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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0386900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0386900.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Myb transcription factor; TAIR: AT4G01280.2 Homeodomain-like superfamily protein; Swiss-Prot: sp|C0SVG5|RVE5_ARATH Protein REVEILLE 5; TrEMBL-Plants: tr|I1MKS3|I1MKS3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0386900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:78276047..78304041) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTAAGCAGATGCAGACGTCGGCGAGGACAACAATGTCATTTCACGCTATTCTCGATCTTTCATATAAAGCGTGATCGCCG AAAAATCGCGACTAAGAAGACGAAAACGGAAAACAAGTAGAAACGGTTAACAGTGGTAACAGAAACGGAGAGTTCTTGAT GGTGTCACTGAACCCTAACCCAGCTCAAGGGTTTTACTTCTTCGATCCTTCCAATATGGGCCTTCCCGGTGTCAACTCTC TCCCTCCGCCGCCGCCACCTCCTTCTACCACCGCCGCTGCAGCCGAGGATCCGAGTAAGAAGATCCGGAAGCCATATACG ATTACCAAGTCCAGGGAGAGCTGGACCGAGCAGGAGCACGATAAGTTTCTAGAAGCTCTTCAATTGTAAGTTCATGAAAT GAAATTCATTGATTTTTTTTTCCTGTTTCTTGGTGGAATTGAAATTGATACTGTGGTCAATTAAGCACTGTTTCGGTCGA TTTTGAATAGTAATTCGATTAGGATTGTTAGGATTGGTGATTGGTGATTGCTAAGTTTGGGAATTTCGCTTTACCTGAGT TTAGGTTTTTGATTGTAGTAGGAATCAACCAATCTAGAAAACATCACTATATAGATTATTCTCTTGAATGAAACTGAAAC CTGAGAGTCTTCTCAACGGTGTTTCAACCGGTTTTCTTCTACCTTGTTGCATTATTGATTTCTCAACAAAATTTCAAGCT GTTTTTCTTCTTCCATGATACATTATTGAAATAGGAGCAAGTCAATTTGTTGATTGTTCATCCTAATAAATGCGAACACT CGTGAATTGTGAATGCAAGCACTAGAGCCCTAAATTTGCCTCCGCTCTGCCCTTCACGAATGGCAACTTTGGTGTGAGGA TCAAGGCTGAAGAGGTGCTTGTGTTGTTGGTGTGAACCTAATAAAAATGATGGAAGGATGGGTGGCGGTCTCAAAAATCA 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AAAGTCCAACCGATTCAAAGCTGACACCTAACTGGGAAGGTCCATACAGAATTCTGCGAGATTTGGGGCAAGGGGCTTAC CACTTGGAGGAGTTATCTGGGCGCAGGGTTCCAAGGGCATGGAATGCACAACACTTGCGCTATTACTACAGTTGAAGTTG TGTTCTGTTTGCTTCGTTTCAGTGTGTTGTTATTCAGTTCAAAGACTACGTCGTATTCATTGTTTGTGGTTTCTGTATTT GCTTAAGTGTCAAGACTATGTGGTTTGTCTATTAAGACTTGGTAGCATGCACTCTTTTCTCTACCCATTAGGGAGAGTTT TTAACGAGGCATGATGTTAATTTTTAATGAAAAAACAGGTATGCATTCTTTTCTCTACCCCAGGCGGGAGAGTTTTTAAC