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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0341500 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0341500.2 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TAIR: AT4G19040.1 ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9UR75|A0A0L9UR75_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0341500 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:81852637..81864393) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCGACGAAGGTGGTTTACGAAGGGTGGATGGTGCGGTATGGCCGCCGTAAGATCGGGCGATCGTTCATCCACATGAG GTACTTCGTGCTGGAGTCGCGGCTGCTTGCATATTACAAGAGGAAACCGCAGGATAATCAGGTGATTCTTTCTTTCTATC ATCGATTTTCTTCTTACTCTCTCATAATCAGGAAAAGATTCAATTCGTTACTGATGAAAATTTCGTGATGCTGAAAGTTT CCTCTTCACGGAATCGCTTTTTGATTTTGGTGGGGGTATGCTTTGAAAAGGGATTGGAGAATTTACGAGACTGCTTTTCA ACTTTTTGAAATTATTATTATGCTTTTTGAACTTTTTTTGAAAAAGGATTGGAGAATTTGATGGTATGAACTTTACTTTG TTGATGTTTTGATTAGGTTCCCATTAAAACACTGCTAATTGATGGCAACTGTAGAGTAGAGGATAGAGGCTTGAAGACCC ATCATGGACATGTGAGTTCTGCAATTAAATTATGACTGTGTTTGTGTGGGTGTTGATATAGCAATGCATGTTGTGGAAAA CTTCTGGTCTTGAATTGAATTGGAATGTGCTTATTGTATGTTGACATGGAATGACTGACTGGTAACTAGCGAACTGAAGG GGTGAGACGATGCTGTGGAATGATTTATGACGTGAAATGTATGACTATGGTTCTACAACAACACCAATGGCATTTAGTGA AACCAAAGAAAAAGTAATGCTAGACATTCATAATTTGCACACAAATTTAACCCCTTCTTGTATCATTATATAAATTTACA GAACTGCGTAGGGTCCATTGAACACTTATGTGAAATTTCTCTAACATATGTGACTAATTGCACCTGTTGTCCAAGACAAT TTTTTGTTTTGTTTTCATTTTAGATTAATGAAGAAATTCACTACAGCAAAAGAACTCTTAAGTAGGATGAAATTGTATCA TCCGTCAACAAAAGAAAATAGACCAATGATACACCTTAGCAGGCTTATGTTAAGGGAACTGTCCTCTAATTTAGGGAACT GTCCCCTAATCATGCTCTCTTCCTCCCATGTAGCTTCTTCAGCAGGCTTATGTTTCCATAGGATAAACCATTCAGTTGCA CTTCTTCCGTCATGCATTTTACTGAGTTGCCAAAACTGTCTTAGGTGCCACAGGGATGCATCATACATTCTTTGATTTCT AAAGTATGAGGTAACTCTTAATCAGCCACATGCACTCAAAGCCCCATTTTTAGTTGAGACACGTGAAATCTAGGATGTAT GCTAGATTTTCCAGGAAGAAGTAATTTGTAAGCAACTTCTCCTATTCCTACTACCACTAAAAAAGGCCTGTAATAACGAG CTGACAGCTTGGGGCTGATTCTTCGTGATTTTCCAGGAAGAAGTAACTTGTAAGCAACTTCTCCTACTCCTCCACCGCTG