Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0353800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0353800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | F-box/LRR-repeat protein; TAIR: AT1G15740.1 Leucine-rich repeat family protein; Swiss-Prot: sp|A2RT62|FXL16_MOUSE F-box/LRR-repeat protein 16; TrEMBL-Plants: tr|I1KGY2|I1KGY2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0353800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:73485681..73495542) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGTGGTGCGTGTTCTAGGAAGCAAGAGAGGGATAGTGAGGAAAGTTTCGGTAGAGGGTTTTCACGAAGATATTGCAA ATGTGGGAGTTTGAAGTGGTGGACATCCTCATTTTCTTATCCATCTGGGGATTTGCACTTACAAAAAGGAGAATGTCCAT TGCTGTTGCACTTGTGCATCCAGAAAATAAATGAGGTATCTTATCAGTCACTGAGTTTCCTTTGTTCAAACTCTGTATTT TGATCTGATCACTGTAATCTTTATTCAACAGGATATTGATAAATATAACACATTTTCTATGCTCCCACGGGATATAAGTC AGCAAATTTTTAATAATTTGGTTTACTCCCAACGTCTAACGGATGTTTCCCTTGAAGCTTTTCGAGATTGTGCTCTCCAG GTAAATCATTTTAAATCTATCATGAACCATGTTCATTATGTATTCTTGAACTAAATGAATAGAGTTTTTATGACAGGATC TTTACTTGGGAGAATATGACGGTGTTAATGATTCTTGGATGGATGTCATCTCATCTCAGGGTGAATCCTTACTTTCTGTA GATCTTTCTGGGTCTGATGTCACTGATTTTGGGCTGACGTACCTTCAAGATTGTCCAAGTCTCATGTCCTTACACCTAAA TTACTGTGACCAAATTTCAGATCATGGACTGCAGTCTATCAGTGGTATTCTTTCTTGTGCTCTATTTGTGTCTTTGTTAT GGAATCACATTAAAATCATCTCAGTTATTGATTTCCCACCCTACATTTGCCCTTGGGTGCTGGTCCCTTGACATCTTTCT TATATCTTTCCAATATTCCTTGAGTAAACTGCATCTATTCATTGGTGTGGGAATGGTGTACATATTGCCTCATTTTTCAG TCTAGTTGATAATGTGTTAAAAGTTAGTCTATCATACTGGTTGCCTGTTCGCAAAAATATTTTCTTTATTCCAATAGCTA CAGTGCCTTTTCTTGGAAAATTTCCAAAAAAAGAATTCTTGGTTATTGATTTCCTGATTAAGAACATTGGCCATCCAGGT GGCTGATTAAATCAGGTAGTGTTTACTCATTTATTGTATTAGAACATTTTTAAGCGCTTGGGGTGGTTTACCACATTGGT TTTACCAAGAATTCCTAAGGAAATTTCTTGTGTAGCTCTCTCTCTCTCTCTAACACTCACACGCACACAGAATTTATTTC CTCTAGACACACCCAATTCCAATTTACTTTTCAGTTAATATGTGTATGGAAATCTTATGAAGATCATCTGCACGAACTAC TACCTTTAATTTCTGCAATTTTTTGTATTTTAATATATGATCTTCAGAGAATGAAATTCTTCATAATGCAGTTGGCATGA TTGTTTTCCCTCCATCAAGGTTTCTTTCAAAGAATGAAAATGTTTTCAACACCCACCCATCAAATAATCCATTTTAATAT AGTGAAACCTGTATAGTGAGGTTGAAGTGGTTTTTATGCATTTCATGCATAATTGTTGTATATTGTTATTTCTGTTTATC TCTCTGCATCTACTATAGCATTTTTTTTTTCATTTAACATTTCATGTAATGTTACTTATGTCTAGAAGCTTTGCTCGTAA