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LotjaGi2g1v0180300.8

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0180300
Transcript ID LotjaGi2g1v0180300.8
Related isoforms 7
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); TAIR: AT1G27170.1 transmembrane receptors / ATP binding protein; Swiss-Prot: sp|Q40392|TMVRN_NICGU TMV resistance protein N; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0EEM5|A0A0R0EEM5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0180300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:60232470..60244739) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CAATTAACCCCACTCTTGTTACTTTTCTCTCCCAGCCGTAACTCCATTCTCTTCCTCGACAATTTCCTCCCATGCCTTTG AAACAACTCGTCCTTCTCCTTTCTCTTATACCAACTATCCCTCCTTCCCAAAAATCACTACCAATCCCTCTGTAGCATAC ACACTCAGGAACGAATTGTGGCACTCAATTGCAAAGGCACTTGGTTAATTTATGGGGTTTATAATTGGTGCTTTAAGGAA GGAAGGGAGTGCCCACATGTCAAGGTTTCTCTGTTAATTGCATTGAGGTATGCCGCACTCACAAATTTTAGAAATAGTAG TCTGGTATGCTAGACTTAAAGTAGAATTATTTAGGGCTTTTGGGTAAATAATTGGGGTTTTCGTAGTTGCTCACGGGTAG TATGACATAAGTTAATTATTGCTGAAGGGTTGGAATATGTTCTTGGTGTTCAGATTTGCTGGGCGTAGGTTCGTTTGCGC GTCGCGGAACTGTTGAGGACGGTCCAATTATTTCGTCATAGTTGTGAGTGATTTTCCAATCACTGTGACTTTTTTTAATA ATTATATAATTGCTGATTTGATTATTTTATCATATCACTATTTATTTAAATTGGGGAAACATGTTTTACAGTTCTTTAAT TATTTGAAAGCTGGTTTTAGGAAGTTGATTTGGAGTCTGATTATGAACTGACATGAGAAAAGAATTTATATTGCTTTGAT TTTGGAAATTATGTGAAACTGAGATTATGAACTTGGAAAGTTGATTTTGAGACTTTTGATGAGACTTGAACTGATTTGAG AAAACGGTTTTGGGGATCCTTGATAGAACCCCGTAGCCGTTAACGGAGGTAACGGCCTAGGTGCACCTAGCTAGTTTGAT TCCGGGAGGAGAGGGCTATCCGTTTGATGGAGCCGCCAGTGCACGGAGAGGGCTATCAACGAGATGTAGCTTCCCCCGAT 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TTTTCTTAGATCTCATTTTCACTCTATTATTATACTTTTCAAAATTAAAAATATCTACCAGCAAAAATAATGTAAAGAAA AGAAAGACAAGGAAACATCACTATTTGGCTTTTGACTGTCTGTGCCAAAACAAACACACGAAACTTCCCGAAAATCACTA TCTCTACCAGTTTCCTTTCTTCTCATGGCTCTTCTACCACCACCATCATCATCTTCCTCTTCCATCACCTATTCATTCAC CTATGATGCGTTCTTCAGCTTCAGGGGTTTTGATACCCGCTACGGCTTTACCGGAAATCTCTACAAAGCTCTCTGTGATG ACGGGGAGCTTCATAAAGGGGATGAAATCACACCAGCACTTGAGGAGGCCATTGAAAAATCCAGGATTGCCATTGTTGTG CTATCCAAAAACTATGCATCTTCCACTTTTTGTTTACATGAACTTTCCATAATTGTTTGGCCAGTATTTTATGATGTGGA