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LotjaGi1g1v0775800.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0775800
Transcript ID LotjaGi1g1v0775800.2
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description piezo-type mechanosensitive ion channel component; TAIR: AT2G48060.2 piezo-type mechanosensitive ion channel component; Swiss-Prot: sp|F4IN58|PIEZO_ARATH Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog; TrEMBL-Plants: tr|G7KZQ3|G7KZQ3_MEDTR DUF3595 family protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0775800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:134797045..134813172) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTTTGCATCCGAAGATTGCTATTGATGCATTTTCTCTGTTTTATGCAGCATCTGTACTTAATTGGAGCTTGATATCATT GGTTGATTTAATAGCCTTCCTTTTCATTCAGTATACGGCTCATAGAAAAGGTGATATGCTTGTTCTCATCCTTTATTTAG TCATGAACAGGTGAATATTCTACACCTAAAAGATTTAGTGTCCCATCAGGAATTTCGCGAAACACACTCTAAATTTATAT TTTGTTTGTAATTTTGTATCATTTCACCTCTTTGGTAGTGCTTTTAAGGCATTTTAGGTGCAAATAATCTTTTCTTCATG TGATGAACTTCTTTATTTTTCATATAGGATCTCGCTTCCATCAACAATCTTTGATACCATGGTCTGTCCTTATACTGTCC TCCTTGACACTACTCTCGCATGCCATATTTCATATTGTTTTGGCCATTGAGGGGGATCAGTGGAGTACTGCTGATGCACA ATGGGCTCAGCTAATTGGATTTATAAGGTAGTCTTTGGTTTTACACATTTTGTATTGTAGAACTTTTCTACTCAGTGTAT CACCATTCAGAATGCTCTACAAATATTGTATGCAATGACTTGCAGAGTGCAGTCTTGGAGGACTTTGCCTACGGAGTATT TTTTGGTCATTCAAGTATTAGCAACCTTTCTTTCTCTCATTGAAATATATGGAAATGGGTTTGGTCAAGATGCATCTTCT GTTCTGCTGATAGGTTTGTCATTTAGTTGCATTATGTTGTTAACAAATAAAACCTTGCAACTGAATAACATGAACAAACT GATTTCCTTATCTATGTGGAGTAAATATAAATGGATATTGATTTTTTGGTTGCAGGATCTCATCTCAAGGGCTTATGCTG CTTATTGTTGCCTGCTATACAATTAATTGTTGGGATTAGTCATGCATCTTGGGTTTCTTTTCCTTTTTTCATTTGCAGCA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0775800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTGTTAAGATCTCATCTCAAGGGCTTATGCTGCTTATTGTTGCCTGCTATACAATTAATTGTTGGGATTAGTCATGC ATCTTGGGTTTCTTTTCCTTTTTTCATTTGCAGCAGTATTGGGCTAGTTAATTGGTCATGGACAAACAATTATTTAGGTA TCTTTCGGTGGTGGCGATACCTTCTATATTATGCTGGCTTCAATATCATCTTTTTGTACATATACCAACTTCCTATCAAA TTACCAGAGACACTTAGGTGGATTTCTTACCACTTTGGGCTTTTCAAACTTTCTACAAAGTCAGAATGGTCAGAAGTTTG TAATGGTCTTTCACTTCTACTTTTCTACATCATGCTATCCTGGATTCGATGTGAGCTAGCCGAAATGGAAATCATCCCAT TAACAAGAGAAAGTGACTTGACCAAGCAGCTTCTTCCCAAAAAACACACTGATTTTGTTCATGAATCCAGGTCTGGTGTG