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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0627000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0627000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC transporter ATP-binding protein; TAIR: AT5G14100.1 non-intrinsic ABC protein 14; Swiss-Prot: sp|Q8LEF6|AB11I_ARATH ABC transporter I family member 11, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3RW12|A0A0S3RW12_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0627000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:117597797..117613892) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTTCTTCAAAAACTCTTCCTACAACCAAACACAGTGTTTGTCTCGTATGCCGGAGACAGACATATCCCGACGACTCCGA ACCTCAGCCCCCACCCGCGGCCATGGCCACCACTTTAAATCCACCAATTGGGTTGCGCTTCCTCAAACCACCACCACCTC CGCCGTCACCACTTTCCACCGCTCCACCACCGTGCGTTTCTCTCCACTCTTCCCTCTCCTCAATTGCATTTTTCATGTCT CTCCCTCACCACCCTCTTCCTCGTTGCAGGTTCAAGTTCCCACCACCGCTTCCTCTTCTCAGAATCAACTGCGCTCACTC CTCATTTGAAGTATGCTCTCTATTTCGTTTCACCAATAACCCTCCCACAAGTTCAATTTTGCTTTCTTTCTCTGTAATGC ACCTTTGGTCACTTTCTCAATTGCTTCGTGTGGCTTATACATTGCAGTTGAAATTGCCGTAATGTATTTGCTAAAACTGT AATATTTTTTTTGCTTAAGGTTAGAGATGTTAGCTATCAAGCTCCGGGGACTCAGCTCAAGCTTCTGAATTCAGTGACTT TTTCACTTCCTGAGAAAAGGTACTTTTCTGTGTCTTTATTTGATTGCATTAAGTTCAGCATGAGTTTGGGATGTTTAGGA ATTTATTACTTATAACTGATTCAAAAGGGGTAGATCTTCCTGTTAGGGGGTTTGGGTGAATCATGATCAGTATTTGTAGC TAATAAGATGTATGCTACTTCATATTGTCCTTCCTTGTTGTCCCTCTTTTAATCACTTGAGCTACATACCCGGTGAGACG TGATTAAACATACACATGCTGAGTGTTTTGCATTTTTCATGAAAGAAAAGGATTTTGCATATGTGTGGTAGCTTATTTCT GTCAATTCCTGCAGTTTTGGTCTGATTTTCGGACAGAGTGGAAGCGGGAAAACAACTCTCTTGCAGGTTTCCCCCCTTAC 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0627000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCACCACTTTAAATCCACCAATTGGGTTGCGCTTCCTCAAACCACCACCACCTCCGCCGTCACCACTTTCCACCGC TCCACCACCGTTCAAGTTCCCACCACCGCTTCCTCTTCTCAGAATCAACTGCGCTCACTCCTCATTTGAAGTTAGAGATG TTAGCTATCAAGCTCCGGGGACTCAGCTCAAGCTTCTGAATTCAGTGACTTTTTCACTTCCTGAGAAAAGTTTTGGTCTG ATTTTCGGACAGAGTGGAAGCGGGAAAACAACTCTCTTGCAGCTTCTTGCTGGTATAAACAAACCGACATCTGGATCTAT TTACATCCAAAATTATGGGGATGATGGAAGTCCTAGTCAGTCTCAAGAGCCCTTGGTGCCAGAAAGGGTTGGCATTGTCT TCCAGTTTCCCGAGAGGTATTTTGTGGCTGATAATGTACTTGATGAAGTCACTTTTGGGTGGCCAAGGCAAAAGGGTGGC CATCAATTGAGGGAGAATCTTGCTCTAGGGCTACAGAGGGCAATTAACTGGGTTGGATTAAGTGGGATATCGTTGGATAA AAATCCTCAGTCGCTCAGTGGTGGTTACAAACGTCGTCTTGCCTTGGCAATACAATTAGTTCAAGTCCCCGATCTATTGA TATTGGATGAGCCTCTTGCTGGACTTGATTGGAAAGCACGTGCAGATGTTGTGAAGCTTTTGAAGCATCTAAAAAAAGAA TTAACTGTGCTAGTTGTCAGCCATGATTTGAGAGAGTTTGCAAGTCTAGTCGATCGATCGTGGAGGATGGAAATGGGTGG CAACCTTAGAGAGGAGTTTCTACCTTTATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0627000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATTLNPPIGLRFLKPPPPPPSPLSTAPPPFKFPPPLPLLRINCAHSSFEVRDVSYQAPGTQLKLLNSVTFSLPEKSFGL IFGQSGSGKTTLLQLLAGINKPTSGSIYIQNYGDDGSPSQSQEPLVPERVGIVFQFPERYFVADNVLDEVTFGWPRQKGG HQLRENLALGLQRAINWVGLSGISLDKNPQSLSGGYKRRLALAIQLVQVPDLLILDEPLAGLDWKARADVVKLLKHLKKE LTVLVVSHDLREFASLVDRSWRMEMGGNLREEFLPL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 28 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 11 | 28 | 18 | - | – | |
| PANTHER | 41 | 272 | 232 | 1.2E-94 | – | |
| PANTHER | 41 | 272 | 232 | 1.2E-94 | – | |
| Gene3D | 42 | 273 | 232 | 2.4E-53 | – | |
| SUPERFAMILY | 46 | 266 | 221 | 5.33E-46 | ||
| ProSiteProfiles | 49 | 274 | 226 | 16.887 | ||
| CDD | 50 | 266 | 217 | 4.07829E-58 | – | |
| Pfam | 66 | 219 | 154 | 6.5E-23 | ||
| SMART | 75 | 267 | 193 | 6.7E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0627000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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