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LotjaGi3g1v0503300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0503300
Transcript ID LotjaGi3g1v0503300.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Cysteine-rich receptor-like kinase; TAIR: AT4G05200.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 25; Swiss-Prot: sp|Q9M0X5|CRK25_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 25; TrEMBL-Plants: tr|V7BUR2|V7BUR2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0503300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:92151582..92161714) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TACAAGTCCAACAGTGCCTCGTACCAAAAAAGCCCAAAGGAGTATATTGTTCACTCAGCTTCGTCTTTCTCAAGAAAAGC AGCAATTTGCAGAAGCAGAAATAGCTGAAGGTGCCAAATTCCAGTGTTGACAATATAGAACATGGAGTTCGTTGCTGAAG AAGGCAAGCACCTCAATGACAATTGCTCCACTTTGATTTTGGTTTGTATCATTTTCTAGGGTTTTATATATTTTCCCCCA ATTTTGACACCACTTTGTTATGAATCTCTTTGCCAAAAAGACATTCACTTTTCAGTACAGTGCTATTGGAGAAATTGTGG GTTTAGCTCAAAATTGTAACTTGTTGAATTTGTGGTTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGTTTCAGCCTGCTTTATCTATTGGG AATGTGGGGCAACTAGCAGCAGACCTTTTGGTTTCATCAATGGCTACAGAGAGAGTTGGGTACTTGGATGATCCTCATGT TCTTCCCTGTGTTGGCAATGATGCTTATGGACCTGTTCCTCAAGGAGACCTTGCTCTTCCTCTTGAAGGTTTTGCTTTAC TTTTTATTTGTTCTGTGACTGCAATGAATTTTCATTTTTTTAAGTTAAAAATTCTCAAAATGTGTCACTTCTTTGCAGCT TATGATTCCCCATCTAATGCTCTCACTATCATCCAACAGCGATCTCCGGTGATTAAGGTATCTTCTGAGGCATCATTTGT TCTCTTCATGTCTTTTATCTGACATTGCTTACCTTAAGTCTAAGTATGGTGATTTCAGGCTGTCATTAAGTGTTTTTTTA TGCGTATATTGTTCCCTAATCAGACTGAGCTGTCTGTAGTAAAATTTGAATGTGGACAGGCTGAAGCTTGAATCTTACTT GCTTTATTTTTCCTGTACATGAGCATGAGTTTCAATCCCCTTTTTCTGTCCTTCAAGTTTGTATTTTCGAGTGTTTCTAG ATGTTGGCTTCTATTTTGTATTTCCTGCAATAATGATCATCACTATTTAAAAAAAAAAGTTAAGATGACATTAATTAGTA TTATGTTGCCCTTGTACTCAATTTATGTGTAATCACCTTAAATGTCACTTAAAAAGAAATGGAGAAAGTAGATATATTAA CTGAGTAGTGTTTTGTGTATTTCCATGTTGGATCCTCTTTTTCTTTGTTTGTTGGTTCTATTTTGTGTGTTTTGTTCAGG ACACGTAACTTTTTATTGTTAATTATGAATGCCATGAATTTTGAGTATTTTTAAGTATATACATACATATATAGTATAAA TTGTATAGACTGTCTAAAATATTCAGTATAGCGGTCATCTTACTACGCGCTATATACTACTAGCATTTTTGGGGTTGAAA GCTACGCACTATTCTTAGTCTAGTTGTGAAGAATCATATGTACAATTCCTGCTTAATATTTTGATCAACACTAGCATAGG CTTGTGGGTAACAACAAGGAATTCACTGGAGTAACTTACAATTTAATGTGCATTTCCTTTATGCTAGTTCCATACTTCAT