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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0150800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0150800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | UHRF1-binding protein 1; TAIR: AT3G20720.2 amino-terminal region of chorein; Swiss-Prot: sp|Q6BDS2|URFB1_HUMAN UHRF1-binding protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7GZD2|A0A1J7GZD2_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0150800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:20284797..20296866) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATTGTTTCATTACACACAGACAGACAGACAGAAAACCATGATCTAACATGCAACATACATTGTCGGTAACAGAATCTGTT GTGATTCCTCGTCGTTTGTCGGAGACACCAGATTTCGAAGCTCCTCTTCTTTCAATCCATGGAGTCGATCCTCGCAAGAG CTCTGGAGTACACTCTCAAGTACTGGCTCAAATCATTCTCCAGAGACCAGTTCAAGTTGCAGGGTCGCACCGTCCAGCTC TCCAATTTAGGTCCACTTTCTCATCTTCTTGTTTTTTCCTTCAATTTTCAGAATTAGGTGGGGATTATTGGGAATGAACG GGGTTGGTTGATTTTTTTGTATTTATTTTTTTGAGTTTTGATTTTCTGTTCAGATATTAATGGGGATGCATTGCATTCCA GCGTTGGATTTCCGCCGGCGCTCAATGTCGCCACTGCAAAAGTTGGCAAATTGGAGATCATGGTTTGTCAATTGTCACTC TTACTATTTTTTTGGTTCATGTTGCTGTTTGGTCATGGTTCCTTAGAATCACTAGAGAAATGGGTAGAAAAAAGATGTAG CCTTCTGTGTTAGAAGTCATTTGCTAGAGATATGACATAGATAGCCTTTATAAAGGATAGAGCGATCCTCAACTCTTGAG CTAGCTTTTGAGTTGAGTTAGGCCTCCCAAATTCTAATATTCTGTACCGATCAAATAGCGTATAATGTTCTAATTGTTTG CCTTGTTGATTATGTTTATCTAGTTGTCTATGTTGAATTTGGCTCATGTGAATTGGGAGTCACTTTAAATGATAAAATAA GTCACTTTAGAGGGTGAAAAAGTAGTTATAGATGGTTGAGATTGCGATCATATTCATGCATATTCATGCTGCTGTTTGGT AATGGTTCCTTATAATCACTAGTAAAATGGGTACAAAAAAGTTGTAGCTTTTTGCACCAATGACCAACCAAATAACTTAT 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TGTTGGCCAGTCTGTAATGAATCAGCTAGGCAACCTAGGTAGGCTGCCACTTTTTCTAATCTAGCCAATGCTTTTCTTTA TAGATAAAGGCGTTGAACTTATATCATAGCATAAGCGCTTACACAGGTATTTGGGAGAATTTATGTAAATAGCTTATGGT CTACCTAGTTTTTTGAGCCAATTTTCACAAGTTGTTCAGATTAGCTGGTGAATAAGAGTTTATGCTTACCTATATAACCT ATTTTCAGCTTATTCCATTAAGTTTCTCAAATTATCTTATGATAAGCGCTTATCGTCATAAACACTTGATTAACTTGTTT ACCCAAACACACCCAAATTCTTATTCTTTTGAGTTCTTTTAGTTATTGTTGATGTGTATTAGAATATTTAGAAAAATCTC AAAATATCAATATTCTATATTATAATATTTTTTAATATCTTAAAATTATGAGTCTAGTATATTAGTATAAGGGACGACGG TTAGTGAGTACTTTGTCTTCTGTATCATACATATCACATCACGTCAAATCAATACCAGTTTCAGATTTTTCAGTCTTTAT ATTCTATTTTTCTTCCTTTACTAAATTCCAATAACCTCGGTATAGTATCAGAAAGATATTATTCTCCATGAGCCCACATC ACTGTTTCTCTACTAAGTTCTCTAAAGCTAGTGCTCTACTTTATTGTCACTATAATGTTGCCATGTTCCTGAAGTCAGGA GCTATACTCTATTTCCCTGGTCATTTCCTTCCTTTCAATTAGCATTGGCATGCCTTAATGCTCATTGTCCTAGAGTTTCA AGGGATCGGTCCGCCAGCATTTTCTAACAATGTTATGATAATTTGCAGGAAGTGAAGGCATAGACAAGATTTTCTCGCCT GAGAAACTCAGCATCGATGGTAGTGTTCGTATTGGAGGACATTCTCCATTACCAAACCTTATAAACGAAAGCCCGCGCAA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0150800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGTCGATCCTCGCAAGAGCTCTGGAGTACACTCTCAAGTACTGGCTCAAATCATTCTCCAGAGACCAGTTCAAGTT