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LotjaGi3g1v0263000.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0263000
Transcript ID LotjaGi3g1v0263000.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like protein kinase; TAIR: AT1G53430.1 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase; Swiss-Prot: sp|C0LGG8|Y5343_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430; TrEMBL-Plants: tr|I1LV96|I1LV96_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0263000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:48716126..48754669) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTGGCTATTATTGAATAAAATCCATTTTGCTCTAAAAAAAAAAAGAAATAGAAAAAAAAAAAACACAAAAACCGGTTCA GGGAAGAATTGGGTGGCTCAACCCGGGTCTCTCTCATGTTCGTCTTCTTCTGGCAACCTAAATGGAACGATGTTGGGCAG AGAAGTGCTGTTGAGCTCGATAGAAGCTGGAGCTTCTCCTACCAGCAATAGGGGAAGACCTCGTAAAAATACCCCCACTC ATATCACTCCTTCTACTTCTTCTACATCTGCGTCCCAAGAGGATACTGCAGCAGTGAACCATATGGCGTGATGACGAGAG CCAGAAGTGCCCTGCTGATGGGGAAAAGGTTGGTTGTGATCTATGATTGCACGGTTGATTTCACTCTAAGAGATATATCA AGACAAATAGCAGCTCGAACCATCTAAGCTGCTGTGGGCATGGACTTTGAGGCTGTATATGCAGTTGGTGCAGCTGGAGG GTTATTTACTATGTGAAAAAACGGCTCTTTTTCAATTCTGCGGGTAAGTAAAAATCCAAGATGTTTACTGCTTACTGTTC AGTTCCCACATGTGAATAGTCCATGCTTGGTGGTGTAGAAATTATTATTCATGGAGGGGTAGTGATATTAGGAGGTGACT TTAATGCAATCCTTAATGATGGTGAAAGGAAAGGCAATGACACTTTTTCAAGCACTTTGTACAGGTCCATGAACTGATTG ACTTACCCATGGTAAATGGAGGGCTGTGGAGTAAGTTGGATAAATGGCTTATGAATGGTGAAGCCATTTTGCTGATCAAT GGTGCCTCTCAAGTTGCCGAGGATTGGTGTGTCTCGGTTGACAAAGCGCTCTCCCTAACATAGGGATCCAATGTTTTTGG CCCCAAGCCATTCTGTTTCTTTAACTACTGGTTTCTTGAAGTTGGGTTTAAGAATTTGGTTGAGGAGTGGTGGTGTTCGG 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GCTAAACCTGGCTTGTTGCAACCTTTGCCTATTCCAGGTGGCATATGGCAAAGTATTGCCATGGACTTCATTGACAAGCT GCCACTGTCCCATGGAAAGGAGACTATTTGGGTCATAGTGGATAGGCTGAGCAAATATGCTCATTTTATTCCTTTATCTC ACCCTTATACAGCTCCAAAACTTGCTGATATTTTTCTGAAGGAGATCTATAGACTACATGGTGCTCCTGCTAACATTGTT AGTGATAGGGACCCTATTTTTACCAGTACCTTCTGGTCTTAACTGAACCTAAGTATTACCTAGGTTTTTGTTGGACTTAG AATCGCAAGCACAATTATTGTTGTAGGGTGGGCAGTGTTTTGGCTTAGTTGTAGGTGCTGTGTATTTCAAAAATGCCTTT TTTATTTTATGGACTTGTAGCACATGCACTTATATACTACATATGTGCTGTTCAACTTACCAATGTGGGTATTTATCGTT TAACATTCCCTAGAGTCCAACTGGATTAGTCTTATTGGACTTGCTTAATTTTGTTTGGACTTGTACTCAAGCCAAACATC TGAGACCATGTGTGGGCCTGTGCTCCTTATGTTTGAACTTGAGTCTCGAAGACCCATGACATAACATATTAATTGATAGT