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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0633900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0633900.5 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Aminopeptidase; TAIR: AT3G19340.1 aminopeptidase (DUF3754); Swiss-Prot: sp|P29558|RBMS1_HUMAN RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9T7L3|A0A0L9T7L3_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0633900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:118782435..118797282) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCGATTATGAA GCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGGTACTGCTTTTGTTTTTTCAGTCCAATTTGCACCTTGAATTTCCT CTCTATGTTGTTTTTGTTGTTGTAGAAGCATGTTTAGGGACTATATACATTTTGTGGTGCTCTGGTTGTAGTGTGATCTA GAAAGGATAGTTAAACAGGGAATCAATATATTAGAAGTTAACATGAGTAATTATTGTTGATATAGTAAAAATGCTGTCAT TTAGTTAATGATTTTGCTGTTCTAGTTTGTATGGGTGTGAAAATTCAGAATATAAATATAGATTTTGTAAAATACAATGG GAATTGGGATGTGTCGGATATGTGTATGGCTGGCTACTGTTTTCATGTGTTAATGCTTCCTTGATTGTGATTTATGATTG TCCTTGGGATGAAGGATCACTATTGGGAAGGGGGGGGGGAGCAAATTGAGTGTTTCTTTCTCCCTTTTGAACCAACTTGG GGTGGAGTTTACTCATATTTCCAACCCTTTATGTAATTTAGTTTTTTAATGCTATTGTGGAATTCAAATGTTTAGTTTTG TAATTTTAATTTAGAATTTTAGATGAAGAAATATAGATTCTCTACGAAGTTGTTATCATGGCTTGAGTCTTTTGGGTGTT ATATGCAGAGCATAGTTCTGACCGAGCTGAGTTTTTGAAGCTCTGCAAGAGAGTGGAGTACACTATTCGAGCTTGGTACC TTCTACAATTTGAGGATTTAATGGTATTGTTCATTCCTGGATCTTTCTGATTTATAGCTATAAATACCTTTTGGTTGTCG AGCCTGATTCCTTCATGCCTTCAGCAACTCTACTCCCTCTTTGACCCTGTACATGGGGCGCAAAAGTTGGAACAGCAAAA GCTAGCTCCTGAGGAAATTGATGTGCTTGAACAGAACTTCTTGACATACCTATTTCAGGTACTATCACTGCTTCATGCAT GTGAAAGAAAGTATACAGTTATCTTTAGGACTTTATTGCTAATATGATATTGAAGTGAACGATTAAGGTGTCCCCACATT TGATTAAAATATTGCTAATTTGTTAAAATATTTTTGTCATCGAATTAGTTCCTTAAAAGATTAATGTATCACCATATTAG TCCTCCAAAGATTTTGTTTCCAAACAAGTTCCTCAAAGATTTAAAACATCAGCATATTTGTCTTGAATAAAGTGGTGATA TAAAAGAATGATTTTGATAGCTGTTGTATCTCTTTGAGGGATTAATAACATGCTAATATTTGAGGGATTAATTTGTTGAC AAAATTCTTTGGAGGATTAATGTGGTTTCACTCTAATCTTTGATGCACTAAATAGTGTTTATGTCAAAGGAATTGATTGA CTAATCAATTGAATAACAGTTACTGACCAGATTAATTGCTGTATATAATTGTAGTTGACCAAGCCTGTAATTAGGATTAA