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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0261300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0261300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; TAIR: AT4G31530.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O80934|Y2766_ARATH Uncharacterized protein At2g37660, chloroplastic; TrEMBL-Plants: tr|I3SSY2|I3SSY2_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0261300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:47752223..47765259) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGGCACAACGAAAATGACTTTTGAGGTCAGGTCACCACTTAATTTAACAGAAATAAAACAAAAAAACTTGTGGTGTCTAA TTTTCAATAAATTTCATTCAATTACAGGTGGGAGTGGGATTGTGGTGCCTGCAGCCTGTAGATGCGTCTGCGTGCTCCAT TTCATGGCTTGCTCAACCGCTACACTCCCTTCGGCTTTCACCCAATTCCAGAGTCTTCCACCGCGTCACGTTTTCATCCC CAAACTCCGTATCAGAATCGCCTCCGTGTCGAAACAACGGAGATTCAATTGTAAGCGCGTTGAAGTGAAAGCTGTTTCAA CTGATCTTCAAAATGGTGCTATCAGTGGTGAAGTGAATGAAACTGGAAGTTCGGAGTTGAAGAAGGATAGGCAAACTAAT CAATCATCCTCAAAATTGGTCCTCGTTGTTGGTGGCTCAGGAGGTGTTGGTAAGTATCCATTCATTTATCTCCTCCCTCA TATTTTACTGCATTATTGGCAAACTGTTTATTTTGTTTTTAAATGAATAATTTGTTCTTTCAAGTTTTCTCACATAACTT TGGTTAAAAAGGGTAAGCTTAATTAGTATGAGTTGAGTTTTATGCCATCATACAATTAAAGTTTATGAATTTGCCATGTC ATAATTAGTTCATGGATGATGTTTTACTCCTCTATCTTTTCCACCCCACCTTGGAAGAATGAGAATAGAGAAAAGAAAAA TAAGTGAATGTTATGTGATGTGATAGGAAATATAGAGAAAGATTGAAAAAAAAAATATCATGCTAAAGACTAATTTGACC ATTAACTCTTAAAAAAACTTTGATCTTTTCTATTTATTAATTTAGTCATGTAAACTAAGTCAAAAACTCATATAGCAGTC TAGCCTATTTCTATTCCTAATTATATAAACTAATTCAAATAAACATTTGTTTACATTTACGTTTATTAAAAAAACTTGTT 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GCCTTTGACTTTTGTGATAAAATCAATAGGCTTGCAAGAAAGTAGAATTTCTCTTACTGGTAATTTGTGTTAAGGCCCTT TTAAAGTTTTAATAGAGGTTATATTAATCTTTAAGACATTGGTTTGGCCTATCTATGTTAGGTTATTAAGACTTCTTATT TCAACTTCAAGAGTAGAACCAAATGAGGGATTAACTAAAATTTTGGAAATCACTTATATTTATATTTTTATTTGATTTCA GTTGCTAGTTTTCTGTTGGCCATTCTTGATTCAAGATTTGGTTTCATTATGTCTAGTTACTACTGTGCTCCGAAGCATGT AATTAGAATCTTGTCGAATTTATCCTGGTCATGATAATTGATAACTAAGACTTAGAATGTGTATTCCTGCAACTGCAAGA AGTGATAAACTAACTAATGGCCTGCAGGAGGGGAAGGTGGAGACTAGAGGAGTTCTTAAATTAGCTAAATTTGAATTCAG CATACATTTAGGCTTAGGTGGATACCGAATTGTACCCACCAGAGATCTGTAACTTTGAAATAGATCATGAATCGTTGATT CCTTTAAAAGAAAAACAAAGAGCAAGGTATTACTGGCGTGATGTCCCTTAAACCCAGATCAAAGGAGAACCCAGGACCCA GGTTAGAAGAGACATAATGATTACTGAACTGCTTTACTAAGAAGAGAAGCTGGTCTCTTCTGCCTTATACTAACTGATCA ACTAACTGACTTCACTTGCTTTCTCTTCTACATTTTAGATTCATATCCTACCTTTGCTACTGCATTTAGAGGGATAACTA ACCAACTCTAACTAATACTCTTAACAGCTTTAACTAACAAGGCCAAACTTTTTAAATATTAATTTTAACTTTATAAGTGT TTATAAATGTACCTTTAACTAACATTTTGTGTAATATAACTCAATGTAACTATGCAAAGTCATATTTCATAAGGAGCTAA 