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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0375800 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0375800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nudix hydrolase 9; TAIR: AT3G46200.1 nudix hydrolase homolog 9; Swiss-Prot: sp|Q8VYR2|NUDT9_ARATH Nudix hydrolase 9; TrEMBL-Plants: tr|V7AGZ1|V7AGZ1_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0375800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:87302062..87319687) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TAGGATTAGAGAAGGAAACACAGCAAAGGCACTGCTAAGAGATTAGGTCATTGCACCCCAAAACCCCAACCATATGAAGC TTCTCCGTGCCGTCGCCGCCAAAACCTTCCGCGACATCGGCGTGATCCGCGGCTTCGCCACTGCCGGGAACTTAGAATTA GAATCGAAGAGAGTGGAGCCTAATTTGGTTTCGTTCAATGCGGGCTATTCAGGATTTGTGCCGGAAAAGTAGTCTGAAAG AGGCTGAGGCGATGCTTGAGGAGATGAGTCGGAAGGGTTTGGCTCCTGATGAGAGGACTTACACGTCTCTCATTATCATG TACTGTTGTCAGTTGCAGAGTTGTAAGGCTTATAAGGCTTATACTGTTCTGTTCGAACCTTGTCAATTATCGACACAAAA TCTCACATCCTCTCCCGTAGATCAATCGAACTGCCATCCATTCCACAACTGAATCGGAATGTAAACATCAATCATCACCA CAACCATAGGTGGGTTGCTCTGGCACCGGAAGCCGACCCCGTCGGCGTTTGATTTGGCGGAGCAGACTCAGGCTGGTTGT CCTGTTTTTTACTTTCAACCTGAGAGACAGAGCTCAGCAATTGCCACCGGAAGTCTTCAAGTAAGCAGTCCTAATTGAAT TTATTTTTATTGCAACAATTGTTTCAATTCAACTTTCTAGCATCTCATGATCAATCTATAATTTAGGTGTCAGGTTTATA CTTCGCTTTGGTGCCAGATCTGATTTGTTTCATGGATGATAGTTAAGAGGAATTCAAGTCGGCTGACCGGAACCACAAGT TTGGTTTGGGAGGAGACCACGGCCATAGTTCACCCTTCAGGAGCTGGATCTTAATATTCAAGTTTGGTTTTCTTTCCTCC TCTCCCTTAGATCGATCGGACGTTTCTCTGGATCAAATCAACCCAAACACGAAACGGTAAAGATCACATATATGGTGACC 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0375800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTAGCAAGATTGAAATTTGAGGACCTGTCTATATACTATTCCATGGACTATCAAATAGCACAGTATGGAGGGTGTGC TTTGTACACTGGTGGTGCATCTGACCATGAACCACATCTTTGCCTCCACCTTGGTTTGACAGATTATAGGACTTTTGTGG GGACAAATTTAAGTCCTTTGTGGGAAAGATTCCTGATTCCATCAGAAGATGATTCCGTTATTTGTCAGCATACCTCCAGG GCACTAGGAAATGGTGCAGTGGTGGAGACAATTGACAAGAAGATACTAGTATTACAACGAAGTAATAATGTTGGTGAATT TCCTGGATATTTTGTTTTCCTAGGAGGCCATCCTGAGCCTCAAGAAGTTGGTATAGCATCCCATCAACATGTCAGGGAGT TAATGGAGTCTATTAACATTAAGGTTTCACAGGAGATGTTTGACAGCATAGTTCGTGAAGTAGTTGAAGAAATTGGAGTG CCAGCTTCTTCCCTTAGCAACCCTGCTTTCATTGGTATATCTCGCAGGGATTTGAATGTGAGGCCAGCTGCATTTTTCTT TATCAAATGCAATCTTGATTCAAAGGAAGTTCAGCAGTTTTATTCTAGTGCACAAGATGGCTATGAATCTACTCAGCTAT ATGCTTTTCCAATGGATGAATTAGAAAAAATGGCTTCTAGGATGCCTGGATGTCATCGAGGTGGATTTGCTCTTTATAAA TTGATGGTTGACACCATGAAGATCACTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0375800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVARLKFEDLSIYYSMDYQIAQYGGCALYTGGASDHEPHLCLHLGLTDYRTFVGTNLSPLWERFLIPSEDDSVICQHTSR ALGNGAVVETIDKKILVLQRSNNVGEFPGYFVFLGGHPEPQEVGIASHQHVRELMESINIKVSQEMFDSIVREVVEEIGV PASSLSNPAFIGISRRDLNVRPAAFFFIKCNLDSKEVQQFYSSAQDGYESTQLYAFPMDELEKMASRMPGCHRGGFALYK LMVDTMKIT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 23 | 247 | 225 | 1.7E-99 | – | |
| Gene3D | 77 | 232 | 156 | 5.3E-13 | – | |
| ProSiteProfiles | 79 | 244 | 166 | 12.088 | ||
| SUPERFAMILY | 81 | 227 | 147 | 1.9E-11 | ||
| CDD | 82 | 221 | 140 | 6.63442E-8 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0375800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…