GTTGCTTTTACTGAAGGTTTATGACAACTGCATCAATATGTTCCAGGTCTGTTAAACTTGACAAGTTTGAGTCTTAGAAG AAATGATTCAATATCTGCTCAAGGAATGAGTACCTTTTCTGGTCTTGTGAACTTGGTCAAGTTGGATTTGGAGAGATGTC CTAGGATTCATGGAGGCCTTGTTCATCTTCAAGGTTGGTTCTTGAATGTAATTATGTGTGAAAAGTAAAGCTTTATTAAC CAATGTTCTTTGGTGAACTTCAACTACCCCAATTATTATACAATATTTAAAAGATGTTTATTATTGTCTATCACAGTCGT TAGTTGTTTCTACTTACTACATGAGATGTCAATGAAATGGAATGTTATTTATGAAGCTCTCTAGTGGAATAATATTTTTT TAGCAACCTTCTGCCAAGTACTATGGATGACTATTACAAGGAATCAACAGCTGAGTACACCTTTTCCTTGAATAAGATGT TTTTCAATTTCAATTATATATTGGTGATAGATATTTGAAGGAATGAGGGATGGGAAAATAAGATCAGAATACTATCAGAA ATGGGCTGGTTTTCTGGTTAAATGGTCACGGGAGTAAGAGTATAATAAAAAGATGAAGGAATTCTTTTACAGTAATTGTG CTTCTGTAGGGAGAATAGCTTACCCAAAATTGATTACTGTCCAAACTCAATCCAATTGTTCACTCCATATTTTCAGGTTT AACCAAGTTGGAATCTCTCAATATAAAGTGGTGTAATTGCATAACAGACTCTGATATGAAGCCTCTATCAGGTTTCTGGC TTGCTGCTTCTTTTTTTCTCAGTAACTGAAAAATTTAACGAAGTTTATTTGTCTAGACTTTCTGTTGTGCAGTTAATGTG TTTTCTACTATGGAGTAGTTCCTGTTGAGGTTATTGATCTCCTTTCTAGTAACCCACCCTTATTCAACCCAAACTTTGCA ACTTTGAGTGGAAAACCTTGAATGATTTTAAAATTTTAATATATGTAGATAAGATCATTTTACAACAATCGCGTTTGACA ACCACATATTTACCACTTGCCAGTGTGCCTTTGTGTTGATAAAAATAATCATTTTTGTCGTAGTGGACATATGGTTCATC AGTACAGTTTATCTGATTCAATTTGCTTGCAGAGCTTGCAAGCTTGACAAGTCTAGAGATTTCTTGCAGTAAAGTCACTG ATTTTGGCATCACTTTTCTAAAAGGTATTGTACCTTGCCTTCTATTATTATGATGTTTCCGACCAAGAGGGATGATCATC TTATACCCTGAATCTTACAGGTTCTTGTGTTAAAATAGGCTTATATAATGCTTGTTTATGATATTTTTCTTTCTCGGAGA GTGAAACATATAGGTTCAACCCAGGAATTTCATCTACAAAGTATTTGTGTGTGTGTGTGAAAATACAAATGATGATTGAT ATTTTGTGCTTGTAAGCACGTTTGTGTATAAAATGATTTTATTCTACTAAGTTATCAATAAAAGCTTTACAGGAATGTAT AGTAGTGTACACTATTATCAAATATCAACTAATCTTTTTCAAGAATAGATGTTTGATTTTGAAGATTGAATTAGTTCTTC TTTTTTCCCCCTTTTTTTTAAAAGATAAAGAAAAAGTTTCAGTTAGGTATTTAATCTTAATTGTGCTTCAGTTTTAATTT GTAGACTGTAATTGTGTAAAAGCCAGAGTGCATTTTAAATATTCATTCTTAGAAAATATTTCTTTTATGATGTAAAGATT TGCCAATTATCCTTCTAAAGGTGACATTGCTCAGTTGGTTAGTAGAAAAGGGGTGCAGTACATCCCAGTTCTATCTCAGC TTACCATTTCAAAGAAAATTTTGAGTTTCATCATCATCATCATCTTCTCATCTAGTTTCAATATTGTCTTGGTTCATTCC AGGATTAAAAAAGCTTGCCCTATTAAATTTGGAAGGGTGCCTTGTAACAGCTGCCTGCTTGGATTCTCTCGCAGGTTGAA TTCCTTCATAGACTTTGAAGCTTATTCTTTTGATTTTGTTATTGTTAAGGTTACACATTGACTAGAGATATGACCAAATA TCTGCATATAGGGCAGAGCATTCCTCATCCTTTGAGCTAACTTTTGGTGGTTGGGTTATGCCTATCTAGAATTCTAAGAT