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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0664300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0664300.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glutamate synthase, putative; TAIR: AT5G04140.1 glutamate synthase 1; Swiss-Prot: sp|Q43155|GLTB_SPIOL Ferredoxin-dependent glutamate synthase, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RUY7|A0A151RUY7_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0664300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:122591207..122619380) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTGACAGTTCAAGTAGTAGTGTTCCACTGTTCAATAGTGAAGCGATCTCGTACTAAATGAAACAACCTTTCCTTCAATG ATAGAGGCAAGAAGACTTTCCGGCCAGGCCTTACTATAACCAACCTCACAGGACAAGTCATTTTCCTAAATTTGCAATTT AGCCACAATATCTTAAACAATAGTCGAAAGACTAAAGAGTAGACCCTGATATGAATTTGCCATAGATAGAATAGAAGCCA AAGAAAAAAGTGATGATGATTGGGTGGTGGTGCACATTGGTAAGCCTAGACCTTACCACATAATGGCGCCCATTAACATC ACGGTCGGAAAAGGAAGACGAGAAAGGAATGAGTTGTTGGTGGCGTATGTGAGGTTAAGCATTTCCTGGCCTCTCCCTCT TCTCCCTTTTATCTTCATTCTCACTCACTCATTCATCTTACTCTCTCACCCTTTCCATTCTCCACAAACACACTCTCCCT CCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCACTCCTCACCCTCTCCATGGCGCTGCACTCTGTAGCGTC CGTTTCTCAAGTCCTTCTTCGCCCTTCCGCGCCATTTCCTTCCAACCTCCACGCTCACTGGCTCGTTGACTTCGCTCCTC TCGGCCGTAAACCTAAGCGCCGCAACCGCAGATTCACGCCGTCGATCAGTTCTGTTCCGCTTCGTCGTTCCGCTGTTCTC AACGTTCACCGCGTCCCTCACTCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCGTCTTCCGATTTGAAACCACAGGTCACAACAGC TTTTCCTTTCTCCTTTTGAATTGCTTTTCGTTTCTAAATGTTTCATGAGAAGAACACGCTCTATCGAAATCGTTGCTGTT AATCGCGTTGACATAACCAAAATCTTACCAGAAAATGATTCAGGTGAGTTGATAGTGACTAGGTGAGTACTGAGTTGACT 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TGGGGTTGCAAAGGGCAATGCTGATGTTATACAGGTGTCTATTGTCACTTGTTATCTATATATTTTTATCTGTCTAATGT TTTATTTCTCAGAAATCTATTATTCATCCTAAAAGCTTGAAATATAATGTGATCGACTTACAGATTTCAGGGCATGATGG GGGTACGGGAGCAAGCCCTATAAGTTCCATCAAACATGCAGGAGGTCCTTGGGAGCTTGGACTTACAGAAACTCACCAGG TTATAATTGAATCATAAATCTGTGTAGTTGCAATTTATTCTGATCATTCTATCCTGAAAATTTGTTTACCATTTGATTGT GGACTGTTTTTTTCAGACACTCATTGAAAATGGACTTAGAGAAAGAGTCATTCTCCGAGTTGATGGTGGATTTAGAAGTG GAGTTGATGTCATGATGGCAGCAACAATGGGTGCTGATGAATATGGGTTTGGTTCAGTGGCAATGATTGCTACTGGATGT GTTATGGCCCGCATTTGCCACACCAATAATTGCCCTGTTGGTGTTGCTAGCCAGGTATTATAAGACTGATTTGTTATTAC TTGCTTTATTGTAATGATTTCTTGTCCTATATTTGATAAAAAATTTATCGTCACATTTCAGAGGGAAGAGTTGCGTGCAC GATTTCCCGGTGTTCCTGGTGATCTTGTCAACTACTTTTTATATGTGGCTGAAGAGGTACTTTGGGGATGCAGTTGATAT