TCCTTCTGATGTGCGAAAACAAACAGGGACATATGGAGAAGCAATGACCCTGCATACCAAGAGGTTTGAAGATAACAAGG ACAAGTTGCAAAAATGGAGGACAGTTCTACAACAAGTGGCTGATTTGTCTGGACATTTCAAACACGGGTGTGTTTCTTAT TCTGATTTCATTCCGTTTTAGATATTGTCTAATTATTACAAAAATTGAGTTATAGTGAATAAGTAATACAAACATGAACA TGATGTATTAATATTATTATGACTTTACACAAACTTCACTTCTCTTATTGGGCAGAGATGGATATGAACACAAGTTTATT GGAAAGATTGTTAATGAAGTATCAAGAAAGATTAATCGTGTTGCTTTACCTATTGCTGATTATCCGGTTGGACTACAGTC CCAAGTGCGACAAGTAGTTTCACTTTTGGATGTTGGGTCTATTGATAGAGTTCACATGGTAGGGATCCATGGAACAGGTG GAATTGGTAAAACAACACTTGCTCTAGCAGTTTACAATTCCATTGCTGACCATTTTGAAGATTTATGTTTTTTGGAGAAT GTTAGAGAAAATTCAAACAAACATGGATTACTACATCTCCAAAAGACCCTTCTTTTGGCTGTCCTTGGAGAGAAGGATAT TGAGATAACAAGTGGATAACAATGTAGGCTCCAACAAACGAAGTTCCTTCTGATACTAGATGACGTTGACAAGGAGGTGC AATTACAATGGATTGTTGGACGACCTGATTTGTTTGGTCTTGGTAGTAGAGTCATCATCACAACTCGGGATAAACACTTG CTAGCATGGCACGGGGTTGTAAGAACAAGTGAAGTGAAAGAGTTGAAGGGGAAAGATGCTTTTGAATTGCTGAGATGGAA AGCTTTTAAAAATGACAAAGTTAGACCAAGTTATGTAGACATAGTAAACCGTGCAGTGGCTTATCCTTCCGGCCTTCCAT TGGCTTTGGAAGTAATTGGTTCAAACTTGTATAGAAAAAGTATACAAGAATGGGAATCTGCATTAGAACAATATGAAAAG GCTCCAGATAAAAAGATCCAAAAGATACTTAAAGTGAGCTTTGATGCTTTGGAGGAAAAAGAGCAGAGTGTTTTCTTAGA CGTTGCTTGTTGCTTCAAAGGATATGAATTAAAAGAGGTTGAAAGTATACTCAATGCTCATCATGACCGATGCATGAAGT ATCAAATTGGTGTGTTAATTGATAAATCTCTCATAAAGATTACTCAAGATGGTGAAGTGGCACTACATGACTTGATTGAA GTTATGGGTAAAGAAATTGTCCGACAAGAATCACCGAAAGTGTTTGGAAAACGTAGTAGGTTATGGTCTCCTAAGGATAT AGTAGAAGTTTTGGAAGAAAATGCGGTAAGACAATAAATTGTGTTTTTTTAACCTTAAATTACCTTTATTATTGTTGCCA CGAATGTTCATGTTACATATTTTTGTCATTTATAATATATAAATATCCATATTTATTGTTGTTGATGTCCTAATGTATGT ATTTATTTTGATTGTATTTCTTTTTTTATGTTAAAGGGAACAAATAAAATTGAGCTGATATGTCTAGATTCCCCATTATT TGAAGAAGTAGAATGTGATGGGAATGCTTTCAAGAAGATGAAAAATCTTAGAACACTTATTATCAAGAGAGCTCATTTTT CTGAAGGTCTGAAGTATCTTCCAAATAGTTTAAGAGTATTAGAGTGGTGGAAATATCCTTCAGAACATTTACCATATGAT TTTCATCCCAAGAAACTTTCCATATGTAAGCTCCCTGGTAATTGCTTTTCATCATCGGAATTGCTTAATTCATCAAAGGC AAGTTTAATTATGATTTCTTTATTTAATCTGTCAATAAATCACATTAAGATTATTCTTTTGATTAATGCCTCTACTTTTC TTTTTCTCTTTCTTTTTTTTAAGCAGGGGTTCGTGAATATAAAAATTTTGAATTTGGAAGAGCGTAAATATTTAACACAC ATATATGATATATCTAGTCTCTCAAATTTAGAAGAATTTTTATTCAATGGGTGTGACAATTTAATTACAATTCACAATTC