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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0164200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0164200.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pleckstrin-like (PH) and lipid-binding START domain protein; TAIR: AT2G28320.1 Pleckstrin homology (PH) and lipid-binding START domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S5D4|A0A151S5D4_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0164200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:22335591..22347486) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATGCAGGCTGAATGTGCTGGTCTGGAAGAATTTTTAGATTCGATACTCGCACAATACACTTAGTTGATGATGAAAAAT ATTAACTATGACAAAATTCTGAATCTAAAATATATAGCATCTGAAGGGTGGCCGAGTATTGAATGGTTTACATTAAAAGA AAATACCATTAAACCAATTGACAATAGTTGTGGTCGACTAGTGTGCGTGCTATAGCATCATCAGCAAACTTGAGGCAATT AGATGTGTACATATAGTTGCCGTAATTGATCAGAATTTATGTGATTATTTAATAGATAAAGAGGTTGCTTCTCACTCCAA CGAATCTAATTATATAATTGGTGATTCATAGGAGGCCGGTGTTCATCTACTTGAAGCAAAGCTAATTAAACCTGCAGTGA TCTTCTTCATTCTTCAATCTTTTATATTGCGGCGGTTACAGACTTACAGGTTGCTGCGGGAGCAAGTGAACGGGTAGACG AGATGCCATGGCCTCGTGTGTGGTGCGATGGATTTGGGAGATGTTCATGGTGAGTTTCCGAATTAATTTTTCTAGTTAAT TTTTAACTTCTGTAATTGTTTCCTTAAAAACGTAGTTAATGTGGGTGTTAACGTGTGTTGATTGGAATAGAAAAGATTGA ACTATGTGGAAATTTTCATGATGTGTGGTGATTTTTTTTCCCTCAGTCTCATCCTATTTTAGTATTTTTTATGGAAAAGA TGTGATTTAATCGGGATTGGGTTGGGGTTAGAGACTTATAGAGTTTATGTACATGTTTGTACATATAATTTAACTTTTAA GATTAACTAGTGTGTATACGAAGTGTTACCTCCTCACTTACTCCATAGGTTTAATCAGATTAAAAAAACACATCGTAATA AGAGCCGGATTGATTTTATTGTCCAATATTTAAAAAATACATCAATATGTACACTTTGATCTTAGAGATAACCATGATTC 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TGGTGGTGGTGCTACGACATCGGCGCCGTCGACGCAGAGCGATGGAACTAGAATGGAAGGTTGGTTATACCTTATCCGCT TCAACCGTCTCGGACTTCAATTCTCTCGGAAGCGTTACTTCGTCCTCGACGGTCACCTCCTCCGCAGCTTCAAATCCGTT CCTGATTCCACTGACCAGGTTCATTTCCTTCGATTTCTTCCGATTACTATTTTTGTCAATTCAAATTGCATAGATTCGGT GACATTAGGCTTTGGATTCTGCTTGATCAAGTTTGAATGATGATGATGATGTGAAACTTGTTTTTGTTTTTTTCTCTTCA GGATCCTGTTAGAAGTGCAATTGTAGATTCCTGCATTCGCGTCATGGATAATGGGAGGGAGAGTGTTAACAGAAAGGTAT