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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0153300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0153300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | RNA-binding S4 domain protein; TAIR: AT1G53120.1 RNA-binding S4 domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|P71020|YLMH_BACSU Putative RNA-binding protein YlmH; TrEMBL-Plants: tr|C6TI80|C6TI80_SOYBN Putative uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0153300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:20716872..20729550) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCGAGTATAGGATCGATACTATATAGTATCCTTCAACTTTAACCCTTTGAATTAAATGTAATGGAAATAAGAGCTGATTA TGAAAGGAAAAAACAAAGCTCCTAGTCTCACTGTTTGAGCGCTCGTTCACCCGAACAAAGGGTGAGGTGAAGATTCCCTC TTCTTCATCACCCGGGTGAAATTTACCTTCTCGCCATGGCTGCTGCTACTAGCTTTGGAACTTCATGGTGTCTAAGAAGA GCAGCTCATGCTTTTGCTCTCTCTCATCTTCATATTCTACGCAGCAATGCCAACCTCTCTTTCCAAACTACCCTCACCGC CTCTCATCTTCTCTCCGTTTCCACTTCTTCAGGTCTCAGCTTACTTTACCAATTTCATTTTCCCCTTGCTTTTCAGGTTT TATTTGTAACTTGATGCTTTTTCGCATACCCATTATGTTTAATCGCTTAAAAATGTAGTCTTTTTCACAAACAGAATCAT GGATACTGGAAACCAGGACGAGAAAATTTGTTCATTATTTTAGTCCACTATTTTAGTTCCAAGGTGCATAAATTACAGTA TGAAAACTCAACAGGGTTATAAATGTTGCTAATGAATGGAGAAGTGGGTTTTGTAAATTATAATCAAGTTGAAAACTTGG TGTTTAATGGCGGATAGGGTAGCGTAGCGGCAAACCCAAAAAAACGTTATTTTGAGTGCTATTGCGGTGCTATAATGGCA AATAGCGGACAATAGCGGCAAATAGCGGTGAATAGTGGCGTAGCGGTGAACCCCAGGGTGCTACGCTGTAGCGCTATTGA GCCGCTATGGCGCGCTGTTAACAAGCCAGGCGAGCAGTGATTCTTTTGTGTTATTGCTCAAAACTCATAAACTTTACTAC ATGTGTAATAATGGTGAAGCGGAATTGGGACGGAGGGACAGATTATCAACTGTGTTGTTGTGGGCTAGTGTGTTGCAAGT TAGACTTCATTCTTCGGATAAAATCACCAATAAAGTGATTGATTGGTCAATTAAGCAAGTGAATTAGAGCCATTACGTGT CAATTAGCTTGACTTGTGAACTGGTGACAAGTGGTAACATGAGTGGAGATATGGCTCCATCAGTGGTATATGGCTCCTGA TTCTTGAAAGTAGGCTTGTTAAGTGGTTTTTCCAGGTCACAAGTGGTAACATAGTTAGATACTTGGCTCAGAGTAAAATG TGCTTGGTGTGCTCCTAGAAAGACCTTGTTTGTTGACTATTGAGTACTTGGGTGAGGCTTGAGCATGACTAGGAGTGTTA AGGATTAATACATGAGGAACAGATTGTTGGGAACTGATAGAAACTGAGTCCAGCAATGGGTAATGATGCAGAATTAACAG AGAATATGAAAGGAGAACGGAAGAAATCAGTAGCAAGAATACTACTGCCCACAGCAAAGCTCCTATAGAGAGAAAGCTCT CTCCATTCTCAACAAACTAATTGATACTCAAATTATACATCCCCACTAACTCTCGTAGCCTATTTGTTGATACTTCCCCC