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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0164200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0164200.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pleckstrin-like (PH) and lipid-binding START domain protein; TAIR: AT2G28320.1 Pleckstrin homology (PH) and lipid-binding START domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4JSE7|EDR2_ARATH Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S5D4|A0A151S5D4_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0164200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:22335591..22347486) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAATGCAGGCTGAATGTGCTGGTCTGGAAGAATTTTTAGATTCGATACTCGCACAATACACTTAGTTGATGATGAAAAAT ATTAACTATGACAAAATTCTGAATCTAAAATATATAGCATCTGAAGGGTGGCCGAGTATTGAATGGTTTACATTAAAAGA AAATACCATTAAACCAATTGACAATAGTTGTGGTCGACTAGTGTGCGTGCTATAGCATCATCAGCAAACTTGAGGCAATT AGATGTGTACATATAGTTGCCGTAATTGATCAGAATTTATGTGATTATTTAATAGATAAAGAGGTTGCTTCTCACTCCAA CGAATCTAATTATATAATTGGTGATTCATAGGAGGCCGGTGTTCATCTACTTGAAGCAAAGCTAATTAAACCTGCAGTGA TCTTCTTCATTCTTCAATCTTTTATATTGCGGCGGTTACAGACTTACAGGTTGCTGCGGGAGCAAGTGAACGGGTAGACG AGATGCCATGGCCTCGTGTGTGGTGCGATGGATTTGGGAGATGTTCATGGTGAGTTTCCGAATTAATTTTTCTAGTTAAT TTTTAACTTCTGTAATTGTTTCCTTAAAAACGTAGTTAATGTGGGTGTTAACGTGTGTTGATTGGAATAGAAAAGATTGA ACTATGTGGAAATTTTCATGATGTGTGGTGATTTTTTTTCCCTCAGTCTCATCCTATTTTAGTATTTTTTATGGAAAAGA TGTGATTTAATCGGGATTGGGTTGGGGTTAGAGACTTATAGAGTTTATGTACATGTTTGTACATATAATTTAACTTTTAA GATTAACTAGTGTGTATACGAAGTGTTACCTCCTCACTTACTCCATAGGTTTAATCAGATTAAAAAAACACATCGTAATA AGAGCCGGATTGATTTTATTGTCCAATATTTAAAAAATACATCAATATGTACACTTTGATCTTAGAGATAACCATGATTC 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TGGTGGTGGTGCTACGACATCGGCGCCGTCGACGCAGAGCGATGGAACTAGAATGGAAGGTTGGTTATACCTTATCCGCT TCAACCGTCTCGGACTTCAATTCTCTCGGAAGCGTTACTTCGTCCTCGACGGTCACCTCCTCCGCAGCTTCAAATCCGTT CCTGATTCCACTGACCAGGTTCATTTCCTTCGATTTCTTCCGATTACTATTTTTGTCAATTCAAATTGCATAGATTCGGT GACATTAGGCTTTGGATTCTGCTTGATCAAGTTTGAATGATGATGATGATGTGAAACTTGTTTTTGTTTTTTTCTCTTCA GGATCCTGTTAGAAGTGCAATTGTAGATTCCTGCATTCGCGTCATGGATAATGGGAGGGAGAGTGTTAACAGAAAGGTAT