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LotjaGi1g1v0497100.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0497100
Transcript ID LotjaGi1g1v0497100.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Cationic amino acid transporter; TAIR: AT1G05940.1 cationic amino acid transporter 9; Swiss-Prot: sp|Q9C5D6|CAAT9_ARATH Cationic amino acid transporter 9, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|K7MUP2|K7MUP2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0497100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:101254259..101267791) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CATTTCCGGAAGTTACTCCGGGAAGGGACCAAAACCAGCGCTCGCTCAAACATCAGGGACCATTTCCATAGTTTTCCCTA GAAATAAAGGTGTGTCAAGTGATGTAGATTTTTGGTGGCAGTCAGAAGTGTCACCTTCTTCATGACTTCATATCAACCAC CATCACCATGTAACCAGAACCATTTCCTTCCATCATGGGACTGGGTGGTGCTACTCATTCTTCCTCTTCTTCATCTTATT GCTCCCGTTTTTGGTCGTCGGCGCTCCGCTCCAAGCTCCTCGTCTCGCCGGCGGAGAAGGCTGCTCGTGACAGCTCCGGC AGGGGACTCTCCCGCCGGCTTGGTGTCCTCGACCTCCTGCTCCTTGGAATCGGCGCTTCCATTGGTGCCGGCATCTTCGT CCTCACCGGAACCGTTGCCCGCGACACCGGACCCGGTACGCCTCAAATTTAATTGAAACGCATTGTTCAAAATTTTGTCA AGTTTTGTTGTTGTTGCTATCATCATTGGTTTGCTTTAGCAAGATGAGTACTTTTAGATTGTCCTGCATCAGACATGGCT GTTTCAAAATGTGTGTATTAGTTACTTATTCCTCCCTTCCTTATTAACGGTCTACTTAGTCGAAAAACAAAATTGTTCTT ATATATCTGTTCACTTATAATTTCAAGAGAGCATTCAATGATATGTTTCCAAGTAATGCCCTTGTGAGTTGTGAGAATAA TAAATGAGAAAAAATAAAATACATTCAAAAGGGTAAAATAGGAAATCAAATAATACATTTATGAAAATCAACAAAATTAA TGTGTTTCTTCTCTCACTATTATGGTATCCTACATTCCTACCCATGTTGGTGAAATTCTATAAATTAAAGTAGAAAAGTT GGACTGAGCTAAGAGTATCTGATGGTGCCTGAGCCTGAGAACTGTCCTGTGTTTGAAAGCAGTACTGCAACTATTATAAA 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CTCAAAGATAACATTCCAAAATGGATTGGACATGGTCAAAACATTGGAAACGTGCTATCCATCAATGTCTTAGCTCCAAT TCTTGTACTGCTTCTCACTTTTATTCTCTGTCGGGGTGTTCAAGAATCATCAGTTGTGAATTCGTTTATGACAGTGACCA AGGTTCCTTTCCATCTTACCAGTTACCACTTCCAGAATATAACATTAAACATTGGATGAAAGCTGGGGCTTATGTGAGAA CAGAATCACAAGTTATTTTACTGTTTGTTGCAGGTGGTCATCGTTATTATTGTCATTTTTGCTGGAGCTTTTGAGGTTGA TGTTTCGAACTGGTCTCCCTTTGCTCCAAATGGTATGAAAAGCATATTTACAGGAGCTACTGTAGTCTTCTTTGCATATG