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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0575200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0575200.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Copper transporter, putative; TAIR: AT2G26975.1 Ctr copper transporter family; Swiss-Prot: sp|Q8GWP3|COPT6_ARATH Copper transporter 6; TrEMBL-Plants: tr|I3T3C3|I3T3C3_MEDTR Ctr family copper transporter; Found in the gene: LotjaGi1g1v0575200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:110978544..111009341) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATGCTTCCCTTTCCAAAACCCCTTTACTTCACTCACTCACTCACAGTCATGCGACCACCGAGAATTGAGACGGTTATT GCGGCGGCGCAATTGCTTCCGCCGGTGGCGTCTTTCAAATCCCTAGAAGTAGAACACGCTGATCGCTGCTTTCACTCACT CGTCGACCACGCCGTTTCTTGGCTTCCACCCTCAACCAACCTTCAATCGCTGCTTTCACTCACTCGTCTCTCTGTTTTCT TTCATCTTCTTCGACCACGCCGCACAGGTATATGCTTCCCCCCTCAACAAACCTTCAATCTCAACCCTAACATTAGGGTG AATATTCACTCATGGCTTTCTTGATTCAATAGGAAAGGATCAAAAGATTGGGAGCGACAACACCGCTCCTCCTCCTCCGT CTCCGTTCTTGTTGTATTCACCGTGTCCAGGTAACCTTTTCTTTTTGCAATTGTTGCCTCTAGGGTTATTCAACACTTCT TCTTCCATCTTCTTCGTTTTCTTGCTCTGAATGTTATTAAATCAAGATTTTGATTTCTTTTTGGTATTTTGATGTTTCTT CCACTTTTCATTGTTTGTAATGTTTGGTATAGTACATGTTACATGTTTCTTCCACGTTTTCTTGCTCTGTCATGTATGTT TCCACTCCATGGTTTAGATTTCCATATCCACTATAATTTAACTTGCTTGTGTTACCGTGGAGAAACTAATTAACTACTGA GCCCCTTGTACCAATTACAATGGTGAGGAATGTAGTTAATTCTATCCCAGGACTTAGGAAATGTCTAGATTTACGGCAAT AATTCTATAATTACTGAAATTTAAGAACTTTATTGCTGGCTGCACATAGCCACTTCGTGATTCATAAAATATTAATATCT ATTAGACATTAACTGTATAATATCTCAAAGTTAAAATATTACTTCTGTTGTATTTTTTCTCTCTATATGCATGAATGTCA 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TTACCCGAAAAATATAATCTTCATTACAAATCGAAGAAACCCATGTTTGAGGGTGGGGATTGATTCGAGAAAACCATGTT AATTGATAAAATTGACGAATCATAAAAGAAAAATAGTTAAAATTTGGGAAATAAACCCTAATTCTCCTCACTCACCCCCC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTTGTTGGATTTGCAGATGAGGGAAGA TTCAAGAAATGTGAGGGTGGGAGAAGAAAGATTTGCTACTAGTGGGGACAACACAACATATCCCTACCACCATCGTTCCA CAGCTGTGTGGGTTAAACCATTTTCGTCGATCTGGTGAGGAAGAGAGAAGAAGGGTTTAGAGTTAGAGAACAAAACGCAG