ATCCGGATTCTTTGTTCATTTTTGTGTTCAAGTTGCTGCTGCATGTTGTTTAATGCTATCGTTTTGTGCGTGAAATGCAG GTGTTCTTCATATTCACGCTCTATAACACTTCAAATCACAATGATCAATTAAAGGTGAGATCACAGTTAGGAACCACTGT TGTTTTTATTTTTCCTCAAATTGGGAATTTGCACAAACTTTGAGTTACAAAACATGAGTGTTTTAGCTAGGAGCGAGCCG TCCTGAAGAGGCAGCGCGGTGGATTCAGTCTTTTCATGAAGCGTCTTTAAAGGTATATGGTCTGAAACGTTTTTAGCATG CGGCAGTGGAACTTTTTTTATTTTTAACTGAAGGGTGAAAAGATTGATGTAAACATGTGCAGGGTGCTCCAGAAGCTGTA GGCTGTTCTAAGAGGAGATGGCAATCCTTTAGGTATTGTAAATTAGATTTATATATAATCTACAAACAATTTTTACTAAG AAAAAGCATTGTAGTTGTCTGGATTAACAATTATTTGAGCTGTTTTCTTGATGTATTTATTGCATGATCATTAATTATTT TTCTCGTGTCGTGCTTGCAGACTAAGTGGATCTAGCAGTAGAAGTCAACCGGAATCCGTGGACTGGACGCTTTCTTCTGC CGATGTTATTGCCCCATCACCTTGGACAATCTTTGGCTGCCAGAATGGTATAGTTTATTTCAAGATCTGCTGTTTGAGTT GTTGTTTTATTTTTCTTCTCTTTTTTTAGAAAATTGTTTTACCTAAAAGGCTAAAACTGGCACTTATGTTTTTATGGGTT AACGCAGGTTTACGATTATTCAAGGAAGCAAAAGATAGGGATTCTTATGGAAAGGTTGGCAAAATTTCTTTTCAGTAATT ATTGGTTTATATTTGTAATGCCTATGTCAATTATTGAATATGGTCCTATATCTAGAAATGGGATGATCACCCTGCAATTA TGGCTGTTGGTGTGGTGGATGGAACATCAGAAGCCATTTTCCAGACTTTATTGTCACTTGGTCCATCAAGATCAGAGTAA GTCCATTAAGTGCTTGAGATCTTCTGTGATGCCATTGTTATATTGTAGCACAAACATATCTTCTTATTTGAAGTTCGTAT TTTTTTTTTGTTTTGTTTCGGATGCAACTTTGAATTGGGTTTACAGATATCTTCTCTTAGGATATTTTCATCTTTTTGCT TATTGACTTGGGCTTTTAATTGTGATGGCTAGGATTACACTCTCAGCGCATGTTAGTTCTATACGATTTAACTATATTAT TTTTTATGATTGAAGAAAAGATAAATTTTTATTGTGTAAAATAATGAAAGAAGTATAAGAGCAGAACAAAATTAAATCCA GAACAAAGAAAATAAGAAAATAAAGTTAAGAAGATAGAGAGTCCCACATTCGAGAAAAGGTCACAATTTGAGTGGAACCA AGTAACATTGCAATTGAATTAGGCTTACTAGTCTCCATTTGCCCCATCTGATATAGTCATTAGCCAGTCACCATAGCAAA 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TGGTCTAAACGATGCTGATGATGAGTTCTATGATGTTCCGGAACCATCAGACTGTGACAAGTCAGAAAATGGATGGACGA CTGAATGTAGTCACCAGAAGTCACAGGTAAAAAAAGGAAACCTGTTCAATACAGCTGCTTTTGTTACACTTCAAAGAAAT GAACAATCAACTGTCATAATCGTAATGCAGTGTGTCTTCAATGTTAATGTTGAGGGATTGCTTTAGATATTTCATTCAAT ACATTTTGGCAATGACCAATCTGCCAGAAGTGGTCTTACAAATCTCATTTACTTTTCTTATCAATTGATATACACTGCTT TAGCTCTGAACCTTTTCCAAGACCTAAACTTGTAAAACATTTAAGGTGTTGTTTACTCTGTAATATAAAATTAAGACTCA