TTGGATATGATGCAGTTGCCAATGCTGCTGAAGAATCTAAGAGACCACAGGTATATTATGTTTCGTGAGATTGCTCTGCT AGTTTATGAATTTCCCTGATGCCTTATATGCTATTTAATGTTTCTGTAGAGAACAATAATGATGTTAGAAAAAAAATTGT GACTACTTGGAGATGGTACATGGGTGTTTAGCTATGTTGGATCATTAATTCTTAGTTCCTTCATGAATATCTTGGGTGAA GGGTGATTGTTTCTTTTGGGAATGAGAATAATTTGAAGATGGCAAATCATTGTTTTACTATGCCGTTCACAATATGAAAA GCATATTTTCAGATCTACTTGTACATCAGCATAACAGTTTAACAGAAACTATCTGGCAATGGTATATTTATTTTGTGTCT AGTTTAAACTCACGCTTTCCATTCTAACTTTTTCTCCTCTTTTGTTGTCATGAATTAGTTGATGATGTTTTTTTAGGGTG TTTTTCTGAGTTTTTAAGGGAGGGGATGGGAGCGTAAGGGAGGGCGAAGGAGGGCAAGCCCTTCCCTTGTTTGGGAGTTC AAATACCCCAATTTGGAGGAAATAGAAAATATAACTGTTGGGGAGAGTCACGGCGAGGGCCCATGGGGCAAGGTCGAGGG GAAACACCAAGGAGATCTTGGACACCACATCTATGAAGACTTTCGACACAAGGAGTCGTCATGGTCCCACGAACCATCGG CTCTGATACCAGTTGTTGGGGAGAGTCACGGCGAGGGCCCATGGGGCAAGGTCGAGGGGAAACACCAAGGAGATCTTGGA CACCACATCTTAACCCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTTATGGGTCACATCTCTTATAAACTCTCCCTCTCACCTTGACTT CTCCGATGTGGGACTTGACTCCAACACTTGATTCCAACAATAACTAAGAGGGTCTTGGAGGGTATTCAAAAATTCCCCAA CCCTTCCCTTTCTTCTTATAAACTAACAAATAAGGGGAGGGCTTCTTAGAAGCCTCACCCTTCCCTTCTTCCCCCCCCCC CCTCTCTAAAACTCAACTCGCAAACCCACCCTTAATCTTTCTAATTTCTAACATTTCAGCGCGATTTGCCGATAGGCATA ATCGGAAGCCTCTTGGTATGTCTTGCGTTGTACATTGGTGTATGCTTAGTGATTACAGGAATGGTTCCATACAATCTCCT AGGAGAAGATGCTCCATTGGCTGAAGCTTTTGAATCTACAGGGTTAAAATTTGTTTCGGTTCTGATTAGCATTTGTGCTA TTGCTGGACTTACGACAACACTCCTTGTTGGTCTCTATGTTCAGGTGAATCACTTGTGAATTATAAATTAATTGTTGTGC CTTGTGGCATGTGCTAATGTACATGATGTTTCTGTTGAGCAGTCTCGGCTATATCTTGGGCTTGGCAGGGATGGTTTACT ACCCGCAATATTTGCTAAAGTTCACTCCAAACGCCACACTCCCATTCATTCTCAGATTTGGGTTGGCTGTGTTGTCAGTG 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AGGTAAAATTAATATTGATTTAATTCAGTTTCAAAAAAAAATATTGATTTGGTTCGATGTAATTTGCAACTTTTGCATGC TTAAAGGACTCTTGGCTTGTTGGGGAGGGGAATACGAAATGATTTCATGAGAAGAAGATCAAGTACTGAGGTTGTCTCAT ACATTCTGCAATGGTGACTCAAATTTATTATATATAGGGGTGGATAACAAGCTAAATATGGGTTGAAACTTGAAAACCAA TATCAAGGCCAACATGGTGTGTAAGCAGGTTTGGGCCAACTCGCGGATCCGATCAAGCCGACTTGATCCAAGTAAAATTA TAGCTCGGCTTTGGTAGGATAGGAAGGAAAAGAATCTTGATCCAAGTGAGGTCAGGTTTTGGGTCAGGAAAATTGAGTTG AGGCCTCGATCAATCTGGGCCGACTCGATATATCATTATTTTATATATCTCTTTCAAAAAAATCATTGTATATAATCTAA