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LotjaGi3g1v0083100.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0083100
Transcript ID LotjaGi3g1v0083100.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Helicase/SANT-associated, DNA-binding protein, putative; TAIR: AT3G24880.2 Helicase/SANT-associated, DNA binding protein; Swiss-Prot: sp|F4J7T3|EAF1A_ARATH Chromatin modification-related protein EAF1 A; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0FX49|A0A0R0FX49_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0083100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:9236493..9256605) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TCCAAAAATGGTAAATTCTCAAAGCGCCCTTATACGTCATCGTCTTCATGTCCAGCCCACGACTCGCATAGTTCCCTCTC CACACCCACAGGCACGAAGAACACAACCAACGTGTAGATACACAGAAAGGAGCAAAATCAAAATCACCATTCCGATAACC CCTAATTGGTGACCTTGAATCCCTTAACACCACTCACAATTGCTTCCATGGCGTACATTTGCTGCTACATGTTGTGTTCC TGTGCCAATTCGTGACAAAGTTACCATTCCCCGAAACCCTAGGAGAGAGAAAGTTCGTGTTGATACGGTCCTCTTGGGGT GTCAGATTGTGCCCTAGCTTCCAATTCTGTGATCCTTTCGTGAATTGAGGTGGTTTTCTTGTCTTAATTGTTGTGTTTTT GGCATTTTCGTTGTTCTCATGAAACCCTAGAATTGTTCAAATTGGGAATTCGAGGAAATGGGTGCTGTTAGGGCTTCAAT TTTGTTGGGGGAATTTTTCTGGGGTGTTGTCTTGTTGCGACTGTGTTGTGCATTGTGTTGAAATGGTATTCTGGTTGATG CTTGGTATTAACGTGCATTAAATGCTGGGGATTTTTTTACCCATTCTGGGAAACTAAATAGAATTCGAAGTCGCGGGATT GTTATTTGAACTTTTAATTAGTAAATGTTTGGTTTGTGATGCCGGTTTGAAAATCATTGGCGGCAACCGTCATATATGTA GTATTTTCCCAATATGTGTACATTTATTGGTGACTATTACTTCAAGTATTAACTGCCGCCGCTTTTTGTTTGTCGCTATT TGTCGGCGTCTTTGAAGAGTCTACAGTTTCTATCTTAATATACATTCACTATCTTTTTGTCGACGTCTCGTCTACAGTCT ATAGGTTTGAATAAATTTCGTGCTTATCTCTAAATAAATGATATGATTTGTTGACTTATGATTATTTTGATCTATGATGT 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AGTTTGCTCGACATCTAATGCACATAATAATGGGGCACAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACAGCCTCTTCAACAGT CATCGCCCCAAGAGCAGCATAAGCAGCAGCAGCAACAGGAGCATGAACTACATTCTCCCACATCTCTTGCTTCACAACAT CAACCTCAGCAACACATGAAGCATCCACAATCAGGGCAGAGCAGTTTGTTTATTCACTCACCTAATTCTAAAGAGGAATG