AAAAAGGTCTGTAATAACGTGCTGACAGCTTGGGGTTGATTCTTCGTGCAACAATTTTTTTTCTGTGCAGGCATATCTGC ACTTGCCATAACCCAATCACCTATATCATAATTGACTTGGTGTCAGTGAGCATATGCATATTTACCTTCGTGACTTGTGC CCTTAAGCGGCCTAAGGGCCTCATCACTCTCCCTTAAAGCAATTGCCACTGATTGGATATCAATCTCTCCAGCGAGAAAA TGAGTGGTAATATGGGAAGGGCGCTTATAAACAACTTGAAAGGGAGTGATAACTGGAATAGTATCAGAACTCTGCCCAAG GAAACCATAGTACAAGCTGAGAAACTACTCCACATTATGACTAAATATGCTCCAGCTGCAGCCGTTTCATAGGCATTAAT TTTGTACACACTTTCTACCATTTTTTTGTTTGTTTTAGGAGTACATTCATTAAAATGAGAGATGTGTGTTTACCTGTTGG TGCGTAGTAGGACCACTGACCAGATAATCCTTAGTCATTGTGTAAAATAGTTATAATATATATTTTTGGGGAGAAAATAT GAATGCTTTTAGGTGAGGGAAAGATAAGTAAAAAATCTGATTGCACATTTTTTCTTCATGTATATTGAAATTTATCGTTG ATTCTATTTTTTTACTGGCATATGATAGATTATGTTAGTCCTATAGTATTACAAGATTAAATACACGTTGCCTTAAGCTA TTTAGAGATTTACCATAGTGATAGTGATTGTGTTCTTCTAAAATTTTACCCACTTTTTTTTTGTGCAGATGGTTTATGTT TTGTGTGTTTACAACAAGAAAGAAAAGAACCATCGAATTATGGTGAGTGGATTTTCCTCATTCATATATCTTTTTATCCA TAAGGAATTTTGTGCAACTTTTAAATAATTTATTCATTTTTTCTTAAATAATATTGTGGATGCTGAATAAATATTTTATT TATCACTCGGGTTGTTGCAGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAGGCCCTAATCTGGAAGGAAAAAATTGAGTATGTCATT GATCAGGTCAGTTTTATCAAATTGCATAATCATGCTATGCTCTTTAATGTGGATCAATATCCATCTTCTTAAGTTTCTGG TTAGACTTCATTTCTCCCTGATGTATATCAACATGAAATATGATAAGCATTTTCGCTGGATACATGGATAAAATGATAGG CTGAAATCTTAGTGACTTTGTAAATTCATCTTAGTAGGACATGTCTTCCTTTCGTGTAAGTTGATGCTATTGAGCTTCAA TGTATGCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTATATTTCTTTTGAGTACAAATCTGGAATGGACAATGG GAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTAAGTATTTTGGTACTGAGTTTTTCCACCTACAGTTTATTGAAGAT 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ATTTGTGTTGTCATAGTATAATTTATGACATGTTATGTGTTATTCCTTTTTGTTTCTCAGAAAAATTGTCTTGATGAAGG GAAGGTATCTAAGTTAACAGACATTTTACAAGATTGTGATGTCATCTAATATGTACTTACATATGTAAAATCAGAATACC TAATATACCCAACATTTTAGTTAGCCACTGCGTTGGAATTTTCATGAAGCTAGTTTTCCATGAAAATTTATACCGATGTT TATGCTCATTTTTGTTTGAACTGCACTTAGTATTTACTTTCATGATCCTTTGCTTATTGTAACTACTTCTTTTTAATATC