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ATTCCTCTCTCATCTTTCTCTCTAACCGACTCATTAACTAACTAACTAGTATCCTAACTAGCCCTCACTAACAGATACCT GTCAGTTTAAGAGATGAGGAATGAACGCTAAACAAATAGTAATAGAAAAACACTAAAGAAGCACACAAAATTATCTAAAC TTACACTTAAGGTCAATTATCACAATTCCTACTAAATTCACATAACTCCCCATTCGTAAAACTCTTAGTCACTCAAAACC ACCATCTAACTGCTCACAATTCGAAGCAAAATATAACAGTAATCACTGCTCTATAGTTGCAATGGAAGCAGGTAGGGTTT TTGGGTTGCTAAAAGACTCCTAGATCAAAAGTTCTGATACCAACTTGAAAGAAATTAAAGATGAATGTTTTTTAATCATA CATTGTAGAAGTGATTTACATAAGATATATGGAGTTATCTTCATTGCTACTGTCCTATATCAGAGCTAGGCTACAAACTC TCCTCATTAAAGAATTTAAAGCATGCAAGTTGTTGGATCTTAGGTGGCTTGTTTGTTGTAAAACTGAATAACAAGCTGTT TCTGCATGTACTACTATGTCAGCGCTTCATGAAACACGTCTGTTACAATGTTTTCACTGTGTATGTATTCATTGATTGTA TAAGCCGTTAGTTTGCGTTTTGGAAATGACTGTTTGAGTAGAAACTGATCACACCACACACACAAAGGGAAATAATGTTA CATCCTCACATAATTTACTTAGGTGAATAGGGCTTTTTCTCTTGGATGTTTTTATTATGTCCTTACATGTGAAATAGCAT TAGAATGTTAACTCTTGGCTAGTGAATTTTGTTTTAAGTTTTAGAAATTTGGTAACGAGCTTTCAGGAGATAAACTAGTG GGAGAGGCGAGCAGAATTGTGGTTGCTGAAGCTTGCATACAGGCACTAGATCTACAAGTCACTGAAAACCAAGTATATGA 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CATAGCATAAAATCTTTCAGTTGGTCCCCCATCACGTAAACTGAGGTAACCGTGTTGGTCGATATTCCCTTTGGTCGTCC ACTCGTCCTATCCTTATGCATTGCATGGTGAGCAGCCAGGTGTTCTTGTTCGTTGCCTTCAAGCTCTTCCACCTCCTCAA CTTGGACTAGGCATCCAATAGTGTCTAATCGCTCGACATCATCCTGCCTTGATCCCTTTCCCTATGGACATAGTTTTCGA GATGTCTATCTCTGATAAAATAATTCATGTTGTGTCTGTAGTTGTTGTGTAAAGTATAGTTCTTGCTTCAGTCTATCAGC CCCTTCTTTCTAGTGTGTAGCAGCTTCAAAACCCGGACAAATGTAGCGGTGAAAACCTCATTGTAGATCATGAATGGCGT GAAAGTGAAGGGAGTGTAAGAACGAGTAAACTTCTCTATTCTTTTTATCAAACAATAAACCCTAGTTTAAAGATTCAATA TGTAGCTCATAACCTTTACTCGATTTTTTTTACTCAAATGAATAAACTGTTGTTCTATTTTACATAGCTTTCATTGATAA TCACACAAGTAACATACATAACATAACGTTTTATTTGGTATATATATAAATGAAATTGTGAAAAATGTAAAAGTTAATCA ACGATTACACGTTATACAAGACAACATCTTGTTAAGGAAGTTTCTGGAATTGGATGGTGCATGTGCGCTAGCACAATCGG CACATTCTACAATTTCAGATTCATCAGCTCCATTTTGCCTTGCTTTCTCACACTCATACAAGAATGTCTTAAATGCATCT TCAACATATTTAGCCGCGTCTGAAACACTCATGTTCTCAGTTAGCTTGTTGGGATATATACTCTTTCTATGATCCCCATT TAGAGTAGCTGCCAATTGTACCAACTCTTCCTGAAACTCACTCAACTTAGCCTCTTCATTAGCTGCTGCCTCCCGTAGTT TTATTGGGTTAGGCAATGTCTCTGCAATTTTGGAAACTTAAATGGTTAACGAATTGATGGGACATTCTATCCATTGTAAT TCAAGGGTCTGTTTCATTACTGTTTTATAAAACTATTTTCAGTTTTTAAAAGCCAAAACAAAACAAATTTCATCATGGTA AAAACTATTTTTTTAAAAATTGGTTTCTTTTTCAATTTTAAAATTGAAAAACCAAAATATCTCAAAATATGTTTCCTCTT TCTGATTTTAGTTTTCAAATCAAAGTTTTATCATTTTTTAAAAACGTGTGCTCAGTCATAAATTATAGCTGGTAAAAACA GTTTTTTTTTTCTTTTTTTGAAAAAGGGATTTTAAAAGTTATTTCTAAGAACAGTTTTTAAATTCAGAATAATAATAATA ATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATAGCTGAAAAAAAGAAAATGGATAAGGTGAACTATTTTAAAAGCTATTG ACTTGGATCAACATATCTAACCGTTAGATATAATATTAAATAAATATATCTAACAGTCAAATATGGTGGTAACCGTTAGA TATAATATTAAATAAATATATCTAACAGTCAAATATGGTGGTTCATCTGTGGACCACTTTTTAAAATGATTTACTGCATC