TTGTTGATTAGCTGTTACAGATCAGGGAAATTATTCCCATAATTAGGAGAGATATTATTTCCATATTTGTAATATGTTAT CAGTATAAAGTTAGCTCTATGCTGTGTACTCAGCATCAAGACAGTATTTTCATTCCATATTTTCCTGAGTTTGACATGGT ATCACAGCTGGTTTTCGATCATATCCTAGTCTAGCCAGAAAATTCCTAGTCTCTTGTCCTAGACCATGTTTTTTTTTCTC AGCCTTGTCCTAGTTCAGACCACGTTCCTTCGTGGTTATCCTCGATACACCCTTTGTCTTCGTTTTTTTTCTCAACCTCA TGGCTACAGAAAAATTTGATGTCTTATTTGTTCGCCTTAATGGCAAGAACTACTCAACCTGGGCATTTCAATTCGAAATA 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ATTTGAAGAACACAAACTGAAATACCAAAAGAAAAAAGTTCAACTCGATATCTGGCAAAATATTCAATTCTTGAACTAGT TTGGTTTGTAACAGCCAAACAAAGAATGAGGGGAGACAACCACGAATGACGGAAGCCAAACAAATCATAATGTTTAACAA TAGAGAGATAATATGCTCTCGAATGTTTGGAACAAAGAATGATAGAGATGAAATCCATTAAGGAACAGTAGAGTACCACA ACTAGAGAACAGAGAACAAAGGCTGATAGTTTTAGGCTGCTGCGGACGGAGAATAGAGGCAGCCTTAGATATTAGAGGGC TAAGAGGAGATGGAATGTATTAGGGGAGTTAATGAGGACAAGGATCAGGCAAGAAAATGTAAGAAGGTGTGGGTTTTATA TTGTCAATCACAAGTTTGGAACATGACTAGATTGTCAATCCCATGACACCATGGTTTTGCTTGGTCAAAGCCCGCGAACT TGCCATTCTAGGTATGATTGGGATTGAGGACTAGCACGAAACTTGTAGGGATCGTGCAATCGTATGAGTGAACTTGCGAT TTTGAGTTTTGACAACAATGCGTAGGTCCATCTATCTTGTGCTTAAATTCAACTATTTTATTAAGGAATGCGGAAAGTGA AGATTTGAACTTTAAACCACTCAGTCATTGATGCTGTGATACCATGCCATGGATGAGCTACCCAAAAACTCCAAAAACTT AAGCTGTTAGGTTGAGAGGCATTAATTTTTTTATATTACATCTCCGACATAAACACTGGGATCATTAACGGTTTAAGGTG GGTGTAAGAAAGATTAAGGTAATCATAATACAGATCTCCTTTTCCAGAAATGATTCCAAAAGAGGGAAGCGGTTTTTAGT AATTACATTAAATTGAAGCAGATTGTAAGAAAGTATCATTACATATATGTTTTAAATATTTGTTTATTATGTTATTGGAA GTTTCTTTGATTCTTTATGTAGGTCATGGAAAAGAGCAACTTCAAGGTAGTGACTGATGATGAGGTTGAAGTTGCGCATT CAGGCCAATATCTTCTGAATCTTCCCATTACTGTTGATGAGTCTAAGGTTTGTGTATAATATATGCGCGCCTTTAATGCT GTAGTTAAGTGGGATTCTTGATTTTTCTGCAAAGTGCCAACAGTTGCTGAAGTCTTTTTTGTTTTTCCCCTGATGAAGCT TGACAAGACACTTTTGAAGAAATATTTTGAAGAGCATCATCACGAGAACCTTCCAGATTTCTCTGATAAGGTATGTCTTG AATCTAGTGTAGAAGGCCCTTATCTGTCAAGTATTTACTGGTTCCTTGATGATCATTATCCAAGGGTTGCTATTTGAAAC CCCTGAACAATGAATCATTATCGCACCTATCACTTCAAAGTTTTGATTTCATTTGATTTTTAAGATGATGTTTTAATCTT TTATGACGTGGTTCTTTTTTCCCTTTTCAGTTATTAAAGCATTCTTCTAGATTCATTACTGAAAATCAGAATCTTTGTTG