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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0443600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0443600.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Importin-like protein; TAIR: AT3G08960.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9UI26|IPO11_HUMAN Importin-11; TrEMBL-Plants: tr|K7MTL7|K7MTL7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0443600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:94106384..94142358) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCGGTTTCCACATCCGACGTGGCGGCGATGTACTCGCTCCTATCCAATTCCATGAGCGCCGATCACCGCCACCGTGG CCCCGCTGAGCAAGCCCTCACTCAATCCGAGTCCAGACCCGGCTTCTGCTCCTGCCTCCTTGTACCCCCTCTCTCACTCT CTCTTAGGGTTCCGATGAACCTCGCATTGTCGCTTTTCGTTTTGTTTTGTTGTGTTCTGAGGTTTTGCTTTTGGTGAATT GAACTGCAGGAAGTGATTACGGCGAAGGATTTGGCGGCGCAGGTGGATGTGCGGTTAATGGCCACCGTGTATTTCAAGAA CAGCATCAATCGATACTGGCGGCATCGCCGCTATTCCTCGTAAGTGCTTATGTGTTAGGTTGTTTGTATTAGCTTTACTA TCTGTTCACAAAGAAAAAAGTTTGTTGTAATTAAAATGCAGCTAGGATTTTCTTAAAAAAGATTAAAGAAGTGCAAATGT GTTTTAGTGTAAAAAATCAAGCTGAACCTAACATGCAAAGCGTGTGGATTGTGTTGTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTAATT CTCTGCCGTCGGTTCAGGGGAATTAGCAATGAGGAGAAAATACATCTGAGGCAGAAGTTGTTGATGCACTTGAGAGAAGA GAATGACCAGGTTTTTTTTTTCATTTTTAAAACTAGGCTTTAGATGGTGCTTGTTTGTGATTTCATACAAGATGGACCTT GTTTGTGATGGACCTTGTTAGTTACTTAGATACTTGAAATGATCTCATTGATGGGTTGGTTGGTTCATAATCAGTGTTGT TCAGTCTGCACGGTTCCGTGTAACTATTGTGTGGTTTTATAGACCTTATGATAAATGAACTCATCTTCCACCCTTGCCCC TCTCTCTGGGAGGAGTTTTTTTTTGTTTTTTTAATTTAATTTTACTGTATACTTTTGTGAACTGTGATAAGCTGTAGATA 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TTATTTTATTTACTTCATACGGAATAATTGGGACTTGGGTTGAATCTTGATGCAACTAACTCACCAGTTTAAAAACTACG AAAGCGTTTTACAAACAATTATTTTTCTGTTGTGAATTACAGTGGAGACATGAGCTCCAGTAACTCTCATGATGAGGGCT CAATCCCTAGTAAAGAATTCAGAAAGAGACAGGTTAGAGAACTATGAAAACTTTGTTTGGAATGATGTACAATTGTTTGA ATTACAAATGAAGTTATGCATTTGTTTGTTCTGTCGATAGATCAAATTTTCAGACAGTATCAATCAGCTGTCATTGGAAG ACTCTGTTAGAGAAAATCTACAAACATGTGCTGCTATTCATGGAGAATCATTTAATGCTGCAATGAGCAGTATGCATCCA TCTGCATTTGCACAATTGAAGCAGGCGTTAAAAATGCCATAACTGGGTGTGCCAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0443600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGTTTCCACATCCGACGTGGCGGCGATGTACTCGCTCCTATCCAATTCCATGAGCGCCGATCACCGCCACCGTGG CCCCGCTGAGCAAGCCCTCACTCAATCCGAGTCCAGACCCGGCTTCTGCTCCTGCCTCCTTGAAGTGATTACGGCGAAGG