AGACAGCCAACTATTTCTTCACGGGTTCTCTGATATAACTCTAAAAGGCTTAAGTTTAGGGGGGTAAATGCAAGTCTAGG AGTAGGAAGTGGACTCTTCCACAGATGTGCGTTCTCGATGTGCGTTCTGAGGCACGGATGCATCTGTACATATTTTTAAC TTCATTCCTCATAATGCACCTATTTACTTATCAATATTTTTATGATGCTCGACCGCAGTTGCATACTCTTTTTTTTCTTT TTATCATTTTGCTCAAAGAAATATTGTTAAACTTGGTATTTTGCTTGATTTGGTATGAATTTGAGAATTTCAGGACGCTC GTCCCCAGAAGTTATCTACTGCTGCTAATTTTGTGAAAAGATTGCATGATCTTGCAGGTGATTCATATACTCTTTTATTG TATATGGTGATTATCTCTGATTTCTTCTTTGATTTACAACGCCTAGAAACAATCTGATGCAGTTCAGAAGAGGGGTTATG TGGACTTGCAAGAGATGGTCAGGGATGAGAGTATCCCATGCTCGTACGGATCCACTCTTCCAAAAGATCCTACCTGTACA ATACCTTGCAGTTTGACTGAAGCAGATCCTTCTACTTTCCTGATTCGTGGAGAAAATTATCTTGAAGATCACCAGAAGGT ATAAGCAGAAGTAATGCATTATCACTTTTATGACAATTTTACTGAAAAAAGGGAAAGAAACTACTTTGGTTTTGGTTGTT CCCAGTTCCCACTCGTGCACGCATTTGTCTTCTTTTTCCATTCTCTGTTACTTCAGTAATCTAACTTAAGTTTAATCACA TTATATGCAATTATCTTTTTTCTGTTATTTGGTTTAGCCATTGACTTACTCACTTATTTCAAACATCTGGGGTATGGATT ACTAGGTTAAAGCGAAGGGGACCTTGATGAAATTGGTTGCTGCAGATTGGCTGAGATCTGACAAAAGGGAAGATGACCTT GGTGGCCGTCCTGGGAGCATTGTGCAGGTTGGTTTTAGACTTTCAGATTTTGGTTTATACTATAATTATAATAATGAGAT CTATAATGTAATATGATTTTTATCTTAAAGAATAATCAATTTGATGATTTTTTTCTACGTGCAGAAATATGCTGCACAGG GCGGGCCTGAGTTCTTCTTCATTATAAACATTCAGGTTAAGTAATAATCCTGTGGTTAGGTTTTTCTAATTTTTTGAAGA ATTCTTAGGTTTTTCTAACATAAATTTTAGCATAAAACTAATTTAGGTTTTTCTTTGAAGCAGGTTCCAGGTTCTACTAC ATACAGTCTAGCCACATACTATATGATGACTACCCCTGTGGAGGATACTCCTTTGCTAGAGAGTTTTATCAAGGGTGATG ATGCCTTTAGAAATTCAAGATTTAAACTCATACCATATATATCTAAGGTTAGTAGAAGTAATCAGTGGTCCAATCTGCTC TCTAAGTTGCAGCCAAGTAGCTCCTTTATGTATAGCGGCTGAGAATATTTTCTTCCACCTCCTTTGGTTTTTCATCACAA AATAACATGACAACAAACAAATGACATATCAATCCGTTTTCTTCCTCTTAGGAACCATATAGGATTCTCAAATCATCCAG TTGGTTAAATTCTCTCTCCTCCCTTGCATTTACCCCCTCATCAATTACCTGGCCCCATTTGGGTTTTGTTGAAACATCTT TTTTTGAGAACATGCTTTTTTATTTCTTCCTCCATTCACTGGTTGGCTTGATTTCACTTTAGTGCTCAATTTTAAGAAAT GCTCTCTATATTAGAATCCCTGATCCTCAATATACCTATGTGGTCCACATTATGAAGGCAAAGTCTCAATTATTCTTCAT TTGTTTAGCCTATGGATTTTTAGTGTTTACATTCCTGTTTCAGGGTTCATGGATAGTAAAACAGAGTGTGGGAAAGAAGG CATGCCTAATTGGTCAAGCTTTGGAAATCAACTATTTCCATGGAAAAAACTATTTGGAGGTAAGTTTGGCATAACTATCA ATGGAATAGGAACTTACTAGGAAAATCAAGACGATCAGCATAAATATTTCATGTTTACTATTTTGAGTTGGTGCAGATCA