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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0341500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0341500.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TAIR: AT4G19040.1 ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9UR75|A0A0L9UR75_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0341500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:81850736..81864885) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAATGGGAAAGCGTCACGGCGCCAACACGCACCTAACCCTCACGGCCCAATAGAATCACCACACGTGTCAAACCACC CTCGCGGTCACAGCTTTTTCTAACTTACGTGGGATCTCACACTTTCTCTAGTTAGAAGAATCTCTTAAATTCCCCACTCT CTCTCTCTCTCCACCGTTCCTCCCTGCAACGACGTCGTTTCCCCGATCGCATCGTCACCGATCCCGGAGAATCCAACTCG AAGGGTCACAACCACCACCACAACCACCACCGTTAATGCGCAATTCGAATTCCGAATCCTAACCGGAATCAACCGAAGAC AGTTCCACTAGAATCGCTGGTTCCGTTGATTTTCAATTTCCGGCGCCGGCGATGACTCGTCTGGTCGCTTAGCTCGAAAT CGATCTCGCCGAAGTTGAGATTCTCCCTCTCCAGCTTCCGCCCGGCACCGCCACTTCCTATTTGTTTCAATTTCCGTTGT TGCGGCGGAGCGATGGCGACGAAGGTGGTTTACGAAGGGTGGATGGTGCGGTATGGCCGCCGTAAGATCGGGCGATCGTT CATCCACATGAGGTACTTCGTGCTGGAGTCGCGGCTGCTTGCATATTACAAGAGGAAACCGCAGGATAATCAGGTGATTC TTTCTTTCTATCATCGATTTTCTTCTTACTCTCTCATAATCAGGAAAAGATTCAATTCGTTACTGATGAAAATTTCGTGA TGCTGAAAGTTTCCTCTTCACGGAATCGCTTTTTGATTTTGGTGGGGGTATGCTTTGAAAAGGGATTGGAGAATTTACGA GACTGCTTTTCAACTTTTTGAAATTATTATTATGCTTTTTGAACTTTTTTTGAAAAAGGATTGGAGAATTTGATGGTATG AACTTTACTTTGTTGATGTTTTGATTAGGTTCCCATTAAAACACTGCTAATTGATGGCAACTGTAGAGTAGAGGATAGAG GCTTGAAGACCCATCATGGACATGTGAGTTCTGCAATTAAATTATGACTGTGTTTGTGTGGGTGTTGATATAGCAATGCA TGTTGTGGAAAACTTCTGGTCTTGAATTGAATTGGAATGTGCTTATTGTATGTTGACATGGAATGACTGACTGGTAACTA GCGAACTGAAGGGGTGAGACGATGCTGTGGAATGATTTATGACGTGAAATGTATGACTATGGTTCTACAACAACACCAAT GGCATTTAGTGAAACCAAAGAAAAAGTAATGCTAGACATTCATAATTTGCACACAAATTTAACCCCTTCTTGTATCATTA TATAAATTTACAGAACTGCGTAGGGTCCATTGAACACTTATGTGAAATTTCTCTAACATATGTGACTAATTGCACCTGTT GTCCAAGACAATTTTTTGTTTTGTTTTCATTTTAGATTAATGAAGAAATTCACTACAGCAAAAGAACTCTTAAGTAGGAT GAAATTGTATCATCCGTCAACAAAAGAAAATAGACCAATGATACACCTTAGCAGGCTTATGTTAAGGGAACTGTCCTCTA ATTTAGGGAACTGTCCCCTAATCATGCTCTCTTCCTCCCATGTAGCTTCTTCAGCAGGCTTATGTTTCCATAGGATAAAC CATTCAGTTGCACTTCTTCCGTCATGCATTTTACTGAGTTGCCAAAACTGTCTTAGGTGCCACAGGGATGCATCATACAT