TGTTCTGAGTATTCATTAAATATCAGTTTGGAGAGACAGATCTTGCGTATTTAGGAAGAAAATGTGGGGGAGGGGGCTTG CTGTTTTTAGATTTTAGTTTTGAAGCTGAAAATAAGAACTGTTCTCAAAACTGTTTTTGAAAACAGGTTATGGCAAATGG ATTCTTTAATTTTTCAGTGCTTAAAAACAGAAAACAGTTTTCAAAAACTGCAAACAAACAAAACCTAAAATAAGCGTTAC TATAAACGTTATTATAAACATTATTATAAACGTTCCAAACTTCGGGGAACTCTGCAGCAGAGTAGTGATGGGATATATCA CGGAGGATGGCATAGCTCTGATACAATGTTATATTAAGCAGGCCTAATACACGTCTTTAGTTGCAGGAGAGTGAGCTACT TTGTAGGCTATAATTGTATAAGGGTACTAGTTTGTCCAAAATGCCTCAAGGCAATCTGGAATTGTGCACCTCTTGCTTAT ATTCACTTGTATTTTTTCTTTACCCATCAATGTGGACTTTTTACTTTTTTTCAACACTTGTACTGAAGTTGGGCAGCAGA TCATGTATCATGTTGATTGATGTTATGGTAGTCTTCCAATCATTTAGGCTTTAGAGGGAGACTGGAAGTTTATATTTCTA GGTTAATAAGGTTCCTTTTTTGCATAATCGAGTAGATATTATTTTGCTTTTTTTACTTGTTTGATGCTGGACTGCAGTTG ATACCCCTTTCTTTCTCTCATTCACACAGACTCAAAGTGGAGGCTGGTTCACAATTATCATTATTATTTTAACTTTTTTG CATTAGATCTGAAAAATGTAAATCTCCAAAAAAGTGAGCTGACGAATACAAATTCAAAAGAAAGAAGTTGTCTTATTCCT TGAACCTAGTTTGTTTGTAAAATGGCAAACTAATACATCTTTTTATTTTAGTATGTTATCTTTCGTCGTGGCATTGGAAT TGATCGAACAACTGACTACTTTGTCATGGAGAAAGTGGACATGCTCATTGGACGTTTATGGGCATATCTGTTAAGACTAA CTAGGTAAGCAAACTCTCAGACTGGAAAGTGAACTTTATAGTTGATAGTAATAAATCATCCATTATGAGAAGTCAATATA TTGATTGTTATATTAGCTTGTCTCAGGGAAACCGTTAAAAGGTCTAGGTCGATGTAAAATAATTTCATGTTTGCTTCAGT TATAGTCAATATCATTGGCTTCATCTGTGCAGTGAAAGACCATATCATGTTCCTTAAGCTTTTCCCCCAAGAAACCTTTT GAGTCTGTGGTGCTTGCAGGTTGGAGAAGCTTTTATCCAGAAGGTCAAAAAAGGGTAATAAGAAAGATCCAAATGACAAT GAAATTAACTCTGAAACAAACGGGGACGAATTTTATGTTGAACGGATACGTCTTGAAAATATGCAACTAAGGTCTATTGC ATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAAGTGTATGTGTGTTATCATTACTGCTTCTGTTTTTCTTGTTAT CCTGTTATCCTATTTTATTTTGTTTTTTCTGGGAAAGGACCCTCGATAGTGAATTTTTATCATGTTATTACTTGTAAATT GTAATAGATTCTTATCTGTTGCATCTGCTTCACATAGGATTGGCCACTCTGCAAGCTGAACGACACTCCTGATAATCTAG ATTTATGTAAATCCTGATTGTTAGCACCTTCTATTCAACTGATGATTCCGGTGTTCATTGTGTGCTCGATACCACGTAAA TTTTTCGTTAATCTGGAATTACAACCATCACAGAAGTACAACTTGTGCAAAACTTAAGAGTGACCTTTTCTAAGATAATA ATAGTCAACCTGGGTTGAGGTTCTCGATCTTCCTTTAGTTAAGTACTAGTGGTTGGAGAATTCTTTTGTGGTGAAATCTA AAACTTTGATTATGTAGAGAAAGGTTTAATTTACGATTTCTCATGGGTTCAGAAAATGATTCAAATGCCTCAAATTTCCA