TTTTTTTTTCTTTTTATGATTGAGCTCATTCTCTCTTTTTCTTGTTTTTTTCTTTTTGGACCATGGTAGCTCAAATTAAT TTGTGGACTGTTGCACTGTCAAATAGTTTGTCTTACTAAATTGGCATATAAGTTTTGCTTCCCTTTCCTTCAAGCGAAAT TTCAAATTTCTGCCATGGCCTAGGTATGAATTTTTTTGGTTACAAGCCTAGGTATGAATTTGATTGCATGACTTGCATCT GGCAAACTCTGTTAGACAGCATTTGGATTTCCTATCCAACAATGCCACTGTGTTTTTTATAATTTATACTCTTGTAAATG TAATGATGTGGAAGTTACCCAACAAATTTCTCTGATTTTTTTTCTTAAACCAGCAGAGCTAAGAGGTTTAGATCTTCAAA CTGGCTTATTCACCTTACGGCAAATCAAAGCAGCAACTAACAACTTTGATATTTCTTTTAAGATTGGAGAGGGAGGGTTC GGTCCTGTTTACAAGGTATTCCAGACGATCTTTGCTTTTATTTGAACATAATTTAATCTAATATTGCTGTTACATTTTTC AACTTCCAAAATTAGAAAAAATAGTATAAATGCCAATCCTTGAAATGCAGGGTGTTCTTTCAGATGGCACAGTAGTAGCA GTTAAGCAGCTTTCTTCTAAATCAAGGCAAGGAAATCGTGAGTTTGTAAATGAGATTGGCATGATTTCTGCTTTGCAACA CCCATGTCTAGTTAAGCTCTATGGATGTTGTATGGAGAGAGATCAGTTGATGTTGATATATGAATACATGGAAAACAATA GCCTAGCTCGTGCGTTGTTTGGTAATTTTTTTTCTCTAATGACAAGTTTGGTTGCTCTTTTAGTAATTTTAATCTTTAAT CTTGTAAACAAAGCATATATATGCATCACCGTATTATTATGTTGTCTGATTTCTATGATAATTACAAATGAAGCCCAAGA AAAATGTCAATTGAAGTTGGACTGGTCGACAAGGAAGAGGATTTGTGTTGGTATTGCTAGAGGTTTGGCATACCTCCATG AAGAATCAAGGCTAAAGATAGTTCACAGAGACATCAAGGCCACTAATGTGTTATTGGATAAAGATCTCAATCCAAAGATA TCTGATTTTGGTTTAGCCAAGCTCAAAGATGACCGCTATACCCATATAACCACCAGAGTAGCTGGGACTTAGTAAGCTCT CGTATATTTACTTCTTTTTTTTGTGAAATTTGTTTTATGATATATATGATTTTGTATTTGTGATTTCGTTGTGAAGAAGA CGGAAAGAAAAGGAGAGTTATGTCTCCAAATTTAGTTTATCCCACTTATTATGACTTTGAAGATGTATTATCTGCAGCTA ATAAATGAATTTTCAACATTGCAGTGGATATATGGCTCCTGAATATGCAATGCATGGTTATTTGACAGAGAAAGTAGATG TTTATAGTTTCGGAGTTGTTACCTTGGAAATTGTTAGTGGGAAGAGCAACACCATGAACCGGCCAAAGGAAGAATGTTTC TCTCTTGTTGATTGGGTAATTCATGCATTTATGAATTTACACTTACTGTGATTTAACAAAATCTGTTGTATTTTCCACAA GAAGTTATCCAACTTTAGTGTCGTCAATGCTGGATTTGAGTTCCCTGCAGTTAGGATAATCCTACATTCACGCAGTCAAG AAATCTGCACCTTTTGATCAAGATCACGCAGATCAGATTCAATAATTGCGTGAATTTAGGATTGCTTTTACCGCAGAGAA TCCAAATTCGTCAATGTTTGCTAGTGCCTAATTTCTGTTTGTATTTCATTTTTCCAGGTGCATCTCTTGAAAGAAGAAGG TAACATAATGGACCTAGTTGATGAGTGGTTGGGTGAAAACTTTAAAAAAGAAGAAGTAATGGTCATGATCAATGTGGCCC TTATATGCACACAAGTTTCTCCGACGCAGAGGCCCACCATGGTTTCAGTCGTGAGCATGCTTGAAGGCAAAACTGTTGTA CGAGAGGTGGTGTCTGACACAAACCAACAGTTTCACCAGCAGAGAGAACATAATAAGAACCATGAGACTCAAGAAGAGAG CATCTCAATTGATGAAATTGGAGCTTTTATGTCTGATACAGATCTAAATTCCCTCAACATGGACTATTCTGGCAGTGATC TATAGGAGTTTCTTCACATTGTAGATCTTATACTTGCATCCACCATTTCTTGCATAATTATAGTTCTTTATAACTTTTAT AGAAGAGTTTACTGAACTTCTGACAGTTAAATAATAAATACCTGTGGGTTTGATTTTTCTTTTTCTAATAATTGGGAGAT TCTTTTATGATAATCAAAATAAAGTCTTTAAGTTTGAAACTCAGATGTTTAGGAAACATTTTTT
