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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0054000 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0054000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Wings apart-like protein like; TAIR: AT1G11060.1 WAPL (Wings apart-like protein regulation of heterochromatin) protein; Swiss-Prot: sp|Q7Z5K2|WAPL_HUMAN Wings apart-like protein homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UNY9|A0A072UNY9_MEDTR WAPL (Wings apart-like protein regulation of heterochromatin) protein, putative; Found in the gene: LotjaGi4g1v0054000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:6501023..6513251) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAAAGTTCTCTCAAATTTTTCAAAATGACGAAACTAGCCTTGTTGTATTTTTTAGTTTTTACTGTTATTACCGGATAC CACCACACTGGCCCATCGATTCAAAATTGCACGGAATTTGATAAAAACGAAGAAAATTTTCAAATTCACACAAAACCCAA TTCAATCCTCCTCCTCCTCCTCCACAACCCCCACCACCACCGCCACCGCCACCGCAACCATCTTTTCTTCCTCCTCCGTC GGTTCTTCTTACTCTGCCAATTTCTCCTTAATTTCCCATAAAGCCCCTCGCCTTATCCGAAAATGCCCAATTCCCACTCT TCCACATAGCAAACCACCACACCAACCACCACCACAACACAAACCCTCCGATCCCGGCGCAATCGAAAGATGATCGTCCG CACCTACGGCCGCCGCAACAGATCAATCTCCGGCACGTGCTCTGGCTCCTCCCTAAACGACGACGCATCGAGGGACTCCC TCTCTCAAGAACACGACGACGACCCCTTCTACAGCGGCGGCGGCGGCGGCTTCGCGTTCTCGTCGCAGGATTCCTCCTCG CAGTGGTTGCTTTTCGATTCGGAGCCGAGCTCGATCGACGACGTGTACGGCGGCCGCCAGGAGTCGAAGAGAGTGAGGAG GAGTGAGAGAAACGGGATCTCGATTCCGGCCACGACGTCAACGCTTATGGAGGCGCAGGAGTTTGGGGAAATGATGGAGC ATGTTGATGAGGTTAATTTCGCCCTCGATGGGCTCCGTAAGGGTCAGCCTGTGCGGATCAGAAGGGCGAGCTTGGTGTCG CTCTTGTCAATTTGTGCCACCACGCAGCAGCGAAGGCTCCTCCGCAGTCAAGGGTAAGTCAATTTTCTCCTGAACTTCGC TCGTTGGTTTTGAATTTCAAAGGTGTCCATTGCAATTTTTTTTCTTCTCTTAAATTGAAATTTGGGTTCGGCCAAGTCTC TGGGTGTTTTTGTTGTTGTGAATGTGTGTGTTTTTATTTAATTTGTTGGCACTTTCAAATTAATGCATATACGGTTCTGG TATTATAGTTTTGGTGTAGGTAGATTGAGCTCTGAGATTTCTTTGGCTACTTTCCAAATTGGACATTGATTAGAAAGGGA GCTTAGATATTTCACTTAATGGACTTTGTTGGATTTTTGGTTCGTTTAATCTCGCTTACTTCTGCAATATGCGCTACATC CCTTATGTCAATGGCACCTGCCCTTGTATGGTTAACTTTTTCTTTTTTCTTAAACTCTCTCAAAGAATAGAACTCATATT GTGAGAGGGAATTCGAGTATTCAGCACTATAGGAGTACCAAAGAGTTGTTCTGAGGTATGGTATTCCCATAACCTTTTGG GAGTGAGATTGCCCATGTCTTGAGGTTGCCTCCCTCACATATGCTTGCTTTGTCACTGGCTTGAATCTTGACATTGCATT