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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0393500 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0393500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Xaa-pro aminopeptidase, putative; TAIR: AT4G36760.1 aminopeptidase P1; Swiss-Prot: sp|D1ZKF3|AMPP1_SORMK Probable Xaa-Pro aminopeptidase P; TrEMBL-Plants: tr|G7KC66|G7KC66_MEDTR Xaa-pro aminopeptidase P; Found in the gene: LotjaGi2g1v0393500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:89068791..89077975) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TAAGCTTTAAAAATAAGAACCAAACAAGGCACTAACTTTTCATCCTATCGTGGATAGCACAGATCGCTGTGTATAAATAT AATTCAAGTCAGTTGAATTTATTTATCACTCAACAAAACTCAGAAGCAGCGAGAGCGAGACTGAGGAAAACCGAAAATGG AAAACACACTTTCAGCGTTGAGGTCGTTGATGGCGTCTCACTCTCCGCCTCTTGATGCCTTAGTTGTCCCCTCTGAAGAT TATCACCAGGTTCTTCTTCATCTTCATCATCATCTTCACTCTTAGATCGAACTATTTCATCGTTTCAATTTCTATCCTCT AATTCGATGTTGCTAATATGAAACCTCTTCTCTATTTCTGCGATTCCTTTTGCGCTTTGCAGAGTGAATACGTCTCCGCT CGAGACAAGCGTCGTGAATTCGTCTCTGGCTTCTCTGGAAGTGCTGGTTAGTTTCTATCCAAAATTTCATTTCATGCGTT TTTGTTTTGGTTTGTCAATATAATTTATCGTAGTATCTATGATTTTAGGGTTTATAATGGATTGAATCAAACTCCGAAGT AGTCCTTTGTTAGTTTCAACATTTCACTATTTACCGTATTGATTTTCTTGAAATTGAGGTGTGTTCTAATCAAGTAATGG AATTATCATATCATACATAAAGTAACTATGCATTAGGCATACTCAAAGAAATTGGTATGCGAGATTGTCGACCCGGTGAA AGTCACATGGATCCAAATCATAAATTGTTCTCAAATCAGAAGAGTTATATTATGATGATGTGAGGTGTCAAAGAAAGTTG GTTGGAAAGCTTACTATCTCACTTTAACAAGAGTATAATTTTTTTTATAATGCAAGTAGTCAGCCAATTCATGCAACCTA ATTTTGAGTTATATTAAGGAACCTGGACAAGGATTCCTCTATGAAGACAATGGAAGTAGGGACACTTAAATATTGGTTAC TGTGATGTTGATTCGATAGGTTATATGTTCTTCCATGGGGTTGTATTTTTGTGGGTGAAAATACTTTCTCATGAAGGACT GAAGAAAATATTCTATGGTCTAGTCCATTAGCTGAATATTAGGTCAGGGCAGTAGCTACCTGTGAGCTTACTTCAATATA GCAACCTCAGGAGTTGAGATTTGGATACATCCAACAAATGAAAGTTATGTCGTGATAATCAAGGACTCTTTATATTAAAT AATTTCTAATCCTATTTTCCATGAAAGAGCTGAGCATATTAAAGTTGATTTCGACTTTATGTGAGAGAAAGTCATTCCTA AGGAAGTTATCACTGAATTTGTTAAGTCAAATGATCAAATATCAGATATCTTAGCAAAGTCTATGGGGATCTCAGTTCAT