ATATCTTTCATGTTCATATTAATGTTCATTATTTTGGAGTTACCATTACTGATTCTTGTGAAGAAATGCAATATGAGGAG AGGGCTAAATTGTTCTCAGTCATTTGAATTAATAGTACACATCATTTTATAACATGTTAGAAGGAAAGAAAACGGGAACT AAATCAACTGTAATTATGGAATGAATTGGGTATGAGTTCTTAATCCAATCCCTTATACTAAAGGATTTCAAAACTGATTC 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GCTTGGTGGCTCATGATCATTGGTCGTCATTCGGGCTATTTCGTTAATGGGAGGTGACACGGTAGTGGCCTTGTATTAGA CATGGTGGTTGGAGAGGGAGATAAAGGATATTGACAATTAGATAAATTCAATGGTTGATTAGCACCGTTAACACGATATA GAAGAGTGTGGTTGGAGAGGATTAAAACCCGGGTATACTGGTTGTGGCTCGTGGGCGGGCCCACATAGCTCGCAACCCGC ATAAATTAGAATCGGGTTTTTTGTTGCTTGTGACGAACACGCATCTCTACAATTCGGTTGGGAATGATGGAATCCTCGTC TTTGTGCGTGTGTG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0664300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGCTGCACTCTGTAGCGTCCGTTTCTCAAGTCCTTCTTCGCCCTTCCGCGCCATTTCCTTCCAACCTCCACGCTCA CTGGCTCGTTGACTTCGCTCCTCTCGGCCGTAAACCTAAGCGCCGCAACCGCAGATTCACGCCGTCGATCAGTTCTGTTC CGCTTCGTCGTTCCGCTGTTCTCAACGTTCACCGCGTCCCTCACTCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCGTCTTCCGAT TTGAAACCACAGGTTGCAAACTTGGATGATATATTATCAGAAAGAGGAGCCTGTGGTGTTGGATTCATTGCCAATTTGGA AAATAAGGCATCACATGTAATTGTCAAGGATGCTTTAACTTCTTTAAGCTGTATGGAACATCGTGGTGGCTGTGGAGCGG ATAATGACTCTGGTGATGGTGCTGGGCTGATGACTGCAATTCCATGGGATCTATTCGACAATTGGGCTGACAAACAAGGG ATTGCTTCCTTTGATAAGTTGCACACTGGTGTTGGAATGGTTTTCCTACCCAAAAGTGTAGAACTCTTGAATGAGGCCAA GAAAGTTATTGTAAGTATTTTTCAGCAAGAAGGTCTTGAGGTGCTTGGGTGGAGGCCTGTCCCTGTAAATACTTCTATTG TAGGTTTTTATGCGAAGGAGACCATGCCCAATATACAGCAGGTATTTGTTAAGATCGGGAAAGAAGAAAATGCCGATGAC ATTGAACGAGAACTGTACATCTGTCGTAAATTGATTGAAAAAGCTGTAAGCTCAGAAAGTTGGGCAAATGAGCTTTATTT CTGTTCTTTATCCAATCAAACAATAGTTTACAAGGGGATGCTTCGCTCACAAGTTCTTGGGTTGTTTTATTCTGACCTTC AAAACGATCTTTATAAATCCCCCTTTGCCATTTATCATCGAAGGTATAGCACAAATACTAGCCCCAGATGGCCTCTTGCA CAACCAATGAGGCTTCTTGGTCATAATGGAGAGATCAACACCATACAGGGGAACTTGAATTGGATGCAATCACGAGAGCC ATCGTTGAAGTCACCTGTATGGCGAGGTCGTGAAAATGAAATTCGTCCATTTGGAAATCCAAAGGCATCAGACTCAGCAA ATCTTGACAGTACTGCAGAATTATTAATAAGAAGTGGTCGTAGTCCTGAGGAAGCTATGATGATTCTTGTTCCCGAGGCT TATAAAAATCATCCAACTCTGACAATCAAATACCCAGAGGTGCTTGACTTTTATGACTACTACAAGGGTCAGATGGAAGC TTGGGATGGACCTGCCTTGCTTTTATTCAGTGATGGAAAAACTGTAGGTGCTTGTCTTGATCGTAATGGACTTCGACCTG CTAGGTTTTGGCGAACATCAGACAATATGGTTTACGTTGCCTCAGAGGTTGGTGTTATACCAGTGGATGAATCAAAGGTT ATCTCGAAAGGCCGATTAGGTCCAGGCATGATGATAACGGTTGATTTACTTGGTGGTCAGGTCTATGAGAATACGGAGGT TAAAAAACGAGTAGCCTTATCAAATCCATATGGGGACTGGATCAAGGAAAATCTGCGGTCTTTGAAGGCTGAGAACTTCC TTTCAACCTCTGTTATGGAGAATGACGCAATATTAAGACAACAACAGGCATTTGGGTACTCCAGTGAAGATGTCCAGATG