TCTTTGATTTCTAAAGTATGAGGTAACTCTTAATCAGCCACATGCACTCAAAGCCCCATTTTTAGTTGAGACACGTGAAA TCTAGGATGTATGCTAGATTTTCCAGGAAGAAGTAATTTGTAAGCAACTTCTCCTATTCCTACTACCACTAAAAAAGGCC TGTAATAACGAGCTGACAGCTTGGGGCTGATTCTTCGTGATTTTCCAGGAAGAAGTAACTTGTAAGCAACTTCTCCTACT 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AAATATTTTATTTATCACTCGGGTTGTTGCAGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAGGCCCTAATCTGGAAGGAAAAAATT GAGTATGTCATTGATCAGGTCAGTTTTATCAAATTGCATAATCATGCTATGCTCTTTAATGTGGATCAATATCCATCTTC TTAAGTTTCTGGTTAGACTTCATTTCTCCCTGATGTATATCAACATGAAATATGATAAGCATTTTCGCTGGATACATGGA TAAAATGATAGGCTGAAATCTTAGTGACTTTGTAAATTCATCTTAGTAGGACATGTCTTCCTTTCGTGTAAGTTGATGCT ATTGAGCTTCAATGTATGCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTATATTTCTTTTGAGTACAAATCTGG AATGGACAATGGGAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTAAGTATTTTGGTACTGAGTTTTTCCACCTACAG TTTATTGAAGATGGCAACATTTAATGCTTAATTGCTTTTAATGCTGTTGTTTCCTATGTTGTTGAATTATGTCTGTCTTC TTTCAGAAAAGTTTTCTATCATTCCAGTCTATTCTTTGGATATGCAACTGAAATAATTCATTGAGACATGCTATATCATG ATTTAGTTATCTTTAGCCTTTTTTCCACTGCTGATCAAATATCATTGTGGGATTCTAATGTTATTGTGCACATCCTTCGA TATATTCATGACATCCAATTTTTTTTTTGTTGATCACTAGGTTCAGTGCTCAGGAGGATGAAGATGAGTCTCAACCAAAT TTGTTAAGGAGGACAACAATTGGAAATGGTCTACCTTGTTTCCCTTCTGCTTGTGGGATTGCAATTACTCTGCTACAGTC TGTATTTACACCTTGTCTTTTTTGAGCTGCAGGTCCTCCTGAATCAATTTTTGACTGGACACGAGAAATTGATTCAGATT 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TGGTTTTATATTATATTTCTAACACGCTCTCTCACGCAATAGCTCACTTGGGCTTGAAACATGGACAATGCACTAGCCCA CCAACCATTTGCTGAAATTAAACTTTTTTTATTAGAATAGTTGGGGCAAGGCAACAAGGATCGAACTCTAGACCACTTGG TCATAGAGGCTCTGATACCATGTCACAGAACCAATTATTCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAATGGACTTTTAATGGGTA ACATTCACATCTATATATTGACCTATATAACCCTGTAATTCACTTAGTCAATCCCTAAAATTAAGGGATTCCATCTTGTA TTGATCTACTATAAATTCAAAAGGCTTACTATCTAATGAAATTTTCAGTTTCATCTAAATTAAATTCTCTCAAGTGTCTC GGCAGCCAAGTTCATAGCTTAGAAAATTAATCTAAAAAAGATGGGTCAAATATAGGATGTCCAAGTTTATTGAATTTAAC CGGTTTTGATCAAGTGCATCCAAGTGTTCATGAAAAAAAGTTTGAAAACTGCTGGTTCAAGCACTTGCTCCAAATATGGA AATATCATTTTGCTTTGTTTACTTTCTGAGGTTTAACTTCATACTTTTTAAAACAAATGCACCCTCAGTTGATATATGCT ACAGCCTGGCACCATTTTGGTGCATATATATTTGGTCTTGTGCTATTGATATGTCTGACTCTTTTGTTCCCATATTTTGG