GGTTGGATTGTTGCATAAACTTAAAATCTTGGATGCTAGTGATTGCCCGAAGCTGAGGAGTGTTCCACCCCTCAAGTTGC CTTCACTTGAACAGCTCGAGCTTTCAGGTTGTTCAAGTCTGAAGAGTTTTCCAGAAATATTAGAAAAGATGTAAAAGATA ACCTTTCTTGACTTGCAAAACATTTATATAAGGAAATTTCCATCTTCATTTCAAAATTTGTCTCGACTTAAATTATTACA TGTAAATCTCTTGTTGTCAATAAGGGGCTTTGCCACAATACCACAGCTGGCTTCGGTTGTGGTCATGGATGGTGGTGTAA GGGGGCCGCTATTGGAAATGAAGGATGAAGGTGAAGAACAAGTGAGCTCAATGCTGCTGTCTTCAAAAATTGAATGTCTT TGTCTCCATGACATTAAGGGAGCAAATAAATGGCTGGCATTAGTTCTCCCGTACTTTGATAACTTGAAAGAATTAGACTT GTCTCATAGTAATATCACAAGTGTTCCAGAGTGCATCAAAGAATGCCGCTATTTATGGAAGCTTGAAATGGTTTATTGCT ATGAACTTCGAGAAATTAAAGCAATTCTGCCGAGCTTAAAATATTTATCAGCAGTAGGGTGCAAATCCTTGAATTCCTCG AGTAAAAGGATCTTACTGAAGCAGGTTAGGTTTTGATTTGTTTGGTTATGTTTTTGAATGTATTTGATTTGATGCCAAAC AAATTTGTGAGCTAAATCTTAAATAACAGGAACTGCATGAGCCAGGAAACACCTTCTTTGGTTTTCCAAGCCCAAAATCA CAGAGGGTTCCAGAGTGGCTCTGAATCATGGCTCTCAAGCACCTTTTCTGACATGGAGGAAAGCGAAACAGATGAGTCTT CCGACTATGTGACTCCATCATATGATGTGGAGGAAAGTGAAGGAGACAAGTCTTTCGATCACGAGACGTTCTCCACAATT CCATGATTTTAACTATGAATCATCGCTTCCAGGCACTGATTCTGATGTGGGGGGAAATAGAAGGAGATGAAACTTCTGAT TCTAATACATTTACTAATAGTAATGGCTACAAAGATGACTCATCTATATTATTATCACATGAGATATTGAAGTAAGTACA TCAATAATTTCAGACAAACTTGTCTTCTTGTAAGATGCATTCTGTTCAATTATATTTTTTGAAATTGTTCTATTTTATGA TACAAATAATTTTACACGATGTAATGATTAAATTTGAATTACTTTAGATTTGGACCAAAATCTTTTTTTTTCTTCTTTCC TAGCAGCATCAAAGTGGAAAGCTGAGAGCTGGATCTTGCCATTGTGGTTAGGCAGTAGCTGCTGTTTCTGCTTGTCCAAG TCCTATTTTGTAAATAATAATTCATGGACATTACATTTGCATTCATCAATTTTTCCTTTTTCTGGTACCAGTTAAATCTG TTACATATTCATGATTCATAAATATATGCTTAGGCTGTCCAGTTTTTTTATGAAAACTGTTACCGGACATCTTGAATGAT GCATTTGTGCTCATATAGTTAGAATCTCAATTGTAGCCAGCTCACTTTAAACTGGAACATTGGATCATTTGACATAAAAT GGAATTGAGTTTTAGTAATTCAATTCCTGTTCTGTTTGGATTATAATTTATGGAATTAGATCTTTCATAGCTATCTCTCA TCTACTTTATTTTTACCTTGAAAAATCTTTAGGTTCCATTGCACATTGGGACAAAATGCCATGCATGGCTAACCAACTAG AATGAGCCATCCCCCATGGAGAGGATTGTGAAGTATAGCCACTACCTCAAGGAGATTGATCACAGTTTGGTACTTTCACA TTTAATAATCTCAAGGTTGATTGTTGAAACTGCTTTTGATGGCGGTGAACCTTCATGTGGCATTCCTTTTCCCATGTGTT ATGATCAATGCAAAGGTAGCACAATGGAGATATAAAGTTCTCAAAAAGATTATCTTTTGTTTTCACTATAAAATGTAAAC TAGACTTCAGATTACGATTTTCCTATCAGTAAAGTCTGTTCAAATATAAATCCAACTCGAAAGAGTTCTTGCTTTTTCTT