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LotjaGi1g1v0362300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0362300
Transcript ID LotjaGi1g1v0362300.1
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Calcium-transporting ATPase; TAIR: AT1G10130.1 endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9SY55|ECA3_ARATH Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type; TrEMBL-Plants: tr|K7KI34|K7KI34_SOYBN Calcium-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0362300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:83717205..83741511) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GGCTTATTCCCAAGAAAAAATTTTGTAGGGGCTTAAACCAAAGGAACCCTATTTTATAGGGGCCTCCAACATATTTAAGC CAAAGTTTACTTGTTTGAGCAACAAATCTCCACTTTCGCCACTTTGTCCCTCACTTACGCCTCCGCGGGGAAGTAGAAAA CAAAAACCACCGCATCCGCAACTGGACCCAGATCGTAACCACCACTCACCGCCGTTCTACCCTCCCTGTGATTCCGAACC CTTCTCTTCCACAAACCCTTACTCCGGCGAGCTTCGGCGGCACGACACGTCAATCAGAGGTGCACTAAAATCTACTCCTC TCTACTCTTTTTGAATCTGCGATTCACTACTGGTTATGTATCTGTTTTTGCATGTTCATTTTGAGGTAGGGATTCGTGTA ATGGAAATAGAATAAGAAATGGATTCATGGATCCCCTAATTTGTAGTTACAGGAAGAAATAGCATTTGCTATATAAATTT AAGAGCTAAGAACATTTGATCGGTGCTATTAGATTTTTTTTTCTTAAGATTTCTAGTCATTAAAATTCCAAACGGTTATG AAGATTTATTGTTGACGAACATGTAAAACATCTGATGTTAACTTCAAGTAAGGATTGAACTAGAGAAAGAAATGCCATTG GCGCGATTATTCGATGTCAATGAGGATCGAGTGACTTTTTGTTTGCTTTTTTACTTGAATTAAAGGTTAGATAGCTTTGC TTGGGTGGAAATCGCGTCAATGATCTGACGGTTCTGTTTAGAAGTGTTGCATGTTCAATTATTTGAGAATTAAAAATGTT ATTCTTCGGCGAGCTATTGTGTGTAGTGTGTTGCTACATGGTTTTTGTTTAGTATAAATGATGTAAATGGCTGTGATAGA AATTTAATGTTTGAGGTCTAAGCTAATTGAACGGTACATCTAAACTAGCATAACATACTTGGGGGTGTTGAAAAATAGCG 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TTTTTTAGAATACCACTTATTTATGGTAAGCTATTTCAAGACAGAATTTTGTCTATATTGTACCAAAAGAATGCTTTTAT GTATTAAATTACTGAGAGTTATGTAATGCTTGAAAAATTTATTAGATTGATGGGAATACGATATTTCGCATAGCAGTAAA ATAATCATAATAGGATATATGTACAAGCTTAAATCTTGACTCAAACGAAAAAGTGATGTATCAGTGTATCACAATCACTG ATAATAATGAATTTCAGCCTTCATACAAAACTCTATAATTTGCCAAAAATGGCATAATGTCATGACTCATGACTGTTCTG TCATTAACAAAAACAATTCAGTCACCCTCTTATTTTTCCATTTAATTCCATTTTGACTGTACAGGTTAGTGAAGCAGTTG TTACAGGTTGGCTCTTCTTTCGTTATTTGGTAATTGGAGGTAACCACGAAATCTCAGTCTGATTTTTTTTCTTGACTAAT TGTTATTCATCCTATTCGTTTCTTTCTTTCTGTCAATAAGATTTCTTCATTGAAGAAGAAAATTGCTTTTTATGTATTTG TATAATGTTAGTTCAGTATGCTAGTTTCACCCGACAAGAGGTGGATTATGCCAATCCCTTGTGATTGTGCTGGGATCCAT TAGCTAAAGTGATGGTAGGAACTTAATTAGTTTGAGAAAGTTTAGAGAAAATGTTCTTGTTACAAGGGATGTGATTGATG