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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0083100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0083100.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Helicase/SANT-associated, DNA-binding protein, putative; TAIR: AT3G24880.2 Helicase/SANT-associated, DNA binding protein; Swiss-Prot: sp|F4J7T3|EAF1A_ARATH Chromatin modification-related protein EAF1 A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FX49|A0A0R0FX49_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0083100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:9235838..9256695) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTGCTTTCAAAAAAAATTAACCTACATGATATTGATAAACAAAAGAAAACCTTGGTTATGATATAATTTTGAAAAGCCC AAAATGGAGGTCCAAAAATGGTAAATTCTCAAAGCGCCCTTATACGTCATCGTCTTCATGTCCAGCCCACGACTCGCATA GTTCCCTCTCCACACCCACAGGCACGAAGAACACAACCAACGTGTAGATACACAGAAAGGAGCAAAATCAAAATCACCAT TCCGATAACCCCTAATTGGTGACCTTGAATCCCTTAACACCACTCACAATTGCTTCCATGGCGTACATTTGCTGCTACAT GTTGTGTTCCTGTGCCAATTCGTGACAAAGTTACCATTCCCCGAAACCCTAGGAGAGAGAAAGTTCGTGTTGATACGGTC CTCTTGGGGTGTCAGATTGTGCCCTAGCTTCCAATTCTGTGATCCTTTCGTGAATTGAGGTGGTTTTCTTGTCTTAATTG TTGTGTTTTTGGCATTTTCGTTGTTCTCATGAAACCCTAGAATTGTTCAAATTGGGAATTCGAGGAAATGGGTGCTGTTA GGGCTTCAATTTTGTTGGGGGAATTTTTCTGGGGTGTTGTCTTGTTGCGACTGTGTTGTGCATTGTGTTGAAATGGTATT CTGGTTGATGCTTGGTATTAACGTGCATTAAATGCTGGGGATTTTTTTACCCATTCTGGGAAACTAAATAGAATTCGAAG TCGCGGGATTGTTATTTGAACTTTTAATTAGTAAATGTTTGGTTTGTGATGCCGGTTTGAAAATCATTGGCGGCAACCGT CATATATGTAGTATTTTCCCAATATGTGTACATTTATTGGTGACTATTACTTCAAGTATTAACTGCCGCCGCTTTTTGTT TGTCGCTATTTGTCGGCGTCTTTGAAGAGTCTACAGTTTCTATCTTAATATACATTCACTATCTTTTTGTCGACGTCTCG 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GGTCTATACATACCATTGGACCTTCTGGTTGCAGAGTTCATTGTTGAACCTCTTTGCTGGTTAGGCTGTTTATGTAGCTC AAACACCACTTCATATGTATCACTTTTGGAAGGTGGGTAACTTATGTATGCTTCCACACTGTTACTGTCGGTGGAGCGCC GCCCTTTGTTTAAAATCCAATTCTTCCCAACAATCTGTTGAGCATAATCCGCAATCTCCGGTGAAGATTTTATTAAGTGC AGCTTCCGATTTTTCCTTTCAATCCACATTCAAGAAAATTCCTCTAGAGTAGTCTGGCCTGGCTCTATGCTGTGTACCCA CGTAGTATCCCTGTTGATTTCTGGTTGTCCTGTTTAGTGTTTCCTGATTTGCAAATTTATTAACTATTGTACATTAGATC