CATAATTTTATTCTCTGGGTCTGTTTCATATAACACAACTATAGACTATAGAAAATAAAAGAAAATATATTTAATGGAAA TGATGGACTCATATATTCAAACAAATATATTTAGTCAAATTTACAAATATATTCGTCTGACACGAATATATTTGTTTGAA TTCGCCTGATTTCTTGTTTGTTGTTTTGAAAAATAATATGGCTGAAAGCACCATTCATCAATTTGATTGCTTTGGAATTT AACTTTTCATTTATTTATTTATTTATTGCAGAAGTGATTTTTTGTGGAAACAAGATGAGCTGCACTGAAATGATTTGTGA GTGTAATTGACTCTTAATTGGTTCTTGGATCTTTGACTTGAAGTGGCGCCAACATATAGCATCTGTTATCACAAAATCTC TGAGGAGAAATAAACAGTAAATAAAGCTAGTGGAAGCAGTATAATGAAATACAAGTACAATGTGAAGGTAATAAAGAAAG GGCTAGGGAGTCACACGTGCTGTCAATGGTAGAGATTGACATTTTATTTCTCTGTTGTAGTTGTCTCTGTTCTTTGTTGT AGTAATTGGCTATTTGTTCTTTGTTGCTTTTGTTTTCCTTAGTTGGGGGAATGTTAGAAGTATACTTTTGGTACTCGTAA GTCTGTTAGGAGTTAGGTGTTCTGTTGTAGTTGGCTATTCTATTTTAGTGATTGTTAGTTAGTATATTAGACCACATGCT TCAGTTAGAAGCAATAGTTTGAAGTCTCAAGCTATAAATGTAATTCAGCTCTTGTGAACTGAGTAGTGAGGAAATAATTA TTCATTCACAGTTATCAGATTCTCTCTCTCTCATTCTTCTTACTTGGAATTCTAAAAGAGGTGAATGTATGATGGAAGTT ATCTACAAATACTTCAAAAGTATATTACTA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0180300.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACCCTGCATACCAAGAGGTTTGAAGATAACAAGGACAAGTTGCAAAAATGGAGGACAGTTCTACAACAAGTGGCTGA TTTGTCTGGACATTTCAAACACGGAGATGGATATGAACACAAGTTTATTGGAAAGATTGTTAATGAAGTATCAAGAAAGA TTAATCGTGTTGCTTTACCTATTGCTGATTATCCGGTTGGACTACAGTCCCAAGTGCGACAAGTAGTTTCACTTTTGGAT GTTGGGTCTATTGATAGAGTTCACATGGTAGGGATCCATGGAACAGGTGGAATTGGTAAAACAACACTTGCTCTAGCAGT TTACAATTCCATTGCTGACCATTTTGAAGATTTATGTTTTTTGGAGAATGTTAGAGAAAATTCAAACAAACATGGATTAC TACATCTCCAAAAGACCCTTCTTTTGGCTGTCCTTGGAGAGAAGGATATTGAGATAACAAGTGGATAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0180300.8) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTLHTKRFEDNKDKLQKWRTVLQQVADLSGHFKHGDGYEHKFIGKIVNEVSRKINRVALPIADYPVGLQSQVRQVVSLLD VGSIDRVHMVGIHGTGGIGKTTLALAVYNSIADHFEDLCFLENVRENSNKHGLLHLQKTLLLAVLGEKDIEITSG 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 56 56 1.1E-8
PANTHER 3 154 152 1.5E-50
PANTHER 3 154 152 1.5E-50
SUPERFAMILY 55 151 97 8.31E-20
Gene3D 57 154 98 1.4E-16
Pfam 70 121 52 2.8E-6

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ADP binding Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0180300.8, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…