GAGGCATAACCTTTAAAAATTTCTTGAGTGCTTTGTTAGCATTTAAGTTACTTTTCAACTTAGGTCTATCAATTGGGCGA TTCCAGACAATTGAGAAAGAGTAAGTCTCTTAAAACTAGAGCGTTTGGCCACGAATTCATAAGCATAGCCTTAACTTGGA TTAAGCTTGTCCAACTTAAGCACAAAGTCTCCAAGCGAGCAAATTTCTATATCAGAACAAATTGCGCTTCTGATCTCTTT ATTTTTGATTCAATTCAAAATTACAAAGGCCTTATGAATTCAAAGAATAGTTGTTAAGGAAATATCAAAGTTTTCCTTTT GTGCAAAACTATGAAAGTTTCTTTTGCGTGGAAAGCTTGAATGAACCCATCGTTCTGTGATTAAAAGGAATCCGGGTGAA AGGTATATGGGCTGTGAATTATTTTCATTTGTTCATATTATTGATATGTTGTTTAGGGATTTTTCATTTGTTCATATTTT TGATACGTTACTTTGGAGTTAATCATATTATCATAAGTGGAAGTGATGAGTCTAGGTGAGGAAGGGCGATGCAGAGTTAA GGTTTAGCAATAACAATGAGATTTTCAACGTAAGAACGCTTGTATTAAAATAAAGGAGAGGCGGTACGCCTTAGACAGAC CAGAGATAATTGAAAAGCAGGAAAGCAAGAAACTACATCATCCACTTGGTATAAGACCAAGCAGGAAACAAAAACATCAT TCTCTATTTTTCGGGCGAAGGATCAGTGGTTTTCTCCTGCACCCTCCTTGTCATTGGCGTCTTCACCTTTGTCGTCATTT CTTTCTCCTTCATTTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCCTCGAAGTTGGGCAGAACCAACTTTCCGTCAATGAT CCTTGCATAAGGATCAATACCGTCAGTGTTGATGGGCAGGTTTGGGTTGAGGAACAGAATTTGCTCTTTGGCCTTGTTAA AGCCAGCTTCAAGTTGGGAGAGGATGGAGGCCTTCAAGGAGGTGGTTTCGGTGGAAAGATTGGCGACAGATTCCTTCAAA TCTGTATTCTCAGAGACGAAAAGGCTTGCCTCTTCCTTCATCTTCTTATTCTCTTCTTCTTTCGCCTTCATCAAGGCTTT GTTTTCTTCAAAGGTCTTCTTCAATTTCTCAAGTTCCAAAGCCAGGTCTGCGACTTTTTTCTCATTGACTTTGTTAGATT TTTCCAACAGTTTCACGGTCGATTTCAATTGGGCGTTCTCTTTTTCCTTGTCTTCAAGCTTCTTGGCTGTAGAAAGCCCA TCGAAGCTACTGGATTCAAGTTCTATCATTTTTGAAATTGCAGCAATTTCCAGGCTCTTGGTCATAACAGCTTGACAGGC TTCTTGAAGCCCAATTTTTCTTATTTTCTCTCTGTCAGCCTCGAACACAAGGTTCGTATCCACCAGGGTGTTGAAGTTGA TACGGGAATCCCATAAAGAAGTGACTTCTTCTGCAGTCATGTCTTCAAACTCTTTAAGTTCATACTTCCACGAAGGGGGC GGGGCGCTGGAAGATCCATATTGGTTGGCACCTTTGGATACAAACTTTTTCATTGAAGACTGAATGTTAGCCTTCTCCGT GGGCTTCTCAGAATCTTGATTTCTTTTCCTTCTTTTCGGGGCGGGATTCTTGTTAGTTTCAGAGTGGCTTCCTTCAGGTT CAGTCAAAGTCTTGGCAGGAGAAGGTTTGTTTTTCAATGCTTGCTGTTCACGACGGAAGCGGAGAATGTCATCTTCAGAG AGGCGTGCCATTCTAGCTGCAATGAAATGAAGAAGCAGAAAGTCATAAATCTTTGGGCAAAAGAGATGGGTAGGAGAGAT ATAAAAGGAGATTCTTACCAACAAAGCTAGCTAAGTCTCTCTTTCTAAACGCCTCGTAAAAGTCATACAGGTTTAAGTTA