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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0527900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0527900.3 |
| Related isoforms 7 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase; TAIR: AT3G13530.1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7; Swiss-Prot: sp|Q9LJD8|M3KE1_ARATH MAP3K epsilon protein kinase 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RK30|A0A0B2RK30_GLYSO Serine/threonine-protein kinase sepA; Found in the gene: LotjaGi3g1v0527900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:94462935..94484302) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGTCGCGCCAGTCGACGTCGTCTGCGTTCACCAAATCGAAGACGCTCGATAACAAATATGTACGCCCATTTTTCCCTCT TCCACTCTCATTCTCTGTTGATCTCAACGGTTTCGTGATTAATTTGAATAATTGAGAAGAAAACGAAGAAATGCTGCTTG AAATGTTACAGTTAATTGCTTTGTTTGAGTCCAATTTGCTGAATTATCGCTCTCTAGACTCTTGAATTGTGCACTGGAAA AATTCTGATTAGTGGAAGCTTTAGGTTTATGTTGTTTAAGAAACTTAGGGTGATTTATTAGAAGCTAAGAAATGATGATG ATTATAGTTAAGGCGAGGCTGCTACTGTAGAAGTTGAGACTTGACATGCAGTGGTTGTGTACTAGGAAATGTGGATGGTA GTAAGGTTAGTCAATTCAGGGTGATGGTGTGGTGTAGCTGATAGCGCGGCATTGGGTTGGGTTGGGGTGAAGGGGTAATG TGGGGTGGTGGGAGGTGGAAAAATGATATAGTGATGGTGGTTGCAAAGATGAGGTTAAAACAAGGTCTGTATGCTGGGCA AGGGCCAGATGTGGGGGGATGGTGCTTGATGGTGGCAGTTGCTAGTTGCTTAGGTTGTTAGATGTTTTTGATTCTTTTTT ATCATTGCTTACGTGTTTTAGTTAATTTTTTAGGGTTCGCATAGGGAGTGTACTGAGAGGATTATATATATGCTGTAGTT GTTGAATTTTATCTGCAAATGTTTGATTTTATGGTTCATCTTGTCTTGGTTATATATTTCAAATTTCATATGGGATTGGC TCATATTTTAATGGTTGATTGCTTTGCCTGCATGTGAGATTCGGAGCAGATGCTGGGAGATGAGATTGGGAAAGGAGCTT ATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGCAATTAAGCAAGTTTCTTTGGAGAATATTGCT 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GAAATCTTGACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCT GCTTCTACATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAG TGCTACTTCATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGG CAGATCTTCTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTT TTCCAGATGTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGGTGTGACACAAAATTCATCTGCTATTTATTGTTAAGCA ACTTTAGCTTATATACTACATCTATAATTTCTTACCATTTATGTATTGGCATATTTTCTAGATACTGAAGTGTATCAATC ATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAGAAAATCTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTC AAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATACATCATGAAGTGAGTCTTACTGGCCTTCTTAATATTGTTAAAAGTTAGTTTTG AACTAAAAGCTTCTATTCATTGTGCTATTCAATATTTGAACACCTTTTTGTCAACAAATGTGATTAGTTGGTAGGTAATA