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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0180300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0180300.7 |
| Related isoforms 7 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); TAIR: AT1G27170.1 transmembrane receptors / ATP binding protein; Swiss-Prot: sp|Q40392|TMVRN_NICGU TMV resistance protein N; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0EEM5|A0A0R0EEM5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0180300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:60230336..60244795) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCATGGGTTTTTAGAAAAAAAAATATAAACAAATACCCTAATTGGTTAAAGAAAACAATTAACCCCACTCTTGTTACTT TTCTCTCCCAGCCGTAACTCCATTCTCTTCCTCGACAATTTCCTCCCATGCCTTTGAAACAACTCGTCCTTCTCCTTTCT CTTATACCAACTATCCCTCCTTCCCAAAAATCACTACCAATCCCTCTGTAGCATACACACTCAGGAACGAATTGTGGCAC TCAATTGCAAAGGCACTTGGTTAATTTATGGGGTTTATAATTGGTGCTTTAAGGAAGGAAGGGAGTGCCCACATGTCAAG GTTTCTCTGTTAATTGCATTGAGGTATGCCGCACTCACAAATTTTAGAAATAGTAGTCTGGTATGCTAGACTTAAAGTAG AATTATTTAGGGCTTTTGGGTAAATAATTGGGGTTTTCGTAGTTGCTCACGGGTAGTATGACATAAGTTAATTATTGCTG AAGGGTTGGAATATGTTCTTGGTGTTCAGATTTGCTGGGCGTAGGTTCGTTTGCGCGTCGCGGAACTGTTGAGGACGGTC CAATTATTTCGTCATAGTTGTGAGTGATTTTCCAATCACTGTGACTTTTTTTAATAATTATATAATTGCTGATTTGATTA TTTTATCATATCACTATTTATTTAAATTGGGGAAACATGTTTTACAGTTCTTTAATTATTTGAAAGCTGGTTTTAGGAAG TTGATTTGGAGTCTGATTATGAACTGACATGAGAAAAGAATTTATATTGCTTTGATTTTGGAAATTATGTGAAACTGAGA TTATGAACTTGGAAAGTTGATTTTGAGACTTTTGATGAGACTTGAACTGATTTGAGAAAACGGTTTTGGGGATCCTTGAT AGAACCCCGTAGCCGTTAACGGAGGTAACGGCCTAGGTGCACCTAGCTAGTTTGATTCCGGGAGGAGAGGGCTATCCGTT 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TGATTAAATTTGAATTACTTTAGATTTGGACCAAAATCTTTTTTTTTCTTCTTTCCTAGCAGCATCAAAGTGGAAAGCTG AGAGCTGGATCTTGCCATTGTGGTTAGGCAGTAGCTGCTGTTTCTGCTTGTCCAAGTCCTATTTTGTAAATAATAATTCA TGGACATTACATTTGCATTCATCAATTTTTCCTTTTTCTGGTACCAGTTAAATCTGTTACATATTCATGATTCATAAATA TATGCTTAGGCTGTCCAGTTTTTTTATGAAAACTGTTACCGGACATCTTGAATGATGCATTTGTGCTCATATAGTTAGAA TCTCAATTGTAGCCAGCTCACTTTAAACTGGAACATTGGATCATTTGACATAAAATGGAATTGAGTTTTAGTAATTCAAT TCCTGTTCTGTTTGGATTATAATTTATGGAATTAGATCTTTCATAGCTATCTCTCATCTACTTTATTTTTACCTTGAAAA ATCTTTAGGTTCCATTGCACATTGGGACAAAATGCCATGCATGGCTAACCAACTAGAATGAGCCATCCCCCATGGAGAGG ATTGTGAAGTATAGCCACTACCTCAAGGAGATTGATCACAGTTTGGTACTTTCACATTTAATAATCTCAAGGTTGATTGT TGAAACTGCTTTTGATGGCGGTGAACCTTCATGTGGCATTCCTTTTCCCATGTGTTATGATCAATGCAAAGGTAGCACAA TGGAGATATAAAGTTCTCAAAAAGATTATCTTTTGTTTTCACTATAAAATGTAAACTAGACTTCAGATTACGATTTTCCT ATCAGTAAAGTCTGTTCAAATATAAATCCAACTCGAAAGAGTTCTTGCTTTTTCTTCATAATTTTATTCTCTGGGTCTGT TTCATATAACACAACTATAGACTATAGAAAATAAAAGAAAATATATTTAATGGAAATGATGGACTCATATATTCAAACAA 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TTTAGGTTTGTTAAAGTGTATAGACCACTAGAGAGATAGGAAGTGAATATATGAATGATA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0180300.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACCCTGCATACCAAGAGGTTTGAAGATAACAAGGACAAGTTGCAAAAATGGAGGACAGTTCTACAACAAGTGGCTGA TTTGTCTGGACATTTCAAACACGGAGATGGATATGAACACAAGTTTATTGGAAAGATTGTTAATGAAGTATCAAGAAAGA TTAATCGTGTTGCTTTACCTATTGCTGATTATCCGGTTGGACTACAGTCCCAAGTGCGACAAGTAGTTTCACTTTTGGAT GTTGGGTCTATTGATAGAGTTCACATGGTAGGGATCCATGGAACAGGTGGAATTGGTAAAACAACACTTGCTCTAGCAGT TTACAATTCCATTGCTGACCATTTTGAAGATTTATGTTTTTTGGAGAATGTTAGAGAAAATTCAAACAAACATGGATTAC TACATCTCCAAAAGACCCTTCTTTTGGCTGTCCTTGGAGAGAAGGATATTGAGATAACAAGTGGATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0180300.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTLHTKRFEDNKDKLQKWRTVLQQVADLSGHFKHGDGYEHKFIGKIVNEVSRKINRVALPIADYPVGLQSQVRQVVSLLD VGSIDRVHMVGIHGTGGIGKTTLALAVYNSIADHFEDLCFLENVRENSNKHGLLHLQKTLLLAVLGEKDIEITSG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 56 | 56 | 1.1E-8 | ||
| PANTHER | 3 | 154 | 152 | 1.5E-50 | – | |
| PANTHER | 3 | 154 | 152 | 1.5E-50 | – | |
| SUPERFAMILY | 55 | 151 | 97 | 8.31E-20 | ||
| Gene3D | 57 | 154 | 98 | 1.4E-16 | – | |
| Pfam | 70 | 121 | 52 | 2.8E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ADP binding | Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0180300.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…