GGTATCAAAGCCTCTATGAAAAAGTGATCTAGATTTTGAACCTTGTTGCCCCCAATTATTCTAATAATAATATTTGGATT CAACACAAGGTTGGTGGGTATGTGCATTGTCAATTCTTCAAGCCCAATGGGCTCTTGCCTGAGGGGTGTGTTAGAAATAT AATACCATTCTTGTGTCTTTTACCCAAGAGCTTAAGCTTTTGGGATAATTGGTTCATGACATGGTATCAAAGTAAGACTA GTTGGCTTTGATATGACTGTTGTGTCATGAGGGGGGATTGGTATACACTCCACATTGGATATAGAGTTAACCAGACTAGT GAAGGACACCAAATCTTTCAGCCAGAACCTTAAAGCATTGGGTTTATGGGTCTTTTCACTTACATATCGTTCAGCACTTC ATTTCAACACCTCATTGTTATGTCATGAGGGGGCTAGACATTGATTAGATATATGTTCTGATATCTACATATATAGGGTA GAACAATCCTCACCCCTTAGCTATTTTTGGGGTAGAATTAAGCCTAATCCAAATTTTATGAAGGTATGTTGAAACTCTAA CAGTAAAACTGAATTGTAACAATATTGTATTTCTGAAAGGGTAGAGATTACAGTGAATAGCACTTAGCTATTTATAGAGA TTGAGTGAAGCTTGCGCAGCAAGCTATTACTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAGTT ACACAGTAACTGATTCTGTTACAGCTAATAACTAATTCTGTTACACATTGACATGTCAGCAGTGCCATGTCAGCATGTGA CTACATATACTCTAATAAGGCATCGAAGTCCATCATAGGTCTGTTTATTGGAGGCCACCCATACATGGGCTACATACAAA TGTCTATTCCTGCAAATTCCACGCTCCAGATATCCAGTCCTGGGCGTGGGGGGGGTGTGTTAAGGCCCCACATTAACTAG AGATTTGGCCAAATACCATCACATATCCCAGGGTAGAGCAATCCTCACCCCTTGAGCTAGCTTTTGGAGGCAAAGTTAGG CCTAACCCGAGTTCTAAGAGTTATGACTATATTTACCTATTAGCACTAACTAGGCCTATTAGCTTTATTATTATTATTAT TATTGTTATTATTATTATTATTCTTGTTGTTGCTGTTGTTATTATTATCACGACTGGAAGATTGCTTTAATCTTGAAGCT GAAATGTTTATTAGGAATTAGAATGCCTTGAGCATACTACTCCAAGCAGATTGTGATTTGAGCGAGGACAGTCCACTAAT TGTGAAACTTTAGAAAGAAAAACATGGGGTGGAGAAACATTATTCCTATCATAGAAAGATCTATAATTTCTTATTTATTT AAACTTAGTTTTCTCGGGTGGGGGAGCATTGGATCAAACCTTTATGCCTTTTCAAAAAGAACCTGAATTTCATTTCCAAT AATGTGAACTCTGTATTTTCCGTTTTTTCTCTATTCAGTAGCTTTAAGGTTCTCATATTGTGTCTGCTTGGCTCATTTAA ATGGAAAGCTTTCAGCTTTCAACTGATCATGTATCTTCTTTAGAACCAAATGCTATTAGTTTGATCATCATCATTGAACT TTGTTGATGTAGAAAGTATTAAATTTATTATGTCTTTTTAGTATATAATGATTTCATGAGGCTGAAATACCCTTTGAACT TTTTGATTTGGCATTGTTATGTTTCCACCCAGAGCTTCCTTCACTTTCAAACTTGAATCTTAATAGATGTGCTCTTTCTG ATGATGGATGTGAAAAGTTTTCAAGTAAGTGGTGAATAATTTAATAGCTACTTCTTTCAGACTGTAATTATATATTTTAC AAAGTGATTTATTGGGTTTTACATTTTGGAACTATAACAATCACTGGGGGATCTACATTTGTAACATTACTTTTTCTTTT TTGCAGGACTGGAAAATTTGAAAGTATTAAACTTGGGATTTAGTGACATAGGAGATACCTGTTTAGCTCACTTGAAAGGT GATTTAAAATGAGGACCATTTCTCTCTTCCTCTCTTTATTTACCTCCCTTTAAAGATATATATTATATTTGAAAATTGAT GATTGTATCTAACAAACTTGTTTATTTTCAAACAGGATTGACTAAGTTGGAGAGCTTGAACCTTGATTCGTGTAAGATTG