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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0600400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0600400.13 |
| Related isoforms 14 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Elongation factor G; TAIR: AT1G45332.1 Translation elongation factor EFG/EF2 protein; Swiss-Prot: sp|Q9C641|EFGM1_ARATH Elongation factor G-1, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0E4F4|A0A0R0E4F4_SOYBN Elongation factor G, mitochondrial; Found in the gene: LotjaGi1g1v0600400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114475180..114503598) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAGAAGATATGACGTCCCGAGACTTGCATTTATCAACAAGCTTGATCGGATGGGTGCAGATCCATGGAAAGTTTTAAA TCAGGTGCATTTGTGATTTCTGGATGTCATGTCATCACAGTTACATTTTTTTTAGTTGCCATTTACATGATTTTGGTTGG TTTTGACAAGAGAACATTGGAAACAAGGTTCCTCAACTCCTGGTCAATTGGCATTGAGAAATTAATGAAGTGATCATTTT CTAAAAAGTTGAAGTTGAGACTCTTTCCTAACTGTTCCTTTATAACTGTTCTTGATTAAAACTTGTTTCTGTCTCTCTCC AACCTGTTCCTTTATAACTGGTCTTGATTAAAACTTGTTCCTGTCTCAATTTTTGGATGCATAGACCAGCCTAAATTAGA CTAAGATTTTAGTATTATACAATTGATAAACTATATTTTTTTTATCTAGCATTATTTATTCATTTTTAGCTAGGGACTAA ATTCACAATAGTACAAACTAAGGGAACCAAAAGTGCAATTAAGCCTATATTTTCAAAAAAAATTCTCAGCCTTATTTTTG AATTGAACTTTTACCATTTTGAGACAATTTGTTTTCTTTTCAGGCTAGATCTAAGCTTCGGCATCATAGTGCTGCAATAC AAGTTCCAATAGGCTTAGAAGATGATTTTAAGGGACTTATTGATCTTGTGGAGTTAAAGGCCTACTATTTTCATGGTTCA AATGGGTCGGTTTCAAAAACCTCTGTACTGTCCATTCTAAGATGAAGTCTCTTGCCATTTTCTTCTGCTTACTTGATTGT TTCTTATTGCAGTGAAAATATTGTCATTGAAGAAGTACCTGCAGATATGGAAGCCCTGGTGGCAGAAAAAAGACGTGAAC TCATAGAAACTGTGTCAGAGGTAGATGACGTACTTGCTGAAGCTTTTCTCGGTGATGAGACCATATCACCTGCTGATCTT 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CACGGTTCACGCACTTATAAGTGAGTGAACTACGCACAAGTGAGTGGAAAAAAAGGGGGTGGAATTAGATGAAAGGGGGT GGCTTTAACAATTACCAAAACATTTTTAACATTGTTTAAGACACATGCACGGTATTGAAGTCACACGTGTTAGTGTAAAA CACATTTTTAACAGCTTATTTGTTGATCATGTTATGCTAATTATTTTTACCATTTATTAGAGTATACTATACCAAGTTGA AAATGCTGAAATGTTTAACTGAATTTCATTGGTTGTAAAACTGAATAGTACAATTGATAATCTCTCTATTTATAGAGAGC TAACAAGCTTGCATAAGAAGCTAACTAATTCTGTTATGCCAGCTCAGCTTGACAGCTAAGCTTAACAACTAACTCTGTTA TACTAACAACTAATCTTGACAGCTAGGATAACTAACTTCATAGCAGTAACTTATCAGTTACCTATCAGAAACTATATAGT ATACTCTAATACCATTCAATGGTGGATGCCAGTTGTATTGTTTCACGTCTTCCCTAATCCCACTTCTATTTCTTGATGAC ATATTTGCTATTCAATGTGGTCACAGGTATATTGAACCACTTCCTGCAGGGTCACCAACAAAGTTTGAATTTGAAAACAT GATTGTTGGTCAGGCTATTCCATCAAATTTTATCCCTGCAATTGAAAAAGGTTTCAAAGAAGCTGCCAACTCGTGAGTTA