GATATTTCCTGTGAGCATTTGATTTGTATTTCCAACTTAAGGGGGAGTGTTCTTCACTCTAGCAATTCAAAAAAATTACT CTATAAAATTCTCTAGTCCCTTTTCGAGTTGTGTGATCGGTTTCCGTAAAACAATTTTTGCTTCTATAAGCTTGAAAAAG GGTTACGGTTTGTTGCTAGCCTTATGGTTAATGACTAATGATCAGCGTGCTTTGTTTTAAATCGGCCTGGGGATGGGAGT ATTTTGGTTGCTATGGAATGCATGTAATAATCACTGGATGGGAATTCTAGGACCGGAGGGTTAGTCCCTGATATAAGATG GAATTTGAGTCTGTTGTTGAATTTCAATTTTGTTTGCTAAATAGCTATGCGATGGTCTTGTGTATTTCAAGTTTTTAACA TGATAACATCAATGAAGTGTTTTTTGTCTTGTTTGTCTTTATCTTTTAAAATTGGCATTCAGGTTTGGCACTTATAACTA AGGATGTAGCACTGCTGTGGACCGATGGACGCTACTTTTTGCAGGCTGAACAACAACTTAGTGATGAGTGGAAGCTAATG CGCATTGGTGAAGATCCTGCTGTGGACACCTGGATGGCTGATGTGAGCTTTTAAAAAAACTCTTTGATATATATATGTGT GTTATTGATAATTATTATGACAAATGCCTAAAATTTAGTGAATGATATTTTTCATATTGTTCACTCACCAAAACATGATA TTACAGCTTGGGTCAAGAATTATCTGTCTACGTCTTGGCACTAATGATATGTTAGGCACAAGTAGCTTGTCCTTAGAAGT TAGAAGTACTAGCATAAGTGATATAAAAAAATAAAAGAAAAAGAAATAAGGGTTTTGAAGTGAAGTAAAGAAGGATATTT TTTTTTTTGAATTTAAGTAAAGAAGGATAGGTATAGAAATAACGGAAAATTTAAAATTCTAAGAGATAGACATGTTAAAA TAGGAATAAGTTTTGATATTATTAGTCATTTAAAAAAATCCTGTTCATAAAGCCCGATGATAAACTTATGTTTTTGAATG AAGGTTATGTGCTGGATCCTTCTGGCCGCATTCATGTCCATTTTCTATTCATTTCATGATTAGACTATATCTGGGATTTT ACTATGTGGGTTATCTAACTAATAAGTCATTTCCATTCACTAGAACTTGCTAAAAGAAGCATCCATCGGGGTTGATCCTT GGTGCATTTCAATTGATACTGCCCAAAGATGGGAGCGTTCTTTTGCCGAAAAACAGCAGAAGCTGGTTCAGACAACAAAA AACTTGGTTGATGAAGTATGGGCAGATCGCCCACCGGCCGAGATTAATGCTGTGGTTGTACAACCATTAAAATTTGCAGG TCGCTCTGTTGCAGATAAATTGAAAGATTTGAGAAAAAAGCTTGTACAGGAGCAAGCTCGGGGGATAATTTTCACATCAC TTGATGAAGTGAGTGTATCCTTTTAATAACTTCTCTTTTTTCTTCTATGTCATCTGAGTTTTAAGGGTATTTTCTGCCTC 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ATAATTATTCAGAGGTTGGGCATGTCTTTTGCAATAATTAGCTCCATATCCTCCGAAATGAGTCAAAAAGTATACTTACT GAATTTTTTCAAATCATTGCAGGCAGTCCTTGAAATTAACTGAGGTGACTGTAAGTGACAAGCTTGAAGGTTTTCGAGCA TCAAAAAAGGTGGAGTTAACTAAATCATTTAAAAATGTATTTATTTGGCTTAGTTTTTTGTACCAAAAAGTTTCTGTTCA AGAAAGAAACACTTGTGGAAAGATGGCAAAGATTATGGCTTAAAAATGATTTATTTTTAAGGTTGTGAAAAAGTGATTTT TTTTATTTATTTTACAAAAATCTGAAGCTATTTCACAGTTGATTATAATTCCCCCTTATAAGCATCTCTCTTGCCCTTGA