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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi3g1v0503300 |
Transcript ID | LotjaGi3g1v0503300.1 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Cysteine-rich receptor-like kinase; TAIR: AT4G05200.1 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 25; Swiss-Prot: sp|Q9M0X5|CRK25_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 25; TrEMBL-Plants: tr|V7BUR2|V7BUR2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0503300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:92151582..92161714) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TACAAGTCCAACAGTGCCTCGTACCAAAAAAGCCCAAAGGAGTATATTGTTCACTCAGCTTCGTCTTTCTCAAGAAAAGC AGCAATTTGCAGAAGCAGAAATAGCTGAAGGTGCCAAATTCCAGTGTTGACAATATAGAACATGGAGTTCGTTGCTGAAG AAGGCAAGCACCTCAATGACAATTGCTCCACTTTGATTTTGGTTTGTATCATTTTCTAGGGTTTTATATATTTTCCCCCA ATTTTGACACCACTTTGTTATGAATCTCTTTGCCAAAAAGACATTCACTTTTCAGTACAGTGCTATTGGAGAAATTGTGG GTTTAGCTCAAAATTGTAACTTGTTGAATTTGTGGTTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGTTTCAGCCTGCTTTATCTATTGGG AATGTGGGGCAACTAGCAGCAGACCTTTTGGTTTCATCAATGGCTACAGAGAGAGTTGGGTACTTGGATGATCCTCATGT TCTTCCCTGTGTTGGCAATGATGCTTATGGACCTGTTCCTCAAGGAGACCTTGCTCTTCCTCTTGAAGGTTTTGCTTTAC TTTTTATTTGTTCTGTGACTGCAATGAATTTTCATTTTTTTAAGTTAAAAATTCTCAAAATGTGTCACTTCTTTGCAGCT TATGATTCCCCATCTAATGCTCTCACTATCATCCAACAGCGATCTCCGGTGATTAAGGTATCTTCTGAGGCATCATTTGT TCTCTTCATGTCTTTTATCTGACATTGCTTACCTTAAGTCTAAGTATGGTGATTTCAGGCTGTCATTAAGTGTTTTTTTA TGCGTATATTGTTCCCTAATCAGACTGAGCTGTCTGTAGTAAAATTTGAATGTGGACAGGCTGAAGCTTGAATCTTACTT GCTTTATTTTTCCTGTACATGAGCATGAGTTTCAATCCCCTTTTTCTGTCCTTCAAGTTTGTATTTTCGAGTGTTTCTAG ATGTTGGCTTCTATTTTGTATTTCCTGCAATAATGATCATCACTATTTAAAAAAAAAAGTTAAGATGACATTAATTAGTA TTATGTTGCCCTTGTACTCAATTTATGTGTAATCACCTTAAATGTCACTTAAAAAGAAATGGAGAAAGTAGATATATTAA CTGAGTAGTGTTTTGTGTATTTCCATGTTGGATCCTCTTTTTCTTTGTTTGTTGGTTCTATTTTGTGTGTTTTGTTCAGG ACACGTAACTTTTTATTGTTAATTATGAATGCCATGAATTTTGAGTATTTTTAAGTATATACATACATATATAGTATAAA TTGTATAGACTGTCTAAAATATTCAGTATAGCGGTCATCTTACTACGCGCTATATACTACTAGCATTTTTGGGGTTGAAA GCTACGCACTATTCTTAGTCTAGTTGTGAAGAATCATATGTACAATTCCTGCTTAATATTTTGATCAACACTAGCATAGG CTTGTGGGTAACAACAAGGAATTCACTGGAGTAACTTACAATTTAATGTGCATTTCCTTTATGCTAGTTCCATACTTCAT GTTTTTATTAGGTTGAATGCTTGAATTGACACATAACTTTGGAATCTGGAAAGATAAATTGCAATTAATACGTGGTCATT