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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0285500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0285500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Importin 9; TAIR: AT1G26170.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q91YE6|IPO9_MOUSE Importin-9; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TJ92|A0A072TJ92_MEDTR Importin 9; Found in the gene: LotjaGi2g1v0285500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:75840471..75861903) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTTTTAGAAAACTCCCAAAGAAGGGAAGAAGACTTTCTCATAAGCCTTCCCTCCCCTCCAAAACTCAACTTACAAACAG ACCCTTAGGAGAAAACACAATTTTCATGCTTGGTTTATGTTGCTTTTTTCCTTCCACATATGAAAACTTCACTAGAGTTG CGAGTTAAGTATTTGGGTCACAGTGCAAGTAAATTATGCATCTTCCTCCTTCTGTGACTTTATGAACTTGGATGATTTAA CCCTCCTCTACTTAGCTGCAGTCCTTCTTAAGCAATTTGTTAAAAAGCATTGGCAAGAGGGTGAGGACTCTTTTGAACCT CCTGTTGTTTCTAGCGATGAAAAGGTAAACATGTTTCCATTTCTATGCGAATATCATTGAAAAAAAGATGTCTAAAAGGT ATTACTGGAAACTATCATCTGAACTTGGTTCAGGTTTAATTATATGGAACCCTGTATCTGATTAGGATTTGATTTGGTTC TGTATACCTTTGGATCATAAATACTTATTTGGCTTGCCAATGGGAGGTGTTAAATTACATTGCATCAAAATGCTGCTGAT TTTGGACAAAGTTTATGTTTTCTTCAGTTGCTGTCAGCTTGTGATAAATGGCATATATTTCCTTGTACTTGGTTGTTTGC GGGAATGGGATTATGTGTCTAGTCAAATATAATGCCAAATAATGTAGTATTTGACTCCTGCTTAGAAGTCAAATGAATAA TTTGCAGGGAACTAGACTGATTCTCTGTAATAGGTTTCTCTAGATGAATATGGGCCTCTGCTGTTTCTGCTTTTTTTAAA CGAAAAAAAAATGTTTTTGAATTTTTTTTAAGATATTTAAAAATAAAAAACACAAAAGAGAAGTTTTAGTACTGTTCTCA TAAGTTAGAAAGAGTAGTTAATTTAAGGGGGGAAAACTCTATAATAACCTATATCTTGAAAAAACTTTTATTTCCCAAAG 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ACATTTCTTAGTATATCAACTACCACTGTTAGTTTAAACTTCCTTTCTTTATTAGTTTGGAAATTTTCAGTGTCCTCCAG GATGAATTGACTAGTAAGGATATGTATGGGCCCATCCATAAATAATTATGGAGTTCAAGCCATACCCTCCAATTGATGAA AAACTTTTGTTATCTACTGAACTTTATGCTATTCATATTGAACCTTTCTTTAGAACATGAAATGAGAAAACCAGCAAGGG GAATTTGTTACTTTTGACAGTTACTACTGTTTCTTTTTATTCTGGAAAAATCAACTATCTCTTGTTTATAGAAATGTATA TCTAAACAGACACATGTAACTGTGCATAAAGATATCTTAAACTTCCAATCCATGTTATGGTTACCTACTATTAGTTATTT GAATTGTTGTGTACACATTTTCTTGGCTGGCATGAATGGACGATTAAAGTGATTAATTGCACGAATCTAAGAAGAGGTAA