GTGACGAAGGATTGGTGAACTTGGCAGGTATATGCTTGAATTCCCTCCTTTGTCTATTAAGGATGACCTCTTGGATGGAA TTGTTTCCAAATTTTTTAGAAAAAGAAAATGTAAAAAGGTCAACTTAGCACATTATGTACTTGGCATAATTGGTGGCTAA TGATTAATTTGAATAACAATCCTGTTGCATATTATTTTTCATCGGAAATGCGAATTTCCCTCAATTGAAAGTATGACTCA CATTTTCTTCCCAATGCTTTTAGGCCATAAGCAATTGATCTGCTTGGAATTGTCTGATACAGAAGTTGGAAACAATGGCC TAGAACATTTATCAGGTTAGATATACCAATTCCTTATTACTTTCAAAGTTTATGTGCTTGGACTTCTATGTTGAATGGGT TTGGTTTCCTTCCATGTTGAGTGATACTTTTACAAAGTAAAATTATGTCTGGTATTTTTTCCTATCGCGTCTTATCTGAT TTGGGGAAGGGGAACCTTGGCGCAATGCTTAGAGTTGCTGCTGTGTGATTAGGAGGTCACAGGTTTGTGGCACCCTTGCA AATGCAAGGTAAGGCTGTCTATAATAGACCCACTGGGTCCAACCCTTTCCTGGTTTGTAGTAAGCTGCCCTTTATCTCAT CTGATTTTGGGCATTGAGGACTGCTTCCCTGTCTCTGTAATTGTGTGTTTTGGGTCGCATTCCTTTTTATTGAAGTTTGC TTTATCCCTTCATATATTTGGTTGTTCTGGCAAACTGCTTATGTTATCATAAGCTAGTCTCTTGACATAGTTGACTGCTG AATAATGAATAGAACTTGTCAGGAAGAGATGCCACATTCTGTGAGTTGTCTAAGTTAAGTGATCCATACACATAGGGACT ATTTTATGCATGATATATTGTGACATAGAATTCTCTGACTCTGCCACTGACTTAGTTTTTATTTCTATTTCTTGCAGGAT TGTCTAGTCTGGAGAAAATAAATCTGTCATTCACCGTGATAAGTGATAGTGGTTTAAGGAAATTGCGTGGACTCTCATCT CTGAAGTCACTTAATTTGGATGCCTACCAAATTACTGATGTTGGACTGGCAACCCTTACAAGTATGTGTTCATATGAAAC ATAAAGTTCTATGAATAATTTGTTTGTTTCTGTTTTGTACAGGTTCTCTAATCCTGTTTAATTTCATTGATTTGCTACTA TTTTTTTGAACCTAATAACAACAACTGCCACAGCCTTTTCCCATTAAGTGAGGTTGGTTTATAGATAAAGCGACGCCATA ATCTTGTCTAACGACAAAATTTAAATCTAAATTCTTCATAATGGTTTAGCTTGTACTTCTTCTTGATCTCCCTCTACGTT TAATTATTGAACTATCTTGTACTTGATTTACGCTCTTTATGGTGCTTCTGTGCCTTCTCCATGCATGCTCAAACCACTCA GGGCTTGTTTGGATATATTTTTCAAAACCGTTTCAGTTTAAAAAACAGAAGAATAAAATTTGGGTGGTTGTTCTCCACCC ACATGTTTCGAAAATTATTCTCAAAATTCAGATTTTAGAACAGGAAACCAGAAACAGGTGAAAGCTTTTCCAACTTTTTG TTCTCAGTTTGGATGAAAATAGATGGCATATTTGTCAATAGGTGAGTTTATTGATGGCATTTTATAAAGGAGAAATGATC AGGGCTTTGTCTAAATGAGCGAGTACAACAATGGAAGTCGCTCCCCTGTCAAAGCCATTCTACAAAAAAAATTCCAAAAA ACAAATTGTTATTTTCAATAACTCCACTCAAAACAAAAGTTCGTAACAGTACTCTGAACATGTTTTAAAAATCAAAAGCA GAAAATCATTTCAATCAAGTCCTTAAGATTTGAAAAATATGACCATTAGTTCCAGCTAGTCTGCTTGAGTATCACGTATC TTTACTTTTCCAAACATAATTTCAATTATTTCGTTTAAGCTTACTGTATTCTGGCTTTTTGGTTTACTAAGCTAAAAGAT TAACTTTGCAGCATGCATCATTTTGAATTTGCTGGTGCAGGTTTGACTGGCCTCACTGACCTCGATTTGTTTGGCGCAAG AATTACAGATTTGGGGACAAACTATTTGAAAAGTATGCAATATTTCACTAAAATATTAATTTCCTTCAACGTGATTATTT