GGCCCCTCAATTGTTGGATACCACTTTAGCACCCTCTATGGGTGACTTTCACGTCATTTGATGCACTGAGAATAATGTAA GGTTTTGCATGTTAGGATTCGAAGTTGAAAGATTTGACATACAAGTTTTTATTGTTTGCCAGAGCATTATGTAACTGTCC ATGAAGGAGGTGGGGTAATGTTTTCTATGTATCTTAATTTAGTTTGGGATTTTGAACTGAGTGGATGGATTGAACTCACT GTCAGTGTCGTATGGAAATATACCAGTGTGAATGTTTAGCTGATAAATCCCACATTTGCATGCTTTCTAGGATGGCAAAG ACAATTGTTGATGCTATTTTGGGCCTCGGTCTGGATGATTCTCCTAGCAATCTTGCTGCTGCAACCCTTTTCTACATTTT GACCAGTGATGTAAGTCTTCTTTTGCTAGTGAAATTGCAGTTGCAGTGAATTGTGTGAAAGAAGCTATGGGTAATATAAT 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CATCGTTATCCTTCGCTCTGATAAAAGAAAATACTTCAAGAAGTGTGAAAGACCATCAATATGATAAGCATCTCACTGAT CATGAGTTAGATTTTCTCGTTGCTATTCTAGGCCTGCTTGTAAATCTAGTTGAGAAGGATGGTCGCAACAGGTAATTTGA TAGTTTCTGAATTGACAGTTGGTTATGAACAAGATATTAAATGTGTTTTTTTCATTAAATTCTTTTCTTCTCTTGTAAGT TTTATATTTGAATAAATGACCAGAAAAGAAGTTCAACACATGACTAGGAGTCTAATAATTATCACAATTAGTTCCCTTAT TTGATTAGAATTGGGGTCTAGTATTAATATTGTTGAGAAGTCACACATTGACTAGAGATATGACCAAGATAACCCTTATA TATGGGAAGACAATCCTCAACTCTAGAGCTAGCTTTTGGGTTGAGTTAGGTCTCCCAAATTCTAATATTCAGGACCCCTC CCAAGTCACACCCAAGGCTGGACATATGCAGCCTAGAATGAACATCTGCGAGTGGCCCATATACGTGTGGTCCCCACTTA ACGGTTCTAGGTTAGACTCTGATACCATATTAGAATTTGGGAGGCCTAACTCAACTCAAAAGCGAGCTCAAGAGTTGAGG ATTGTCTTCCCATATATAAATAAGGGCTACGTTGGCCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTCTCAACAAATATAAATATG GTATAGTGCTCAGTCCTTTGTATTAAAAAACCATAATCACTATTTGAGTCTTACTTTTTTGTGATTTCACGAAAACCCTA TAACTTCAACACTTTTATACTCTTATTCTTGTTTTTATAATCATGATGTAGCATAACAATTGTACCTTTTTTGGCCCTTT CATAATAAGTGCTTCACCATTGTGTAGAGCTACTGCGCTGACATTCCTAACACACTTCAAAATTAAAAAAAATTACCCAC TTACTCCATTTGATTTATTTCATGTTTATTTGATGAAAAAGAAAGAAATGAATGACTTCCCCCACTAACTGTAACCTTGT TTTTGGAGATAAACGACAACTTACTAGACCTAACACCAGATAGACTTTTTGACATTTTATTATAGTGTATCTCATTATTA TTGTACTTTTAACCCATTCAAGCTTTGTTACTTTTTTTTGCAGATCGCGTCTTGCAGCAGCTAGTGTCCTGCTACCTTCT TCAGAAGGTCTGGACCAGGAGGTTCAGCGGGATGTTATTCAATTATTATGCTCTATTTTCTTAGCTAACCAGGGTGAACA TGAGGGAGCTGGGGAAGATAAACAGTTTGTACTGGTGGGTAGCATCTTCCAAATTTTCCATAGAAATCTTGGATTAATTA TGTTTAAAATTTTGTACCTTATCTATTGATGTGATGGTAGGAAGCTTGGAATAACATGGATAGTACTAAGTGTAAAATCT GCAATTAATCTTACCAACTTGTATTCTATATCATTTCATGGTTCATAATTATCAGCTGATCAATAGCTGTTTCTGTCTGC CTCAACTGAAATAGTTGCATGGGGACCAAAAAAGTTGAAGTTAGAATCATGCATGACTGATTGCACCCTGACATGGATAA