ATGAGTATTTAACTTCCCATTCCCCTTTTCAATCTCTTCCAGTTCGGCATCCTTATTCTTTCTCCTGTAAACTCTCCAAA CCCAAGGCCTGTGTGCTACCAACTGATGGGGCCTATTTAGGATGGTAACAGGAACTTATTTATTTGTTAAATGAAGGTGT GAGTGAAGGAGTTTCATATTGGACAGGGTGAGTATAATTTAAAGTGGACCCATGAACTTGATGCCTTAAGGTTTTGGGTT GGGTAGTGTCAGGTTCACTAATGTGGTTTCCCCGGTAGCTCCATTGATACATATCTCTCCCTGGTGTTTTTGACTCCGCC AACAGCCAAATAGTCTGGCTATCTCCAACAAAATGGGGGCTGTATGTCTTGCGTGAAAAGTTTTTGTGCAATGGGAAAGG 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ATTAAGGTAAGTGCTGAAAATTTTGTTACCAAAATGGTCAAGCTCACTGCATCCATTATTAACGTTTACTTAAAATTACA CTTTCCAGCATCACAGGGAACTTTCAGTTTGAACCTTGCTCTCATGGTGACTTCCTTGGCTCAGTTCTCGGTACAGGAAT TGTCAGGGAGAAAGTTGGAGATATCATATTGCAGGTATTCCTCCCCCCCCCCCCCTTCATTCATTTCAAGAATGTGCTGT TTGAAATTATGTTCTGTGCACTCAAGGGTACTAATAGAAGAATTTAATAGTATCATTCTTTAACCATGTTCTTATGTTGT TTTATGCAACTGAAGAATAGTAGTGTATTTACAAGGAACAGTTAAGGCTTTGCAGCTTTTAATAGACATGCTTCTCTGGG ATATGTAGTTTTCCTTTATTTCAGAAACTAGTTCATGTTACACTACTTTACAGTTTGTTTGCGCATCAAAGACTCCCATT ATCTAATCCAACCATATCAAAGCTGTTCAGAGAAAACGTGACTTGAAGTAAAATCCTAATATAAATAGACTTCAGCTATA ATAGTAGCATAGCATAATCTGCAATTTGTTGCATATTAGATATTATAGTATTATACAACAATTTACCATCTCATAAGTTG TTCATTTGTTGAATTTGTAGTTCTAATCTCAATTTTATCCCTCTCATCGTGTGCACAGTAGAATACAAGACTATTGTCTA AGGCTGCTATTATCTCTAATGTTAGTTATTGACTCCAGTTGTTGTTTGATGACAAAATAATTCTATTTTCTTCTGCTAAT TAGTTAGATCTGTAATAGGAAGTTATCCATACAATGGGGCTGAACAAAGTCAAATCATTGTGGCAGAAAGAAAAACTGAA CTCAACATCTGTCTAGAAAGCAGTATTGGAAAGAAGGGTCACTTTTATATAATTCAGTTGGCAATAATTCAGTTTGCTAC TGTGTTGTTCATCTTTTGGTTCGCTGCAATTTAAGTTTATTGACATGACCTGGATTACATTGTCTTATTTGCATTCATTT TGATTTTTATTTGACTTCGTCTGTTGTATTTATCCCATTAAATATTTGTTTTTTCTGTTTATTTTTCCAGTGTGCATATA AATAGCCCAAACATATTTTAGGGAACTTTGACATTGCTGCCTTTGCTGTCCAGGGTGAGCAGGGTGCTCAGATACTAATT GTACCAGAACTTGTGGAATTTATTATGTCAACACTGGATAAGGTAGCGCTATTTCACTTACTACTTTGTACAGTTTAATT TCTGAATAAACGTCTAAAAATTTGAACAAAAGGAAATAGTTTGATGTAATACTTATTTTACATGATAGCATGAATATTTT TCCAAATTGTGGGGTGCAATTTTTTTTTAAGAATCTGTATACGAGCATGGTAGACTATTTAAGTTATGAAACTATATAGT TTCTTATAAATAAATATTGTGAAAGTTCATTTATAAGGATAAAATATGTATCTCTTCATTCTAAATGCTTCTACACTAAA ATGTTCAAATATTTCAGCGTGCAATATGATACTAGGAGAGGTATAATGGCAGGCTTTGGCGATGAAACGAAGTAATGTTT CATATGTTAGAGGAATCAAATATATGTATTGTGGGACCACAACTAGTGTTAGATGAGAACATGAGGTGTGGCAACAAAAG