ATGCATTCTATTGGATTGAGCAGCAGCCAAGTGTACTTGGTTTTGTCAAGATTGGAGTCTTTATGCCCTTACCGCCGCAG TGTACAGGTATTCTTATTTTTACAAATATAATGATCATTGTGTTACATTTTTGGTTTGGTTGTTTCTTATTTAGGAATGA AGCAGAACCATGCATTTTCTGATTCTCTGAACTTGGGTCCATGTTAAGGAAAGCTTTTTTCCTCCATGGTCACAATGGCT GCATATTGTTCTTTAAATTGTATTGCTCTGCTCTACTCGGAATCTGTTGAATGCTGTTGTGACATGTTGTAATATTAGAA TTAATTAGTATTAGAATATTCTTTTTTATTATTAGGAGATTGCGTACATATTTAGTTTACTTCTATATATTACTCATTGT ATTCTATTCAAGCAATAATATTATAATTTCTCCTACTTTCAAGTAATGGTAAGGAGAACAAAACCAAGAGGAATGCCAGG CATCATTTCAGAACATGACCTAGAATCCACTGCATATTCACCCTAGATATAACATAGACGCAGGAAAAATCTATTCAATA ATGTTGAGCAAAAATTATTCTCAGAACCTCTGGAATATTGTCTGTTTGGAGGATTGCTTATAGTTGAGAGTAAATATGAT CGTTGAAAGGAAATCTGAAATTCTTATTTCTGAATATAATCTGTAGCTGAGGTATATACACTTTGTATACCAAGGCCCAT AATTAGTTTCCTAGATTAGACAGGGTTGTCAATAACGCGCGATAGCGGCGGAGCGTGGCGGCACGGAGGTTGGGCGCGAC GAAGGAGGCTGTAGCGGCGCGGAAATCACGTCGTGGTGGTAGCGGGGGCGATCGCGGCCGAAATCACGCCTGGTTGAGCG CGATGGCGGCGCGAGGAAGAAAGTTCAGACAGAAAACCCTAAATTGCCCCCGGTTTTAAACATTAAGTTTTAATTTTTAA GGGCATTTTGGGGCTTTCCTGTCTTTAATAAAATGCTGTGTTTAATCTTATGCTTTGAATAACCCTAGTATAAGCTGCGA GCGAAAACCCCAAAATGCCCCCAGATCTAAACATTCCTTCGAAATTTGAAGGGCATTTTGGGGTTTTCGCACCATTAGCG AAGACGCTGCGTTTTATGTTTCTTCAACCTCCAGCCTCTGCGATTTCAAGCATCCTTCTTCCTCCTTCCTCCTCCTCCTT ATTCCTCCTCCTCCTTCTTCAGCGTAGCGGCCATAGCGCTACACGCTATAGCGCTATAGCGTTTTTTGGCCTCGCCGCTA CGCGACGCGATCCGCCATTAACAACACTGAGATTAGAGCTGAATTCCATGAGTATATCTGTCATAATTATCTATCCTAAT TGATTTACTAATCTGTATTATAGAAAAATAAAATACAAGCATGAAAAAAGGAATAATGAAACACTAACAGGTCAACACTC CACCTCACGCTGTTTGAACGGATATCTAGCATTTCCAGCTTGCAAGTATACTCTTGAACCTGTGGCACGTTTTTTAGTCA ACTCATCTGGCAATAGGTTTCCAAACAGTAACTGAATGGCGGACTGGTTAGGGTTTTCTTCCTTCCTTGGGGTCTATACA TACCATTGGACCTTCTGGTTGCAGAGTTCATTGTTGAACCTCTTTGCTGGTTAGGCTGTTTATGTAGCTCAAACACCACT TCATATGTATCACTTTTGGAAGGTGGGTAACTTATGTATGCTTCCACACTGTTACTGTCGGTGGAGCGCCGCCCTTTGTT TAAAATCCAATTCTTCCCAACAATCTGTTGAGCATAATCCGCAATCTCCGGTGAAGATTTTATTAAGTGCAGCTTCCGAT TTTTCCTTTCAATCCACATTCAAGAAAATTCCTCTAGAGTAGTCTGGCCTGGCTCTATGCTGTGTACCCACGTAGTATCC