ATTTGGCGGCGCAGGTGGATGTGCGGTTAATGGCCACCGTGTATTTCAAGAACAGCATCAATCGATACTGGCGGCATCGC CGCTATTCCTCGGGAATTAGCAATGAGGAGAAAATACATCTGAGGCAGAAGTTGTTGATGCACTTGAGAGAAGAGAATGA CCAGATAGCTCTAATGTTGGCTGTTCTAATCTCCAAAATTGCTCGGATCGATTATCCCAAAGAATGGCCAGACATCTTCT TAATTTTATCGCAACAACTTCAATCAGCTGATATTCTTGCTTCCCACCGAATCTTCATGATTCTATTTAGAACTTTAAAG GAGTTGTCTACAAAACGCCTTACTGCAGACCAACGCCACTTTGCAGAGATATCATCCCATTTCTTTGATTATAGCTGGCG CCTGTGGCAAAGTGATGTGCAGACAATACTGCATGGTTTCTCAACTCTTTCTCAAAGCTTTAATTCAAATGCTGAAGATC AGCACCATGATCTTTATCTTACGTGTGAGAGATGGTTGTTATGTTCAAAGATCATACGGCAATTAGTTATTTCAGGATTT CAAAGTGATTCAAAGTGTTTTCAGGAGGTTCGACCAGTCAAGGAAGTATCACCTGTGCTCTTAAGTTCCATTCAATCACT TCTTCCATATTATTCGACTTTTCAAAAGCAATATCCTAAATTTTGGGACTTCTTAAAGAGGACATGTACCAAATTGATGA AAATTTTAGTTGCCTTTCAGGGCAGACATCCTTATTCATTTGGTGATAAATTTGTGCTTTCATCAGTCATGGACTTCTGT TTGAATAGGATAACGGACCCTGAGCCATATCTATTGTCATTTGAACAATTTCTCATTCAATGTATGGTGATGATTAAGAA TATTCTGGAATGTAAGGAATATAAGCCGACTCTTACTGGTCGAGTGATGGATGAAAATGGTGTTACACTGGAGCAGATTA AGAAAAATATTTCCAGTGCAGTTGGTGGTGTTTTAAGTTCCCTTTTGCCCAATGAACGGATAGTCCTCTTGTGTAATGTG TTGATACAAAGGTATTTTGTTCTGACTGCAAGTGATCTGGAGGAGTGGTATCGTAACCCCGAGTCTTTTCATCATGAGCA GGATATGGTCCAGTGGACAGAAAAATTGAGGCCATGTGCTGAGGCTCTATACATCGTATTGTTTGAAAATTATAGCCAAC TGCTATGTCCTGTGGTGGTTTCTCTTCTTCAAGAGGCCATGAATAGTTGCCCGACTTCAGTGACAGAAATTACTCCTGCA TTGCTTCTTAAAGATGCTGCCTATGGTGCTGCTGCTTATGTTTATTATGAACTCTCAAACTACTTGAGCTTTAAAGACTG GTTCAATGGTGCTTTATCGCCCGAACTCTCAAATGAACATCCAAATTCACGTATCATTCATCGAAAAGTTGCTGTAATTT TGGGGCAGTGGGTCTCTGAGATTAAAGATGATACAAAAAGGCCTGTGTACTGTGCTTTAATCAGATTGTTACAGGGCAAC GATTTATCAGTCCGGCTGGCAGCCTGTCGATCCATGTGCTTACATATTGAAGATGCAAACTTTTCAGACAAAGAGTTTGT CGATCTTCTTCCTAACTGTTGGGAGTCGTGTTTTAAATTGTTTGAGGAAGTTCAGGAATTTGACTCGAAGGTTCAGATTT TGAATTTGATCTCTATCCTTATTGGACATGTTAGCGAAGTTATTCCATTTGCAAACAAGTTGGTGCAGTTTTTTCAGAAG GTCTGGGAGGAATCTTCTGGTGAAAGTCTGCTGCAGATTCAGCTGCTGGTTGCTTTGAGAAACTTTGTGGTTGCACTTGG GTACCAGTCTCCCATTTGCTATAATATACTACTGCCAATTCTGGAGAATGGGATTGATATTAATAGCCCAGATGAACTCA ATCTTCTTGAAGATAGCATGCTGTTATGGGAGGCCACTCTTTCTCAAGCTCCATCTATGGTGCCTCAATTGTTATCATAT TTTTCACGCCTTGTTGCGATTATGGAAAGAAATTTTGACCATTTGCAGGTTGCAGTTAACATAATTGAAGATTACATAAT TTTGGGTGGAAATGACTTTCTGAGCATGCATGCTACAAATATTGCTAAAATTCTTGACTTAATTGTCGGAAATGTCAGTG ACAAAGGCCTCCTTTCAGTTCTTCCTGTCATTGATATCTTAATACAGTGTTTCCCAATGGAAGTGCCGCCACTTATTAGC