TGAATAGGGTATGATGCTTGATTTTGCAAAAAACATGGCTGATTTCCTTGCTGGTAGTGGAAAGAAGCATATTGTTCTTC TCTCCAGCTTAGATTTTGGAAAATGGCAAAAAGTTGACATGTCAAGGTGAGGCAGTTATATTTTGAAATACAACTTCTTT ACGATTAAGATATTCATTCATTGTTCCTGTTATTTTTTGTTTGTCACATTTATTCAAATCATAACTGCATGAAGATTATG TCCATTCTCACCCTGACAATCTTGTAAAATTTAAGAATAATCTTGGTCTAGGAAATGCATTGGGATATTTTCCATTCTGA 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AAGTTGAATCCTAACTAGTGAATAGAAACATGTTGGCATGTAAGAAAAATCATAAAACTTCGTTGGTAATATTTCTGATA ATTGCATTTCAGGGATTGAAGGTAACAAGTGGCGAGTTCCACTTTCTTGGATGACGGTATATGGACCACCCCCGGATATG TCAATGTTCTAAGGCTAGATTGGTGTTATTAGTGAAATTTAATGGATTCTATTGTCTTAGAATTTAGTTTTGATTGTGCA GTAAAGAACATGTAAAATTTTATCGGAGTTCTGTACAATTAATTAGATATAACCTTTTTTTAATAGTCGTCTTGGGATGT TGAAAATTTCCCCATCTATAGTCAACTCTTTAATTCAGGTTTCTTTATGCAATATTTTTATATGAAATGTGTTGAGCAAA GTAACATGAAGTACAAATATGAATTTATTCTTCCTAATCTCCTAATCAATGAGACTTAGAGAGCATATTCATCCATTTTC AAGTTATGAATACTCTAATCTTTTATAGAAACAAGAGTAATCACATCACTAGCCAGTGGCCAGCATCTTCATATATTTCA TTTTAAATTTTCTTTCTTCAGTTACCATGATCTCTAGTCACTTGACTTTTTTATTTCAATCTAATACACTTTAGTGATAC AAGTTCTCTTCAATGAGAAAAATACTTTTATCCAATATACCTCGTTACTTCATTTAACTTTTTTTGTATCAGGATGATGC AAAAATCAATTTACAATCTTGTAAACCTTAAAATAACCTAACACTTAGACTCTGGACAGGTTGTATTTGATTCTGACAAA TTCAAATCTGGCCAAGTAGAAGAACTACTAGATGGCAAAACCTTTTGTATCAGAATGATTATATTTTTTATTCACAGAAC TCAAACATAAAAGGGAATTAAACTCTGTATCACTTGAGCCAAATTGGTATTGATAAAGCAGTTGACTAAATCATATGTGA GTATCATCAGTTCTTGGGGTGTGGAATTCAACTAGATTCATCTCAAATGATGATGGCAACAGTATTCAACCTGAGAACAC CAATTATTGCCATCCTCACGTTTCTTGGCTTCATGGCCCTGTCCCTTTCCACCACAGCAAGAGCACAATCCCCAAATTAC GTTGGTGATGACTGCCAAAACTCAACAGAACAAGCCCTGACCACTGCATACCAAACCAACCTTAACAAAGTCCTCTCATG GCTCTCCTCTGATGCAGCCACAAGCAAGGGTTATAACCACACCACCATAGGAACTAACACGTCTGACACTGTCTATGGCT TCTATGATTGCAGGGCTGATGTCACAGAATCATTCTGCCAGTTCTGTGTCTCGACTGCAGCATCAGAAATCCCTCAACGC TGTCCTAACAGATCCTCCGCTGTGATATGGTACAACTTCTGCATTCTCAGGTACTCGAACCGTGATTTCTTTGGGAAACT CACAACAACCCCGTCATGGGAAATTTTGGGGTCCAAGAACATCACTGGCTCACAAGAACTTCAGAAAGCTGAGAAATTTA TGCAGAGTTTGATAAGTGAAGCTAGTGTGGAGAGCAACAAGTTGTTTGCAATGGGGGAGTTCAATTTGAACAGTTCTGAG GAGAGGTATGGGTTGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTTCTGCTAACTATTGCAGCCTGTGTTTGGAAACTATGCTAGACAA AGTTCCTCAGTGCTGTGGGACAGAGGTTGGATGGCAGGTTTTGGCTCCAAGCTGTCTGATAAAGTATGATGATTACATAT TCTACCAGATTACTAATCAAACATCTCCTTTGCCTGCTCCAGGTACATGTAGCAGATTAATTGTTACCATTGTTAGGTAG