AATTTATTAGTTTGGCAATCGTGCTTTCAGCATTCAAATTTCATTTTTGTGATTCATCATGTAGTGTTTTGTAATAACGT AATAGGCAAGATCTCATTGTTTATACAATTTTGCTGCATGCCAATACGATAAAACTGTTGGGTATGAAAACCAATTTTGC TCTCCATACAGTGGTGCTTTAATTGGACATCCAGTTGAAAATCTTCGAGTTGTCTTGACGGATGGTGCTGCCCATGCTGT TGATTCCAGTGAACTTGCATTTAAGTTGGCTTCTATCTATGCTTTTAGACAGGTACTTTTCATTTCTATTATCCATATTT TATAATATTATTGCACATATTCTTTTGACTCCTTCAGATAATAATGATGGTCCCATTCGTTGAAATTTTATTGTACTATC TTTTGTAACAGTGTTATCCAGCTTCTAGACCAGTTATATTAGAACCTGTTATGCTTGTTGAGCTGAAAGTACCAACAGAA TTTCAGGGAGCTGTTGCTGGTGACCTCAACAAGTGAGGGTTCTTTATTTATTTTTTAATGGATGTTGTTGTAAAAATTCT TAATTTTCTGACATGTTTTTGCATCCGTAAAAAGGAGAAAAGGTGTGATTGTTGGCAACGATCAGGAAGGAGATGATTCT GTCATTACTGCTCATGTAAGTACCTAACTAATCTTAGTTGGCAACCTCTGTATTAGTTCCAATAGTTGATCATTGAAACT GTGACATAATGCTTTATATGATTTGAAACTTGAATGTGCATCTACATTTTTCTTTGTTCTCTTTTTTCGTGTTCATTAGA AGGTTTACGTCAGTGTTTT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0600400.13) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGAAGATATGACGTCCCGAGACTTGCATTTATCAACAAGCTTGATCGGATGGGTGCAGATCCATGGAAAGTTTTAAA TCAGGCTAGATCTAAGCTTCGGCATCATAGTGCTGCAATACAAGTTCCAATAGGCTTAGAAGATGATTTTAAGGGACTTA TTGATCTTGTGGAGTTAAAGGCCTACTATTTTCATGGTTCAAATGGTGAAAATATTGTCATTGAAGAAGTACCTGCAGAT ATGGAAGCCCTGGTGGCAGAAAAAAGACGTGAACTCATAGAAACTGTGTCAGAGGTAGATGACGTACTTGCTGAAGCTTT TCTCGGTGATGAGACCATATCACCTGCTGATCTTGAGGGGGTACAGCCACTTCTGGATGGTGTAGTTAATTATTTGCCAT GTCCAATTGAAGTTAAAAATTATGCTCTTGATCAAACCAAGAACGAGGAGAAGGTGGAGTTGCTCGGAAATCCTAATGGA CCACTTGTGGCATTGGCTTTCAAGTTGGAGGAAGGACGGTTTGGCCAGTTAACATATCTAAGAGTCTATGAGGGTGTTAT TCGAAAGGGTGATTTTATTATTAATGTAAACACCGGCAAGAAGATCAAGGTCCCTCGCTTGGTTCGGATGCACTCAGATG AGATGGAGGTTGATGTATATTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0600400.13) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRRYDVPRLAFINKLDRMGADPWKVLNQARSKLRHHSAAIQVPIGLEDDFKGLIDLVELKAYYFHGSNGENIVIEEVPAD MEALVAEKRRELIETVSEVDDVLAEAFLGDETISPADLEGVQPLLDGVVNYLPCPIEVKNYALDQTKNEEKVELLGNPNG PLVALAFKLEEGRFGQLTYLRVYEGVIRKGDFIINVNTGKKIKVPRLVRMHSDEMEVDVY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 144 | 144 | 3.0E-37 | – | |
| PANTHER | 1 | 218 | 218 | 1.0E-115 | – | |
| SUPERFAMILY | 2 | 133 | 132 | 1.31E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 120 | 216 | 97 | 3.3E-18 | ||
| Gene3D | 145 | 218 | 74 | 7.2E-19 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0600400.13, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…