GGTCCTGTGTAATGTTTATCTGTCCTTCCCTTTTTCTTTTGCTGGGTGTACAGTATACTTTTCTATTTTTTATGGTAGAA TGAGAAAAAAAAGACCTCATTTATGTCATGGTGTTTTTTGCAGATGAAGCAGGTCATTCATGGGGGTTTGTGGAATATTG GCACAGATGTTCGTTGTTTCTGCACAGGTCCTGTTAAAATATTAACCAAAGTAATATTGACACAGCATCATTGCTTTTTG GTTCGTGTTTTGCAAATCTTGTATATTATGACTGTTCTTAGAAGGTTGCCGCCATTTTGTTTTTGGAAAGAGGCGAATAT TAGAGGCATTTGTACAGGGTAGTCTCTTCTTTCCCTTTGCCCCATCATTAACGTCTCATGTGCAGAGGATTACTTTTTGT TCTACTAGATTAGTGAATGTATTATTACCTTCTAGATAATCGAGATAGAAATCATTTATATAGGCAAATGCCAATTCAAT GTTTTGTGAATACAAGTTTTCTGGTGTTTAAACAAGCCAATCATGCCATTTACTGTCTTCGTACTAGTTACTACCTGCAC 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0083100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTAGGCCGTGGAGTGCATGGATATAACCCGGGATCTGCTCCCCTAGCAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGAGT TGTTGATGGTGGAGTTGGTATTGGTTCGAAGATCTCTCCACACCGAGGAGCAGTTGAGAAGGCTCAAGCAAATCTCAGAG AGGAGTATGATGGTCGTGAAGAAAGTAGCCGAGAGCTAGAATTTCTTGAAAAAGGTGGGAATCCTCTGGAGTTGAAGGCT GGGAATGCTGCTTCAGTTAGTGTTCAGTCCACTTCACTCACTGATCAGCATCATGAGCAGTTTGTGACCAGTGAAGCAAA AGGTAGTTTTGCATTGACTGCCTCCCCGCACGGTGACTCTGTGGACAGTAGTGCTAGACCAGGGCCTCCTTTTGCTAGTG AACCTATAACTGCTGATAATCTCCTACTTTTTGATGCTGAGAATGAGTTGCCTGAAAGTGAAAAGAGGTGCTTGCGTTCA AATAGAAGGAATTATATTGCTCCATCAGAACAGTCTTCCCGAATTGATGGGAGTCAAAATGCTAAGGAGACTGAAGATTC TGCTATTTTCCGGCCATATGAACGAAGGAACAGATCCCGAACAAATCATGGTCCTCGGGGGGCTTCAAGGGAAGGGAAGG GGTTAATGTCTGATACATTTATCCAAAAGGACCACAAAGTTCCTTCTTTTACTAAGCCAAATTCTACTAGTTTTAATGGT GATACTGTTACTAAGAATCTGACAGCTAATAATTCACTGAATAATGAATTAGTTGGGGTCCAAGATCATCAATCTACTAG TGGCAGTGTTAGTGTTCCTAAAGATAAATTGGATATTACCCTGAATGGAAATTTAAGAGAAAATCATGGCACTCTACCTC CCCAAGCTGATAATGTACAAAATCCAGTTCTCATGGCTTCTGGAGAAGCTAATGTGGTTGAAGTAAGGGAGCCAGTGGCT GCTGTCGATTATGAGCCTGCACCACATGTAGCTACTACAAAACCTGAAAATGGAAGTTATTATGGTCAGCCAAATGGATT TGGTAATGTAGAAGTAGACAGGAAAAGTGTACCAAATGGAAGCCAAAATAGCATTGCTGTATTGGGCAAGAATATTGATC TGGAGTTCTGTACTCAAACCAGTTTAGATAGAGATGTAAATAAGGATAGTGATATATGTACTAATAGAAAGAATGTTGAT GACACTGGAAATACCCTGGAACAAACTCTTGCATTTGACAATAAACTGAACTTTGCTGGTCGTGAAGTTATGAAAGCTAG GAATAAAATCAAAAGTGAAAATGGCGCTTCAGTTAGCAATGAACACGATGCTGGTTATTCAAATCATTCTGGTAATGGTA