ATTGTTGACAAGAAATCAACTTCATGTTTCTCATCAATTGTTAAGGAAGATTCAGGTATTTTGTAAATCAGTTCGGGCTT ATCAGTCCAGTAATATGGGAACCGAGGAGTGCCGTCATCATAGTAGAAAACGTCTTTACTTTTTTCAGATTCCCTCAGTT TGAAAAATTTTGCTTTCCAGTGTTTGTAGTTGCTCCTAAACAGAGTGAAAAGCCCACTTCCTCTAGCGAAAGATAGAGAA ATGTACTCACCCTTCACTTTCATCCCAGAGGTTTCAAAAAAGGAGAAAAATTTCTTACAGGTAGGAACTATGTTCAGGCA GATGCATAACAATTCAAAGGCCCTAAGATAAGCCCAACCATTTGCAGATAGTTGAGTTGGGGCGATATTCATTAGGGATA GGCTGGAACAGGTGAAGTCTGAAAGGGGAAGTTTATATTCGAGGTCAAGAAATATGGTTTGGAAGAAATACGTGTAGTTT CTTCCGCTAGAGTCAGGTTTTCCAAAACAACAAGGTTCATCAGGGGCGCATGCGATTATGTCTAAGTAGGCATCATTTCC GTCAGCCCTAAAAGTGTATTTGGTTAGCAGATCCATTACTTTAGGAATGGTATGGAAATGACTGAATCTAGTTGTGATTT TTCGTGAAACCCATAGGGAATCAGCAGCCGTGGGGTTCTTACGATTCTTAGGTGCCTTACGGGAATTTTTTGCAACCATT TTTGAGAACCTACCTGAAATTAAAAGGAAAAGGGGTTATCAGGGTGGAGAAGTTTTGTGAAAGAGTCGTTTATGGATATA TTAGGCAGATAGGTCTCAGTATTCTGGGTAAGAGAGTTTGTGTGCAAGAAATTTGATTTGATATTTGATTTTGAGTTCAA GAGAAGAAATGGAGAAGAGGGGATGTGAACATTAAAGCTGATAAACAAATAGTTGAAGGGGATGAGGATTTACCAGGAGG AAAAGAGTAGAGCTTTGAAGAAGACGCGGAATGTTCTTGTAAAATTCTCAGAGGCCCCTTTTGTTTCCCGAGAGTAAGCA GCAAGCACCTGTTAGGATTTTGTGAGGAAATTACTAGAGAGGTTGAAAGTAGTGAGAAGTGAAGAGAGGTGGTGCTTTTA TAATTGTAACTAGGAGTAGTCGCGTGGTTTCATATACATTTTTAGGCTTTAGGAGAGGAGACGTGTCCTTTGTTGAACCG GTAAAACTTCTCTGGTGAAACGTCTTGGGGAAGTAAACAGTCGCGTTTCTTTAGGTTTGAATGTAATAATTACTTTTTTA CTAGTGCCGTTTGAAAGGAGTCAGATAGTGGGTATTAAATGCTGAGTGGAAATGAATTATGAGAATTGTCAGGTTTTGTG CCATCACGTGTTAGGGAAGGTAGATTCAAATTTCAAAATATTTGCATATCTTATTTGTGATTATGACAGGAATATGACAG TGAAGTGATGGGAAGAGATCTCAGTCAGAATCTTAGAAACGAGAGCAGGTGGAGTAATTTCAGTAATCGACAAGGGCGAA GCTTCTTTTTGCTTATTAAAAAAGGCGAAGATTCATTTGCTTGTTATAAGGGCGAGGCTTATGCTGTTTATTATGTGACA TCTTTGCATGTAACAGTTATTTAAGTTTAGCGTTACGGACTTGTTTAGGGGCTTCGAGTATTGTATTGTGGGCTTACTTG AAAGACACGCTGCACCTTAAAATGGCTTTTAAGCTTAGGTGTCTTGTGGGCTTGTGTACTGTTAGCGGGCTTACAGCCTT TGTATTATGTGGGCTTACCGAATTTGTACTATTGGGCCAGGCGACCCATGACCCGAACGGGTCAAAACTTCATAATATAT AAAGAGGACACCGCCCATGCGGTGGGGGATCCAATACTTTTTACTCATTTTGTTACTTTGCCTTGTTCTACTTTTATTGC