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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0397300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0397300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transducin family protein/WD-40 repeat protein; TAIR: AT2G46560.1 transducin family protein / WD-40 repeat family protein; Swiss-Prot: sp|Q8TDJ6|DMXL2_HUMAN DmX-like protein 2; TrEMBL-Plants: tr|K7KZU1|K7KZU1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0397300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:79851123..79869372) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCAAACATTAATTAAGTAAATGACTCCTCCCACCAAGAATTTGTTGTTCCAAGTCCTACTCATAATTTGTTGGGACTGAC AGAGAGAGTTTCATGATCAGTTATCACGATCCTGTTATGCGAAGTTTTTTCACTCGAGATGAGTTGATTCACGCTTTCTT CTTCTTTGTTCCTCAGATGAATCGAGAGAGAGAGGAACAATGATACACACAGAGAACACAGAGACAACAACCTCTTCTTC TCCAAACATGAACACCAACAACAACAAGAGCATCATCATCAATCATCTTCCCCTCAATCTCCTCAGATCCGAGGTGGTCA CACCCGCCCCCACCTTCTCCGATTCCACCATCGATTTCCTCCCTCACTTTGCCGGCTACTCATGGCTCGCGTATGGAGCT TCTTCCCTCCTCGTCATCACCCACTTCCCTTCTCCTCTCTCCCCTCACCAAACCCGCTTTGGACCCATTTTCCGTCAAGT CTTCGAGCTCTCCGCAGATCACTCTTCACCCGTCGCTGCTGTCTCCTGGTGCCCCGACACCCCCTCCTCCGGTGACCTCG CTGCCGCTGCCGAAAATTGCATCTGGGTTTTCAACCATGATTCTGCCACGTCTAATGGTAACTCAAAGTTTGATTTTTTT TCTTTTGGATTTTTGTTTAAGTACTGAAATAATTGTTAGTTTTCATAGAAACTACTATAATTTGGAGGGTGATGTTGTGC TTAGTCAGCTAAAAATCTGTTTTGTTAGTTAAGGTGATTCTATAGGTTTGTATCAGACACTTATGATTGATGTGAATTGT GAAATAAACTGTGAAGTACTAAGTAGCTGTTGAATTCTAATCCTTCTGACATAGTGAGCAAAGAGCTGTGTGTACATATA GATTCTCAACTGTTTGGTTGTTAAACTTCAAATAAAGGGGCAGGAAGGATGCTCATCATTGCGCATATGATAATCATGTC 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ATTGTCATAACAATAATGCACATTGCGGAAGCCACCATCAATTTTGGACAAGGATTCTTCATTGGTATGCTCAGATATTA CAAGAGGAAGAGCATAGCTTCATCTGGGATTGGAAGTAGTCCTCAACTTGGCCAAGCAATTCATACCAGCACATGAATAT CTCATGCTAGTGAACCTCACCTCTTCTTTGAAGTTTGAACAGAATGCATGGTTCATTTTGATGCTAGTCATTCTTTCTGC ATGGTACAGAATTTTAATCAGTGGCCGGCATAGAACTTTGTCAAGATTTTTGATAAGATTTAGTCTCTTTTTTGGGTGTA TATTACCTATATGTTTGATTGTTCAGGCATGTCATTCATGAATTTAGACATACTAGGAAACAGAGGACCGGGCTACATGT CTATAGGGTCCCCTGATAGCTTTGTTTTTGTGTACATTTGTAGTCATGCCTCACATCTTGTATATATTGAGAAATTGTTT