AATTGAATGATTGGGATTTGAATCAGACCTGCGCTCCCATCTCAGATCTCTTTGTCCCCTTCCATCGCCATAACATCAAA GGAAGCAAAACGCAACATGCCGACTTGCTTTGTGAGTGAAACGAACCAGTATAATAGTTGTACCTTTGTGCCAGATCGAC GACGACAGATCTGAAATCACCAACGCAATTCCTTCTTCCTGAACAAGTTCAGTTTTTGAAGGTGCAGGACGATTCGTCCT CGCTGTTCCGGCGCAGGTGGATAACTGTGGGTTGGTTGGAGAAGATGAGGAGGGGTTATAAATTTACATTTTTATCATTT TCATCATCATTCAATCCTAACCATCCAATAAAAGAATATTCTAAGATTCTCAGATCTAACGGCATATGATAATGGTCCAC CGGTGGACCAATAATAAAAGTGTCCACCCTAGTGGGCACCCATTTTTTGCATTGAAATCATTTTGTACTTATTTGCATTG AAAATCTTTTAGCATAAGTTGGATTGATACTTGATTGCATTGAAACATTTTTAGCATAAATTTGCATTGAAATTTTTTTG CATATTTTATATTGATACTTCTTTGCATTAAACTTTTTTTTGGCATTCAACTCATTTTGCACTTATTGTGAAAAAAGAAA CAAGAAAGCACATAGAAGGAGGTGAGATAGTGAGCACCCTTCTTCAAGGGGCAATTTTCGAGAGAGAAATGTTTTACTTT GTGTTGAATGTGAATTGATGCATAGGTTAAACAAACAAAGAGAGACATTGTGTTATGTTGGGTTACAGTAGCACTGATGA CATGGTAAATATTTTATTGAGTTTGACATACGGAAAGTGATTTTATTATGTGACTAGGTGCCATAAGTCAAATGGTGGGT AACTAGTAGTTGAACTTGAATGGTTTTATTATGTGACTAGAGAGACAAAGGGGATATTTTCGGTAAGAGCTTATCTAGTG ATCTGTAGTTAAAGATAGTTGCCGGAAGTCGATTGATGAGGTTAACTAGATAATGTACAACGAAGGGACTGTAAATTATT GGTAAATGAATATAATATAGAAGGGCCCTTGTCAAATTTAATGTCTCTGTGTTTTCTTCCAATAGTGGAATTTTATTTTT GGGTTTGCACAAGAGGTTTGATGAATAATGCATATACTATTATATAAAAATATGGCATTTTGAACTCTACTCTGTTATCA GAACTTGTGGTGTCATTTTGGTGTCAAGTCGGGCTGCCTCTAAATTGATAAATTTACAAATTATAGATCTGGTTTCATAT TTGGATTTTGTAGTTATAACCAAACGTGTCCTGTGAATCATCAACAATTGATAGTAATGGTGACCATTGATAGAGGGCAT AGAAATTGAACCCTATATATGTTTATGCGAATTAAATTAAAAGCTTTATTTGTTTTGGTGGCATTGATAGAAAATGGTTA TTTGCACTGCGTATCTAGGTGATAATAAATTACATGCACTAATTTTCTTAGTTTGATTTATGGAAAATGATTAGAGTTGT GAAGTGCAGTAGATGAGGGATGTCATGATATGTGGTGCCATAAGTTAAATGATGGGGAGGGGATTGCTTATAGTATCTAT TTACGTGAAAGGTAAAAGTAATATGTTGTTGTAGAAGGTATTAAGTCGATGAACTTTAGCTTGCCCCTACAAAATACATG ATAGTGTAAAAATTAGGTGACAAATTTGTACTTTATGGATATTACTTTATAGATGGAGATAAATTTGTACTTAAGAGAAG GAGCATTTGAGACATGGGTTAGATAGAAGTGAGAAAATAAGATGGATCCTGAATTATTGGCATTTAATGGTAGGTTTATA TGGCAACTTGATATTGATAAGGGTTATGGTCGTATAAGTGTAGAAAAGAGACAGTAGCACCCGTATCTAAGACCTGAAGT ACTGAGGTAATTGAATGTTCTTATTGTGTGACATGTGAGATTGTGTTATGCTGGATTTCAGTTGCATTGATGTGCTAGGT