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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0147300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0147300.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Callose synthase-like protein; TAIR: AT3G14570.1 glucan synthase-like 4; Swiss-Prot: sp|Q9LUD7|CALS8_ARATH Putative callose synthase 8; TrEMBL-Plants: tr|K7MDN8|K7MDN8_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0147300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:19781911..19800850) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGATGGAGATTGTGCCTGCAGAACCGATTGAGGGCATATATTTTGAGCAAGGAGAGTCCTCTACAGCGAGAAGCCATGA CCCCTTGGCCATTACCAGTGTCAGTAACAGCGGCGGCGACGTTGGTTATGTTCCAGGACCCTTTGATAGTGAAAGGTTGC CAACAGTTTTCGCTTCCGAAATAGAAAGGTTCCTTCGTGTGGCCAACTTGGTTGGGAAGGAGGAACCTCGTGTTGCTTAT CTGTGTGAGTCATTTTTCTTTTCTAGGTTTTCTATTCTGGGTGTATATATTTTTTTTTTTTACAAAAATGTTCGAAATGA TAGAAAACACTTCAGACTACGGGATAGGACGCCAGTGGCCAGCAGAGGCCCACTCTTGGGTAGGAGTACCAGGGATTTTC TCGAGAAGGGTTGCCCACCAATTGAGATTTTACTTGATGTAGGGGGATTCGAACCCTCAACCTATGAGGATGTGAGAGTT GAACCCGAAACATGTGGCTAGTTGTGCCAACCCAAGTTAGCCGGGTGTATATATATGTTATGGAAGTCCCTCTGCAACTG ATTATTTTTTTTAAGTATTTGGGGTTTCTTGTTTTTTTGGTTGTGTATGTTGATTGAGTTATATGCTAGATTATGGCTAC AAAATAAATTTTTCATTAAAGGCTAGTTTTGCCTTTTTATAACCTTAATTATGGTAGTTAAAGAAAAATGTAGTTGAAAA AGAGGCTCAATTTATCCAATTACCTTATTCTTGGTGAAGAAATTGCATCAAGACACAAACAGTCATGATGAAGGTTTAAA ATACACGGGAAAAGGAGAATTGCATCCATGATCCATGCAGTTCTGTGCTCTCAATTTCAAGATGTTAGTGTCTATTCTTG TCTATTCTCTTCTTCAATTGGCAAACAGTTGTACATTGTAAGAGTGCAAAGTTTAAGTGTTTCCATATCACTTTATTTTA 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CTCAACAAAGTAAAAGCATGATTTTGATGCAGGCTGTGAACCTGGGAAGGCAACTGCTAAGTGCTAATTATCAGCTTGGA TTCAGATTTTTCAAAGCATTCCTGTTCATTGGTGTTATTGCCCTCATAATTACTCTTTCCTTTATATATCAACTTTCATC GATGGACCTTTTTGTTTGCTGTCTGGCATTCATGCCAACTGCATGGGGATTGATAATGGTAATAATCTTTAGCAACCCTT TTTTTTAACATATCTTTAGCAACCTTGGATGAGCTAAATTGTCACCTTTTTTAATTTGTTCCTTGCTTTTTCCCTGTGAG GCTGTGACTTAATCCATGTAGGAGGCCATTTGAATACGGACTTATTGAAGCTTATGTATAAGAAAAAACACTGTATAAGC TCTAACAAGTGCTCTTTGTCTTACATCCAAGCGGGTTCTAATTAATATATTTTGGTGGTTCAGATAGCACAAGCTGCAAG GCCAAAGATAGAGCATACAGGATTGTGGGACTTCACCCGTGCACTTGCTAGAGAATTTGACTACGGAATGGGGATAGTTC TTTTTGGACCTATAGCTATTTTGGCATGGCTACCAATCATTAAAGCCTTCCATGCTCGTATCCTCTTCAACGAGGCATTC AAAAGGCACTTGCAAATCCAACCAATTCTTGCAGGAAAAAGGAAGAAGCACAGAACTTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0147300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGTACTACAGAGAAGCCTTAAAATTACAAGCATTTCTTGACATGGCTGAAGATGAAGATATTCTTGAAGGTTATGA