CATTGATAATATAAGGGCAGTCCTATTACTACCACCCACATACCTTAGCACACCATTCCCTGATTTTTACTATCCCAAAA ATACCCTGAATGATAAGCGACACTTTTATTAAGACGTGTCAGTTTTACAATCTTATCCTCTTTTTTAGTTCAAGATACAC ATGACAAGCAAAGAGAAAGATAATCACACTAAGTTTTTTCTTGATTCACTCGACAAACAAGTATTTTGACCAACAACTTG TCCCTTACAAGTATTCTTTTGCTAAAGGCATTTTCAGATTCAACTCTTACAATACTCTTTGTATCCTTTTCCTCTTGAGT ATGATTGCAATCACAAGCAAAAAGGTATTCAAAAAGAGAATTAACAAAAGACTTACTTCAATATAATCCGTTGATGATTG AAAATCAGCTGCAAGAGCTTGCAAGATAAAGTTATATATTAACCACTATTATGAAGCTTTTCCAAAAAATTGAAAAGTTT ATTGACAAGG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0397300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATACACACAGAGAACACAGAGACAACAACCTCTTCTTCTCCAAACATGAACACCAACAACAACAAGAGCATCATCAT CAATCATCTTCCCCTCAATCTCCTCAGATCCGAGGTGGTCACACCCGCCCCCACCTTCTCCGATTCCACCATCGATTTCC TCCCTCACTTTGCCGGCTACTCATGGCTCGCGTATGGAGCTTCTTCCCTCCTCGTCATCACCCACTTCCCTTCTCCTCTC TCCCCTCACCAAACCCGCTTTGGACCCATTTTCCGTCAAGTCTTCGAGCTCTCCGCAGATCACTCTTCACCCGTCGCTGC TGTCTCCTGGTGCCCCGACACCCCCTCCTCCGGTGACCTCGCTGCCGCTGCCGAAAATTGCATCTGGGTTTTCAACCATG ATTCTGCCACGTCTAATGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACAACAGACGAAAGTGGGAGCCATCAGA TGGACAGGATCAGGGGATGGAATTATATCTGGTGGAATGGAGGTAGTCTTCTGGAAAAGAATTAACAAGTGTTGGGAAAT TGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATCAACCCCAAACTCTTGTTAGTGCAACATGGTCTATTGAGGGCCCTTCGGCAACTGCAG CACATCCTAGTAAAGAACAGATTGGAGGCTCCTTAATCAGCGAGGTGAGCAAATGTGTATTAGTATGCCAAAGCAATGGG CTATCTGAATATTCAAAAGTCAAACTGCATCATCCTCTACCTGTTGTAATGATTCAATGGAGACCATCAAGGGGAAAGCT AAACAGATATGGTAGGAATTCAATAAAGAATGTATTACTCACTTGCTGCTTAGATGGAACTGCAAGGTTATGGAGTGAGA TTGATAATGGAAAGGTCAGAAGGGCTGGGAAGGACATCAATGATCAGAAGAACACAGGGTGCTCTTTTTGTGCTGTTGCT GTTATTGAGATTAATCAGACCTTAAATGGAGTTCTTGGTTCAGATATATTTGTGTCATGGGGGATGGAAATCGAGGGAAT ATTTAGAGCAGGTGAAAGAATCAAACAAGTTTTTTCCAAAGAAGGATCTGAGCATGATGTTAGAAAATGTGATTGGTTAG TTGGGTTTGGTCCCGGGATGTTGCTTAGCTTTTGGGCTGTCCACTGTCTTGATGATGTTTCCCCGCTGAGATTCCCCCGA GTTACATTGTGGAGGAGAATTGAACTCCAAAACCAAGACATAGAAAATGTTTTTAAGTTTGACTTATCTAATTTTAGAAA TGCATTAGTTTTGCATAAAGTCAATACACTGAGAAACTGCTTGTCTGGCCCCCCTATGATATGCTCTCCACTGCAGTTAT TACCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCATTTTTCCATATTCAAACATTGCATGATACTGTGGAGAACTCCTGTGATAATGAC