ATCTTTGTGAGTTGGGTTTCAACCTGTTTTTCCCCAAAAGAACCTGATATAACCCATCTGTTTTCTGAACCCCTTATCTC CTCTTTTGTCTTCTAGACCCTCTTTCCAATCTGATCTCTAAACACAGTTGTTCTCTTCAAAACCACTTGCTGGTTACTGG TCGCTGCTGTTTCTCTCAATTCTCTGTGGTTCTTCTTGTTCAAGTTTCACCTTCTCTTGCTGCTGCTTGTTCTCTTGCAT GTTTTGGGTGCTTATTCTGTCGCTTCTGCTGCTTGTTTGAAATCTTGTTGGGCCCTTGTTCTCCCTCTTGTTTCAATTGG GTTTTTCGGCTGCTTCTTTGTCTTTCTTTTGCTTGTGAAGGAGGTACTCTCTCTAATTTTTTTGGTTAAGGTCTAGATTG GTGCTGTTTTGTTGCTGAAATTGTCTTCCAAAGGCTGGTGTTAGTGGGTCTGAGGGATATTTTCTTGTTTATAATATTTA ATATACATACATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATGTATATATTGTGTGTGTGTGTGTGATTTATATGC TTACATATGAATTTTTTAGATATTATGATTAGGGGAGGAAATAGGTTAGGTCACTTGTCGGGAACAAGCAAGGCCTATTA GTTGCTCAATAAATCAATTCAAGGCATTTTAAAAGCGTATTTAGCTAAAAATAAAAATAAAAAAAATTTATTTTTGCTAT TATTATTATTTTATATTTTAATAATAATATCATGAAGTTATATCCTTAGTGACACATTTAAAGATTTAAACATGTTGACG TATTTATAAGTTTGAGTTTATAAGCCTATTTAGAGAGATTTATAACTTATTTAAGTCCCGTATCTTAGTTAGACTTGTAG GCCTGAGTGCCTGACCAAACTTTTATAAAAGGCCAAGTAAGACCTTGAAAAATGATATGTATCAGTCCTACAGGTCAATC TTAGGTATTAGAAAGCTCAACTCAGCCTATTTCCACCCCTATTATGCATTTTTTTGATAATGTAGCTTACTGCACCTAGT GGGTTAACACTTTTGTTGTTGCTGTTTTACTGCTTAAGAGAAAGGTTTTTGTTGTTGTTGCACTGCTTTTGAGCAGTTTC TCTTTTGTGTAATTGATATTATTTATGCACTGATTGCATTCTTCTTTCAGGTTGGTAATGTTTCTGTATCTTGCAGCAAG ATACCATTAATTTCTCTTGACTATGAACCACCAAGGTATGTTGATCCTTGTGTCAAGTCCACATAGTGTTTAATTGCCAG TTAGACTTTAGTAATTTTGTTTATTGTGCAGAACAAGATCATTCAAAACTGTAGAAGCATCACTAAGAGTTGATGCACTT GCAAGTGCAGGATTTAAGATTTCACGTTCAAAGCTAGTTGACATGATCAGGTTGGCAATCCCTAATATACATATACATAT ACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATACATATAC ATATACATATACATATACATATACCATGCCTGTTCATTATTTGTAAATTGTTGATTGCGTACGATTGTAGTGCAGTGGTC CATGAGATCTTGTTTTCTAAAAACTATTTTAAACTTGTTTCTGCTAAGTAAAATAATGGTCAGTTATGACTTATGAACGT TGTACAGAAACATATGCATAAATTGACTGTCTTTGAATTTGATTAGCTGTAACTGAATCAGCCGGGATTCCCGTTGAACT CAACACGAATCCACACTGAATCCAACATGTAAAAATCCTGCTTCTCCAGTCCACATTAAACTCAACGTTGCAAATTTTAG CTTCTCCGTTTGTGTCTTGAGTTACTTGAAATCATGTTTTTGTTGGCTCTAATGCCATAACAAACACGCACTGGTCTCCT CGCTGACTTTCTTTTCTTCCCATTTCTTTCAATGTCCCTGTTGGCTCGCAAAAAATCCCTAACAGCTATGAGGGTAGCCG AAGAGATGAGTTAGCCGAAGCAAGTAGCTAGCTGTTTGAGTAAAGTAGCCGGATGAAGAGAAGTCATGCATCTGGACGGG