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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0633900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0633900.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Aminopeptidase; TAIR: AT3G19340.1 aminopeptidase (DUF3754); Swiss-Prot: sp|P29558|RBMS1_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MXN7|K7MXN7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0633900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:118781867..118800193) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGGACTAACCGCAATATTGCAATAGAAACGATGAACATTTGAGGGAATAGCTTAAAAAAATGTAAAATACTAAAATGAT TTAAAGAAATAATATGTAGAAATATATATACCGACCCTTGACAAACGGAATCATGTTTGGCATGAGAAAGAAAAATATAA TAATATTCAGAATTTATTTAAAAATAAAAGCAACTTTGAATACATCAAAATTAAGTTTTTTATTGAGGTACCAGTAGTAT CGTACTAACTTCCAAAAATTTGTGTCCACTGAAACTCAAAATCACTGCTGTGAGTGATAACAACAATCGTGTTGCATCTG AATTCTGAAGGAGAAATCGAACCTGCGAAAGAACCAACGTTTGGTCGGAAAACGCATATAGTGTCAGTGTGTGAGGACCC ACTTTCACCTTAGAGCGGTTTCATTACTTTTTCATGACTGCACATACCCTTTTCCATTTATTCCATAAAAGCGTTTCCTT CACGCCTTCACCGCTTCAAGTTTCGATTTTTTGAAGAGTGTTGCTGAAACTGACAAGAGGGTAGCTTGGAAAAGAAAGAA GACAAGAAATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCG ATTATGAAGCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGGTACTGCTTTTGTTTTTTCAGTCCAATTTGCACCTTG AATTTCCTCTCTATGTTGTTTTTGTTGTTGTAGAAGCATGTTTAGGGACTATATACATTTTGTGGTGCTCTGGTTGTAGT GTGATCTAGAAAGGATAGTTAAACAGGGAATCAATATATTAGAAGTTAACATGAGTAATTATTGTTGATATAGTAAAAAT GCTGTCATTTAGTTAATGATTTTGCTGTTCTAGTTTGTATGGGTGTGAAAATTCAGAATATAAATATAGATTTTGTAAAA 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AAATGTGTTTGTAAAAAAATACATGTTGAATGTGAATCACAACCTAAATACTCTTGGGCAGGTTGACACTACTTTACTAA AACATAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0633900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCGATTATGAA GCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGAGCATAGTTCTGACCGAGCTGAGTTTTTGAAGCTCTGCAAGAGAG TGGAGTACACTATTCGAGCTTGGTACCTTCTACAATTTGAGGATTTAATGCAACTCTACTCCCTCTTTGACCCTGTACAT GGGGCGCAAAAGTTGGAACAGCAAAAGCTAGCTCCTGAGGAAATTGATGTGCTTGAACAGAACTTCTTGACATACCTATT TCAGGTCATGGAAAAGAGCAACTTCAAGGTAGTGACTGATGATGAGGTTGAAGTTGCGCATTCAGGCCAATATCTTCTGA ATCTTCCCATTACTGTTGATGAGTCTAAGCTTGACAAGACACTTTTGAAGAAATATTTTGAAGAGCATCATCACGAGAAC CTTCCAGATTTCTCTGATAAGTATGTTATCTTTCGTCGTGGCATTGGAATTGATCGAACAACTGACTACTTTGTCATGGA GAAAGTGGACATGCTCATTGGACGTTTATGGGCATATCTGTTAAGACTAACTAGGTTGGAGAAGCTTTTATCCAGAAGGT CAAAAAAGGGTAATAAGAAAGATCCAAATGACAATGAAATTAACTCTGAAACAAACGGGGACGAATTTTATGTTGAACGG ATACGTCTTGAAAATATGCAACTAAGCTTCCATAATTTGATCGGCAAGACATTGATCCAAGAACCGACATTTGATCGGAT AATTGTTGTTTACAGGAGAGCTAGCGCCAAATCAAAAGCAGAACGAGGAATATTTGTAAAGCATTTCAAAAACATTCCAA TGGCTGATATGGAAATAGTTCTTCCAGAAAAGAAAAACCCTGGATTAACTCCAATGGACTGGGTTAAGTTTCTTGGGTCA GCAATAGTTGGGCTGGTTGCTGTAGTTAGTTCACTTGAAATGCCCACAGCTGATTGGTGGGTGATCTTTGCTGTTGTGTC CACAGTAATTGGTTATTGTGCTAAGACATACTTCACGTTCCAAGCAAACTTGGCTCAATACCAAAATTTGATTACACAAT CAATGTATGACAAACAACTGGACAGCGGAAAGGGTACACTTCTCCATTTGTGTGATGATGTCATTCAACAGGAAGTCAAA GAGGTAATACTTTCATTCTTTATTCTGATGGAACAAGGCAAAGCTACAAGACAGGATCTTGACCAATGGTGTGAGGAACT AATCAAAGAAGAGTTTGGGGAGGAATGTAATTTTGATGTGGATGATGCAGTTCATAAATTAGAGAAATTTGGAATTGTTA GTCGGGATTCTATTGGCCGGTATCAATGTGTTGGGCTGAAACGAGCTAACGAGATCATTGGCACCACCACTGAAGAGCTT GTCCTCAAGGCAAGGCAGGGAAACATTAATCCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0633900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAQSDEKGRHKKEVIRLERESVIPIMKPRIIMTLANLIEHSSDRAEFLKLCKRVEYTIRAWYLLQFEDLMQLYSLFDPVH GAQKLEQQKLAPEEIDVLEQNFLTYLFQVMEKSNFKVVTDDEVEVAHSGQYLLNLPITVDESKLDKTLLKKYFEEHHHEN LPDFSDKYVIFRRGIGIDRTTDYFVMEKVDMLIGRLWAYLLRLTRLEKLLSRRSKKGNKKDPNDNEINSETNGDEFYVER IRLENMQLSFHNLIGKTLIQEPTFDRIIVVYRRASAKSKAERGIFVKHFKNIPMADMEIVLPEKKNPGLTPMDWVKFLGS AIVGLVAVVSSLEMPTADWWVIFAVVSTVIGYCAKTYFTFQANLAQYQNLITQSMYDKQLDSGKGTLLHLCDDVIQQEVK EVILSFFILMEQGKATRQDLDQWCEELIKEEFGEECNFDVDDAVHKLEKFGIVSRDSIGRYQCVGLKRANEIIGTTTEEL VLKARQGNINP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 313 | 313 | - | – | |
| PANTHER | 9 | 490 | 482 | 5.1E-286 | – | |
| PANTHER | 9 | 490 | 482 | 5.1E-286 | – | |
| Pfam | 264 | 385 | 122 | 6.5E-22 | ||
| Phobius | 314 | 333 | 20 | - | – | |
| Phobius | 334 | 338 | 5 | - | – | |
| Phobius | 339 | 358 | 20 | - | – | |
| Phobius | 359 | 491 | 133 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0633900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…