ATATTGTCAAAGCTGCGGAAGATGTCTATACTAACTCTGTGAAGGAAACCAACTGTGAAAGACACCAGATTCCTGTGGAT GTGTCAATATCAGAACCTCCTCAGATTGCACCACCAACTGAAAAGGTTTCAACTGCCACCTCTGACTATCAATCATGTTC TACATACCATATGAAGTTAGCCGAGAAGGCTCGTGAAGATTCTATTTTGGAAGAGGCTAAAATCATAGAGGCCAAGCGGA AGAAAATTGCAGAGTTATCTATTCGCTCATTACCCGCAAGGAACTACATAAAGTCACATTGGGGTTTTGTTCTTGAAGAA ATGACGTGGCTGGCGAATGATTTTGCGCAGGAGCGTCTTTGGAAGATAACTGCTGCAGCACAATTGGGTCATCGAGTGGC TTTTACTTGTCGGCAAAGAGTTGAAAAACTAAACAAACATCTGGGGGTAAAAACATTGTCTCACAGAATTTCAAAGGCTG TCATGCAGTTTTGGCATTCAGCTGAGCTACTTCTAGACAATGATGATCCAGCTATTAACTCTATTGTTGGTTGCGTTGAA TCTGCGAAAGTTGATGCAAATGAAGCTTCTAGGGACCAGAAAGGAAATTCCTACGTGGATACAAGCAACTTTTTGGAAGG ACTAAATCCCATAAAAAACTCAGCACTTAAAGTGCACGCATATGCTATAAGATTATTAAAGGCTAGTAGGTCTCAGGGAA TTTCCTCGCAAGCAGAAGCACCAACAACACCTGAAATGATATTTGACTCAGGCATTGTGGACATATCATGGAAGGAGCAT CTTACTGAAGAAAGCCTTTTCTATGAAGTCCCCCCTACTGCGATGGAAAAATACAGAATATCTGTTGAATCTCATTTCTT TCAGTTTGAGAAAAATGGGAGTGCCATTCAAGGTGAAACATCTGTATATGATACTGCGGCAGAGTTTGGGTCTGAAGAGA TTGCATATGATGAGGAAGAAGGAGAATCCAACACTTATTACTTGCCTAGTGTCTACAAGGGTAGCATATCATCAAAATCT GTGCACAAGAAACACAAAAACTGGAAGTCTTACACTCCTGGGTCTGGTGATGCTGGGACTGATTTTCCTTATGTACACTA TTCAACTGGAACTAAACCGTCCATGCTATTTGGAAAAAGACCTGCTAGTTCAAATGTTGGGTCAGTACCAACTAAGCGGA TGCGTACAGCTACTAGGCATAGAGTTGTAAGTCCTTTTACAGTCACCACTGGGACAATACAGGCTCAAGATAGGGCAGAT GCTTCAAGTGGAGATAACAATTCCTTCCATGATGACCACATTGACCAGAGTACTTTACATGTTGGACCCCTGATCCAGAA AAGTATGGAGGTGGAGTCAGTTACGGACTTTGAAAAACAATTAGCTTATGACTGTGCTGAAACATCTATTAAAACAAAGA AAAAGAAGAAGGCAATGACTCTGGGTTCTGCCTATGAACAGGGATGGAAGTTGGATTCTAGTGTTCAAAATGAACAGAGG GATCATTCGAGTAAGAGACTGAATAGTCATCACTTTGAATCTAATGGGAATTGTGGTTTGTATGGGCAACATAATGTGAA GAAGCCAAAGATAACGAAGCAATCACTTGATCATGCTTTAGACAATAATTCTCCGATGACTAATTCTGTTCCTTCCCCAG CTGCTTCACAAATGAGTAACATGTCCAATCCTAATAAATTTATTAAAATTATCAGTGGGCGAGAAAGGGGCCGGAAAGCA AAAGCACTGAAGATTTCTGCTGGACAGCATGGTTCTGGAAGTCCTTGGTCACTATTTGAAGATCAGGCTCTTGTTGTCCT GGTGCATGATATGGGTCCAAACTGGGAGCTTGTAAGTGATGCTATCAACAGTACTCTCCAAATCAAGTGTATCTTTCGGA AACCAAATGAGTGCAAGGAGCGTCATAAGATTTTAATGGATGGAAGTGCTGGGGATGGTGCAGATAGCGCTGAAGATTCT GGGTCTTCACAGTCTTATCCATCTACATTGCCTGGAATTCCTAAGGGTAGTGCCAGGCAGTTGTTTCAACGTTTGCAAGG