GTGATTGAGGCTATGGCTGGTCAGGGAAAGGAGCCAACTTTTTGCATGGGAGATGATATTCCATTGGCAGCATTGTCTCA GAAACCTCACATGCTTTTCGATTATTTTAAGCAACGGTTTGCACAGGTCACAAATCCTGCAATTGATCCTCTTCGAGAAG GATTAGTTATGTCTCTTGAAGTGAATATAGGGAAGAGAGGGAATATATTGGAAACTGGACCTGAAAACGCATCACAGGTT ATATTATCTGGTCCAGTATTGAATGAAGGGGATCTTGAATCATTATTAAACGACCCCTTATTAAAACCGCAAGTATTACC AACATTTTTTGATATAACTAAGGGGATTGACGGTTCCTTGGAGAAAGCATTAAATAAGCTTTGTGAAGCTGCAGATGAAG CTGTTAGAAATGGTTCCCAGCTTCTTATTCTTTCAGACCGTTCAGAAGCACTGGAACCAACACATCCTGCAATTCCAATA CTTCTTGCTGTTGGTACTGTTCATCAGCATCTAATCCAGAATGGCCTGCGGATGTCGGCATCAATTATAGCGGATACTGC TCAGTGCTTTAGCACTCATCAGTTTGCCTGTTTAATAGGATATGGTGCAAGTGCTGTGTGTCCATACTTGGCACTGGAGA CATGCCGACAATGGCGTCTTAGTAGTAAAACTGTAAATTTGATGAGGAATGGAAAGATGCCTACTGTATCAATTGAACAA GCACAGAAGAATTACTGCAAGGCTGTAAAAGCAGGTCTTCTTAAAATTCTTTCCAAAATGGGCATCTCATTGCTTTCAAG TTACTGTGGTGCACAGATATTTGAGGTCTATGGATTAGGGAAGGAAGTTGTGGATCTTGCATTCAGAGGAAGCGTGTCAA AAATTGGTGGATTAACCTTTGATGAGCTTGCAAGAGAGACTTTGTCTTTCTGGGTGAAAGCGTTCTCTGAAGATACGGCA AAAAGATTGGAAAATTTTGGGTTTATACAGTTCAGACCAGGAGGTGAGTTTCATGCAAATAATCCAGAAATGTCAAAGTT GCTCCACAAAGCTGTTCGTCAGAAAAGTCAAAGTTCCTTTGCAGTTTATCAGCAACATTTGGCTAACCGACCTGTGAATG TTCTTCGTGATCTTCTTGAGTTTAAAAGTGATCGTGCTCCAATACCTGTAGGAAAGGTTGAACCTGCTTCATCTATCGTG CAACGGTTTTGCACTGGGGGCATGTCACTTGGAGCTATTTCAAGAGAAACTCATGAAGCAATTGCAATCGCAATGAATAG ATTAGGTGGAAAATCAAATTCTGGGGAAGGTGGTGAGGATCCTATTCGCTGGAAACCACTTTCAGATGTCGTGGATGGTT ACTCTCCAACACTTCCACATCTTAAAGGTCTTCAAAATGGGGATACTGCAACAAGTGCCATCAAGCAGGTTGCTTCAGGA AGGTTTGGTGTCACACCAACATTCTTGGCAAATGCTGCTCAATTGGAAATCAAAATTGCACAAGGTGCGAAGCCTGGTGA AGGTGGACAATTGCCTGGGAAAAAAGTTAGCATGTACATTGCAAGGTTGAGAAATTCTAAACCAGGGGTTCCTCTTATAT CTCCACCTCCTCATCATGACATTTATTCTATTGAGGATCTTGCTCAATTGATCTTCGATCTTCATCAGGTGAATCCTAAG GCGAAGGTATCAGTAAAACTGGTGGCTGAAGCTGGAATCGGTACTGTTGCATCTGGGGTTGCAAAGGGCAATGCTGATGT TATACAGATTTCAGGGCATGATGGGGGTACGGGAGCAAGCCCTATAAGTTCCATCAAACATGCAGGAGGTCCTTGGGAGC TTGGACTTACAGAAACTCACCAGACACTCATTGAAAATGGACTTAGAGAAAGAGTCATTCTCCGAGTTGATGGTGGATTT AGAAGTGGAGTTGATGTCATGATGGCAGCAACAATGGGTGCTGATGAATATGGGTTTGGTTCAGTGGCAATGATTGCTAC TGGATGTGTTATGGCCCGCATTTGCCACACCAATAATTGCCCTGTTGGTGTTGCTAGCCAGAGGGAAGAGTTGCGTGCAC GATTTCCCGGTGTTCCTGGTGATCTTGTCAACTACTTTTTATATGTGGCTGAAGAGGTAAGAGGCACGTTGGCACAGCTG GGGTATGAGAAGTTAGATGACATAATTGGTCGAACAGACTTATTGCATCCAAGAGACATATCTCTAGTGAAAACTCAGCA TCTGGATCTAAGTTATATCCTCTCTAGTGTTGGGTTACCTAAATGGAGCAGTACAACCATCAGGAATCAGGAGACTCATA CCAATGGTCCTGTTCTGGATGATGTTTTGCTAGCAGACCCAGAGGTTGCAGATGCCATTGAAAATGAAAAGACTGTTAGT AAGACGATAAAAATATACAACATTGATCGTGCTGTTTGTGGGCGTATAGCTGGTGTCATTGCAAAGAAGTATGGTGATAC