CACCAGCATAAAGGACACAAGGATCCTAGGAGGGCTATTGAAATAGACCAACAGAAGAATATCAGCTGTGCAACAGAGGT AATGGAACTTGAAGACTCTCGTTGCTCTAACCACTTTTTAAAATCCATGTAGGGCTAGAGATGTCAAAGATTTATTTGAG GGCTCAGGTGTAGGTGGTGGAGCAGTCCTGACAACATTGGTTTGTCAGGGGGGAGCCCATGTATAATCCAAAACTTGTCA ATCGGATCGCCGGAGTGGTTGCAATGATCATACTTAGGATGGAGTTTATTACTTACTTCACCAGTTCACCCTAGCCTTTT GTTTGACTGACAAGTATAGACTATAGAGGTATTGGCAGGATTAGGGGTTAGAACAACATCAGAGGGTTGCTTGGCTGGAT CTGGAGCAAGGTGGGCAAGCTATGGACAGAGTAGGGACAATATGTAAACCCAAGATCTGATAATGGTAGATATAGTACAC CAAGGTAAACCATAAATTGCCAACAGCATAAAAAGAGTACTTCATGGTCATGTTTCTTTGCCAGGATCTCTCTACTAGAG GCAAATATTATAAAAATCATTCGGTTTTTTGCTGAACCTTCCCCAAATAAGCAGACCTAGGACCATCAAACTTAAAGGTG ATTGTCTTGAGAGACACTAAGTGTCTTTAGTTAGAAAAAAGGCCTGCTCCTAAATAGATTTGCAGATAAAATGAACGTGG AAAATTTGCGAAGTGAGGGATGAATGATTGACTTGATATCACTTCACAATCAAGCAGCAATTCTTTCCCACTTGAATCAG TCAGCTATATAAAAAAATGACAACTTTTATGGTAAGGTGGTCTATGTACCTTTGACTTTCAAGCCGCAACTTGATGTCTA AGGCCAAAGTATCATAGTTTCTTTCACCTGATTTGTTAGTAGAGACAGGAGACTGACATAATTGATGTCAATTGGTCCTC AGGCACAAAGATAACTTTACGGTGAGGTGGTATTTAAAGCCTTGGCTGTGTTAAGCCACAACTTCATGATAGAGAGCGAG GCCCAAGTATCATGGTTGCTTCCATCCAAACTTTCGGCGGAGAGAGAAGGGTGAGAAGCTCTGTGACAAAAATGACACTG ACAGTTTCTTGGTGGAGAAAAGGGTTGTGGGAAAGACAACATGGAGGGATGGGTGTTAGACTTAGACTATAGTCGAAACA TGGTGAACCACCAAAAATGTTCACCAGAGGACAGTGGATCCACCATGTATGCACGGGTCTTGTACTTTCCTACCTTTAGA TACAATTTAGATACTAGAGAGAGGGGGATATTTATATAATGCATGTGATAACTGATAAATACAAAGCTTTAATTTTCCTA GTGACTGTTTATTTGATACACTGTTCCTAGCCATTTGTGTAATGTTGTAAATAACCTAGTTTTTAAGTTGAGTTAGGCCA AGCCATAATTTAAAGATGTAATATGCTATGTTTAAGACATATAGTGGAAATAACTAGTCATTATTCTTCCCAAGATTGCT GGAACTTAGACTCATGTCTTAAATATTATTCGTCTTGCTTCATTTGTCTTTGTGTTTATATGATGTTAAATCGTTTATGT TGATGCAGCTTATGTTGGCCTTGCCACCGTTGCTGGTTTTATTTGGTGGTTTGTTTATTCTGATAGTGGCCCTAAACTAC CATATTCGGAATTGGTAAGATATTAGCCTATTCTCACTTATGGCGTGTGTCTGCGTCAACATTTGAGATTCTAAGAATGC ATGATATGTATTCTCTTTGTAGATGATAACTTCTGAGGAAATGTGACACAAAAAAAAATTGCTATCAGGAAATACCTTCA TATCTTCAAAAACTTCCGTTTCAGAAATCAACAATCTAAACTTTGACAACTTCAATTACAAAATAAAAATTAATCAAAAC TGGTGAAAATAGATATTAGCAGATGAATCTATTTCAGGTATTCTTTGTTTGATTTTTTATTATTTTCTCCTAGATGAATT TTGACACCTGCCCAACCAGGGAGACAACTTATCCATGCAGTATATTTGATGATCGACACCCATCGACTGTATCCATGACT GTGCTTGTCGTTGTTGAGATGTTCAATGCTTTGAACAATCTTAGTGAAAATCAATCTCTCCTGTAAGTAGTTTATTCAAT TTAATTTCTTTCAAATTTTTGTCCCTTGCTGGTTCTTGCAAATTAATGGGAGAATATCTGCATGACACTGTTAATTATCA AGTCAATCAACTGCTTTCACCCATCAACTTGCTTTTTGGATAGTTGATTATGATATGATATCAAGGCTTCTATGATCAAG TGGCCATAAGTTCAACACTTCATGCTTTTATTCTTCTAAATAAAAGTTATTTCTGCAAAATATAGGTGAACCTGTGCAGT