ATCCGGATTCTTTGTTCATTTTTGTGTTCAAGTTGCTGCTGCATGTTGTTTAATGCTATCGTTTTGTGCGTGAAATGCAG GTGTTCTTCATATTCACGCTCTATAACACTTCAAATCACAATGATCAATTAAAGGTGAGATCACAGTTAGGAACCACTGT TGTTTTTATTTTTCCTCAAATTGGGAATTTGCACAAACTTTGAGTTACAAAACATGAGTGTTTTAGCTAGGAGCGAGCCG TCCTGAAGAGGCAGCGCGGTGGATTCAGTCTTTTCATGAAGCGTCTTTAAAGGTATATGGTCTGAAACGTTTTTAGCATG CGGCAGTGGAACTTTTTTTATTTTTAACTGAAGGGTGAAAAGATTGATGTAAACATGTGCAGGGTGCTCCAGAAGCTGTA GGCTGTTCTAAGAGGAGATGGCAATCCTTTAGGTATTGTAAATTAGATTTATATATAATCTACAAACAATTTTTACTAAG AAAAAGCATTGTAGTTGTCTGGATTAACAATTATTTGAGCTGTTTTCTTGATGTATTTATTGCATGATCATTAATTATTT TTCTCGTGTCGTGCTTGCAGACTAAGTGGATCTAGCAGTAGAAGTCAACCGGAATCCGTGGACTGGACGCTTTCTTCTGC CGATGTTATTGCCCCATCACCTTGGACAATCTTTGGCTGCCAGAATGGTATAGTTTATTTCAAGATCTGCTGTTTGAGTT GTTGTTTTATTTTTCTTCTCTTTTTTTAGAAAATTGTTTTACCTAAAAGGCTAAAACTGGCACTTATGTTTTTATGGGTT AACGCAGGTTTACGATTATTCAAGGAAGCAAAAGATAGGGATTCTTATGGAAAGGTTGGCAAAATTTCTTTTCAGTAATT ATTGGTTTATATTTGTAATGCCTATGTCAATTATTGAATATGGTCCTATATCTAGAAATGGGATGATCACCCTGCAATTA TGGCTGTTGGTGTGGTGGATGGAACATCAGAAGCCATTTTCCAGACTTTATTGTCACTTGGTCCATCAAGATCAGAGTAA GTCCATTAAGTGCTTGAGATCTTCTGTGATGCCATTGTTATATTGTAGCACAAACATATCTTCTTATTTGAAGTTCGTAT TTTTTTTTTGTTTTGTTTCGGATGCAACTTTGAATTGGGTTTACAGATATCTTCTCTTAGGATATTTTCATCTTTTTGCT TATTGACTTGGGCTTTTAATTGTGATGGCTAGGATTACACTCTCAGCGCATGTTAGTTCTATACGATTTAACTATATTAT TTTTTATGATTGAAGAAAAGATAAATTTTTATTGTGTAAAATAATGAAAGAAGTATAAGAGCAGAACAAAATTAAATCCA GAACAAAGAAAATAAGAAAATAAAGTTAAGAAGATAGAGAGTCCCACATTCGAGAAAAGGTCACAATTTGAGTGGAACCA AGTAACATTGCAATTGAATTAGGCTTACTAGTCTCCATTTGCCCCATCTGATATAGTCATTAGCCAGTCACCATAGCAAA 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TGGTCTAAACGATGCTGATGATGAGTTCTATGATGTTCCGGAACCATCAGACTGTGACAAGTCAGAAAATGGATGGACGA CTGAATGTAGTCACCAGAAGTCACAGGTAAAAAAAGGAAACCTGTTCAATACAGCTGCTTTTGTTACACTTCAAAGAAAT GAACAATCAACTGTCATAATCGTAATGCAGTGTGTCTTCAATGTTAATGTTGAGGGATTGCTTTAGATATTTCATTCAAT ACATTTTGGCAATGACCAATCTGCCAGAAGTGGTCTTACAAATCTCATTTACTTTTCTTATCAATTGATATACACTGCTT TAGCTCTGAACCTTTTCCAAGACCTAAACTTGTAAAACATTTAAGGTGTTGTTTACTCTGTAATATAAAATTAAGACTCA