GTTTTTATTAGGTTGAATGCTTGAATTGACACATAACTTTGGAATCTGGAAAGATAAATTGCAATTAATACGTGGTCATT TGAATAGGGTATGATGCTTGATTTTGCAAAAAACATGGCTGATTTCCTTGCTGGTAGTGGAAAGAAGCATATTGTTCTTC TCTCCAGCTTAGATTTTGGAAAATGGCAAAAAGTTGACATGTCAAGGTGAGGCAGTTATATTTTGAAATACAACTTCTTT ACGATTAAGATATTCATTCATTGTTCCTGTTATTTTTTGTTTGTCACATTTATTCAAATCATAACTGCATGAAGATTATG TCCATTCTCACCCTGACAATCTTGTAAAATTTAAGAATAATCTTGGTCTAGGAAATGCATTGGGATATTTTCCATTCTGA 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AAGTTGAATCCTAACTAGTGAATAGAAACATGTTGGCATGTAAGAAAAATCATAAAACTTCGTTGGTAATATTTCTGATA ATTGCATTTCAGGGATTGAAGGTAACAAGTGGCGAGTTCCACTTTCTTGGATGACGGTATATGGACCACCCCCGGATATG TCAATGTTCTAAGGCTAGATTGGTGTTATTAGTGAAATTTAATGGATTCTATTGTCTTAGAATTTAGTTTTGATTGTGCA GTAAAGAACATGTAAAATTTTATCGGAGTTCTGTACAATTAATTAGATATAACCTTTTTTTAATAGTCGTCTTGGGATGT TGAAAATTTCCCCATCTATAGTCAACTCTTTAATTCAGGTTTCTTTATGCAATATTTTTATATGAAATGTGTTGAGCAAA GTAACATGAAGTACAAATATGAATTTATTCTTCCTAATCTCCTAATCAATGAGACTTAGAGAGCATATTCATCCATTTTC AAGTTATGAATACTCTAATCTTTTATAGAAACAAGAGTAATCACATCACTAGCCAGTGGCCAGCATCTTCATATATTTCA TTTTAAATTTTCTTTCTTCAGTTACCATGATCTCTAGTCACTTGACTTTTTTATTTCAATCTAATACACTTTAGTGATAC AAGTTCTCTTCAATGAGAAAAATACTTTTATCCAATATACCTCGTTACTTCATTTAACTTTTTTTGTATCAGGATGATGC AAAAATCAATTTACAATCTTGTAAACCTTAAAATAACCTAACACTTAGACTCTGGACAGGTTGTATTTGATTCTGACAAA TTCAAATCTGGCCAAGTAGAAGAACTACTAGATGGCAAAACCTTTTGTATCAGAATGATTATATTTTTTATTCACAGAAC TCAAACATAAAAGGGAATTAAACTCTGTATCACTTGAGCCAAATTGGTATTGATAAAGCAGTTGACTAAATCATATGTGA GTATCATCAGTTCTTGGGGTGTGGAATTCAACTAGATTCATCTCAAATGATGATGGCAACAGTATTCAACCTGAGAACAC CAATTATTGCCATCCTCACGTTTCTTGGCTTCATGGCCCTGTCCCTTTCCACCACAGCAAGAGCACAATCCCCAAATTAC GTTGGTGATGACTGCCAAAACTCAACAGAACAAGCCCTGACCACTGCATACCAAACCAACCTTAACAAAGTCCTCTCATG GCTCTCCTCTGATGCAGCCACAAGCAAGGGTTATAACCACACCACCATAGGAACTAACACGTCTGACACTGTCTATGGCT TCTATGATTGCAGGGCTGATGTCACAGAATCATTCTGCCAGTTCTGTGTCTCGACTGCAGCATCAGAAATCCCTCAACGC TGTCCTAACAGATCCTCCGCTGTGATATGGTACAACTTCTGCATTCTCAGGTACTCGAACCGTGATTTCTTTGGGAAACT CACAACAACCCCGTCATGGGAAATTTTGGGGTCCAAGAACATCACTGGCTCACAAGAACTTCAGAAAGCTGAGAAATTTA TGCAGAGTTTGATAAGTGAAGCTAGTGTGGAGAGCAACAAGTTGTTTGCAATGGGGGAGTTCAATTTGAACAGTTCTGAG GAGAGGTATGGGTTGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTTCTGCTAACTATTGCAGCCTGTGTTTGGAAACTATGCTAGACAA AGTTCCTCAGTGCTGTGGGACAGAGGTTGGATGGCAGGTTTTGGCTCCAAGCTGTCTGATAAAGTATGATGATTACATAT