AAAAACATACTTTTATTACTCATTAATTTTCTATTCAATTATTTCTCACTGTCTTTTGTAACAAGTTTGAATAAACTTTG CTGTAGTCATGTAGCAACTAAAAGTTTGTTTTACTTTTACCATCCAAAAAAGACAACAGTATTGAAGTCTAGCATAAATA TATTGGCTTCTGGACTGTTTTTTCCAATTTACAAGTGTGGTTATCTGCGATTTTTTTGTCCTTTGTCATGTTGTGGCAGA TATCCAAAGTTGGCGTGAATCTCACCTTTCAACTCTTGACAGGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAA GAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAATCATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAAC AATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTCATGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTG GATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTTTGGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGA CAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCTGAAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTC CTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCATTTTTGAAAATCATCACGTATAGTATTCTAAGTCCTTTTATTTCTTCC GTCCAGTTAATTAAGTATTTGGTTTTAGATCCTTTAATTATTTGATAAAGTAGTCTTTGGGTTGATGTTTGATAAGTTAT AAACTAAGGATGTCTAGGTTGTTGCACCAAAGTTTCTTTTCTTATTGTGAAGTTGACTGGATGTAAGATGGACAAGTTTT CACTTTAGGTGCTAAATTTACGGATAGCAGAGAATGAATTAGGATTCCACCAAATTGGCAGCCTTGTTATATCTAGGACC TGATGCCATTAGAAGTTAGATTTAGTAGCATATGATTAATAAGAAATATAAGATATGGTGGGGCAAAATGAGAGTGTTGT TTATCTTTAGGCCAAATACTTATATAGTAAATGTAGTATAAGAGAACTGTTTGTTCAAGGTATGTGCACCAAACATTCTA CAAGGATTGGGTCCCCGGTCGTTAGAGATATAGCCTAGTCTCTACTGTTAGTCTGTTGCACAATTAGCTTAGCCTACTGT TGTTAGCTTACTGTCAGGTAGTAAGGGATTTTTTTATAGTTTATACTAGAGATGATTTATACGTACTTCTAGCCCAGAGA ATTATAAGTACTTAGAAAATCATTTTATATGTTTTTTCTCCAAATGTTATCATTCTTACTTTCTTTTCTTCATATAATTA TATTGCAGAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGGCTTGATCA TCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGTATGCATATATGATATTTGTTATACATTTGAGAATT CTGGTGCGCCCTACCACACGTTAACCAACCTTAAGCATTGCTTTAGTCTAAGACGCTTTAAATTCAGTCATGAAACAAGG TAAAAAACTAAGGTGGCCAAACTTTGGTGCAGGATTTTACTTCTAGAACTATAAACCTTTTAAGTATGATGTTCATGTAT GTGTGGCTTCACATACTGAAGAAAGTCTTAAACTACATCCATATTATGCATATTTCTTTAGATAGTAATAATGTAGTGAT TCCATAAGAGCTTCATTTGAGAAATTGGTTTCTCTGCAGTTGTATTTAACTTGATAAGTTTTAATAATTGAATGAGCGTA TTAAGTTTCGAACGTGAGAAAGTAAACTCCTGATGCAGATATCTCAGGTTTCCAACATATGGTTTCAAATAACATGCTCC TATTTTGTTCCTTTTTTTTCTAGTGTCATTATATAAATTCGAAGGTGCTATCATTTCATTTATAATAAACACCAGTGTCT TTTGATCCTGATAGATGATTTGTGGATAGATTAGATAAGCCTTCTCCAAAATGTGGAATATTAAAATTGAATGAGCGTAT TAATAATTCAAATATATCTAACCATATGGGCTTAAAAGACAATCATATCTTGATATCCTCTCAAGATAGAGTGAAACATG GTTATTTTGTTTTCCCCTAGACATTACTTGGTATAAAATATGTATGAATGTGACATCCAATGGATCTCTGCACATTGTTT TTGCAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAAGAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTT AATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGAAACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCG TATTGTAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0527900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGCGCCAGTCGACGTCGTCTGCGTTCACCAAATCGAAGACGCTCGATAACAAATATATGCTGGGAGATGAGATTGG GAAAGGAGCTTATGGTCGAGTGTACAAAGGTTTGGACCTGGAGAATGGAGATTTTGTTGCAATTAAGCAAGTTTCTTTGG AGAATATTGCTCAGGAGGATCTTAACATCATTATGCAAGAGATTGATTTGTTAAAGAATTTGAACCACAAAAACATTGTA AAGTATCTTGGATCCTTAAAGACAAAGAGTCACCTGCACATAATTCTTGAGTATGTGGAGAATGGCTCACTTGCAAATAT TATCAAGCCAAATAAATTTGGACCCTTTCCAGAATCATTGGTTGCTGTTTATATTGCCCAGGGTCTTGTCAAACTTGCTG ATTTTGGTGTGGCAACAAAATTAACAGAGGCTGATATTAATACCCATTCAGTTGTTGGAACACCATACTGGATGGCCCCA GAGGTTATAGAAATGTCCGGGGTTTGCGCAGCTTCTGACATTTGGAGTGTTGGCTGTACGGTTATTGAACTTCTTACATG TGTTCCTCCTTACTATGACTTGCAGCCTATGCCAGCTCTTTTCCGAATTGTACAGGATGAGCAACCTCCAATTCCTGATA GCCTTTCACCTAACATTACTGACTTTCTGCATCAGTGCTTTAAGAAGGATGCAAGACAAAGGCCTGATGCGAAAACGCTG CTGTCTCACCCCTGGATCCTAAACTGTAGACGTGTCCTGCAGTCTTCTCTTCGTCATAGCGGAACATTAAGAACTATAAA GGATGATGGTTCTGCAGTTGCAGAAGTTTCTGGTGGCGACCATAAGAGCACTGGTGAAGGATCTTCTGTGGAGAAAGAGG ACTCTGCAAAAGAGTTTTCAACTGGGGAAGCTAATAGCAGGAAATCTCATGAAGACAACGCTTCAGATTCTAATTTTTCC AACGAGAGAACAGAGAAGGAAGATGATATTCCATCAGATCAGGTTCTTACTTTAGCCATTCGTGAGAAGTCATTTCTACG AACTGGTTCTGGCAATCTCTCTTCTAGTATAGAAGTGGTTAGTGCTGAGCCAACTGGCACTGAAACTTCAAATGCTAAAG ACCTTCATGAAGTCATAATGAATGGAGAAGTTGAATCTCCACAATCAAGAGGAAAGGCTAATATGGCTGTAGGAAAAGAC AGTTCTATCAATAATCGCACTAAACCATTTGCTTTTGAACCAAGAGGACAAGATAGTGGTTCCCTAAAGGCAATGAAGAT ACCGCCCCCTGTGGAAGGAAATGAGCTGAGTAGATTTAGTGACCCTCCAGGAGATGCCTACTTAGATGACTTATTTCATC CATCAGATAAGCAATCTGGGGAGGTTGTGGCTGAGGCATCCACATCTACATCTACTTCACATATAGCTAAAGGTAATGTA TCTATGAATGATGGTGGGAAGAATGACCTTGCCAAAGAGTTGAGGGCTACAATTGCTCGAAAGCAATGGGAGAAGGAGAG TGAAATTGGGCAGGAAAACAATGGTGGGAACCTTTTACACCGAGTGATGATAGGTGTTCTAAAAGACGATGTTATTGATA TAGATGGTTTGGTCTTTGATGACAAACTTCCTGGAGAAAACCTTTTTCCTCTACAGGCCGTTGAGTTCAGCAAATTAGTT GGTTCTTTAAGAACAGAAGAATCAGAAGACGTGATTGTCTCTGCTTGTCAGAAACTTATTGGTATATTTCATCAACGCCC AGAGCAGAAGATTGTATTTGTTACCCAGCATGGTTTACTTCCTTTGACTGACTTGCTAGAAGTTCCTAAAACGCGCGTCA TATGTTCTGTGCTTCAGCTTATAAATCAAATAGTTAAAGACAACACTGATTTTCAAGAAAATGCATGTCTTGTTGGATTG ATTCCGGCAGTCATGAGCTTTGCAGTATCTGATCGTCCTCGAGAGATTCGTATGGAAGCGGCTTATTTTTTACAGCAGCT TTGTCAGTCAAGTTCTTTGACATTACAAATGTTTATAGCTTGCCGTGGGATACCTGTTTTGGTGGGATTTCTTGAGGCTG ATTATGCCAAGTACAGGGAGATGGTTCATCTGGCTATTGATGGCATGTGGCAGGTGTTTAAACTTCAGCAGACAACGCCT