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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0140700 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0140700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Auxin efflux carrier family protein; TAIR: AT1G76520.1 Auxin efflux carrier family protein; Swiss-Prot: sp|Q9C9K5|PILS3_ARATH Protein PIN-LIKES 3; TrEMBL-Plants: tr|K7MGQ0|K7MGQ0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0140700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:21286074..21315584) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTTGTATATAAACTTATCCTAAACGGCATATGCCAATCCCATTGTTCATGCTTTCCCCCTTGTATATGGAATTTTGATCT CTGTTTGGTGGTTATCATCAGTTTCTGGACAGCAGATTGTGGGTGTTTGGTATGGCTCTTTTTCATCCACGTTAGCATGT GATTTATCTTTCATAAACCATAAGTTACACATTATATGATAAGATTCTACAGCATAACCATTTTCTAATATGCTTAATTG CACAAGTTTGGTGTGAGCAGAACAGGGGGCCGGGTCACATAGCAATGGCATTCTGGAACTTGTTCGTGGTGGCACTGATG CCAGTGTTGGAGACACTCTTGGTTACTCTCCTTGGTGCATTGATGGCTACTGAACGTTTCAACTTCCTGCGAGGAGTTGA AGCCAAGAATTGTTTGAACAGTGTGAGTTCACTCTGTTTTTAATTAAGTACACTAGATACCATTATATTAAGGTGTTATT GGATAATTTTTCATTAAGCTATGACTATGCGAGCTAGATCCATTGCGTTTGGAAATTCATTTCTTATGAATTTACTTCCT CCTGTCCTCTAGCTTCTTGAATCATAGGAGTTTTAAGAGAGAAGAGACATAATATTTAAGAGAGTAAATAAAAGCAAAAT TAAGAGAAGAAAATAAAAAGAGGTTTTGCCAATATTCTTATTATCCCTTTATCACTTGAAGAAGGTGATCCTAGCTAGGA CTAAACAATGCCATACAAGTGGCATGATCTTGTTGCACCGAAATATTCTAGAACATGGATCTAAATAATAAACTAGCAAT AAACATAAAAATAATAATATCTGACTATAATTGGCCTAGTAACTTGAGACTCATAAGAAATGCAGCTATAGAAGACTATT AAAGATGCAACACTCTACCAATTACTTGGGGCACTATTTTATTAGTGTAAATAAAATTGAGTGAAAACTAAATAATCGTT 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TGTATTTACTGCCTCTGCCCAAAAGTGCTTAGCCATGCCAGTTTCTTGGAGCATGGTTCTAGCCATCTCCTGAAGAATTC TGTTCTTCCTCTCAACAACACCATTTTGTTGAGGAGTTCTGGGACAAGAGAAATCATGTGCAATTCCATAGGAATCAAAC AGACTCTCAAACTTGTCATTCTCAAACTCTCCACCATGGTCACTTCTGACACGCACAATCCTACAAGCCTTCTCGTTTTG CACTTGGGCAATGAAGGTAGAGAACACAGCATGAGACTCATCCTTGCGGGTTAGAAACTTTACCCATGTCCAGCGGCTAT AGTCATCAACGATAACCATCCCATATCTCTTGCCACCTATAGACTCAGTTTTCACTGGTCCAAAAAGGTCGATATGCAGA AGTTACAACGGCCTTGAGGTTGAGACAACATTCTTTGCCTTGAAAGGGACTTTTGTGAATTTGCCTTTCTGACATGCTTC ACAAAGAGCGTCTGAAGCGAACTTCAGATTGGGTAAGCCCCTGACAAGGTTTAGCTTGCTCAGCTGAGAAATCTTTCTCA