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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0299000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0299000.5 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Dedicator of cytokinesis; TAIR: AT4G16340.1 guanyl-nucleotide exchange factors;GTPase binding;GTP binding protein; Swiss-Prot: sp|Q8SAB7|SPK1_ARATH Guanine nucleotide exchange factor SPIKE 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0G4P9|A0A0R0G4P9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0299000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:62233756..62255879) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGCCTTACAAAGAGTCCTTCGCATGGACTATTGTATCATTATTTGATAGCAGTGTTGGTACAGCTTCGGTAGGGCCTGC TTCTCCGAGCAGCCCTCTTGCTCCAAGTGTATCTGGTTCAAGTTCCCATGAAGGTGTTTTTGAGACTACTTCAAAAATCT CTTTAGATGGAAAACTGAGTTACTCGAATGGAAATTCTGTTGTAGTTGAGGTTTCAAACTTAAATAAAGTCAAAGAAAGC TATACTGAGGAATCACTACAGGTATGTGCGTCAGATTTCATTTGGTTGAGACTTTACTTCTGTTCTGAGAGTCTAAATTA AGGGATGAAAATTCTGGCTGAAGATTTCTGCTATTTATGGCACTTTAAAGTGATATTGATAATTAACATGAGAGAACTAT ATGGCAATCATTCAGTGTGCTGTATGCATTGAATTTATTTGTTTGTTGTTTTTTTTTGTTCTCATATGGGTTTAACTATT ATATTCATCTAATTAAATGTTAAACTGTGATTGCATCATTCTCTATGTTCATGTGTTCATTTCTATTCTAAATGAAATTT TTGAAACAAATTCAAACTCGTTTTAGATGATCTTATTGTTTGGGCTTTAAAAAATTTAACTAAAAAGAAACTGCACTTGG ACTACATAATTTAGTGGATATGTTACACTGTGATCCTTATTATAAGTCTGAGTTCTTGCTGTCTGCATTTCTCTTTTCTC GAGAAGACAAATTTATATGCTTGCTATGATCTAACAGTTTGTGGTTTGTATTGATACTCTTTTCTTGGTATTTTTTGAAA AAATGTCAAGGATCCCAAGCGTAAACTGCATAAACCTGTCAAAGGTGTTTTGAAACTGGAAATTGAAAAGCACAAGATAT CGCCAGCTGATTTGGAAAATGTGTCAGAAAATGGTAGCACTACCAATGATTCTGTTGACCCAGGGGATCGCATTGCAGAT 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ATACAACCACAAAGCTGAAGGTATACAAAGTTAGTATCTGCCACAGGAAACAACTGAACACGCACATATGAAGAGCCTCA AAACACACTTGTCACACCCAATGCTGGACATTTGAAGCATGTGGTTCATTTATAGGTGGCCTGTGGCCCAATAAACAGAC TCTGATACCATGTTAGAATTTGGCTCTGATACCTCAAAGCTAGGTTTTTGGGTAGAGTTGGACCTAGTCCAAATTCTAAG ATGATATCAGAGCCTTCCTATGCTCTCTGATACCCTGTTTTAAATTTTATGTTTAACTCTCAAGAAGGAGGTAGAAATAA AGCTGCCAGTTCTGGATGCTCATCTGTTTAAGGATGTATTCCTGATCATTGTGAACCTTTTTAATGGGCATCAATTTCAA TACTAAGTGTAATCTTATTGTTCCAGGGCCCTGTGATGACTATGGATAGATATGCTACTGCTGAAAGCTTCTATAAATTG GCAATGGCATTTGCTCCAGTTCCTGATCTTCACATAATGTGGCTGCTTCATCTATGTGATGCGCATCAGGAAATGCAGTC