ACCAATGGAGGAAGATACTCTGAAGTCTCATTTTGAGAAAATTATAAAGATTGGGCAGAAACAACATTACCTTAGGAATC AGATTGATAACCAGGATTTAAAACATTTAGTACCTATCCATAATTCACATGTCATTGCTCTTTCCCAAGTCTGCCCCAAC AACCTGAGTGGAGGTATTTTAACGCCGCTTGATTTTTGTGAAACAAACACATCGAACCCAGATGTCCCAGCCCTTGGGTA TCATGGTCTTCATACTGGCAGTTTGGCATCATCAAATCAAGGTTCTGTACCATCAGTGCTTCCTACATCTGGGGTGAATA CCTCACTGCCAGGGTCTTCTGGTATGGTTCTTAATAATAACTTCTCACCATCTTCTGGTCCAACTGCAGCCTCTGTCAGA TATGGGGTTCCAAGAAGTTCACCTTTATCGGTGGATGAACAGCAAAAATTACAACAATACAATCAAATGTTATCTGGGAG AAACATTCAGCAATCTAGCATGTCAGTCCCGGGAACTCTTCCTGGAAATGATCATGGTGTTTGCATGATGCCTGGTGGAG GTGCTATGGGCTTAATGGGCGGAATTAACAGAAGCATGGCAATGCCCAGGCCAGGGTTTCAAGGAATGTCATCACCATCT ATGCTTAATTCTGGAAGTATGGTTTCCTCTAGTATAAACATGCGCTCTGGAGTTGGTTCTGGACAAGGCAACTCAATGTC GAGACCTCATGACCCTCTTATGAGGCCTGGCCATAACCCTGAACATCAAAGGCAAATGGTAGCTCCACAGCATCAGACGC AAGTCACCCAGGGGAACAATAAAAGCAATCCTGCTCTCTGCGGGATTAGTTCTGCCTTCAATAATCAGACAACTCCACCA CCTGTTCAGCCTTACCCAGGACATGCCCAGCAGCAGCCCCACCGCAGCAATCCTCGTCCTCCTTTTCAAGGTCCAAATCA TGCGACAAATTCACAGCAGCAAGCATATGCAGTCCGGTTGGCAAAGGAAAGGCAACTGCTGCAACAGCAGAAATATTTGC AGCAGCAGCAGCAGCAGATTGCTGCATCAAATGCATTGATGCCTCATGTCCAGGCTCAATCTCAACTTCCCATATCATCA TCACCTTTGCAAAATAGTTCCCAGGTTCAACCTCCAAATTCATCTCAGCATGAACCTCTTTCACCTGCAACTGCATCATC AGCCTTGGGTCCCATGTCATCTCAGCATCAACAGCACAAGCTTCACCAGCTACAACATGGGTTAAGCAGGAATCCCGTTG CTAATGGGTTGACTAATCAAGCCGGAAAGCAACGGCAACGACAGCCATCACAGCAGCAGCAGCAATATCAACAGTCTGGT AGGCAACATCCTAATCAGCGGCATAATGTACCACCTCAACAGCAGGCTAAACTTCTAAAGGGTATAGGAAGAGGAAACAT GTTGGTTCGTCAGAACCTCTCTGCCGATCCTTCTCATCTAAATGGGCTCTCGTTGCCTGCAGGAGGCCAAACTGGTGAAA AGGGGGACCAAATCATGCACATGATACAAGGTCAAAGTTTTTATCCTGGATCTGTTTTGAACCCAAGTCAACCATCACAG CCATCGGGTCATGCCCATTCTGTAAACCATTTGCAGTTGCAGCAGAAACTATGTTCTGGGTCCCCAACCACTTCACCAAA GCTACTTCAGATTTCTTCTGATGCTAGTGCTCAAGTACAGGTTTCACCAGTTTCATCAGGTCAAATGTTATCACCTACCC AGCCAGCTGTGATTGTTTCAAACCACCACCAGTTGCAGCTACAGTCTAACAAAATTAATCAAACTCAATCAAATATTCAG AGAATGTTGCCACAAAACTGCCAGGTGCATTCTGAGTCATCAAGTAAGTCTCAATCTGATCCAACTCAAGTTGATCAAAC GCCTGAAAACAGTGCTTCTAAGATTAGTACAAGTTCTACAATGAGTCAGGGTTATATGGATTCATCGAGTCTGGTACCAG CTGTTACTACTGTTTCTTCTCAGTGGAAAACATCAGAAACACCATATGATTCCAATATTGACAATCAAGCCCCTAAAGTG