GATACAGATAACATCTCCTCTCGTTTGATTGGTGGAGTTTTAAATTTAGATGGACACAGCGGAAAAATTTTAAAGGTTTC AATTCACCCTTATATATGCAAAGTTCAATTTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTGCTTTTTTGGTCACTATCTA ACATTTCAAACAGCATTTTGGGGTGTCCAACTTTGGTTCCTACTTGGGAACTCCTTGGAAAGCTTGCAACTCAAGACTCA TGCTCCAAGTATACAAGCTTGACATGGGCACCTTCAATAGTTGGTGATAAACTGGTTTTTTTTATGGGACATACCAGGGG GGTTGATTGCTTCATAGTCAACATTAGTCGAACCGAGGAAGAAAACATAGAATGTCACTACTTATGCACCATTCCTTTCA GTGGCCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCATCTGATATCTTTGCAATACCTCTGACTTCTACTTGCAATAAAACATTATGT AGAAATAAACTTATGCTATTGGCAGTTTGGATGGGGAAATTTCAGGCCCTATCATGGGAAGTTAACATGCACTCTTTTGA CATATCAACAAGCTGTTGTGAATGCAATTTTGATTCTAATAGCCTTGATGACTGCAGTGTTTGGGCATTTCAAAGTACAT TTGCTAATAAAAGGTATTGCGTTACTGTAATTCCATGTTCATCTGAGTTTCCAAGTTCTGATGATATGGTTACTAGTTTT GCTGTAGCTGATTCAGGCACTCTGAGTTGTAAACAACAGGAGTTCGGTTTTGCAAGTGATCTTTGCAGTAGTTATCCTAC ATATATCATGGCCACTGGCTGCTTTGATGGTAGCTTAAAACTTTGGAAAAGTAACCCTGGAACCCCGTCGACCCTGCACT TGCCATGGGAGCTTGTGGGTATGTTTGTTGCACACGACGGTCCTATCAAGGGCATATGTTTCGCTGATTGTGGTAAAAAA ATTGCTACATTCTGCAACAAAAACAAATCAAATGCTGTCAATACCATCCATATATGGGATGCTGTAAATCTGATCACCAC AGGGACTTTTATTTTGGAAGATAAACTAACACCTGAAAGTGATGTTATTACTCTGAAGTGGTTAGCTTTAGGGACTGGTG ACTTATTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGGATTGCATGTATATGCTCAGAAGCATTATGACGGTCTGAATTTGTCCAAC TCTGTTAGTTTTCCAAAAATGAATCTATGGGTTCGCATTGCATTTGCTCACACTGACATTCCAATTTATGATTTTGTGTG GGGACCCAGAGCTGCAGCAGTGGTAATCCATGGAAATTACTTTAGTATATTCAGTCATTGGTTGTTTTATATGGATAAGA AGCAAAAGAGTAATTTTCATCCTTGTCATTCAGAGCCAAATGCCTATAATTGCAAAGGTGAAATATATGAAGACATACTT TCTGCAGTTTTTACTGATGGCGACACTGGTGACTTCAGAGAACTGTCAACAGGAGACAGTCCTGCAGATTGTGATTCCAA GCAGTCCATCAAAATAAATATCAAGGACCATAACCTATCCAGTAGCTTGTTTCTGGCCAAGGAACAATTAAAATCTGAAC CTCTTACCATGGTTGGTTTATGGAGCATCTTAGAAGTAGCTGAGATAATTAGTGGGTCTTTGCCTACTTATCACCCTGAT GTACTACATACGAATATAAGTTCAGGCAATTGGAAACGTGCTTATGTAGCTCTGAGGCATCTTGTTGAATGTCTGGCTTC TAATTATGATCCTCAAAAGAAACATATCTCCAAAAGAAATGCTCTTCCAAATATCATATTGTCATACTATTTCGAAGGCC GTATATTAGAAAGTTCCCAAGATAAGGGATTCCATTGGAGTGGGGATGTTTCTTCAATGTCATCAATTTCACAGGCTCCA TATTATTCAGGTTCCAGTGCTGAAAATAACAGCATTCCCACCTCGACAAGATCTGAGCTAAATGGCTTTATTGAATCTCT TGAGAAATTTCCCGATATACCCCTTTGGATCAACATAGAGAAGACACAGATTCTTGCAATTATTGATCTGCTAAGTGAAG