AGGCATATTGATTTCTTATTTCGAGGAGCTGTTTCTCGATCGTTCAGCATAAACTTTCTAACATATGGATTTCCGATTTC CTTGCTAGCTCTATCATTCTGGAGTTTCCACTTTGCAAGTCTCTGCTCATTTGGATTGCTTGCTTATGTGGGATACATCC TCTATTCCTTCCCTTCCATGTTCCGATTGCACCAACTGAATGGCATGCTTCTTGTTTTCATTCTCTTTTGGGCAGCTAGC ACATATATCTTCAATGTAGCACTCACTGTCTCCGATAACAAATCATGGAAGTATATGAAGATGTGGGAAACTATAGGCTT GTGGCATTACCCTATCCCAGGATACTTTTTGCTTGCTCAATTTGGTCTTGGCTTTCTTGTTGGCATGTGCAATCTTGTAA TTAGTTCAGTGTTATCGTGCATTACTGATCAAGGACAACTAACAGCTGATGAATCTGTAGTGGAAGAGGAAGAAGAGACT ACAGTATTAGTTGTGGCTACAATAGTGTGGGGATTGCGCAAGTGCTCACATGCTGTAATACTAATATTGATATTTCTTAT TGCAATAAGACCTGGCCTCATGCATGCTGTTTATATGATTTTCTTTTTAATTTATCTTTTAAGGAATGCAGTCACTTGTA AATTACGCCAGGCAATTATCCTTTTATGTGAGGCACAGTTTGCACTTCAGTTCATTCTTCAACTTGATCTGATCTCCAAA ACATTGGATCAGAAGGGTTCTTATGCTTTTCAAATTCTGTCACAATTAGGCCTACTTAATCATATCTATTCAGTGGATTT CTTCAAAATATCGGTTCTCGCTTGCTTCTGCGCAATTCACAACAATGGGCTTCAAACACTTCTTCTATTTTCTGCTATTG TCCGGCACACATCTTGCCCCCCTGTTGGGTTTAGCATCTTGAGAGCTGGCTTGATTAAACCTGTTCGTTTATTAGGTCAT AGTCCAAGATCCAGTGAGATCCCAGGAACTCATGGGAGGAGGACAATATCTTATCTGGAGATTACAAGACAGAATTTTCT TTCTGTTTATCGGTCATGTGGCAAATACATTGCCTTCCTGACAATTCTCCTCTGTGTATACCTTTGCACACCCAACTATG CTTCATTTGGTTACTTATTCTTTCTTCTACTGTGGATAAGTGGAAGACAACTTTCGGGGAAAACTAGAAAGCATCTATGG AATCCAATGAAAATATATGCTGTATTTGTGTTTGTCTCCATTTACAGCATTGGTGTCGTTTCCAGCTCAGACATGTGGTT TCCCATGATCATTGATCTTCAAACTGCATTTGGGTATAACCCAGCTGCTTCAATGTTCCAAAACATTTGGGAATCCTTGG CTATATTGGTAGTGATGCAGCTATATAGCTATGAAAGGAGGCAGAGCAAAAGTTCTGGATCAAGTGACTTTGATTTACCA GAAGTTGGACCCTTTCCTTTTACCAGACGTCTTTTGGTTCGTCATACTGAGAAAATATTATTCCTTGCCCTGTTTTATGC ATCCTTATCACCTATTAGCGCATTTGGCTTCCTGTATCTTCTTGGTTTAATTAATTGTTCGAGATTACCAAAGTCTTCTC AGATCCCTGCAAAAGTATTTCTAGTTTATTCAGGACTTCTTATAATGGTTGAATATCTTTTCCAGATGTTGGGAGATCAG GCTGAAATGTTTCCTGGTCAAAAGTACTCTCAGTTGTCCTTAATTATGGGTTTACAGTTGTATAAGCCTGGTTTTAAAGG CTTAGAGTCAGGGTTTAGGGGAAAGGTTGTGGTTATTGTAGCATGTATACTTCAATACAATGTTTTTCGTTGGTTGGAGA AGATGCAATATGTTGATCCAAATGGAGGAAAATGGAACGAACCTTGTCCTTTGTTCAATATGGTAGATATTCCTAATGAA ACTACTGCCTGTACCCCACAAAATAAACAAGCAGAAACTTCCACCTCAGCAACAATTAAAAGACTTGCAAGAAGTCGTTC ATGTCCAACAGTTAATTCTGCATTATCCCAAGGAACAGATTCAGGGATTGAAGGAGACAGCACCAAAAAACTCAGACAGT TACATTTCTGGGAGAGTTCCAAGGATAGCTTGAAGTGGAATAGAAAGAGGCTTCTTTTCTTGAGAAAAGAGAGGTTAGAG ATGCAGAAGACTGCTTTGAAAGTATCGTTGAAGTTCTGGATAGAAAATATGTTCACTTTATTTGGTCTTGAAATCAACAT