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CDS sequence (LotjaGi3g1v0263000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATTTCTGCTTTGCAACACCCATGTCTAGTTAAGCTCTATGGATGTTGTATGGAGAGAGATCAGTTGATGTTGATATA TGAATACATGGAAAACAATAGCCTAGCTCGTGCGTTGTTTGCCCAAGAAAAATGTCAATTGAAGTTGGACTGGTCGACAA GGAAGAGGATTTGTGTTGGTATTGCTAGAGGTTTGGCATACCTCCATGAAGAATCAAGGCTAAAGATAGTTCACAGAGAC ATCAAGGCCACTAATGTGTTATTGGATAAAGATCTCAATCCAAAGATATCTGATTTTGGTTTAGCCAAGCTCAAAGATGA CCGCTATACCCATATAACCACCAGAGTAGCTGGGACTTATGGATATATGGCTCCTGAATATGCAATGCATGGTTATTTGA CAGAGAAAGTAGATGTTTATAGTTTCGGAGTTGTTACCTTGGAAATTGTTAGTGGGAAGAGCAACACCATGAACCGGCCA AAGGAAGAATGTTTCTCTCTTGTTGATTGGGTGCATCTCTTGAAAGAAGAAGGTAACATAATGGACCTAGTTGATGAGTG GTTGGGTGAAAACTTTAAAAAAGAAGAAGTAATGGTCATGATCAATGTGGCCCTTATATGCACACAAGTTTCTCCGACGC AGAGGCCCACCATGGTTTCAGTCGTGAGCATGCTTGAAGGCAAAACTGTTGTACGAGAGGTGGTGTCTGACACAAACCAA CAGTTTCACCAGCAGAGAGAACATAATAAGAACCATGAGACTCAAGAAGAGAGCATCTCAATTGATGAAATTGGAGCTTT TATGTCTGATACAGATCTAAATTCCCTCAACATGGACTATTCTGGCAGTGATCTATAG
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Protein sequence (LotjaGi3g1v0263000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MISALQHPCLVKLYGCCMERDQLMLIYEYMENNSLARALFAQEKCQLKLDWSTRKRICVGIARGLAYLHEESRLKIVHRD IKATNVLLDKDLNPKISDFGLAKLKDDRYTHITTRVAGTYGYMAPEYAMHGYLTEKVDVYSFGVVTLEIVSGKSNTMNRP KEECFSLVDWVHLLKEEGNIMDLVDEWLGENFKKEEVMVMINVALICTQVSPTQRPTMVSVVSMLEGKTVVREVVSDTNQ QFHQQREHNKNHETQEESISIDEIGAFMSDTDLNSLNMDYSGSDL
Download Protein Sequence

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR27006
1 267 267 5.2E-148 –
Gene3D
G3DSA:3.30.200.20
1 30 30 6.1E-9 –
PANTHER
PTHR27006:SF133
1 267 267 5.2E-148 –
SMART
SM00220
1 225 225 9.8E-12
IPR000719
ProSiteProfiles
PS50011
1 231 231 31.481
IPR000719
Pfam
PF07714
2 224 223 3.1E-39
IPR001245
SUPERFAMILY
SSF56112
2 236 235 1.05E-66
IPR011009
Gene3D
G3DSA:1.10.510.10
31 257 227 9.1E-64 –
ProSitePatterns
PS00108
76 88 13 -
IPR008271

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0004672
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Subterm of
GO:0005524
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Subterm of
GO:0006468
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0263000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…