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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0362300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0362300.4 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Calcium-transporting ATPase; TAIR: AT1G10130.1 endoplasmic reticulum-type calcium-transporting ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9SY55|ECA3_ARATH Calcium-transporting ATPase 3, endoplasmic reticulum-type; TrEMBL-Plants: tr|K7KI34|K7KI34_SOYBN Calcium-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi1g1v0362300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:83722162..83741099) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTGTACCTAATAAATGGAAATGTTACTGTTAGTTGATTTCAGGCTAGTCAAGGTTTGTGCAAAGTTATAGAAAAATAAAT TAGTTTATATATACTGTACTATAATGAACATTAGCGCCTGGGGATAATTCAAAAACCATAAATTGCTGTGCCACTGGTTT GAACCTCATCAAATATTATTGCCAATTGAGGTTCCGCTAGTTAATTGCCGATACCTTTGCTGTCCTGTAATTTTTCTGTT CTACGAAATAAACTCAATCAGTTCTTCTTAACTAATTCCTTTGAAATTTGATGTGCAGGAGCCCCGTTTTGGAAATTGGT TTTGAAACAATTTGATGATTTGCTTGTTAAGATACTAATTGTAGCTGCACTTGTATCATTCATTCTGGCGTTAATTAACG GAGAAACAGGGTTGATGGCATTTTTGGAGCCTTCTGTAAGATTTGTTTGTACTTATATGTTGTGTATTTTTGTGAACATT TCTATTGGTGAAAGAATATTTGCTTGAATTGGTTCATACTTCATACCTTGATAATAAAGATGTATCCTTTTAATAGAAGC TGTAGACTATGAGCTGATTGAGTTTCTTTGCAACTTATGGAGTTTCTTGGCAAGATGACTTGTTAAATAATGTTTCTGAG TTAGAGAATGTACCAAAATTTTCACTATAAGTGTGATATTTATTAAATTGGGCTTATCAAATTGCTAGTATTATCTTGGA TTAATTTCATTACTTTTACAGGTTTATTGATACAAAAAGAAATTCATTCATGTACAGGTTATTCTGATGATACTGGCAGC AAATGCAGCTGTAGGAGTGATTACAGAAACAAATGCTGAAAAAGCTCTTGAGGTAAATTTGAAATACTAATAATTTAGAG CTCCAAAGTCCCAACAATCTTACTGATAGTAGCTTATCAGTAACAAATCTTCATTGGTTTTGGATGAGTTTCCTAAATTT 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TTCTATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAATATTATATGTTCGCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAAGTACTT TTCTAAAGCAGTGATTCCCAATATATTTTCTTGAAGTCACAACTCTATCATTTGTGTCCTGTTCGCAAGCAATCAGTATT ATTAAGATTACAATTTGTTTTGGCAGGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTTTCACTACCG GTATGTGGTTTTGTTCATCTTTCCCCAGAATTTTATTTGGGCCTTTGTGCCCCATCCCTGTGCCAATATCTGGGTATATG ATTTCCGTATGGGCATTATGGCAGGTGTATCATGTCTACAGTTTTGTAATAACATTTTTTGACTTCAAACATTTTAATGT ATCATTATGGCCTAAATTGATTGCTTAAAGTTTGCAATGCACCAGTAAGCACTATCTACATTTGATCCACTTGTAGAGAG TCCGATTATCATACTGTCTTAGAATAGTTAAATGATAACGTATGGAGCATTTGATGCACTAATTTGTTATGCTTGATCAG AAATCAATGTTAGATTATATTTGGTTTGGTATCTGTTTGGCTTTCTTTTTTTGAATTAAAAAAAACTTGGGAGTCTCGAT TTGGGGTAAGAAAAGTGCATTTTTTAGTTTCTGCATTTTTTTAGATTTCTTTTTTTTGTTCTCGAAAAAAAAATCTTTTA TTCTTTTTAACTTGTAAAGGATTGCTTTTTGGTTTGGTAACCACATAAGAAGAATAAATCAATTAATTTTTTGAATGTAA