TCTACCAGATTACTAATCAAACATCTCCTTTGCCTGCTCCAGGTACATGTAGCAGATTAATTGTTACCATTGTTAGGTAG TTACCATTGTGTTTTATTGGTTCCTTCTACCTTCTACTCTACTCTGCCATTTTTTTTGTCAAAGTATAGTTAGATACTAC AATGCTTTAGAATAAAAGAGATACAAAACATTGCACGTTTGTTTATTATAGCACAAAAATCAATAGACAATAAGAGAAAG ACAAAACTCCCTGTGAGTCGACTCTGTCGGAGTAAATCGACATAAATTTCACAAAATAATTTTGTCTTCAGAAGAAATTG TAGAAGGATTACCAAACTCATTGACAAGTCTTTCTATTTTGGCTGCATGGTCAGGCTGCAAGGTTGGTTTAGTTATTAAA GATAAAAAAAAAAACTTTATTTAAAAAGTTTAGGTTCATTTTCTACCATGAAGTTCTTAATTCTTGGCCCATAATGTATA ATTAACAAGGATGAGAAATTCAATATAATAATTTTGTTGTAGTTAGTTTGTTATCTATAAATCTAAAAAGCTAATACATT ATTTTAAAAATGAGAAGCTAATTTAGTTTTCTAGATAAATTAATCCTGAACTTTATTAGATTGTATACACACCCCTATAA ATTAAATTTGAGTTTTAATTCTTGAATTTCTCAAGGCTATTTCATATTTTCTTTCACATAAAATTGCATCTCTTTATCAT ATTATGAAATATAACCTTAACTTCTATATTAAAAATTAAATTATTATTAGTTATATCTAAATAGAATTTTATTTAAATTA ATTTTTTTGATAAATAGTTAATTTATTTCATCAATCAAAATTAAATTAAATTAAATATCTTTGCCTTCCACTTGTAACAA AAAAAATATCTTCAAATCATCAGGGAATTAAATTTTTTTAAAAAATAAAAAATAATAATAATCTTATATTTTGTTTTCTA ATGAAAATAGTCCTGAGAGATACTAATTGAAAAACATATTACTCTCTTTAAGTCAAATTCTTGCACAAGCTTGTAATAAT GTCCTAGGCTTGAAATGAGAACCTATCACGTTTTGAACATGAGCTCAGTGAATTGTAAATACTAATTTTTAAAGGGCAAC CAGAAAAGAATTCGTTAAGCTTTCATAATGATTTTTGTATAAAGAAATTCATGCTAAATAGTAGTTCGTTTGAATATGCC TTAAACTTATAATTAGTTTTATTTAAGCATACGTCAAAGCAATTTTCTCCCCGATAATACGTTGATCAAAGATAAGGTGA GAATTAATTGAGATTGTATATGGATTGTGTTGCTTTCGAAGACTATAGCTACACGCTTGATTTCGGAAAAACGACCAAGT GTCATTCTGAATTGGTCTTATGTAAATACTAAATTGTGCATAAACTAAAATAATGTAACACGTTTACTTTACTATATATA CTATAATCACAATGATGTGGAAACATTGAATTGTTTAAATGTAGTTTTTTTAACTTTATATCTTTTTCTCCTTTGATTAC TCTCCTCTTTTCTCTGCACTCAACTTAGCACCTCTCAAATTTTATAGATTCAAAGATAGTGGAAAAGTATTTTGAAAGAT ACATCAAACCTAATATTGAACACAACTAAACTTTCTAGTTTCTATGATGCTATCTTGAATAACTGGTCAATTTTTTTAAC AAAATTGAATTTGTTACAGCATCTACTAAATAGAGAGTGGACACACAAGTAAAATATGGTGGACCAACATATAGATCACT TATATGTTGAAAAAAGTACTTTGGTAGCATTTTCCATCCCTTGGCTTGATATAGATAAACTTTATAAATTAGTGATTATT TAGATTCTAGTTGAACTCAACATGGATCTAGATTGAACTTAACGTAGCAAAATTTTACTTTTTTAATTCATATTATACTC AGCGTGGTAAATTTTAACTTCTTCATTGATACATTAAGATATGTGAAATCACATTTGCGTTTGCACCAACACGCCAAAAA AAAAATACACTTACTAATTACTAATGTGTATTTATGAGATGAATTTGGTATATGAGTGGAAAGAAATGTTGGCATCTTCA ACTGTGCTATTGTTGCACTTGCAGCCAAGCAGAGAGGTACAAGCAATTTGTCAAAAACCTGTACCATTACCATAGTAAGT GTGTTGGTGGTACTAGCTCTACTAAGTTTCTGTATGTACTACTCATGGAGATGGTATAAGTCTAAGAAAGGTAATTAACA