TATCTATGATGCAAATCAATCTTAGAACTTTCATCAATAAGAACTCCTGTAGTGATTTATAGTTATGAATAGATGTGGGA AGTCAATTAATGAGGTGAACTTGATGACATACAATGAAGGGCCAAAAATAATCATCGGTGAATGAAAATGATAGAGAAGG GTCTTAGTCACATTTAATCGGTTTGAACGCACACGAGGTTTGATGAATCATGCATTTGGTATTAGATAAATTTTGCATAT TGAATTCGACACCATTTTCTGACTAAGACCATATGATGTTAATTTTGGCGTCCAGTTTGTTGGCCACTAAATTGACATTT GCGGAAAATAGCTCTCGTTTCATATTTGGGTTTAGCAATTATAACCAAATGTGTCTGTGAAATCATTAACAATTGTCAGA AAGTAATGGTGAGATGTGACCATAAATTCAGGATGTAGATAATCACCCCTATATGTCTATTGAATTAAATCAAAAACTTT ATTTGTTTTGGTGCCACTGATAGAAAATGGTTATTTGTGCTGCTTATTTAGGTGACATGAATCAGGGACACCATTTTTAT TGAGTTAATTTGATGTGTGAATAAAATTTACAGAGTTGTTGAAGAGTATTAGGAGAGGGTTCTCCTAGTTTATGGTGCCA TAGGTTAAATTGATCGGGTATTGGATTGCTTATAGCATGTATTTCCATGGTGAAATTCAGCATGCCTAATCATACTTGAG GAGTAAATGTTTTGTAAAATACAATAAGATGGTGTTGAAATGGGTGACCTGTGTTAATTATTTTAAGTTATGGTTTTCGA ATGTCGACTATTACTTACGTGTGTGTTTTTGTTCAATTTTGAAAAGAGTTTTTTATTTCTTAACATACAAGTGGAGAGAG ATCTTGACATCTCTTTTAAAATAAGTGAATTTCCGATGTGAAGTATGCAGAAACCTTAGCTTAAAGCTCAGGCACCTTGA TATTTAGCACACAGTGACAAAAGTATATATGGCAGACCATTATTAATGTAAATGACTACGGATAATCTATACTAGTAGTA CTCACTTGAAGAAGCCGTGGGTTTGCTAAACATTTGTTTTGACTCTGTATCAGCTAAAATGGAACATCACATGATGTTCT ATGTTTTATGTGGAACAGTATAAATAGAGGTGTTTAACTGGTTTTGTCTAGGTAACTGCAGGAGAATATCTTTTCTCGAA GCAAGTGACAATAAAGGAGATGCCAACATGAAAAAAATTTCCGGAAGGGATAATTGAGGCTAAAAGGTTTGTTGTATTGT TATCTAAATGTAGCTCATTTTGCACTGTCTTGATATTCGATTTTTTTATGAGAATTAACAAACACAAAATAATGGCTTTC GTATCCCTTATTTACAACCATGAGTTATATAAGTGGAGAGAGTCCTTATAAACTTAATGCCTAAAGAGGCAGTGAAAGGA TACTTGGAGGAGTCATGTCTAGTACTCAATGTCTAACGAGTCAGTGAAATAATACAGGAGAAGTCCTTATAAACTAGTGA GGCAGAGTCCTTATAAACTCGTGAGGATGAGTCCTTATAAACTCGATAGGAGGAGTCTTCCTTATAAACTCGTGAGGAGG AGTCCTTATAAACTCAATACCTAAGGAGGCAGTGAAATAATACTTGAAGGAGTCCTGGATAATAACTCAATGCATGAAGA GGCAGTGAAACAATACTTGGAGGAGTCTTGAACAATACTCAATGCCTGAAGACAGAGTCAAATAATACTTGGAGTAGTCC TGTCGAATACTTATTGGGAGAAGTCATGGTGAATACTTGTAAGGAGAAGTCCTTGATACTTGCATAGTGAAATCCCTGTG TTGCAGGGGACTGGATGTAGCCCTATTATTTTGGGGCGAAACAGTATAAAATTGTCTGTGTGCATCGTCTACTTTACTCT CTCTCACTTCCGCTGCACCAAACGATATTGACCACGAGAAATATCTCTCTATTCTTTGGAAATCCAAAATTTTGAACGAC ACAATTCAAACCCCATTTTCTTGTGCTACTCTGATTTCAACTTCACACCCTTCTTTTTCTTTTTTCGAATTTTATAACCC