CATATTGAAGAATTCCGTCATTTTCTCTAATAATATCAAAGTACTTATAGTAAAAAATCGCTAATATGTCTTTAGCTCCC CAAAAAGCTACTTTTTAATTTTGATTATTGGGATCTCTCATTAGGAGAAGCTGTGTTTTCAACCATATAGGAGTCCTGCT TTTTTTCAAATTGTCTTTTAACCTGTTGTTTTATTATGCAGGTTATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGA AACCCTATTGGTAATCTTTTATTCCATCATGTTAAATTTTCAGCTCAATCTATGATACTAAGGGCCTGTTTATTTGAAAA AAAATATTTATTCTCATTTCTTGTTTTCCCAAATAATATACAAAAATATTATTTTATTTTCATTTTGTTTTTGTTTTTGA ATACTAGTTCAGGAAATAGTGAAAATACCAAAATGTTGTTTGACTTGTTTCTACCATTTTCTATATGAATCGTTGAAAAT ATTCACAAGAAAAACAAGTACACTTTTTAAAATATTGATGAAAACTAGATATAGAAATCAAATATTTTTTCTCAAACTGA ATAGACTTAATTCTCTGTTTTGGGGGTTGGGGGTGGAGTGTTCAATGTGGCGTAAGATTGGTAGTCTCATTTTCAATTTG ATATTAACAATAATCATGGAAAAATATCAGTGGGTACATTTTCGACAGTGCTTTGACATGGGATATATACAGCATTAAGT GGTGTAAGCAACATCTCTATATTAAATATTTTCCTCATAGCTGATGTGAAAACTGTTCCTATGGTTTTAGGTTTGAGGTT CAGATTATGGTTCAGGAGGTCTGATTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0362300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTTTTGGAGCCTTCTGTTATTCTGATGATACTGGCAGCAAATGCAGCTGTAGGAGTGATTACAGAAACAAATGC TGAAAAAGCTCTTGAGGAGCTACGCGCCTATCAAGCTGATGTGGCAACTGTCTTGCGAAATGGTTGTTTTTCCATACTTC CTGCAACTGAACTTGTTCCTGGGGATATTGTGGAAGTTTCTGTGGGGGGCAAAATTCCTGCTGATATGAGGATGATTGAG ATGCTAAGTAATCAAGTGCGTGTTGATCAGGCTATTCTTACAGGTGAGAGCAGCTCTGTGGAAAAAGAGCTCGAAACTAC CACAACAACAAATGCTGTATACCAAGACAAAACAAACATTCTGTTCTCGGGAACAGTTATGGTTGCTGGTAGGGCAAGAG CTGTTGTGGTGGGAGTTGGTCCTAACACTGCCATGGGCAGCATACGTGACTCAATGTTGCGAACAGAGGATGAGGTGACA CCATTGAAAAAGAAGCTGGATGAGTTTGGTACCTTTTTGGCCAAGGTTATTGCTGGAATATGTGTATTGGTATGGGTTGT AAATATTGGTCACTTCCGTGACCCTGCTCATGGTGGTTTCTTGCGTGGTGCAATTCATTATTTTAAGATTGCAGTTGCTC TGGCAGTTGCAGCAATTCCCGAAGGGCTCCCTGCTGTTGTTACAACGTGTTTGTCTCTTGGAACAAAGCGTATGGCTAGG TTGAATGCCATTGTTCGCTCTTTGCCATCCGTTGAGACCTTGGGCTGTACCACCGTAATTTGCAGTGACAAAACTGGGAC TCTAACTACCAATATGATGTCAGTTGCGAAGATATGTGTGCTTGAATCTGCAAATCGTAGTCCTTTTGTTACTGAATACA GTGTCAGTGGAACGACATATGCACCTGAAGGCACAATCTTTGACACGACAGGGGTTCAGCTTGACCTTCCTGCTCAATTG CCATGTCTTCTTCACATGGCTATGTGTTCTGCTCTTTGCAATGAATCAACCCTGCAGTACCATCCTGATAAAGGGAAGTA TGAAAAAATTGGTGAGTCCACTGAAGTGGCACTACGAGTCTTGGCAGAAAAGGTTGGTCTCCCTGGTTTTAATTCTTTGC CATCAGCCTTGAATATGTTGAGCAAGCATGAACGTGCTTCTTACTGTAACCATTATTGGGAGGAACAATTTAGAAAGTTA GATTATTTGGAATTTTCTCGAGATCGGAAAATGATGAGTGTTCTTTGCAGCCGGAACCAATTGCATGTTTTATTTTCTAA GGGTGCCCCAGAAAGTATAATATCTAGATGTTCAACCATTCTGTGCAATGACAATGGTTCCATTGTGCCACTTACTGCTG ATATTCGAGCCGAGCTGGAGTCGAAGTTCCACAGGTTTGCTGGAAAAGAAACATTGAGATGCCTAGCTTTGGCCCTGAAA TGGATGCCCTCAGTTCAACAAGCGCTGTCCTTTGATGATGAGAAAGATCTTACATTTATTGGACTGGTTGGGATGCTGGA TCCACCAAGAGATGAAGTAAGAAATGCGATGCTTTCATGTATGACTGCTGGCATACGTGTTATAGTTGTCACTGGGGATA ACAAGTCCACTGCTGAGTCACTTTGCCGCAAGATTGGAGCTTTTGACCATTTGATAGATTTTACTGAACATTCTTACACT