CTAATTGCTTAGCCCTAACCGGAGATTTAGACCGGAACAGGATGGGTCAGATTTAGCTCTGCTTTCAAAGGACCAAATAC GAGAGGCGAGTCGTTATACTATGATGGGCGGACAACTTTACCGGAGGGGCGCAGGAGTACCGTTGTTAAGGTGTGTTAGC AAAGAGGATGCAGAAAGGATTATGTTTGAGGTGCATGAGGGGGTCTGTGCCAGTCATGTAGGAGGAAGATCTTTGGCTTC GAAGGTGTTGAGGGCAGGATTTTATTGGCCAACTTTAAAGGGCGATTGTATGGAGTATGTTAAGAAATGTGAAAAGTGCC AAGTTTTTGCTGATCTTCACAGGGCACCTCCTGAAGTTTTAAGTTCAATGAGTTCTTCATGGCCATTTGCAATGTGGGGC GTAGATATTCTGGGTCCATTCACTCCAGCAGGGGCGCAAGTCAAGTTTGTTTTGGTGGCGGTGGATTATTTCACAAAGTG GATTGAAGCAGAGTCAATGGCGAAGATAACAGCTGAGAAGGTTAAAAAAATTTATTGGAGGAAGATAATCTGCAGGTTTG GAGTGCCAGCAACCATTGTTTCTGATAATGGAACACAGTTTACAAGCAAGAAGGTCAGAGATTTTTGTGCAGAGATGGGA ATTGAAAACAGGTTCGCCTCAGTGGAACACCCACAATCTAATGGGCAGGTTGAAGCAGCAAAGAAGGTGATTTTGAATGG CGTGAAGAAGAGATTGGGCGAAGCAAAAGGATTATGGGCTGATGAATTGATCACAGTGGTTTGGGCTTACAACACAACAC CCCAATCCACTACTGGAGAAACACCTTTCAAGCTTGCTTACGGAGTTGATGCAATGATTCCAGTGGAAATACAAGACATG ACTTTTCGAGTGGCTACATATGAAGAAAACCAGAATCGGGAAAATGTTCTAGTGGACTTGAACTTGGCAGATGAGGTAAA AGCAGAAGTTCGTTTAAGGGAGGTTGCAGTCAAACAAAGGTCAGAAAGGCGTTATAATACACGAGTGGTGCCTAGGAGCA TGAAAGTGGGTGACTTGGTATTACGCAGAAAGGCAAAAAGTCCAACCGATTCAAAGCTGACACCTAACTGGGAAGGTCCA TACAGAATTCTGCGAGATTTGGGGCAAGGGGCTTACCACTTGGAGGAGTTATCTGGGCGCAGGGTTCCAAGGGCATGGAA TGCACAACACTTGCGCTATTACTACAGTTGAAGTTGTGTTCTGTTTGTTTCGTTTCAGTGTGTTTTTATTCTGTTCAAAG ACTACGTCGTGTTCATTGTTTGTGGTTTCTGTATTTGCTTAAGTGTCAAGACTATGTGGTTTGTCTATTAAGACTTGGTA GCATGCACTCTTTTCTCTACCCATTAGGGAGAGTTTTTAACGAGGCATGATGTTAATTTTTAATGAAAAAACAGGTATGC ACTCTTTTCTCTACCCCAGGCGGGAGAGTTTTTAACGAGGCATAACCTTTAAAAATTTCTTGAGTGCTTTGTTAGCATTT AAGTTACTTTTCAACTTAGGTCTATCAATTGGGCGATTCCAGACAATTGAGAAAGAGTAAGTCTCTTGAAACTAGAGCGT TTGGCCACGAATTCATAAGCATAGCCTTAACTTGGATTAAGCTTGTCCAACTTAAGCACAAAGTCTCCAAGCGAGCAAAT TTCTATATCAGAACAAATTGCGCTTCTGATCTTTTTATTTTTGATTCACTTCAAAATACAAAGGCCTTATGAATTCAAAG AATAGTTGTTAAAGAAAAATCAATTTTTTCTTGAGACAGAAAATTTGATAAGCCTAGGGCTTTGAGTTTTGTGAGAATTT GTCAAGCCTTCTTCATAAGGTAGACAACTTGTTAAGATCAACGCCTTCGTGGATAAACGAATTCAGAAGAAAGGTATTTT