TGGTTTTGCTGGACTGTTGAATATAACATTTACTGGAAGTGCTGGGCAGTCATTTGCGTGCTTTCTGACACCTGGAATGA AAATTCGCCTTGTTGGAGAGTCTAATGATTATGTGGGGAAGGGCATGGCGGGGGGTGAGCTAGTTGTGACTCCAGTCGAC AATACAGGTTTTCAGCCTGAGGATGCAGCTATTGTGGGCAACACTTGCTTGTATGGGGCAACTGGTGGACAGGTTTTCAT TAGAGGGAAGGCTGGGGAAAGATTTGCTGTCAGAAACTCACTTGCTGAAGCTGTGGTTGAAGGCACAGGAGATCATTGTT GTGAGTACATGACCGGTGGCAGCGTGGTTGTCTTGGGAAAAGTGGGTAGAAATGTAGCTGCTGGAATGACAGGAGGGTTG GCTTACCTTCTTGATGAAGACGATACTCTAATTCCCAAGGTAAACAGAGAAATTGTTAAAATTCAACGAGTAACAGCGCC AGTGGGGCAGATGAAGCTGAGAAGCCTTATTGAAGCCCATGTTGAGAAAGCCGGTAGTGGCAAAGGTGCGGCTATTCTGA AGGATTGGGATAAGTATTTGTCATTATTTTGGCAGCTGGTTCCACCTAGTGAAGAAGATACCCCTGAGGCTAATGCCAAG TTTGGCACCACAACTTCAGAGCAGGTCACTTTGCAGTCTGCTTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0664300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALHSVASVSQVLLRPSAPFPSNLHAHWLVDFAPLGRKPKRRNRRFTPSISSVPLRRSAVLNVHRVPHSPPPPPSSSSSD LKPQVANLDDILSERGACGVGFIANLENKASHVIVKDALTSLSCMEHRGGCGADNDSGDGAGLMTAIPWDLFDNWADKQG IASFDKLHTGVGMVFLPKSVELLNEAKKVIVSIFQQEGLEVLGWRPVPVNTSIVGFYAKETMPNIQQVFVKIGKEENADD IERELYICRKLIEKAVSSESWANELYFCSLSNQTIVYKGMLRSQVLGLFYSDLQNDLYKSPFAIYHRRYSTNTSPRWPLA QPMRLLGHNGEINTIQGNLNWMQSREPSLKSPVWRGRENEIRPFGNPKASDSANLDSTAELLIRSGRSPEEAMMILVPEA YKNHPTLTIKYPEVLDFYDYYKGQMEAWDGPALLLFSDGKTVGACLDRNGLRPARFWRTSDNMVYVASEVGVIPVDESKV ISKGRLGPGMMITVDLLGGQVYENTEVKKRVALSNPYGDWIKENLRSLKAENFLSTSVMENDAILRQQQAFGYSSEDVQM VIEAMAGQGKEPTFCMGDDIPLAALSQKPHMLFDYFKQRFAQVTNPAIDPLREGLVMSLEVNIGKRGNILETGPENASQV ILSGPVLNEGDLESLLNDPLLKPQVLPTFFDITKGIDGSLEKALNKLCEAADEAVRNGSQLLILSDRSEALEPTHPAIPI LLAVGTVHQHLIQNGLRMSASIIADTAQCFSTHQFACLIGYGASAVCPYLALETCRQWRLSSKTVNLMRNGKMPTVSIEQ AQKNYCKAVKAGLLKILSKMGISLLSSYCGAQIFEVYGLGKEVVDLAFRGSVSKIGGLTFDELARETLSFWVKAFSEDTA KRLENFGFIQFRPGGEFHANNPEMSKLLHKAVRQKSQSSFAVYQQHLANRPVNVLRDLLEFKSDRAPIPVGKVEPASSIV QRFCTGGMSLGAISRETHEAIAIAMNRLGGKSNSGEGGEDPIRWKPLSDVVDGYSPTLPHLKGLQNGDTATSAIKQVASG RFGVTPTFLANAAQLEIKIAQGAKPGEGGQLPGKKVSMYIARLRNSKPGVPLISPPPHHDIYSIEDLAQLIFDLHQVNPK AKVSVKLVAEAGIGTVASGVAKGNADVIQISGHDGGTGASPISSIKHAGGPWELGLTETHQTLIENGLRERVILRVDGGF RSGVDVMMAATMGADEYGFGSVAMIATGCVMARICHTNNCPVGVASQREELRARFPGVPGDLVNYFLYVAEEVRGTLAQL GYEKLDDIIGRTDLLHPRDISLVKTQHLDLSYILSSVGLPKWSSTTIRNQETHTNGPVLDDVLLADPEVADAIENEKTVS KTIKIYNIDRAVCGRIAGVIAKKYGDTGFAGLLNITFTGSAGQSFACFLTPGMKIRLVGESNDYVGKGMAGGELVVTPVD NTGFQPEDAAIVGNTCLYGATGGQVFIRGKAGERFAVRNSLAEAVVEGTGDHCCEYMTGGSVVVLGKVGRNVAAGMTGGL AYLLDEDDTLIPKVNREIVKIQRVTAPVGQMKLRSLIEAHVEKAGSGKGAAILKDWDKYLSLFWQLVPPSEEDTPEANAK FGTTTSEQVTLQSA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| Phobius | 1 | 26 | 26 | - | – | |
