Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message

LotjaGi2g1v0144500.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0144500
Transcript ID LotjaGi2g1v0144500.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Myb transcription factor; TAIR: AT4G25560.1 myb domain protein 18; Swiss-Prot: sp|Q9M0K4|LAF1_ARATH Transcription factor LAF1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9VIR1|A0A0L9VIR1_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0144500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:52351814..52361636) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CATGAATAAGATCTTTTAAAAGTGCTTGCCAATAAAAATGTTCCATATGGGCCATTTTGTGTTGGAAAAAAAACCATGCT GATCATACCCAAAATATATTCATGTACGATTTGGGATTATTTTGATAAATGATTGATGCAGAGAAACAAACAATGATTGG TACAAATTTATTCTAACAGTTTCCTAGATGGTACCCTTCCAATAAGGAAAAGCATGGTTTCTACCAAGCAGGACATAATT TCTTTTTAACATCATTTCAGAGAAGGTTTTACATGCTTGGTTAATATTTATTTTAATGATTTTTGTTTCAACTCTTTTCT GGTATAAATTATGGGCATCCACTGCACCATAATCACAACTATTCGTTACATTATATATTAGTCTGAAATATTCTACCTCT ATTTTCTTTGTGGACTACTTGGTCTCTCTGTAGTTCATATCAGCTTCAGGGAATCCAAGGTTGCCATCAAAGTGAAGTGG TGTTAGAAAAAAGCAGAATGGGGGTCCAGTTACAGGAAAAAACAAAGCCAAAATACAGAAAGGGTTTATGGTCACCTGAG GAAGATAATAAGCTCAGAAACTATATCCTTAACCATGGTCATGGCTGCTGGAGCTCTGTCCCCATTAAGGCAGGTAGGTT TCTTTCCAATTGGTGATCCTTTATCAGTAAGTAGCATAATCTTGGTCCATGTGCTGTCTTATATAATTCAATTGATTCTT CCTTGGTTTTGTTGAGGAGAAGTTTCTCTTCCTTTCATATGATAAAATGTGCATTCAACTTATTTATGTGTTTGGATTAG TGTGTAACATGAACGAATTCATAAAAAGAGTTATTATCACTTTTTATCTTGAACTCATGTTAACCTCAATTTACGTAGGG GTGAACAGTTATACAAACATAACTCATACTTAAGTTATCAAACAGAAATGTAGGCATTCTTCACTGACTTTGGCACCAAT AATTTTGAGATATCTAGTGAAATAAACTACTAACAATTAAGACATTCTTCTCATGAATCAGTTTTAAGAATTTTGTCCAA TCCATTTAAAATTAGAAAAGAAGAAATGTGGTTAAAAGTTCAAAATCTTCTTTGTAAAAGACAACCTAAGGATTATCCAC AATTCTGATTTCCAAACTTTTATACCATATGGCTGACATGATAATCATTTTGTGTTAACTTCTGATTCTGCAGGTAAAAA TATTCATGTTAAAGTTAGAGATGGGTTTTTATTGTGAATAACTTAAAGTTTAAATTATTTCTTATTTTGTTCTACATTCA CTAGAGATATATACTTTATAAAGAGTAGGATAATTCTAACCGCTGAACTAATTTTTGGAGCAGAGTAAAACTTAAATCAA ATTTTAATATGGTGGTAGAGCCAATTTTAAATCCAAGGCCACCCCTAAAAAATTAAGATTAAAGAATCATGTTCTTTCAT