GCCTAGAAAGGCTCAAGCAATGAATAATTAGGAGATGGCAGTAGAACTGCTCTCGGGACCTTCAATCAAAAGAAATAAAG TAACACACACACATGATATTCCATAATTCTGTAAATATTTACTCTGTGGATAAAATTTGTTAACCTCTTAGTATTTGCAT GCCTGCAGATGGGATTGCAGTTTCCAACACGGTAGTTTAGTTGAGGAGGTGGATGGGCATACCGCTATTCTCTATCACCG ACTTCTGCTGGACTGGTTCCCAATGTAATTATAATCTAACTTTTCTGCCATTTAAAATAATTTATACTATATATTATAGC TAACTTGAGCTATAATCTTTATGTAAAGGATCAGAATATCTTTGCAAGAGAACCTAACTTACTTGTATCTTGTGTCATAA AGTTTTTCAATAGTTCTTTTTTTCTTCCATGACATGCAAATCTATATTTACATCTATGAAAGCATGACTTAGGATGGGTA ACTGATTTTAAATTGGTTGAACATCCACAAACTAAGTCATTAAATGTATTAACACCAAGTGCTGTGTTTCATGACAGGTT TGTATGGCCTCGTGATCTTTGTTATGTACGTTACTGGCGGCGAAATGATGATGGAAGTTATGGTGGGCCATTTGGTTTAT TCGTTCGAAGTTTTCATTATATGTTCATCGGATTTGCTAACGGTAGTGCTGGTTAAAGAAATAAAAGTAAAAAATGTTAA ATGAAAATTAAATCATTTGTCATATTAGAACTCGAAAACATTGAGTACTTTCCTCTTCAAGTAACTAGAAGCATTCAATT GAGGGTATCAAATGCTCCTTAACCAGTGTCTTAAGGCCACAGTTAGCAAGATCCTATGTTTATTATTTTGAAGTTTGAAT TGATGTTTCTTCTTCTTGCAGTGGTTTTATTTCGCTCTAGGGAACATGAGAATTGCAGTCCACAGCCAGGGTGTGTTCGG GCACATATTGAGAGTAAGATCCAATTCTTTATAGATCTTGCTCCATTGTTCAAAGCTTAAGAGTGGGATGGTTTTTCATA TTCAAAGGGTGTGGATGTCCTCTGTGAGATGTAAAACAACTCACATGTTTTCACCTCACACTTTAAGGTTTTGGGATAGT TTATTCATGACATGGTATTAGAACCTCTATAACTAATTGGTCTTGAGTTTGATCCTTATTATCTCCCGTTCTTCTAAGTA ATTTATATTTCAGAACAAGGTTGAGTGAGCCTTTGCAGTGTCTACTATTCAAGCCCAAAGAATCTTGCGTGAGGGGGCAT GTTAGATATAAACCACTCATTTGCTTTCACCTAACAATTTTAGCTTTAGGGATAGTTGGTTTATGACATCAACTTATTAT GAAATAGGACTGTGCATGGGCCTCTTTGCCTGTTCTGGCTTGTGTGGATTGGGCAGTTGTTGCTGATCTCTGTTTTTCTG ACCTTGTCATACTCTCTATTTTCTGCTTTGGAGGGTTATCCATTTAGATCCTAAAATCAATGGATTTATGTTTTGGAATC TATTAATTTCGTTGAAATATATTATTCTAACAAACAATAACCTACATTAGTTACCCCCACTGCTCCACTTGACTCAATAG AATAATAATCTTAGTCTAGGGACTGTTAACAGTTGGAAAATATTTATAGAAATTCTACCCGATATGCATATTTTTTTTAT CTTATTGAGGTTGTTGTATGTAAAGCTTTGGATTTTCCTTCTTTTAATCAATTGAAACAAGTGAAATGTTTCGACAATTA CAAAGATAAACATGGAACCTGTGTGGGATACTAAGGTTTTATAAATTGCATCAGTTTTTCTGTCACCTTTAAATTAAGAT TGATCTTTACAATAGTCAGATTTTGTCATTATTTATCATTATTCTTTATATTTATTGAGAAGTACCACATTGACTAGAGA