AACAAAAATTGATCTTTAATTGGTTTGGATCTACTTTCTCTCAAATCTGACCTGACCTGATTAAACCTCTATGTTATTTT CTCTCATTAATTCCTTTCTGTTCTATCATTTTGCTTTCCAGGTTTATGCAGCAGATTCACCAGGGTTTTCTTGCCCTGGG GTTCCCCTTGTGCCAAATGTTTGCATCTTTTTCAACATGTTCTTATTTGCCCAGGTATGCCCATGATCTCTACTATTTGA AAGTTTAGCCAGAATTAATACTGTCTTAGAAAACGTTAAAGTTAATAGTTTTAATATTTCTACATAAAAACTGACAAATG ATGATGAACTTCTGTTGACAGTTACATCATGAAGCATGGCTGAGATTTGTGATTATTAGTGTTGTTATGGTTGGTTTTTA TGCAATATATGGGCAGTATCATGCTGACCCCAGTGCAGAGGAGAATGCTGTTTATCATGAGGCACCAGAGGAAGAAACTT GATGAGTTATCAGGTCAATATTAAACAATGTGGTTTTCATTGGCCAATGGGGAGAAGGGGGTGTTGGTTAAAATGTATGT AGCAAATAAGCTATTTGTTCTTTCTGTTAGGAGTGTGAATGTCCATCAGGTATAGTCAGATTGTATATGGCACTGCCAGC AAGCATAATACATTAATACCCATTAGGGATTTATATTGCTAAATTGCATATGATAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAACTAAG GCAACCATGTGGTGCACAACACAATTTTATATTGCTAAATTGTATATGGTAGAAAAGAAAAAAGAAACTAAGGTCACCAT TTGGTGCACAACACAATTTTATGTTGGTAAATTGTATATGATAAAAAAGAAAAATGGAACTAAGGCCATCATGTGGTGCA CAACACAATTTTATATTGCTAAGTTGTATATATGTTAGAAAAGAAAAATGAAACTAAGGCCTGTATGTGATGCACAACAC AATTTTATATTGCTAAATTTGTATACAATCCCTGACCAGAAGTCCATCCATGCTCGAGTTATTTCTAATATAGAGAAGAA CTTGTAAGGTGTAGATGACAGCTGAAGACTCCTCTTCTAAAAATTTAAGTGGTATGAAAAGTTAGCAATCATCATATATA ACTTAGCAAAAAATTTAACATAAATTTTAACATAGGTTTGGAAAGACTATTACTAAACTTCTTATAAAATATGAATTTCT CTTTATATTTTTGTTGAAATCAGATTTTTACTGTGAGCATCAGCAATGCAGAACACAAAAACATAGATTGTGCAAACTTT TTATTTGTAATTATATTGAAACCTTAGAAATTAAATGGGCAGAAATCAGTTGTTTAGTTTTATAGTCCTGGATTTTAATC AAAGAATCATAATAAGTTAAAATATTTTTGGCCCATCTAAATATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGGTGAAAGT CACTTTCTCTTCTTATTTCTCTATTTTCTCCCTATCACATTACATATAAAATCTTTCATTACTCTCAAATTTCTTTGGTG GAGGCAGATTTGTATTGTGAACATAAGTTTTTCCAAAATCTAACTCACTGATGCTTTGTGTATTTGTGATGTCATACTTT TCCATGTACATTTTATTAATGGGCCAAATTTGTTGTTTCAGAAAAAAAGAAAAATTCACTTTTATTAGTCTGTGTTACCC ACCACAAAAAGAGGTTTTTGGTGGCAGTCAGAAGTGCCACCTTCTTCTAGTAGTTAACCTCTTACTAATGTGAGTACCAG CATGGTCAGAGACAGTGAGACACCTTCATCTCAAAGCATTTCAGAGAAATCCATTACTATATATTTTCCAAACCATGTGT ATCCAACAACCTTACCACAAAAAAGTCAATAACTACCATGAAGGTATCAATATTCTCAATCATTGACCCCACATTATAAT