GTAAATATTTCATGATAGGGATAAAGGTATTGACAAGACCTCTCATGTTCATATCCCGCACTTGAAGGCGAGTTCAAATC ATTGATTTAAGATGTGACTAATAAAATACATATAAAGGGTTGGACAATCTTACTCCTAAGCTAACTCTTGGCATGTGGTT AGGTTTATTCAGAATTCTAATAATGTAGCAGCAGGTGAATTTGTATTCATTTAATTATAGCTTATTTTGAATTGCTGACT AAGTGTGCTGAAATATCCAGGATTGCAAAGGAATGGAAAGAGCTGCAGACTAAGGTGGATCAATTACCTGAGGCCAGGAC TAAAGAGAGGGGTATTCAGCAAACATGAGGAGGATACAATCATGACCCTTCACCACATGTTGGGTAACAAGTAAGCAAGA ACACCTTCCCTTTCACCTTATTAATTTTTAATTATTTCAATTGCACCTAGAGGTCAAGAACTAAAAATTGGAACTTTTAG TGAAGATAATGATATAGCCATAGTAGACTTTTGAGTCAAGGAGTTGTTAGTTACCAAATAATTAGGTAGTGCAAGTGCTG CAAGTAAAGGAAAATATTATTTTTTGCATTTATTTATATATTTATTTATGTTGAGGACTTACGCTATTGAATGTCATTGG ATTTCCATGCCAGCTATCTCCTATTTAATGTTATTTAAATACTATTCGTACCAAAAACTAGTACGACAATGAAACCATGA ACTGGCATTTGATCGCATGCTCCTTTTTCAAATAGAGGGAGAGACGTGAATGTACATATAAAACATATCTGGTCTACTAT TCCTTAACTTTTTTAAATGAACTTAAATTTAGCCCAGCATTAGCATTATTGAATAATTGTTAGACTTTTCCATCACAAGT ATTTAACAATCAAAATATTAAAATATTTCTCTAAACATACTGTTATGCCATATGATGAAATGTTTCTTTAATTAAACTCC GTTGGAACTGAGCCTGCCCCCAACATGTGAAACTAAGGATGCAATTACTATGAGTTTAATTTAAAGTGCATCACAAACAC ATAAATTGAACTCATTAGGTTTGGTGACATTTATGAAAAAATGATTTTTATAGGTAATATTGTGAAATTCAATCACAAAA TTTCATAATTGATCATGTTAAATGCATGCATAATTGATTATGTGTGAGATTAATTCCACAAATTGATTCTCAATTATCAA TGTTTTCATCCATAATTGATTTTACTCTACCGAAATTGATTTTGGAGTTTCCAAACAAGCTCTCAATCTCTCAAAGCGCG CGCTTGTTTAGATATCAATTGAGTAATCAGAATAGTTGCTTTAACTTTTTATACACTAATGTGCCAACAGATATTTAAAT GTATCATTACAATTCAAGTGTGTTATTTTTGGGAAGACATTTTCATCAGCGTTATTTCTTTCAACTCATTAAAACAAAGC CTGATAGAATGAATAATCACACAATATCATTTTCTTTGTACCCATTTTGCAGTGTTCAATCTTTGATTTCCCTAAAACAA TTCTTTTTTTTTAATGGAATCTGCTGAGAGAAACTTAATATATATTTTGATCAGGTGGTCTCAGATATCACAGCATTTGC CAGGAAGGACTGACAATGAGATAAAAAACTACTGGCATTCATATTTGAAAAAGAAAGTACTCAAACCTCATGAAATGGAA CCTCATAGCCAAACTCAGCATGCTAGCTCAAGCTCAGACACAAAGGACTCATCACTCTCTACACAGAAACTCTCAATTCA GGATCCTAATTATGGAATTTTAGAAAACATGGAAAAATCAACACCACAATATTCTGATCACCACCTCTCACAAAACTATA ACTTGGCCAAGGATACTTCTCAAAGCTCCTTACCAAAACTGCTATTTGCTGAGTGGCTTTCAGTGGAGCATGTGAATGCT GGTGGAAGCTCTGTAAATTCTGAAGACTCTTTGGTCAATGGATTTGATCAAACTTCAACTTTCCAAGAACCTGTGATGAA TATGTCAGGAGGACACTTCGGTGAAGAGTTTCATGATAGTCTAATTCACAACTCAGCTACTGCTATGTACAATTCACAGC