TGCAATTTTGTGCTTAAGAAAAACAAGGTTTTGGCTTCAAACTTCGGAGATATTGCATAATTCTTGTATATCTCATATGA TGTGGTAGTCATTAACTCATTATACTTGTTTGGTTATTATCAATAGTAGAAAGAGTTAATTAAAAGTTGGTGTGACTCAA CTCTCAAGACGTGTAATGTGGGGATGAACATATATGAAATTTTAGTGCGATTGGTGTATCTTGAATAATCTTGTGTTTCA TCATGCAGAATGATGAGGCAGCTGTTCTACAAGGTGAAAAAGAAGCTGAGAAAATGATTGTGGAAGCTTATTCTGCACTG CTTCTAGCATTTCTTTCCACTGAAAGGTTAATTTCTTATCAATTTTCAATTCGTTTTTATTTAAAATTGTTTTATTGCAT ATTTTACGGCCTACAATTTACTTTTTTGGTCTACAGCAAGAGCATCCGTGCAGCAATTTCGGAGAATCTTCCAGGGCACA ACTTAGCGAGTCTTGTACCTGTGTTGGACAGATTTGTGGTATGTTGCTTTTGGCAATTGTTAATGCCCTGCAGATTTAAT TATGAAATTGTGATACTAACAAGCTAGACATATTGTTAGTTAGGCACTCAATTTGTATGGGAAGGGTAATTGGAGTTCCA GTTTAGTATCTGATGCTTCATCTGAGTAAAGTAACTAACATATTTAGGCTGTGTTTGGTTCAGCAGCTTAATTAAGCACT TATGGAAATAAGTGCTTATCGCATTAGCTAATTTGATAAACTTATTGACATAAGCTGAAAATAGGTTATGGATAAGCATA AACTCTTATTCATAAGCTAATATGAACAACTTATAAAAATAAGCTCAGAACAGCTTATAGGTAGGCCACGAGCTATTTAC CTAAACTCTCACATCACAAACGCTTGTATAAGTGCTTATGCTATTAGATAAACTTAAATAAGCTCTTCCAAACGAGGCTT AGTTGCAGAAGTTTACTTGCTAGATGGTGGGTAAATGCTGATGTGTTTTGATAGATAATGGGATTGAAAATCACCGTTTA AAGGGTGAAAAAATGGAGATGGCCTGCTGAATCATATTAGATGCCCAAGGCTCACTTTTTTCCCTTTTAATTTTTTTAAT ACTATTAATATCCTTTTAAACTCAAATTTGTGTCTTTACACAGGAATTTCATCTGTCTTTGGACATGATTTCACCAGAGA CTCATAAAGCTGTTAGCGAGGTCATCGAATCGTGTAGGATTCGCAAAAGCTGAAATCGAAAACTCTGTACAGCCACAGCT TACATTAGGGTTTGTTGTTACTCCGGTGGAAATGTGACTGCTGCAGCTCACTTCATTGCAGAGTATGACCAATGTTTATA CTCTGTTCATAGAGCTTATACCCTTATTTTTATATCACCATGCTGGTGATGCTTGTATAAAAAAAATCAATAGTGGGATG CGTTCCTAGCATAGTTTGTGTGTAATCAATACTGGTAATTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTCATTTTATTCTTTCATCTTGT ATCCGAAGCTTATATATTATGTCTCAAGTTTTCACATCTCGTGTCTCCATCTTTTCACCAACATGATGATACAAGCTGAA GCTGAAATAATCTTATTTATTCTTAGTACTAGTAGAGGCTTGTGCATTAATCGTATCTCTTTCAGCAACAAGCTTTGTCT GATCCATAAGTTGCAATTGTGTTCCTGTAGTGGATATTATTCCGGGGGAAACATAAGTTTATAAATTTGAAAGTAAATGT AACTTAGAGGCAGTTTTTTACACGCTGTTATTACCGTTGCTCAATTACAACATGACACATCAGTTAGAAAATGGAAAATT GAAAAAATTAATAAATTAATAAAAAGTGGATGCTATCCAAATATCAGATTCCTCCTCTTTCATCAGGTGAATCTTGAGTG TCATAGAAAAAGCTGCTCTTGATTGTGATTTCTGCGAAATTAGCTTGATGTCCTTTAGGTATAGGTCCA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0054000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATCGTCCGCACCTACGGCCGCCGCAACAGATCAATCTCCGGCACGTGCTCTGGCTCCTCCCTAAACGACGACGCATC