CTGTTGATTTCTGGTTGTCCTGTTTAGTGTTTCCTGATTTGCAAATTTATTAACTATTGTACATTAGATCGGTCCTGTGT AATGTTTATCTGTCCTTCCCTTTTTCTTTTGCTGGGTGTACAGTATACTTTTCTATTTTTTATGGTAGAATGAGAAAAAA AAGACCTCATTTATGTCATGGTGTTTTTTGCAGATGAAGCAGGTCATTCATGGGGGTTTGTGGAATATTGGCACAGATGT TCGTTGTTTCTGCACAGGTCCTGTTAAAATATTAACCAAAGTAATATTGACACAGCATCATTGCTTTTTGGTTCGTGTTT TGCAAATCTTGTATATTATGACTGTTCTTAGAAGGTTGCCGCCATTTTGTTTTTGGAAAGAGGCGAATATTAGAGGCATT TGTACAGGGTAGTCTCTTCTTTCCCTTTGCCCCATCATTAACGTCTCATGTGCAGAGGATTACTTTTTGTTCTACTAGAT TAGTGAATGTATTATTACCTTCTAGATAATCGAGATAGAAATCATTTATATAGGCAAATGCCAATTCAATGTTTTGTGAA TACAAGTTTTCTGGTGTTTAAACAAGCCAATCATGCCATTTACTGTCTTCGTACTAGTTACTACCTGCACAAGCGGAATT TTTGAATATTCAACCTTTTCAAGGTTCTAAATG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0083100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTAGGCCGTGGAGTGCATGGATATAACCCGGGATCTGCTCCCCTAGCAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGAGT TGTTGATGGTGGAGTTGGTATTGGTTCGAAGATCTCTCCACACCGAGGAGCAGTTGAGAAGGCTCAAGCAAATCTCAGAG AGGAGTATGATGGTCGTGAAGAAAGTAGCCGAGAGCTAGAATTTCTTGAAAAAGGTGGGAATCCTCTGGAGTTGAAGGCT GGGAATGCTGCTTCAGTTAGTGTTCAGTCCACTTCACTCACTGATCAGCATCATGAGCAGTTTGTGACCAGTGAAGCAAA AGGTAGTTTTGCATTGACTGCCTCCCCGCACGGTGACTCTGTGGACAGTAGTGCTAGACCAGGGCCTCCTTTTGCTAGTG AACCTATAACTGCTGATAATCTCCTACTTTTTGATGCTGAGAATGAGTTGCCTGAAAGTGAAAAGAGGTGCTTGCGTTCA AATAGAAGGAATTATATTGCTCCATCAGAACAGTCTTCCCGAATTGATGGGAGTCAAAATGCTAAGGAGACTGAAGATTC TGCTATTTTCCGGCCATATGAACGAAGGAACAGATCCCGAACAAATCATGGTCCTCGGGGGGCTTCAAGGGAAGGGAAGG GGTTAATGTCTGATACATTTATCCAAAAGGACCACAAAGTTCCTTCTTTTACTAAGCCAAATTCTACTAGTTTTAATGGT GATACTGTTACTAAGAATCTGACAGCTAATAATTCACTGAATAATGAATTAGTTGGGGTCCAAGATCATCAATCTACTAG TGGCAGTGTTAGTGTTCCTAAAGATAAATTGGATATTACCCTGAATGGAAATTTAAGAGAAAATCATGGCACTCTACCTC CCCAAGCTGATAATGTACAAAATCCAGTTCTCATGGCTTCTGGAGAAGCTAATGTGGTTGAAGTAAGGGAGCCAGTGGCT GCTGTCGATTATGAGCCTGCACCACATGTAGCTACTACAAAACCTGAAAATGGAAGTTATTATGGTCAGCCAAATGGATT TGGTAATGTAGAAGTAGACAGGAAAAGTGTACCAAATGGAAGCCAAAATAGCATTGCTGTATTGGGCAAGAATATTGATC