TATCATAGACTAGGACTTTAACATTTACTCCATTTATATTTATGTTTTTTCCTTTTTTGTCTTCCCTTCTTCTATTTGTT ATTTATAATTACTATTGTTTGATATAGACATAAGAAACAAAATACTGTTTAATTTTTCTCATTCCTTATTGATTTTCAAC TTAAAAAATGCAGGGCTCATGGATTGTACGCCAAAGTGTTGGGAGTACTCCTTGTTTACTGGGAAAGGCAGTTGATTGCA 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0341500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACGAAGGTGGTTTACGAAGGGTGGATGGTGCGGTATGGCCGCCGTAAGATCGGGCGATCGTTCATCCACATGAG GTACTTCGTGCTGGAGTCGCGGCTGCTTGCATATTACAAGAGGAAACCGCAGGATAATCAGGTTCCCATTAAAACACTGC TAATTGATGGCAACTGTAGAGTAGAGGATAGAGGCTTGAAGACCCATCATGGACATATGGTTTATGTTTTGTGTGTTTAC AACAAGAAAGAAAAGAACCATCGAATTATGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAGGCCCTAATCTGGAAGGAAAAAATTGA GTATGTCATTGATCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTATATTTCTTTTGAGTACAAATCTGGAATGG ACAATGGGAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTTCAGTGCTCAGGAGGATGAAGATGAGTCTCAACCAAAT TTGTTAAGGAGGACAACAATTGGAAATGGTCCTCCTGAATCAATTTTTGACTGGACACGAGAAATTGATTCAGATTTGTC AAATCAGAATATCAATAACCAAGCATTTTCAAGAAAGCATTGGCGTCTTTTACAATGCCAAAATGGACTTCGTATTTTTG AAGAACTTCTTGAAGTTGACTACCTTCCAAGGAGCTGTAGTAGAGCTATGAAGGCAGTGGGTGTTGTGGAGGCCAGTTGT GAAGAAATTTTTGAGCTTGTAATGAGCATGGATGGGACACGGTTTGAATGGGATTGCAGTTTCCAACACGGTAGTTTAGT TGAGGAGGTGGATGGGCATACCGCTATTCTCTATCACCGACTTCTGCTGGACTGGTTCCCAATGTTTGTATGGCCTCGTG ATCTTTGTTATGTACGTTACTGGCGGCGAAATGATGATGGAAGTTATGTGGTTTTATTTCGCTCTAGGGAACATGAGAAT TGCAGTCCACAGCCAGGGTGTGTTCGGGCACATATTGAGAGTGGAGGATATAATATTTCCCCTTTAAAACCTCGAAATGG GAGGCCCAGGACACAAGTCCAGCATCTTATGCAGATTGATTTAAAGGGTTGGGGTGCAGGTTACGTACCATCTTTTCAGC AGCATTGTCTCCGCCAAATGTTAAACAGTGTGGCTGGTTTACGTGAATGGTTTGCCCAAGCGGATGAAAGGAGTGCTCCT CCTCGAATTCCCGTAATGGTTAATATGTCCTCAACAGCTGTCTCTTCAAAGGGTCAGAAGCCAAATGATTTATCTATGCA TCCTACTTCCCTCGATCAAATAAATTTTGCAAGTAGAAATTCTGCTTTGATGGATGAATATTCTGATGAAGATGAAGATT TTCAAATAGCAGAACCTGAGCAAGAGGCATTCCAAAGTGATCTTGATAATGATGTGAGAAGAATAGCCTTGGAGGAAGAA CCAGCAACTGTGATTGACTTATCTTCCTTCTCGGGTAATTTACGCCGAGATGATCGTGATAATGCTCGGGACTGCTGGAA AATTTCTGATGGAAATAACTTCAGAGTCAGAAGCAAGCATTTTTGCCATGACAAATCAAAGGTTCCTGCGGGCAAGCATT TGCTGGATCTTGTTGCTGTTGATTGGTTTAAGGACTCAAAAAGAATGGACCATGTGGCTAGGCGTAATGGTTGTGCAGCA