ATGGGCAGAAGCTGCTCAGTGTGCCGTTGCCGTTGCTGGTGTTGTGATGCAGGTAAAGACATGATTTATTTATGCATAAA GAATGCAGACTAGGAATTTTCATGATGCATAAATTATATTGATGGGCATATTCTAGGCTCAGCTAAACATTAAATGCCAG TGTGATTAATAATTACTTTTTTTTACCTGGTGTATGTAGTCATGTTTTTCTAATTCTGGTTGTTTGTTAATGTTCTTTTC GGATTGGGTAAACTGTGACTAGACAAAACATGATTGTTGAATCAGGACAGATACAAACTTTTGGTTACAATCGAAAGACA AATTTAGTACATTATTCCCAATTCTCCTTCAGTTAGCGAGTTATAGTGTTTCCAACTGGACAGCTCAAATTATCAATGCC CGGAAAATGAATATTTTTACTTTTTTCCCCCTTGCCTAAAGCTTTAGCTGTTAAATGAAACTTAACCTTTTCTTCTTTTT CCCTTTCTTTTGTCTAGTCTGCTCATGCATGAAAACTTTTCAACTTGAACAAAGTACACCTAGAGACCTTTCTATATATG TTGATATCACACTTAGTGATAAGAACTGAGGGAGGGAGGATAAAAATTAGAGGTTAAATTAAAGCTTTACTTGCCATGGT TTTCATTTTCAATTTGGTTTCTAGCTTCTTTTTTTAAATCAGCGCTCATCTCATCATTACAAACATTTTAAAATTGTCTT TATCATAACGTCAATAGAGTCCCCTAGTTGACATTTTATAGTACAAATGTGCATCCAAACGATCACCTATTGAAAAAAGC ACATATTCGAGAATGGATTACTTACAAGCCAGTTCTTTTACAAGTAAAAGAACTTGTAAAGGAGCACTTACTGCACAAAT AAACGCTTACTGAGTGAACTGAGTGTCAGAGTTATAGTAACAGGGCAGATTTTGAAAACATTATTAGTTTAAGGACTGGT TTGGAACAATATAAGGATTATATTGAGAATGAGTGGAACTAAAAGGACCAAAATTAACCTCCAGCTTCTGGGCGGATGTG AAGGGGAATCCTCCCTTTTCAAACAAAAAAATAAACATAAAAGATTCTTTCTCTGGCCTTCGGCGAATGTATAATTGAGG GTTAGGCTGATTTTATAGCTTTTTCATGGGTTTTATAACACTTTATTTTCCTTTTTACTCACTGTAGCAGTGTAGTTTCT GTATCCCTGTAGTAGGATTTGGGATCCTTTTGTACTTCCTTCCCTCAAAGATTTCTTCTTTCATTGAAAAAGTCAAAGCC TTAGCACTTATTGAAGGACCTATTATTAGCCTTAGATATTACAGTTAGCTATCTAAAGTGATAGAGATTACTAAAGAGTT AGCATAGTCAAATCTGATCATTAAAAGATAACCCAAATGGTAGACGTCATTCATTTAACTCTATCAATGTTTTTTTTTTC TATCAGTAGTAGTTGATAAGTCTCACGTTGACTAGAGATATGGTTAACATAGTCCTTATGAAGGTTAGAACTTAGAACAA CCCTCACCCATAAACCTAGTCCTTATGAACGTTAAAACAACCCTCACCTATAAACTAGCTTTCGGTGTAGAGTTAGGCCT AACCCAAATTTTAAGATTATATCACACCTATCCTAGATCCGTTTATTGGAGAGCACCCATATATGGGACCCATAGATGAT CTGCAAATTTCACGCTCCAGATGCTCGGCCCTAGGTTTTAGGAGTGCTGTTGAGAAGATCCCCATTGTTCTCAAGTTAAA ACAATTGTCACCCAGAACTCACCCTTGAGCTAACTTTTGGGGTAGAGTTTGACCTAACTCAAATTTTAAGAGTAGCCATT GATTCCATATTAGACCTCATTATCTTATTTCTTATTCTTCATTGTTGTGATCTGATTTATATAGCAACACTTTTTTTATG AGCTTCACACTTACTCTGTTACTATGTTTGATGCAGGCCCTTGTTGCCAGAAATGATGGTGTTTGGAGCAAAGACCATGT TGCTTCATTACGTAAGATTTGTCCCATGGTCAGCAGTGAGATCACATCTGAAGCATCTGCTGCAGAGGTAGAGGGATATG GTGCTTCAAAACTGACAGTTGACTCTGCTGTGAAGTACCTGCAGCTTGCTAATAAGCTCTTTTCACAAGCTGAGCTTTTT CATTTTTGTGCAAGCATTCTGGAACTTGTAATTCCAGTTTACAAAAGCAGGAGGGCTTATGGACAGCTAGCTAAATGTCA