CGCAGTACATTATTTTCATATTCTTATACTGATTAGAGCAGTACTTTAAGTTTAGAGAACACAATAACTTTTGAGTTAGA TTACTGAGTTATTACCTTTTAAGAAGGAATGGGGGATTTTAGAGGAAGATAAGTAATTTTGAAGCGTAGACTAGGGGTGA CACTTAGATTTTAAACTTAAGCTTTGTTGCATTAATACTAGAGGGGGGCGTTACATTTAATTGAAAGCGGGAAATGCAGG AAATAAAAAGCAGGAAACTAAGTCAACCGTTTGGTATAAGACCAACGGGAACAAAACATCATTTCAGTTTTTCTTAGGAA GGATCAATTGCTTTCCCCTTCGCCCTCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTCCTTGTCTTCTTCTTCTTCTTCTT GTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCGTCAAAGTTGGGCGTGATTAATTTTCCTTCAATGATCCTAGCATAAGGATCAACGCCT TCAGTCTTGATAGGCACGTCAGGATTTAGGAACAAGATTTGCTCCTTAGCTTTGTTAAAGCCAGCCTCAAGTTGGGAGAG AATGGAGGCTTTCAAAGATGCCGTTTCGGCAGTAAGATCATCAACAGTCTTGTTCAAAATTTGTTTTTCTGAGGCCAAGG AGTTCGCCTCTTCCTTCATTTTTTGTGTTTCTTCTTCCTTCGCCTTCAGTAAGGCTTCACCTTCTTCCACAGTCTTTTTC AATTTTTCAAGTTCTAAAGCCAGGTCAGCGGCTTTCTTCTCGTTGGCCTTGTTAGATTTTTCCAACAGCTTCATTGTGGA CTTCAGCTTTTCATTTTCTTTTTCTTTGTCTTCCAGCTTCTTAGCGTTAGAAAGCCCATCGAAGTGGCTGGACTCAATTT CTATCATCTTGGAAATGGCAGCAATTTCCAAACTTTTAGTCATGACGGCCTGGCAGGCTTCTTGAAGCCCAATTTTCCTC ATCTTTTCCTTATCAGCTTCAAATACAAGGTTGGTCTCCACAAGAGAGTTGAAGTTGATGCGGGAATCCCATAAGGAAGT AATTTCTTCTGAAGTCATGTCCTCGAATTCTTTCAGTTCGTTCTTCCACGAGGGAGGTGGAGCGCTTGAGGAACCATATT GGTTCGCCCCTTTGGTTGTGAATTTTTCCAGCGGAGTTTGAATGGTGGCTTTCTCAGCAGTCTTTTCAGAACTTTGGTTT TTCTTTCTTCTTTTCGGGGCTGGATTCTTCTCCGTCTCAGAGTGACTCCCTTCAGGTTCGGTTAGGGACTTGGCAGGAGA TTGCTTTTTCTTCAACGCCTGTTGCTCGCGGCGGAAGCGGAGAATATCGTCTTCAGAAAGGCGAGACATCTTCGCTGCAA GACGTAAAAGCAGAAAATAGCAGTTAGGAGTTTTGCATTAATTTTTGGGTGAGTCATATTAAGAAGAAAAATGTTCTTAC CAACAAAATAGGATAAGTTTCTTTTCTTGAATGCTTCATAGAAATCATAAAGGTTCAAATGAATTGTGGATAAGAAATCA ACCTCATATTTCTCATCGGGGCTAAGAGAGGATTCGGGAATATTATGGATAAGTTGGGGCTTATCAGTCCAATAGAAAGG GAATCGTGGGGTTCCGTCATCAAAGTAGAAAACATCTTTACTTTTTTCGGTTTCCTTTAATTTGAAAAATTTGGATTTCC AGTGTTTAAAATTACTCCTAAAGAGAGTAAACACCCCACGCCCCCTGGCAGAGGATAGGGAAATATATTCGCCCTTCACC TTCATGCCGGAGGTTTTGAAAAAGTAGAAAAACTTCTTGCAAGTTGGTATTATGCCTAGGCAGACACATAATAATTCAAA GGCTCGAAGGTAAGCCCAACCATTAGCAGAAAGCTGGGTAGGGGCGATGTTCATTAAGGTTAAGCAGGAACAGGTAAAGT