TTTGTAGCTCAGACTCATCTTCTGCATATCAAAGTCTCGATGAACCTGGGCGGAGGTTTTGGGTTTCCCTCAGGTTTCAG CAACTGCTTTTTCAACGGAAGTTTGCTAGAGCTGCATCTTTTGAAGAGTTGCTTGTTAACTCAAGGTTGTTTGTGTGGGC TTACCACTCTGATTGCCTAGAAAATTTATTCGGTTCTGTCATACCTAATGAACCATCATGGCAAGAAATGCGTGCTTTGG GTATGGGCTTTTGGTTTGCTAGCATACCTCAGTTGCGTGCAAGGATGGAGAAATTGGCAAGAGCACAGTATTTGAAGAGC AAAAATCCTAAGGATTGTGCCTTGTTGTATATTGCATTGAACAGAATTCAAGTTTTGGCTGGCCTTTTCAAAATCAGCAA GGATGAGAAGGACAAGCCTTTAGTGGGTTTTCTTTCACGCAATTTTCAGGAAGAGAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAAA ATGCTTATGTCTTACTGGGAAAGCATCAGCTGGAATTAGCAATAGCTTTCTTTTTGCTTGGAGGTGATCATTCGTCTGCT ATAAATGTTTGTGCTAAGAACCTTGGGGATGAACAGCTTGCACTAGTCATTTGTCGCCTACTTGAGGGCCATGGTGGACC ACTGGAGCATCACCTAATTACAAAGTATATACTTCCATCTGCGATTGATAAAGGAGACTACTGGCTTTCAAGCCTTCTGG AGTGGGAAATGGGTAATTATTATCAATCTTTCTATAGAATGCTAGAGTTTTCTGTGAATCCTGTGGCTCAAGAGTCTACC ATCATGTCCAATTGTGGTCCTTTTCTAGACCCTACTGTTGGTTCTTATTGCCAAATGCTAGCATCAAAGAATAGCATGCG GAATGCTGTAGGGGAGCAGAATTCTGCCATCCTTTTAAGATGGGCAACTTTGATGACAGTTACTTCCCTAAAAAGATGCG GTAATCCTCTTGAGGCATTGGAGTATTTCTCATCTTCACTGAGCATGCTTGGGACTGCAGATCAAGAGAATGAATTGGGT GATGGACATGTTGTGATATCCAGTACATTAAAGCCTTTGCCAAGAAAATCCTCTAACTGGTTGTCTACTGATGTATCTGT GCATCTGGAGTTTCATATTAAATTGAATTTGGCACTTTGCTACTTATCTAAATTGATAAGAGAGCATCCAAGTTGGCCTG ACACTGCTTCAGAATCTGATGGGGAAGCCTCTTGTTCTGATGAGTACATGTTGCAATATGAGAAATCAGTTGAAAGTTTT AAACAAAGGTTATACAAAGGGCTTGCTGTATTTGAACAGAGGTTTTTATTGGCTCCGAGCTGCCTAATCAGTATGGTTTT ACTCTTACTTTGCCATCATGGATTATTGTTCATTGGTCATGATATGACAGATGGATGCACTCAAGAAGAAATGTCTCAAA AGAAGAGTGATATATTTGATGTTTTCAATTTATATCACTCTCCGTTTAAACCCTTCTTTAAGACTGCCGAAGAAATCTCC TTTTTGTATTCAAGATTGTTTTCTGCCTGCAGTATGGAATATTCTCAACGAAGTTCAACTCCTCTTGAGAAAGATGAGTC CAAGTTTTTGGATTCTTCACATTCTCACTTTGAAGGTCTTCTGGTTTCATTGTGGTACTTAAGAGCTAGTTTGAGGACCC AATTGAGTTCTGTTAGCAAAGATTTTATTAAAAAGCATGTTGATATCCTTGATTATTTTGAGTACTATTTATATTTTTCA TTAGCTTGGCTTCAAAAGAACTCAGAAGCTCTTTTATTGATGGTGCATCCTTTCTTGATTGAAAATGCTGATGGCCATAA TCCTTATGAGATTGATATGGTGAATCTGAAGAAGCTTATACCGAAAATTGCACAGTTGTTGGCTCAAAATTCTTCCGTAA CTAATATGGAAAACCTCCAAGTTTCCAAATGTGAAGAAGATAAACTAGTTGCAGATGTAAAGCATTTGGTTCCTGATGAT GAAAGATGGAAGATTTTAGGGACCTGCTTGTGGCAACATATGTCTAGATTCATGATATCTAACTTGAATTTGGTTCTTGC