TACTGGCATGCCCTAACCGTCTATGCCATACCCACTGCTCTTCATTAACAGACAGAAGGCACTTCACATTTTGAGCCTCC AACTCAGATAATCTGATCTTATAAATGTTGTTCTTCCTCTTGCTGTTAAACAGAACAGAGCCATCGATTTGACTTACAGC CCGGCAGGACTTTTGATTGAATATAACATCATAATCCTTGTCAGCTAATTGACTTATAGACAATAAGTTATGTGTTAAGC CGTCTACCAATAACACATTATCAATGCATGGACTACTATCTACACAAATAGTACCAGTACCAACAATTTTACCCTTTTCA TTTCCTCCAAAGCCAACTTCGCCTCCAGGCTTAAGTTTTAGCTCTTGGAACATACGCCTTTCTCCCGTCATGTGACGCGA GCATCCACTGTCCAGATACCATGATTGGTGTTTCAGTGGAGCTATCAAGGATATCTGCAACATAGATAATCTTGTCCTTA GGTACCCACTTTCTGGGTCCTTTCTTGTTAGTTACCCCAGAGGTTCTGATCACCTTGGGTGTCTCAACATGATATTTTAA AGGAATATTTGCATGATATTTAGACATAGAGAAAGATCCCTTTTTAAGAGGGTTTTTAGCAACTTTAGCAGGTAAAGGAT CAGGCAATATGGTACTAGAGGGAACAAAGCATTCATACAAGGATTTAGCTTTAGACACAGAGGGCTCATTTCTAATTGGT TTAGAATAGCCAATGCCACGCATTCCATTTATGCTTACGCCGTAGATCATTGAAGCCATTAAGCTTCTATCCACGCTTTT AGCTAGGAATCTTTGAAAAGACTTTTCATACATAGACTCATTTCTACAATCAGAGGCATCACAAGCAACAATTTCTTCTA ACTTAGCAATCTGGTTCTTAAGCACAGAGTTAGAATTGATCAAAGCATGATTATCATTTTTCAAATCAGAAATAATTTTC TCATGTTCAGAAGGAGTCTTGGAAACAGCAGATAAGTCCTTTTTCAGCTTCTTATGCTTAGACAATAAGGAGTTATACTT ATCCATGATATCAGACAATGCATGTTTCAGTTCAGAGGTAGAGAAAGAAGCGAATACCTCATTTTCATCGTCTGAGTTAG GATCTCCTTCTGATTCTGAGTCAGAGTCAACAGCTCCCTTTGACTCTGCTTCTTTGTCTTTGACAATAGCCATGAGTCCT TGGACTTCACCATCAGAGTCAACATCCTCTGACTCTGATTCATCAAATGTCACCATCAGACTCTTCTTTGTCTTGAAGTG CTTCTTTGGCTTCTTGTCCTTCTTCAACTTTGGACAGTCACTTTTGTAGTGCCCTGATTCTTTGCACTCAAAGCATGTGA CTTCCTTAAGTGAGGACTTCTTCTGACCTGAGGATTCAGACTTTCCTTTTGCCTTTCCAGAGCCTTTGTATTTGCTCTGC CTGTGCTTCCAAATGCGATTGAGTCTCTTGGAGATCAGAGTCAGCTCATCTTCATCAGAATCTTCTGATGCTTCTTCAGA TTCCTCTTCTTCAGCTTGAAGAGCTTTTGACTTCTCAGCCTTAGCCTTTTCAGATTTAGATTTCAAGGCTATGGACTTTT TCCTCAGATCTTGCATCTCTGAGCGCTTCAGCTCATGGCATTTCAAAATGCTGATGAGCTCTTCTAAACTCATATTCTCA ACATCTCTCGTGAGCTCTATTGAAGTCACTAAAGGCATCCAACTTTCAGGAAGACACCTGATGACCCTTATGACATGATC TTTTGTTGTGTAGCTCTTGTTGAGAGGTCGTATGCCAGCTACAAGCAACTGAAATCTGGAGAACATTTCTTCAATGGACT CATTTGGCTCCATGATGAAGGATTCATACTTTTGGATTAAAGACAATGCCTTTGATTCTTTGACTTTCTTGTTTCCTTCA TGAGACATCTTCAGAGATTCGAAAATGCCTTTCGCAAACTCACGATCTGTAATCTTCTGGTACTCTTCATAGGAAATAGC ACTTAGAAGAATTGCTCTTGCTTTGTGATGTTGTGAGTACAGCTTCTTTTGATCTGCAGTCATCTCTGACCTTGGGATCT