CAAGTTGCATCAGAAAAAGGATTTTTCTCCTTTATCATCAATCTTCAAGTGCCCGGATCAACCCACTACAGTATGGTGTT CTATTTTGTGACAAAGGAGCTAGTTCCTGGATCCCTTTTGCAACGGTTTGTTGATGGTGATGATGAATTCCGAAACAGCA GGTTTAAGCTCATCCCATCAGTTCCAAAGGGCTCATGGATTGTACGCCAAAGTGTTGGGAGTACTCCTTGTTTACTGGGA AAGGCAGTTGATTGCAACTATATTCGCGGTCCCAAGTATTTAGAAATTGATGTAGATATTGGTTCTTCTACGGTTGCTAA TGGAGTTTTGGGGCTGGTTGTTGGTGTGATTACAACATTGGTGGTTGATATGGCTTTTCTTGTACAGGCAAATACTCCTG ATGAGTTGCCCGAGAGGCTTATTGGAGCTGTTCGTGTTTCTCATTTAGAGCTTAAATCGGCCATAGTCCCGAAACTGGAA CCAGATCTATCTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0341500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATKVVYEGWMVRYGRRKIGRSFIHMRYFVLESRLLAYYKRKPQDNQVPIKTLLIDGNCRVEDRGLKTHHGHMVYVLCVY NKKEKNHRIMMAAFNIQEALIWKEKIEYVIDQHQGAQPSNGNKYISFEYKSGMDNGKTASSSDRESQFSAQEDEDESQPN LLRRTTIGNGPPESIFDWTREIDSDLSNQNINNQAFSRKHWRLLQCQNGLRIFEELLEVDYLPRSCSRAMKAVGVVEASC EEIFELVMSMDGTRFEWDCSFQHGSLVEEVDGHTAILYHRLLLDWFPMFVWPRDLCYVRYWRRNDDGSYVVLFRSREHEN CSPQPGCVRAHIESGGYNISPLKPRNGRPRTQVQHLMQIDLKGWGAGYVPSFQQHCLRQMLNSVAGLREWFAQADERSAP PRIPVMVNMSSTAVSSKGQKPNDLSMHPTSLDQINFASRNSALMDEYSDEDEDFQIAEPEQEAFQSDLDNDVRRIALEEE PATVIDLSSFSGNLRRDDRDNARDCWKISDGNNFRVRSKHFCHDKSKVPAGKHLLDLVAVDWFKDSKRMDHVARRNGCAA QVASEKGFFSFIINLQVPGSTHYSMVFYFVTKELVPGSLLQRFVDGDDEFRNSRFKLIPSVPKGSWIVRQSVGSTPCLLG KAVDCNYIRGPKYLEIDVDIGSSTVANGVLGLVVGVITTLVVDMAFLVQANTPDELPERLIGAVRVSHLELKSAIVPKLE PDLS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 121 | 121 | 3.3E-10 | ||
| PANTHER | 3 | 721 | 719 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 3 | 721 | 719 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 4 | 111 | 108 | 9.397 | ||
| SUPERFAMILY | 4 | 116 | 113 | 9.25E-13 | – | |
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| CDD | 7 | 106 | 100 | 5.24269E-8 | – | |
| MobiDBLite | 135 | 174 | 40 | - | – | |
| SMART | 181 | 393 | 213 | 8.2E-49 | ||
| SUPERFAMILY | 185 | 381 | 197 | 1.01E-42 | – | |
| CDD | 193 | 393 | 201 | 4.42104E-48 | – | |
| ProSiteProfiles | 201 | 383 | 183 | 27.127 | ||
| Gene3D | 201 | 402 | 202 | 1.7E-44 | ||
| Pfam | 227 | 365 | 139 | 2.7E-21 | ||
| Pfam | 506 | 709 | 204 | 4.7E-68 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0341500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…