GATTGCTTTGCTTCTTGCTAGCTTTGCTGTGTTGAATGCCATCTCCTTGCTCTATATTGCATCACTTGCTGCTTGTGTTC TTCTACATCGGCTACTTATTAAAAAGTTATGGCCTATTTTTGTTTTTCTATTTGCTTCTGTCGTCACTGTTGAATACTTG GCTATCTGGATGCGCCTCACTTTTATGAACCTAGAGATTGAAGAACATGTACCATGCCGTGACTGCTGGAGAGTATCGGA TATATACTTTAGCTACTGCAGAAAGTGTTGGCTAGGAATTATTGTTGACGATCCTCGTATGCTTATTGGCTATTATGGGG TTTTCATGTTTTCCTGTTTCAAATTCCGTGCTGACAAGTCATCTAGTCTCACCGGATTAGAGATGTATCAAAAAATACAC TCTCAATGGAAGTCCGCATCTGTACTAAGTAATCTTTCATTTGAAACAAAGGGATACTGGACGTTTCTCGACCACTTGAG GCTTTATGGTTACTGTCACTTGCTAGATTTTGTTCTTTCCTTGATTCTGATTACAGGAACTCTTGAATATGATTTTCTAC ATCTTGGCTACCTTGGTTTTGCTCTGGTTTTCTTCCGAATGAGGCTAAAAATACTAAAGCAGGGAAATAACATTTTTAGA TACTTAAGGATGTATAACTTTGCTGTTATCGTTTTGTCTCTTGCATATCAATCTCCTTTTCTTGGTGACTTTAGTGAGAT CAAAAGTGGTTTCATAGAATACATCAATGAATTGGTTGGATTTCAAAAGTATGATTATGGATTTCGAATTACATCGAGAT CAGCATTAGTGGAAATCATCATATACATGTTGGTTTCACTACAGTCATACATGTTTTCATTTCCAGAGTTTGATTATGTA TCAACATACCTTGAGAAAGAGCAGATTGGTGCTATACTGCGACAGCAAGAGAAGAAAGCTGCTTGGAAGACTGCTCAGTT ACGGCACATACGTAAAGCTGAAGAGCTGAAGCATCTTCGAAGCTTGCAGGTAGAAAAGATGAAATCAGAGATGCTTAACC TTCAAAATCAGCTGCATAGTATGAGCACTGATGCGAACTATAGTAATGCTTCTCTAAAAAATGATGGTTTAAGAGAGAGA AGAAACTCTTTCCTAGAAAATGAATTCAGGAAGCAAGCTCTTGATACAAATACTGAGTCCATAGGCACATTGGATGTGAA TCAATCTCTCTTAAGTGAAAAATCTGAAAGTCCATTGGTACCAGAATATATGAAGCATCCAATGGGCTCTCCTCATGGAA TTGTTGAGGTAAAGGAAAGAACTAAAAACAACGATTTTTTGGATTTAGAAATACGGAATCGTTACAAACTGCCAGGAAAG AGAAATGCTTTAGTTTCAGCTGTACATTTCATAGGGAGTGGAATATCTCAGGCTCAGTCTCTTGGAAATATGGCAGTAAA CAACCTAGTGAACTATCTGAAGATAGAACGAGAAGGACAAGAGCCCACTGATGATTCTTCAGAAGATGAGGAATACTATG AGATTGAGAATCAGAATTCGGGTGCAGAACCTCTGGAGCCTACATTTTCCACAAACTCTATTAATGAGCATACTGGGTCT GATACTTCTTGCCTTCAAATTGGTATTCTTGTCCGTCACATATGGTCTCGAATGAGGTCGAATAATGAAGTTGTTTGCTA TTGCTGCTTCATTCTAATATATTTATGGAACTTCAGTTTACTTTCAGTGGTCTACCTAGCAGCTCTCTTCTTATATGCTC TCTGTCAAAATACCGGTCCAAGTTACATATTTTGGGTTCTTATACTAATTTATACTGAAGTGTGCATTTTGCTACAGTAT TTATATCAAATCATCATTCAACACACTGAGTTTGAATTCCCAATGAGCTTACTTCAAGAATTAGGATTTCCTGCAAAAAA AATAACATCGTCTTTTGTCACAAGCAACTTACCATTTTTCCTCATATATATATTCACTCTCTTGCAAATCTCCATAACCA TGAAGGGTGGTGGTTGGACAATCTCTGTAGATCCCAGCTTTTTTAGGAGAAGAAATCAAAAAAGCTACTTGGAGGATGTG AAGTGCTCCACCTACCATGAGAGAGTACAGAGATTATTTTTACCACTGAGCAATGCATTGAAACTGTTAACCAGAAGCCT