TTGGTTATATTGTCTACCTTTACCAACAATGTGGTTTTCTTTGTTTTTGTTTCTTGCCTTCATCTAGGAAACAGAAGAAT GTCTGGTTATAACTTAACAATTAAATTGCATGAGCTTGATTTCATTAAAATGACTGGAAAATGCTCAGCGCTTAATTCTG AATCCTTTGTTTACATGAGATTTATTATTTTGAGTTCATAAGTTTGATCTGATCGCTAAATCTGTTGAGAATTCAAGTGG AGTTGGAGTCCCACATTGGTTAAGTATGGGTGAGGAGAAGACTTTATAAGAGATGTGACCCATAAGCCTAATGCCTTAAG GTTTTGGGTTTAGATGTGGCGTTGATATCTCTTGGTGTCTTGCTCCTCGGACAAAATCTCAATTTGACAACGGTAATATG TATTTTGTGATCTTCGACTCCCTCTGTGCCAGTCAAGATTTCTCACTCATGTAAAAAGAGTAATGACCTACTGGATAATT GATGAATCTATTTAGTCAAATAAGCTCCAAATTCAATCATAATCCTCTTTTAGTCAGCTGAATTCTGTAGAATTAACTAC ATGTTAATGTCAATTCTTTCTTGAGCCCAGATCAGTTATAGTTTGAATTTACTTTTTTTTTGCTAACTCTGTTTATTGTG AAACAGAATTTAAGAATCTGAGGTCCTTGGAAATATGTGGTGGAGGATTGACTGATTCTGGTGTGAAAAATATCAAAGAT CTTTCTTCTCTAACATGCTTAAATTTATCACAAAACAGCAACCTTACGGACAAAACCCTGGAGTTAATTTCTGGTAATTT TGATGACCTTCGTTTCTCATTTTCTTTGTATAATTTACTCTTGACCAAGTTGAAACCTAAATCCAAATCAAGATATAAGA AGGAAATTTTTGGGTGTTTTTCTTTTCAAAGGTTGTAATTCAAACAATTGGTTGGCTATCCTTCTTGCTTCTAATTAGAA AATGTATAATTATTTGTTTGAATTCCTGCAGTTGAGATGTAATTTTTTTGGTTCTGCTGAAAGGTGGAATCAATAAAGGT TACCAATTACACAATTTGAAGTTAGCAAAAGGTGTCTAAATTTCATTATTTTTTATTGTCAGGATGGGTTTATGATTGTC TTGATTTCTTTCTTATGAATCTATGTCAAGAATTCAAACTTGTATAGTGATACGCAAGGCCAATGGTATAATACAAAGCA TGCAATGCTGTAGTGTCTTGGGGTTGGTATAACCTGATTCTGGATTATCATTTTGTCGCAATCCTAATGACCTAAGTTTT CTGCTTTCCCGGTCCTTCCTGGGTTGTTTGTGTAGTTCTGTATTTTGCGTGGGCTGTTTTCCCATTCATTCACCAAAAAA TCATTGCATCCAGATTTAGTTTTTGGGTAACATCAACATGCATCAAATTCTTTTACAATCGAATGCTGTGCTGGCATTGC TGAATGAGGTACATGTCTGTTTCTTCATGAAGAGAGGAGGGGCTATCTAAATATGTTGTTTTCTTTTACGCAACACTTGG CACGTAAACCACCATTCCCAAGTGCAGGACTAACTGAAATTAAGCTTATGCTCACATGTTTGTGCTCACAATTTCAGGGC TTACTGGGTTGATTTCTTTGAATGTTTCAAATTCTCGAATCACCAATGCTGGACTGCGGCATTTGAAAACGCTCAAGAAC TTGAGATCTCTGACATTGGAGTCCTGTAAGGTGACAGCAAATGACATTAAGAAACTTAAATCAACATACCTCCCTAATCT GGCATGCTTTCGGCCTGAGTAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0353800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGTGGTGCGTGTTCTAGGAAGCAAGAGAGGGATAGTGAGGAAAGTTTCGGTAGAGGGTTTTCACGAAGATATTGCAA ATGTGGGAGTTTGAAGTGGTGGACATCCTCATTTTCTTATCCATCTGGGGATTTGCACTTACAAAAAGGAGAATGTCCAT TGCTGTTGCACTTGTGCATCCAGAAAATAAATGAGGATATTGATAAATATAACACATTTTCTATGCTCCCACGGGATATA AGTCAGCAAATTTTTAATAATTTGGTTTACTCCCAACGTCTAACGGATGTTTCCCTTGAAGCTTTTCGAGATTGTGCTCT