TTAACTTACCAGGTCAAGGGGATGAAAATGACTATGTCCATTATATACAAGGAGGAGATTTATGTAGCAATTTCACCCTG AGCATTGATTCAATAATGTATGTATAAGGAAGAAGTGTACAAGACTTCTTAAAAAGGAAGAATAATTTGCCCAGCGTCTG TGTTGTTCCCGGAGATCTCTTCTCCTTGCAGGGGCGTTGAGTGGGCTGTTTCTGGTGGGATGAGGGCTCTTCCCAGGGAG GCTCTGTTCCCTGAATTGGGGGCGGGCCTCTCTGGTTCTGATGCAATTGCTTGCTTGGAGGCTCCTTCTTCCGTTCCGGT TTGCGACCCCCTCTCCCTTCTAGTGTTTTTCATACCATCACATCCCAAACACATTCTCTTATTTTAGTTTCTTAATACTA TTTATCACCATTTATGTGGGTTCATTGCCACAAAAGATTTAAGATCTCAAATGGAACAGAGCAAATTTTGCTTCAACTAT GATTTTTTATTTTACTATTACTCGGGTCTCATCATAGCACAAATATTTATAATGCAAGTGAGAGAATTTAATAATACTCA ATCTAACGAACCATAAAGTAGAGTTTCTTAGTGTTTTAATTTTAAGGAACCAAGACTCCAAGATCACAAGTGTTTGTTTA AGGCTCACAAAAAACCGTGATTTTAGAGGGACCTAAGATATGATAAAAATTGATTTTTATATCACTCTAAAATTATGGTT CTTTGGTTTAGGTCCCACTAAAATCATGATTCCTTGGTTCTGACCTATACATATAACAACATTAATTAGTGGATAGTAGT CTTTTATATTTGGACCTAATTGTAATTTTTTTATTTCTCATTTTTTTTTTTGTTACAAGAGGAATTTCTCATATATTTGA ATTAAGATTGAAGATTTCATATTTAAAAATAAAAGTTATCATTATTTAAATTTCAATTAGTAATCATGACTTGATAAAAT TAATTAAAGATAATAATGATAATAATAAGTTGATTGGTTATGACCCTTTTTGGTTTGTTCCTGGGTCGTGGGGCTTGGAT TTTGCGCTTCTTATCTAGGTTTTTTTTTTGGGCTGTCTATATTGCTTGGTAGTTTCCTTTTTGTTGCGCAAATCTCCACT TTGCTCCTACTCTTGCTAGTTAAGCTTTGAAATGTATATATAATATTATCGTTTAGCTGTAAAAAAATAATAAGAAAAAT TGAAATTGACTCACACTATATAAAAATATTAATCATTTATTATAACCTTTTATATTATTATTTATACTAATAACTAGTTG TAAAAGATTTCAATTACTCATAATTAAATTAAATATTAATATTGTTTAAATTTTAATTATTAATCAAAATTTTAATATTT TTTTATAATAAAACAATATTAATAAGAAGAAGTAAAATTGACTTGACTTGTACATTGATAACTACATTAATGAGTGGATA ATAGTCTTTTATATTTATAACTAAAAGATTCGAGAGCTCGAAGACAATCTAAAATCTATTATGGGAAGAATGGAAGTGGT GGGAGTGTCTGAGGAGCTTCGAAAAGACAGATTTCAAGTAATGGAGGTTCTGTGGAGGGAATATACAAACGAGGAAAGAA AATGGCGGGTGAAATCTCGGGTACAATGGTTGAAGGAAGGGGATCGCAACACAAGGAATTTTCATCGTGTTAGTAAAGCA AAATCAGTTAAGCGTAACATGGTTCACCTAAACTATGATGGGAGGAGCTTGGAAAATCCGAAGGAAATCAAGGAAGCGGT TCGTGATCATTTTGTTCAGTTTTTTGCTTCGGACAACAGGGATAGGCCAACGCTGAGGAATTTGGGAATGAAAACAATGA GTATGGCAATGAATATGTTGCTAGAAGAAGAGTTCAGTGAGGATGAAATCAAGGATGCTATTTGGGGTTGTGATGGTAAC AAAGCACCGGGTCCGGATGGGTTTACAATGGCATATTTTACAGAGTTTTGGGATGTAATCAAGGCTGATCTGTTTAATTT TTTTCCAGGAATTTTACCGGTTAGGGAAGTTTGTGAGAGGTTTGAATACAACGTTTGTTTCTTTGATTCCCAAAGGAGAT