GCTCTCATTTTTAATCTAAAGGGCTTTTGTGTGAAGGGACAGTAAATATAAAATCATTCAAGTGCCCCATAAACTTAAAT TTTGAGGATAGTTGGTTTATGACAGTTACTTAACTAGTATGATGTGAGGTGGGGAAAAGGTCGATGATAATAGTAAAAAG ATAAATGTAGTATGTCATGAGGCAGCATCTATGATTCTCTATATTGGAGTACGTGGAGGAAATTTTTCTAGGGGGGAGAT TATCTCATGTAAGTATGTAACCAACTGACACATAGGCATCATCCATGATTTACAATCTATAGGCTGACCGCTGACGTCAG TTATGGAAAATAAATGCTGAATCTTTCCTTATAAAAGAAAAATAATATGACATCAATGAATTCACGACAAATATGTCTTA GAGCTATTTACATTATTTATAACACTCCTCAAGATAATGGATATCTATGAAAATGCTCAGTTGATAAACCCTTAGTTAAT ACATCTTCCAGATGGTATTTAGAAGGAAAATATGTTCTTATCAAACCTCTATCCAATTTCTCCTTAATAATGTGCTAGTC TATCTCAAATCTCAATGCGTCATGTTGAAATGTATTAAAAGCAATGTTAACAGCTGATTAATTATCACAAAATAGTTTCA TGGAATCTTTATATTTTATCTTAAAGTCATGTAATACAATCCTCATTCTCAATAATTTACAGACTCCATGTGAAATAGCT CGAAATTCAAGTTCTGCACTTGTCTCAGAAACCATATATTGTTTCTTATTCCTCCATGTTACCAACTTTGCTGTAATAGT TTTTAATTTATCATTTGACAGTAGTCATTTCTCTGTTTCAGGGTCATCCCTCCCTGGAGTAACTTGTGGCTTGTTGGTTC TATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAATATTATATGTTCGCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAAGTACTTTTC TAAAGCAGTGATTCCCAATATATTTTCTTGAAGTCACAACTCTATCATTTGTGTCCTGTTCGCAAGCAATCAGTATTATT AAGATTACAATTTGTTTTGGCAGGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTTTCACTACCGGTA TGTGGTTTTGTTCATCTTTCCCCAGAATTTTATTTGGGCCTTTGTGCCCCATCCCTGTGCCAATATCTGGGTATATGATT TCCGTATGGGCATTATGGCAGGTGTATCATGTCTACAGTTTTGTAATAACATTTTTTGACTTCAAACATTTTAATGTATC ATTATGGCCTAAATTGATTGCTTAAAGTTTGCAATGCACCAGTAAGCACTATCTACATTTGATCCACTTGTAGAGAGTCC GATTATCATACTGTCTTAGAATAGTTAAATGATAACGTATGGAGCATTTGATGCACTAATTTGTTATGCTTGATCAGAAA TCAATGTTAGATTATATTTGGTTTGGTATCTGTTTGGCTTTCTTTTTTTGAATTAAAAAAAACTTGGGAGTCTCGATTTG GGGTAAGAAAAGTGCATTTTTTAGTTTCTGCATTTTTTTAGATTTCTTTTTTTTGTTCTCGAAAAAAAAATCTTTTATTC TTTTTAACTTGTAAAGGATTGCTTTTTGGTTTGGTAACCACATAAGAAGAATAAATCAATTAATTTTTTGAATGTAACAT ATTGAAGAATTCCGTCATTTTCTCTAATAATATCAAAGTACTTATAGTAAAAAATCGCTAATATGTCTTTAGCTCCCCAA AAAGCTACTTTTTAATTTTGATTATTGGGATCTCTCATTAGGAGAAGCTGTGTTTTCAACCATATAGGAGTCCTGCTTTT TTTCAAATTGTCTTTTAACCTGTTGTTTTATTATGCAGGTTATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGAAAC CCTATTGGTAATCTTTTATTCCATCATGTTAAATTTTCAGCTCAATCTATGATACTAAGGGCCTGTTTATTTGAAAAAAA ATATTTATTCTCATTTCTTGTTTTCCCAAATAATATACAAAAATATTATTTTATTTTCATTTTGTTTTTGTTTTTGAATA CTAGTTCAGGAAATAGTGAAAATACCAAAATGTTGTTTGACTTGTTTCTACCATTTTCTATATGAATCGTTGAAAATATT CACAAGAAAAACAAGTACACTTTTTAAAATATTGATGAAAACTAGATATAGAAATCAAATATTTTTTCTCAAACTGAATA