CATATGACATATTTATTACATCTTCTGATTTGTCATATAAGCATAAGATGTTTCTTTCTCACCAAAATTGCTATGCACAT GCAATTATGTTATAAACTTTGAATGTATGAGAATTGATAACATGGTTACTCATGAAACTGTTTTCTGCAATTGCCAGCTT CCATAATTTGATCGGCAAGACATTGATCCAAGAACCGACATTTGATCGGATAATTGTTGTTTACAGGTAGATCTTCCTTT TATCTCAAACTTCTATTGGAAATTTGAAATCTAAGCACTAAAAAGAAAGCTATTTTTTCAGGAGAGCTAGCGCCAAATCA AAAGCAGAACGAGGAATATTTGTAAAGCATTTCAAAAACATTCCAATGGCTGATATGGAAATAGTTCTTGTGAGTAACCT CATTTGTGAAGCATTTAAAAACCATTCCAATTTTTATTAACTTATCCCTCAACAAACACAAGTGATGACCTTGGTCAAGA ACTTCTTACTTGACAGCCAGAAAAGAAAAACCCTGGATTAACTCCAATGGACTGGGTTAAGTTTCTTGGGTCAGCAATAG TTGGGCTGGTTAGTTTTTCAACCTCGGCTGATTTTGTTATTCCTATTTTCATCAGCCTAAGCTAATGAATCTAATGTTCT TCACAGGTTGCTGTAGTTAGTTCACTTGAAATGCCCACAGCTGATTGGTGGGTGATCTTTGCTGTTGTGTCCACAGTAAT TGGTTATTGTGCTAAGACATACTTCACGTAAGCATGTTAACTATTCCCTTTCAGTAGAAATACATGCTATACAATGGTTA TTGTGAAACCCACCTGCATATAACTTCAAAAGTTGATCTATTTTTTGGTTAAGGCCCCGTTTGGAAGATCTTATTTGAGC TTATCTTATAACATCAGCGCTTATACAATTGTTTGGTAGAAGGCTGTTTCGAGCTCATTTTCATAAGCTGTTAAGAATAG CGTATGAACAAGAGCTTATGCTTATTCATAACCTATTTTCTACTTATTTCAATAATTTTCTCAAATTAGCTTATGAATAA GTGTTTTACAGCCATAAGTGCTTAACTAAGCTGTTTTCTCAAACGCACCCTAAATCAAACTTCTTACTCTACCAATTCTT TGTTGGACTGGTTGTTACTTAGTAGTCATGCTGCTCATCGAATCTTGTTCACATCATCAACTGTCACATTCCACAAGTTT GTGGTATATAGAAGTAAAGTAGTAAACACATCTAATAAATCTAACAGCTGTGGCTATTATGTTTTCCCCGCAGGTTCCAA GCAAACTTGGCTCAATACCAAAATTTGATTACACAATCAATGTATGACAAACAACTGGACAGCGGAAAGGGTACACTTCT CCATTTGTGTGATGATGTCATTCAACAGGAAGTAAGTGGTAGCTCGATACACTTTGTATTTCTTTTCTTCAAAATTAAGT CAGCACAGACATCCATCCATCCACACACACACACACAATAGCTTATTATTCTGGTCTACCCTCAATAACCTTGTTTAACC GAATATTACCAGAACTCATCAAAACTGGCTAGCCAAAATTATTAAACCACTTCATGCATGCTATACCTGCCACTTGAAGA GTATGAAGTGTTTAAGCCAACAGCGTATGGCGTGCCCATCAGTAAATTTTTTTTCTATTGTTCGTATGGTTGGGACCACA AACAAGGTTCTTTACCTCAAATATTTTCTTAAATATTCATTAAGTTGTCTTCAAATAAAGGGTTTATCGTTGAAAGAAAA AAGTTTTACAATTGAGAGCTCTACAAATAATGAAAAAATCTGCTCTGCTGTAAAATTTGCTGTCTAAATCATAATCTTAT ACTTTTTCTGGGAGCATTGATCTCGGTTACCCCACAGTTTGGTTAGATTGTGGTAGGATTGTTATTTGTTAGGCAAGCTC GTGCAATAGGTGAAATCAGCTAATTTTTGCGAGAGCCATCATTTAAGTGGCAGAACAACCGTAAAATCCAACCTGTTTGA