TGGAGTTCTGTACTCAAACCAGTTTAGATAGAGATGTAAATAAGGATAGTGATATATGTACTAATAGAAAGAATGTTGAT GACACTGGAAATACCCTGGAACAAACTCTTGCATTTGACAATAAACTGAACTTTGCTGGTCGTGAAGTTATGAAAGCTAG GAATAAAATCAAAAGTGAAAATGGCGCTTCAGTTAGCAATGAACACGATGCTGGTTATTCAAATCATTCTGGTAATGGTA ATATTGTCAAAGCTGCGGAAGATGTCTATACTAACTCTGTGAAGGAAACCAACTGTGAAAGACACCAGATTCCTGTGGAT GTGTCAATATCAGAACCTCCTCAGATTGCACCACCAACTGAAAAGGTTTCAACTGCCACCTCTGACTATCAATCATGTTC TACATACCATATGAAGTTAGCCGAGAAGGCTCGTGAAGATTCTATTTTGGAAGAGGCTAAAATCATAGAGGCCAAGCGGA AGAAAATTGCAGAGTTATCTATTCGCTCATTACCCGCAAGGAACTACATAAAGTCACATTGGGGTTTTGTTCTTGAAGAA ATGACGTGGCTGGCGAATGATTTTGCGCAGGAGCGTCTTTGGAAGATAACTGCTGCAGCACAATTGGGTCATCGAGTGGC TTTTACTTGTCGGCAAAGAGTTGAAAAACTAAACAAACATCTGGGGGTAAAAACATTGTCTCACAGAATTTCAAAGGCTG TCATGCAGTTTTGGCATTCAGCTGAGCTACTTCTAGACAATGATGATCCAGCTATTAACTCTATTGTTGGTTGCGTTGAA TCTGCGAAAGTTGATGCAAATGAAGCTTCTAGGGACCAGAAAGGAAATTCCTACGTGGATACAAGCAACTTTTTGGAAGG ACTAAATCCCATAAAAAACTCAGCACTTAAAGTGCACGCATATGCTATAAGATTATTAAAGGCTAGTAGGTCTCAGGGAA TTTCCTCGCAAGCAGAAGCACCAACAACACCTGAAATGATATTTGACTCAGGCATTGTGGACATATCATGGAAGGAGCAT CTTACTGAAGAAAGCCTTTTCTATGAAGTCCCCCCTACTGCGATGGAAAAATACAGAATATCTGTTGAATCTCATTTCTT TCAGTTTGAGAAAAATGGGAGTGCCATTCAAGGTGAAACATCTGTATATGATACTGCGGCAGAGTTTGGGTCTGAAGAGA TTGCATATGATGAGGAAGAAGGAGAATCCAACACTTATTACTTGCCTAGTGTCTACAAGGGTAGCATATCATCAAAATCT GTGCACAAGAAACACAAAAACTGGAAGTCTTACACTCCTGGGTCTGGTGATGCTGGGACTGATTTTCCTTATGTACACTA TTCAACTGGAACTAAACCGTCCATGCTATTTGGAAAAAGACCTGCTAGTTCAAATGTTGGGTCAGTACCAACTAAGCGGA TGCGTACAGCTACTAGGCATAGAGTTGTAAGTCCTTTTACAGTCACCACTGGGACAATACAGGCTCAAGATAGGGCAGAT GCTTCAAGTGGAGATAACAATTCCTTCCATGATGACCACATTGACCAGAGTACTTTACATGTTGGACCCCTGATCCAGAA AAGTATGGAGGTGGAGTCAGTTACGGACTTTGAAAAACAATTAGCTTATGACTGTGCTGAAACATCTATTAAAACAAAGA AAAAGAAGAAGGCAATGACTCTGGGTTCTGCCTATGAACAGGGATGGAAGTTGGATTCTAGTGTTCAAAATGAACAGAGG GATCATTCGAGTAAGAGACTGAATAGTCATCACTTTGAATCTAATGGGAATTGTGGTTTGTATGGGCAACATAATGTGAA GAAGCCAAAGATAACGAAGCAATCACTTGATCATGCTTTAGACAATAATTCTCCGATGACTAATTCTGTTCCTTCCCCAG