TTACCTGCACACATGCTGAAACTTCTCTTAAGTCTTAACTCATTTTACATAACAATGGCAGAAAGCAAATACTAACTCAC AAGTTTCCTTAGAACATGGTCTATTATCAGAGACAATTCCTATATCTTTTCATGGCCATCTTCAAGGAGAGGAAGATTCA CTGAATACAAACCTTCCTACAATCCCTTTAATTTGGATTCGACAGAGCACTAATAACTTTGATGAGTCATGTAAATTAGG AGAAGGTGGATTTGGCCCAGTTTACATGGTATTACTCAAGCAGTACAAATTTTTTTTGAGCCTTTAATTCTTAGTTGCCA TATGTATTTTTCCTTTCATTTCCCTTATTTCAGGGTAATTTGGAAGATGGAACAGAAATTGCTGTCAAAAGACTCTCTTA AAAATCTAACCAGGGTGTAGAGGAGTTCAAGAATGAAATAATTTTCATAGCAAAACTACAACATAGGAACCTTGTGAAAC TCTTGGGTTGCTGCATTGAGGAAAATGAAAAGCTGCTAGTATATGAGTACATGCCAAATTCAAGTCTTGACTCTCACCTA TTCAGTATGTTTTAACTAAATGCCTGTACTATTTTACATTTTCTTTTCCATGTTCCAATATATTGTTTATACAAGTATCT AGAGATTATTAATAAGGATTGTTTGTCATGTGGTAGAAGGAGTTTGGAGGAAGAACTCTGTAGCCAAAACTACATGATAT GTTTGGAAATTCTTCTACAATTGATTCTAAAATCAGAATCGGTTAAAAGGAGAAGCTTCTGTGGCAGCATGTTTTGATTA GCTACTTTGCCCTCAAAATAAATTCCGAAGTCTAAACTACTCACAGAAGTTTCTCCTCATAATAGTTTTTGAGTTCCATA ATTGAATTTAAGGAAAGAGAAGTGGATGCAAACATTACAGAAGTTTGTTACTTAGGGGGAAAAGAAAGAGAGAATGGTTA TTTCCTCTGATACTGCACAAGCTTGTTACTTGTTCTCAGCTCTATATATTCCAGTATCAAAAAACCTTTCCTAATTGTGA CTTGCATGTCAGATGAAGAGAAACGAAAGCAACTAGATTGGAAATTACGACTGAGCATAATTAATGGAATTGCAAAAGGA CTTCTTTACCTACATGAAGACTCTAGGCTTAGAGTAATCCATAGAGATCTGAAAGCCAGCAATGTTCTTCTGGATCAAGA GATGAATCCAAAAATTTCAGATTTTGGATTGGCCAGGATATTTGTAAAAGGCCAGAGTCAGGAAAATACAAACAGAGTTG TGGGTACCTAGTATGTGTTAATGCTAACTCTTTCTTTTCATGGCACATGAATATGCAATTAATTAACTAATATAATTGTA AAATTGGCAAACTAACAGGGTTATATTGATTTTAAACAGTGGATACATGGCTCCAGAATATGCTATGGAAGGGTTATATT CAGTGAAATCTGATGTTTTCAGCTTTGGAGTTATTTTGTTAGAAATCATTTGTGGGAAAAGGAATGGTGAATTCTATCTT TCAGAACATGGTCAGAGTCTTCTTATGTATGTGAGTTTTTCTGCTCTCATGTAGTTAAAAATCTGACATTAGCTGAAGAT ACATGAATGGTCAGGTCCTTATGGTAAAAGCTTATGGTAATAGGTGCTCAATTAAGTTGTTTGCCCAAACACATCTTATT TGAAGTTTCTGAATATCCATTTTGTATGCAGAGTTGGAGACTTTGGTGTGAAGGAAAAAGTTTGGAACTATTAGATCCAA TACTGAAAACAACATGCATAGCCAATGAAGTTATGAAATGCATGCACATTGGATTATTGTGTGTACAACAAGATGCAGCA GATAGACCAACCATGTCCACGGTTGTTGTCATGCTGGCGAGTGACACAATGGCACTTCCCAACCCAAATCATCCAGCATT TTCTGTTGGAAGAAAGATCAAGGATGAAGAATCAAGATCAAAAGCTTTCAAGGATCATTCTATTAATGAAATAACAGTAT CAAATGTTTTAGCCAGGTAGTGGATATAACATGTTAAGAAATTTTCTTTGTGTATACACTTTGGACTATGCAACCAATAA CTATAAAAACTGGTCAGGTCAACCACCCCTGTATATAAGAAGCACTTTTTCTTCTTTTGTGTTGCTATTTTTACCTAAGC