ATTTATGGACAATTATATCAGTCGTTGTTTGACATACACTCAGAATCTATTTTCAAACTATACTCAGAATCTCGGGTTTA TCACGTGAAATATCAAATATGGATCTGATGTGTATCGTCCTCCAATAAGGAAGGTTAATGAAAGAAGGAATAAGAGGAAG GCTGCTGTTTAGCCTTATTCCTGTTATATATTGTTATCTGTGTAATAAAGACTAGCTTAGTATCTAGTCTGTTAATTGGG CAGTTGGGATTCTGCTATATAAATATAGGGAAAGGGTAGTTAGTCAGTTAGGGAAATTGATAGGTAGTTGGGAGAGACTG GACTCTCGAAGTTCTAGAGGAATCTAGGGTTCCATTGTTACAGTTCCATTCTTGTAACCTTGAGCCATGGAATCTCAGTT CTGAGAATCTTGGTTCTGTTCAACTGAATAAGCAATTCCATTTCTTTGTTCTTGAATCCTTGAGGATCCTTCCCTTTAAA ATAGGAATGGTAGTTACACCTTACGAGCCAATCAGTCAAGTCAATACATGGAAGTCTTCCTAGCTGACTAGGAAAGAGAG GGTATTAACAAACCCACGATTATAAGGGTTTGCATGGGACGTACGACGTAGGTTAGTGGTTACGTTCTTGAACAACCGTT GTAGTCAGCCGATCTAGCAATCACTAAGAGCTTTTTAGAGTGTCTTAGGAACCTGCATTGAGGAACATAGTCCCTATCTT GAGGAATCGCTTGTTTAGAGAATCATTAGTTGGTTTCTCAGCCGTCTCACATGGCAACCCGTAGACCTAAATTTATTTGA ACCAACAGTTCCCAATAAATGTATTAGTGTGTCACAACTGCTCGGATTTCTCTAGCTATTTTTGCCTATGTTTGTCAGAG TTGCTTCAAAAATCAAAAGAGAGCATTTATCTTTCAATAAATAGTTGCAGTTTCACTGTTTCAGCTTGAAACAAATCATA AAGAGTTTATAACAAGTGAACTTGCTCTTGATCGCAAGACCTTTGTAAGATACATTTTCTTGTATTCCCCAAACAGCGCT GCACCTAACTCTGTTAACATTTTCTGATTTTATTTGGGGGTTAATTGATTGTTTAGAGAAGGAGCATGGTTGGTTGGTAC ATTTTTCACCACATGCATTTTTATCATGATAGAAAAAAGCGCCAATTTCAGTTGTTTGGTCTGCATAACTTGAAGAAAAT GAATTAATTGTTTAATTTGGAAATCTTTTTCTCCGCCTCTTCATGAAGCTTATCAAATATGTACAAATTATGCATAGCAC TTCAAGTCAGAAGATAGTCAAGATACTTAATTTTTTAATTTGTGCTTTTCTTTTTCATTCTAAATTAGTCTTGTTATTTT TAGTTGGGGCATTTGAACTTTAGATGATTGTTGTGAACCCTAAATAAATGTGCATCAGTGACATTTAAGGCCAGGCACCA GGACAAAAGGAAAAAATAAACACAAATCCTTGGGATACATGATATAGAATAATTACAACATAAGACAACAGCTGATATAT TTCAAATATTTTCATCCCCTACTTTCTTTCTCGACTAATATCTGATTAATGATTCCTTCATTCTTGATGCTGTCATGAAA GTTTGTTTTCTTATGATATGAGGATGTTGAGATGTTTTGTTGATGCAATGAAAAAAATTGTTTATATTTATATGATGATT GTGCTCTACACATGATGTTTGTAGCCATGGTGATGTGCGTATCAACTGGATCTCTGTTACTACCAAAGGAACCACACTTA AGAGTGGAGATATTGTATCAGTTAGTGGAATGGGAAGATTAAAGGTAACTTGCCAAAGCTTAAAAGAAGGTAATGATTTT GTGTATATATATAGTCATTAATGTTTTATTTCATTTTGGTCCAGATAGGAGAAATAAACCCCACAAAGAAAGGAAAATTT GCAGTGGAGCTCATTCGGTATTTGTAGCAGGAACAAGAGCAATGTACGAATTCCTACACATACAGGACATGCTCCTTTAT GCACGAGTAATGATTCATTCATACATCAGTTTCTCTCATATTATTTTTATTCATTTTTCTTCTCATTTATTTGCATTTCC TATCACATCACTTATCATACCACTTATTTCTCTCTTTTCTTCTGATCTCATCAAATGTGAGTGGATTTGAAGTCTCAATG