TTAGTTGTTGCCTGATTTAAGTGATCATATGGGAAGAAGGTTTATTTTCATCTACTTTTCACCTGAACCCTCCATTATAG TTTCATGTAGGATTAGTTCATTATTTTTTTTCTTCTGTTTTCTTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTTTGTGCTCC TCTTTTTCTGTTTTTGATTTGTTGCTTGATTTTGTGAAATTTGAACAGATTACTGGACCCCAATTTGGAAAGCTCTGGAT CTCTTTTTGTAGGCAGTTACATCCTTCAACTTATATTGCATTTACCATCACATATGGCTATACATATACGAGATCTGGTA GCCGCTCTAGTCAGACGTATGCAATCTGCTCAAATTGCTTCCTTGAGAAGCTCCTTGCTAGTTGTCTTTGCCAGATTGGT AATATAGCCAAAAAAATTGGTTGATTTTGAATGAATCTACTGTCAAATTTTACTAGTAATGGTTAATGCCCAAATCTCCT TTATTATTAAAAGTTTATAGGAGTGGAAAACCAATGCTTTTGTATACGATTATAAAACACTTTTGCTAGTAGCCAATGCC TCTAGAAATGATCATTTATAGAACTTGCATGCTACTTTTCTCCTTCTTGTTCCTCCCATTTCTGCTTTTCTCTTGCATCA TTAATTTTTTTTCCTAAGAGCTTGCCCGAATTCTAAGATGGTGTCAGAGCCTATCCTAGATCTGTTTATTGGACCACCCA TAAATGGGCCACCCGCACATGTTCATTCTTGCAAATTCCATCCTCCAGATGTCTAACCCTGGGTGTGAGGGGGTGTTTTG AGAAGTCTCACATTGGCTAGAGATATGGCCAAATAGGTCCTTATACAGAGTAGAGCAATTTTCACCTGAGCTAGCTTTCC GGGTAGATTAGGCCTAACCCAAATTCTAAGAGCTTGCAGTTTGTGATATCCTTTTTAGTTTTTATTATAGTTTCTAGTGC TTGTCATGTTTTCCTTAGCATCTGCTTTTATATACATTATTTGTTTGAGAAGAAGCCTGCCATTTGCCCTTTGTCTGTGG GGATAATTTATTTTCAAATATTTAAAATGCAGGTACACTTGAGTGTTCCTAATGTTGGACAATTTATTGATTTGCTGATC TCAATTCCTGCTGAAGGACATGATAATTCCTTTGCTTATGTAATGTCAGAATGGACTAAGCAGCAAGGTGAGCATCCTTC TGCTATTGTGTTTGCTAAGGTATCCAAGTATGGGATTTTTGGGTATTTCCTAATTTGCAAATTGTGAACTTGTCATTGCA TGGTTTGCCAATAGCATTGAATTCTGTTTCTATAACTTTATTTTTGGAAATATCTATGGAGTTTCCTCATGCATATGGTT GAAACAATTGACAGTTTTGACTTAAACTTTACGGACCAAACCCTGTAGTGCTTATTGCTTAAGGACCAAAACCTACATCT TTTCCTTATATTTCTATCCCAAAATGATTTGTTTTGTTCATGATGCTTGTACTAAAGTAACTTGGCTTTTCCTGGTAAAA GACCAATTAATTAGTCTTCAATTGTATGTTAAATTTTATCATATAGTTTATACATAGTTTGGAGAATCCATTAAGTGGTT GCTGTTTGATAATGGTAAGGAGTATATCAACAAACATCTTTCTTGTCAAGCTTCCTCATTATGTACCATCAGATTAGATC TGCCATTATCTTGTATGGTTATACAAAGAGCTTGTATGCATCAAGGAAAAGAGACAGTCTGTGTGTGAATAGTTTATCTT TTTCGTGAACCTCTTTTGTTTCTTATTTTTTGGTTGAACATGAGAGTGATTGATAGGAAATAATTAGCACACACGCATAA GCAAGATCAAGTAAATTTTTTCCACATGATATTTGGTTGCAGGTGAGATACAGGGGGCCTATCAAATAAAAGTTACAACA AGCGCCCTGGCCTTGTTGCTAACCAGTAGGCACAATGAACTGGCAAAAATTCATGTCAATGGCCATCTGATTAAGGTATT