TAAAATTGAAGATGATAATTTGTCTGGCACTTTCCACAAAAAACATGCTTATAGGGAGTTGGCACTCATTAATATGGATT ATGATAGCATCAGCTTGCCAGAGAAGATTCAGTTAGTCTCATTTTGCTTATGTGATTTCCTGATGACAACAGTTACTCAC ATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACTTGTGGAAATTTTGTGGCAGAAATTGGAGCATGATTCGAATGTAATGACCCTTAA ATGGCTAAAACAAACAACAGCATCAGAATACAGTCATGACAGAAACCTGGACATATTGGAACTGGTGAACAGGAAAGATA AATGTTTAGCTCACCAGTTACTATGGGATCACTGTGCTGATCCCAAATTAATATCTGATTGCTTTGCACAGGAAAAGCTC GATTGGTCAAAGGATTTGGACCATAAGCCTACTAAAGGATGGAATGACCTGTATATAATTATGACAGGACTACATAAAAC TGATGATTCACGTGGTGATGAATGTAAACTAAGCACTGGATCTTCTAATCATGAAGTCGGATCTCCTGTTAAAGGAATGT TTCTAAGTGATCATGCTTCTGCAAGATCCAACCAGAAAGATATTACTAGTATGAATATTGCAGTTTTCCAGAGTCCCAGA GAAATGTACAAGAGAAATGGAGAACTTTTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACTGATCTTCAGGAAGCTGCAGCTGCTAG CAACCGGAAGGGTATAGTATTCTTTCATCTGGAAGATGAGGTTCCTTTAAGTGGTGAATCAGACCTTTTGTGGACCAAGG CTGATTGGCCACAAAATGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACACCTGCTCCAACATGCGTTTCTCCTGGTGTTGGCCTTGGG AGCAAGAAAGGGGCACACCTCGGTCTAGGTGGAGCAACTGTTGGTGTGGGTTCTTCAGCTTGGCCAAGTAGAGACCTGAC AGGTGGTGGAGCATTAGGAATGCTAGGTTATGCTGGTGTTGGTGCCTCTGGATTGGGTTGGGAAATTCAACAAGACTTTG AAGATTTTGTTGATCCACCTGCCACTTTGGAGAACACAAGTACGAAGGCTTTCTCTAGTCATCCAATGAGGCCTTTCTTC TTAGTTGGTTCAAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAATAAGGATAAAGCTGCTGCTACATATGGAGTGCTGCC TGCTGCCAATGTCCCTCCACCTTATGCTCTTGCGTCAATTTCAGCTGTACAGTTTGACCACGTTGGACACCGGTTTGCCA GTGCTGCATCAGACGGGACTGTCTGCACATGGCAGCTCGAGGTTGGAGGAAGGAGCAATGTTCGCCCAACAGAATCATCC CTCTGCTTTAATGGTCATGCATCGGATGTCACGTACTTTTCTTCAAGTGGATCAATTGTAGCTGTGGCTGGATATAGCTC TAATAATGTTAATGTGGTGATATGGGATACTTTAGCTCCACCTGCAACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTG GTGCACGCTCCATTTCTGTGTTTGATAATCATTTCGGAAGTGGTTCTGTTTCCCCTCTTATCGTGACCGGTGGCAAAGGC GGTGATGTTGGAGTTCATGACTTCCGCTATATTGCTACTGGAAAAGCTAAAAGGCATAGGCGTGCTGATAGCGGTGGGCA AAGCTCCATCACATCTTTGAATTATGAAAAGGACCAGAATATAGATGGGATGCTTTGGTATATCCCAAAGGCCCACTCAG GAAGTGTCACAAAAATAGTTGCCATCCCAGACACCAGCTTGTTTTTGACTGGAAGCACAGATGGAGATGTCAAGCTCTGG GATGCCCAGAGCACAAAGTTGATACATCACTGGCCAAAGATACATGACAAGCACACCTTTCTGCAGTCAACCTCTCGCGG ATTCGGTGGCATTGTTCGGGCTGCTGTTACGGACATACAAGTTGTTCCCCATGGTTTTCTTACTTGTGGTGGGGATGGAA