TATATTTTCGAAGTGATTTTGTTTTCTAATGTGCTTATTAATAACTAGAGTCCTCCATAGAGTCTGATAAGCCCATTGGA TAGAAGTAGTGGCTTACATTTTAAGCTATTGCTTATAGTTTGTATGCAGATTCTGCATATAAGGTAGACTTGAACCATTA TGAGTATGACTAGTTTTGGCATATAACTTGTAGGAATCACATATTAATTAATATCGATTTTGAATGACTGCATTGCACTT TTGGTGTCTCAGTTTGGACTGTTTGTGATTTTGGTCTCAAGTTTTATTGAGCTAATCAAGTTGCTCTATTTTTTAAAAAA TAAGCAAATTGGGTCTTAATATCAATTTTCCTCTATCTAAAGTCCGCAAAATTTTATTTTCTATTTAAATGTTTTGACTT TTTGATTGTGTTATAGACTTGGGATTTGGTATAATTGTAAAGTTCAAAAGTAAAAAAATTAGTGGACATTTGATTAAATT TGAAGTATTTTGTAGGATATATGATTAGGAGTTGAAAAGGGGGAATTTGAGATTTATTTATTTCGTCTGAAATTGAATGT TTTTGTTGGTAAGTTGAGTCAAAGAATGTTTAAAATGATTAATTGATTCAGTTTTTGAAACTTAAAAGAAAATGAGAATT TTGAGAGTTCTAACTTTAAGTAAAAGAAAAATGATGGAGGAACTTAATTGTAATGGTTACAAAATTCGAGGGATAAAGTT CACTTTAAAAAATATTATAGGATAAAAATTACATATTAGCTATATAGTAGAGAGATTGAAAGTGAAATTATGCCTTTCTG CAACTTAGTCGAAGTGTCGAACATCATTTTACTGCGTTTGCTTAAATATATAAGGTTTGGTCTGTTTGGAGTTAAAGTAA TGAGGAGAAATGTTTGTTTCTTATTTAACTCAATGGAATATGAAGGTTTTGAAGTAGATGTTCATATACACATGCATGTT TCAAGAGTATGACAGTCTGTTCAATCCTAAGAATTTTTTTCCTTTATGTTTTCAGCATTTCAGAGGATTGAGTTTCCCTA CTATTTCCTCTGTTGGTCCCAATGGCGCTGTTATTCATTATTCTCCAAAAGCTGAAACATGTGCCGAGCTTGATCCAGAT AAAATTTATCTTTTTGATTCTGGTGCCCAGGTCTGTCTAGGATTTTTAACTGAAGTCTGCGGATAATATTTTTTATTGGT GAAATTTTATGGTTTTCATATTATCATATATGATAATCATGATCTCCACCTCTGTATACTGATAACTGGTGGTGGTGTTT CTAAAAGTATCTAGATGGAACAACTGATATTACAAGAACAGTTCATTTTGGGAAACCTTCGGCCCATGAGAAAGCATGCT ATACAGCGGTATGTGCTTTTATTTGCTCTTTCTACAAGTTACATAGTTTCAAAACTTTACCATGAAGCGTTTTTTTTGGG AAGGAAAATGCTTTATTAATATTTAATATCTTGTAAACAGAAATAATACTGCTAGTTAGCAGTGTTATCAAATATCCGCC ATGGCGGTTTTTCGGCTTTCCGCTATGGCCGATATGCCCGCCATATTTCCGCCATTATTTGTCATGAATGGCGGGATTTT GGCTTTCCGCCATGTCCCGCTATCCCCAATTAACAACACTGCTAGTTAGTCACCAACCTGAACGTATCCAATCATACTCA AATATTATTTCGCTTTCCCAATTTTATTTCTATCGGGGCTTTATATCATGTTTGATTTGCTGAGCTTGGCGCAGGTCTTA AAGGGTCACATTGCTCTTGGGAATGCTGTGTTTCCTAATGGGACAAATGGTATAACGAAATTTCACAATTTTTATTTGTC AAATTCTGAGTATAATTGATTAGTCTTGGTTTCTCACATCCAACTTAGCTACTCATTTCCTTTTTTTGTGAAATAATTTC AGGTCATGCCCTTGATATACTTGCTAGAATTCCTTTGTGGAAGAATGGTCTTGATTATCGACATGGTACTGGTCATGGTA