TAGATCTTAGGGGCTTAAGTCATTTTGCTATCTGATGATAACTATACAAATTGGGGGTACTAATGATATGTTTTTGTGTT CGTCTAAATCACCCGATAAACATGAAGTAAAATTATTCTAGTTGTTTTAGTTT 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0503300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATGATGGCAACAGTATTCAACCTGAGAACACCAATTATTGCCATCCTCACGTTTCTTGGCTTCATGGCCCTGTCCCT TTCCACCACAGCAAGAGCACAATCCCCAAATTACGTTGGTGATGACTGCCAAAACTCAACAGAACAAGCCCTGACCACTG CATACCAAACCAACCTTAACAAAGTCCTCTCATGGCTCTCCTCTGATGCAGCCACAAGCAAGGGTTATAACCACACCACC ATAGGAACTAACACGTCTGACACTGTCTATGGCTTCTATGATTGCAGGGCTGATGTCACAGAATCATTCTGCCAGTTCTG TGTCTCGACTGCAGCATCAGAAATCCCTCAACGCTGTCCTAACAGATCCTCCGCTGTGATATGGTACAACTTCTGCATTC TCAGGTACTCGAACCGTGATTTCTTTGGGAAACTCACAACAACCCCGTCATGGGAAATTTTGGGGTCCAAGAACATCACT GGCTCACAAGAACTTCAGAAAGCTGAGAAATTTATGCAGAGTTTGATAAGTGAAGCTAGTGTGGAGAGCAACAAGTTGTT TGCAATGGGGGAGTTCAATTTGAACAGTTCTGAGGAGAGGTATGGGTTGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTTCTGCTAACT ATTGCAGCCTGTGTTTGGAAACTATGCTAGACAAAGTTCCTCAGTGCTGTGGGACAGAGGTTGGATGGCAGGTTTTGGCT CCAAGCTGTCTGATAAAGTATGATGATTACATATTCTACCAGATTACTAATCAAACATCTCCTTTGCCTGCTCCAGCCAA GCAGAGAGGTACAAGCAATTTGTCAAAAACCTGTACCATTACCATAGTAAGTGTGTTGGTGGTACTAGCTCTACTAAGTT TCTGTATGTACTACTCATGGAGATGGTATAAGTCTAAGAAAGGTAATTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0503300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MMMATVFNLRTPIIAILTFLGFMALSLSTTARAQSPNYVGDDCQNSTEQALTTAYQTNLNKVLSWLSSDAATSKGYNHTT IGTNTSDTVYGFYDCRADVTESFCQFCVSTAASEIPQRCPNRSSAVIWYNFCILRYSNRDFFGKLTTTPSWEILGSKNIT GSQELQKAEKFMQSLISEASVESNKLFAMGEFNLNSSEERYGLVQCSRDISANYCSLCLETMLDKVPQCCGTEVGWQVLA PSCLIKYDDYIFYQITNQTSPLPAPAKQRGTSNLSKTCTITIVSVLVVLALLSFCMYYSWRWYKSKKGN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_GRAM_POSITIVE 1 33 33 -
SignalP_EUK 1 33 33 -
SignalP_GRAM_NEGATIVE 1 33 33 -
Phobius 1 13 13 -
Phobius 1 33 33 -
TMHMM 7 29 23 -
Phobius 14 25 12 -
PANTHER 24 307 284 4.0E-89
PANTHER 24 307 284 4.0E-89
Phobius 26 33 8 -
Phobius 34 279 246 -
Gene3D 36 141 106 2.2E-25
ProSiteProfiles 37 141 105 18.987
Pfam 43 138 96 1.8E-18
ProSiteProfiles 147 252 106 17.765
Gene3D 152 252 101 3.0E-18
Pfam 166 250 85 7.9E-9
TMHMM 278 300 23 -
Phobius 280 300 21 -
Phobius 301 309 9 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0503300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…