CTGTAGGTACTGGAAATCATTAACCTGGGGTGCAGAAACTCCCCCTTACTTTGTGCAGCTGTCTATGGAAGTTAATTTGT GGCCTAAAGAGGGAATTCAGCCGAAGAGAATTGAATCAAAAATAAATAAGCTATTGAGGATCTTGCGTCATAGGAGATGC AAAGAGGAAAAGATTTTTAATTTGCACTCTGCAAGTAGGGTTCGTGTACAGAGCATTGAAAAAAGTGAAGAGAACGAAAA CTTGTGTCTTGTTATTTTTGAGGTGTTATACGCCTCTCCTCCAAATGAATTTGCTGCTGAAGAATGGTACAGCTCATTAA CTCCAGCAGCAGATGTATCCTATGAAATTCAGAAAGCTCAACATGCAGGTATTTTAAAAGAAATTGGGTTTCCATATCGA ATCCTTTCCGTCATTGGTGGGGGAAAAAGGGAAGTTGATCTTTATGCCTACATCTTTGGAGCTGATTTGGCTGTTTTCTT TTTAATTGCCATATTTTATGAATCAATTATGAAAGCTAACAGTGAGTTTCTTGAAGTCTATCAGCTTGAAGATCAGTTCC CAGAAGATTTTGTATTAGTTCTCATGGTTGTCTTTTTCTTGATCGTGCTTGATCGTATTATATACCTCTGTTCATTTGCA ACAGCAAAAGTTATTTTCTATTTATTCAGCCTTGTTCTCTTCACATATTCAGTCACAAAATATGCCTGGGACATGGATCC TTTGCGCAGATATTCTGGAAGATTAGCACTTCGTGCCATTTATTTCACAAAAGCAATCTCTCTGGTTTTGCAAGCCATAC AATTTCATTTTGGGATGCCACACAAAAGCATTTTGTACAGGCAGTTTTTGACCAGTAGTGTTTCACGAATTAATGTTATG GGGTTTCGACTATATCGCGCTATACCTTTTCTGTATGAATTGAGATGCGTGCTAGATTGGTCTTGCACGACAACATCTTT GACTATGTACGATTGGCTAAAGTTGGAGGATATTCATGCAAGCTTGTTTCTTGTCAAATGCGATGTGGATTTGAATAGAG CCAGCCACCAACAAGGGCAAAAACAGACAAAAATGACGAAGTTCTGCAATGGGATATGTTTATTCTTTGTTTTAATGTGT GTCATATGGGCTCCAATGCTGATGTACAGTAGCGGTAACCCAACAAACATTGCGAACCCGATCAAAGATGCCAGTGCTCG GGTTCATATAAAGACATTAAGTGGAAGGTTGACATTGTTTGAGACTACTTTGTGCGAAATTATATCGTGGGAAACCCTTG AAGCACGAACAAGTTTGGACCCCAAGGGTTATCTTAGCACATATAATGAGAAAGACATTCAACTAATTTGCTGTCAATCA GATGCAAGTACATTGTGGCTTGTTCCACCTATTGTACAGGCCAGATTTATGAAGTCCCTTAGCTGGAACATGGACCTTGC TTTCTCCTGGGAATTCACCAGAGATAGGCCTAGAGGAAAGGAAGTAGTGAAGTATGAATTAACCATACAGGAGCAGGATC TTCCTAAATCTTCAGAAGTTACTGAAGTTTTCAATGGTACTTCCAATAGTTTCTCAGCGTTCAATATTTACCCTAGATAT TTTCGGGTCACAGGCTCTGGAGATGTGCGGTCCTTGGAACAGTCGGTGGAGCTAGTTAGTGGGGATCTTGTTCTCAACCG TGGCAATCCAGAATGGTGGTCTTTTTATGATCTTGACATCTCTGATGCACATGGATGTGGGAAGTTCCCAGGACCGATGG CGATAATTGTATCTGAAGAAACCCCACAGGGCATTATCGGTGACACTCTCAGCAAGTTCAGCATCTGGGGTCTTTACATC ACCTTTGTGCTTGCGGTTGGACGATTTATCAGATTACAATGTTCTGACTTGCGAATGAGAATTCCTTTTGAGAACCTTCC TTCTTGCGACAGATTGATGGCACTGTGTGAAGATATATACGCTGCACGAGCAGAAGGAGAGCTAGAAGTGGAAGAGGTTC TGTATTGGACGCTTGTTAAAATTTATCGCACTCCACACATGCTGTTAGAGTATACACAGGCTGAATAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0775800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLLRSHLKGLCCLLLPAIQLIVGISHASWVSFPFFICSSIGLVNWSWTNNYLGIFRWWRYLLYYAGFNIIFLYIYQLPIK