ACATCATTTTATTTATGTATTCTCTGCCTCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTTTGGTTTTATGAGTGCCTGCTGATTTGTTTA ACTTCATGAAGTCTGGTATGGGAATAACCACAAGATCCAAAGCTAAATCAGCTCCCGACCAGTGGGTGATGTTGCCACTT CCTACAAAGGTAATTCCTTTTGATTATATATACTACCTTGACGTAAAGATATCTATTCATCTGCAGAGATTTGCCATTTG GGCATACTATGTTGATGATGTGGTGCCAGTTTCCTTGGGCATATTTGTATTTCGTCTTAATGTAAACTTTTGTAGCTCTA TATGGCAAATTGTTTCTGATAGCTGTGTGGCTTTTGCTTTTTCCTGCGACCATAGTGCATTTTAAGGTTTTATTAGTGCA AGTATGGAATTTTTTAAATCAGAAAATGACCTTTACTTTTAGAATCCAAAGTTTTGACAACATTTGTGGCTGAATTTTGA CAGTGCTACTACCATCTTGATTGAAATTTTCGTCACCTAAATCTAGTATCTTTTTTCTCACTATCTTGCAGATTGTGGGT TTACTGGCCGATTCATTAACTGAAATACAAGAACAAGTTTTGGCTGGTGATGATGAGGTAGTATAATGCATATTGATGTG TCTTAAATACACACTGATTAGTAAGCTTACTGCATGGTATGAGCGGTTCTTTCAGGATAGTGACTGGGAAGAAGTTCAAA CAGATGGCATTGAAAATGATAGAGAGTTTCTTTATTCAGTATCTACATCAACTTCGGGAAAACCCACATATGAACATCTT GAAGCAATGGCCGAAGTATTTAACAAGGTTTTGTTGAGTTACAGTTGTTGTCACTTATACCTTAATTTCTTTATTACTCA ATTTTATCTTGTTAGTTTTTAAGCTAAATTCTATTGATTTACTTATTTTTTATATTGCTCTTCACAATCACAAGGATCAA GATGATCAGTATGAAGATGACCTGTTAAGTATTGCCGATCCTCTTAACCAGGTATGCACTGCAGAATGTTTCATTTGTTC AATGTCAGCGCTAACTTGCATATGTATTCGTTAACAGTTTTGGTTGCACTGGCAGATAAATCTGGTAAATTACCTTGTGG ATTTCTTTGTTAACTTTTCACAGTCCGACAGACAGCTCTTAGATCACATTTGCAAGGTTATTAAAAATTAGACATTATTT TAAGTTCAGCTTCTAAGACTTACCGTCAAATTTCATTGAACTTGTGCAATGTGTTATGTCTTGCACTGCAGAGCTTGACC GAGTCTCAACGAAATGCGATTAAACTGGTGCTACAGAGATGAACATTTAGTTTCACTGAGAGCTGTCTCAAGATGGGTTG ATACTATCAGAGAAAGAGAAACACAGATGGTTGGAATGGAATATTTTGTCATTGATCTTGTTGGGGAAACTGATTGTAGT TCTGAAAGATGTTTTCTTTCTGCTGCTGTGTGTCCCCTCCTGTGTGTTTGTTTATTCTTTTTACTCAATTTCTGTATGTA ACGGCTATAAGTTTTGACTTTACTGGGTTTTTGCCCATTGTTAATTCACCAAAAAAAATGTGTTACAAGATGAAATCACC AAATTTATTTGTTTGCTGTTGAAAATCTTCAACTGAATTTCATTGATTGAAAAGATAATGAATACATGAGAGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0285500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAACTTGGATGATTTAACCCTCCTCTACTTAGCTGCAGTCCTTCTTAAGCAATTTGTTAAAAAGCATTGGCAAGAGGG TGAGGACTCTTTTGAACCTCCTGTTGTTTCTAGCGATGAAAAGGAAATCATCCGCAGAATGCTTTTAATGACATTGGATG ACCCTCATAGGAAAATTTGTACAGCTATTGGTGTGGCTGTGGCATCCATTGCAATGTATGACTGGCCAGAGTTATGGTCA GATTTGTTACCGTTTCTCCTGAATTTGATTAACAATCAAACCAAATTGAATGGAGTGCATGGAGCTATGAGATGCTTGGT