GACTTAATTCTCTGTTTTGGGGGTTGGGGGTGGAGTGTTCAATGTGGCGTAAGATTGGTAGTCTCATTTTCAATTTGATA TTAACAATAATCATGGAAAAATATCAGTGGGTACATTTTCGACAGTGCTTTGACATGGGATATATACAGCATTAAGTGGT GTAAGCAACATCTCTATATTAAATATTTTCCTCATAGCTGATGTGAAAACTGTTCCTATGGTTTTAGGTTTGAGGTTCAG ATTATGGTTCAGGAGGTCTGATTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAAGATGTGGAGTACTATTTTAGCAAAT TCTGCAGTTGCAAATCAGATAGTTACAGTGGTATCCTTGATTGGATCTAAATCATCAACATATGCATGGAAGTCCAACAA TGACCAAAGGTACCTTAATAGATACTGTACAATATTTGTTTTATTTCATTGTAAAATTTATATTTCCTGAAAATGCTAGT GATGTAAAGCAACAAAATATAGGTATCTTTATTCTTTAGGCTGTTATTATCTTCAATTATCCATTTTTCTTCACCGTTTG TATTTGATCAATTTTGCTAGCATAATTACCCAATAGGCACGTATTTCCCCCTGTTCGGATAACGTTGTAGATTGTCATTT GTTTACCTTAAAAGAAGTGACGCAGAGATTTATGTAATAGGTTGCGTGGAACCCAAAAAAAGGGATC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGACAACGCATTTGCTAGATCTATTACCGAGGTCCTTGATTTCTTCGGAGTGGACCCAACAAAGGGTCTCTCTGACAC TGAGGTGGTACAACATGCTAGACTTTATGGTAAAAACGTGCTGCCCGGAGATCAAAGAGCCCCGTTTTGGAAATTGGTTT TGAAACAATTTGATGATTTGCTTGTTAAGATACTAATTGTAGCTGCACTTGTATCATTCATTCTGGCGTTAATTAACGGA GAAACAGGGTTGATGGCATTTTTGGAGCCTTCTGTTATTCTGATGATACTGGCAGCAAATGCAGCTGTAGGAGTGATTAC AGAAACAAATGCTGAAAAAGCTCTTGAGGAGCTACGCGCCTATCAAGCTGATGTGGCAACTGTCTTGCGAAATGGTTGTT TTTCCATACTTCCTGCAACTGAACTTGTTCCTGGGGATATTGTGGAAGTTTCTGTGGGGGGCAAAATTCCTGCTGATATG AGGATGATTGAGATGCTAAGTAATCAAGTGCGTGTTGATCAGGCTATTCTTACAGGTGAGAGCAGCTCTGTGGAAAAAGA GCTCGAAACTACCACAACAACAAATGCTGTATACCAAGACAAAACAAACATTCTGTTCTCGGGAACAGTTATGGTTGCTG GTAGGGCAAGAGCTGTTGTGGTGGGAGTTGGTCCTAACACTGCCATGGGCAGCATACGTGACTCAATGTTGCGAACAGAG GATGAGGTGACACCATTGAAAAAGAAGCTGGATGAGTTTGGTACCTTTTTGGCCAAGGTTATTGCTGGAATATGTGTATT GGTATGGGTTGTAAATATTGGTCACTTCCGTGACCCTGCTCATGGTGGTTTCTTGCGTGGTGCAATTCATTATTTTAAGA TTGCAGTTGCTCTGGCAGTTGCAGCAATTCCCGAAGGGCTCCCTGCTGTTGTTACAACGTGTTTGTCTCTTGGAACAAAG CGTATGGCTAGGTTGAATGCCATTGTTCGCTCTTTGCCATCCGTTGAGACCTTGGGCTGTACCACCGTAATTTGCAGTGA CAAAACTGGGACTCTAACTACCAATATGATGTCAGTTGCGAAGATATGTGTGCTTGAATCTGCAAATCGTAGTCCTTTTG TTACTGAATACAGTGTCAGTGGAACGACATATGCACCTGAAGGCACAATCTTTGACACGACAGGGGTTCAGCTTGACCTT CCTGCTCAATTGCCATGTCTTCTTCACATGGCTATGTGTTCTGCTCTTTGCAATGAATCAACCCTGCAGTACCATCCTGA TAAAGGGAAGTATGAAAAAATTGGTGAGTCCACTGAAGTGGCACTACGAGTCTTGGCAGAAAAGGTTGGTCTCCCTGGTT TTAATTCTTTGCCATCAGCCTTGAATATGTTGAGCAAGCATGAACGTGCTTCTTACTGTAACCATTATTGGGAGGAACAA TTTAGAAAGTTAGATTATTTGGAATTTTCTCGAGATCGGAAAATGATGAGTGTTCTTTGCAGCCGGAACCAATTGCATGT TTTATTTTCTAAGGGTGCCCCAGAAAGTATAATATCTAGATGTTCAACCATTCTGTGCAATGACAATGGTTCCATTGTGC