CGGCAAGATTCTATTGCAGATTGTCGCCCTATTAGCCTTATAGGAAGCACTTACAAGATAGTCTCTAAGGTATTGGCCAA TAGACTAAGCCTGGTGCTTCCGGGGCTGCTGTCAGAGAATCAATTTGCATTTACCAAAGGTCGACAGATTGTTGATTGCT GTTTTATTGCAAATGAGGTGGTTGATGTGCTGAAACGGAAACCGGGTGGCAAAATTTTGCTTAAGTTAGACTTGGCAAAA GCTTATGATAAGGTTGATTGGAATTACCTGTTTGATATTATGCAAAATATGGGTTTTGGAGATAAGTGGTTGGAGTGGAT TCGATGTTGTGTGACTACGTCGTCTCTTGCGGTGTTAGTGAACGGTTCACCAACGAAATCTTTTTCTTTTCACAGAGGTT TAAGGCAAGGGGATCCTCTGTCCCCTTTGCTCTTTAATTTGTGTGTTAATGGCTTGTCTGTGATGCTTAATCAGCTATTG CAAGAAAATAGTCCGTGTGGTGTTAATGTGGGGCATGATCTTTTCCTAAACCATTTGCTATTTGCAGATGATATTCTTCT GTTTTGTGAAAATCATTTTTGGCAGATTGAGATGTTGGCAGACACAGTGGAGGCTTTCCTATATGTTTCTGGGTTACAGC TTAATTTCCAAAAATCGAATGTCATTGGGGTTAATGTTAATGATGAGCTGGTACAAAGAGCAGCGGTATATTTGTCTTTC TCAAGTTGTCATTTGCCTGTAATGCATTTGGGTTGTTCGCATGGGGGTAATCCACGAAGAAAGATTTTTTGGGAGCCCGT TTTACAGAAGCTTAAGCGTAAGTTGGGGTCAATGACTTCACGGTTTTTATCATTAAGCGGGAGGTTAGTGCTCTTGAAGG CAACTCTAAATTCTATACCGCTGTATTTTATGGCAATATACAGGGCACCGGTAGGGGTGGTTAAGGAGATGGAGAAAATA ATGCAGAGGTTTGTGTGGGGCTTTAATGATGGGGGGAGAAATATTGTGTGGGTTGCTTGGGGAGACATTTGTAAGGGAAG GAGGCTTGGGGGCTTAGGAGTGGGATATCTCGAGTGGCGAAACTGAGCTTTGTTGCTGAAGTGGGTGTGGAGGTTTGGGA GGGAGAAGGGAGCTCTTTGGAGAAGGGTGGCTTGTGCAAAATATGATATCCCAGAAGAGTTCATTTGCTTGGATTTGATC AGGTTACAGCGTCAGAAAGCTTCTTTGGTTGTGGCAGATATTTACAAAACCTATACAGAGGCGTCTCTGGTGGCTGCTGA ATTTAAAAGAGGATTAGCATGTCAGGTAGGTGATGGTGTTAGTGTTCGGTTTTGGTCAGATATTTGGTTCGGGGATGCAC CGCTGCAGGTGAGGTTTCCTAGAGTGTTTGCTCTTGCTCGTGATAAAAATGTATCGGTGGCCCAAGTGCGTATCTCCAAT GAAGAGGGGATGGGGTGGTCCTTTGATTTTCGAAGGGCGTTCTTTGATTGGGAGTTGGGGCAATATGATGATTTTATGCA ACTCATCAGTTCGCATGTGCCGGCAATGGATAAGGACGATAAATTGATTTGGAGAGGGGATCAGTCAGGGTTCTTCTCAG TCAAAGCAGTGTGTGATGCAGCGGAAGCATTGTGGATTGCGAGCGAATCCTAGATGGTACCCGTGCGTATTTCATGGGTG ATCCCAGCCAAGGTTTCCTAATTCGTCTGGCAGCTGCAGGCCAATAAGGTGGCTACTAAAGATAATCTGATTGCTCGTGG TGTGCCAGATATTGGGGAGGGACTCTGTGATTTTTGTAGGCGGGTACCAGAAACAACGGGTCATTTATTTATTCATTGCC CGGTTGTTTGGGAGCTATGGTGTAAGGTCTTGAGTAGGGAAGACATGGTGTGGGTGTGTCCGAGGATTGTTGAAGCTTTA CTGTTAGCATGGGAGGGCTATCGAAGAAGGGTTGATAAGTTTGTTTGGGAATTGTTCCCTTATGTCGTGTTTTGGACAGT TTGGCTTCACCGGAATGATTGTGGGTTTAATCAAGGAACTGTTTCTTCAGTTCATTTATGGGACCTGAGTTTGGTTCATG