GTATCAGCATATGAAACCTTATATTCTGGTCAGCCTTGATCGGGTCTGCGGAATTTTTTTTTTTCGAAGCAAATGAATGA GTAATGGGTGTTAAGAAAGGATAGGGCTCAATGGATATGCATGATGCATAAAATATTTAACCCTCAATCATCTTTTCATG TAATGTTTTTTTTTTAATAAGCTCTTTTCATGTAATACTTATCCTGAAATCACGGCATCCATTTCAGCTCGGGATTGATA TTGGATCATCAACTGTTGCAAGAGGTGTCGTGAGTCTTGTCCTTGGGTACCTCAACCATCTAGTTATTGAGATGGCATTT TTAATACAGGTACAATGATCTTGTTCTTTTTCTTTCTTTCTAATTTACTTTTGGGTTAAAAGTTGGTGAAACTATATATC ATTGAAAATTCACAGATGTTCAGATTTGAAACAAGATGGGAACAACGGGGATAAATTACATATACTCTTAATTTATACAT GATCTTATGAAAAAGTCTTCTATAATAACAACGCCATCATTTCCAAAAAAAGAAAACACAACGCCAACTGCCTTCTGAAA AAATTTGTTATTTCATGCTAAGTTACTAATAATTGTAATATATCTTGTTCAGGGCAACACACGTGAAGAGCTCCCTGAGT TTCTTCTTGGAACCTGCCGCCTTAACCATCTGGATGCCTCCAAATCAGTTTTGCTGAAGCAGTGATTTTTAACAAGACGC GTAACAAGTACGTTGTGATTTCCAAGTTGTGAATGTAGATAATTGAAAGTAAAATTTTGTATTGTCTCCATAAACTTACT TTCTGAAGCCATATTTATTCAATCAATCTGAATGTTGCAGCAACTTATGTTGCTGTGAGCATTATTAGGATGGATGGTTT GGGGGACGAATCTTGGTAAAATAGAAGTTGCATTCTTTTCATCACAACTGAGAGTTTTTTTTCTCTGACAGTTCGATTTA ATTATTATTCCTTTCGCACCCAGGCAGGGAAACCTCAGAATTTTATTCTTCCGAGAAATTAGATGCATTCTTTTTTTTAT ATATAATTAAGTTTTTGTCTTGAGTTCATAACAATTTCTCGACCTTATTTGCTTAAACGCCGAAGGTTTAAGGGCCCGTT TGGTGCGACGTATAGTATAAGGCCTGATAGTATAAGACCTGATAGTATGAAGCCTGATAGTATAAGCCCTGATAACTTTC TTATACTATCCAGCGTTTGGTCATACTCTGTATAATTTACCATATCGTTCAAGCTAATGCAATTTTATGTTTAGTAAAGT ATTGAATAATTATATATAATAAAAATCAAATATGGAGGTGATTATAACAGTGGTGGCGGTTGTGATGGAAGTGGTGGTAG GTTGGTGGTGGTGGTGGCGATGGTGGCAGGTTGGTGTTGGTGGTGGCAGCGATGGTGGTGGCGACGATAGGGTGGTGGTA AGCGGTGGCAGCTGCGGTAGGGTGGCAGCGATGGTGGAGGGTTGAGGCAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGATAGTGT GGTGGTTGTGGTGCCGGTGGTGGCGATTATGGTGGTGGCGATTATGGTGGTGGCGGCGATAGAGTGGTGGTTGTGGTGTT AGTGGCGGCGGTGGGGCGGTGGTGGTGGTGGTAGGGCGGCGGTGGCGGCGGTGGTGATCGGGTGGTGACGATGGTGGTGG TGACGATAAGGTGGTGGTGGTAAGGCGGTGGCGGCTGCAGTAGAGTGGTGGCGACG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0164200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCCTCGTGTGTGGTGCGATGGATTTGGGAGATGTTCATGGTGAGAACTCAATTTCAAAACAACAGAATGAGTTGCAT TAGAACTGGTGGTGACGGTGGTGGTGGCGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTACGACATCGGCGCCGTCGACGCAGA