CAGGAAAGGGGAGTTTGTATTCAAGGTCTTGGAACAGGGTTTTAAAGAGGTAAGTGTGATTTTTCCCATTCGGGTCAGGT TCACCGAAACAACAGGGTTCATCAGGGGCGCAGACGACTATATCTAAATGTGTATCATTACCGTCAGCCCTAAAATTATA TTGGGTTATCAAATCCATCACTTTGGGAATAGTGTGGAAGTCGCTGTATCTAGTAGCAATTGATCGTGAGATCCATAGGG AGTCAGCAACTGGAAGTTCTTTACGTTTCTTAGGTGATTTACGAGGATTTTTGGCAACCATTTTTGAGAGCGAAGTTTCC TGAAAAGTAAGAAGAAATGGGGTTTGTCAAGTAGGAGTTTTTGTGTGTAAAGGGTGAAGTAGGTTGGGTAAACAAGTTCT AAGTTTTGGGGAAAATTATTTATCCTTAGAGAAGTGATGGAGTGATTTTAAGTTAAACAGGAGAGACAGGATAGTAAAGT TGAAAAGATGAGTAAAAGTTTGAGAGAAGAAGAGATTACCAGGAAGAGAGGTGATAAGATCTGGAAGGAGATGGGAAGTG TTTCTGGTGAAATTCCCAGAAATTCTTCAAGTACTCGAGGCAAGGCAGTGAATATTGTTTAGAATTATAGAGAAAGTTAC TAAAAAGTTGGGAAGGTAGAGAATGGTAAGAAAAGGATTTTGAGCCACGTTTTATAGTGTTGGTGGGTTTAAGCCGCGTC GATTCATTTTTAAGCCGAATCGATGAACTTTGAAACGTGTCTCTTTAGGGGCCTTTAATTTTTACCTTGAAAACGTTTCG GGAAAGGGAACGGGTTTGCGTGTGGATAGAGTTGAGAATAGGTAATTATTACTTTTGTGCCGTTTGATAAGAGTTATGTA AGTGGAAATTAAATGCTGAGTGGAGGTGAATTTTGGGAAACGTCAGGCGTCGTTTCACCATGAGTTTTCAAATTTCAAAA TATTTGCATATCTTATCTGTGATCATGGCAGGAATATGACAGTGAAGTGACAGGAAAAGATCTCAGTTAGAATCTTAAAA GAGAGAGCAGGTGGAGTAATTTCAGTAATCGATAAGGGCGAAGCTTCTTTTCGTTTGCTGAAGAAGGCGAAGCTTCCTTT GCTGGTTACAAGGGCGAAGCTTATTTTGTTTATTATGTGACATTTTTTGCATGTAACAGTTACTTAAGTTTAGCGTTACT GACTTTATATGTTAAAGGGCTTTGAGTATTGTATTGTGGGCTTACTTAAAAGACAAGCTGCCCCTTAAAATGGCTTTTAA GCTTAGGTGTCTTGTGGGCTTGTGTACTGTTATTGGGCTTACAATATTTGTGTCATGTGGGCTTACCGAATTTGTACTAT AGGGCCAGGCGACCCATGACCCGAACGGGTCAAAACTTCATAATATATAAAGGAAACACCGCCCATGCGGTGGGGGAATC CAACACTTTTTTACTCATTTGCTATCTTGTCATTTTCTACTTTTGTTGCCTAATTGCTTAGCCCTGACCGGAGATTTAGA CCGGAACAATCATTTAGACAACCCCTTTATTGTACCATAATTAATTTTGATTTAAAAAACAGTCAAAAGAAAAAATGGAA AGATAAATTAGATGCTAAAACTCTTTATTATTAGTTTTTTGATACATCGGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0386900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGTCACTGAACCCTAACCCAGCTCAAGGGTTTTACTTCTTCGATCCTTCCAATATGGGCCTTCCCGGTGTCAACTC TCTCCCTCCGCCGCCGCCACCTCCTTCTACCACCGCCGCTGCAGCCGAGGATCCGAGTAAGAAGATCCGGAAGCCATATA