| Phobius | 3 | 14 | 12 | - | – | |
| Phobius | 15 | 26 | 12 | - | – | |
| Phobius | 27 | 1614 | 1588 | - | – | |
| PANTHER | 49 | 1606 | 1558 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 49 | 1606 | 1558 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 98 | 497 | 400 | 20.337 | ||
| SUPERFAMILY | 98 | 524 | 427 | 3.55E-145 | ||
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GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Catalytic activity | Catalysis of a biochemical reaction at physiological temperatures. In biologically catalyzed reactions, the reactants are known as substrates, and the catalysts are naturally occurring macromolecular substances known as enzymes. Enzymes possess specific binding sites for substrates, and are usually composed wholly or largely of protein, but RNA that has catalytic activity (ribozyme) is often also regarded as enzymatic. | ||
| Biological process | Glutamate biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of glutamate, the anion of 2-aminopentanedioic acid. | ||
| Biological process | Nitrogen compound metabolic process | The chemical reactions and pathways involving organic or inorganic compounds that contain nitrogen. | ||
| Molecular function | Glutamate synthase activity | Catalysis of the formation of L-glutamine and 2-oxoglutarate from L-glutamate, using NADH, NADPH or ferredoxin as hydrogen acceptors. | ||
| Molecular function | Oxidoreductase activity | Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction, a reversible chemical reaction in which the oxidation state of an atom or atoms within a molecule is altered. One substrate acts as a hydrogen or electron donor and becomes oxidized, while the other acts as hydrogen or electron acceptor and becomes reduced. | ||
| Molecular function | Oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors | Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction in which a CH-NH2 group acts as a hydrogen or electron donor and reduces a hydrogen or electron acceptor. | ||
| Biological process | Oxidation-reduction process | A metabolic process that results in the removal or addition of one or more electrons to or from a substance, with or without the concomitant removal or addition of a proton or protons. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0664300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…