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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0341400 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0341400.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Formin-like protein; TAIR: AT1G31810.1 Formin Homology 14; Swiss-Prot: sp|Q7G6K7|FH3_ORYSJ Formin-like protein 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PWC5|A0A0B2PWC5_GLYSO Formin-like protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0341400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:81827377..81846079) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAATAACTTTCTTAACCAAGTTCATTTTTCAACGTGAAACACTGTTTGGTTACACAATAATAATAAGAGCTTTAGGGCCA CTGTCAATGTTCACCACCTAGCTAGAGGCTGAAAATTTCAAGCAAAATTGACTTTACCTCAAAGGCAAAGCAACAGTTCA TTTGCATTCCTCCCAAGAATAGCCAAACAAGAGTGTGAATGGTAAAATAGTATGATTCACGTTTTCAAGTTGTATTGTAT GTACACTCTAAGACAGCAATATTGTAGCTAATAGCATCCTCAATTATATAATAAGGGCCCTAAATTCACATCTTCACTTC AAGAAACAATAATAGATCAAAAATTAAAAACAGAGAGAATTGAGAGATGGAAAAGAGCAAGGTCCTTATTGTTGGAGGAA CAGGGTACCTAGGAAAGAGGTTAGTGAAGGCATGTTTGGCTCAGGGACATGAAACATACGTTCTTCAGAGGCCAGATATT GGTGTTGACATTGAGAGAGTTCAGTTGCTTTTGTCATTCAAGGAACAAGGAGCTAAGCTTGTGAAAGGTTCTTTCAATGA TCACCAGAGCCTTGTGAATGCTGTGAAACTTGTTGATGTTGTGATTTGTGCCATATCTGGTGTTCACATCCGCAGCCACC AAATTCTCCTCCAACTTAAACTTGTTGATGCAATCAAAGAAGCTGGAAATGTCAAGGTAATGAACCTTTTAGTATAGGGT CATCACAATCTCATATAGTCACATCACTAAGTCTCCTAAGTAATATGAAATAAAATCTTATCATACCATATAGTATTTTA AGAAAACTTTTCCATGTTCTACTTATTGTTATGCCATTTCATATTTGATCAAGAAATTGCTTAGTACACTAATGTCATGT TAATATTACATATAATAATGAATTTTAAAATTAACATTTCAACATTTTGAGAAAATGACGAATTCAATTTCTATCGCCTC 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0341400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATGTTTCTTCTGTGGTTGTGGGAGGTGGGGATACTGCTGTTCCTGCAGAAGGTGCGGCCTCGGCAGGTGAAAGTAA TGGTGGGACTGCTGCTCCAAAGAAAACTTTGTTAATGCCCCTACTTTGGGAGACAATTGATCATGTAACAGAAGGGAGTT TTTGGGATGATTCACGTCCCAATGCATTTAGGCTTCCTGATTTAGATATATCAGAACTTGAGATCCTGTTTTCAGTAGCG GCCGCTTCTGATTGGAGCAGTACTAAAGGTGGAGGTCGGCATGGTTCTTATATTAACAAACCTGAGAAAATACGATTGAT GGGTAGAGCATATAACCGTGAAATAATGCTCTCTACTATAAAAAAAACTTTGCCAGATATGATTAAGGCAATTCTGGCAT TGGATTCTTCTGTTCTGGATATTGATCAAGTTGAGAATCTTATCAAACTCTATCCCACTAAGGAAGAGATTGAGATGTTG AAGAATTATACAGGGGACAAGGAAATGCTCGGAAAGTGTGAGCAGTTTTTTATGGAGCTCATAAAGGTTCCACGAATAGA ATCCAAGTTATGGGTGTATGCTTTCAAAATCAACTTTTTTAAGAAGGTGAGCGATTTAGAGGAAAATTTGAAAATAGCCA ATGGTGCAGTCAGAGAGGTGAAAGCTTCTGTGAAATTGGCTGAGATAATGCTGACTATGCTTACTTTGGATAATGGCTTT GCCTTGAATCAGGGAACATCACAGGGATCAGCAATAGATTTCAAGTTGGAGATCCTTCTTAAATTTTCTGATAATCGCGC AAGAAATGACAAAAGGACCTTGATGCATGATTTGTGTCAGCTCCTTGCTGAGAAAAAGCCAGAATTGCTAGATTTCTATA AAGATTTTGTCAAGTTGGAAAAAGCTTCTAAGATCCAACTAAAAGCAGTAGCTGACGGAATGCAAGTTCTATGTGAAGAT TTAGAGAAAGTTGACCAAGAACTCCATGCTTCTGAAACGGAATTTTACAAGGTGTTGAAGACTTTTCTGGATGACGCCGA AGCTAAGATGGGGTCACTTGTATCATCGTATACAAATGCGAGAAGATTTGCAGATTCTTTGTCCCGGTACTTTGGGGCGA ATCCAGCTACATGCCCATTTGAAAAAGTGACACAAATACTTGTTACCTTTGTCAAGATGTTCAAGAAGACAAGGGAGGAG AACAAAAAACAAGGAGATGCTGAAAAGGAGAATTTACATGCTGAAAGAGGGAATTTAAGAGTCCATGAAGGACAAGATAT TATGTGTGTCCAATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0341400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDVSSVVVGGGDTAVPAEGAASAGESNGGTAAPKKTLLMPLLWETIDHVTEGSFWDDSRPNAFRLPDLDISELEILFSVA AASDWSSTKGGGRHGSYINKPEKIRLMGRAYNREIMLSTIKKTLPDMIKAILALDSSVLDIDQVENLIKLYPTKEEIEML KNYTGDKEMLGKCEQFFMELIKVPRIESKLWVYAFKINFFKKVSDLEENLKIANGAVREVKASVKLAEIMLTMLTLDNGF ALNQGTSQGSAIDFKLEILLKFSDNRARNDKRTLMHDLCQLLAEKKPELLDFYKDFVKLEKASKIQLKAVADGMQVLCED LEKVDQELHASETEFYKVLKTFLDDAEAKMGSLVSSYTNARRFADSLSRYFGANPATCPFEKVTQILVTFVKMFKKTREE NKKQGDAEKENLHAERGNLRVHEGQDIMCVQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 31 | 31 | - | – | |
| PANTHER | 7 | 410 | 404 | 2.9E-139 | – | |
| PANTHER | 7 | 410 | 404 | 2.9E-139 | – | |
| ProSiteProfiles | 28 | 420 | 393 | 50.674 | ||
| SMART | 28 | 429 | 402 | 2.8E-22 | ||
| Gene3D | 28 | 406 | 379 | 1.4E-86 | ||
| Pfam | 31 | 395 | 365 | 7.5E-83 | ||
| SUPERFAMILY | 108 | 410 | 303 | 9.55E-75 | – | |
| Coils | 203 | 223 | 21 | - | – | |
| Coils | 314 | 334 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0341400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…