LPETLRWISYHFGLFKLSTKSEWSEVCNGLSLLLFYIMLSWIRCELAEMEIIPLTRESDLTKQLLPKKHTDFVHESRSGV RHIDFLFRGAVSRSFSINFLTYGFPISLLALSFWSFHFASLCSFGLLAYVGYILYSFPSMFRLHQLNGMLLVFILFWAAS TYIFNVALTVSDNKSWKYMKMWETIGLWHYPIPGYFLLAQFGLGFLVGMCNLVISSVLSCITDQGQLTADESVVEEEEET TVLVVATIVWGLRKCSHAVILILIFLIAIRPGLMHAVYMIFFLIYLLRNAVTCKLRQAIILLCEAQFALQFILQLDLISK TLDQKGSYAFQILSQLGLLNHIYSVDFFKISVLACFCAIHNNGLQTLLLFSAIVRHTSCPPVGFSILRAGLIKPVRLLGH SPRSSEIPGTHGRRTISYLEITRQNFLSVYRSCGKYIAFLTILLCVYLCTPNYASFGYLFFLLLWISGRQLSGKTRKHLW NPMKIYAVFVFVSIYSIGVVSSSDMWFPMIIDLQTAFGYNPAASMFQNIWESLAILVVMQLYSYERRQSKSSGSSDFDLP EVGPFPFTRRLLVRHTEKILFLALFYASLSPISAFGFLYLLGLINCSRLPKSSQIPAKVFLVYSGLLIMVEYLFQMLGDQ AEMFPGQKYSQLSLIMGLQLYKPGFKGLESGFRGKVVVIVACILQYNVFRWLEKMQYVDPNGGKWNEPCPLFNMVDIPNE TTACTPQNKQAETSTSATIKRLARSRSCPTVNSALSQGTDSGIEGDSTKKLRQLHFWESSKDSLKWNRKRLLFLRKERLE MQKTALKVSLKFWIENMFTLFGLEINMIALLLASFAVLNAISLLYIASLAACVLLHRLLIKKLWPIFVFLFASVVTVEYL AIWMRLTFMNLEIEEHVPCRDCWRVSDIYFSYCRKCWLGIIVDDPRMLIGYYGVFMFSCFKFRADKSSSLTGLEMYQKIH SQWKSASVLSNLSFETKGYWTFLDHLRLYGYCHLLDFVLSLILITGTLEYDFLHLGYLGFALVFFRMRLKILKQGNNIFR YLRMYNFAVIVLSLAYQSPFLGDFSEIKSGFIEYINELVGFQKYDYGFRITSRSALVEIIIYMLVSLQSYMFSFPEFDYV STYLEKEQIGAILRQQEKKAAWKTAQLRHIRKAEELKHLRSLQVEKMKSEMLNLQNQLHSMSTDANYSNASLKNDGLRER RNSFLENEFRKQALDTNTESIGTLDVNQSLLSEKSESPLVPEYMKHPMGSPHGIVEVKERTKNNDFLDLEIRNRYKLPGK RNALVSAVHFIGSGISQAQSLGNMAVNNLVNYLKIEREGQEPTDDSSEDEEYYEIENQNSGAEPLEPTFSTNSINEHTGS DTSCLQIGILVRHIWSRMRSNNEVVCYCCFILIYLWNFSLLSVVYLAALFLYALCQNTGPSYIFWVLILIYTEVCILLQY LYQIIIQHTEFEFPMSLLQELGFPAKKITSSFVTSNLPFFLIYIFTLLQISITMKGGGWTISVDPSFFRRRNQKSYLEDV KCSTYHERVQRLFLPLSNALKLLTRSLCRYWKSLTWGAETPPYFVQLSMEVNLWPKEGIQPKRIESKINKLLRILRHRRC KEEKIFNLHSASRVRVQSIEKSEENENLCLVIFEVLYASPPNEFAAEEWYSSLTPAADVSYEIQKAQHAGILKEIGFPYR ILSVIGGGKREVDLYAYIFGADLAVFFLIAIFYESIMKANSEFLEVYQLEDQFPEDFVLVLMVVFFLIVLDRIIYLCSFA TAKVIFYLFSLVLFTYSVTKYAWDMDPLRRYSGRLALRAIYFTKAISLVLQAIQFHFGMPHKSILYRQFLTSSVSRINVM GFRLYRAIPFLYELRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDIHASLFLVKCDVDLNRASHQQGQKQTKMTKFCNGICLFFVLMC VIWAPMLMYSSGNPTNIANPIKDASARVHIKTLSGRLTLFETTLCEIISWETLEARTSLDPKGYLSTYNEKDIQLICCQS DASTLWLVPPIVQARFMKSLSWNMDLAFSWEFTRDRPRGKEVVKYELTIQEQDLPKSSEVTEVFNGTSNSFSAFNIYPRY FRVTGSGDVRSLEQSVELVSGDLVLNRGNPEWWSFYDLDISDAHGCGKFPGPMAIIVSEETPQGIIGDTLSKFSIWGLYI TFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPFENLPSCDRLMALCEDIYAARAEGELEVEEVLYWTLVKIYRTPHMLLEYTQAE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 9 9 -