GCAGGGTCGCACCGTCCAGCTCTCCAATTTAGATATTAATGGGGATGCATTGCATTCCAGCGTTGGATTTCCGCCGGCGC TCAATGTCGCCACTGCAAAAGTTGGCAAATTGGAGATCATGCTACCATCAGTGAGCAATGTACAGATAGAACCAATCATT GTGCAAATTGATAGGCTCGATTTGGTTCTTGAGGAGAATTCAGATTTTATACCATCTGAAAGTCCAACCAGTTCTACGTC ATCAAGTGCCTCTGCCAAAGGTAGCGGGTATGGTTTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAGATTCATACAG TTAATCTATTACTTGAAACTCGTGGAAGTGCTCGTCGCCAAGGGGGAGCAACATGGGCACCACCCATGGCATCTATAACT ATACACAACCTTTTGTTGTATACTACAAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAGCACGAGAATTCTCATGTAA TAAGAAGTATATATATGTCTTCAAAAAACTGGAATGGGAATCACTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCA CGGATGCTACTTTAGGCCACTCTCAAGGGGGTGGAAACCTGAGAGATGATGATGGTGCAAAGCGAGTATTCTTTGGAGGT GAACGTTTTATAGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATCACAGTTCAGAGAACTGAATTGAACAGTCCACTTGGGCTGGA GGTTCAGTTACATGTCACAGAAGCTGTTTGTCCGGCACTAAGTGAGCCAGGACTGCGTGCACTTCTCCGCTTTATGACTG GATTGTGTGTTTGTCTAAACAGGGGAGATGTAGATTTCAAGGCCCAGCGGTCAACTGAAGCTGCTGGGCGCTCTCTTGTC TCAATTGTTGTGGACCATATATTTCTCTGCATTAAAGACTCTGAGTTCCAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCCCTCTTTTT TTCTCGGGCCAGTCTTCGTGAAGGAGATTCTGATTGTAACTTGACCAGGATTACTATTGCAGGACTATTTTTGAGGGATA CCTTTTCACGGCCTCCATGTACCTTAGTGCAACCATCAATGCAGTCTGTCACAAGAGATGCTTTTGAAGTGCCAGAGTTT GCCAGAAGCTTTTGCCCTCCAATATATCCTCTAGGAGAACAGCAGTGGCAATCAATCGTGGGAACTCCAATAATATGTCT CCATTCCCTGCAGATCATGCCCTCTCCTCTTCCACCATCCCTTGCTTCTCAAACAGTTATTGACTGTCAGCCTCTTGCGA TCCATCTCCAGGAAGAATCCTGCCTTAGGATATCATCTTTCTTAGCTGATGGTATTGTTATCAATCCTGGTGATATTTTG CCAGATTTCTCCGTAAAATCTTTTATTTTCACTCTCAAGGGACTGGATATTACAGTTCCTTTGGATAAGGGTCAATTGGA TATTTCTAAAAGCTATATTGACAATACAGTCCAGTCCTCATTTGCTGGAGCAAGGCTTCATGTTGAAAACCTACTCTTTT TGGATTCACCCTCAATGAAGCTAAGGATACTCAATCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTTTGGGAGGATCAGCCA ATTGATGCTAGCCAGAAGAAATGGGCTGCCAGTGCATCCCATCTTACTTTATCTCTAGAAGCAAGTACCGGCACCCTTAG GCATCAGAATTCTCTCGGATGGACTGCTGGAATGTGGAGATGTGTCGATCTGAAAGATGCTTGCATTGAAGTAGCTATGG TAACTGCTGATGGTAGTCCATTGTTAAAGATTCCTCCTCCTGGAGGTATTGTTAGGGTTGGTGTTGCTTGTGAACAGTAT CTATCCAATACTTCTGTTGAACAGTTATTTTTTGTCTTGGATCTCTATGCTTATTTCGGGAGAATTAGTGAGAAAATTGC AGCAGCTGGAAAAAGCAAACAATGGAATGACATGGGGAACAAATCTTTTAATGGAAAGCTGTTGGACAAGGTTCCTAGTG ACACTGCTGTAAGTTTAGCAGTAAAAGACCTCCAACTTCGATTTCTTGAGTCTTCTTCAATGGATGTTGAGGGAATGCCT CTAGTACAGTTTGTTGGGGATGATCTGTTCATTAGTGCCACTCATAGAACCCTTGGTGGTGCTGTTGTCATTTCATCCAC TTTATGTTGGGAGAGTGTTGAGATAGATTGTGTGGATTCTGAGGAATACTTGACATCTGAAAATGGCTCTTATTTTAGTT CGGGAGAAAATGTTTCCTCTGTGAATGATAATGGATACCCTATGAGAGCTGTTTTTTGGGTGGATAACAAGAATCGTCTA CTGAGTGCAAATGCTCATTCAGTCCCATTTCTGGATGTAAACGTGGTACATGTCATACCATTTTGTGAAGTAGACATGGA GTCCCATAGTTTGAATGTCTCAGCTTCTGTATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGGGGAATGAACTATGCTGAAGCCCTCCTGC ATCGATTTGGAATACTTGGGCCTGATGATGGTCCCGCGCAGGGTCTTTCTAAAGGGCTGGAAAACTTACAAACGGGGCCT