CGATTACCAAGTCCAGGGAGAGCTGGACCGAGCAGGAGCACGATAAGTTTCTAGAAGCTCTTCAATTATTTGATCGTGAC TGGAAAAAGATTGAAGCATTCATCGGTTCGAAAACAGTTATCCAGATACGAAGTCACGCGCAGAAGTATTTTCTCAAAGT TCAGAAGAATGGAACAAGTGAGCATGTACCTCCTCCTCGGCCCAAGAGAAAAGCTGCTCACCCATACCCTCAAAAAGCTC CCAAAAATGCTCCTACATCCCAAGCCACAGGGCCATTGCAATCTTCGTCTGCTTTTATTGAACCTGCATATATTTATAGT TCAGATTCATCATCTGTGCTTGGAACACCAGTTACTAGTGTGCCTTTATCATCTTGGAATTATAGGGCTATACCATCATC TAGTGTGCCACCAGGGACAAGAGATATGGGATTGACTGGAGCTGGGCAAGCTGTTCCTCTGAATAGTTGTTATAGTAGCA GCAATGAGAGCACCCCTCCTGCTCGGCCAAGTAGCGAAGGGATTAATCAATGCAACCAGCGGCAGCCAATTAAAGTAATG CCAGACTTCGCACAAGTATACCGCTTCATCGGCAGTGTATTTGATCCAGATTCAACTAATCACTTACAGAGACTAAAACA GATGGATCCAATAAATGTGGAGACGGCGTTGCTATTGATGAAGAACCTCTCCATCAATTTGAGGAGTCCTGAATTTGAGG ATCATAAGAGGCTGATTTCATCTTATGATGCTGACTCTGAGAAGCCGAAGTCTGTTAAATCTGAGAGCGTTCTTCTGTCT GTGTAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0386900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVSLNPNPAQGFYFFDPSNMGLPGVNSLPPPPPPPSTTAAAAEDPSKKIRKPYTITKSRESWTEQEHDKFLEALQLFDRD WKKIEAFIGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTSEHVPPPRPKRKAAHPYPQKAPKNAPTSQATGPLQSSSAFIEPAYIYS SDSSSVLGTPVTSVPLSSWNYRAIPSSSVPPGTRDMGLTGAGQAVPLNSCYSSSNESTPPARPSSEGINQCNQRQPIKVM PDFAQVYRFIGSVFDPDSTNHLQRLKQMDPINVETALLLMKNLSINLRSPEFEDHKRLISSYDADSEKPKSVKSESVLLS V
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 23 | 49 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 24 | 39 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 36 | 315 | 280 | 2.0E-158 | – | |
| PANTHER | 36 | 315 | 280 | 2.0E-158 | – | |
| SUPERFAMILY | 53 | 109 | 57 | 1.72E-16 | ||
| ProSiteProfiles | 54 | 108 | 55 | 14.986 | ||
| TIGRFAM | 57 | 106 | 50 | 2.1E-18 | ||
| SMART | 58 | 106 | 49 | 7.9E-11 | ||
| Pfam | 59 | 103 | 45 | 5.0E-11 | ||
| CDD | 61 | 104 | 44 | 8.58649E-9 | ||
| Gene3D | 62 | 109 | 48 | 1.2E-16 | – | |
| MobiDBLite | 108 | 146 | 39 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0386900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…