Phobius 1 33 33 -
PANTHER 3 2315 2313 0.0
PANTHER 3 2315 2313 0.0
Phobius 10 21 12 -
TMHMM 15 37 23 -
Phobius 22 33 12 -
Phobius 34 56 23 -
Phobius 57 75 19 -
TMHMM 57 79 23 -
Phobius 76 164 89 -
Phobius 165 184 20 -
Phobius 185 195 11 -
TMHMM 193 215 23 -
Phobius 196 217 22 -
Phobius 218 228 11 -
TMHMM 228 250 23 -
Phobius 229 250 22 -
Phobius 251 269 19 -
TMHMM 265 287 23 -
Phobius 270 294 25 -
Phobius 295 337 43 -
Phobius 338 367 30 -
TMHMM 339 361 23 -
Phobius 368 515 148 -
Phobius 516 544 29 -
TMHMM 516 545 30 -
Phobius 545 564 20 -
Phobius 565 587 23 -
TMHMM 565 587 23 -
Phobius 588 606 19 -
TMHMM 602 624 23 -
Phobius 607 624 18 -
Phobius 625 658 34 -
Phobius 659 683 25 -
TMHMM 659 681 23 -
Phobius 684 694 11 -
Phobius 695 714 20 -
TMHMM 696 718 23 -
Phobius 715 906 192 -
Phobius 907 931 25 -
TMHMM 907 929 23 -
Phobius 932 942 11 -
Phobius 943 962 20 -
TMHMM 944 963 20 -
Phobius 963 1067 105 -
TMHMM 1066 1088 23 -
Phobius 1068 1086 19 -
Phobius 1087 1091 5 -
Phobius 1092 1109 18 -
TMHMM 1092 1109 18 -
Phobius 1110 1120 11 -
Phobius 1121 1138 18 -
TMHMM 1122 1141 20 -
Phobius 1139 1165 27 -
Phobius 1166 1185 20 -
Phobius 1186 1463 278 -
Coils 1244 1264 21 -
Phobius 1464 1490 27 -
TMHMM 1470 1492 23 -
Phobius 1491 1501 11 -
Phobius 1502 1522 21 -
TMHMM 1504 1526 23 -
Phobius 1523 1773 251 -
TMHMM 1559 1581 23 -
Phobius 1774 1797 24 -
TMHMM 1775 1797 23 -
Phobius 1798 1816 19 -
Phobius 1817 1837 21 -
TMHMM 1817 1839 23 -
Phobius 1838 1843 6 -
TMHMM 1844 1863 20 -
Phobius 1844 1863 20 -
Phobius 1864 1874 11 -
Phobius 1875 1897 23 -
TMHMM 1876 1898 23 -
Phobius 1898 1987 90 -
Pfam 1927 2313 387 7.7E-111
TMHMM 1988 2010 23 -
Phobius 1988 2009 22 -
Phobius 2010 2232 223 -
TMHMM 2233 2250 18 -
Phobius 2233 2250 18 -
Phobius 2251 2315 65 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Mechanosensitive ion channel activity Enables the transmembrane transfer of an ion by a channel that opens in response to a mechanical stress.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0775800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…