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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0465300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0465300.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | BEACH domain-containing protein; TAIR: AT2G45540.2 WD-40 repeat family protein / beige-like protein; Swiss-Prot: sp|F4IG73|BCHC2_ARATH BEACH domain-containing protein C2; TrEMBL-Plants: tr|G7L1D4|G7L1D4_MEDTR WD-40 repeat protein/beige protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0465300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:97313664..97328067) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTCTGTCTTGAAGACGTGAGGAATCGTTACCTGTATTTAAAAGGAGACTCTTAGGTGGCTTGCTGGACTTTGCTGCTAGA GAATTGCAGGTTCAGGTACATCTTGTTTTCTATCTTTATTGATTTTCCTTATAAAATTTTCATGCACTCTATGCCATGGC ATGATGTTGTTCTTTCTGATACACCCGGGAAATAAAATACCTCAACCTATGCCTAAGCACAGTGAGATATCAAAATCCTA TATTAAAAAATGGAGGAAAATTATCTGATACTCATTTTTGTTGAATAGTGGAAGAAAAAACAGCAATAATGTCTACATGC AGCTTTTCCTTGCTGCAGACTCAAATCATTGCTGCAGCTGCTGCTGGTGTTGCAGCTGAGGGTTTGTCACCAAAAGATGC TAAGGCCGAGGCTGAGAATGCAGCCCAGTTGTCTGTGGCTTTAGTAGAGAATGCCATTGTGATACTCATGCTTGTTGAAG ATCATTTACGGTTACAGAGCAAGCATTCTTCATCTCGTGCTACAGATGCTTCCCCGTCACCACTTTCTACTGTGTATCCA ATAAAAAATCGTTCTACTTCATTGTCGACAATTGAGGAGTCAACAGAAGTTACGGATGATCGTAGATCAGAATCGAGTGA CTCGGGGGGAATCCCTCTAGATGTATGTATACTGAATCTAAAACTAGAGATGCATGAAGCAATGTCATAAATAGATATGT ATTTGTAGTTTTTATATTTGTACATCTCCTATGCTGCTTCTGTTATTCCTCTAAAATTCATGCGATGGTCACGTTCTATC CTATTATCCAAATACCTTTATTTTATTTTTTGAACGTTTTCTCTTGTCTCCTTTTAATCTCTTACTTTCGTGTTTGTCCT TGAGATTTGAGAAAATATGTCCAGGCTTTTGTTTTTTCAGTATTTTCCATATACAGTTCATTTGATTTACATTCTTATTA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0465300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTTGTTGAAGATCATTTACGGTTACAGAGCAAGCATTCTTCATCTCGTGCTACAGATGCTTCCCCGTCACCACTTTC TACTGTGTATCCAATAAAAAATCGTTCTACTTCATTGTCGACAATTGAGGAGTCAACAGAAGTTACGGATGATCGTAGAT CAGAATCGAGTGACTCGGGGGGAATCCCTCTAGATGTCCTTTCTTCAATGGCTGATGGAAGTGGTCAGATCCCTACATCA GCGGTGGAAAGGATTGCAGCTGCTGCAGCCGCTGAGCCCTATGAATCAGTGTCTTGTGCTTTTGTGTCATATGGGTCCTG TGTTAAGGATTTAGCTGATGGCTGGAAATATAGGAGTCGTTTATGGTATGGTGTCGGCCTTCCACAGAATGCAGTTCCAT TTGGTGGTGGTGGTAGTGGATGGAATTTTTGGAATTCTGCATTGGAGAAAGATGCCAGTGGCAATTGGGTTGAGCTTCCT TTGGTAAAGAAGTCTGTGGCAATGCTCCAAGCATTATTACTAGATGAGTCTGGACTAGGTGGTGGTCTTGGTATAGGAGG AGGATCAGGTACCGGAATGGGAGGAATGGCTGCATTGTATCAGCTGTTAGATAGTGACCAGCCATTCTTGTGCATGCTTC