AGACAGCCAACTATTTCTTCACGGGTTCTCTGATATAACTCTAAAAGGCTTAAGTTTAGGGGGGTAAATGCAAGTCTAGG AGTAGGAAGTGGACTCTTCCACAGATGTGCGTTCTCGATGTGCGTTCTGAGGCACGGATGCATCTGTACATATTTTTAAC TTCATTCCTCATAATGCACCTATTTACTTATCAATATTTTTATGATGCTCGACCGCAGTTGCATACTCTTTTTTTTCTTT TTATCATTTTGCTCAAAGAAATATTGTTAAACTTGGTATTTTGCTTGATTTGGTATGAATTTGAGAATTTCAGGACGCTC GTCCCCAGAAGTTATCTACTGCTGCTAATTTTGTGAAAAGATTGCATGATCTTGCAGGTGATTCATATACTCTTTTATTG TATATGGTGATTATCTCTGATTTCTTCTTTGATTTACAACGCCTAGAAACAATCTGATGCAGTTCAGAAGAGGGGTTATG TGGACTTGCAAGAGATGGTCAGGGATGAGAGTATCCCATGCTCGTACGGATCCACTCTTCCAAAAGATCCTACCTGTACA ATACCTTGCAGTTTGACTGAAGCAGATCCTTCTACTTTCCTGATTCGTGGAGAAAATTATCTTGAAGATCACCAGAAGGT ATAAGCAGAAGTAATGCATTATCACTTTTATGACAATTTTACTGAAAAAAGGGAAAGAAACTACTTTGGTTTTGGTTGTT CCCAGTTCCCACTCGTGCACGCATTTGTCTTCTTTTTCCATTCTCTGTTACTTCAGTAATCTAACTTAAGTTTAATCACA TTATATGCAATTATCTTTTTTCTGTTATTTGGTTTAGCCATTGACTTACTCACTTATTTCAAACATCTGGGGTATGGATT ACTAGGTTAAAGCGAAGGGGACCTTGATGAAATTGGTTGCTGCAGATTGGCTGAGATCTGACAAAAGGGAAGATGACCTT GGTGGCCGTCCTGGGAGCATTGTGCAGGTTGGTTTTAGACTTTCAGATTTTGGTTTATACTATAATTATAATAATGAGAT CTATAATGTAATATGATTTTTATCTTAAAGAATAATCAATTTGATGATTTTTTTCTACGTGCAGAAATATGCTGCACAGG GCGGGCCTGAGTTCTTCTTCATTATAAACATTCAGGTTAAGTAATAATCCTGTGGTTAGGTTTTTCTAATTTTTTGAAGA ATTCTTAGGTTTTTCTAACATAAATTTTAGCATAAAACTAATTTAGGTTTTTCTTTGAAGCAGGTTCCAGGTTCTACTAC ATACAGTCTAGCCACATACTATATGATGACTACCCCTGTGGAGGATACTCCTTTGCTAGAGAGTTTTATCAAGGGTGATG ATGCCTTTAGAAATTCAAGATTTAAACTCATACCATATATATCTAAGGTTAGTAGAAGTAATCAGTGGTCCAATCTGCTC TCTAAGTTGCAGCCAAGTAGCTCCTTTATGTATAGCGGCTGAGAATATTTTCTTCCACCTCCTTTGGTTTTTCATCACAA AATAACATGACAACAAACAAATGACATATCAATCCGTTTTCTTCCTCTTAGGAACCATATAGGATTCTCAAATCATCCAG TTGGTTAAATTCTCTCTCCTCCCTTGCATTTACCCCCTCATCAATTACCTGGCCCCATTTGGGTTTTGTTGAAACATCTT TTTTTGAGAACATGCTTTTTTATTTCTTCCTCCATTCACTGGTTGGCTTGATTTCACTTTAGTGCTCAATTTTAAGAAAT GCTCTCTATATTAGAATCCCTGATCCTCAATATACCTATGTGGTCCACATTATGAAGGCAAAGTCTCAATTATTCTTCAT TTGTTTAGCCTATGGATTTTTAGTGTTTACATTCCTGTTTCAGGGTTCATGGATAGTAAAACAGAGTGTGGGAAAGAAGG CATGCCTAATTGGTCAAGCTTTGGAAATCAACTATTTCCATGGAAAAAACTATTTGGAGGTAAGTTTGGCATAACTATCA