GAGGGACTCCCTCTCTCAAGAACACGACGACGACCCCTTCTACAGCGGCGGCGGCGGCGGCTTCGCGTTCTCGTCGCAGG ATTCCTCCTCGCAGTGGTTGCTTTTCGATTCGGAGCCGAGCTCGATCGACGACGTGTACGGCGGCCGCCAGGAGTCGAAG AGAGTGAGGAGGAGTGAGAGAAACGGGATCTCGATTCCGGCCACGACGTCAACGCTTATGGAGGCGCAGGAGTTTGGGGA AATGATGGAGCATGTTGATGAGGTTAATTTCGCCCTCGATGGGCTCCGTAAGGGTCAGCCTGTGCGGATCAGAAGGGCGA GCTTGGTGTCGCTCTTGTCAATTTGTGCCACCACGCAGCAGCGAAGGCTCCTCCGCAGTCAAGGGATGGCAAAGACAATT GTTGATGCTATTTTGGGCCTCGGTCTGGATGATTCTCCTAGCAATCTTGCTGCTGCAACCCTTTTCTACATTTTGACCAG TGATGGTCAAGATGATCACCTCCTTGAATCACCTGGTTGTGTTAAATTTCTAATCAAGTTGTTAAGACCAATTATCTCCA CTGTTATTAAAGACAAAGCACCAAAAATTGGCTCTAAACTACTCTCATTGCGGCAGAATGATGGCATGCTAAAAAATACA ACAGGAAGATTCGACTCCAGTTCTGTTGCAGTATTTTCTAGCGTTCAAGAAATTCTAGTAAACTGCAAAGAACTAAAAAC AGTTTGTCAGAATGACAGTTGTGTTGAAAGGCCAGAATTATGCCCTAAATGGTTAGCATTGCTGACCATGGAGAAGTGTT GTTTATCTGCCGTTTCTCTCGATGAAACCTCTGGCGCCGTACGGAAGACCGGTGGAAATTTTAAGGAAAAACTAAGAGAG TATGGAGGACTTGATGCAGTCTTTGAAGTTGCCATGAATTGTCATTCAGATTTGGAGAATTGGATGGAGGATAGTTCTCT GTCAACCAAAGATTTGAGAAATGACAAATGTCTAAAGAGCCTAACCTTGCTTCTCAAATGCCTGAAGATAATGGAAAATG CTACTTTCCTAAGCAAAGACAATCAGGCTCATTTGCTTGGAATGAAAGGAAAGTTGAGTCCTCAGGCAACCCCATTTTCT TTTACAGAGCTGATTATAACCGTCATAAAGATCCTCTCAGAACTATGTTTACGTCGGGGTGCCTCTGCTGCTGCATCCAA TAATGATAGCATGCCTAATGATCCTTTCTCTATGGGCAGTCATGACTCTGAATTGGATCAAGTCAGAGATTATAAAGAGA ATGAGACTTTATCCGTTAGTTCCAGCAGTAAATACGGCAGCGTAGAGAGAGCCTCTTCTATTAAGAGTTCTAATGTTACG GAAAACCGCCGACTGTTGACATGTAGACAGTTGGACAGTTCGCTATCCATTTCTGAAACTCCCAGCACATCAACTTCTGA TACTTATTCACTAAATATGAGGGTCAATTCTTCCACGTCTGGGTCTCATAGTGGTGCGTCAAAGAGTTCATACCGTAAAA CATCTGTGATCCAAAATAGTTCCAACAAGAATGTACACTCTACGAAAGGTGCGGCAGTTGTAATCTTGGATGATAACCAA GATCCCTTTGCATTTGATGAGGATGACTTTGCACCGTCTGGGTCTAATAGTGGTGCGTCAAAGAGTTCATACCGTAAAAC GTCCGTGATCCAAAATAGTTTCAACAAGAATGTGCACTCGACGAAAGGTGCGCCAGTTGTAATCTTGGATGATAGCCAAG ATCCCTTTGCATTTGATGAGGATGACTTTGCACTGTCTAAATGGGACCTACTATCAGGGAAACAGAAAATACCTCATTCT AAAAAACATGAGGTAGAAAACAGAGAATTTGAAAATAGATGTCAATCTCAAAGCAATATGAGCCAGCAAGAACTAAGCCA TGGGGACATCAATTGTTCCAGTTCTGAAGTTGGTGGTGAAGAAGGTTCCAGCCTTCTAACTGATTGCCTTCTTGCTTCTA TTAAGGTGTTGATGAATTTGACTAATGACAACCCTGTTGGCTGTCAGCAAATTGCTGCCTATGGAGGACTAGAAACTATG TCTATGTTGATTGCTGGCCATTTTCCTTCTTTCAGCAGCCCATCGTTATCCTTCGCTCTGATAAAAGAAAATACTTCAAG