AACTATGGATAGCCAAATGTACAACTGACAAAAAAAAAACTGTACAGACAAAATTGTCCTCTCTTGTTACTCTATTCACT AGATTTAGACCTGGGCAATTATATAGTACAATATTAATTGTGGTGTGAAGCTTTAGAAAATAATTGCTAAGAATCATATT TCCGGAAATATTATGACAAGAATGTTATTATGGAGCATATTTATGAAGTGTTTGGTTAAAAAATTTAATTTCCTGGATTA CTTTCTGATATTCCTTGGAACAATTATAACAAGCATTTGTTTTTTTATGCATATTCTAAGAAATAGATTCTGAATATCTT TAAATATCCTTATTATATATCTATTTAACTTTTTTAATGTACTTATTAAAATGGAATAAAAATTCAATTGATTATTATGT CAATTGTACGATTTTTCTATTGTGAGGAATTGTGTGGGTTGATCACCTGTCAACCAAAATATGTCATCTTTCATATTATC AAGGTTATTTTGCAATATTTGATAGAGAATCTATCTATATATATATAAGTAAAGCACACTTGAACCATTACATTAAATAC ATTAGTAAATATTGCATGTATTATAATGCATTAAGTAATAAAAATTTTATCTTTGTAATAAATATATTAAATAATAAGAT TAAAAACTGAAAAAAAATTTGTATTATCAAAAGCTATTCAACTACCTATATTAAATATTTACAAAAATACCTATATTAAA TAATAATAGTTATAATTTTAAAAAATAACATGAGTTGACAAATGTTAAGAATTAAAATAACATGGGATTTTCTCTGTCAA GCATTTCCTTTAGATCTTCAACTATGGTTGCATCAAGTTCTTCTGCCTTTGCTCCCTTTTTGAAGGAGCGCATTCTATTT TGGATTTCATTTTCTGTATCATGGATATAAAGCTGGCAGAATTTTGGGGTTTCTCCATTTGCATGCAAAATCTTAGTGGA AGTGGAGGGGTTGAATCTCGTTAGATTTGTGCATTTCACGCTCTCTACGAGCTTGCCTTTGTAATTTCGCTCTCTCTAGG CTTGCCTTCTGGGTTTTGGAAAGGCTTAGATGGTGGAAAGATCTTATTCAACCGTGTGAGGAAGAGGAAGATGGGTGGTG AACCCAGATCGTGCGAATGGTCGCCATCAGAGTCGCTTCACTTGGCCAATAGTGGCACACCACAAGCTCACAATTAGGGG TTTCTTTATGTCTTAAGATCTACATATATGTCTTCATCTTCTTCCACTATAACGAGTTAACGACAAAGAACGACGTCGGT ACCACAAGCTTAACGACGATGGTTGTGCGTCAGGGAGAGAGGAAGAATGACAACACGATCTGAGGGAGAGAGAAGAGGTG GTGGTGTCGCGTTTCTAGGAAGGGAAGAAATGGTGGTGTTGCACGACTAGAGAGAAAATGGTGATGGGCTGGTGGCTGCA TGACTTAGGTTTTTTGTGGAGGGGAAGGATAAAGACTTGAGTATTTTGATTCTTAATTTTGAAATTTTCAAAACTTAAGT TCGAAAAACCACTCGTCTTCACGTAGGAGAGTTAGATTCACTTTTAATTTTAATTAATATAAAATATAATTTTATGATTT GACAGAGTTCAATTGGATGTATGTGTAAACTTTGTTTCAACTGTGAGTGCATAGACTTTTTTTTTGTTGAAAGAATAGAC CTTTAATCCTATTGATAGTGTTTAATCGATATGAACTATTAGTATAAAATAGTTTTACCCTGATATCCAATCAATTTATG TCACATAGGAGAGAGTTACATTCATTTTCAATTTTAGTTAAAATAGAAATATATTTTTCTGATTTTGCGGAATTAAATCG GATGTCCATGTAAACTTTATTTACACATCGGTGCACAGACCTTTAATTCTATTGATAGAGTTTAATGAATATGCAACTGA CATCCAATTAATGTATGTCACGTAGAAGAGAGAGTTACATTCATTTTTTTGATCTTTAACTCAAATGTTTACCTTCAAAT TCAGAAACTAATCGTAATTATCCCTCTCAATTAATGACTTTCCTTGGGTTCATCTCGAACTCCAACCCCATTTTTGGTCC