TTGGGTCCTACCTGAATGTTCATGAAGGTATTGAGGAACTATCATGGATCCCTTATTGCTGATTTTGATCGTGTAATCAA GTTTTTTTCTTTTTCCTGAAGTCAATACAAAATGAGAATTTAAATTAATACAACATAAGTTCTGCAGGACCTCATTTAAT CAGTTTCAAACCTCGGAATGTACCGTTGCAATCTTCCATGACTGTTACAGATGGTTAGTACCATAACATTGTAGTGGATG TGCAATTGAGATTCACACATCATTTCTATCATATTATTTTTGCATTTGATTGTTCTGTATCATTTTTAGTTCTGGTCATT ACAAAGGCCGCATATGTTGGGTTCTGCTTCTGAACCATGCGTTGGAATTTGTTTTTCAGAGCCTGGTTACTATGAAGATG GAGCATTTGGAATAAGATTGGAGAATGTGCTTATAATCAACGAGGCTGATACAAAATTCAATTTTGGTGATAAGGGTTAC TTATCTTTTGAGCATATTACCTGGGTAAGTTATAATCTGTATTAGTATGTGTTTAGCTTATTTCAGTTGGATGTTTACTT TTGAAATATAAAATATAGAATATTTTACACTTCATTCAACTATTCACTCTAAGTTCTGGCCTTTGCATTTGTATTGTGGT ATTTAAAATTGGAGAATTTTATCATGACAGTAGAATATTATTCCTCATGGTATTTCATCAAGTGCTTTTTGATTTTTGTC GTCCAGGCACCATATCAAACGAAGTTGATTGACCTGAACCTTCTAACGCCTGATGAGATAAATTGGCTGAACTCTTATCA CTCCAGATGTAGGGATATTTTGCAACCACATTTGGATGATGCAGCTGAAAATGAATGGCTCAAGAAAGCCACTGAACCTG TAGGTGTGTGAGCTGTGTTGTGAGTTTGGAAAAGTTAATAATTGACTTTACTACGGCGTAATACTGCATATAAATTGATT CTTGCTCTTTATAAGGTCTATAATGTTGAATTTCCTACCAAACACCACATCAGTTTTTTTTTTTAATTTTCCTTTGTAGT TTTATTATCATCGAACTCTTAGTCTAAATAAGATGAACCTTGTAGCTGAAAATGAAGAACCACAAGTACAGATGTAAGTG GACAAAAGTTTAATTCGAAGATTGTTTCTTGCTTGACGGCTCGTTATTGAATCTAGCCATGTGTCAGGTGGGGCATTTAA GATGAATGGTTTCCCTTGTATAGAAGAAATTTGCTTGTAGTGCTTGCGTATATGACATAACCAAAAAAACATATCTACCC TTACATCTAAATTAGGGTTGAGACATTTTCCCATTTACTTAAAGAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATGAGTTGAGTGATTC TTTAAATAGAGACACTCTAGAGGTAATATGGGTTGAAGTACCCTTTGTACTTCAATTTAATATATTTCATTTGCTTATAA AAAAAAACTCTATAGAGGTAATAAACTCTTAAATGCATGCCAAGATTTTTAAAATCTTTTCACAAATAAAATAGCATCTC TATAAATTAAATAAAAATCCTAACTCTCTTGAATACGATAATCTAACGCTAGCTAACAACAGGATTTCACATGACAAGTT TTTCCAAATTCAAATCAAATTTTGTTTTGTTTGCTCTTATTTTAAAGCAAATCAATCATAAATTCACATATTATTTTTTT ATAAAACCATGACTCACTAGTTCCTATATAAGAACTTAGGGCTCTGAACTCAATGCACTTGTGAGAAAGAGGATGGCTGA TAGGATTAGTGCCCTACCGGATGAACTTTTATGTCACATATTCTCTTTTCTCCCAACTAAACTCGCATTCACCACCACCA TTCTTTCCAAGCGCTGGATCTCACTTTGCTGCTCATTTGCCTCTCTCAATGTTTGCTATGAAGGCAGCCCACAGGACGAA CACGAGGTCTGTGACTTTGTTCGTGACGCAGTTTCACTCATTCCACGCGGGCAGGACCAATCCAC