TTACCATTGTGTTTTATTGGTTCCTTCTACCTTCTACTCTACTCTGCCATTTTTTTTGTCAAAGTATAGTTAGATACTAC AATGCTTTAGAATAAAAGAGATACAAAACATTGCACGTTTGTTTATTATAGCACAAAAATCAATAGACAATAAGAGAAAG ACAAAACTCCCTGTGAGTCGACTCTGTCGGAGTAAATCGACATAAATTTCACAAAATAATTTTGTCTTCAGAAGAAATTG TAGAAGGATTACCAAACTCATTGACAAGTCTTTCTATTTTGGCTGCATGGTCAGGCTGCAAGGTTGGTTTAGTTATTAAA GATAAAAAAAAAAACTTTATTTAAAAAGTTTAGGTTCATTTTCTACCATGAAGTTCTTAATTCTTGGCCCATAATGTATA ATTAACAAGGATGAGAAATTCAATATAATAATTTTGTTGTAGTTAGTTTGTTATCTATAAATCTAAAAAGCTAATACATT ATTTTAAAAATGAGAAGCTAATTTAGTTTTCTAGATAAATTAATCCTGAACTTTATTAGATTGTATACACACCCCTATAA ATTAAATTTGAGTTTTAATTCTTGAATTTCTCAAGGCTATTTCATATTTTCTTTCACATAAAATTGCATCTCTTTATCAT ATTATGAAATATAACCTTAACTTCTATATTAAAAATTAAATTATTATTAGTTATATCTAAATAGAATTTTATTTAAATTA ATTTTTTTGATAAATAGTTAATTTATTTCATCAATCAAAATTAAATTAAATTAAATATCTTTGCCTTCCACTTGTAACAA AAAAAATATCTTCAAATCATCAGGGAATTAAATTTTTTTAAAAAATAAAAAATAATAATAATCTTATATTTTGTTTTCTA ATGAAAATAGTCCTGAGAGATACTAATTGAAAAACATATTACTCTCTTTAAGTCAAATTCTTGCACAAGCTTGTAATAAT GTCCTAGGCTTGAAATGAGAACCTATCACGTTTTGAACATGAGCTCAGTGAATTGTAAATACTAATTTTTAAAGGGCAAC CAGAAAAGAATTCGTTAAGCTTTCATAATGATTTTTGTATAAAGAAATTCATGCTAAATAGTAGTTCGTTTGAATATGCC TTAAACTTATAATTAGTTTTATTTAAGCATACGTCAAAGCAATTTTCTCCCCGATAATACGTTGATCAAAGATAAGGTGA GAATTAATTGAGATTGTATATGGATTGTGTTGCTTTCGAAGACTATAGCTACACGCTTGATTTCGGAAAAACGACCAAGT GTCATTCTGAATTGGTCTTATGTAAATACTAAATTGTGCATAAACTAAAATAATGTAACACGTTTACTTTACTATATATA CTATAATCACAATGATGTGGAAACATTGAATTGTTTAAATGTAGTTTTTTTAACTTTATATCTTTTTCTCCTTTGATTAC TCTCCTCTTTTCTCTGCACTCAACTTAGCACCTCTCAAATTTTATAGATTCAAAGATAGTGGAAAAGTATTTTGAAAGAT ACATCAAACCTAATATTGAACACAACTAAACTTTCTAGTTTCTATGATGCTATCTTGAATAACTGGTCAATTTTTTTAAC AAAATTGAATTTGTTACAGCATCTACTAAATAGAGAGTGGACACACAAGTAAAATATGGTGGACCAACATATAGATCACT TATATGTTGAAAAAAGTACTTTGGTAGCATTTTCCATCCCTTGGCTTGATATAGATAAACTTTATAAATTAGTGATTATT TAGATTCTAGTTGAACTCAACATGGATCTAGATTGAACTTAACGTAGCAAAATTTTACTTTTTTAATTCATATTATACTC AGCGTGGTAAATTTTAACTTCTTCATTGATACATTAAGATATGTGAAATCACATTTGCGTTTGCACCAACACGCCAAAAA AAAAATACACTTACTAATTACTAATGTGTATTTATGAGATGAATTTGGTATATGAGTGGAAAGAAATGTTGGCATCTTCA ACTGTGCTATTGTTGCACTTGCAGCCAAGCAGAGAGGTACAAGCAATTTGTCAAAAACCTGTACCATTACCATAGTAAGT GTGTTGGTGGTACTAGCTCTACTAAGTTTCTGTATGTACTACTCATGGAGATGGTATAAGTCTAAGAAAGGTAATTAACA TTACCTGCACACATGCTGAAACTTCTCTTAAGTCTTAACTCATTTTACATAACAATGGCAGAAAGCAAATACTAACTCAC AAGTTTCCTTAGAACATGGTCTATTATCAGAGACAATTCCTATATCTTTTCATGGCCATCTTCAAGGAGAGGAAGATTCA