TCTTCTCTCTGCGGACTTGGATGATAAAATGGTTCCAACATTAATACCTGCTTTGTTCCCAAGTTTGCTGACAATTGTAT CCTCTCCCCAGATATATGATACATACCTTCGAACCAAGGCCCTTTCAATAGTCTATTCTTGCTCTTCTATGCTTGGGACG ATGAGTGGTGTCTATAAGGCAGAAACAAGTTCTCTGATAGTTCCTTTGCTTAAACCATGGATGGAACAATTTTCTTCTAT TCTAGAAACTCCAGTTCAATCTGAAAATCCAGATGATTGGAGTATCCGAATGGAGGTTTTGAAGTGCCTGAATCAGTTTG TTCAAAATTTCTCAAGCCTCATTCAAAGTGATTTTGAGGTTATATTGGGCCCATTATGGAATACTTTTGTCTCCTCTTTG AGAGTTTATGAGCAAGCCTCTATTCAAGGAACAGAAGATTCATATGAGGGAAGTTATGATTCTGATGGTTCAGAGAAAAG CCTTGATTCATTTGTTATGCAGCTTTTTGAACTTCTGTTGACTATTGTGGGTAATCCAAGATTGGGAAAGGTTGTTATGG CTAATGTCAAAGACTTGGTTTACTACACAATTGCTTTTCTTCAAATGACGGAACAGCAGATTCACACATGGACTATGGAT GCTAACCAGTTCATTGCAGATGAAGAGGATGCCACTTATAGCTGTCGCATTTCTGGTGTGCTTCTACTGGAAGAGGTTGT CAATTCTTTCCATGGTGAAGGACTTCTGGCCATCATAGATGCTGCAAAACAATGGTTCACTGAGTCTCAAATAAGAAAAG TGTCTGGCAGTGCAAGCTGGTGGAGGATAAGAGAAGCCACTCTTTTTGCCTTATCATCACTTTCAGAACAACGGCTTGAG ATAGAGGAGTCAGGGTTTGACACAAGTAGCTTGAAGACCCTGGTTGAGCAGATCATCACTGAGGACTCTCTAATTGATCC TTTTGAATACCCCTTTCTATTTGCTCGTATTTTTACTTCGGCTGCTAAATTCTCCTCTTTGTTGAGCCATGGAGTACTAG AGCACTTTCTCAATGCTGCAATGAAGGCTATTACAATGCATACGCCTCCCCCTGTAAAAATAGGTGCCTGCCGGGCACTT TCTCAGCTCCTCCCTGAAGCAAAGGATAAAATTGTCCAACCACAATTATTGGGTTTATTTTCATCACTCACAGAACTTCT TAATCAAGCATCAGATGAAACCTTGCACATGGTACTTGAAACATTGCATGCAGCAGTCATGACAGGTCATGAATCATCAA CATTGGTAGAAAGCATTATTTCTCCAGTAATCCTTAATGTATGGGCTTCACATGTTTTGGATCCTTTTATCAGCATTGAT GCACTTGAAGTTCTTGAGGCAATCAAAAACATTCCTGGATGTATACATGCATTGGTTTCCAGAGTTTTGCCATATATTGG ACCAATTTTAAATAAACCCCAGGAGCAGGCTGATGGTTTGGTAGCTGGATCATTAGATCTGGTAACAATATTACTAAAGA ATGCCCCCGGCGATGTAGTCAAAGCAATATATGATGTTTCTTTTAATGCTGTTATCAGAATAATCCTTCAAAGTGATGAG CATAGTGAAATTCAGAATGCTACGGAATGTTTATCCGCTTTTATATCTGGGGGAAGACAAGATATTCTTAATTGGGGATC TGATTCTGAATCCACTATGAGAAGTTTACTTGATGTAGCTTCAAGATTACTGGACCCCAATTTGGAAAGCTCTGGATCTC TTTTTGTAGGCAGTTACATCCTTCAACTTATATTGCATTTACCATCACATATGGCTATACATATACGAGATCTGGTAGCC GCTCTAGTCAGACGTATGCAATCTGCTCAAATTGCTTCCTTGAGAAGCTCCTTGCTAGTTGTCTTTGCCAGATTGGTACA CTTGAGTGTTCCTAATGTTGGACAATTTATTGATTTGCTGATCTCAATTCCTGCTGAAGGACATGATAATTCCTTTGCTT ATGTAATGTCAGAATGGACTAAGCAGCAAGGTGAGATACAGGGGGCCTATCAAATAAAAGTTACAACAAGCGCCCTGGCC