ATGGAATAGGAACTTACTAGGAAAATCAAGACGATCAGCATAAATATTTCATGTTTACTATTTTGAGTTGGTGCAGATCA GTATCAGCATATGAAACCTTATATTCTGGTCAGCCTTGATCGGGTCTGCGGAATTTTTTTTTTTCGAAGCAAATGAATGA GTAATGGGTGTTAAGAAAGGATAGGGCTCAATGGATATGCATGATGCATAAAATATTTAACCCTCAATCATCTTTTCATG TAATGTTTTTTTTTTAATAAGCTCTTTTCATGTAATACTTATCCTGAAATCACGGCATCCATTTCAGCTCGGGATTGATA TTGGATCATCAACTGTTGCAAGAGGTGTCGTGAGTCTTGTCCTTGGGTACCTCAACCATCTAGTTATTGAGATGGCATTT TTAATACAGGTACAATGATCTTGTTCTTTTTCTTTCTTTCTAATTTACTTTTGGGTTAAAAGTTGGTGAAACTATATATC ATTGAAAATTCACAGATGTTCAGATTTGAAACAAGATGGGAACAACGGGGATAAATTACATATACTCTTAATTTATACAT GATCTTATGAAAAAGTCTTCTATAATAACAACGCCATCATTTCCAAAAAAAGAAAACACAACGCCAACTGCCTTCTGAAA AAATTTGTTATTTCATGCTAAGTTACTAATAATTGTAATATATCTTGTTCAGGGCAACACACGTGAAGAGCTCCCTGAGT TTCTTCTTGGAACCTGCCGCCTTAACCATCTGGATGCCTCCAAATCAGTTTTGCTGAAGCAGTGATTTTTAACAAGACGC GTAACAAGTACGTTGTGATTTCCAAGTTGTGAATGTAGATAATTGAAAGTAAAATTTTGTATTGTCTCCATAAACTTACT TTCTGAAGCCATATTTATTCAATCAATCTGAATGTTGCAGCAACTTATGTTGCTGTGAGCATTATTAGGATGGATGGTTT GGGGGACGAATCTTGGTAAAATAGAAGTTGCATTCTTTTCATCACAACTGAGAGTTTTTTTTCTCTGACAGTTCGATTTA ATTATTATTCCTTTCGCACCCAGGCAGGGAAACCTCAGAATTTTATTCTTCCGAGAAATTAGATGCATTCTTTTTTTTAT ATATAATTAAGTTTTTGTCTTGAGTTCATAACAATTTCTCGACCTTATTTGCTTAAACGCCGAAGGTTTAAGGGCCCGTT TGGTGCGACGTATAGTATAAGGCCTGATAGTATAAGACCTGATAGTATGAAGCCTGATAGTATAAGCCCTGATAACTTTC TTATACTATCCAGCGTTTGGTCATACTCTGTATAATTTACCATATCGTTCAAGCTAATGCAATTTTATGTTTAGTAAAGT ATTGAATAATTATATATAATAAAAATCAAATATGGAGGTGATTATAACAGTGGTGGCGGTTGTGATGGAAGTGGTGGTAG GTTGGTGGTGGTGGTGGCGATGGTGGCAGGTTGGTGTTGGTGGTGGCAGCGATGGTGGTGGCGACGATAGGGTGGTGGTA AGCGGTGGCAGCTGCGGTAGGGTGGCAGCGATGGTGGAGGGTTGAGGCAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGATAGTGT GGTGGTTGTGGTGCCGGTGGTGGCGATTATGGTGGTGGCGATTATGGTGGTGGCGGCGATAGAGTGGTGGTTGTGGTGTT AGTGGCGGCGGTGGGGCGGTGGTGGTGGTGGTAGGGCGGCGGTGGCGGCGGTGGTGATCGGGTGGTGACGATGGTGGTGG TGACGATAAGGTGGTGGTGGTAAGGCGGTGGCGGCTGCAGTAGAGTGGTGGCGACG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0164200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTTGCATTAGAACTGGTGGTGACGGTGGTGGTGGCGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTACGACATCGGCGCC GTCGACGCAGAGCGATGGAACTAGAATGGAAGGTTGGTTATACCTTATCCGCTTCAACCGTCTCGGACTTCAATTCTCTC GGAAGCGTTACTTCGTCCTCGACGGTCACCTCCTCCGCAGCTTCAAATCCGTTCCTGATTCCACTGACCAGGATCCTGTT AGAAGTGCAATTGTAGATTCCTGCATTCGCGTCATGGATAATGGGAGGGAGAGTGTTAACAGAAAGGTGTTCTTCATATT CACGCTCTATAACACTTCAAATCACAATGATCAATTAAAGCTAGGAGCGAGCCGTCCTGAAGAGGCAGCGCGGTGGATTC AGTCTTTTCATGAAGCGTCTTTAAAGGGTGCTCCAGAAGCTGTAGGCTGTTCTAAGAGGAGATGGCAATCCTTTAGACTA AGTGGATCTAGCAGTAGAAGTCAACCGGAATCCGTGGACTGGACGCTTTCTTCTGCCGATGTTATTGCCCCATCACCTTG GACAATCTTTGGCTGCCAGAATGGTTTACGATTATTCAAGGAAGCAAAAGATAGGGATTCTTATGGAAAGAAATGGGATG ATCACCCTGCAATTATGGCTGTTGGTGTGGTGGATGGAACATCAGAAGCCATTTTCCAGACTTTATTGTCACTTGGTCCA TCAAGATCAGAATGGGATTTCTGTTTTTACAAGGGGAATGTGGTTGAGCACCTGGATGGTCACACCGACATTATTCACAA GCAGCTATATAGTGATTGGTTACCTTGGGGAATGAAACGAAGAGATCTCTTGTTGAGGCGCTATTGGAGGCGAGAAGAGG ATGGAACCTATGTTATTCTTTACCACTCCGTGTTTCACAAGAAGTGCCCTCCCCAGAAAGGCTATGTCCGTGCCTGCCTT AAAAGTGGAGGCTATGTTATATCACCATTCAACAATGGAAAGCAATCAGTTGTGAAGCATATGCTTGCTATTGATTGGAA ATTCTGGAGATCTTATATTAAATCTTCATCAGCATATTCTATAACCATTCGAATGCTTGGGAGAGTTGCTGCATTACGAG AGTTATATAGAGCTAGACTAGGGAATTGTCCTTTGTCTGATTGTTCATCTGGAGAATTGACAAGAAGCAGTAGGCTTCAT CTGAAGGAAGGAAACATCAACTCTGATACCCATGTTCAGGCAGATGGGAACAATTATGATAACTCAATTGGAGAATTAGA ACAAACACAATCAGAGCATGCAAGCCTGGTTGGTCTAAACGATGCTGATGATGAGTTCTATGATGTTCCGGAACCATCAG ACTGTGACAAGTCAGAAAATGGATGGACGACTGAATGTAGTCACCAGAAGTCACAGGACGCTCGTCCCCAGAAGTTATCT ACTGCTGCTAATTTTGTGAAAAGATTGCATGATCTTGCAGTTCAGAAGAGGGGTTATGTGGACTTGCAAGAGATGGTCAG GGATGAGAGTATCCCATGCTCGTACGGATCCACTCTTCCAAAAGATCCTACCTGTACAATACCTTGCAGTTTGACTGAAG CAGATCCTTCTACTTTCCTGATTCGTGGAGAAAATTATCTTGAAGATCACCAGAAGGTTAAAGCGAAGGGGACCTTGATG AAATTGGTTGCTGCAGATTGGCTGAGATCTGACAAAAGGGAAGATGACCTTGGTGGCCGTCCTGGGAGCATTGTGCAGAA ATATGCTGCACAGGGCGGGCCTGAGTTCTTCTTCATTATAAACATTCAGGTTCCAGGTTCTACTACATACAGTCTAGCCA CATACTATATGATGACTACCCCTGTGGAGGATACTCCTTTGCTAGAGAGTTTTATCAAGGGTGATGATGCCTTTAGAAAT TCAAGATTTAAACTCATACCATATATATCTAAGGGTTCATGGATAGTAAAACAGAGTGTGGGAAAGAAGGCATGCCTAAT