TTTTTTGTGTTGTTTCATTTTCATTGATTATTCTAGAATGGGTATATATACATATATATTTTTTCCCAATTTGTTTAAAG CCTCAATTTAACATTAACAAATGACACAACACAAAACAAAAGTGTCAAAGAAAGATTAAATATCTATGCACCGTTAGTGT AAATTTTATTTACACTTACATTAAATTGAATTTCGTCAAATTAGAAAATATGTTTCTATTTTATTTTAAACTAAAAATGA ATATAACTATCTCTCTTACGTGACATATATTAATTGAATGCCAGTGTAATATAGTTTTACACTGACTGTACATGTCCATT AAACAAAAAAATTAAACAAGTGGTAAAACCCAATGAAACCCACATTAGCCATCAATTGTTTTTGGGTTAAATATGCTATT CGTCCCTGAACTTAAGCGAGATTTTGGTTTCCACCACTGTACTAAAATTTCATAGTTTTTCATCTCTTAACTTTTTAATC TGTTTGATTTTCGCCCTTTGACCAGTTTGACTGATGATTTGACATGTCAACATGTAGGTAACAAGTGATGTGTGATGATA CGTGTAGGTTTTAGCTGATGTGTTAAATTTTTTTAAATTAGAATTTTTTGTATCCCACCTAGGCTCAATCACATAATTTA TTTTTTTACTAAACCCAAATCATTTCTAGGGTTCTTAGTGAGATCAGAGGCTAGGGTGGAAACCAAAATCTCGCTTTAGT CAGGGACGTTAAACAGTTTTAATTTTTTTTATCATACTTTCCAGAATCCGACAAATCCAAATCATTAGCCCAACGAGAGC GGTCTTGTATTTTATTTCTTAAAATAAGATCAGATTGAGCTTTTATGGCCCGAATCTAATTCAATCTGACCATTGCCAAG CTCTGTATAATGGGCTCTCGGCTCTTTTGAGTTGAATGATATAAGCCGTTTTTCTTATAAAAAAATTAGAAAACATTCAA AGAATATCTATAACTTCGACAAAAAATAATAATAATAGTAATCAATTACTTAAAAATTAAAAATTGAATTCATGGTGGGT CCCGTTCTGCTGAAAATCCTAGCTAGAAGGTGAGAACTAAAGTGCTAGCTAATAGCCTCTTTTTCTTTAATTTCCCTTTC CGATTTCTTTATCAGAGAAATGTTTACATTTTATAGTACATATATGCTGGCACGTTTGCTTGCATATGAATTATGGAACC ATCTTTATCAACAAGAATAATATCTTCATGTTCTATTCTTTCACGTCCCAACCTAACAGACAAGGTTTCCATGCATATAT ATAATGTGCAAAGTACAAACCATTATCAATTTATACTACTCCATCACCTCAATATGTCGTACAACTCCACGGGGGCGACA CGGCTGGGGCGACGGAGAATCCCCATACACACGACCCTCTACTGGGGCTACAAGGTGAACATACTGTTCCATTGCTGGCC CGGAAATAGCGCCGCCATGTACGCGGTGGCGCTAATGCTCGTGTTCGCCATGGCGGTATTGGTGGAGTGGCTTTCCTTCA CCAACATTGTGAAGCTCAAGCCCGGGGGTTCAAACCACGTCGTTGAGGCGCTCCTTAAGACGGGGCTCTACGGCGTGCGT TCCGGGCTTTCTTACTTGGTAATGCTGGCCGTCATGTCGTTTAATGGCGGCGTTTTCCTCGCCGCAATTGGCGGCCACGT CATTGGTTTCTTGATTTTCGGTACGCAGGCCTTCCGGAAGAAGTCATTAGGCGGATTGGATTCTTCAAAACTGTAGAATT TGGTCCGTTTGGAAAGCAGTGACGCGCTACCGTTGGATGGATATGAATCCAGCGATTCAAAACTGATTCATCGTTAGGGT GTTCTTTTTTCTGAATTCTTGGTGAAATTTATTTTACAAAAATGGTACCAAAATGTTGGACTTCTGCCTTGCTGCAATGC CAACCTGCCAACAAAAAGATAGTATGTTGGTGTTTTTACTTTTGAGTTACAAATAACAAGAATTGTCATTTGACACGTAT