CTGCTTCACAAATGAGTAACATGTCCAATCCTAATAAATTTATTAAAATTATCAGTGGGCGAGAAAGGGGCCGGAAAGCA AAAGCACTGAAGATTTCTGCTGGACAGCATGGTTCTGGAAGTCCTTGGTCACTATTTGAAGATCAGGCTCTTGTTGTCCT GGTGCATGATATGGGTCCAAACTGGGAGCTTGTAAGTGATGCTATCAACAGTACTCTCCAAATCAAGTGTATCTTTCGGA AACCAAATGAGTGCAAGGAGCGTCATAAGATTTTAATGGATGGAAGTGCTGGGGATGGTGCAGATAGCGCTGAAGATTCT GGGTCTTCACAGTCTTATCCATCTACATTGCCTGGAATTCCTAAGGGTAGTGCCAGGCAGTTGTTTCAACGTTTGCAAGG ACCAATGGAGGAAGATACTCTGAAGTCTCATTTTGAGAAAATTATAAAGATTGGGCAGAAACAACATTACCTTAGGAATC AGATTGATAACCAGGATTTAAAACATTTAGTACCTATCCATAATTCACATGTCATTGCTCTTTCCCAAGTCTGCCCCAAC AACCTGAGTGGAGGTATTTTAACGCCGCTTGATTTTTGTGAAACAAACACATCGAACCCAGATGTCCCAGCCCTTGGGTA TCATGGTCTTCATACTGGCAGTTTGGCATCATCAAATCAAGGTTCTGTACCATCAGTGCTTCCTACATCTGGGGTGAATA CCTCACTGCCAGGGTCTTCTGGTATGGTTCTTAATAATAACTTCTCACCATCTTCTGGTCCAACTGCAGCCTCTGTCAGA TATGGGGTTCCAAGAAGTTCACCTTTATCGGTGGATGAACAGCAAAAATTACAACAATACAATCAAATGTTATCTGGGAG AAACATTCAGCAATCTAGCATGTCAGTCCCGGGAACTCTTCCTGGAAATGATCATGGTGTTTGCATGATGCCTGGTGGAG GTGCTATGGGCTTAATGGGCGGAATTAACAGAAGCATGGCAATGCCCAGGCCAGGGTTTCAAGGAATGTCATCACCATCT ATGCTTAATTCTGGAAGTATGGTTTCCTCTAGTATAAACATGCGCTCTGGAGTTGGTTCTGGACAAGGCAACTCAATGTC GAGACCTCATGACCCTCTTATGAGGCCTGGCCATAACCCTGAACATCAAAGGCAAATGGTAGCTCCACAGCATCAGACGC AAGTCACCCAGGGGAACAATAAAAGCAATCCTGCTCTCTGCGGGATTAGTTCTGCCTTCAATAATCAGACAACTCCACCA CCTGTTCAGCCTTACCCAGGACATGCCCAGCAGCAGCCCCACCGCAGCAATCCTCGTCCTCCTTTTCAAGGTCCAAATCA TGCGACAAATTCACAGCAGCAAGCATATGCAGTCCGGTTGGCAAAGGAAAGGCAACTGCTGCAACAGCAGAAATATTTGC AGCAGCAGCAGCAGCAGATTGCTGCATCAAATGCATTGATGCCTCATGTCCAGGCTCAATCTCAACTTCCCATATCATCA TCACCTTTGCAAAATAGTTCCCAGGTTCAACCTCCAAATTCATCTCAGCATGAACCTCTTTCACCTGCAACTGCATCATC AGCCTTGGGTCCCATGTCATCTCAGCATCAACAGCACAAGCTTCACCAGCTACAACATGGGTTAAGCAGGAATCCCGTTG CTAATGGGTTGACTAATCAAGCCGGAAAGCAACGGCAACGACAGCCATCACAGCAGCAGCAGCAATATCAACAGTCTGGT AGGCAACATCCTAATCAGCGGCATAATGTACCACCTCAACAGCAGGCTAAACTTCTAAAGGGTATAGGAAGAGGAAACAT GTTGGTTCGTCAGAACCTCTCTGCCGATCCTTCTCATCTAAATGGGCTCTCGTTGCCTGCAGGAGGCCAAACTGGTGAAA