CACATTACTTACCACAATCTATGAGTCGATACTTGAACAGGAATCTAGTCCAATTCCTTTTACTGATGCAACATACTACA GAGTTGGATTTTACGGTGATAGATTTGGAAAACTTGACAAAAAGGAATATATATATCGGGAGCCACGTGATGTGCGTCTA GGGGATATAATGGAAAAGCTTAGTCACATATACGAGTCTAGAATGGATGGTAATCATACTTTGCACATTATTCCAGATTC TAGGCAAGTGAAGGCAGAGGAGTTACAGCCTGGTGTCTGCTACCTTCAGATTACTGCCGTTGATGCAGTCATGGAAGATG AAGATTTAGGAAGTAGAAGAGAAAGAATTTTTTCTCTTTCTACTGGAAGTGTCCGTGCTCGTGTGTTTGACCGTTTCTTG TTTGATACCCCATTTACAAAAAATGGCAAGACTCAAGGTGGATTGGAAGATCAATGGAAGAGACGCACTGTTCTTCAGAC CGAGGGTTCATTTCCAGCTTTAGTAAATAGGCTAGTGGTAATCAAATCTGAGTCCCTTGAATTTTCGCCTGTAGAAAATG CAATTGGAATGATTGAAACGCGAACAGCTGCATTAAGAAATGAGCTTGAAGAGCCTCGAAGTTCTGAGGGGGATCAACTT CCACGACTCCAGAGTCTACAAAGAATCCTTCAAGGCAGTGTTGCAGTACAAGTATGTTGTAGTATTGGTTCTTATTACCT ATCATATGCAATATGCATTTTGGTTGCTAAATGAGCTAAAATCCAGATATGAACATTGGATGCTTTACTTTAGGTTTCTC AATTCTGACAGCCACTGCTTTTTGTGCAGGTGAATAGTGGGGTTTTGAGTGTTTGCACAGCCTTCTTGTCTGGGGAGCCT GCAACAAGGTTGCGATCACAGGAACTGCAGCAACTTATAGCTGCTCTTCTTGAGTTCATGGCTGTATGTAAACGTGCCAT CCGGGTACATTTCAGATTGATTGGTGAGGAAGATCAGGATTTCCATACGCAACTTGTAAATGGATTTCAGTCTCTAACAG CCGAGTTATCGCACTACATTCCTGCCATTCTCTCAGAGCTATGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0299000.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTTACAAAGAGTCCTTCGCATGGACTATTGTATCATTATTTGATAGCAGTGTTGGTACAGCTTCGGTAGGGCCTGC TTCTCCGAGCAGCCCTCTTGCTCCAAGTGTATCTGGTTCAAGTTCCCATGAAGGTGTTTTTGAGACTACTTCAAAAATCT CTTTAGATGGAAAACTGAGTTACTCGAATGGAAATTCTGTTGTAGTTGAGGTTTCAAACTTAAATAAAGTCAAAGAAAGC TATACTGAGGAATCACTACAGGATCCCAAGCGTAAACTGCATAAACCTGTCAAAGGTGTTTTGAAACTGGAAATTGAAAA GCACAAGATATCGCCAGCTGATTTGGAAAATGTGTCAGAAAATGGTAGCACTACCAATGATTCTGTTGACCCAGGGGATC GCATTGCAGATTCACTGGCCGGAAAGTATCCTAGTAATGGTTGTGATGATCCTCAGGGTAGTAATGGGAAAGAAGTTTCG GGCAATGGATCAAATCAACATGGAAATTCAGATTCTTATGCTGATGATTTCCATGCTTTTGACTTCCGCACTACAACAAG AAACGAGCCTTTTTTGCAACTTTTTCACTGCCTGTATGTGTATCCGTTGACTGTAAGTTTGGGTAGGAAAAGGAATTTGT TCATACGGGTTGAACTCAGGGAGGATGATGCTGATATTCGTAGACAGCCATTGGAGGCAGTGTATCCTAGAGATCCAAGT CTAGATGCATCATTTCAGAAGTGGGGTCACACCCAAGTTGCTGCTGGGGCTAGGGTTGCTTGCTACCATGATGAAATTAA ACTTTCACTTCCTGCAATGTGGACACCCACGCACCACCTCCTATTTACTCTATTTCATGTTGATCTACAAACAAAATTGG AAGCTCCAAAGCCAGTGGTAATTGGATATGCAGCTCTTCCTTTATCATCACATGCTCAGCTGCGATCAGAAATAAATCTT CCAATTATGAGAGAGTTGGTCCCTCATTATCTCCAGGATGCAGGACGGGAGAGATTGGATTATTTGGAAGATGGGAAAAA