TTACACTTACCTCCTTCATGACTTTATATATCAACCACCATCACCATGTTATTTGATAGAGTGATTCTTTTTCTCCAATC TTCATCTATGGAGGTAACAATGACTTCACCCATATCAAAACCACTAAATTCCTAGTCATTCAACTTTCCTACATTATTAT GGGATTGGCTGGTGCTGCTTCTCCTTCTTCTCCATCCTCATTATCATCATCTTATTGCTCCCGTTTTTGGTCCTCGGCAC TCCGGTCCAAGCTCCTCGTGTCGCCGGCGGAGAAGGCCGCTCGTGACAGCTCCAGCAGCGGACTCTCCCGCCGCCTCGGT GTCCTCGACCTCCTGCTGCTTGGTATTGGTGCTTCCATTGGTGCCGGCATCTTCGTCATCACCGGAACCGTTGCTCGCGA CGCCGGACCCGGTATGCCTCCAATTTAATTGAAATGGGCTGTTCAAATTTTCTGTCTAGTTTTGTTTTTGTTACTATTTT CATCATGATCATCATTCTTCATGATCATTATAAATTTTGTGATTTTGCTAAGAAAAAAAGGCACAAATTATTGAAATATA GTAGAGATTAAACATTGGAAGTAAAAGAAAGAAGTATCTATGGCATTTCTGGCAATGGGAATCATTGAATGCTTGCTTGG TAAGGCTCATTCATGCCATGTAGCTTGATTGTTGACTTTGTTGTGTTTGCTATGTAGTAGTTTATCCATGAAATGTCTGG CAAGGGTACAGCTACTATTTCAAAGTTTCCAAGTGTGTATTAGTTTTTGAACACATGTTAAATACTATAAGTTATCTAAT TATTATGTATTCTCCTACCCATGTTGGTGAAAATTCTATAAATTAAAGTAGAAAGTTGGAGGGTGTAGGCTAAGAGTATA TGTTGGTGGTGCCTGAAGACTGTCCTGTGTTTGATAGCAGCACTGCAACTATTTGAATTTTTCATGCTTGATAATTAACA TGTGAGATGTAACTCTTAGTTTGCAACTTTGAGAGGTTTAGTCATTCTTGATAATGATAAAAATGGGAAGGTTGTCAATG AGAAATGAAAGCCACTGAATGCTGCTTGCTTGTCAAGGCTCATTCATGATTCATGCCTTGTAGCTGGGGTAGCTGGATTG TTGACTTTATTGTGTTTGTTAGGCAGTAGTTTATGTAACGAATGTGGGATAGCTAAAATTTCGATTCAGTCTTTTGTAAT TTTATAATGCAATCTGGAGGGTACAAATAGAACAAGTTTTCTCATTCCATTTTCCAAATTCTCTAATCTTTGCTAGGCAT CATTAGGTAAAAGTGTATACATCTTTCTTCCTCTTCGGTTTTCGCTTTCTCCCTTCATGTTATTTATTTTCATACCCACA ATGGGTTAGTATCCGTGTTTCTACGGATATGTATGTGTCTTTGACAACAACATAGATTTTCTATGTTAGACTTCTTCTTC ATGAAACTTGTATCCATCACAAATGGCTACTTTGCACCTCTTCAGAAGGGAGTACGACAGGGTATAAATTACTGTTTAGT TACATCTTGAGTAGTTACAAAATTTGATGGTTTCTTCAGCTTGCTTACATTTGCACTTCAGTCTTCTCTATTGTAATGCT ACTCGATGTGCTGAGACAGAACTATTCTTATTTCTTATTTTGAAAAATTGACCTTCATTCTGTATCTATTTATCTTTATA ACTGCTTTAAAATATCGGTCAGGACTTGTAATGGTTACTTTGCTTTTACCATTCCAAACTTAGTGGCTTATTCATGGTTT CTTTCTGTAATGCAGGAGTAACAATAAGTTTTATACTTGCGGGGGCATCCTGTGTTATAAATGCACTCTGTTTTGCTGAG CTAGCTTCTCGATTTCCTGCTGTTGTTGGAGGGGCATATCTATATGCATATACTGCTTTTAATGAACTTACAGCTTTTCT TGTTTTTGCACAATTAATGTTTGACCATCATATTGGAGCAGCTATAATAGCAAGAAGTTGTGCAAATTATTTGGTAGAAT TTCTAGAGCTCTTCTCTTTTTTCAAAGATAACATTCCGAAATGGATTGGACATGGTGAAAGCATTGGAAACGTGCTATCC