AAGTGTGAAAGACCATCAATATGATAAGCATCTCACTGATCATGAGTTAGATTTTCTCGTTGCTATTCTAGGCCTGCTTG TAAATCTAGTTGAGAAGGATGGTCGCAACAGATCGCGTCTTGCAGCAGCTAGTGTCCTGCTACCTTCTTCAGAAGGTCTG GACCAGGAGGTTCAGCGGGATGTTATTCAATTATTATGCTCTATTTTCTTAGCTAACCAGGGTGAACATGAGGGAGCTGG GGAAGATAAACAGTTTGTACTGAATGATGAGGCAGCTGTTCTACAAGGTGAAAAAGAAGCTGAGAAAATGATTGTGGAAG CTTATTCTGCACTGCTTCTAGCATTTCTTTCCACTGAAAGCAAGAGCATCCGTGCAGCAATTTCGGAGAATCTTCCAGGG CACAACTTAGCGAGTCTTGTACCTGTGTTGGACAGATTTGTGGAATTTCATCTGTCTTTGGACATGATTTCACCAGAGAC TCATAAAGCTGTTAGCGAGGTCATCGAATCGTGTAGGATTCGCAAAAGCTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0054000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MIVRTYGRRNRSISGTCSGSSLNDDASRDSLSQEHDDDPFYSGGGGGFAFSSQDSSSQWLLFDSEPSSIDDVYGGRQESK RVRRSERNGISIPATTSTLMEAQEFGEMMEHVDEVNFALDGLRKGQPVRIRRASLVSLLSICATTQQRRLLRSQGMAKTI VDAILGLGLDDSPSNLAAATLFYILTSDGQDDHLLESPGCVKFLIKLLRPIISTVIKDKAPKIGSKLLSLRQNDGMLKNT TGRFDSSSVAVFSSVQEILVNCKELKTVCQNDSCVERPELCPKWLALLTMEKCCLSAVSLDETSGAVRKTGGNFKEKLRE YGGLDAVFEVAMNCHSDLENWMEDSSLSTKDLRNDKCLKSLTLLLKCLKIMENATFLSKDNQAHLLGMKGKLSPQATPFS FTELIITVIKILSELCLRRGASAAASNNDSMPNDPFSMGSHDSELDQVRDYKENETLSVSSSSKYGSVERASSIKSSNVT ENRRLLTCRQLDSSLSISETPSTSTSDTYSLNMRVNSSTSGSHSGASKSSYRKTSVIQNSSNKNVHSTKGAAVVILDDNQ DPFAFDEDDFAPSGSNSGASKSSYRKTSVIQNSFNKNVHSTKGAPVVILDDSQDPFAFDEDDFALSKWDLLSGKQKIPHS KKHEVENREFENRCQSQSNMSQQELSHGDINCSSSEVGGEEGSSLLTDCLLASIKVLMNLTNDNPVGCQQIAAYGGLETM SMLIAGHFPSFSSPSLSFALIKENTSRSVKDHQYDKHLTDHELDFLVAILGLLVNLVEKDGRNRSRLAAASVLLPSSEGL DQEVQRDVIQLLCSIFLANQGEHEGAGEDKQFVLNDEAAVLQGEKEAEKMIVEAYSALLLAFLSTESKSIRAAISENLPG HNLASLVPVLDRFVEFHLSLDMISPETHKAVSEVIESCRIRKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 47 | 47 | - | – | |
| MobiDBLite | 9 | 27 | 19 | - | – | |
| PANTHER | 36 | 920 | 885 | 3.1E-241 | ||
| ProSiteProfiles | 83 | 188 | 106 | 10.181 | ||
| Gene3D | 95 | 440 | 346 | 1.4E-60 | ||
| Pfam | 96 | 782 | 687 | 3.1E-86 | ||
| MobiDBLite | 496 | 543 | 48 | - | – | |
| MobiDBLite | 565 | 585 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 640 | 920 | 281 | 5.1E-64 | ||
| SUPERFAMILY | 689 | 872 | 184 | 1.15E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0054000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…