AGCTCCTTGGGTAGTGCACCTGTTGGCAATTCTACTGGAAGTGAACAGCCCACAGTTAGTCAAGGGATTGACCCAAGATT AGTTTGCTCGACATCTAATGCACATAATAATGGGGCACAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACAGCCTCTTCAACAGT CATCGCCCCAAGAGCAGCATAAGCAGCAGCAGCAACAGGAGCATGAACTACATTCTCCCACATCTCTTGCTTCACAACAT CAACCTCAGCAACACATGAAGCATCCACAATCAGGGCAGAGCAGTTTGTTTATTCACTCACCTAATTCTAAAGAGGAATG A
Protein sequence (LotjaGi3g1v0083100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLGRGVHGYNPGSAPLANAEVDSMGGVVDGGVGIGSKISPHRGAVEKAQANLREEYDGREESSRELEFLEKGGNPLELKA GNAASVSVQSTSLTDQHHEQFVTSEAKGSFALTASPHGDSVDSSARPGPPFASEPITADNLLLFDAENELPESEKRCLRS NRRNYIAPSEQSSRIDGSQNAKETEDSAIFRPYERRNRSRTNHGPRGASREGKGLMSDTFIQKDHKVPSFTKPNSTSFNG DTVTKNLTANNSLNNELVGVQDHQSTSGSVSVPKDKLDITLNGNLRENHGTLPPQADNVQNPVLMASGEANVVEVREPVA AVDYEPAPHVATTKPENGSYYGQPNGFGNVEVDRKSVPNGSQNSIAVLGKNIDLEFCTQTSLDRDVNKDSDICTNRKNVD DTGNTLEQTLAFDNKLNFAGREVMKARNKIKSENGASVSNEHDAGYSNHSGNGNIVKAAEDVYTNSVKETNCERHQIPVD VSISEPPQIAPPTEKVSTATSDYQSCSTYHMKLAEKAREDSILEEAKIIEAKRKKIAELSIRSLPARNYIKSHWGFVLEE MTWLANDFAQERLWKITAAAQLGHRVAFTCRQRVEKLNKHLGVKTLSHRISKAVMQFWHSAELLLDNDDPAINSIVGCVE SAKVDANEASRDQKGNSYVDTSNFLEGLNPIKNSALKVHAYAIRLLKASRSQGISSQAEAPTTPEMIFDSGIVDISWKEH LTEESLFYEVPPTAMEKYRISVESHFFQFEKNGSAIQGETSVYDTAAEFGSEEIAYDEEEGESNTYYLPSVYKGSISSKS VHKKHKNWKSYTPGSGDAGTDFPYVHYSTGTKPSMLFGKRPASSNVGSVPTKRMRTATRHRVVSPFTVTTGTIQAQDRAD ASSGDNNSFHDDHIDQSTLHVGPLIQKSMEVESVTDFEKQLAYDCAETSIKTKKKKKAMTLGSAYEQGWKLDSSVQNEQR DHSSKRLNSHHFESNGNCGLYGQHNVKKPKITKQSLDHALDNNSPMTNSVPSPAASQMSNMSNPNKFIKIISGRERGRKA KALKISAGQHGSGSPWSLFEDQALVVLVHDMGPNWELVSDAINSTLQIKCIFRKPNECKERHKILMDGSAGDGADSAEDS GSSQSYPSTLPGIPKGSARQLFQRLQGPMEEDTLKSHFEKIIKIGQKQHYLRNQIDNQDLKHLVPIHNSHVIALSQVCPN NLSGGILTPLDFCETNTSNPDVPALGYHGLHTGSLASSNQGSVPSVLPTSGVNTSLPGSSGMVLNNNFSPSSGPTAASVR YGVPRSSPLSVDEQQKLQQYNQMLSGRNIQQSSMSVPGTLPGNDHGVCMMPGGGAMGLMGGINRSMAMPRPGFQGMSSPS MLNSGSMVSSSINMRSGVGSGQGNSMSRPHDPLMRPGHNPEHQRQMVAPQHQTQVTQGNNKSNPALCGISSAFNNQTTPP PVQPYPGHAQQQPHRSNPRPPFQGPNHATNSQQQAYAVRLAKERQLLQQQKYLQQQQQQIAASNALMPHVQAQSQLPISS SPLQNSSQVQPPNSSQHEPLSPATASSALGPMSSQHQQHKLHQLQHGLSRNPVANGLTNQAGKQRQRQPSQQQQQYQQSG