ATCAATGTCTTAGCTCCAATTCTCCTACTGCTTCTCACTTTTATTCTCTGTCGAGGTGTTCAAGAATCATCAGTTGTGAA TTCGTTTATGACAGTGACCAAGGTTCCTTTCCATCTTATCCGTTATGACTTACCAGAATATAACATTAAGCATTGGATGA GAGCTGGGGTTTATGTGAGAACAGAATCACAAGTTATTTTACTGTTTGTTGCAGGTAGTCATTGTTATTATTGTCATTTT TGCTGGAGCTTTTGAGGTTGATGTTTCCAACTGGTCTCCCTTTGCTCCAAATGGTGTAAAAAGCATATTTACAGGAGCTA CTGTAGTCTTCTTTGCATGTATTGGATATGATGCAGTTGCCAATTGTGCTGAAGAATCTAAGAGGCCACAGGTATATTAT GTTTTGAGAGATTTCTCTGCTAGTTAATGAACTTTCCTGATGCCTTATGTGTTATTTAATGTTTATGTTGAGAACAATAA TGATGTTAGAAACAAACTAGTGACTACTAGGAGTTTTATGACTGCTGCTAGGTGCCATAGTTTATTGTATACACCTTGCC TTCAATTATCTTAGAAGTAAATAGTAACTATTCAGATTTAGTTGTAGTTACTAGTTACCACTTACCATCATAGTTATAAA TTAACTTCAGCTCATTTTGTAAATGTACTTGTACACGCGCATAGCAGTTTAACAGAAACTATCTGGCAATGGTATATTTA TTTTGTGTCTAATTTAAAGTCACGCTTTCCATTCTAACTTTTTCTCTTCTTTTTGTTGTCATGAATTAGTTGATGATGTT TTTCTTTTTGGGTGTGTTTCTGAATTTTTAAGGGAGGGGAGCGTAAGGGAGGGGGAAGGAGGGCAAGCCCTTCCTTGTTT GGAAGTTCAAATCCCCCAATTTGGGGGGAAATAGAAAATATAACTAAAAGAGGGTCTTGGTGGGATCTTGGAGGGTATTC GAAAATTCCCCAAACCCTTCCCCCTATTCGAAAAACTCACGGACAAGGGGAGGGCTTCTTGGAAGCCTTGCCCTTCCCTC CCCTCCCCTCCAAAACTCAACTCGCAAACCCACCCTTAATCTTTCTAATTTCTAACATTTCAGCGTGATTTGCCGATAGG CATAATTGGAAGCCTCTTGGTTTGTGTTGCGTTGTACATTGGAGTATGCTTAGTGATTACTGGAATGGTTCCATACAATC TCCTAGGAGAAGATGCTCCTTTGGCTGAAGCTTTTAAATCTAAGGGGTTAAAATTTGTTTCTGTTCTGATTAGCATTGGT GCTGTTGCTGGACTTATAACAACACTCCTTGTTAGTCTCTATGTTCAGGTGAATCACTTGTGAATTATGAATTTAATTGA TGTGCCTTGTGGCATGTGCTAATGTACATGATGTTTCTGTTGAGCAGTCTCGGCTATATCTTGGGCTTGGCAGGGATGGT TTACTACCCCCATTATTTGCTAAAGTTCACTCCAAACGCCACATCCCCATTCATTCTCAGATTTGGGTTGGTTGTGTTGC TAGTGTTTTGGCTGGACTGTTGAATGTGCACATGCTCTCACACATTCTTTCTGTTGGTACACTGGTAAGTTTTGATTTCT TATTTCATGGTATTCAGGTTGTCAACAAAATATATGTATCCACATTATTTTGTATGATGTGGTGTCACATGACACTATCA TGTTGCAATTCTATATCTATCTTTCTCTTCAAATATTAAATAGTTTGAACCCTTTGAATATTTATGAAGGAAGAGATAGA CGGAAAGTTTCACATGACAATGTCATGTGGCATGATAAGATCCCGATCCCAGTGGTTGTTTAACATATATTCAGATAACG TGCATCATCTTATCTATGTAGGGAATAATACAACATGGTGTACCTTGACATTGAGAAGAGTGTAATTGAACAATGTTTGC AAATATTTTTAGTTAATGCCCCTCACATGGTATTTGCACTTATTTCAGACTGGCTATTCCGTTGTTTCGGCATGTGTTGT TGTACTTCTCTGGAAGGATAAGACAAATAGTCAAGTATCACCTTCAGCAAAGAGGGAAGGTGTAATTTGCCTCATTGCTG