CGGTAAAGCTTGTGCGGCTGAACAGTCACCTGCATGGCTATGGAGGGGAGTTATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0397300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MIHTENTETTTSSSPNMNTNNNKSIIINHLPLNLLRSEVVTPAPTFSDSTIDFLPHFAGYSWLAYGASSLLVITHFPSPL SPHQTRFGPIFRQVFELSADHSSPVAAVSWCPDTPSSGDLAAAAENCIWVFNHDSATSNGSFCWSQNAVLVQQTKVGAIR WTGSGDGIISGGMEVVFWKRINKCWEIAWKFKADQPQTLVSATWSIEGPSATAAHPSKEQIGGSLISEVSKCVLVCQSNG LSEYSKVKLHHPLPVVMIQWRPSRGKLNRYGRNSIKNVLLTCCLDGTARLWSEIDNGKVRRAGKDINDQKNTGCSFCAVA VIEINQTLNGVLGSDIFVSWGMEIEGIFRAGERIKQVFSKEGSEHDVRKCDWLVGFGPGMLLSFWAVHCLDDVSPLRFPR VTLWRRIELQNQDIENVFKFDLSNFRNALVLHKVNTLRNCLSGPPMICSPLQLLPCNSLVWSFFHIQTLHDTVENSCDND DTDNISSRLIGGVLNLDGHSGKILKVSIHPYICKVQFAASLDSNGLLLFWSLSNISNSILGCPTLVPTWELLGKLATQDS CSKYTSLTWAPSIVGDKLVFFMGHTRGVDCFIVNISRTEEENIECHYLCTIPFSGHGPYEDGPSDIFAIPLTSTCNKTLC RNKLMLLAVWMGKFQALSWEVNMHSFDISTSCCECNFDSNSLDDCSVWAFQSTFANKRYCVTVIPCSSEFPSSDDMVTSF AVADSGTLSCKQQEFGFASDLCSSYPTYIMATGCFDGSLKLWKSNPGTPSTLHLPWELVGMFVAHDGPIKGICFADCGKK IATFCNKNKSNAVNTIHIWDAVNLITTGTFILEDKLTPESDVITLKWLALGTGDLLLGVCLQNGLHVYAQKHYDGLNLSN SVSFPKMNLWVRIAFAHTDIPIYDFVWGPRAAAVVIHGNYFSIFSHWLFYMDKKQKSNFHPCHSEPNAYNCKGEIYEDIL SAVFTDGDTGDFRELSTGDSPADCDSKQSIKINIKDHNLSSSLFLAKEQLKSEPLTMVGLWSILEVAEIISGSLPTYHPD VLHTNISSGNWKRAYVALRHLVECLASNYDPQKKHISKRNALPNIILSYYFEGRILESSQDKGFHWSGDVSSMSSISQAP YYSGSSAENNSIPTSTRSELNGFIESLEKFPDIPLWINIEKTQILAIIDLLSEVCSSDSSSAYQSLDEPGRRFWVSLRFQ QLLFQRKFARAASFEELLVNSRLFVWAYHSDCLENLFGSVIPNEPSWQEMRALGMGFWFASIPQLRARMEKLARAQYLKS KNPKDCALLYIALNRIQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQEEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAIAFFLLGGDHSSA INVCAKNLGDEQLALVICRLLEGHGGPLEHHLITKYILPSAIDKGDYWLSSLLEWEMGNYYQSFYRMLEFSVNPVAQEST IMSNCGPFLDPTVGSYCQMLASKNSMRNAVGEQNSAILLRWATLMTVTSLKRCGNPLEALEYFSSSLSMLGTADQENELG DGHVVISSTLKPLPRKSSNWLSTDVSVHLEFHIKLNLALCYLSKLIREHPSWPDTASESDGEASCSDEYMLQYEKSVESF KQRLYKGLAVFEQRFLLAPSCLISMVLLLLCHHGLLFIGHDMTDGCTQEEMSQKKSDIFDVFNLYHSPFKPFFKTAEEIS FLYSRLFSACSMEYSQRSSTPLEKDESKFLDSSHSHFEGLLVSLWYLRASLRTQLSSVSKDFIKKHVDILDYFEYYLYFS LAWLQKNSEALLLMVHPFLIENADGHNPYEIDMVNLKKLIPKIAQLLAQNSSVTNMENLQVSKCEEDKLVADVKHLVPDD ERWKILGTCLWQHMSRFMISNLNLVLAKIEDDNLSGTFHKKHAYRELALINMDYDSISLPEKIQLVSFCLCDFLMTTVTH