CGTCTTCAGACTGCGTTTACGGCTATGTTCTTCTTTATACCCTATCAATGAACGTATTAGAGATTTCTTTCTTGAATACG ACCGCCACACTCTTCGTACAAGTCCGCCTTGGGGTTCTGAACTTCTGGAGGCTATTAATAGTTTGAAGAATGTTGATTCC ACTGCATTACTTCAGTTTCTTCACCCAATTCTTAACATGCTACTTCATCTTATTGGTAATGGTGGAGAAACATTACAGGT TGCAGCTTTCCGGGCTATGGTTAATATTGTAACCAGGGTACAGCAAGAGTCGGTTGATGATGCTGAAAGAAATCATTTTC TAGTCAACTATGTGGATTGTGCTTTTGATGATTTTGGTGGTCGACAACCACCAGTATATCCTGGATTATCCACTGTCTGG GGAAGCCTGGCACGAAGTAAGGCTAAAGGGTATCGTGTTGGACCTGTGTATGATGATGTTTTGGCAATGGCTTGGTTTTT TCTGGAGCTAATTGTTAAATCAATGGCATTGGAGAAGACTCGCCTCTTCTATCATAGTCTTCCGATAGGTGAAGATATCC CACCAATGCAGTTAAAGGATGGTGTATTCAGATGTATAATGCAGTTGTACGATTGCCTTCTTACTGAGGTGCATGAACGC TGCAAAAAGGGTTTAAGCTTAGCAAAACGGTTGAACAGTAGTTTGGCCTTCTTTTGTTATGATCTTCTATCCATTATTGA GCCACGACAAGTTTTTGAGCTGGTATCTTTATATCTTGATAAGTTCTCTGGTGTATGTCAATCGGTTCTTCACGAATGCA AACTTACATTTTTACAAATAATATGTGACCATGATCTTTTTGTTGAAATGCCTGGGAGAGACCCTTCAGATAGGAACTAC CTTTCATCTGTATTGATACAAGAACTTTTTGTTACTTGGGATCATGAAGATTTGTCTCTACGAGCAAAGGCAGCGAGAAT ATTGGTTGTGCTCTTGTGCAAGCATGAGTTTGATGTCAGATACCAGAAGCCAGAAGATAAGTTGTATATTGCTCAGCTCT ATTTCCCACTTATTGGACAGATATTAGATGAAATGCCTGTTTTTTACAACCTGAATTCTGTTGAAAAGCGTGAAGTATCC ATTGTGATTCTGCAAATAGTTCGAACCCTTGATGATGCATCTCTTGTCAAGGCATGGCAGCAAAGCATTGCCCGGACTAG ATTGTTTTTCAAGCTTATGGAGGAATGCTTACTTCTATTTGAGCACAAAAAGCCCTCTGATGGCATGTTACTTGGCTCAA GTTCTCGCAACCCTGTAGGGGAGGCGCCTGCGTCTCCCAAGTACTCTGATAGACTTTCTCCTGCAATCAACAACTATCTA TCGGAGGCCTCAAGGCAGGAAGTCAGGCCTCAGGGAACACCTGATAGTGGATACTTATGGCAGAGAGTAAATTCACAGTT AAGCTCCCCTAGCCAGCCATATTCGTTGAGAGAAGCTCTTGCTCAAGCACAGTCCTCTAGGATTGGAGCTTCTGCTCAAG CACTTCGAGAATCACTACACCCACTATTGAGGCAGAAATTGGAACTTTGGGAGGAAAACTTGAGTGCTGCTGTCAGTCTT CAGGTTTTGGAGGTGGCTGAAAAGTTCTCTACGATGGCAGCATCGCATAGCATTACCACTGATTATGGAAAACTTGATTG CATCACAGCAGTATTCACGGGCTTTCTATCGAGAAATCAGCCACTCGCTTTTTGGAAAGCTTTTTTTCCTGTATTTAACA ATGTGTTTGATTTACATGGGGCAACTCTAATGGCAAGGGAAAATGATCGTTTTCTAAAGCAAGTCACTTTCCATGTCCTT CGGCTTGCTGTTTTTCGAAATGAAAACATCAGGAAAAGGGCAGTTGTTGGGCTTCAAATACTTGTGAGGTGTTCATTTCA TTACTTTATGCAGACAGCAAGATTAAGAGTAATGTTGATTATCACATTATCAGAGCTAATGTCTGATGTGCAAGTGACTC AAATGCGATCTGATGGAAGCCTAGAAGAGAGTGGTGAAGCAAGACGACTTAGGAAATCTTTAGAAGAAATGAAGGATGAA ACTGAAAGTGCTTGCCTGTTGAAGGAGTGTGGATTACAAGAGAGTGCTCTTGTGGCCATACCAGAAAAAGTGACAGAGAA