GACTGCTGAGAAAGGCAACCATGCATTGTTTGCTCGTTTAGAAGCACTAGCGGACATGAAATACACCTATGTCATTTCCT GTCAATCATTTGCTTCACAAAAGGCTTTGAATGATCCCCGTTATAAAGATACAATTGACTTAATGATAAGGTATCCATCT CTTCGTGTTGCTTATGTTGAGGAAAAGGAACAGATTGTGCCGGGTAAACCTCCCAAAGTATATACATCTAAACTGGTTAA AGTTGTCAATGGATTTGAACAGACAATATATCAAATAAAACTTCCAGGTCCACCACTACTTGGAGAAGGGAAGCCTGAAA ATCAAAACAACGCAATAATATTCACTCGGGGTGAAGCCCTCCAAACAATTGACATGAACCAAGATAATTGCTTGGAAGAA GCTCTTAAAATGAGAAACCTTCTCCAAGAATTTCATCGCCGCCAAGGCCGGCGTCCTCCAACCATACTTGGTCTGAGGGA GCACATTTTCACAGGAAGCGTGTCTTCTCTGGCATGGTTCATGTCATATCAGGAGACCAGCTTCGTCACTATTGGTCAAA GGATTCTGGCTAACCCTCTCAGAGTGCGGTTCCACTATGGCCATCCAGATGTATTTGACAGGGTTTTTCATATTACAAGA GGAGGAATAAGCAAGGCATCTAAAACAATTAACTTGAGTGAGGATGTTTTTGCTGGGTTCAATTCTATTTTAAGAAGGGG GTGTATTTCCTACCATGAATACTTGCAAATAGGAAAAGGTCGGGATGTAGGTCTAAATCCGATCTCAAAATTTGAAGCCA AGGTAGCAAATGGAAACAGTGAGCAAACTATAAGCCGTGACATATTCCGCCTAGGACGGCAATTTGATTTTTTTCGGATG CTATCTTGTTATTTCACAACCATTGGATTTTACTTCAGCAGCTTGATTTCAGTTATAGGAGTATATGTATTCCTTTACGG GCAACTATACCTGGGGATTAGTGGTTTGGGGAGAGCACTTGTTATGGAGGCTCGAATAAAAAATGTACAGTCCCTAGAAA CAGCGCTTGCCTCGCAATCATTTATACAACTCGGGCTTCTAACCGGCTTGCCAATGATGATGGAGATAGGCCTTGAGAGA GGTTTCCTCACAGCGCTTAAAGATTTTGTCCTCATGCAATTGCAGCTGGCTGCTGTTTTCTTCACTTTCTCCCTCGGAAC GAAAACACATTATTATGGAAGAACAATTTTGCATGGGGGTGCCAAGTACAGACCAACTGGGCGCAAAGTCGTCTTTCATG CTAGCTTTACTGAAAACTACAGATTATATTCAAGAAGCCACTTTGTCAAGGCATTTGAGCTATTGTTGTTGCTGATTGTT TATAATATGTTCAGGAGGTCTTATCAAAGTAACGTGACATACGTTGTAATAACTTACGCCATTTGGTTCATGTCCTTAAC TTGGTTATGTGCACCTTTCCTTTTTAACCCTGCCGGATTCAGCTGGACCAAGGCGGTAGATGACTGGAAAGAGTGGAATA AATGGATCAGGCAACCAGGTGGATTGGGAATTCATCAGGATAAAAGTTGGCATTCTTGGTGGTATGATGAGCAAGCTCAT CTTCGCCGGTCAAGTCTTGCTTCCAGGTTCACCGAGATATTGCTCTCTCTTCGTTTCTTCATCTATCAGTACGGTCTAGT CTATCACCTAGACATATCTCACCATAGCAAAAACTTCCTGGTCTATGTCTTTTCTTGGATTGTGATTGTTGCAGTTTTCG TCTTGGTGAAGGCTGTGAACCTGGGAAGGCAACTGCTAAGTGCTAATTATCAGCTTGGATTCAGATTTTTCAAAGCATTC CTGTTCATTGGTGTTATTGCCCTCATAATTACTCTTTCCTTTATATATCAACTTTCATCGATGGACCTTTTTGTTTGCTG TCTGGCATTCATGCCAACTGCATGGGGATTGATAATGATAGCACAAGCTGCAAGGCCAAAGATAGAGCATACAGGATTGT GGGACTTCACCCGTGCACTTGCTAGAGAATTTGACTACGGAATGGGGATAGTTCTTTTTGGACCTATAGCTATTTTGGCA TGGCTACCAATCATTAAAGCCTTCCATGCTCGTATCCTCTTCAACGAGGCATTCAAAAGGCACTTGCAAATCCAACCAAT TCTTGCAGGAAAAAGGAAGAAGCACAGAACTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0147300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMYYREALKLQAFLDMAEDEDILEGYETAEKGNHALFARLEALADMKYTYVISCQSFASQKALNDPRYKDTIDLMIRYPS