AGTGCATTGCAAAAACTAATCATAGTATGTTTGAGTGGAGGAGATGACCGGGATCCGTCTAAAACATCTGTGAAAGCATC TTCTGCTGCCATCCTCGCAAGACTTTTGGTGATGAATACAAATTCACTAGCCCAATTGGCATCAGATCCATCAACTTCTC TACTGCTTCAGGCAGCATCTATCCCAATTCAAGAAAATATACTTCTTTGTCTGGTTGACATTTGGGTTGATAAGGTAGAT AATGTTTCTTCCATCCAGAAGAAGGCAATTGGCTTAGCCCTGTCAATAATTCTGACCTTAAGGCTGCCTCAAGTACTTGA CAAACTTGATCAAATTTTGAGTGTCTGCACTAGTGTAATTCTGGGCAGAAGCGATGACCTAACGGAGGAAGAATCCAGTG GAGACATGAGCTCCAGTAACTCTCATGATGAGGGCTCAATCCCTAGTAAAGAATTCAGAAAGAGACAGATCAAATTTTCA GACAGTATCAATCAGCTGTCATTGGAAGACTCTGTTAGAGAAAATCTACAAACATGTGCTGCTATTCATGGAGAATCATT TAATGCTGCAATGAGCAGTATGCATCCATCTGCATTTGCACAATTGAAGCAGGCGTTAAAAATGCCATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0443600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAVSTSDVAAMYSLLSNSMSADHRHRGPAEQALTQSESRPGFCSCLLEVITAKDLAAQVDVRLMATVYFKNSINRYWRHR RYSSGISNEEKIHLRQKLLMHLREENDQIALMLAVLISKIARIDYPKEWPDIFLILSQQLQSADILASHRIFMILFRTLK ELSTKRLTADQRHFAEISSHFFDYSWRLWQSDVQTILHGFSTLSQSFNSNAEDQHHDLYLTCERWLLCSKIIRQLVISGF QSDSKCFQEVRPVKEVSPVLLSSIQSLLPYYSTFQKQYPKFWDFLKRTCTKLMKILVAFQGRHPYSFGDKFVLSSVMDFC LNRITDPEPYLLSFEQFLIQCMVMIKNILECKEYKPTLTGRVMDENGVTLEQIKKNISSAVGGVLSSLLPNERIVLLCNV LIQRYFVLTASDLEEWYRNPESFHHEQDMVQWTEKLRPCAEALYIVLFENYSQLLCPVVVSLLQEAMNSCPTSVTEITPA LLLKDAAYGAAAYVYYELSNYLSFKDWFNGALSPELSNEHPNSRIIHRKVAVILGQWVSEIKDDTKRPVYCALIRLLQGN DLSVRLAACRSMCLHIEDANFSDKEFVDLLPNCWESCFKLFEEVQEFDSKVQILNLISILIGHVSEVIPFANKLVQFFQK VWEESSGESLLQIQLLVALRNFVVALGYQSPICYNILLPILENGIDINSPDELNLLEDSMLLWEATLSQAPSMVPQLLSY FSRLVAIMERNFDHLQVAVNIIEDYIILGGNDFLSMHATNIAKILDLIVGNVSDKGLLSVLPVIDILIQCFPMEVPPLIS SALQKLIIVCLSGGDDRDPSKTSVKASSAAILARLLVMNTNSLAQLASDPSTSLLLQAASIPIQENILLCLVDIWVDKVD NVSSIQKKAIGLALSIILTLRLPQVLDKLDQILSVCTSVILGRSDDLTEEESSGDMSSSNSHDEGSIPSKEFRKRQIKFS DSINQLSLEDSVRENLQTCAAIHGESFNAAMSSMHPSAFAQLKQALKMP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 1 | 1005 | 1005 | 1.87E-83 | ||
| PANTHER | 6 | 1004 | 999 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 6 | 1004 | 999 | 0.0 | – | |
| Pfam | 29 | 102 | 74 | 4.2E-16 | ||
| ProSiteProfiles | 29 | 104 | 76 | 17.243 | ||
| SMART | 29 | 104 | 76 | 2.4E-11 | ||
| MobiDBLite | 927 | 950 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Molecular function | Ran GTPase binding | Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0443600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…