TAGGTGGTCCTGGTCAGAAGTGAAATATCTCTCTGACAGTTCTCTTTTGGCCCTTGATGCTAGCTTGGAGCATGCACTGT TGGGCCCTGTGATGACTATGGATAGATATGCTACTGCTGAAAGCTTCTATAAATTGGCAATGGCATTTGCTCCAGTTCCT GATCTTCACATAATGTGGCTGCTTCATCTATGTGATGCGCATCAGGAAATGCAGTCATGGGCAGAAGCTGCTCAGTGTGC CGTTGCCGTTGCTGGTGTTGTGATGCAGGCCCTTGTTGCCAGAAATGATGGTGTTTGGAGCAAAGACCATGTTGCTTCAT TACGTAAGATTTGTCCCATGGTCAGCAGTGAGATCACATCTGAAGCATCTGCTGCAGAGGTAGAGGGATATGGTGCTTCA AAACTGACAGTTGACTCTGCTGTGAAGTACCTGCAGCTTGCTAATAAGCTCTTTTCACAAGCTGAGCTTTTTCATTTTTG TGCAAGCATTCTGGAACTTGTAATTCCAGTTTACAAAAGCAGGAGGGCTTATGGACAGCTAGCTAAATGTCACACATTAC TTACCACAATCTATGAGTCGATACTTGAACAGGAATCTAGTCCAATTCCTTTTACTGATGCAACATACTACAGAGTTGGA TTTTACGGTGATAGATTTGGAAAACTTGACAAAAAGGAATATATATATCGGGAGCCACGTGATGTGCGTCTAGGGGATAT AATGGAAAAGCTTAGTCACATATACGAGTCTAGAATGGATGGTAATCATACTTTGCACATTATTCCAGATTCTAGGCAAG TGAAGGCAGAGGAGTTACAGCCTGGTGTCTGCTACCTTCAGATTACTGCCGTTGATGCAGTCATGGAAGATGAAGATTTA GGAAGTAGAAGAGAAAGAATTTTTTCTCTTTCTACTGGAAGTGTCCGTGCTCGTGTGTTTGACCGTTTCTTGTTTGATAC CCCATTTACAAAAAATGGCAAGACTCAAGGTGGATTGGAAGATCAATGGAAGAGACGCACTGTTCTTCAGACCGAGGGTT CATTTCCAGCTTTAGTAAATAGGCTAGTGGTAATCAAATCTGAGTCCCTTGAATTTTCGCCTGTAGAAAATGCAATTGGA ATGATTGAAACGCGAACAGCTGCATTAAGAAATGAGCTTGAAGAGCCTCGAAGTTCTGAGGGGGATCAACTTCCACGACT CCAGAGTCTACAAAGAATCCTTCAAGGCAGTGTTGCAGTACAAGTGAATAGTGGGGTTTTGAGTGTTTGCACAGCCTTCT TGTCTGGGGAGCCTGCAACAAGGTTGCGATCACAGGAACTGCAGCAACTTATAGCTGCTCTTCTTGAGTTCATGGCTGTA TGTAAACGTGCCATCCGGGTACATTTCAGATTGATTGGTGAGGAAGATCAGGATTTCCATACGCAACTTGTAAATGGATT TCAGTCTCTAACAGCCGAGTTATCGCACTACATTCCTGCCATTCTCTCAGAGCTATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0299000.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPYKESFAWTIVSLFDSSVGTASVGPASPSSPLAPSVSGSSSHEGVFETTSKISLDGKLSYSNGNSVVVEVSNLNKVKES YTEESLQDPKRKLHKPVKGVLKLEIEKHKISPADLENVSENGSTTNDSVDPGDRIADSLAGKYPSNGCDDPQGSNGKEVS GNGSNQHGNSDSYADDFHAFDFRTTTRNEPFLQLFHCLYVYPLTVSLGRKRNLFIRVELREDDADIRRQPLEAVYPRDPS LDASFQKWGHTQVAAGARVACYHDEIKLSLPAMWTPTHHLLFTLFHVDLQTKLEAPKPVVIGYAALPLSSHAQLRSEINL PIMRELVPHYLQDAGRERLDYLEDGKNVFRLRLRLCSSLYPINERIRDFFLEYDRHTLRTSPPWGSELLEAINSLKNVDS TALLQFLHPILNMLLHLIGNGGETLQVAAFRAMVNIVTRVQQESVDDAERNHFLVNYVDCAFDDFGGRQPPVYPGLSTVW GSLARSKAKGYRVGPVYDDVLAMAWFFLELIVKSMALEKTRLFYHSLPIGEDIPPMQLKDGVFRCIMQLYDCLLTEVHER CKKGLSLAKRLNSSLAFFCYDLLSIIEPRQVFELVSLYLDKFSGVCQSVLHECKLTFLQIICDHDLFVEMPGRDPSDRNY