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LotjaGi2g1v0255400.9

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0255400
Transcript ID LotjaGi2g1v0255400.9
Related isoforms 13
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TAIR: AT5G15070.1 Phosphoglycerate mutase-like family protein; Swiss-Prot: sp|Q9VR59|VIP1_DROME Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PX10|A0A0B2PX10_GLYSO Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0255400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:72151590..72168196) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTATATTTTCTCAAATTTGGTAATAACTGTTATTTTTGTGCCTTTGTGAAGCTGATAATCACAGTATAATGATATATTAT CCCAGTTCGGCCGGTGGAGGTATGAAGGAATTATTCAGGAAGGTGAGCTTTAGGCTGAAAACTCACTCTCCATAAGTAGA CGGACCACGGATGCAAAATAGTACTGTTAACATGAAATGTCCTAGAGGACATTCTTTTTCCAACGGACTTGTTGAAAAAG GTCGTGACAATACTGTTTTGGTCACTGTACCTTCCTATGTAACCAACAGGGGTGAATTTTTGTTAGCTCTAATCAATGTA ATAGGCATCAACCTATTATCTTTTTAAGTGGGCGGGTTGACTGGGTTGGGATATTCATGTGCTATTTCCGGTGATTATAT TGCTAAACAATATTTAGAAAACACATATTCTATGTTATAAATATAAATCAAAAATATTTCTCAGCCTTCGCCTTAGTAAC TTGAGCGTCAAATAGATTATTCTTCAACAAGCTTTGTAATAATTTCTGGTTTTCCTTACTTTCTTTCCTTACTTGGTCTC TGTATTCGGTATTGTATAATCTTAGGTTGGCAATAGGTCCAGTGAGTTTCATCCGGATGTGAGAAGAGTGAGGCTTGAAG GCTCCTATATTTATGAGGAATTTATGCCAACTGGAGGGACAGATGTTAAGGTTTGGCCGTTTTGAGATTTATGTTGCCCA GTGTTATTTTATTTTTTTGAAATACTTTTTAATGGATTTGGAATGATTCTGTCTTGTTTCTTCATACTTTTAACCATAGG TGTATACGGTAGGTCCTGAATATGCCCATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCT GATGGGAAGGAAGTAAGTCGCAACATCTCATCTATTCGGTATCTTTTCCGGTTATCGTTGTGATCTACATTATGTTTGTC 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AATTTTGTTCTGACATTGTTGGCAGAAGAATAATAGAGAGGGGGCTACATCATTGCATCAGGAGCACACATTGCCTATTA TGGGTCCAGAGAGACTGCAAGAAATAGGATCATATCTAACACTAGAAACTATGGAGAAAATGATTCGCTCATTTGCCATG CCTGCAGAAGACTTTCCACCAGCAACACCTGCAGGATTTTCTGGCTATTTCTCAAAAGGCGTTCTTGAGCGTCTGGTCAA CCTTTGGCCTTTCCATAAGAATGCCTAATGGAATATAGTAAGCTTGA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0255400.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATATATTATCCCAGTTCGGCCGGTGGAGGTATGAAGGAATTATTCAGGAAGGTTGGCAATAGGTCCAGTGAGTTTCA TCCGGATGTGAGAAGAGTGAGGCTTGAAGGCTCCTATATTTATGAGGAATTTATGCCAACTGGAGGGACAGATGTTAAGG TGTATACGGTAGGTCCTGAATATGCCCATGCTGAGGCAAGGAAGTCTCCTGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGAAATCCT GATGGGAAGGAAGTTAGGTATCCAGTGTTACTGACTCCCGCTGAGAAGGAAATGGCAAGAAAGGTCTGCATTGCATTCAA GCAAGCGGTTTGTGGATTTGATCTCTTGAGAAGTGAGGGACGCTCATATGTTTGTGATGTGAATGGATGGAGCTTTGTTA AAAACTCACACAAGTATTATGATGATTCTGCCTGTGTGCTGCGGAAGATGTTTTTAGATGCAAAAGCACCTCATCTTTCT TCGGTGATTCCACCAACTTTGCCGTGGAAAGAAAATGAGCTAGTTCAACTTTCTGAGCCACTAACTCGTCAGGGTAGTGG TATTAATGGCTCTTTTGGAGAATCTGAGGAGCTACGTTGCGTAATAGCTGTAATTCGTCATGGTGATAGAACCCCTAAAC AGAAGGTGAAGTTAAAAGTTACTGAGGAAAAGCTGCTTGATTTATTGTTAAAATATAATGGTGGCCGACCTAGATCAGAG ACAAAACTTAAAAGTGCTGTTCAGCTGCAAGATCTGTTAGATGCCACACGAATGCTGGTTCCTCGCACCGGACCAGATCA TGAAAGTGATAGTGAAGCTGAAGATATTGAGCATGCTGAAAAGCTCCGTCAAGTTAAAGCAGTTCTTGAGGAGGGAGGAC ATTTCTCTGGCATATATAGGAAGGTTCAATTAAAGCCACTAAAGTGGGCCAAAGTGACAAAAAGCAATGGTGAAGTTGAA GAACGACCCGTTGAAGCTCTTATGGTTCTTAAATACGGTGGTGTTCTTACGCATGCTGGCAGAAAGCAGGCTGAAGAACT GGGAAGATATTTCAGGAATAAAATGTATCCAGGGGAAGGTACTGGGCTGCTTCGTCTCCATAGTACATACCGTCATGATC TCAAGATTTACAGCTCTGATGAGGGTCGTGTGCAGATGTCTGCAGCTGGTTTTGCCAAAGGTCTCCTTGACCTAGAAGGG CAGCTAACACCAATTCTGGTTTCCCTTGTTAGCAAGGACTCCTCAATGTTGGATGGGCTTGAGAATGCGAGTGTTGAAAT