TGGTCAAGCTTTGGAAATCAACTATTTCCATGGAAAAAACTATTTGGAGCTCGGGATTGATATTGGATCATCAACTGTTG CAAGAGGTGTCGTGAGTCTTGTCCTTGGGTACCTCAACCATCTAGTTATTGAGATGGCATTTTTAATACAGGGCAACACA CGTGAAGAGCTCCCTGAGTTTCTTCTTGGAACCTGCCGCCTTAACCATCTGGATGCCTCCAAATCAGTTTTGCTGAAGCA GTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0164200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSCIRTGGDGGGGGGGGGGGGATTSAPSTQSDGTRMEGWLYLIRFNRLGLQFSRKRYFVLDGHLLRSFKSVPDSTDQDPV RSAIVDSCIRVMDNGRESVNRKVFFIFTLYNTSNHNDQLKLGASRPEEAARWIQSFHEASLKGAPEAVGCSKRRWQSFRL SGSSSRSQPESVDWTLSSADVIAPSPWTIFGCQNGLRLFKEAKDRDSYGKKWDDHPAIMAVGVVDGTSEAIFQTLLSLGP SRSEWDFCFYKGNVVEHLDGHTDIIHKQLYSDWLPWGMKRRDLLLRRYWRREEDGTYVILYHSVFHKKCPPQKGYVRACL KSGGYVISPFNNGKQSVVKHMLAIDWKFWRSYIKSSSAYSITIRMLGRVAALRELYRARLGNCPLSDCSSGELTRSSRLH LKEGNINSDTHVQADGNNYDNSIGELEQTQSEHASLVGLNDADDEFYDVPEPSDCDKSENGWTTECSHQKSQDARPQKLS TAANFVKRLHDLAVQKRGYVDLQEMVRDESIPCSYGSTLPKDPTCTIPCSLTEADPSTFLIRGENYLEDHQKVKAKGTLM KLVAADWLRSDKREDDLGGRPGSIVQKYAAQGGPEFFFIINIQVPGSTTYSLATYYMMTTPVEDTPLLESFIKGDDAFRN SRFKLIPYISKGSWIVKQSVGKKACLIGQALEINYFHGKNYLELGIDIGSSTVARGVVSLVLGYLNHLVIEMAFLIQGNT REELPEFLLGTCRLNHLDASKSVLLKQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 32 | 32 | - | – | |
| Gene3D | 27 | 144 | 118 | 6.9E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 29 | 141 | 113 | 7.28E-12 | – | |
| PANTHER | 32 | 746 | 715 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 32 | 746 | 715 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 33 | 141 | 109 | 9.284 | ||
| SMART | 34 | 143 | 110 | 5.2E-8 | ||
| Pfam | 36 | 139 | 104 | 6.7E-8 | ||
| CDD | 36 | 136 | 101 | 5.16607E-7 | – | |
| SUPERFAMILY | 168 | 350 | 183 | 1.79E-40 | – | |
| CDD | 170 | 349 | 180 | 6.70251E-43 | – | |
| ProSiteProfiles | 174 | 345 | 172 | 23.452 | ||
| SMART | 176 | 378 | 203 | 4.7E-6 | ||
| Gene3D | 187 | 382 | 196 | 1.7E-38 | ||
| Pfam | 206 | 349 | 144 | 1.8E-18 | ||
| Pfam | 533 | 738 | 206 | 4.4E-65 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0164200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…