GAATGGTTCTTCTATCAATGAGGGAAGATGATGACGGAGAAGATCATATGCTGATGAGAAGTACAAGTTTTGACGATTCT GTGTCTGAAGGAAGAAAACCACGATCAGCACTCTTGTGGAGTGTTCTCTCACCTGTGCTCAACATGCCAATTTCTGATTC TAAGAGGCAAAGAGTCTTGGTAGCATCTTGCGTGCTTTATTCCGAGGTGTACCATGCCGTTAGCAGAGACCAAAAGCCTC TTCGTAAACAGTACCTTGAGGCTATTTTACCGCCTTTTGTTGCTGTCTTAAGAAGATGGCGACCCCTTTTGGCTGGCATT CATGAGCTTGCTACTGGTGATGGTTTGAATCCTCTTATTGCTGATGACCGAGCATTAGCGGCTGATTCCCTGCCAATTGA GGCTGCTCTTGCTATGATATCTCCTGCCTGGGCTGCTGCTTTTGCATCTCCACCTGCTTCGATGGCATTGGCGATGGTCG CGGCTGGTGCTTCAGGTGGTGAAAGTCAAGCTCCTGCAACAAGTTCCCATCTTAGGCGTGATACATCACTGCTGGAACGC AAACAGACTAGGCTTCAAACATTTTCAAGTTTTCAAAGACCTTTGGAAGTCCCTAATAAAGCACCACCTCTTCCAAAGGA CAAAGCTGCTGCAAAAGCTGCTGCTTTGGCAGCTGCTCGTGATCTTGAGCGATTTGCAAAAGTTGGTTCTGGAAGAGGTC TTAGTGCTGTTGCAATGGCTACATCTGCACAGCGAAGGAGTGCTAGTGATATGGAGCGGGTTAAGAGATGGAATATGTCT GAAGCAATGGGAGTTGCTTGGATGGAATGTTTGCAGCAAGTTGATACGAAGGCGGTATATGGGAAAGATTTTAATGCTTT TTCGTATAAATATATTGCAGTTCTTGTTGCCAGTTTTGCCCTAGCAAGGAATATGCAACGGTCTGAGATTGACAGGCGTG CTTATGTAGATGTAGTTGATCGACATCGAATCAGTATTGGAGCCCGTGCATGGCGCAAACTTATTCACCAGTTAATAGAG ATGAGAAGTCTTTTGGGGCCATTTGCAGATAATTTATACAGCCCACTTCGAGTTTTCTGGAAGTTGGATTTAATGGAAAG TTCCTCCAGGATGAGAAGATGTTTGAGGAGGAATTACCAAGGGTCTGACCATTTAGGTTCTGCAGCCAATTATGAAGATT ATTTTCAGGAGAAAAATGAGCCGAGCACTCCAATTTTGTCGGCGGAAGCAATCTCGCTTGAGGCAGTCAATGTAGACGAA GAGCCAGTGGAAACTGAGGACTCGGTTTCTAGGGTTGATCATATTGAATATGAAGGAGATAATCAGCCTAGACTTTCTGA AGCAGCTGAACAAACTGTTCAGGCATCTCAGGAGTCCAGTCCTACTCAACTTGCAAGTGATGAACACCTTGTCCAAAGTT CTTCGCCCATTGCACCTGGGTATGTTCCTAGTGAACTTGATGAAAGAATTGTTCTTGAGCTACCATCATCAATGGTCCGA CCACTTAAGGTCATACGAGGAACCTTTCAAGTAACCAGTAGGAGGATAAATTTTCTAGTTGATAAAAGTGAGACCAGATC TACAACCGATAGTTTGCATACCAGTTCTGAGGCAGGCCACCAAGAAAAGGACCGTAGCTGGTTAATGTCATCTCTTCATC AAATCTATAGCAGGAGACACCTCCTTAGAAGAAGTGCTCTGGAGCTATTTATGGTGGACCGTTCAAACTTCTTCTTTGAT TTTGGGAGTAGTGAAGGGCGAAGAAATGCATATCGTGCAATTGTTCAAGCACGACCTCCTCATTTAAATAACATATATTT GGCTACTCAGAGGCCTGAACAACTTTTGAAAAGAATTCAACTTATGGAGCGTTGGGCCAGGTGGGAGATCAGCAATTTTG AATATCTAATGCAGCTCAATACACTAGCTGGGCGTAGTTACAATGATATAACCCAGTATCCGGTATTCCCCTGGATTCTT TCTGATTACAGTTCAGAGAGCTTGGATCTTTCTAATCCTTCTTCATATCGAGACCTTTCAAAGCCTGTTGGTGCACTGAA CCCAGATCGTCTGAAGAGAATTCAAGAAAGATATGCTAGCTTTGATGATCCAGTCATCCCCAAATTCCATTATGGATCAC ACTACTCGAGTGCAGGAACAGTTTTGTATTATCTTGTTAGGGTTGAACCATTCACTACCCTTGCAATCCAACTGCAAGGT GGTAAATTTGACCATGCAGACCGGATGTTTTCTGATATTTCTGCTACTTGGAATGGAGTTCTTGAGGACATGAGTGATGT GAAGGAATTGGTTCCTGAGCTATTTTACCAACCTGAGGTCCTCACAAATGAAAATTCAATTGATTTTGGCACGACACAGT