TTGGCAAAACTTTTCACGACAACACCTCTCATTGTTGACAATTCAGAAGATGTTGAGAGTGTGACAGAAGGGAAAGAAAT CAAATTTCCACACTTGAAGCCGGATAATGTGGATGTAACTATAGAATTGAGAGATTGGTTATTTGCTCTTGAAAGTGCAC AAGAGATGGCTGAAAGATGGTGGTTCTCCAGCCACGAAGAAGTAGGCAGAGAGCAGAGGTGTTGGCACGCAACTTTCCAT ATTTTACAAGTAAATGCTAAAAGTAGTCCAAAGAATGTTCCAGGCGGAAAATCACAATCACATAGAACACAACAATATCC CCTAGAACTTGTTACGGTTGGTGTCCAAGGGCTTCAGATCTTGAAGCCCCTTACCCAAAAAGATATTCCTTCATCAATGT TAACTGCAGATGCAGTTAAAGAATTTACCAACAGCGTTGGGGGTATCAATCTTGAAGTGGGCTTGGTATTACATGAGGAT AATGTCGATGATGAAAAGGCTAATTGGGAGGTGGAAAACCTAAAATTCTCTATAAAGCAACCGATTGAGGCTGTTGTAAC CAAGGATGAGGTCCAATACCTCACTTTTCTGTGCAAATCTGAAATTGATTCCATGGGCCGTATAACAGCTGGAATTCTAA GACTGCTTAAGCTAGAAGGTTCTGTTGGCCAGTCTGTAATGAATCAGCTAGGCAACCTAGGAAGTGAAGGCATAGACAAG ATTTTCTCGCCTGAGAAACTCAGCATCGATGGTAGTGTTCGTATTGGAGGACATTCTCCATTACCAAACCTTATAAACGA AAGCCCGCGCAAATCGATGGAATCAACACTAACTTTGCTTGAGGAAGCAGTTGTGGATTCACAGGCTAAAGTTGATGCTT TGATAACTGATATTGGCACTTCTGAATCTACCTCTCAGCACCTTACTGCTGTGAAACAGCTTAGTCAGAAGATTGAGTCG ATGCAGGGTTTAATGATGCAATTACGGAATCAACTTTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0150800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MESILARALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHSSVGFPPALNVATAKVGKLEIMLPSVSNVQIEPII VQIDRLDLVLEENSDFIPSESPTSSTSSSASAKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETRGSARRQGGATWAPPMASIT IHNLLLYTTNESWQVVNLKEAREFSCNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDATLGHSQGGGNLRDDDGAKRVFFGG ERFIEGISGEAYITVQRTELNSPLGLEVQLHVTEAVCPALSEPGLRALLRFMTGLCVCLNRGDVDFKAQRSTEAAGRSLV SIVVDHIFLCIKDSEFQLELLMQSLFFSRASLREGDSDCNLTRITIAGLFLRDTFSRPPCTLVQPSMQSVTRDAFEVPEF ARSFCPPIYPLGEQQWQSIVGTPIICLHSLQIMPSPLPPSLASQTVIDCQPLAIHLQEESCLRISSFLADGIVINPGDIL PDFSVKSFIFTLKGLDITVPLDKGQLDISKSYIDNTVQSSFAGARLHVENLLFLDSPSMKLRILNLEKDPACFCLWEDQP IDASQKKWAASASHLTLSLEASTGTLRHQNSLGWTAGMWRCVDLKDACIEVAMVTADGSPLLKIPPPGGIVRVGVACEQY LSNTSVEQLFFVLDLYAYFGRISEKIAAAGKSKQWNDMGNKSFNGKLLDKVPSDTAVSLAVKDLQLRFLESSSMDVEGMP LVQFVGDDLFISATHRTLGGAVVISSTLCWESVEIDCVDSEEYLTSENGSYFSSGENVSSVNDNGYPMRAVFWVDNKNRL LSANAHSVPFLDVNVVHVIPFCEVDMESHSLNVSASVSGVRLGGGMNYAEALLHRFGILGPDDGPAQGLSKGLENLQTGP LAKLFTTTPLIVDNSEDVESVTEGKEIKFPHLKPDNVDVTIELRDWLFALESAQEMAERWWFSSHEEVGREQRCWHATFH ILQVNAKSSPKNVPGGKSQSHRTQQYPLELVTVGVQGLQILKPLTQKDIPSSMLTADAVKEFTNSVGGINLEVGLVLHED NVDDEKANWEVENLKFSIKQPIEAVVTKDEVQYLTFLCKSEIDSMGRITAGILRLLKLEGSVGQSVMNQLGNLGSEGIDK IFSPEKLSIDGSVRIGGHSPLPNLINESPRKSMESTLTLLEEAVVDSQAKVDALITDIGTSESTSQHLTAVKQLSQKIES MQGLMMQLRNQL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1209 | 1209 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1209 | 1209 | 0.0 | ||
| Pfam | 2 | 102 | 101 | 2.8E-10 | ||
| Coils | 1191 | 1212 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0150800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…