GCTTCTGAGTTTGAAGAACTTTCAGCAGTAGAACGAACTATAGCATTGCAACGAATGGCACTTTTTACCAGGGTTGAACC TTCTCATAAAAGGATGCTGGTTGAAGCATTACAGCATCAGAATGAAGTGGTTGCAATGACGGGTGATGGAGTCAATGATG CACCTGCATTGAAGAAGGCAGATATAGGAATTGCTATGGGTTCAGGGACATCTGTTGCTAAGAGTGCATCGGACATGGTC CTGGCTGATGACAACTTTGCTTCAATTGTTGCGGCTGTGGCAGAGGGAAGGGCTATATACAATAATACAAAACAGTTCAT TAGATATATGATTTCCTCCAATATTGGTGAAGTAGTGTGTATATTTGTGGCTGCCGTGCTTGGACTACCTGATACTCTGG TCCCTGTCCAGTTGCTTTGGGTCAATTTGGTCACTGACGGATTGCCCGCTACTGCTATTGGCTTCAATAAGCAAGACTCC GATGTGATGAAGACTAAACCTCGAAAGGTTAGTGAAGCAGTTGTTACAGGTTGGCTCTTCTTTCGTTATTTGGTAATTGG AGCTTATGTTGGCCTTGCCACCGTTGCTGGTTTTATTTGGTGGTTTGTTTATTCTGATAGTGGCCCTAAACTACCATATT CGGAATTGATGAATTTTGACACCTGCCCAACCAGGGAGACAACTTATCCATGCAGTATATTTGATGATCGACACCCATCG ACTGTATCCATGACTGTGCTTGTCGTTGTTGAGATGTTCAATGCTTTGAACAATCTTAGTGAAAATCAATCTCTCCTGGT CATCCCTCCCTGGAGTAACTTGTGGCTTGTTGGTTCTATAGTCATAACTATGCTCCTTCACACACTAATATTATATGTTC GCCCACTGTCTGTTCTTTTCTCTGTAACTCCATTATCTTGGGCTGACTGGATGGTTGTCCTTTATCTTTCACTACCGGTT ATAATCATTGATGAGGTGTTAAAGTTCTTCTCCAGAAACCCTATTGGTTTGAGGTTCAGATTATGGTTCAGGAGGTCTGA TTTACTTCCAAAAAGAGAAGTGCGTGATAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0362300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFLEPSVILMILAANAAVGVITETNAEKALEELRAYQADVATVLRNGCFSILPATELVPGDIVEVSVGGKIPADMRMIE MLSNQVRVDQAILTGESSSVEKELETTTTTNAVYQDKTNILFSGTVMVAGRARAVVVGVGPNTAMGSIRDSMLRTEDEVT PLKKKLDEFGTFLAKVIAGICVLVWVVNIGHFRDPAHGGFLRGAIHYFKIAVALAVAAIPEGLPAVVTTCLSLGTKRMAR LNAIVRSLPSVETLGCTTVICSDKTGTLTTNMMSVAKICVLESANRSPFVTEYSVSGTTYAPEGTIFDTTGVQLDLPAQL PCLLHMAMCSALCNESTLQYHPDKGKYEKIGESTEVALRVLAEKVGLPGFNSLPSALNMLSKHERASYCNHYWEEQFRKL DYLEFSRDRKMMSVLCSRNQLHVLFSKGAPESIISRCSTILCNDNGSIVPLTADIRAELESKFHRFAGKETLRCLALALK WMPSVQQALSFDDEKDLTFIGLVGMLDPPRDEVRNAMLSCMTAGIRVIVVTGDNKSTAESLCRKIGAFDHLIDFTEHSYT ASEFEELSAVERTIALQRMALFTRVEPSHKRMLVEALQHQNEVVAMTGDGVNDAPALKKADIGIAMGSGTSVAKSASDMV LADDNFASIVAAVAEGRAIYNNTKQFIRYMISSNIGEVVCIFVAAVLGLPDTLVPVQLLWVNLVTDGLPATAIGFNKQDS DVMKTKPRKVSEAVVTGWLFFRYLVIGAYVGLATVAGFIWWFVYSDSGPKLPYSELMNFDTCPTRETTYPCSIFDDRHPS TVSMTVLVVVEMFNALNNLSENQSLLVIPPWSNLWLVGSIVITMLLHTLILYVRPLSVLFSVTPLSWADWMVVLYLSLPV IIIDEVLKFFSRNPIGLRFRLWFRRSDLLPKREVRDK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| Phobius | 1 | 171 | 171 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 18 | 18 | - | – | |
| TIGRFAM | 1 | 762 | 762 | 2.6E-285 | ||
| SUPERFAMILY | 4 | 892 | 889 | 4.84E-108 | ||
| PANTHER | 6 | 908 | 903 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 6 | 908 | 903 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 8 | 155 | 148 | 1.2E-41 | – | |
| Coils | 27 | 47 | 21 | - | – | |