TATGGCAAAATAGTCCTTATAAAGGGTAGAACAACCCTCACCCCTAAGCTAACCTGAATTCTAAGAGTATGTACTGGTTT GTATTAATGAATTAATCTTTTTTCAATCGATTGATGCATCTCATGTACAATCATAAGTGAAAAGCCATGTTGAAATTTAT TAGGTCTAATAACTGTTATCTACAGGTGGAGGATATAATATTTCCCCTTTAAAACCTCGAAATGGGAGGCCCAGGACACA AGTCCAGCATCTTATGCAGATTGATTTAAAGGGTTGGGGTGCAGGTTACGTACCATCTTTTCAGCAGCATTGTCTCCGCC AAATGTTAAACAGTGTGGCTGGTGAGTTGATTTTATTCTATATGATTAAGAATTTTCTTATAGAATGGTAAACTATTGTT TCTATCATCATTGTTTCTTTTATAAACCCCTCTCTCTATGTTAATAGAAAGTATAGGTGACTATAGGTTGCCCCATTTTG GATCTCTCTCTTTTGTGGGGTGTCCTGATGTGCAATCACTTTCAAAAGGCTTGTTTTTTTTCCCTCCTTCTCTGCAGGTT TACGTGAATGGTTTGCCCAAGCGGATGAAAGGAGTGCTCCTCCTCGAATTCCCGTAATGGTTAATATGTCCTCAACAGCT GTCTCTTCAAAGGGTCAGAAGCCAAATGATTTATCTATGCATCCTACTTCCCTCGATCAAATAAATTTTGCAAGTAGAAA TTCTGCTTTGATGGATGAATATTCTGATGAAGATGAAGATTTTCAAATAGCAGAACCTGAGCAAGAGGTTGTATTTGCAT TACCACATATATACTTGTGGCCTTTACTTCATCAATTTTGAGTGCTAATATTTTAATACTTCATGCAGGCATTCCAAAGT GATCTTGATAATGATGTGAGAAGAATAGGTAGCGACCTGCTATACTTATTTTGTATCTAATAATATTATAATGATCAACA TTTTTCATGAAGCACCTGCGCGCAGAGATGCATGCAGCCATGCTAATAACAGAGCCTTGATTGAATCTAATATTTATGTC TTTCTAAACTGAAGCCTTGGAGGAAGAACCAGCAACTGTGATTGACTTATCTTCCTTCTCGGGTAATTTACGCCGAGATG ATCGTGATAATGCTCGGGACTGCTGGAAAATTTCTGATGGAAATAACTTCAGAGTCAGAAGCAAGCATTTTTGCCATGAC AAATCAAAGGTCCTCTCTTTGTATTCTAATCTTTCCGAATCAAAATTTATCATTATTTGGGGGTGCTCTTATTCATTTAT GGTGAACGATGAAGGTTCCTGCGGGCAAGCATTTGCTGGATCTTGTTGCTGTTGATTGGTTTAAGGACTCAAAAAGAATG GACCATGTGGCTAGGCGTAATGGTTGTGCAGCACAAGTAAGAATTCAAACCTTGTCTGTATTATGTTACTTGATGAAGAT TTGGTAGGTGCGGAACTAGGTAATTTGTTACAGTAAAATCGGATAAACCCAATTACAGAGACCAGAATCACATATCCATC GCTCACAAAACAAGAAAAAAGATTGAACATGTTTGGAAATATCCCTGCCTGAAGGCCCCAAAACTAAATGACTGAATGCC CTCTCCCCTTCCTTTCTTTCCTTTTATTTTTGGTTCTAATCTTTTCCACATGTTGGCAAGGTTTTTGCAACTCTAATCTC TCTTCCGCCCCTTACACATAATTTCATCCGATCTATCATACAAGTGTTCCATAATACTCCCCCCTTCCCCCAAAGGATAC ACCTTACCCTCAAGGTGGGAGGTCTAGGTAAGTACCCTACAATACAACAACTGAAAAGAGTTTTACCAATTTCCATTTGC