AGAAATGATTTTTGTCGGATAGCTGCAAAAAATGGGATACTCCTTAGGCTTATAAATACCCTTTATAGCTTAAATGAGTC AACTCGATTAGCTTCTATGTCTGCTGGGGGTGGATTTCTGGCTGATGGTTCGGCTCAACGGCCACGTTCTGGTATCTTGG ATCCTGCACACCCTTTTATGAATCAGAACGATGCACAGCTATCTTCAGCAGATCAGCAAGATCTCTCTAAAGTGAGGCGT GGTGTGCTGGATCATCACTTAGAGCCTATGCATGCTTCGTCTTCCCATCCTCGAAGATCAGATGCTAACTACCCAACGGA TGTTGATAGACCTCAATCGAGCAATGCAGCAGCTGAATGGAAAACTGATCCTTCTCGGGCTGAAGTTGAACCCAGACAGC AGCGTAGTAGTATTTCTGCTAACAGGACATCAACAGATAGGCCTCCAAAATTGGCAGAACCTTCTTCGAATGGGCTATCA ATGACAGGAGCTACACAGCAAGAACAAGTTAGGCCTCTTCTTAGCTTGTTGGAGAAAGAGCCTCCATCTGGACGCTTTTC AGGACAGCTTGAGTATGTCCGTCAGTTTTCAGGATTAGAGAGACATGAAAGTGTACTCCCTTTGTTACATGCCACTGAAA AGAAAACAAATGGTGAACTAGACTTTTTGATGGCAGAATTTGCAGATGTTTCTCAACGTGGGAGGGAAAATGGAAATCTT GACTCCAGTGCTAGAGTGTCTCACAAAGTTGCTCCCAAGAAATTAGGGACTTTTGGTTCTAGTGAAGGAGCTGCTTCTAC ATCTGGGATTGTATCTCAGACAGCATCAGGTGTACTGTCTGGTTCAGGTGTTCTAAATGCTAGACCAGGTAGTGCTACTT CATCTGGGCTACTTTCCCACATGGTTTCATCATTGAATGCAGATGTTGCAAGAGAGTACCTGGAAAAAGTGGCAGATCTT CTGCTTGAATTTGCACAAGCTGACACAACAGTGAAGTCGTACATGTGTAGCCAAAGTTTGCTTAGTCGTCTTTTCCAGAT GTTCAATAGGGTGGAGCCTCCTATTTTGTTGAAGATACTGAAGTGTATCAATCATCTGTCAACTGATCCAAATTGCTTAG AAAATCTTCAGCGTGCTGAAGCCATTAAACACTTGATACCAAATCTTGAACTCAAAGAAGGGACTCTTGTATCAGAGATA CATCATGAAGTTCTGAACGCACTGTTCAATTTATGCAAGATAAATAAGAGAAGACAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGAAT CATTCCCCATTTGATGCAATTCATCACATCAAATTCTCCCCTGAAACAATATGCGTTGCCTCTGCTATGTGACATGGCTC ATGCATCTCGCAACTCAAGGGAGCAGTTAAGGGCTCATGGTGGTTTGGATGTCTATTTGAACCTTCTTGAGGATGAACTT TGGTCTGTGACAGCACTAGATTCAATTGCTGTTTGCTTAGCCCATGACAATGACAACAGGAAGGTTGAACAATCATTGCT GAAAAAGGACGCAGTTCAGAAGCTTGTGAAGTTCTTCCAGAGCTGTCCTGAGCAACATTTTGTACACATATTGGAGCCAT TTTTGAAAATCATCACAAAATCTTCCCGGATCAATACCACATTGGCTGTTAACGGATTAACACCATTGCTCATTGCAAGG CTTGATCATCAGGATGCTATAGCTCGTCTTAATTTACTCAGGCTAATAAAGGCTGTTTATGAGCATCATCCGCAGCCCAA GAAGCTGATTGTGGAGAACGATCTTCCTGAGAAACTTCAAAACTTAATAGGGGAACGGAGAGATGGACAAGTGTTGGTGA AACAGATGGCTACTTCATTGCTTAAAGCTCTACACATCAACACCGTATTGTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0527900.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSRQSTSSAFTKSKTLDNKYMLGDEIGKGAYGRVYKGLDLENGDFVAIKQVSLENIAQEDLNIIMQEIDLLKNLNHKNIV KYLGSLKTKSHLHIILEYVENGSLANIIKPNKFGPFPESLVAVYIAQGLVKLADFGVATKLTEADINTHSVVGTPYWMAP EVIEMSGVCAASDIWSVGCTVIELLTCVPPYYDLQPMPALFRIVQDEQPPIPDSLSPNITDFLHQCFKKDARQRPDAKTL LSHPWILNCRRVLQSSLRHSGTLRTIKDDGSAVAEVSGGDHKSTGEGSSVEKEDSAKEFSTGEANSRKSHEDNASDSNFS NERTEKEDDIPSDQVLTLAIREKSFLRTGSGNLSSSIEVVSAEPTGTETSNAKDLHEVIMNGEVESPQSRGKANMAVGKD