LSSVLIQELFVTWDHEDLSLRAKAARILVVLLCKHEFDVRYQKPEDKLYIAQLYFPLIGQILDEMPVFYNLNSVEKREVS IVILQIVRTLDDASLVKAWQQSIARTRLFFKLMEECLLLFEHKKPSDGMLLGSSSRNPVGEAPASPKYSDRLSPAINNYL SEASRQEVRPQGTPDSGYLWQRVNSQLSSPSQPYSLREALAQAQSSRIGASAQALRESLHPLLRQKLELWEENLSAAVSL QVLEVAEKFSTMAASHSITTDYGKLDCITAVFTGFLSRNQPLAFWKAFFPVFNNVFDLHGATLMARENDRFLKQVTFHVL RLAVFRNENIRKRAVVGLQILVRCSFHYFMQTARLRVMLIITLSELMSDVQVTQMRSDGSLEESGEARRLRKSLEEMKDE TESACLLKECGLQESALVAIPEKVTENRWSWSEVKYLSDSSLLALDASLEHALLGPVMTMDRYATAESFYKLAMAFAPVP DLHIMWLLHLCDAHQEMQSWAEAAQCAVAVAGVVMQALVARNDGVWSKDHVASLRKICPMVSSEITSEASAAEVEGYGAS KLTVDSAVKYLQLANKLFSQAELFHFCASILELVIPVYKSRRAYGQLAKCHTLLTTIYESILEQESSPIPFTDATYYRVG FYGDRFGKLDKKEYIYREPRDVRLGDIMEKLSHIYESRMDGNHTLHIIPDSRQVKAEELQPGVCYLQITAVDAVMEDEDL GSRRERIFSLSTGSVRARVFDRFLFDTPFTKNGKTQGGLEDQWKRRTVLQTEGSFPALVNRLVVIKSESLEFSPVENAIG MIETRTAALRNELEEPRSSEGDQLPRLQSLQRILQGSVAVQVNSGVLSVCTAFLSGEPATRLRSQELQQLIAALLEFMAV CKRAIRVHFRLIGEEDQDFHTQLVNGFQSLTAELSHYIPAILSEL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1 | 6 | 6 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1561 | 1561 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1561 | 1561 | 0.0 | ||
| Phobius | 7 | 15 | 9 | - | – | |
| Phobius | 16 | 22 | 7 | - | – | |
| Phobius | 23 | 1565 | 1543 | - | – | |
| MobiDBLite | 24 | 44 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 113 | 170 | 58 | - | – | |
| MobiDBLite | 116 | 131 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 148 | 170 | 23 | - | – | |
| Pfam | 193 | 364 | 172 | 2.6E-28 | ||
| CDD | 194 | 366 | 173 | 7.69183E-37 | – | |
| ProSiteProfiles | 195 | 356 | 162 | 32.167 | ||
| SUPERFAMILY | 390 | 983 | 594 | 6.64E-6 | ||
| Pfam | 985 | 1556 | 572 | 8.7E-156 | ||
| ProSiteProfiles | 1114 | 1563 | 450 | 54.662 | ||
| Gene3D | 1115 | 1268 | 154 | 1.4E-32 | ||
| CDD | 1121 | 1554 | 434 | 1.29362E-116 | – | |
| Gene3D | 1433 | 1560 | 128 | 7.5E-28 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with a GTPase. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Small GTPase mediated signal transduction | Any series of molecular signals in which a small monomeric GTPase relays one or more of the signals. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0299000.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…