CCTCATGGGAACATCCCATTTGACCTCATTTTCTCACCCATAGCCCAGTGTCACAATCTGGGCCTGGTGCATCTTTGATT TGTGGGTGAGTTTGACTGGGTTTTTGCTTTGGCTTGACCTTGGCTGAAATTTTGATTTGGGTGGGTTTTAGTGGTACATT GACTGTGCAATTGTGCTTTGTTTCAGTGCTTGGTTTTGTTTTGGTTGGCTGTATCTGTGCTTTGATTTACCGGTATGAAA 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ACATGACCATAAGTTTTTAACAATCTTGTTTTCTATTATCTCAGTCACTTTTTTTTTTTTGAAATTCCATTTTATAATCC AGGTTTCTTTTAGTGTTGCTTAAATACTTATATTAGCTGGATAATGTGAATCAGGATCTTGACCAATGGTGTGAGGAACT AATCAAAGAAGAGTTTGGGGAGGAATGTAATTTTGATGTGGATGATGCAGTTCATAAATTAGAGAAATTTGGAATTGTTA GTCGGGTAAGATTCCCCAAAATTCTCTTGTTCTAATCTCTAAAGTGATTGTTCTCATCTCTAAAGTGATTATATCTATGT TGAAATATTTAATACTGCAGCTCTTAAAAGGAAACCTAGGCATTTTTTTCCTTTAACTTTGTTTTTTATTTTTGTATTTC TATTTCATCTCTGTAGGAAAGGATCATGTGGGATGTTCCTTTATAGTGTCGATGAACCTTTGTTTTCTAATTTTTTGTCG AATGTATTATTGCTAAATTGGTAATTTTGATTCAGGTAGCAGTTGAAATATTAGTTAAATTTTAGCCTTGTTTACCAACG AGGGATGACTCATTGTATTTGTTCTTGTACTTATTATCATTTTATGGTGTTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATATGAC ATAGATTGCCTTTGTAAAGGATAGAGCAACCCTCAACTCTTGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAAGCCTCCCAAATTCTA ATATGATATCAGAGCCTATCCTAGATCTGTTTGTTGGTGGAGACCTCCCATATTTGGACCACTCTGCAGATGTCCAGACC TGCAAATGTCATGCTTCAGATGTCCAACCCTGGGCGTGAGGGGGTGGACTAGAAGTCCCACATTGGCTAGAGATATTGCA TATATAGCCTTTATAAAAGGTAGAGCAATCCTCAATTCTTGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAGGCCTCCCAAATTCTAA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0633900.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTCAATCTGATGAAAAGGGTCGGCACAAGAAGGAAGTAATCCGTTTAGAGCGTGAATCTGTCATTCCGATTATGAA GCCTAGAATCATCATGACATTGGCCAATCTTATTGGGGTGTTATATGCAGAGCATAGTTCTGACCGAGCTGAGTTTTTGA AGCTCTGCAAGAGAGTGGAGTACACTATTCGAGCTTGGTACCTTCTACAATTTGAGGATTTAATGCAACTCTACTCCCTC TTTGACCCTGTACATGGGGCGCAAAAGTTGGAACAGCAAAAGCTAGCTCCTGAGGAAATTGATGTGCTTGAACAGAACTT CTTGACATACCTATTTCAGGTCATGGAAAAGAGCAACTTCAAGGTAGTGACTGATGATGAGGTTGAAGTTGCGCATTCAG GCCAATATCTTCTGAATCTTCCCATTACTGTTGATGAGTCTAAGCTTGACAAGACACTTTTGAAGAAATATTTTGAAGAG CATCATCACGAGAACCTTCCAGATTTCTCTGATAAGTATGTTATCTTTCGTCGTGGCATTGGAATTGATCGAACAACTGA