CTGAATACAAACCTTCCTACAATCCCTTTAATTTGGATTCGACAGAGCACTAATAACTTTGATGAGTCATGTAAATTAGG AGAAGGTGGATTTGGCCCAGTTTACATGGTATTACTCAAGCAGTACAAATTTTTTTTGAGCCTTTAATTCTTAGTTGCCA TATGTATTTTTCCTTTCATTTCCCTTATTTCAGGGTAATTTGGAAGATGGAACAGAAATTGCTGTCAAAAGACTCTCTTA AAAATCTAACCAGGGTGTAGAGGAGTTCAAGAATGAAATAATTTTCATAGCAAAACTACAACATAGGAACCTTGTGAAAC TCTTGGGTTGCTGCATTGAGGAAAATGAAAAGCTGCTAGTATATGAGTACATGCCAAATTCAAGTCTTGACTCTCACCTA TTCAGTATGTTTTAACTAAATGCCTGTACTATTTTACATTTTCTTTTCCATGTTCCAATATATTGTTTATACAAGTATCT AGAGATTATTAATAAGGATTGTTTGTCATGTGGTAGAAGGAGTTTGGAGGAAGAACTCTGTAGCCAAAACTACATGATAT GTTTGGAAATTCTTCTACAATTGATTCTAAAATCAGAATCGGTTAAAAGGAGAAGCTTCTGTGGCAGCATGTTTTGATTA GCTACTTTGCCCTCAAAATAAATTCCGAAGTCTAAACTACTCACAGAAGTTTCTCCTCATAATAGTTTTTGAGTTCCATA ATTGAATTTAAGGAAAGAGAAGTGGATGCAAACATTACAGAAGTTTGTTACTTAGGGGGAAAAGAAAGAGAGAATGGTTA TTTCCTCTGATACTGCACAAGCTTGTTACTTGTTCTCAGCTCTATATATTCCAGTATCAAAAAACCTTTCCTAATTGTGA CTTGCATGTCAGATGAAGAGAAACGAAAGCAACTAGATTGGAAATTACGACTGAGCATAATTAATGGAATTGCAAAAGGA CTTCTTTACCTACATGAAGACTCTAGGCTTAGAGTAATCCATAGAGATCTGAAAGCCAGCAATGTTCTTCTGGATCAAGA GATGAATCCAAAAATTTCAGATTTTGGATTGGCCAGGATATTTGTAAAAGGCCAGAGTCAGGAAAATACAAACAGAGTTG TGGGTACCTAGTATGTGTTAATGCTAACTCTTTCTTTTCATGGCACATGAATATGCAATTAATTAACTAATATAATTGTA AAATTGGCAAACTAACAGGGTTATATTGATTTTAAACAGTGGATACATGGCTCCAGAATATGCTATGGAAGGGTTATATT CAGTGAAATCTGATGTTTTCAGCTTTGGAGTTATTTTGTTAGAAATCATTTGTGGGAAAAGGAATGGTGAATTCTATCTT TCAGAACATGGTCAGAGTCTTCTTATGTATGTGAGTTTTTCTGCTCTCATGTAGTTAAAAATCTGACATTAGCTGAAGAT ACATGAATGGTCAGGTCCTTATGGTAAAAGCTTATGGTAATAGGTGCTCAATTAAGTTGTTTGCCCAAACACATCTTATT TGAAGTTTCTGAATATCCATTTTGTATGCAGAGTTGGAGACTTTGGTGTGAAGGAAAAAGTTTGGAACTATTAGATCCAA TACTGAAAACAACATGCATAGCCAATGAAGTTATGAAATGCATGCACATTGGATTATTGTGTGTACAACAAGATGCAGCA GATAGACCAACCATGTCCACGGTTGTTGTCATGCTGGCGAGTGACACAATGGCACTTCCCAACCCAAATCATCCAGCATT TTCTGTTGGAAGAAAGATCAAGGATGAAGAATCAAGATCAAAAGCTTTCAAGGATCATTCTATTAATGAAATAACAGTAT CAAATGTTTTAGCCAGGTAGTGGATATAACATGTTAAGAAATTTTCTTTGTGTATACACTTTGGACTATGCAACCAATAA CTATAAAAACTGGTCAGGTCAACCACCCCTGTATATAAGAAGCACTTTTTCTTCTTTTGTGTTGCTATTTTTACCTAAGC TAGATCTTAGGGGCTTAAGTCATTTTGCTATCTGATGATAACTATACAAATTGGGGGTACTAATGATATGTTTTTGTGTT CGTCTAAATCACCCGATAAACATGAAGTAAAATTATTCTAGTTGTTTTAGTTT