AGGGGGACCAAATCATGCACATGATACAAGGTCAAAGTTTTTATCCTGGATCTGTTTTGAACCCAAGTCAACCATCACAG CCATCGGGTCATGCCCATTCTGTAAACCATTTGCAGTTGCAGCAGAAACTATGTTCTGGGTCCCCAACCACTTCACCAAA GCTACTTCAGATTTCTTCTGATGCTAGTGCTCAAGTACAGGTTTCACCAGTTTCATCAGGTCAAATGTTATCACCTACCC AGCCAGCTGTGATTGTTTCAAACCACCACCAGTTGCAGCTACAGTCTAACAAAATTAATCAAACTCAATCAAATATTCAG AGAATGTTGCCACAAAACTGCCAGGTGCATTCTGAGTCATCAAGTAAGTCTCAATCTGATCCAACTCAAGTTGATCAAAC GCCTGAAAACAGTGCTTCTAAGATTAGTACAAGTTCTACAATGAGTCAGGGTTATATGGATTCATCGAGTCTGGTACCAG CTGTTACTACTGTTTCTTCTCAGTGGAAAACATCAGAAACACCATATGATTCCAATATTGACAATCAAGCCCCTAAAGTG AGCTCCTTGGGTAGTGCACCTGTTGGCAATTCTACTGGAAGTGAACAGCCCACAGTTAGTCAAGGGATTGACCCAAGATT AGTTTGCTCGACATCTAATGCACATAATAATGGGGCACAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACAGCCTCTTCAACAGT CATCGCCCCAAGAGCAGCATAAGCAGCAGCAGCAACAGGAGCATGAACTACATTCTCCCACATCTCTTGCTTCACAACAT CAACCTCAGCAACACATGAAGCATCCACAATCAGGGCAGAGCAGTTTGTTTATTCACTCACCTAATTCTAAAGAGGAATG A 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0083100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLGRGVHGYNPGSAPLANAEVDSMGGVVDGGVGIGSKISPHRGAVEKAQANLREEYDGREESSRELEFLEKGGNPLELKA GNAASVSVQSTSLTDQHHEQFVTSEAKGSFALTASPHGDSVDSSARPGPPFASEPITADNLLLFDAENELPESEKRCLRS NRRNYIAPSEQSSRIDGSQNAKETEDSAIFRPYERRNRSRTNHGPRGASREGKGLMSDTFIQKDHKVPSFTKPNSTSFNG DTVTKNLTANNSLNNELVGVQDHQSTSGSVSVPKDKLDITLNGNLRENHGTLPPQADNVQNPVLMASGEANVVEVREPVA AVDYEPAPHVATTKPENGSYYGQPNGFGNVEVDRKSVPNGSQNSIAVLGKNIDLEFCTQTSLDRDVNKDSDICTNRKNVD DTGNTLEQTLAFDNKLNFAGREVMKARNKIKSENGASVSNEHDAGYSNHSGNGNIVKAAEDVYTNSVKETNCERHQIPVD VSISEPPQIAPPTEKVSTATSDYQSCSTYHMKLAEKAREDSILEEAKIIEAKRKKIAELSIRSLPARNYIKSHWGFVLEE MTWLANDFAQERLWKITAAAQLGHRVAFTCRQRVEKLNKHLGVKTLSHRISKAVMQFWHSAELLLDNDDPAINSIVGCVE SAKVDANEASRDQKGNSYVDTSNFLEGLNPIKNSALKVHAYAIRLLKASRSQGISSQAEAPTTPEMIFDSGIVDISWKEH LTEESLFYEVPPTAMEKYRISVESHFFQFEKNGSAIQGETSVYDTAAEFGSEEIAYDEEEGESNTYYLPSVYKGSISSKS VHKKHKNWKSYTPGSGDAGTDFPYVHYSTGTKPSMLFGKRPASSNVGSVPTKRMRTATRHRVVSPFTVTTGTIQAQDRAD