GCGATGGAACTAGAATGGAAGGTTGGTTATACCTTATCCGCTTCAACCGTCTCGGACTTCAATTCTCTCGGAAGCGTTAC TTCGTCCTCGACGGTCACCTCCTCCGCAGCTTCAAATCCGTTCCTGATTCCACTGACCAGGATCCTGTTAGAAGTGCAAT TGTAGATTCCTGCATTCGCGTCATGGATAATGGGAGGGAGAGTGTTAACAGAAAGGTGTTCTTCATATTCACGCTCTATA ACACTTCAAATCACAATGATCAATTAAAGCTAGGAGCGAGCCGTCCTGAAGAGGCAGCGCGGTGGATTCAGTCTTTTCAT GAAGCGTCTTTAAAGGGTGCTCCAGAAGCTGTAGGCTGTTCTAAGAGGAGATGGCAATCCTTTAGACTAAGTGGATCTAG CAGTAGAAGTCAACCGGAATCCGTGGACTGGACGCTTTCTTCTGCCGATGTTATTGCCCCATCACCTTGGACAATCTTTG GCTGCCAGAATGGTTTACGATTATTCAAGGAAGCAAAAGATAGGGATTCTTATGGAAAGAAATGGGATGATCACCCTGCA ATTATGGCTGTTGGTGTGGTGGATGGAACATCAGAAGCCATTTTCCAGACTTTATTGTCACTTGGTCCATCAAGATCAGA ATGGGATTTCTGTTTTTACAAGGGGAATGTGGTTGAGCACCTGGATGGTCACACCGACATTATTCACAAGCAGCTATATA GTGATTGGTTACCTTGGGGAATGAAACGAAGAGATCTCTTGTTGAGGCGCTATTGGAGGCGAGAAGAGGATGGAACCTAT GTTATTCTTTACCACTCCGTGTTTCACAAGAAGTGCCCTCCCCAGAAAGGCTATGTCCGTGCCTGCCTTAAAAGTGGAGG CTATGTTATATCACCATTCAACAATGGAAAGCAATCAGTTGTGAAGCATATGCTTGCTATTGATTGGAAATTCTGGAGAT CTTATATTAAATCTTCATCAGCATATTCTATAACCATTCGAATGCTTGGGAGAGTTGCTGCATTACGAGAGTTATATAGA GCTAGACTAGGGAATTGTCCTTTGTCTGATTGTTCATCTGGAGAATTGACAAGAAGCAGTAGGCTTCATCTGAAGGAAGG AAACATCAACTCTGATACCCATGTTCAGGCAGATGGGAACAATTATGATAACTCAATTGGAGAATTAGAACAAACACAAT CAGAGCATGCAAGCCTGGTTGGTCTAAACGATGCTGATGATGAGTTCTATGATGTTCCGGAACCATCAGACTGTGACAAG TCAGAAAATGGATGGACGACTGAATGTAGTCACCAGAAGTCACAGGACGCTCGTCCCCAGAAGTTATCTACTGCTGCTAA TTTTGTGAAAAGATTGCATGATCTTGCAGTTCAGAAGAGGGGTTATGTGGACTTGCAAGAGATGGTCAGGGATGAGAGTA TCCCATGCTCGTACGGATCCACTCTTCCAAAAGATCCTACCTGTACAATACCTTGCAGTTTGACTGAAGCAGATCCTTCT ACTTTCCTGATTCGTGGAGAAAATTATCTTGAAGATCACCAGAAGGTTAAAGCGAAGGGGACCTTGATGAAATTGGTTGC TGCAGATTGGCTGAGATCTGACAAAAGGGAAGATGACCTTGGTGGCCGTCCTGGGAGCATTGTGCAGAAATATGCTGCAC AGGGCGGGCCTGAGTTCTTCTTCATTATAAACATTCAGGTTCCAGGTTCTACTACATACAGTCTAGCCACATACTATATG ATGACTACCCCTGTGGAGGATACTCCTTTGCTAGAGAGTTTTATCAAGGGTGATGATGCCTTTAGAAATTCAAGATTTAA ACTCATACCATATATATCTAAGGGTTCATGGATAGTAAAACAGAGTGTGGGAAAGAAGGCATGCCTAATTGGTCAAGCTT TGGAAATCAACTATTTCCATGGAAAAAACTATTTGGAGCTCGGGATTGATATTGGATCATCAACTGTTGCAAGAGGTGTC