TGGGAGGAAAGCTTGATACTGTTAAACTTCCTGCTTGGGCTGAAAATCCAGTTGATTTTATTCATAAGCATCAGAAGGCT CTGGAGAGTGAATATGTATCTGCTCATTTGCATGAGTGGATTGACCTAATATTTGGGTATAAACAACGGGGCAAAGAAGC TGTTGCAGCAAATAATGTGTTTTTTTATATTACCTATGAAGGGACAGTGGATATTGATAAAATCTCTGACCCAGTACAAC AGCGTGCCACACAAGATCAGATTGCATATTTTGGGCAAACACCTTCCCAACTTCTGACTGTTCCTCACTTGAAGAAAATG CCATTAGCCGAAGTTTTGCATTTGCAGACAATATTCCGCAACCCAAAAGAAATCAAACCATATGCTGTTCCATCCTCTGA ACGATGCAATCTTCCTGCGTCTGCCATTCAAGCATCTTCAGATATGGTTGTGGTTGTTGATATGAATGCGCCAGCAGCTC ATGTTGCTCAACACAAGTGGCAACCCAATACACCTGATGGCCACGGTACTCCTTTCCTTTTCCAACATAGAAAAGTGACA TCGGGGTCTGCTGGTGGTACACTTATGCGCATGTTCAAAGCACAGACCGCATCTGGTGAGGAGTGGCAATTCCCTCAAGC ACTAGCGTTTGCTGTCTCTGGAATTCGAAGCCAAGCTATCGTTGCTATTACGTGCGACAAAGAAATTATTACTGGTGGGC ATGCTGATAATAGTATTAGGCTAATATCCTCAGATGAAGCTAAAACCATAGAAACAGCTTATGGACATTGTGCTCCTGTT ACTTGCCTTGGCATTTCACCCAATAGTAACTACCTAGTGACAGGATCCCGAGATACAACAGTATTACTATGGAGAATACA CAGGGCACTTGTGTCTCCCTCAAATGTCATATCAGAACATTCCAATGGGACAAGAAGATTGTCTTCAACCAGTAATAGTT CATCGAGCTTGATTGAAAAGGATCAGAGACGTCGAATTGAGGGTCCTATACAGGTACTTCGGGGGCACCGCAGTGAAATA CTCAGTTGTTGTGTTAACTCAGATCTCGGGGTAGTTGTTTCTTGCTCTCATTCATCAGATGTCCTTCTGCACTCTATAAG AAGGGGACGTTTAATTAGAAGACTGGATGGAGTAGAGGCTGATATTGTCTGCCTTTCCGCTGAAGGGGTCGTGATGACTT GGAATGAATCACAGCATACTCTTAGTACCTTTACTCTCAATGGTGCTCCGATAGCAAAAGCACAATTCTCCTTCTTTTGC AGTATCAGTTGCATAGAGATTTCTACTGATGGGACGAGTGCTTTGATTGGAATTAATTCTCTAGAAAATGGTAGACCCGA TAATAACAGTTTAAATTCACAGTTGAATAAGTCAGGTGTTGTTGATTTTGATTCAGAATCAGAAGAAACTTATGAAAGCA ATAGAATAGATGTTCCATCACCATCAATTTGCTTCCTGGATATGCACACTCTGGAGGTATTTCATGAATTGAGGCTGGGA GAAGGGCAGGATATCACAGCTTTGGCTCTAAACAAGGATAGCACAAATCTTTTGGTTTCAACTTCGGATAAACAATTGAT AGTCTTCACTGATCCAGCTTTAAGCTTGAAGGTGGTAGATCAAATGCTCAAGCTTGGCTGGGAAGGTGATGGGCTTCGAC CTCTCATGAAATCATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0465300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLVEDHLRLQSKHSSSRATDASPSPLSTVYPIKNRSTSLSTIEESTEVTDDRRSESSDSGGIPLDVLSSMADGSGQIPTS AVERIAAAAAAEPYESVSCAFVSYGSCVKDLADGWKYRSRLWYGVGLPQNAVPFGGGGSGWNFWNSALEKDASGNWVELP LVKKSVAMLQALLLDESGLGGGLGIGGGSGTGMGGMAALYQLLDSDQPFLCMLRMVLLSMREDDDGEDHMLMRSTSFDDS VSEGRKPRSALLWSVLSPVLNMPISDSKRQRVLVASCVLYSEVYHAVSRDQKPLRKQYLEAILPPFVAVLRRWRPLLAGI HELATGDGLNPLIADDRALAADSLPIEAALAMISPAWAAAFASPPASMALAMVAAGASGGESQAPATSSHLRRDTSLLER KQTRLQTFSSFQRPLEVPNKAPPLPKDKAAAKAAALAAARDLERFAKVGSGRGLSAVAMATSAQRRSASDMERVKRWNMS EAMGVAWMECLQQVDTKAVYGKDFNAFSYKYIAVLVASFALARNMQRSEIDRRAYVDVVDRHRISIGARAWRKLIHQLIE MRSLLGPFADNLYSPLRVFWKLDLMESSSRMRRCLRRNYQGSDHLGSAANYEDYFQEKNEPSTPILSAEAISLEAVNVDE