ISSYHVKQLVEILWQKLEHDSNVMTLKWLKQTTASEYSHDRNLDILELVNRKDKCLAHQLLWDHCADPKLISDCFAQEKL DWSKDLDHKPTKGWNDLYIIMTGLHKTDDSRGDECKLSTGSSNHEVGSPVKGMFLSDHASARSNQKDITSMNIAVFQSPR EMYKRNGELLEALCINSTDLQEAAAASNRKGIVFFHLEDEVPLSGESDLLWTKADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGVGLG SKKGAHLGLGGATVGVGSSAWPSRDLTGGGALGMLGYAGVGASGLGWEIQQDFEDFVDPPATLENTSTKAFSSHPMRPFF LVGSSNTHIYLWEFNKDKAAATYGVLPAANVPPPYALASISAVQFDHVGHRFASAASDGTVCTWQLEVGGRSNVRPTESS LCFNGHASDVTYFSSSGSIVAVAGYSSNNVNVVIWDTLAPPATSRASILCHEGGARSISVFDNHFGSGSVSPLIVTGGKG GDVGVHDFRYIATGKAKRHRRADSGGQSSITSLNYEKDQNIDGMLWYIPKAHSGSVTKIVAIPDTSLFLTGSTDGDVKLW DAQSTKLIHHWPKIHDKHTFLQSTSRGFGGIVRAAVTDIQVVPHGFLTCGGDGTVKLVRLNSHLHGYGGEL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 1286 | 1286 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| PANTHER | 37 | 2538 | 2502 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 37 | 2538 | 2502 | 0.0 | – | |
| SMART | 90 | 132 | 43 | 7.6 | ||
| SUPERFAMILY | 99 | 847 | 749 | 2.52E-14 | ||
| SMART | 242 | 292 | 51 | 0.79 | ||
| SMART | 489 | 531 | 43 | 140.0 | ||
| Gene3D | 671 | 886 | 216 | 4.8E-9 | ||
| SMART | 703 | 763 | 61 | 0.65 | ||
| SMART | 775 | 820 | 46 | 0.39 | ||
| Pfam | 813 | 1424 | 612 | 1.9E-77 | ||
| Phobius | 1287 | 1305 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1306 | 1614 | 309 | - | – | |
| Phobius | 1615 | 1638 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1639 | 2551 | 913 | - | – | |
| SMART | 2216 | 2253 | 38 | 120.0 | ||
| Gene3D | 2217 | 2439 | 223 | 2.4E-15 | ||
| ProSiteProfiles | 2221 | 2365 | 145 | 9.046 | ||
| SUPERFAMILY | 2231 | 2541 | 311 | 3.21E-28 | ||
| SMART | 2270 | 2305 | 36 | 0.4 | ||
| SMART | 2316 | 2356 | 41 | 7.6 | ||
| SMART | 2361 | 2407 | 47 | 5.8 | ||
| Gene3D | 2440 | 2546 | 107 | 6.8E-11 | ||
| SMART | 2442 | 2481 | 40 | 6.1E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 2449 | 2490 | 42 | 13.106 | ||
| Pfam | 2449 | 2481 | 33 | 0.0087 | ||
| ProSiteProfiles | 2449 | 2490 | 42 | 14.251 | ||
| SMART | 2498 | 2539 | 42 | 9.7 | ||
| Coils | 2551 | 2551 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0397300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…