TTGCTGTTTCTGGATTTATTGGGGGGCTTTTTTTCCGCTATGATGCTTCACCTATTTTGCTGATTCTGGCTATACTTGTT GGAGCTGGTGCTTCTACTGCTCTTCATTTCCGCCAGGTGAGTGTTCTTTTGCATTTTATTAACTGTTTGTTGCCTGGACT CCTTCAATACGCTTTTGTTAAAAAATAATTAATTTGATATAACATGGCATAGAATACTAGTTGAAAGCATTAAGGGATAT CTAGTTATAAAGTAATTCTGCTTTAGTACAGGAGGGAAAGTAGTTTGCTGCCTTCTTCTTTCCTGGATCATGTAACACAA GCAATATCCCATACATTACACCAGTATTTTTGTGATATATAAAACATTAAGTTAAAAAATATTTCAAAGGTTCATGTGAC TGATAAAAAGATTACTTTCATGGTTATATAAACCTAAACTGAAGTTATGGACATTTAAACTTTGTAATTTATAGTATCTT AAAATTTATTTTAATGACTATTTGCAATATTTATATTTAACATTGGTTGAAGATTTTTTAAAGCACTACTTAAAGAAATT AGAAAAAGTAGAAACCTTCTTTGATTGAATAACTAATCAAAGGTAAAATTAGTATTGATTTGATTCCATGTAATATGCAA CTTCAGCATGCATATCACAACATGGCAAAGACACGTGGCTTGTCGAGAAGGGGAATATGAAATGATTTCATGAGAATAAG ATCAAGTACTGAGGTTGTCTCATATGCTCAGCAATGGTGACTCAAATTTATTATATATAAGGGCGGATAACAAGCACAAT ATGGGTTGAAAACCAATCTTAAGGCAAACATGGGGTGTAAGCAGGTTTGGGCCAACTCGCGAATCTGATCAACCCGACTT GATCCAAGTAAAATTGTAGCTCGGTTTTGGCAGGATAGAAAGGAAAAGATTCTTGATCAAAGTGATGTTAGGTTTTGGGT CAAGAAAATTGAGCTAAGGCCTCGAACAAATCATTTTAAAAAAAATTATTTTATATATTCTAAAATCAAAATTGATCTTT AATTGGTTTGGATCTATTTTCCCTCAAATCTGACCTTACCTGATTACACCTCTATGGCCAACCAACAGTTTTGCTAAGCT TCCCGGACCTCTTAACTTAAAATTTTGTGAAATTCATGTGTGTTGCATTGCATTGATGTTATTTCCTCTTCATTAATTCC TTTCTGTTCTATCATTTTTGCTTTTCAGGTTTATGCCGAAGATTTACCAGGGTTTTCTTGCCCTGGGGTTCCCCTTGTGC CAAATGTTTGCATCTTTTTCAACATGTTCTTATTTGCCCAGGTATGCCCATGCTACTTTTGACAAATTAGCCAGAATAGT ACTATATCTTTTTTTTTGGTTACAGGAGGAAGAGTGAATAGTACTATATCTGAAAAGACTAAAGTTAATAATTTTAATAT TTATTCATCAAACTGACATGATGATGAACTTCTGTTGACAGTTACATCATGAAGCATGGGTGAGATTTGTGATTCTTAGT GTTGTCATGGTTGGTCTTTATGCAATATATGGGCAGTATCATGCTGACCCCAGTGCAGAGGAGAATACTGTTTATCATGA GGCACCAGAGGAAGATGGTCGATGAGTTATCAGTTCAATATTATAAACAATGCGGTTTTCATTATGGCCAATGGGGAGAA GGGGGTGTTGGTTAAACTGTATGTAGCAAATAAGCTATTTGTTCTTTCTGTTAGGAATGTGAATGTCCATCAGGTCTAGT TAGATTGTATATGGAACTGTCAGCAAGCATAATATCCATTAGGGGTTTAAATTGAGGTTGTAGTCGTGGTTATGTTGCAA AGAAGTGCAGGTTGGTGCGGCTACAATAGCGGTCGTGTTGCCGTTGTTGGGACTCAAAAACCCTTTTACATTGCGGCAGC AATTGTGTCAGGACCGCAATTTGAAATCCTGCTTTCCCTCAAATGGCTCCTCCTTTCAACCCCAAGTCGAACATATGTAT