CTTGAAACGAAAGCATAAACAAGAGATACCTGGACAATCAGTTCGTGGGCTGCTTCGAGTTAAAAGTCCCTCAAATGTTC CAGCCCATGCATCTCGCTTTGTCAAAAATTTGGGTAGATTGAATATTTTCTTAACGGTTGCTGGAATAGAAGAATGCTCA TATTGTGATGTCGGGAATGGTCCAGAAGGCTCGTGCAAAACTGTATACATATATTTGATCAATGATTAAGTAGTAATGTT AGGGTCTTAAGATATGAATAAATTACTAAAAAAAATTCATTAATATGTTTATGTTAAGATATCAAATTAAAATAAAGTAA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0261300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACTTTTGAGGTCAGGTCACCACTTAATTTAACAGAAATAAAACAAAAAAACTTGTGGTGTCTAATTTTCAATAAATT TCATTCAATTACAGGTGGGAGTGGGATTGTGGTGCCTGCAGCCTGTAGATGCGTCTGCGTGCTCCATTTCATGGCTTGCT CAACCGCTACACTCCCTTCGGCTTTCACCCAATTCCAGAGTCTTCCACCGCGTCACGTTTTCATCCCCAAACTCCGTATC AGAATCGCCTCCGTGTCGAAACAACGGAGATTCAATTGTAAGCGCGTTGAAGTGAAAGCTGTTTCAACTGATCTTCAAAA TGGTGCTATCAGTGGTGAAGTGAATGAAACTGGAAGTTCGGAGTTGAAGAAGGATAGGCAAACTAATCAATCATCCTCAA AATTGGTCCTCGTTGTTGGTGGCTCAGGAGGTGTTGGGCAGCTAGTAGTAGCATCACTGCTTCAGCGGAACATCAAGTCA CGCTTGATACTCCGGAATCCTGAGAGAGCCACGGCACTGTTTGGGGATCAAGATAAGGAGACATTGCAGGTAGTCAAAGC TGACACGCGGAAGCAGGAAGATTTGGATCCTTCCATATTCGAGGGAGTCACACATGTGATTTGCACCTCAGGAACAACAG CTTTTCCTTCCAAGCGGTGGGAAGATGACAATACACCAGAAAGGGTTGATTGGGTGGGAGTGAAGAATCTAGTATCTGCA TTGCCTTCCTCAGTGAAGAGAGTTGTTCTGGTGTCATCAATAGGTGTGACCAAGTATAATGAATTGCCATGGAGCATTAT GAACCTATTTGGCGTCCTGAAGTATAAGAAGATGGGGGAGGATTTTCTTCAGAATTCTGGCATTCCATTTACCATAATAA GGCCCGGAAGGCTGACAGATGGACCATACACTTCATATGATCTCAATACTTTACTCAACGCGACAGCTGGACAACGACGC GCAGTCCTTATAGGTCAAGGAGATAAACTAGTGGGAGAGGCGAGCAGAATTGTGGTTGCTGAAGCTTGCATACAGGCACT AGATCTACAAGTCACTGAAAACCAAGTATATGAAGTTAGCTCTGTTGAGGGAGAAGGTCCTGGAAATGAAGCTCAGAAGT GGGAAGAACTATTTCAGGCTGCGCAGGACTGCTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0261300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTFEVRSPLNLTEIKQKNLWCLIFNKFHSITGGSGIVVPAACRCVCVLHFMACSTATLPSAFTQFQSLPPRHVFIPKLRI RIASVSKQRRFNCKRVEVKAVSTDLQNGAISGEVNETGSSELKKDRQTNQSSSKLVLVVGGSGGVGQLVVASLLQRNIKS RLILRNPERATALFGDQDKETLQVVKADTRKQEDLDPSIFEGVTHVICTSGTTAFPSKRWEDDNTPERVDWVGVKNLVSA LPSSVKRVVLVSSIGVTKYNELPWSIMNLFGVLKYKKMGEDFLQNSGIPFTIIRPGRLTDGPYTSYDLNTLLNATAGQRR AVLIGQGDKLVGEASRIVVAEACIQALDLQVTENQVYEVSSVEGEGPGNEAQKWEELFQAAQDC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 134 | 134 | - | – | |
| PANTHER | 118 | 382 | 265 | 1.9E-108 | – | |
| PANTHER | 118 | 382 | 265 | 1.9E-108 | – | |
| Gene3D | 132 | 383 | 252 | 1.3E-52 | – | |
| SUPERFAMILY | 132 | 361 | 230 | 8.41E-35 | ||
| Phobius | 135 | 154 | 20 | - | – | |
| Pfam | 140 | 348 | 209 | 2.0E-29 | ||
| CDD | 151 | 361 | 211 | 1.27556E-48 | – | |
| Phobius | 155 | 384 | 230 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0261300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…