SSINNRTKPFAFEPRGQDSGSLKAMKIPPPVEGNELSRFSDPPGDAYLDDLFHPSDKQSGEVVAEASTSTSTSHIAKGNV SMNDGGKNDLAKELRATIARKQWEKESEIGQENNGGNLLHRVMIGVLKDDVIDIDGLVFDDKLPGENLFPLQAVEFSKLV GSLRTEESEDVIVSACQKLIGIFHQRPEQKIVFVTQHGLLPLTDLLEVPKTRVICSVLQLINQIVKDNTDFQENACLVGL IPAVMSFAVSDRPREIRMEAAYFLQQLCQSSSLTLQMFIACRGIPVLVGFLEADYAKYREMVHLAIDGMWQVFKLQQTTP RNDFCRIAAKNGILLRLINTLYSLNESTRLASMSAGGGFLADGSAQRPRSGILDPAHPFMNQNDAQLSSADQQDLSKVRR GVLDHHLEPMHASSSHPRRSDANYPTDVDRPQSSNAAAEWKTDPSRAEVEPRQQRSSISANRTSTDRPPKLAEPSSNGLS MTGATQQEQVRPLLSLLEKEPPSGRFSGQLEYVRQFSGLERHESVLPLLHATEKKTNGELDFLMAEFADVSQRGRENGNL DSSARVSHKVAPKKLGTFGSSEGAASTSGIVSQTASGVLSGSGVLNARPGSATSSGLLSHMVSSLNADVAREYLEKVADL LLEFAQADTTVKSYMCSQSLLSRLFQMFNRVEPPILLKILKCINHLSTDPNCLENLQRAEAIKHLIPNLELKEGTLVSEI HHEVLNALFNLCKINKRRQEQAAENGIIPHLMQFITSNSPLKQYALPLLCDMAHASRNSREQLRAHGGLDVYLNLLEDEL WSVTALDSIAVCLAHDNDNRKVEQSLLKKDAVQKLVKFFQSCPEQHFVHILEPFLKIITKSSRINTTLAVNGLTPLLIAR LDHQDAIARLNLLRLIKAVYEHHPQPKKLIVENDLPEKLQNLIGERRDGQVLVKQMATSLLKALHINTVL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 127 | 127 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 127 | 127 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 11 | 257 | 247 | 8.68E-70 | ||
| Gene3D | 11 | 125 | 115 | 2.5E-27 | – | |
| CDD | 19 | 246 | 228 | 1.89606E-146 | – | |
| ProSiteProfiles | 20 | 246 | 227 | 31.948 | ||
| Pfam | 22 | 111 | 90 | 1.6E-14 | ||
| ProSitePatterns | 26 | 49 | 24 | - | ||
| Gene3D | 126 | 270 | 145 | 5.7E-40 | – | |
| Pfam | 127 | 246 | 120 | 7.8E-27 | ||
| PANTHER | 128 | 1345 | 1218 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 128 | 1345 | 1218 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 270 | 333 | 64 | - | – | |
| MobiDBLite | 285 | 332 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 385 | 423 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 467 | 487 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 553 | 757 | 205 | 3.3E-16 | ||
| SUPERFAMILY | 558 | 1242 | 685 | 1.04E-37 | ||
| SMART | 586 | 626 | 41 | 6.2 | ||
| MobiDBLite | 764 | 793 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 807 | 886 | 80 | - | – | |
| MobiDBLite | 816 | 840 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 851 | 886 | 36 | - | – | |
| Gene3D | 1006 | 1347 | 342 | 5.4E-24 | ||
| SMART | 1089 | 1133 | 45 | 110.0 | ||
| SMART | 1135 | 1174 | 40 | 7.9 | ||
| SUPERFAMILY | 1218 | 1342 | 125 | 7.96E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0527900.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…