TCCAAGCATAAAAGCTAAGTGATGATTTAATTTGAAGCATAATAATATCCATTATTCCACCCCAGCTATACCTCAGTTAT CGGGGTCTATTTGCTATGTTACCCGTTGTGTGAAAATATTCGAGACCTATTGTAGGCTTTTTGTCAGTTGCATATGTGAA AGGATTCCATTATTGTAGACCTATACTCGGCAGCATTTAAAAATGTAATGAAATTCTATGTTGAGCCTTTATTAGACAGG ATATGGACTACGAAAGTGGAGCTAATCTCTTCTTTTTTTTCATGACATTTTTTATGCATTTTTTTATACTGAAGAATTCC ATTAAAACTGATTCTCTAAACCAAAAAGCCGTCATTCAATTTGAAAATGTATCTTTGAAGCAATAAAGTTCTCTTAAATG ACCTGGGATTTAAATAGTGTCCTCCATGACTGCACCTCGTAATCACAAACCTGCGTTCTGGCTTAAACACCTAGCTGCAG ATGAAGACAGGGCCCCCAAACTAAACCCATCTGCAACAAAATCACGTTGACTAAGGGAGGGTGGTATATTTTTTAAAATA GGAGGGGTATTGGTTGTCATAATCTCAGACCTCAATTAGGTGAATTTAATTTCTCTAGTTATTTATAATTTATGTAAGCT GTTTGGTGATGGTTGTCTCTTTTCTGTTGTTGTTTTATTTTTTTGGTAGGCCTTTGCTGACAATACCCCTAATCTTTGGG TGTCTATGCAGGTTGCATCAGAAAAAGGATTTTTCTCCTTTATCATCAATCTTCAAGTGAGTCCTTCATTGCACTATATG AATCAACTTTGAACTTCAGTGGTTTAAAGTCTTGAAGTAAATTGATTCACGCTGTTTGGCTGCAGGTGCCCGGATCAACC CACTACAGTATGGTGTTCTATTTTGTGACAAAGGAGCTAGTTCCTGGATCCCTTTTGCAACGGTTTGTTGATGGTGATGA TGAATTCCGAAACAGCAGGTTTAAGCTCATCCCATCAGTTCCAAAGGTATTTACTGACATTTGTCATCATATACATCAGA CAATTTACACTGGCTTTGCAAGATAAAGTTATTATTTGTGGGTGTGTCATTGTTGTGAATCAAAACCTGATGTCCGCACA TTCTTATGTAGTTATTGTCAAGAACCAATTATCCCAAAATCTTAAGCTATTGGGTAATGGACCTTTAATGGTTTTATATT ATATTTCTAACACGCTCTCTCACGCAATAGCTCACTTGGGCTTGAAACATGGACAATGCACTAGCCCACCAACCATTTGC TGAAATTAAACTTTTTTTATTAGAATAGTTGGGGCAAGGCAACAAGGATCGAACTCTAGACCACTTGGTCATAGAGGCTC TGATACCATGTCACAGAACCAATTATTCCAAAAGCTTAAGCTGTTGGGTAATGGACTTTTAATGGGTAACATTCACATCT ATATATTGACCTATATAACCCTGTAATTCACTTAGTCAATCCCTAAAATTAAGGGATTCCATCTTGTATTGATCTACTAT AAATTCAAAAGGCTTACTATCTAATGAAATTTTCAGTTTCATCTAAATTAAATTCTCTCAAGTGTCTCGGCAGCCAAGTT CATAGCTTAGAAAATTAATCTAAAAAAGATGGGTCAAATATAGGATGTCCAAGTTTATTGAATTTAACCGGTTTTGATCA AGTGCATCCAAGTGTTCATGAAAAAAAGTTTGAAAACTGCTGGTTCAAGCACTTGCTCCAAATATGGAAATATCATTTTG CTTTGTTTACTTTCTGAGGTTTAACTTCATACTTTTTAAAACAAATGCACCCTCAGTTGATATATGCTACAGCCTGGCAC CATTTTGGTGCATATATATTTGGTCTTGTGCTATTGATATGTCTGACTCTTTTGTTCCCATATTTTGGTATCATAGACTA