TGTTCTGGTGGATTAAGGGCGCGTGGGAGGAGTGTCCTTATGATTTGCAGCAGTTTGTGGCGGGTTTTGAGCATGTTCGA TGGCCACAAAAACAGAAGGTACAACGTGTTGTTTGTTGGACTCCACCGCAAGCTCCTTTGTTGAAATTTAATGTTGATGG AGCGTCAAAAGGAAACCCGGGTCAGAGTGGGATTGGTGGAGTGCTTAGAGACCATGACGGGGAACCTTTGGGTTTTTTTG CAAAAGGAATGGGTATCTTGTGGGCCTTTGAGGCAGAAGTCCAGGCTGTGTTACATGCCTTGCGGTTTTGCTCTCAATTT AGTTTTAAGGATGTTGTGATTGAAACTGATTCTACTCTAGTGGTGGGATGGATATCTAGTGGAGATAGGAGGCCATGGAA GCTAGAACATGTTTTTAATCGTATTGACCAGCTAATGGCTGAGGTGAGGTGTGTAGGGGTGGTGCATGTACTACGTGAAG GGAATACGGTTGCAGATTTTTTGGCAAATCAAGGATGTGGTAGGGAGAATCAAATATGGGTCTGCAGTGGTATTACTGAA TGATAAGGGTAATCATAGTACTGGTATATTTACCATATATCTGCATATTTCTGTCTGCTGCAATTGTATGTGAAGTTGTT CATTTGCTGCAAGTGATTTGGTGGGTTCAAGGGGTTTCAAAGGTTTTTTTAATGTATATGCCAACGGTGGGATTGTGATA TTTTGATTGTGGGAGGTTTTTTGTTATGATCTTTGGCTCTTTGTGGTGACTTGGTAGCCAAAAGTTTTGGTTCCTTGGGT ACTGTAGGTGTCTCACGGGGTGACTAAAAGGAGTTTGGTTGTGTCAAGATTTTTCAAGGCTTTATATGAGACTTATTTTT CCACAGGAGCTAAAATGTGTTGGTGATGGGTTGTGTTGGAAACTACTTTTTTGGCTGTGGTCACGGTGCATTTTTGGGGG GGTTATATGATCTGTACGGTATATGGCATCTTTGAGACTTGAGTACTCTTTTTCCTTCCTTAGGTTTTTTCCCATTGGGT TTTTCCTAGGAAGGTTTTAATGAGGCTTAGTCTCAAGGTTTTCTTTGGCCATAGGGTGGGTTTTGTCTTCCCTTTCTGGA TTATACTTGTACTCTCTTTTTGTTGTGCTTTTGTAGCACTTTATTAATAATATATATTCAGCTTCAAAAAAAAACTTAAT TGTAGAAAAAATTAATTTCTGTGACGCCCAAACTTGTGACGCAAATTAAGTTCTAATGATGCATTACTTGACTAGAAATT TAAAACTTCTCTTCATTAATCACAACATCAAAACTTAGATATATCTTCGAATTGTAATTTCAATGAGAAACTTTCTTAAG TTATATAGTCTAAGGTAAACTTCCGGTGTACACAAAATGCATGATCCTGAGTCCTAAGCTCCTGAAAATCTTATGTCTTA ACTTTTCAGGAATATTTAACGTCTATACTCCCTATTGTCTGAAGAGCACAAGTCTGGTTTGAAGAACGCATCGTCCAAAG ATTATTTGACCAGTTAATGAAAGAACTGTTACATACAATTGAAGAAGTAATATGGTTCAATGAAGAAGCTGAAGAAGAGA CTTAAGTGATAAGTAGCTAGAAGAACCAGGTCTTATCAAGTGAGCTACAAAAGTCTTGTTGAACAAAGAACAAAGCGAAA GTACAATGTTGTCATAACAAGTCACATCAGACAGTTATTTACCAACTCCAAACTTTCACTCAAAGAGGACAGATCCACTA TACGAGGACTTCACCTACCTTTTGGATCACCTTTTCAGAAGTCTTCTCTGAAGCAAAGTACAACGACGTGCAAAAGCATT AAACGCAAAGCAAATGTCTGTTTGTATTATAGAAGGCTTGGACGGTCAAGCACTCAACAATGTCTCTTGACCTAAAGTGA GAAGTATATGAAGAAGACTTGAAGAGCTGAAGTAATAACAATTCTTATATAATTATATATAAGCTAAAAAAACATTTCCT CAATATATAAATATTGCTTATAAAAAAATATAGCTAAAATAATTTTATTCTATTTTTTTTTCTCAAATTAAGACCACGTC