TTGTTGCTAACCAGTAGGCACAATGAACTGGCAAAAATTCATGTCAATGGCCATCTGATTAAGTCTGGTATGGGAATAAC CACAAGATCCAAAGCTAAATCAGCTCCCGACCAGTGGGTGATGTTGCCACTTCCTACAAAGATTGTGGGTTTACTGGCCG ATTCATTAACTGAAATACAAGAACAAGTTTTGGCTGGTGATGATGAGGATAGTGACTGGGAAGAAGTTCAAACAGATGGC ATTGAAAATGATAGAGAGTTTCTTTATTCAGTATCTACATCAACTTCGGGAAAACCCACATATGAACATCTTGAAGCAAT GGCCGAAGTATTTAACAAGGATCAAGATGATCAGTATGAAGATGACCTGTTAAGTATTGCCGATCCTCTTAACCAGATAA ATCTGGTAAATTACCTTGTGGATTTCTTTGTTAACTTTTCACAGTCCGACAGACAGCTCTTAGATCACATTTGCAAGAGC TTGACCGAGTCTCAACGAAATGCGATTAAACTGGTGCTACAGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0285500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNLDDLTLLYLAAVLLKQFVKKHWQEGEDSFEPPVVSSDEKEIIRRMLLMTLDDPHRKICTAIGVAVASIAMYDWPELWS DLLPFLLNLINNQTKLNGVHGAMRCLVLLSADLDDKMVPTLIPALFPSLLTIVSSPQIYDTYLRTKALSIVYSCSSMLGT MSGVYKAETSSLIVPLLKPWMEQFSSILETPVQSENPDDWSIRMEVLKCLNQFVQNFSSLIQSDFEVILGPLWNTFVSSL RVYEQASIQGTEDSYEGSYDSDGSEKSLDSFVMQLFELLLTIVGNPRLGKVVMANVKDLVYYTIAFLQMTEQQIHTWTMD ANQFIADEEDATYSCRISGVLLLEEVVNSFHGEGLLAIIDAAKQWFTESQIRKVSGSASWWRIREATLFALSSLSEQRLE IEESGFDTSSLKTLVEQIITEDSLIDPFEYPFLFARIFTSAAKFSSLLSHGVLEHFLNAAMKAITMHTPPPVKIGACRAL SQLLPEAKDKIVQPQLLGLFSSLTELLNQASDETLHMVLETLHAAVMTGHESSTLVESIISPVILNVWASHVLDPFISID ALEVLEAIKNIPGCIHALVSRVLPYIGPILNKPQEQADGLVAGSLDLVTILLKNAPGDVVKAIYDVSFNAVIRIILQSDE HSEIQNATECLSAFISGGRQDILNWGSDSESTMRSLLDVASRLLDPNLESSGSLFVGSYILQLILHLPSHMAIHIRDLVA ALVRRMQSAQIASLRSSLLVVFARLVHLSVPNVGQFIDLLISIPAEGHDNSFAYVMSEWTKQQGEIQGAYQIKVTTSALA LLLTSRHNELAKIHVNGHLIKSGMGITTRSKAKSAPDQWVMLPLPTKIVGLLADSLTEIQEQVLAGDDEDSDWEEVQTDG IENDREFLYSVSTSTSGKPTYEHLEAMAEVFNKDQDDQYEDDLLSIADPLNQINLVNYLVDFFVNFSQSDRQLLDHICKS LTESQRNAIKLVLQR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ProSiteProfiles | 1 | 54 | 54 | 11.929 | ||
| Pfam | 6 | 53 | 48 | 1.8E-5 | ||
| SUPERFAMILY | 6 | 969 | 964 | 4.32E-89 | ||
| PANTHER | 11 | 967 | 957 | 3.8E-275 | – | |
| PANTHER | 11 | 967 | 957 | 3.8E-275 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Molecular function | Ran GTPase binding | Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0285500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…