CACTTACTGCTGATATTCGAGCCGAGCTGGAGTCGAAGTTCCACAGGTTTGCTGGAAAAGAAACATTGAGATGCCTAGCT TTGGCCCTGAAATGGATGCCCTCAGTTCAACAAGCGCTGTCCTTTGATGATGAGAAAGATCTTACATTTATTGGACTGGT TGGGATGCTGGATCCACCAAGAGATGAAGTAAGAAATGCGATGCTTTCATGTATGACTGCTGGCATACGTGTTATAGTTG TCACTGGGGATAACAAGTCCACTGCTGAGTCACTTTGCCGCAAGATTGGAGCTTTTGACCATTTGATAGATTTTACTGAA CATTCTTACACTGCTTCTGAGTTTGAAGAACTTTCAGCAGTAGAACGAACTATAGCATTGCAACGAATGGCACTTTTTAC CAGGGTTGAACCTTCTCATAAAAGGATGCTGGTTGAAGCATTACAGCATCAGAATGAAGTGGTTGCAATGACGGGTGATG GAGTCAATGATGCACCTGCATTGAAGAAGGCAGATATAGGAATTGCTATGGGTTCAGGGACATCTGTTGCTAAGAGTGCA TCGGACATGGTCCTGGCTGATGACAACTTTGCTTCAATTGTTGCGGCTGTGGCAGAGGGAAGGGCTATATACAATAATAC AAAACAGTTCATTAGATATATGATTTCCTCCAATATTGGTGAAGTAGTGTGTATATTTGTGGCTGCCGTGCTTGGACTAC CTGATACTCTGGTCCCTGTCCAGTTGCTTTGGGTCAATTTGGTCACTGACGGATTGCCCGCTACTGCTATTGGCTTCAAT AAGCAAGACTCCGATGTGATGAAGACTAAACCTCGAAAGGTTAGTGAAGCAGTTGTTACAGGTTGGCTCTTCTTTCGTTA TTTGGTAATTGGAGCTTATGTTGGCCTTGCCACCGTTGCTGGTTTTATTTGGTGGTTTGTTTATTCTGATAGTGGCCCTA AACTACCATATTCGGAATTGATGAATTTTGACACCTGCCCAACCAGGGAGACAACTTATCCATGCAGTATATTTGATGAT CGACACCCATCGACTGTATCCATGACTGTGCTTGTCGTTGTTGAGATGTTCAATGCTTTGAACAATCTTAGTGAAAATCA ATCTCTCCTGGTCATCCCTCCCTGGAGTAACTTGTGGCTTGTTGGTTCTATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAA TATTATATGTTCGCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTT TCACTACCGGTTATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGAAACCCTATTGGTTTGAGGTTCAGATTATGGTT CAGGAGGTCTGATTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0362300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDNAFARSITEVLDFFGVDPTKGLSDTEVVQHARLYGKNVLPGDQRAPFWKLVLKQFDDLLVKILIVAALVSFILALING ETGLMAFLEPSVILMILAANAAVGVITETNAEKALEELRAYQADVATVLRNGCFSILPATELVPGDIVEVSVGGKIPADM RMIEMLSNQVRVDQAILTGESSSVEKELETTTTTNAVYQDKTNILFSGTVMVAGRARAVVVGVGPNTAMGSIRDSMLRTE DEVTPLKKKLDEFGTFLAKVIAGICVLVWVVNIGHFRDPAHGGFLRGAIHYFKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLSLGTK RMARLNAIVRSLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNMMSVAKICVLESANRSPFVTEYSVSGTTYAPEGTIFDTTGVQLDL PAQLPCLLHMAMCSALCNESTLQYHPDKGKYEKIGESTEVALRVLAEKVGLPGFNSLPSALNMLSKHERASYCNHYWEEQ FRKLDYLEFSRDRKMMSVLCSRNQLHVLFSKGAPESIISRCSTILCNDNGSIVPLTADIRAELESKFHRFAGKETLRCLA LALKWMPSVQQALSFDDEKDLTFIGLVGMLDPPRDEVRNAMLSCMTAGIRVIVVTGDNKSTAESLCRKIGAFDHLIDFTE HSYTASEFEELSAVERTIALQRMALFTRVEPSHKRMLVEALQHQNEVVAMTGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTSVAKSA SDMVLADDNFASIVAAVAEGRAIYNNTKQFIRYMISSNIGEVVCIFVAAVLGLPDTLVPVQLLWVNLVTDGLPATAIGFN KQDSDVMKTKPRKVSEAVVTGWLFFRYLVIGAYVGLATVAGFIWWFVYSDSGPKLPYSELMNFDTCPTRETTYPCSIFDD RHPSTVSMTVLVVVEMFNALNNLSENQSLLVIPPWSNLWLVGSIVITMLLHTLILYVRPLSVLFSVTPLSWADWMVVLYL SLPVIIIDEVLKFFSRNPIGLRFRLWFRRSDLLPKREVRDK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 59 59 -