TTGAAAGATTTGGAGCCTTTGGATATAGGGCTTTCACGACCTATGACACAGCCAAAGAAAATAAAACTATAGTGTTTTCT TTAGTTAGTTTGTGATTTGTGATCAAACATTCTATGTATTGTAGTGTTTTATTCTTAAGAATGGTAGTAATGGTTTTGGG GCTTACGTGAAATTTATGAGTGATGTTTGTTTACACTCGTAGCTTTAATCAAACGGGTACTCTTGACAAAAAAACAAAAT ACAAAAACCAATCCAAATTAATTAACAACCACTTTGAAAGCCAAATATTTAGCCTGAACTTATTCAAAGAATCCTTAAAT AATTCAAAATGCTTGAACGAATTCTAACATTCTAGTAGTACCCTTCAAGCATACCCACAAAACCCATACCTGCAATGTAT CCCATGTTTACACTTCTTGTTGCACTTGCCACAGTTGTTGTTATTTTTCAATATGTTGGTACAAACTCCACCACAACAAC GCTCTCCATACTTGCACTTCTTTCCACACTTTCCACAATGGTTCATGTCTCCCCTAACATTCACACATTTGTTCTTGCAG CAATTTAGGAGCTCTGTCCCTTTGTTTGCTGAAATCCCATTGCAGATGTTCTTATAATAGGGATTGCAGTGTGCCCCTTT CTTTATTACTGTTGCCAAGAACCTGCTTCTTGATGTCAAATGAGGAAAAGGGGTATCCACTTCATAGTACTCTTTATCAT CACCCTCATCATCATCATTATCATAAGTTAACTGAGTTGAAAAGGCCATTTGGTAGTGAAGGGATAGAGTGATGAGCAGA GAAAGAACAGCAGTGAGTTTGAAAAGTGTTTTGGCCATTGCTTAGAAGGTGAAACTTGAGATTGCCAATGCCAACAAAGA TGTTGTGAGATACCTCTGAATGGTGTGTCTCTAATTTAAGAAGCAGATTTTCTTGTAAAATATTACATGTTGCTTAAATA CTTTTTTTCATTTTATGTCACTTGCTCTGGATTCTACATGGGTTTGAGCATCTTTCTTTATTTCACTTGACTATTTCTGC TTAGTGCTGATATTGTACAAAGTAAACTCCTGATGCTGTCTCTTGGGAATTGACTATGATTAATGAAAATTTTAGTCCAG CTGTAAACGTGCAAATTCTGTTCAACTTAGTAGATCTTGTTTCTTTTCTCTTGCAGAGGCAGAACAAAACAGACCATATT ATTGATAAAGCATTTGTTAGTTTCTCTTTTCACATTAAGGAACTATAATTAATTTTTATCCAAATTATAATAACAATGCT GAACACATCCATAATAGTATCCTTCTTCGTTTCTACTATGTATTAACTTTTGGAAAATGATCAATGGTAACATTTAGCTT CAAAGGCCCGAAATAGAAAGAGACAATGGTATTGTACTGCTTGCCGACTGAAACTTGGATGAAATTTTGAGGTCAACACG TTTTGGAAAATATTGGCCAGCATGTAGAAGCTCTTTGTCAACTATTTGGGGGTTTAATTAAAGATCATAATTTGTCAACG TTAAAACCGACTTTCATATGATTTATTGTATGAGAAAAAGTTTGATTCACCGACGGTGTAAAGTTTTTTTACACCGTCAA CCAATCAATCAAATTGTCATGCTCCTTGAAATCTGATTGGTTGACGGTGTAAAAAAACTTTACACCGTCGGTGCATCAAA ATTAAACTCTTATTGTATTTGTGATTAGAGCATGACAATTCTCATCATGACCAGATTTCCTTGGTGTGAAGCATTGCTGT CTAAGTTGGAAAACGGAAGAAGATTCCACACTAGTTGAT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0153300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGCTGCTACTAGCTTTGGAACTTCATGGTGTCTAAGAAGAGCAGCTCATGCTTTTGCTCTCTCTCATCTTCATAT TCTACGCAGCAATGCCAACCTCTCTTTCCAAACTACCCTCACCGCCTCTCATCTTCTCTCCGTTTCCACTTCTTCAGCCT CAGGGGTCAGCCAGACTGTACAGGCTTTAAAAGGAGAATTTGATGTGTTACTCAAGGGAGTTGGAGAAAGAAGTGTAACA