TCAATTTTACAACTCATGGGGACTTAGGTGGTATACTTTGTTCATATCTAAAGAAATTCTCAG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0144500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGGTCCAGTTACAGGAAAAAACAAAGCCAAAATACAGAAAGGGTTTATGGTCACCTGAGGAAGATAATAAGCTCAG AAACTATATCCTTAACCATGGTCATGGCTGCTGGAGCTCTGTCCCCATTAAGGCAGGATTGCAAAGGAATGGAAAGAGCT GCAGACTAAGGTGGATCAATTACCTGAGGCCAGGACTAAAGAGAGGGGTATTCAGCAAACATGAGGAGGATACAATCATG ACCCTTCACCACATGTTGGGTAACAAGTGGTCTCAGATATCACAGCATTTGCCAGGAAGGACTGACAATGAGATAAAAAA CTACTGGCATTCATATTTGAAAAAGAAAGTACTCAAACCTCATGAAATGGAACCTCATAGCCAAACTCAGCATGCTAGCT CAAGCTCAGACACAAAGGACTCATCACTCTCTACACAGAAACTCTCAATTCAGGATCCTAATTATGGAATTTTAGAAAAC ATGGAAAAATCAACACCACAATATTCTGATCACCACCTCTCACAAAACTATAACTTGGCCAAGGATACTTCTCAAAGCTC CTTACCAAAACTGCTATTTGCTGAGTGGCTTTCAGTGGAGCATGTGAATGCTGGTGGAAGCTCTGTAAATTCTGAAGACT CTTTGGTCAATGGATTTGATCAAACTTCAACTTTCCAAGAACCTGTGATGAATATGTCAGGAGGACACTTCGGTGAAGAG TTTCATGATAGTCTAATTCACAACTCAGCTACTGCTATGTACAATTCACAGCTTAACTTACCAGGTCAAGGGGATGAAAA TGACTATGTCCATTATATACAAGGAGGAGATTTATGTAGCAATTTCACCCTGAGCATTGATTCAATAATGTATGTATAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0144500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGVQLQEKTKPKYRKGLWSPEEDNKLRNYILNHGHGCWSSVPIKAGLQRNGKSCRLRWINYLRPGLKRGVFSKHEEDTIM TLHHMLGNKWSQISQHLPGRTDNEIKNYWHSYLKKKVLKPHEMEPHSQTQHASSSSDTKDSSLSTQKLSIQDPNYGILEN MEKSTPQYSDHHLSQNYNLAKDTSQSSLPKLLFAEWLSVEHVNAGGSSVNSEDSLVNGFDQTSTFQEPVMNMSGGHFGEE FHDSLIHNSATAMYNSQLNLPGQGDENDYVHYIQGGDLCSNFTLSIDSIMYV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 5 264 260 1.5E-127
Gene3D 5 67 63 6.6E-17
PANTHER 5 264 260 1.5E-127
ProSiteProfiles 10 62 53 16.279
SUPERFAMILY 13 109 97 1.25E-27
SMART 14 64 51 3.4E-10
Pfam 15 62 48 3.9E-12
CDD 18 62 45 1.65651E-9
ProSiteProfiles 63 117 55 24.147
SMART 67 115 49 2.2E-14
Pfam 68 113 46 7.5E-14
Gene3D 70 144 75 2.1E-19
CDD 71 113 43 4.08379E-10
MobiDBLite 121 145 25 -
MobiDBLite 127 145 19 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function DNA binding Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0144500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…