GGACTTTAACATTTACTCCATTTATATTTATGTTTTTTCCTTTTTTGTCTTCCCTTCTTCTATTTGTTATTTATAATTAC TATTGTTTGATATAGACATAAGAAACAAAATACTGTTTAATTTTTCTCATTCCTTATTGATTTTCAACTTAAAAAATGCA GGGCTCATGGATTGTACGCCAAAGTGTTGGGAGTACTCCTTGTTTACTGGGAAAGGCAGTTGATTGCAACTATATTCGCG GTCCCAAGTATTTAGAAGTAAGTCATGCAAATTCTATATAAATTTTTCTGTTCTTGTTGTATGAAGTTTCCCATTAATGA ATGACTTACATACCCTCACTTTTCTGCCATGATTGTTTAACCAATTATTTTTTATTTGTAGATTGATGTAGATATTGGTT CTTCTACGGTTGCTAATGGAGTTTTGGGGCTGGTTGTTGGTGTGATTACAACATTGGTGGTTGATATGGCTTTTCTTGTA CAGGTATGTTTTCTATGGTGTAGAATTTTATATGCTAGTAATGAACATGTTTGATAACTGTTTCCAAAACAGTTTTCAGT TTTTAAAAACTGAAAACTTGTTTGGTAAGATCTGTTTTCAAAAACAGTTTTTGAAAACAGTTCTCATTTTCAGTTTTTAA AACTAAAAAACCAAAATAGGTAAAAGATGTTTTCAGTTTCAGTTTTTAGTTTTCAGATATCAGTTTTCTAAATGTTCGAA AACATGTCATTCAAACTGTTTTCTTCTTCTGAAAACTATTTTTAAGAATTGTTTCTGAAAACTGTTTTAAAAACTGAAAA CTAAAACTGCTATCAAACAGGCTCCTAATCTTGTTTTTTGAAAGTAATGAACATCTAATCAAGTCATGGTATTTTTGTTT TGGGGGGGGGGGGGCAATTGGACTGGATCTATTTGCTTGTTGTATTCAGTGTGGAAACTTTTATATTCATTTTTTAAATA GCATAATGTTACTATTATTTTACATTTTTCAGGGGAAAAAGTTGTTTTCACTATTTCTTGCACAAAACTTTGAACACAGG GAACAAAGTAAAAAAAAACGTGGCTTCTAGTTTTTTATTAGAAGTAAAAACATCAAATGAAAATATTTCTTTTTTCCTAG CCAAACAGGCCGGAAATCTGTTGCATATAGGACTGGAACCAAACCATATACTTTTCTTGTTTGAAATCTTCGTACAGTTT TATGTGAACATCTTGAATGGGTTTAAATTCTAAATGTTGGGGACTTCCTCACACAACCTAGTATTTGTGAGTTAAATAAT ATTGATAATGACCATATTTGTGGACGGTTTTTTCCTCTCCTTTTTTTCAAATTAAATTGAATATTAGCTTTTGTGGAGGA TTCTATCGCAGGAATATTAAATTAAATTATTTTTAAATCGTGGCTTTACTATTATGTCTAGGCACGAATATGTGCTTGTG AGGTAAAAATTGTACTTGGTTATGAATAAGTGCTTGACATGTGAGTAATTTTCACAATGCATTGGTTGTCAGTTCATTGA CATATTTTTGGTTGTACTGTTTTTTGTTTTGATAAGCTTTTTGGTTTTTCTGTGGAATGATGATAAAATTGTTACAATTG ACAGGCAAATACTCCTGATGAGTTGCCCGAGAGGCTTATTGGAGCTGTTCGTGTTTCTCATTTAGAGCTTAAATCGGCCA TAGTCCCGAAACTGGAACCAGATCTATCTTGATAACCAAGTCAGAACTTTTGTTCTTTTATACAAAATCATTTGTTTGCA ATATGCTCTTGTACCATTTTTTTTCTTCTTTTACTGGGATGTAGGTTCATTGTTTTCTAATTGGTTTTTCTGTAAAATAT