHMM | 295 | 317 | 23 | - | – | |
Phobius | 318 | 749 | 432 | - | – | |
SFLD | 326 | 743 | 418 | 0.0 | – | |
SFLD | 326 | 743 | 418 | 0.0 | – | |
Gene3D | 327 | 729 | 403 | 0.0 | ||
PRINTS | 345 | 359 | 15 | 1.6E-41 | – | |
ProSitePatterns | 347 | 353 | 7 | - | ||
SUPERFAMILY | 352 | 589 | 238 | 2.09E-54 | ||
Gene3D | 355 | 593 | 239 | 0.0 | ||
Pfam | 415 | 524 | 110 | 6.6E-21 | – | |
SUPERFAMILY | 578 | 739 | 162 | 2.41E-44 | ||
Pfam | 582 | 705 | 124 | 7.4E-17 | – | |
PRINTS | 585 | 596 | 12 | 1.6E-41 | – | |
PRINTS | 607 | 617 | 11 | 1.6E-41 | – | |
TIGRFAM | 661 | 780 | 120 | 7.2E-37 | ||
PRINTS | 663 | 679 | 17 | 1.2E-13 | ||
PRINTS | 691 | 707 | 17 | 1.2E-13 | ||
PRINTS | 691 | 710 | 20 | 1.6E-41 | – | |
PRINTS | 714 | 726 | 13 | 1.6E-41 | – | |
PRINTS | 722 | 747 | 26 | 1.2E-13 | ||
Phobius | 750 | 771 | 22 | - | – | |
TMHMM | 750 | 772 | 23 | - | – | |
Phobius | 772 | 782 | 11 | - | – | |
Pfam | 776 | 974 | 199 | 8.7E-44 | ||
TMHMM | 777 | 799 | 23 | - | – | |
Phobius | 783 | 800 | 18 | - | – | |
Phobius | 801 | 820 | 20 | - | – | |
Phobius | 821 | 847 | 27 | - | – | |
TMHMM | 822 | 844 | 23 | - | – | |
Phobius | 848 | 885 | 38 | - | – | |
TMHMM | 886 | 903 | 18 | - | – | |
Phobius | 886 | 903 | 18 | - | – | |
Phobius | 904 | 914 | 11 | - | – | |
Phobius | 915 | 936 | 22 | - | – | |
TMHMM | 915 | 937 | 23 | - | – | |
Phobius | 937 | 955 | 19 | - | – | |
TMHMM | 952 | 974 | 23 | - | – | |
Phobius | 956 | 974 | 19 | - | – | |
Phobius | 975 | 1001 | 27 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
Molecular function | Calcium-transporting ATPase activity | Enables the transfer of a solute or solutes from one side of a membrane to the other according to the reaction: ATP + H2O + Ca2+(cis) = ADP + phosphate + Ca2+(trans). | ||
Biological process | Calcium ion transport | The directed movement of calcium (Ca) ions into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. | ||
Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0362300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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