EPVETEDSVSRVDHIEYEGDNQPRLSEAAEQTVQASQESSPTQLASDEHLVQSSSPIAPGYVPSELDERIVLELPSSMVR PLKVIRGTFQVTSRRINFLVDKSETRSTTDSLHTSSEAGHQEKDRSWLMSSLHQIYSRRHLLRRSALELFMVDRSNFFFD FGSSEGRRNAYRAIVQARPPHLNNIYLATQRPEQLLKRIQLMERWARWEISNFEYLMQLNTLAGRSYNDITQYPVFPWIL SDYSSESLDLSNPSSYRDLSKPVGALNPDRLKRIQERYASFDDPVIPKFHYGSHYSSAGTVLYYLVRVEPFTTLAIQLQG GKFDHADRMFSDISATWNGVLEDMSDVKELVPELFYQPEVLTNENSIDFGTTQLGGKLDTVKLPAWAENPVDFIHKHQKA LESEYVSAHLHEWIDLIFGYKQRGKEAVAANNVFFYITYEGTVDIDKISDPVQQRATQDQIAYFGQTPSQLLTVPHLKKM PLAEVLHLQTIFRNPKEIKPYAVPSSERCNLPASAIQASSDMVVVVDMNAPAAHVAQHKWQPNTPDGHGTPFLFQHRKVT SGSAGGTLMRMFKAQTASGEEWQFPQALAFAVSGIRSQAIVAITCDKEIITGGHADNSIRLISSDEAKTIETAYGHCAPV TCLGISPNSNYLVTGSRDTTVLLWRIHRALVSPSNVISEHSNGTRRLSSTSNSSSSLIEKDQRRRIEGPIQVLRGHRSEI LSCCVNSDLGVVVSCSHSSDVLLHSIRRGRLIRRLDGVEADIVCLSAEGVVMTWNESQHTLSTFTLNGAPIAKAQFSFFC SISCIEISTDGTSALIGINSLENGRPDNNSLNSQLNKSGVVDFDSESEETYESNRIDVPSPSICFLDMHTLEVFHELRLG EGQDITALALNKDSTNLLVSTSDKQLIVFTDPALSLKVVDQMLKLGWEGDGLRPLMKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 64 | 64 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1567 | 1567 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1567 | 1567 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 14 | 44 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 659 | 698 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 665 | 698 | 34 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 705 | 815 | 111 | 33.506 | ||
| SUPERFAMILY | 708 | 815 | 108 | 7.38E-22 | – | |
| Gene3D | 708 | 814 | 107 | 2.7E-33 | – | |
| CDD | 708 | 818 | 111 | 5.0247E-29 | ||
| Pfam | 717 | 815 | 99 | 8.9E-27 | ||
| SUPERFAMILY | 829 | 1119 | 291 | 2.35E-124 | ||
| ProSiteProfiles | 830 | 1119 | 290 | 117.208 | ||
| Gene3D | 831 | 1119 | 289 | 4.1E-136 | ||
| SMART | 842 | 1119 | 278 | 2.6E-197 | ||
| CDD | 842 | 1119 | 278 | 2.61099E-149 | ||
| Pfam | 843 | 1118 | 276 | 5.6E-121 | ||
| SUPERFAMILY | 1242 | 1550 | 309 | 7.02E-28 | ||
| ProSiteProfiles | 1246 | 1314 | 69 | 12.842 | ||
| SMART | 1266 | 1305 | 40 | 1.6E-7 | ||
| ProSiteProfiles | 1273 | 1306 | 34 | 13.282 | ||
| Pfam | 1274 | 1304 | 31 | 2.4E-6 | ||
| MobiDBLite | 1318 | 1341 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1318 | 1337 | 20 | - | – | |
| SMART | 1346 | 1385 | 40 | 0.015 | ||
| SMART | 1510 | 1550 | 41 | 1.2 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0465300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…