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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0001500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0001500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1; TAIR: AT5G49880.1 mitotic checkpoint family protein; Swiss-Prot: sp|Q9LTY1|MAD1_ARATH Mitotic spindle checkpoint protein MAD1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2P2M0|A0A0B2P2M0_GLYSO Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1; Found in the gene: LotjaGi4g1v0001500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:306718..321680) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGTGTGGTTAGCTTTCAAGTTTCAATAAAATGATGTGGGAAACAACCCAGGGTGAGGGCGGCAAAGAAGAATGATACTGA GAACTCCTCCACCATCCAAGAGGCCACGCGCCGATGTCGATGCCGATCACCAGCTCGTCATCTACGAGGATCCACCGGAG TCTCTGCCGGTGGTGTCGGAGCCTCAGGAACCCTCCGTCTCCGAGCACATGCTCTGTACCTATCAGTGCCGCCAAATGGT TCGTGTCCTCATTGATTGATTCTTCTTCATTCCATTACATTACATTACATTACAATGTTGAACAGTTCGTTAAACCCTTG TCACGTTATTGCATAGGTCAAATCAGATTTCATAGATGCCCTAAACAAAGCTGAAAACCAAGTTCGTGATTATCACTCTA AATTCGAGATATTGAATGCCAATTTCCTCCAAGTTGAGTCTGAGCGGAAGAAATTTCTGGATAAATTCTTATATGCCGAG CAGGAACTCGCCGCTGCAAAAGGGCGCGAACAGGCACTCCAAGACCAACTTTTGAAGGAGGTCACTGAATGTCAAGAACG ATTAAGAAAACAAATACAATTAAACAGTGAACTCGAGGTCTTTTTCTTTTTACTTTCTATTTACTTCTTCATGCTCACAA ATAAACTTCTCTATAACAATATGCACATCTGCCTGCCTGGCGGCATTTTCAGACTGTGTTTTAACCCTTTTCCGTCTGGA ATTTAGGTCAAGCTCAAAAATGAGATCAACCTTCGTATAAAATCCGACTCTCATGCTGCATCAGCAGAACAGAAAGCAAC ATCTTTAGAAAGAAAGCTAGGCAATCTCTCTGAGAGCATAGAGAGGGAAAAAAGGAGACTTCATGATGAACATTCACAAC TGAAAAAGGATTCCAAGTTATCTATTTCTAGAATAACTGCGGATGTAAGTGGCTATACTTGTTTTTCATGGTTCAGATTT CAGACTAGTGGTCATTTACAGCTATGACTCATTGTTTACGTTATGTTATTCTCTTTTTGTAGCTTGAACAAATGGAATGC AAAGCAAATAATGCTGTCAGAGAAGCAGAGTTGCTAAAACACCAACTAGAACATCTTAAGGACCAATTCAATGAGGTTTG GATGTCTGCTTAGTTGATTTTTCCCCTTTATAGGTCCTTCAAGAACCTCTCAACAAACCTATTCTTATTCTGTGCTGTTA AATTTGATTTGATGTTAAGCCTCTAACACTCATGTTGTACTTGCTTTCATGTCATTTGCATATTCCCTTTCCAGGAGGGT TATGGTTGCATTACTTATTAGTTCCTATTTCCAGTGTTTGAACCAGAAGATTGAAGTTGAAAAAAAACTATCAACTTTAA CATCTCAAGAAGTTGCTCCTACAGGGAATGATACTTTAGTTAAACAATTGCAACAGGAGCTTCAGCACTATGTAAGTTGG CTTTCTTTCTTTTTTCCTTGAATCTTGATACCTCTTTCTATTGTGATTGTTGTAGTTTGTTGAAGTTATTGATGACTTGA TGTGTTGAGTAATTTTAGTTGTTACTTAAGTGGCATGATCATATATGGAGAGGAATGATGTCATTATTTTATTGAATGGT CTGGATGTATAAAGTGGAGGTTTGAGTAGGCATGGCTCCTGAATAGAGTCGTATTATTTTCTTAATAATTTTTTTGGGTT GTTTATGGGTTGGTGCCAAAAGTCATATTGGTGCATTTTTTATTTACATTTTATTGTCCTTTATTATCAAAATTTTCAGT AAGTGTAGTTTAATCTGACACCTGATGTTACAATGATACAGTTTGTTAATATGTCTGTAATGTTTTAACTTTTAAAAATG ATTTTATTTTCTTTAAGGGTACACTGTCAGTGTCATATAAATGCTCTTGTTTGTACCCTTCCCTTTGCTGTAACTTGCTG 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AATTAAACTCTTTTGATATTATGGCCTTTGAATTATAATCCAGTGGCGTTTAATTTCAACGACGATATAATATAAGGGTA ACACAATAATTATAACAGGTTTATACACGAGCATCATTCAACTTCGTTTTCTTTGTCCTTTAGCAGAAATAAATAATGAT ATATGAATCTATGTTTTTCGTGGGGTGGATGCATGAATCTTAAAGCGTATCAGATTGACCTTGTTTCGCCTATATTATAT TTATAAATTAAAATTGTTTTAATCTTGTTCAAATATGTTTAAATAAATTGCTTCACCTCTTTGTCATTATTACATTGAAC TCCCTCTATTTTACAAAATGCATTGGCATTCCCTTCTTTATGTATCATTTAATTAGAATAATAGAGAGGTGTCGAGTGTT ATAATGATAAATCTTAAGGAAGATCGATGCAATAATAATAAACTTCAAAAGATATTAGTGCAATGTTTTCATTAAAATAA AGACAACTAGTGTCTTGTTAATTGATAAAGGGGAGATTAGTGATGAATTTCATAACAGACGAGTGCAATTTTTTACGTAG AAA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0001500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi4g1v0001500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| Pfam | 91 | 711 | 621 | 1.8E-24 | ||
| Coils | 160 | 198 | 39 | - | – | |
| Coils | 203 | 251 | 49 | - | – | |
| Coils | 269 | 340 | 72 | - | – | |
| Coils | 350 | 370 | 21 | - | – | |
| Coils | 378 | 433 | 56 | - | – | |
| Coils | 451 | 520 | 70 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 486 | 569 | 84 | 1.16E-12 | – | |
| Coils | 543 | 570 | 28 | - | – | |
| Coils | 589 | 609 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 626 | 713 | 88 | 1.5E-11 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Mitotic spindle assembly checkpoint | A cell cycle checkpoint that delays the metaphase/anaphase transition of a mitotic nuclear division until the spindle is correctly assembled and chromosomes are attached to the spindle. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0001500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…