GATGTATCTCTTGTAGTTTACAACTTAGTTGAAAAGAAAATTATCATGTACCATTTTCATATGTGAATGTTCAGTTGATA CTTTTTGATGTGTTCGTGCCTTACATTTTTTCTGTTTTTTTTTTTTCAATGTATATAATATTTTAGTTTAATATCAAGCA TCAAATCATGTTT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0497100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGACTGGGTGGTGCTACTCATTCTTCCTCTTCTTCATCTTATTGCTCCCGTTTTTGGTCGTCGGCGCTCCGCTCCAA GCTCCTCGTCTCGCCGGCGGAGAAGGCTGCTCGTGACAGCTCCGGCAGGGGACTCTCCCGCCGGCTTGGTGTCCTCGACC TCCTGCTCCTTGGAATCGGCGCTTCCATTGGTGCCGGCATCTTCGTCCTCACCGGAACCGTTGCCCGCGACACCGGACCC GGAGTAACAATAAGTTTTGTACTTGCGGGAACATCCTGTGTTATAAATGCACTCTGTTTTGCTGAGCTAGCTTCTCGATT TCCTGCTGTTGCTGGAGGGGCATATCTATATGCATATACTGCTTTTAATGAACTTACAGCTTTTCTTGTTTTTGCACAAT TAATACTCGACTATCATATTGGAGCAGCTACTGCAGCAAGAAGCTGTGCAAATTATTTGGTAACAATTCTAGAGCTCTTC CCCGTTCTCAAAGATAACATTCCAAAATGGATTGGACATGGTCAAAACATTGGAAACGTGCTATCCATCAATGTCTTAGC TCCAATTCTTGTACTGCTTCTCACTTTTATTCTCTGTCGGGGTGTTCAAGAATCATCAGTTGTGAATTCGTTTATGACAG TGACCAAGGTGGTCATCGTTATTATTGTCATTTTTGCTGGAGCTTTTGAGGTTGATGTTTCGAACTGGTCTCCCTTTGCT CCAAATGGTATGAAAAGCATATTTACAGGAGCTACTGTAGTCTTCTTTGCATATGTTGGATATGATGCAGTTGCCAATGC TGCTGAAGAATCTAAGAGACCACAGCGCGATTTGCCGATAGGCATAATCGGAAGCCTCTTGGTATGTCTTGCGTTGTACA TTGGTGTATGCTTAGTGATTACAGGAATGGTTCCATACAATCTCCTAGGAGAAGATGCTCCATTGGCTGAAGCTTTTGAA TCTACAGGGTTAAAATTTGTTTCGGTTCTGATTAGCATTTGTGCTATTGCTGGACTTACGACAACACTCCTTGTTGGTCT CTATGTTCAGTCTCGGCTATATCTTGGGCTTGGCAGGGATGGTTTACTACCCCCATTATTTGCTAAAGTTCACTCCAAAC GCCACATCCCCATTCATTCTCAGATTTGGGTTGGTTGTGTTGCTAGTGTTTTGGCTGGACTGTTGAATGTGCACATGCTC TCACACATTCTTTCTGTTGGTACACTGACTGGCTATTCCGTTGTTTCGGCATGTGTTGTTGTACTTCTCTGGAAGGATAA GACAAATAGTCAAGTATCACCTTCAGCAAAGAGGGAAGGTGTAATTTGCCTCATTGCTGTTGCTGTTTCTGGATTTATTG GGGGGCTTTTTTTCCGCTATGATGCTTCACCTATTTTGCTGATTCTGGCTATACTTGTTGGAGCTGGTGCTTCTACTGCT CTTCATTTCCGCCAGGTTTATGCCGAAGATTTACCAGGGTTTTCTTGCCCTGGGGTTCCCCTTGTGCCAAATGTTTGCAT CTTTTTCAACATGTTCTTATTTGCCCAGTTACATCATGAAGCATGGGTGAGATTTGTGATTCTTAGTGTTGTCATGGTTG GTCTTTATGCAATATATGGGCAGTATCATGCTGACCCCAGTGCAGAGGAGAATACTGTTTATCATGAGGCACCAGAGGAA GATGGTCGATGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0497100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGLGGATHSSSSSSYCSRFWSSALRSKLLVSPAEKAARDSSGRGLSRRLGVLDLLLLGIGASIGAGIFVLTGTVARDTGP GVTISFVLAGTSCVINALCFAELASRFPAVAGGAYLYAYTAFNELTAFLVFAQLILDYHIGAATAARSCANYLVTILELF PVLKDNIPKWIGHGQNIGNVLSINVLAPILVLLLTFILCRGVQESSVVNSFMTVTKVVIVIIVIFAGAFEVDVSNWSPFA PNGMKSIFTGATVVFFAYVGYDAVANAAEESKRPQRDLPIGIIGSLLVCLALYIGVCLVITGMVPYNLLGEDAPLAEAFE STGLKFVSVLISICAIAGLTTTLLVGLYVQSRLYLGLGRDGLLPPLFAKVHSKRHIPIHSQIWVGCVASVLAGLLNVHML SHILSVGTLTGYSVVSACVVVLLWKDKTNSQVSPSAKREGVICLIAVAVSGFIGGLFFRYDASPILLILAILVGAGASTA LHFRQVYAEDLPGFSCPGVPLVPNVCIFFNMFLFAQLHHEAWVRFVILSVVMVGLYAIYGQYHADPSAEENTVYHEAPEE DGR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 48 48 -
PANTHER 7 558 552 7.3E-283
PANTHER 7 558 552 7.3E-283
Gene3D 45 489 445 1.4E-108
Pfam 49 460 412 2.3E-51
TMHMM 49 71 23 -
Phobius 49 70 22 -
Phobius 71 81 11 -
TMHMM 81 100 20 -
Phobius 82 104 23 -
Phobius 105 115 11 -
TMHMM 113 135 23 -
Phobius 116 136 21 -
Phobius 137 176 40 -
Phobius 177 199 23 -
TMHMM 180 202 23 -
Phobius 200 205 6 -
Phobius 206 227 22 -
TMHMM 207 229 23 -
Phobius 228 246 19 -
TMHMM 239 261 23 -
Phobius 247 268 22 -
Phobius 269 279 11 -
Phobius 280 306 27 -
TMHMM 282 304 23 -
Phobius 307 325 19 -
Phobius 326 349 24 -
TMHMM 327 349 23 -
Phobius 350 381 32 -
Phobius 382 400 19 -
Phobius 401 405 5 -
TMHMM 402 424 23 -
Phobius 406 424 19 -
Phobius 425 439 15 -
TMHMM 439 458 20 -
Phobius 440 458 19 -
Phobius 459 463 5 -
Phobius 464 483 20 -
TMHMM 465 483 19 -
Phobius 484 494 11 -
TMHMM 493 515 23 -
Pfam 494 543 50 3.7E-15
Phobius 495 515 21 -
Phobius 516 520 5 -
Phobius 521 539 19 -
TMHMM 522 544 23 -
Phobius 540 563 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.
Molecular function Transmembrane transporter activity Enables the transfer of a substance, usually a specific substance or a group of related substances, from one side of a membrane to the other.
Biological process Transmembrane transport The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0497100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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