GTGAGTCTTGTCCTTGGGTACCTCAACCATCTAGTTATTGAGATGGCATTTTTAATACAGGGCAACACACGTGAAGAGCT CCCTGAGTTTCTTCTTGGAACCTGCCGCCTTAACCATCTGGATGCCTCCAAATCAGTTTTGCTGAAGCAGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0164200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASCVVRWIWEMFMVRTQFQNNRMSCIRTGGDGGGGGGGGGGGGATTSAPSTQSDGTRMEGWLYLIRFNRLGLQFSRKRY FVLDGHLLRSFKSVPDSTDQDPVRSAIVDSCIRVMDNGRESVNRKVFFIFTLYNTSNHNDQLKLGASRPEEAARWIQSFH EASLKGAPEAVGCSKRRWQSFRLSGSSSRSQPESVDWTLSSADVIAPSPWTIFGCQNGLRLFKEAKDRDSYGKKWDDHPA IMAVGVVDGTSEAIFQTLLSLGPSRSEWDFCFYKGNVVEHLDGHTDIIHKQLYSDWLPWGMKRRDLLLRRYWRREEDGTY VILYHSVFHKKCPPQKGYVRACLKSGGYVISPFNNGKQSVVKHMLAIDWKFWRSYIKSSSAYSITIRMLGRVAALRELYR ARLGNCPLSDCSSGELTRSSRLHLKEGNINSDTHVQADGNNYDNSIGELEQTQSEHASLVGLNDADDEFYDVPEPSDCDK SENGWTTECSHQKSQDARPQKLSTAANFVKRLHDLAVQKRGYVDLQEMVRDESIPCSYGSTLPKDPTCTIPCSLTEADPS TFLIRGENYLEDHQKVKAKGTLMKLVAADWLRSDKREDDLGGRPGSIVQKYAAQGGPEFFFIINIQVPGSTTYSLATYYM MTTPVEDTPLLESFIKGDDAFRNSRFKLIPYISKGSWIVKQSVGKKACLIGQALEINYFHGKNYLELGIDIGSSTVARGV VSLVLGYLNHLVIEMAFLIQGNTREELPEFLLGTCRLNHLDASKSVLLKQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 30 | 54 | 25 | - | – | |
| Gene3D | 50 | 167 | 118 | 7.3E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 52 | 164 | 113 | 7.56E-12 | – | |
| PANTHER | 55 | 769 | 715 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 55 | 769 | 715 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 56 | 164 | 109 | 9.284 | ||
| SMART | 57 | 166 | 110 | 5.2E-8 | ||
| CDD | 59 | 159 | 101 | 6.35896E-7 | – | |
| Pfam | 59 | 162 | 104 | 7.1E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 191 | 373 | 183 | 1.92E-40 | – | |
| CDD | 193 | 372 | 180 | 1.02129E-42 | – | |
| ProSiteProfiles | 197 | 368 | 172 | 23.452 | ||
| SMART | 199 | 401 | 203 | 4.7E-6 | ||
| Gene3D | 210 | 405 | 196 | 1.7E-38 | ||
| Pfam | 229 | 372 | 144 | 1.9E-18 | ||
| Pfam | 556 | 761 | 206 | 4.7E-65 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Lipid binding | Interacting selectively and non-covalently with a lipid. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0164200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…