SMART 3 77 75 9.3E-16
SUPERFAMILY 3 976 974 1.7E-129
CDD 5 976 972 0.0
Pfam 8 72 65 2.2E-16
Gene3D 9 59 51 1.5E-5
PANTHER 21 992 972 0.0
PANTHER 21 992 972 0.0
TIGRFAM 53 846 794 1.1E-293
Phobius 60 78 19 -
TMHMM 60 79 20 -
Gene3D 60 127 68 6.3E-17
Phobius 79 83 5 -
TMHMM 84 106 23 -
Phobius 84 106 23 -
TIGRFAM 92 367 276 2.2E-39
Phobius 107 255 149 -
Coils 111 131 21 -
Pfam 122 324 203 9.6E-49
SUPERFAMILY 124 235 112 3.14E-28
Gene3D 128 231 104 3.5E-24
PRINTS 173 187 15 1.6E-41
Gene3D 239 976 738 0.0
TMHMM 253 275 23 -
Phobius 256 274 19 -
Phobius 275 293 19 -
Phobius 294 317 24 -
TMHMM 295 317 23 -
Phobius 318 749 432 -
SFLD 326 743 418 0.0
SFLD 326 743 418 0.0
Gene3D 327 729 403 0.0
PRINTS 345 359 15 1.6E-41
ProSitePatterns 347 353 7 -
SUPERFAMILY 352 589 238 2.09E-54
Gene3D 355 593 239 0.0
Pfam 415 524 110 6.6E-21
SUPERFAMILY 578 739 162 2.41E-44
Pfam 582 705 124 7.4E-17
PRINTS 585 596 12 1.6E-41
PRINTS 607 617 11 1.6E-41
TIGRFAM 661 780 120 7.2E-37
PRINTS 663 679 17 1.2E-13
PRINTS 691 707 17 1.2E-13
PRINTS 691 710 20 1.6E-41
PRINTS 714 726 13 1.6E-41
PRINTS 722 747 26 1.2E-13
Phobius 750 771 22 -
TMHMM 750 772 23 -
Phobius 772 782 11 -
Pfam 776 974 199 8.7E-44
TMHMM 777 799 23 -
Phobius 783 800 18 -
Phobius 801 820 20 -
Phobius 821 847 27 -
TMHMM 822 844 23 -
Phobius 848 885 38 -
TMHMM 886 903 18 -
Phobius 886 903 18 -
Phobius 904 914 11 -
Phobius 915 936 22 -
TMHMM 915 937 23 -
Phobius 937 955 19 -
TMHMM 952 974 23 -
Phobius 956 974 19 -
Phobius 975 1001 27 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleotide binding Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose.
Molecular function Calcium-transporting ATPase activity Enables the transfer of a solute or solutes from one side of a membrane to the other according to the reaction: ATP + H2O + Ca2+(cis) = ADP + phosphate + Ca2+(trans).
Biological process Calcium ion transport The directed movement of calcium (Ca) ions into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0362300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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