CCAGGATCTTTACTTGGGAGAATATGACGGTGTTAATGATTCTTGGATGGATGTCATCTCATCTCAGGGTGAATCCTTAC TTTCTGTAGATCTTTCTGGGTCTGATGTCACTGATTTTGGGCTGACGTACCTTCAAGATTGTCCAAGTCTCATGTCCTTA CACCTAAATTACTGTGACCAAATTTCAGATCATGGACTGCAGTCTATCAGTGGTCTGTTAAACTTGACAAGTTTGAGTCT TAGAAGAAATGATTCAATATCTGCTCAAGGAATGAGTACCTTTTCTGGTCTTGTGAACTTGGTCAAGTTGGATTTGGAGA GATGTCCTAGGATTCATGGAGGCCTTGTTCATCTTCAAGGTTTAACCAAGTTGGAATCTCTCAATATAAAGTGGTGTAAT TGCATAACAGACTCTGATATGAAGCCTCTATCAGAGCTTGCAAGCTTGACAAGTCTAGAGATTTCTTGCAGTAAAGTCAC TGATTTTGGCATCACTTTTCTAAAAGGATTAAAAAAGCTTGCCCTATTAAATTTGGAAGGGTGCCTTGTAACAGCTGCCT GCTTGGATTCTCTCGCAGAGCTTCCTTCACTTTCAAACTTGAATCTTAATAGATGTGCTCTTTCTGATGATGGATGTGAA AAGTTTTCAAGACTGGAAAATTTGAAAGTATTAAACTTGGGATTTAGTGACATAGGAGATACCTGTTTAGCTCACTTGAA AGGATTGACTAAGTTGGAGAGCTTGAACCTTGATTCGTGTAAGATTGGTGACGAAGGATTGGTGAACTTGGCAGGTGCCA TAAGCAATTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0353800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGGACSRKQERDSEESFGRGFSRRYCKCGSLKWWTSSFSYPSGDLHLQKGECPLLLHLCIQKINEDIDKYNTFSMLPRDI SQQIFNNLVYSQRLTDVSLEAFRDCALQDLYLGEYDGVNDSWMDVISSQGESLLSVDLSGSDVTDFGLTYLQDCPSLMSL HLNYCDQISDHGLQSISGLLNLTSLSLRRNDSISAQGMSTFSGLVNLVKLDLERCPRIHGGLVHLQGLTKLESLNIKWCN CITDSDMKPLSELASLTSLEISCSKVTDFGITFLKGLKKLALLNLEGCLVTAACLDSLAELPSLSNLNLNRCALSDDGCE KFSRLENLKVLNLGFSDIGDTCLAHLKGLTKLESLNLDSCKIGDEGLVNLAGAISN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 36 | 373 | 338 | 1.1E-160 | – | |
| PANTHER | 36 | 373 | 338 | 1.1E-160 | – | |
| SUPERFAMILY | 115 | 362 | 248 | 2.55E-43 | – | |
| Gene3D | 126 | 219 | 94 | 5.5E-20 | ||
| SMART | 154 | 179 | 26 | 4.8E-4 | ||
| Pfam | 155 | 215 | 61 | 2.6E-6 | ||
| SMART | 180 | 204 | 25 | 730.0 | ||
| Gene3D | 220 | 292 | 73 | 2.2E-15 | ||
| SMART | 228 | 253 | 26 | 0.68 | ||
| Pfam | 229 | 251 | 23 | 0.016 | ||
| SMART | 253 | 279 | 27 | 130.0 | – | |
| Gene3D | 293 | 376 | 84 | 2.1E-14 | ||
| SMART | 301 | 325 | 25 | 95.0 | ||
| SMART | 301 | 330 | 30 | 44.0 | – | |
| Pfam | 302 | 362 | 61 | 1.3E-6 | ||
| SMART | 349 | 373 | 25 | 9.9 | ||
| SMART | 349 | 376 | 28 | 0.81 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0353800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…