AAAGAAGTGAAGCATATTCTTGAAATGGCTAAACGAGCATCATTAAAACGAGAGGTTCTCCATACAGATTTTCTAACCCC TCCAGTGGTGAAGGAATCTATGCAAATATTGGAAAAATTAGCAGAAGTGAAAGCAATTGCTCAAGGAGGTTACCCACAGG CTGAACGATGTCGGATTTCTGTTGGTCATCCAGATGTACTGACAAGTGATCCAGTAGTTATTTCAGCATTAAGCATCACA GGGAACTTTCAGTTTGAACCTTGCTCTCATGGTGACTTCCTTGGCTCAGTTCTCGGTACAGGAATTGTCAGGGAGAAAGT TGGAGATATCATATTGCAGGGTGAGCAGGGTGCTCAGATACTAATTGTACCAGAACTTGTGGAATTTATTATGTCAACAC TGGATAAGGTTGGTAATGTTTCTGTATCTTGCAGCAAGATACCATTAATTTCTCTTGACTATGAACCACCAAGAACAAGA TCATTCAAAACTGTAGAAGCATCACTAAGAGTTGATGCACTTGCAAGTGCAGGATTTAAGATTTCACGTTCAAAGCTAGT TGACATGATCAGCCATGGTGATGTGCGTATCAACTGGATCTCTGTTACTACCAAAGGAACCACACTTAAGAGTGGAGATA TTGTATCAGTTAGTGGAATGGGAAGATTAAAGATAGGAGAAATAAACCCCACAAAGAAAGGAAAATTTGCAGTGGAGCTC ATTCGGTATTTGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0153300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAAATSFGTSWCLRRAAHAFALSHLHILRSNANLSFQTTLTASHLLSVSTSSASGVSQTVQALKGEFDVLLKGVGERSVT KEVKHILEMAKRASLKREVLHTDFLTPPVVKESMQILEKLAEVKAIAQGGYPQAERCRISVGHPDVLTSDPVVISALSIT GNFQFEPCSHGDFLGSVLGTGIVREKVGDIILQGEQGAQILIVPELVEFIMSTLDKVGNVSVSCSKIPLISLDYEPPRTR SFKTVEASLRVDALASAGFKISRSKLVDMISHGDVRINWISVTTKGTTLKSGDIVSVSGMGRLKIGEINPTKKGKFAVEL IRYL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 1 | 1 | - | – | |
| Phobius | 1 | 21 | 21 | - | – | |
| Phobius | 2 | 13 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 324 | 321 | 3.3E-162 | – | |
| PANTHER | 4 | 324 | 321 | 3.3E-162 | – | |
| Phobius | 14 | 21 | 8 | - | – | |
| Phobius | 22 | 324 | 303 | - | – | |
| TIGRFAM | 79 | 322 | 244 | 4.9E-94 | ||
| SUPERFAMILY | 108 | 310 | 203 | 1.57E-18 | – | |
| Gene3D | 150 | 232 | 83 | 1.1E-15 | ||
| Pfam | 154 | 229 | 76 | 1.1E-13 | ||
| Gene3D | 239 | 299 | 61 | 1.5E-7 | ||
| SMART | 249 | 311 | 63 | 1.9E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 249 | 309 | 61 | 13.285 | ||
| CDD | 250 | 299 | 50 | 1.59964E-9 | ||
| Pfam | 253 | 295 | 43 | 1.4E-7 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | RNA binding | Interacting selectively and non-covalently with an RNA molecule or a portion thereof. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0153300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…