ASSGDNNSFHDDHIDQSTLHVGPLIQKSMEVESVTDFEKQLAYDCAETSIKTKKKKKAMTLGSAYEQGWKLDSSVQNEQR DHSSKRLNSHHFESNGNCGLYGQHNVKKPKITKQSLDHALDNNSPMTNSVPSPAASQMSNMSNPNKFIKIISGRERGRKA KALKISAGQHGSGSPWSLFEDQALVVLVHDMGPNWELVSDAINSTLQIKCIFRKPNECKERHKILMDGSAGDGADSAEDS GSSQSYPSTLPGIPKGSARQLFQRLQGPMEEDTLKSHFEKIIKIGQKQHYLRNQIDNQDLKHLVPIHNSHVIALSQVCPN NLSGGILTPLDFCETNTSNPDVPALGYHGLHTGSLASSNQGSVPSVLPTSGVNTSLPGSSGMVLNNNFSPSSGPTAASVR YGVPRSSPLSVDEQQKLQQYNQMLSGRNIQQSSMSVPGTLPGNDHGVCMMPGGGAMGLMGGINRSMAMPRPGFQGMSSPS MLNSGSMVSSSINMRSGVGSGQGNSMSRPHDPLMRPGHNPEHQRQMVAPQHQTQVTQGNNKSNPALCGISSAFNNQTTPP PVQPYPGHAQQQPHRSNPRPPFQGPNHATNSQQQAYAVRLAKERQLLQQQKYLQQQQQQIAASNALMPHVQAQSQLPISS SPLQNSSQVQPPNSSQHEPLSPATASSALGPMSSQHQQHKLHQLQHGLSRNPVANGLTNQAGKQRQRQPSQQQQQYQQSG RQHPNQRHNVPPQQQAKLLKGIGRGNMLVRQNLSADPSHLNGLSLPAGGQTGEKGDQIMHMIQGQSFYPGSVLNPSQPSQ PSGHAHSVNHLQLQQKLCSGSPTTSPKLLQISSDASAQVQVSPVSSGQMLSPTQPAVIVSNHHQLQLQSNKINQTQSNIQ RMLPQNCQVHSESSSKSQSDPTQVDQTPENSASKISTSSTMSQGYMDSSSLVPAVTTVSSQWKTSETPYDSNIDNQAPKV SSLGSAPVGNSTGSEQPTVSQGIDPRLVCSTSNAHNNGAQRQQQQQQPQPLQQSSPQEQHKQQQQQEHELHSPTSLASQH QPQQHMKHPQSGQSSLFIHSPNSKEE 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 7 1931 1925 0.0
PANTHER 7 1931 1925 0.0
MobiDBLite 112 134 23 -
MobiDBLite 161 216 56 -
MobiDBLite 164 185 22 -
MobiDBLite 187 207 21 -
MobiDBLite 433 452 20 -
ProSiteProfiles 541 615 75 11.393
SMART 542 608 67 3.6E-10
Pfam 551 587 37 3.4E-6
MobiDBLite 836 856 21 -
MobiDBLite 959 981 23 -
MobiDBLite 1000 1021 22 -
ProSiteProfiles 1054 1106 53 6.841
CDD 1055 1101 47 0.00145107
Pfam 1056 1104 49 1.1E-5
MobiDBLite 1107 1134 28 -
MobiDBLite 1116 1131 16 -
MobiDBLite 1373 1387 15 -
MobiDBLite 1373 1472 100 -
MobiDBLite 1405 1438 34 -
MobiDBLite 1449 1472 24 -
MobiDBLite 1511 1613 103 -
MobiDBLite 1667 1688 22 -
MobiDBLite 1766 1806 41 -
MobiDBLite 1825 1946 122 -
MobiDBLite 1825 1901 77 -
MobiDBLite 1908 1940 33 -
Coils 1944 1946 3 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0083100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…