TCAACACTTGGTTGTGTATACTCATATTTTAAGTTTAATTGTGAAGTGCAAAATAAGAGAACATTTATGCAATAATGTAT TTTTTTTTTGGTCAAAGCAAAAATGTATTTTCATCTGGGGTCGTTTCAATCATTTGGGATGCAGTGGTCAAATTCATGCA ATAAAGTTGAAAATTTACTTATTTTAGTTTGTGTTGTGTAGGTCGCTAATTAAGTGAGCCCACTGCATATTGTCTAAAAG ATCGATAAAAAAAAAAGGAATAATTGAAGCTTTGATGTGCCGTAGCCCATATGCAATTAAAGGATTTATACCCTTATTAT TTATTAAACCTTGTCTGCTACTGTCACGTGAGAGAGGAAAAAATAAATTAGAATTCTCTAGATTGAGAAATTGGAGAGCC ACCAAATAGGAGGGAGGCAGAGAGATTAAAGTATCTATCATCATGTATCTAGTGAATTAATGCCCACAGTTTGTGAAAAA AATTTGAAGGATTTGAGTCTAAAAATGCAGAGAACAAGGTATTCCTAATTTAGAGATGGGTAAATTTGAAGTACATGAAT GGTTCTTCAGTGGCTAAGCATATGAGCAGTTTATAAAAAAATTGTGAATCAATTGACTACTGTAGAGGTTCCTTTTCTGA TGATCTCTTTGAATTGTTGTTGCTCATTTTAAAACTTGCTCTCATTTTATTGTTGGTAAAGAACATAGAATTTCTTTCCA TGCTTACCCTTGAGCCTTAAGTGACTTTTGAGTCTGATTACTTCTTTTTATATATATATATATATATATATATATATATA TATATATATTATTTATTTATTTGTGGGTTCTGTCAACTTGTGGTCATAAGTTATGCATGATATCTTTTGAGAAAGCCCTT TGAAAAACAAAACAAAAAATTCATTCGCTTTTTATTATGACTATTTTACGAAAATGTTTACATGTTTATTTTGGAAGGGT TACTATTGTGCCCACAAAATTTTTGGTGTTACACTCTATATATAGCACAACTCTTTCCTCCTTGAGGCGAATACAACAAC TCTGCGGTCATGAACTTTGCTTAGCACTACCATATTCCTAGGTATGTGAATCTCCAATTGCATTTGCATTACTCAATGCA ACGTTAGCATATACAAAATCCCATCATATTATCATATTGGCCATGGGCATAAACATATAAATACATGTGTCACACTCATA AATATATCATCAGGCATTCACATATATTCACACTGCAACACACATTCACATTACATCACGCACCATTAGCAACCTTAGAC AACCAATAGCAAGCACCCCCGTGATAACATAAACCTAGCTTTCAGCCAAGAGGTAACCCCTCCTACCTAACTTGGATTCG ATTGCAGATTTGCAGGTTCTTAAGGGTTTGAAGGTTCCTCTTTCAAGTCTTAGTATTCTCAGGATGTTCAGTGTTCGCCT TCTTATCCAAGATCACGTATCAGGTTAGCTCTGCAACGAGCTTTAATATCTCAAATATCATTTTTAGATATAGCACGTTA TATACAACTTTGGGTTATTCTCGGCCTCCACTACCCCTTATAAGCTTAAGTTTAGGGTTCTTAATCACTTTCTTATTCAA TGATATTCATTTCACTTAACTTATCCATTTTAACCAAATATTTCATTAATCTCTCATTCCATGCCCTCTTCCTTTGTTTC ATTAAACCTAATTTTGGTCTTGCATATCCATGAACTATGTTAAACTGACTTAAGTTAGCATCTCATACTAGGGTTTGTTA TTCACTAATCTTATTTAGTTTTATTAAATTTAATTAATCATGAATTACCTACATTAACCTAAATTAATTAATTCTCATTC TAATCATCCAATTCCTCCCTTAATCAACATATGTAGCGTACCTATCTAGGAACATAAATTACTCTATCATACACCCTAAG TTCTGTTCGTCCATCAAAGTTACCATTGTTAAGTTCCTCAAGCTGAAAATTACAGCTTCCATGGAAAAACTCATGACTTA