CDS sequence (LotjaGi2g1v0393500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAAACACACTTTCAGCGTTGAGGTCGTTGATGGCGTCTCACTCTCCGCCTCTTGATGCCTTAGTTGTCCCCTCTGA AGATTATCACCAGAGTGAATACGTCTCCGCTCGAGACAAGCGTCGTGAATTCGTCTCTGGCTTCTCTGGAAGTGCTGGTT TGGCACTTATAACTAAGGATGTAGCACTGCTGTGGACCGATGGACGCTACTTTTTGCAGGCTGAACAACAACTTAGTGAT GAGTGGAAGCTAATGCGCATTGGTGAAGATCCTGCTGTGGACACCTGGATGGCTGATAACTTGCTAAAAGAAGCATCCAT CGGGGTTGATCCTTGGTGCATTTCAATTGATACTGCCCAAAGATGGGAGCGTTCTTTTGCCGAAAAACAGCAGAAGCTGG TTCAGACAACAAAAAACTTGGTTGATGAAGTATGGGCAGATCGCCCACCGGCCGAGATTAATGCTGTGGTTGTACAACCA TTAAAATTTGCAGGTCGCTCTGTTGCAGATAAATTGAAAGATTTGAGAAAAAAGCTTGTACAGGAGCAAGCTCGGGGGAT AATTTTCACATCACTTGATGAAGTTGCATGGTTGTATAATATTCGTGGAAATGATGTGGCATACTGTCCCGTTGTTCATG CATTTGCTATTGTGACATCCAATTCTGCTTTCCTTTATGTGGACAAGCGTAAGGTGTCAGCTGAGGTAAAGTCTCATTTG GAGGAGAATGGAATTGAAATTCGAGAGTACACAGCAGTAAGCTTTGATGTTGCATTGCTTGCAACGGATGAGCTTGATAC TACATCTACTGCCAAAGATACTCTAGCTGAAATTACAAAGCAGGCTGAAAAATTTGTCAGTGAAACCAATAAGAGTGTAA ACGGCAAACATCAGGCAAAAGAAAATAGTAACAACCTCATATGGGCTGATCCAGGTTCATGCTGTTATGCAGTGTATTCA AAATTGAACCCTGATACAGTTCTCTTGCAGCAATCACCTTTGGCTCTTGCAAAAGCTTTGAAGAACCCGGTGGAGTTGGA GGGGTTAAAACAGGCACATATTCGGGATGGTGCAGCTGTTGTGCAATATCTTGTCTGGTTGGATAAGCAGATGCAGGATA TTTTTGGAGCATCTGGTTACTTCTCAGAGGGGAATACTGTGAAAAAAGAGGAACTGTCGCAGTCCTTGAAATTAACTGAG GTGACTGTAAGTGACAAGCTTGAAGGTTTTCGAGCATCAAAAAAGCATTTCAGAGGATTGAGTTTCCCTACTATTTCCTC TGTTGGTCCCAATGGCGCTGTTATTCATTATTCTCCAAAAGCTGAAACATGTGCCGAGCTTGATCCAGATAAAATTTATC TTTTTGATTCTGGTGCCCAGTATCTAGATGGAACAACTGATATTACAAGAACAGTTCATTTTGGGAAACCTTCGGCCCAT GAGAAAGCATGCTATACAGCGGTCTTAAAGGGTCACATTGCTCTTGGGAATGCTGTGTTTCCTAATGGGACAAATGGTCA TGCCCTTGATATACTTGCTAGAATTCCTTTGTGGAAGAATGGTCTTGATTATCGACATGGTACTGGTCATGGTATTGGGT CCTACCTGAATGTTCATGAAGGACCTCATTTAATCAGTTTCAAACCTCGGAATGTACCGTTGCAATCTTCCATGACTGTT ACAGATGAGCCTGGTTACTATGAAGATGGAGCATTTGGAATAAGATTGGAGAATGTGCTTATAATCAACGAGGCTGATAC AAAATTCAATTTTGGTGATAAGGGTTACTTATCTTTTGAGCATATTACCTGGGCACCATATCAAACGAAGTTGATTGACC