GGAAGAAGCCAAGGCTCGATTGAATGAGATTATTACCTCCAGTACAAAGACAGATGATGTCAATGAATCACCTGAATTTC CTTGGATGGTTGATGGAGCCGGATTGCCTCCCAATGCATCGGAATTACTTCCCGAGTTGGTAAGGTTGACAAAGAAGGTT ACTGAACAAGTACGAGTACTTGCAAAAGATGAAAATGAGCAACTTACAGAAAGAAGTTTATATGATGTAATTCCTCCATA TGACCAAGCAAAAGCTCTTGGCAAAACAAATATAGATGTTGACCGGATAGCTGCTGGATTACCTTGCGGCAGTGAGGGAT TTCTATTGATGTATGCTCGTTGGAAAAAGCTTGAAAGGGAATTGTATAATGAACGCAAGGAGCGCTTTGATATCACCCAA ATTCCTGATGTTTATGATTCATGCAAGTATGATCTCTTGCACAATGCACATCTTAACCTAGAAGGACTTGATGAGCTTTT CAAAGTTGCTCAGATGCTTGCTGATGGTGTAATTCCAAATGAATATGGAATTAATCCAAAGCAGAAACTGAAGATTGGCT CAAAGATAGCTCGTCGGTTACTGGGAAAACTTTTAATTGATCTGAGGAACACTCGTGAAGAAGCTATTACTGTTGCTGAG CTAAAGAATAACCAAGACAATAATTCATTATCTGTAAAAATTGAAAAGGAAGATGCAGAGGCCAAGTCAAAAATGTTCTA TAAGAATGATGAAACACGAAAATCCAGCATGAGCGATAAATCAATGGACCAGGATGATGATGACGATAAAGAGACCAAAT ACCGTTTAGATCCCAAGTATGCAAATGTGAAGACACCTAATCGTCATGTGCGAACACGCCTATACTTCACATCAGAATCC CATATCCATTCTCTCGTAAATGTTCTTCGATATTGTAATTTGGATGAATCTCTTCAAGGAGAAGAGAGTCTTGTTTGTCA TAATGCTCTAGAGCGACTGTGTAAAACTAAAGAGCTTGACTATATGAGTCACATTGTGCTGAGGATGTTCGAAAATACTG AGGTGGCTTTAGAAGATCCTAAAAGGTACCGCATAGAGCTGACCTTCAGCCGTGGTGCCGATTTATCCCCCTTGGAGAAG AATAATAGAGAGGGGGCTACATCATTGCATCAGGAGCACACATTGCCTATTATGGGTCCAGAGAGACTGCAAGAAATAGG ATCATATCTAACACTAGAAACTATGGAGAAAATGATTCGCTCATTTGCCATGCCTGCAGAAGACTTTCCACCAGCAACAC CTGCAGGATTTTCTGGCTATTTCTCAAAAGGCGTTCTTGAGCGTCTGGTCAACCTTTGGCCTTTCCATAAGAATGCCTAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0255400.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MIYYPSSAGGGMKELFRKVGNRSSEFHPDVRRVRLEGSYIYEEFMPTGGTDVKVYTVGPEYAHAEARKSPVVDGVVMRNP DGKEVRYPVLLTPAEKEMARKVCIAFKQAVCGFDLLRSEGRSYVCDVNGWSFVKNSHKYYDDSACVLRKMFLDAKAPHLS SVIPPTLPWKENELVQLSEPLTRQGSGINGSFGESEELRCVIAVIRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLDLLLKYNGGRPRSE TKLKSAVQLQDLLDATRMLVPRTGPDHESDSEAEDIEHAEKLRQVKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWAKVTKSNGEVE ERPVEALMVLKYGGVLTHAGRKQAEELGRYFRNKMYPGEGTGLLRLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAGFAKGLLDLEG QLTPILVSLVSKDSSMLDGLENASVEMEEAKARLNEIITSSTKTDDVNESPEFPWMVDGAGLPPNASELLPELVRLTKKV TEQVRVLAKDENEQLTERSLYDVIPPYDQAKALGKTNIDVDRIAAGLPCGSEGFLLMYARWKKLERELYNERKERFDITQ IPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEGLDELFKVAQMLADGVIPNEYGINPKQKLKIGSKIARRLLGKLLIDLRNTREEAITVAE LKNNQDNNSLSVKIEKEDAEAKSKMFYKNDETRKSSMSDKSMDQDDDDDKETKYRLDPKYANVKTPNRHVRTRLYFTSES HIHSLVNVLRYCNLDESLQGEESLVCHNALERLCKTKELDYMSHIVLRMFENTEVALEDPKRYRIELTFSRGADLSPLEK NNREGATSLHQEHTLPIMGPERLQEIGSYLTLETMEKMIRSFAMPAEDFPPATPAGFSGYFSKGVLERLVNLWPFHKNA 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 878 878 0.0
PANTHER 1 878 878 0.0
Gene3D 1 131 131 2.1E-82
SUPERFAMILY 34 131 98 6.12E-7
Gene3D 132 156 25 2.1E-82
SUPERFAMILY 193 791 599 7.9E-48
Pfam 197 790 594 3.1E-136
ProSitePatterns 198 212 15 -
CDD 334 420 87 1.8502E-18
Coils 417 440 24 -
MobiDBLite 665 693 29 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Inositol heptakisphosphate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate = ADP + bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate. The isomeric configurations of the diphospho-1D-myo-inositol-pentakisphosphate (PP-IP5) and bis(diphospho)-1D-myo-inositol-tetrakisphosphate (bis-PP-IP4) are unknown.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0255400.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…