GCTTTTCTTCTCTGTTGTTCAAATCCAAAGCACTTTTAAGTTTACATATAACATAATTCAGTAGGTTCTGTGGCAAGGAT TTGTGGTGTTCATCACCTTTAAGGTGTTGATGATAGTGGTCGAGGAGGGTGAAACTTTTTTCTCCTCCGCTGGCTCAATC TTTCCTTCCCTGACCTCACCATTATCGTCTACGTGTTTTATTGAATACATTATGATACACATAAGCTATTTATCGTGTCA ACTTGACCCTACATGCACAAAACTAAGCATGTATATTCATTTACTTGGTCAACTCAAAAATGCTATAACCATGGCCTAAA ACTACATTTTTCCTATTTATAATCATTGAAATAAGCTCAATGATTGATTAGGAACGGAAGATACCTCGAAAATTGAATTC TGGAAAATTTCCAGATTTGAAGGACACGAGCCCAAAAATGCTTCAAACGCGACCACAGTGATGCTAAACTCACCAGAATC GACCTTTTCACGCCTAGAAACACTTTGACACAAGAACTTTAGGGAACTCAACAAGGATTTCAAAGAACAAAGAAGAGAAA GAAGATGGCCATGGAGAGGATTTCTAGTTCTAGCTAGTTGCAGAGAAATAGAGTTTTGGGAAGGCGAAAGGAGGGTTCCA TGGCTTAAGAGGGGGTGTATTTCTTAAAGGATTTAGGAGAGGGAGAGGTGCCAAGTAGCCATAGTGGTGTTTCCTTCACC AAGTGATTTTGGCTCTCCTTTGTCACCAGCATGTGACTTTAGACTCCTCTCCAATTACCTTTAAATTCTAAATAAGTCCG TAATTAATTCAGAAATTTGTTTCTTCCCCCATAAAAATAATTATGTAATATAGTGAAATCGAGATGTTATACCACACGAG ATTCCTTCTCCTTTTTTCACAGTATTCACATATTTTTATGTGAATATTGTTTGGTCTTTTTAGCATCCAAAAGTTTTTTG AGAATGCTGAGTACGCAACCTTCGAAGTTCGAAGGATTTTTTATTGTATTAGCATTCACAAACTTTTTTTGGATGTTAAC AACCTCAACCAACTCACCCTCCAAGCTGGCCAAAATTACCCAAGGAGACTAAATAAATTTTTTTACACCTTGTTTTGTTA AAAAAAACATTCACATTATTAAAAAAAACTATGTAACAAGAATTCTAAAATTCTGACTCATATTTCGAGGAGACTTTCCC TGATGACATATCAACATTTTACTAAGCAAAAGAGAATCATTTTGAGCCCAATTTTTGTCGATTTCACTTCCAATATGACA TGATATGGACAAAATAGTGCCAGTCATGAAAGCCTTAAAATATAGCCCAAGCTAACGCACGCAACTCTAAGTCTCTATCA CCATTGGTTCTTCTTCTCTATCACAATTACATTTTTTTCACCGCAGGCAGAGAAGATGGACATGCCCATGTCTAACAGCA CGATGCCGATGGAGATGCAGATGAGTTTCTATTGGGGAAAACATGCCACAGTGCTTTTTTCTGGGTGGCCTAACAACAGT GTTGGCATGTACATCTTAGCTCTCTTTTTTGTGTTCTCTTTAGCCATTACGACTGAGATTTTGTCGAACCAGCCACTCGT CAAGCGCGGGACTAGTCCCCTCAAGGGAGGGCTTATTCTGGCTTCTGTCCATTTCTTTCGCACCGGTCTCGCTTACCTGG TGATGCTTGCTGTCATGTCCTTCAACGTTGGAATCTTCATAGCTGCTGTTGCTGGACACACCTTGGGATTTTTCATTGCA AAGTCTCGTGCTATTGCGGTAGCAAACAAGGAAAATCAAGAGTCCTCCTCTCCTACTCTCAAAATTTGAATTGGTTTTCT GTACTATATATGCATGCATGAGTGTGATGTTAATTACATGGATTTCCTTTAAGCTTTTCTTGTTTATTAGATATGTAGAT TGGTTAGCAGTGCCTGCTTGTATTTCTCAAGTACTTCAAGTGTGTTCAAATTAATATTCTGGATTGTTATTTAATTTCTT