TGAACCTTCTAACGCCTGATGAGATAAATTGGCTGAACTCTTATCACTCCAGATGTAGGGATATTTTGCAACCACATTTG GATGATGCAGCTGAAAATGAATGGCTCAAGAAAGCCACTGAACCTGTAGGTGTGTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0393500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MENTLSALRSLMASHSPPLDALVVPSEDYHQSEYVSARDKRREFVSGFSGSAGLALITKDVALLWTDGRYFLQAEQQLSD EWKLMRIGEDPAVDTWMADNLLKEASIGVDPWCISIDTAQRWERSFAEKQQKLVQTTKNLVDEVWADRPPAEINAVVVQP LKFAGRSVADKLKDLRKKLVQEQARGIIFTSLDEVAWLYNIRGNDVAYCPVVHAFAIVTSNSAFLYVDKRKVSAEVKSHL EENGIEIREYTAVSFDVALLATDELDTTSTAKDTLAEITKQAEKFVSETNKSVNGKHQAKENSNNLIWADPGSCCYAVYS KLNPDTVLLQQSPLALAKALKNPVELEGLKQAHIRDGAAVVQYLVWLDKQMQDIFGASGYFSEGNTVKKEELSQSLKLTE VTVSDKLEGFRASKKHFRGLSFPTISSVGPNGAVIHYSPKAETCAELDPDKIYLFDSGAQYLDGTTDITRTVHFGKPSAH EKACYTAVLKGHIALGNAVFPNGTNGHALDILARIPLWKNGLDYRHGTGHGIGSYLNVHEGPHLISFKPRNVPLQSSMTV TDEPGYYEDGAFGIRLENVLIINEADTKFNFGDKGYLSFEHITWAPYQTKLIDLNLLTPDEINWLNSYHSRCRDILQPHL DDAAENEWLKKATEPVGV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 145 | 145 | 3.9E-52 | ||
| PANTHER | 4 | 655 | 652 | 0.0 | – | |
| Pfam | 6 | 138 | 133 | 6.8E-17 | ||
| SUPERFAMILY | 41 | 131 | 91 | 2.09E-8 | ||
| Gene3D | 146 | 282 | 137 | 3.1E-40 | ||
| Pfam | 147 | 345 | 199 | 4.6E-49 | – | |
| Gene3D | 339 | 656 | 318 | 2.8E-105 | ||
| SUPERFAMILY | 342 | 621 | 280 | 3.14E-54 | ||
| CDD | 348 | 592 | 245 | 1.1747E-132 | ||
| Pfam | 350 | 584 | 235 | 1.5E-44 | ||
| ProSitePatterns | 526 | 538 | 13 | - | ||
| Pfam | 596 | 655 | 60 | 7.4E-24 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Hydrolase activity | Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3. | ||
| Molecular function | Metalloaminopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of N-terminal amino acid residues from a polypeptide chain by a mechanism in which water acts as a nucleophile, one or two metal ions hold the water molecule in place, and charged amino acid side chains are ligands for the metal ions. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0393500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…