TAAAAGACAATTTTTTTTTCTCTTATCTTCTCTTTTCTGTTTTGTTTTCTTTTTAGTTCACTCAAATGTTTAGTTGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0341500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACGAAGGTGGTTTACGAAGGGTGGATGGTGCGGTATGGCCGCCGTAAGATCGGGCGATCGTTCATCCACATGAG GTACTTCGTGCTGGAGTCGCGGCTGCTTGCATATTACAAGAGGAAACCGCAGGATAATCAGGTTCCCATTAAAACACTGC TAATTGATGGCAACTGTAGAGTAGAGGATAGAGGCTTGAAGACCCATCATGGACATATGGTTTATGTTTTGTGTGTTTAC AACAAGAAAGAAAAGAACCATCGAATTATGATGGCAGCATTTAATATCCAAGAGGCCCTAATCTGGAAGGAAAAAATTGA GTATGTCATTGATCAGCATCAGGGAGCACAGCCATCAAATGGCAACAAGTATATTTCTTTTGAGTACAAATCTGGAATGG ACAATGGGAAGACAGCTTCTTCCTCAGACCGTGAAAGCCAGTTCAGTGCTCAGGAGGATGAAGATGAGTCTCAACCAAAT TTGTTAAGGAGGACAACAATTGGAAATGGACTTCGTATTTTTGAAGAACTTCTTGAAGTTGACTACCTTCCAAGGAGCTG TAGTAGAGCTATGAAGGCAGTGGGTGTTGTGGAGGCCAGTTGTGAAGAAATTTTTGAGCTTGTAATGAGCATGGATGGGA CACGATGGGATTGCAGTTTCCAACACGGTAGTTTAGTTGAGGAGGTGGATGGGCATACCGCTATTCTCTATCACCGACTT CTGCTGGACTGGTTCCCAATGTTTGTATGGCCTCGTGATCTTTGTTATGTACGTTACTGGCGGCGAAATGATGATGGAAG TTATGTGGTTTTATTTCGCTCTAGGGAACATGAGAATTGCAGTCCACAGCCAGGGTGTGTTCGGGCACATATTGAGAGTG GAGGATATAATATTTCCCCTTTAAAACCTCGAAATGGGAGGCCCAGGACACAAGTCCAGCATCTTATGCAGATTGATTTA AAGGGTTGGGGTGCAGGTTACGTACCATCTTTTCAGCAGCATTGTCTCCGCCAAATGTTAAACAGTGTGGCTGGTTTACG TGAATGGTTTGCCCAAGCGGATGAAAGGAGTGCTCCTCCTCGAATTCCCGTAATGGTTAATATGTCCTCAACAGCTGTCT CTTCAAAGGGTCAGAAGCCAAATGATTTATCTATGCATCCTACTTCCCTCGATCAAATAAATTTTGCAAGTAGAAATTCT GCTTTGATGGATGAATATTCTGATGAAGATGAAGATTTTCAAATAGCAGAACCTGAGCAAGAGGCATTCCAAAGTGATCT TGATAATGATGTGAGAAGAATAGCCTTGGAGGAAGAACCAGCAACTGTGATTGACTTATCTTCCTTCTCGGGTAATTTAC GCCGAGATGATCGTGATAATGCTCGGGACTGCTGGAAAATTTCTGATGGAAATAACTTCAGAGTCAGAAGCAAGCATTTT TGCCATGACAAATCAAAGGTTCCTGCGGGCAAGCATTTGCTGGATCTTGTTGCTGTTGATTGGTTTAAGGACTCAAAAAG AATGGACCATGTGGCTAGGCGTAATGGTTGTGCAGCACAAGTTGCATCAGAAAAAGGATTTTTCTCCTTTATCATCAATC TTCAAGTGCCCGGATCAACCCACTACAGTATGGTGTTCTATTTTGTGACAAAGGAGCTAGTTCCTGGATCCCTTTTGCAA CGGTTTGTTGATGGTGATGATGAATTCCGAAACAGCAGGTTTAAGCTCATCCCATCAGTTCCAAAGGGCTCATGGATTGT