GGTACTTTTTACCCCTCCTGTATGTAGAAATAAAAATTATTTTACTATATAGGTCATTCTTTGAGTTTGCAACCCAGAGA CGTGACTAAGAAAAATGAAACCAAACAGCGTTGCGTTGATTCATGTACAAACACTATAAAGCATCGATTAAAAACCAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0575200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACATGCCCATGTCTAACAGCACGATGCCGATGGAGATGCAGATGAGTTTCTATTGGGGAAAACATGCCACAGTGCT TTTTTCTGGGTGGCCTAACAACAGTGTTGGCATGTACATCTTAGCTCTCTTTTTTGTGTTCTCTTTAGCCATTACGACTG AGATTTTGTCGAACCAGCCACTCGTCAAGCGCGGGACTAGTCCCCTCAAGGGAGGGCTTATTCTGGCTTCTGTCCATTTC TTTCGCACCGGTCTCGCTTACCTGGTGATGCTTGCTGTCATGTCCTTCAACGTTGGAATCTTCATAGCTGCTGTTGCTGG ACACACCTTGGGATTTTTCATTGCAAAGTCTCGTGCTATTGCGGTAGCAAACAAGGAAAATCAAGAGTCCTCCTCTCCTA CTCTCAAAATTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0575200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDMPMSNSTMPMEMQMSFYWGKHATVLFSGWPNNSVGMYILALFFVFSLAITTEILSNQPLVKRGTSPLKGGLILASVHF FRTGLAYLVMLAVMSFNVGIFIAAVAGHTLGFFIAKSRAIAVANKENQESSSPTLKI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| PANTHER | 2 | 137 | 136 | 4.0E-67 | – | |
| PANTHER | 2 | 137 | 136 | 4.0E-67 | ||
| Pfam | 16 | 57 | 42 | 6.1E-7 | ||
| Phobius | 36 | 57 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 36 | 58 | 23 | - | – | |
| CDD | 49 | 96 | 48 | 0.00143205 | – | |
| Phobius | 58 | 68 | 11 | - | – | |
| Phobius | 69 | 90 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 71 | 93 | 23 | - | – | |
| Pfam | 73 | 114 | 42 | 1.6E-9 | ||
| Phobius | 91 | 95 | 5 | - | – | |
| Phobius | 96 | 115 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 98 | 115 | 18 | - | – | |
| Phobius | 116 | 137 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Copper ion transmembrane transporter activity | Enables the transfer of copper (Cu) ions from one side of a membrane to the other. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Biological process | Copper ion transmembrane transport | The directed movement of copper cation across a membrane. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0575200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…