CDS sequence (LotjaGi3g1v0503300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGATGGCAACAGTATTCAACCTGAGAACACCAATTATTGCCATCCTCACGTTTCTTGGCTTCATGGCCCTGTCCCT TTCCACCACAGCAAGAGCACAATCCCCAAATTACGTTGGTGATGACTGCCAAAACTCAACAGAACAAGCCCTGACCACTG CATACCAAACCAACCTTAACAAAGTCCTCTCATGGCTCTCCTCTGATGCAGCCACAAGCAAGGGTTATAACCACACCACC ATAGGAACTAACACGTCTGACACTGTCTATGGCTTCTATGATTGCAGGGCTGATGTCACAGAATCATTCTGCCAGTTCTG TGTCTCGACTGCAGCATCAGAAATCCCTCAACGCTGTCCTAACAGATCCTCCGCTGTGATATGGTACAACTTCTGCATTC TCAGGTACTCGAACCGTGATTTCTTTGGGAAACTCACAACAACCCCGTCATGGGAAATTTTGGGGTCCAAGAACATCACT GGCTCACAAGAACTTCAGAAAGCTGAGAAATTTATGCAGAGTTTGATAAGTGAAGCTAGTGTGGAGAGCAACAAGTTGTT TGCAATGGGGGAGTTCAATTTGAACAGTTCTGAGGAGAGGTATGGGTTGGTGCAGTGCAGCAGAGACATTTCTGCTAACT ATTGCAGCCTGTGTTTGGAAACTATGCTAGACAAAGTTCCTCAGTGCTGTGGGACAGAGGTTGGATGGCAGGTTTTGGCT CCAAGCTGTCTGATAAAGTATGATGATTACATATTCTACCAGATTACTAATCAAACATCTCCTTTGCCTGCTCCAGCCAA GCAGAGAGGTACAAGCAATTTGTCAAAAACCTGTACCATTACCATAGTAAGTGTGTTGGTGGTACTAGCTCTACTAAGTT TCTGTATGTACTACTCATGGAGATGGTATAAGTCTAAGAAAGGTAATTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0503300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMMATVFNLRTPIIAILTFLGFMALSLSTTARAQSPNYVGDDCQNSTEQALTTAYQTNLNKVLSWLSSDAATSKGYNHTT IGTNTSDTVYGFYDCRADVTESFCQFCVSTAASEIPQRCPNRSSAVIWYNFCILRYSNRDFFGKLTTTPSWEILGSKNIT GSQELQKAEKFMQSLISEASVESNKLFAMGEFNLNSSEERYGLVQCSRDISANYCSLCLETMLDKVPQCCGTEVGWQVLA PSCLIKYDDYIFYQITNQTSPLPAPAKQRGTSNLSKTCTITIVSVLVVLALLSFCMYYSWRWYKSKKGN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 33 | 33 | - | – | |
SignalP_EUK | 1 | 33 | 33 | - | – | |
SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 33 | 33 | - | – | |
Phobius | 1 | 13 | 13 | - | – | |
Phobius | 1 | 33 | 33 | - | – | |
TMHMM | 7 | 29 | 23 | - | – | |
Phobius | 14 | 25 | 12 | - | – | |
PANTHER | 24 | 307 | 284 | 4.0E-89 | – | |
PANTHER | 24 | 307 | 284 | 4.0E-89 | – | |
Phobius | 26 | 33 | 8 | - | – | |
Phobius | 34 | 279 | 246 | - | – | |
Gene3D | 36 | 141 | 106 | 2.2E-25 | ||
ProSiteProfiles | 37 | 141 | 105 | 18.987 | ||
Pfam | 43 | 138 | 96 | 1.8E-18 | ||
ProSiteProfiles | 147 | 252 | 106 | 17.765 | ||
Gene3D | 152 | 252 | 101 | 3.0E-18 | ||
Pfam | 166 | 250 | 85 | 7.9E-9 | ||
TMHMM | 278 | 300 | 23 | - | – | |
Phobius | 280 | 300 | 21 | - | – | |
Phobius | 301 | 309 | 9 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0503300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…