LRVAYVEEKEQIVPGKPPKVYTSKLVKVVNGFEQTIYQIKLPGPPLLGEGKPENQNNAIIFTRGEALQTIDMNQDNCLEE ALKMRNLLQEFHRRQGRRPPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSYQETSFVTIGQRILANPLRVRFHYGHPDVFDRVFHITR GGISKASKTINLSEDVFAGFNSILRRGCISYHEYLQIGKGRDVGLNPISKFEAKVANGNSEQTISRDIFRLGRQFDFFRM LSCYFTTIGFYFSSLISVIGVYVFLYGQLYLGISGLGRALVMEARIKNVQSLETALASQSFIQLGLLTGLPMMMEIGLER GFLTALKDFVLMQLQLAAVFFTFSLGTKTHYYGRTILHGGAKYRPTGRKVVFHASFTENYRLYSRSHFVKAFELLLLLIV YNMFRRSYQSNVTYVVITYAIWFMSLTWLCAPFLFNPAGFSWTKAVDDWKEWNKWIRQPGGLGIHQDKSWHSWWYDEQAH LRRSSLASRFTEILLSLRFFIYQYGLVYHLDISHHSKNFLVYVFSWIVIVAVFVLVKAVNLGRQLLSANYQLGFRFFKAF LFIGVIALIITLSFIYQLSSMDLFVCCLAFMPTAWGLIMIAQAARPKIEHTGLWDFTRALAREFDYGMGIVLFGPIAILA WLPIIKAFHARILFNEAFKRHLQIQPILAGKRKKHRT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 1 | 570 | 570 | 8.2E-178 | ||
| PANTHER | 1 | 752 | 752 | 0.0 | – | |
| Phobius | 1 | 322 | 322 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 752 | 752 | 0.0 | – | |
| Phobius | 323 | 345 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 324 | 346 | 23 | - | – | |
| Phobius | 346 | 380 | 35 | - | – | |
| TMHMM | 372 | 394 | 23 | - | – | |
| Phobius | 381 | 398 | 18 | - | – | |
| Phobius | 399 | 409 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 409 | 426 | 18 | - | – | |
| Phobius | 410 | 427 | 18 | - | – | |
| Phobius | 428 | 466 | 39 | - | – | |
| Phobius | 467 | 484 | 18 | - | – | |
| Phobius | 485 | 495 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 493 | 515 | 23 | - | – | |
| Phobius | 496 | 515 | 20 | - | – | |
| Phobius | 516 | 565 | 50 | - | – | |
| Phobius | 566 | 587 | 22 | - | – | |
| Phobius | 588 | 598 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 599 | 621 | 23 | - | – | |
| Phobius | 599 | 616 | 18 | - | – | |
| Phobius | 617 | 635 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 634 | 656 | 23 | - | – | |
| Phobius | 636 | 656 | 21 | - | – | |
| Phobius | 657 | 662 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 661 | 683 | 23 | - | – | |
| Phobius | 663 | 684 | 22 | - | – | |
| Phobius | 685 | 703 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 703 | 725 | 23 | - | – | |
| Phobius | 704 | 725 | 22 | - | – | |
| Phobius | 726 | 757 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
| Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
| Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0147300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…