RQHPNQRHNVPPQQQAKLLKGIGRGNMLVRQNLSADPSHLNGLSLPAGGQTGEKGDQIMHMIQGQSFYPGSVLNPSQPSQ PSGHAHSVNHLQLQQKLCSGSPTTSPKLLQISSDASAQVQVSPVSSGQMLSPTQPAVIVSNHHQLQLQSNKINQTQSNIQ RMLPQNCQVHSESSSKSQSDPTQVDQTPENSASKISTSSTMSQGYMDSSSLVPAVTTVSSQWKTSETPYDSNIDNQAPKV SSLGSAPVGNSTGSEQPTVSQGIDPRLVCSTSNAHNNGAQRQQQQQQPQPLQQSSPQEQHKQQQQQEHELHSPTSLASQH QPQQHMKHPQSGQSSLFIHSPNSKEE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 7 | 1931 | 1925 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 7 | 1931 | 1925 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 112 | 134 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 161 | 216 | 56 | - | – | |
| MobiDBLite | 164 | 185 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 187 | 207 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 433 | 452 | 20 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 541 | 615 | 75 | 11.393 | ||
| SMART | 542 | 608 | 67 | 3.6E-10 | ||
| Pfam | 551 | 587 | 37 | 3.4E-6 | ||
| MobiDBLite | 836 | 856 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 959 | 981 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 1000 | 1021 | 22 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 1054 | 1106 | 53 | 6.841 | ||
| CDD | 1055 | 1101 | 47 | 0.00145107 | ||
| Pfam | 1056 | 1104 | 49 | 1.1E-5 | – | |
| MobiDBLite | 1107 | 1134 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 1116 | 1131 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 1373 | 1387 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1373 | 1472 | 100 | - | – | |
| MobiDBLite | 1405 | 1438 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 1449 | 1472 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 1511 | 1613 | 103 | - | – | |
| MobiDBLite | 1667 | 1688 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 1766 | 1806 | 41 | - | – | |
| MobiDBLite | 1825 | 1946 | 122 | - | – | |
| MobiDBLite | 1825 | 1901 | 77 | - | – | |
| MobiDBLite | 1908 | 1940 | 33 | - | – | |
| Coils | 1944 | 1946 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0083100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…