CTACTTTGTCATGGAGAAAGTGGACATGCTCATTGGACGTTTATGGGCATATCTGTTAAGACTAACTAGGTTGGAGAAGC TTTTATCCAGAAGGTCAAAAAAGGGTAATAAGAAAGATCCAAATGACAATGAAATTAACTCTGAAACAAACGGGGACGAA TTTTATGTTGAACGGATACGTCTTGAAAATATGCAACTAAGGAGAGCTAGCGCCAAATCAAAAGCAGAACGAGGAATATT TGTAAAGCATTTCAAAAACATTCCAATGGCTGATATGGAAATAGTTCTTCCAGAAAAGAAAAACCCTGGATTAACTCCAA TGGACTGGGTTAAGTTTCTTGGGTCAGCAATAGTTGGGCTGGTTGCTGTAGTTAGTTCACTTGAAATGCCCACAGCTGAT TGGTGGGTGATCTTTGCTGTTGTGTCCACAGTAATTGGTTATTGTGCTAAGACATACTTCACGTTCCAAGCAAACTTGGC TCAATACCAAAATTTGATTACACAATCAATGTATGACAAACAACTGGACAGCGGAAAGGGTACACTTCTCCATTTGTGTG ATGATGTCATTCAACAGGAAGTCAAAGAGGTAATACTTTCATTCTTTATTCTGATGGAACAAGGCAAAGCTACAAGACAG GATCTTGACCAATGGTGTGAGGAACTAATCAAAGAAGAGTTTGGGGAGGAATGTAATTTTGATGTGGATGATGCAGTTCA TAAATTAGAGAAATTTGGAATTGTTAGTCGGGATTCTATTGGCCGGTATCAATGTGTTGGGCTGAAACGAGCTAACGAGA TCATTGGCACCACCACTGAAGAGCTTGTCCTCAAGGCAAGGCAGGGAAACATTAATCCTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0633900.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAQSDEKGRHKKEVIRLERESVIPIMKPRIIMTLANLIGVLYAEHSSDRAEFLKLCKRVEYTIRAWYLLQFEDLMQLYSL FDPVHGAQKLEQQKLAPEEIDVLEQNFLTYLFQVMEKSNFKVVTDDEVEVAHSGQYLLNLPITVDESKLDKTLLKKYFEE HHHENLPDFSDKYVIFRRGIGIDRTTDYFVMEKVDMLIGRLWAYLLRLTRLEKLLSRRSKKGNKKDPNDNEINSETNGDE FYVERIRLENMQLRRASAKSKAERGIFVKHFKNIPMADMEIVLPEKKNPGLTPMDWVKFLGSAIVGLVAVVSSLEMPTAD WWVIFAVVSTVIGYCAKTYFTFQANLAQYQNLITQSMYDKQLDSGKGTLLHLCDDVIQQEVKEVILSFFILMEQGKATRQ DLDQWCEELIKEEFGEECNFDVDDAVHKLEKFGIVSRDSIGRYQCVGLKRANEIIGTTTEELVLKARQGNINP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 295 | 295 | - | – | |
| PANTHER | 9 | 253 | 245 | 7.3E-261 | – | |
| PANTHER | 9 | 253 | 245 | 7.3E-261 | – | |
| PANTHER | 254 | 472 | 219 | 7.3E-261 | – | |
| PANTHER | 254 | 472 | 219 | 7.3E-261 | – | |
| Pfam | 256 | 367 | 112 | 4.9E-21 | ||
| Phobius | 296 | 315 | 20 | - | – | |
| Phobius | 316 | 320 | 5 | - | – | |
| Phobius | 321 | 340 | 20 | - | – | |
| Phobius | 341 | 473 | 133 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0633900.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…