| Pfam | 38 | 240 | 203 | 8.3E-49 | – | |
| SUPERFAMILY | 40 | 151 | 112 | 2.88E-28 | ||
| PRINTS | 89 | 103 | 15 | 9.8E-42 | – | |
| TIGRFAM | 151 | 283 | 133 | 1.6E-25 | ||
| Gene3D | 156 | 892 | 737 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 169 | 191 | 23 | - | – | |
| Phobius | 172 | 190 | 19 | - | – | |
| Phobius | 191 | 209 | 19 | - | – | |
| Phobius | 210 | 233 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 211 | 233 | 23 | - | – | |
| Phobius | 234 | 665 | 432 | - | – | |
| SFLD | 242 | 659 | 418 | 0.0 | – | |
| SFLD | 242 | 659 | 418 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 243 | 645 | 403 | 0.0 | ||
| PRINTS | 261 | 275 | 15 | 9.8E-42 | – | |
| ProSitePatterns | 263 | 269 | 7 | - | ||
| SUPERFAMILY | 268 | 505 | 238 | 1.83E-54 | ||
| Gene3D | 271 | 509 | 239 | 0.0 | ||
| Pfam | 331 | 440 | 110 | 5.8E-21 | – | |
| SUPERFAMILY | 494 | 655 | 162 | 2.07E-44 | ||
| Pfam | 498 | 621 | 124 | 6.5E-17 | – | |
| PRINTS | 501 | 512 | 12 | 9.8E-42 | – | |
| PRINTS | 523 | 533 | 11 | 9.8E-42 | – | |
| TIGRFAM | 577 | 696 | 120 | 6.4E-37 | ||
| PRINTS | 579 | 595 | 17 | 9.1E-14 | ||
| PRINTS | 607 | 623 | 17 | 9.1E-14 | ||
| PRINTS | 607 | 626 | 20 | 9.8E-42 | – | |
| PRINTS | 630 | 642 | 13 | 9.8E-42 | – | |
| PRINTS | 638 | 663 | 26 | 9.1E-14 | ||
| TMHMM | 666 | 688 | 23 | - | – | |
| Phobius | 666 | 687 | 22 | - | – | |
| Phobius | 688 | 698 | 11 | - | – | |
| Pfam | 692 | 890 | 199 | 7.5E-44 | ||
| TMHMM | 693 | 715 | 23 | - | – | |
| Phobius | 699 | 716 | 18 | - | – | |
| Phobius | 717 | 736 | 20 | - | – | |
| Phobius | 737 | 763 | 27 | - | – | |
| TMHMM | 738 | 760 | 23 | - | – | |
| Phobius | 764 | 801 | 38 | - | – | |
| TMHMM | 802 | 819 | 18 | - | – | |
| Phobius | 802 | 819 | 18 | - | – | |
| Phobius | 820 | 830 | 11 | - | – | |
| Phobius | 831 | 852 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 831 | 853 | 23 | - | – | |
| Phobius | 853 | 871 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 868 | 890 | 23 | - | – | |
| Phobius | 872 | 890 | 19 | - | – | |
| Phobius | 891 | 917 | 27 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
| Molecular function | Calcium-transporting ATPase activity | Enables the transfer of a solute or solutes from one side of a membrane to the other according to the reaction: ATP + H2O + Ca2+(cis) = ADP + phosphate + Ca2+(trans). | ||
| Biological process | Calcium ion transport | The directed movement of calcium (Ca) ions into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0362300.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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