ACGCCAAAGTGTTGGGAGTACTCCTTGTTTACTGGGAAAGGCAGTTGATTGCAACTATATTCGCGGTCCCAAGTATTTAG AAATTGATGTAGATATTGGTTCTTCTACGGTTGCTAATGGAGTTTTGGGGCTGGTTGTTGGTGTGATTACAACATTGGTG GTTGATATGGCTTTTCTTGTACAGGCAAATACTCCTGATGAGTTGCCCGAGAGGCTTATTGGAGCTGTTCGTGTTTCTCA TTTAGAGCTTAAATCGGCCATAGTCCCGAAACTGGAACCAGATCTATCTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0341500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATKVVYEGWMVRYGRRKIGRSFIHMRYFVLESRLLAYYKRKPQDNQVPIKTLLIDGNCRVEDRGLKTHHGHMVYVLCVY NKKEKNHRIMMAAFNIQEALIWKEKIEYVIDQHQGAQPSNGNKYISFEYKSGMDNGKTASSSDRESQFSAQEDEDESQPN LLRRTTIGNGLRIFEELLEVDYLPRSCSRAMKAVGVVEASCEEIFELVMSMDGTRWDCSFQHGSLVEEVDGHTAILYHRL LLDWFPMFVWPRDLCYVRYWRRNDDGSYVVLFRSREHENCSPQPGCVRAHIESGGYNISPLKPRNGRPRTQVQHLMQIDL KGWGAGYVPSFQQHCLRQMLNSVAGLREWFAQADERSAPPRIPVMVNMSSTAVSSKGQKPNDLSMHPTSLDQINFASRNS ALMDEYSDEDEDFQIAEPEQEAFQSDLDNDVRRIALEEEPATVIDLSSFSGNLRRDDRDNARDCWKISDGNNFRVRSKHF CHDKSKVPAGKHLLDLVAVDWFKDSKRMDHVARRNGCAAQVASEKGFFSFIINLQVPGSTHYSMVFYFVTKELVPGSLLQ RFVDGDDEFRNSRFKLIPSVPKGSWIVRQSVGSTPCLLGKAVDCNYIRGPKYLEIDVDIGSSTVANGVLGLVVGVITTLV VDMAFLVQANTPDELPERLIGAVRVSHLELKSAIVPKLEPDLS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
Gene3D | 1 | 121 | 121 | 3.0E-10 | ||
PANTHER | 3 | 170 | 168 | 0.0 | – | |
PANTHER | 3 | 170 | 168 | 0.0 | – | |
SUPERFAMILY | 4 | 116 | 113 | 8.41E-13 | – | |
ProSiteProfiles | 4 | 111 | 108 | 9.397 | ||
SMART | 5 | 113 | 109 | 7.3E-10 | ||
CDD | 7 | 106 | 100 | 4.34105E-8 | – | |
MobiDBLite | 135 | 161 | 27 | - | – | |
SMART | 151 | 352 | 202 | 7.7E-46 | ||
CDD | 168 | 352 | 185 | 5.80749E-44 | – | |
PANTHER | 169 | 680 | 512 | 0.0 | – | |
PANTHER | 169 | 680 | 512 | 0.0 | – | |
Gene3D | 180 | 361 | 182 | 9.0E-43 | ||
SUPERFAMILY | 185 | 340 | 156 | 4.12E-38 | – | |
Pfam | 188 | 324 | 137 | 2.2E-20 | ||
ProSiteProfiles | 189 | 342 | 154 | 25.461 | ||
Pfam | 465 | 668 | 204 | 4.2E-68 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0341500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…