TCTTGTCATCTGCATCAACTGGACGCTCGTAGCCATCCACAATAATATCCCAGAGATCTGCATCGAAACCCAGAAAGAAA CTTTCCAGTCTATCTTTCCAATATTCGAACCTTTGACCGTCGAACATAGGAGGCTTTGCATTGTAACCATCTCTTTGAGT TTCACTGGTGGTGGCAGCCATTGTTTTTCACACCGGCCCGGATCACTGAACACTGTTAGGTGTGGTAATCAGAACTTGCG CTCTGATAATAATTGAAGGTATGAAAAACGGTAGAAAGGGGGGGGTTTGAATAACGTTTTCAAGATAAAGCTTCCACCTT AAAGATTTTGACAAATCTTTCGAGAACTTAAGTGCCAAAGATAAGAGATAGAAAAGCACACAAGGATTTTATCCTGGTTC ACTTGATAAATCACTCAAGCTACTCCAGTCCACCCGTTAAGGTGATTTCTTCCTTCTTAGAATGAAGGCAATCCACTAAT CAGGTAAGAGTTACAACTGCACTTGAAACCTACAAGTGACTAACAATTACACTGACTTAGCTCACACTAAGATTCACTCT CTTAGTCTTCTCTAGGATCCGATCAACCTTGATCTCCTAAAGGAACTAAACAAACTGTTTATCAAAGAATTGTTTACAAG AGATTTGCTTCTAAAAAGCTAATAGTAAACTCAATGAATTTCAGATGAAAGAAAGCTTAGAAGAATTTGAATTTGTCTTG CGCGTATGTGAATGCTTCTCGCCGCTTCTTTCAGTCTTCAGCCTCTTTATATACTCCAAGGATTAGGGTTGAGCGTTGCT TGGGAAATGCTACCGTTGGAGGGCAGTTCTGGAAAATCCAGCTTCTGCTGTGTCTGAGACTATTAGGTAGGTCGTCAGGA AGGTACAGTTGCTTTTGTACTTGGATAGCGACTTGACCTTTAAACCTAGGAGACTTCTGATCAGGAGAAAGCTTCATGTT GGAACTTGTGAAGCCGGTTGATCAGAGTCAGAAGGAAAGCCCAGATCCTCTGACCATTGTTTCTTCTGATTCTGAACTCA GAGGGAAGTACATGGTCTTCAGAGTATCTTGCTTCTGGACATCAGAATTTCACTAATCAGCTTCTGGATCTTCAGAGTCT TCTACACCATCAGAATATCTGAGCCTTCAGTGTTTCTTGGTTATCAGACTTTCTGGATCTTCAGAACTTCTAGTGACTGA GTCCACATCAGAGTTTGTATAACTTCAGAACTTCTGAAGCTTTTCCACTGTTCATACTGAACATGGTGAATGCGAAAGCG TTGCTTGGGTCGCTCTTTATACACAGTGCTTCTGATTTGTGTGAGGTTGAGTTGAGGTCAGAGCCTGTAAATAGCACACT CAGAAAAACACGTTAGAGTACCACAATTGTTCATATCAAAAGGTTAACTTGTAATCATCAAAACATAGAGTTGTACTACT AGATCAAAACTTGATCTTACAAAGGGCACTCCTTTCCCTAGTCATAACACCCTTTGCTCCGAAAACACCATCGAAAAAAT CATCAATTGATTCCCTTAGTGTGCATTCAAAGAAGTCAAGTCTTCCATTACAACAAAGCCTTTGGAGAACTCATCTTGGT CCTTCTTCTTCCTTCCTCTCTTCTCAACGTTCCTAGGTCTACCTTAGGCCTAGAGGCTTTTACTTCTCGACCACGAGGTA AAGGATCAGAAGGAAACAATGATCACAGGGGAGGGACGCCACGAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCT GAAAGTCTGCAACGAAGCACCCTAACGCCAACGAAATGACCTCAACCCAAAGACAAGACTTTCAGCAATAGAAACTTTGG CGGGTGTCCTTACATCGTCAATCGTCATCAGGCCAAGACTAACCCGACATATAAGAGCATCAAGTTCAAGAAACAAAACT ACATTAGACACCCAAGTGCCCCTGTGGCAACACCTACACAAATCAGAAACCATCTCCACTTCTCAAGGAAACAAAAAGCA ACATGTTGGTATCCATCTTCTTCCCCATCAAAACCTCTCTCCAAGGCTTTGAAACAATAACTTAATCACCTGCCAACATA AACACTGAACTTAGCCCATGTTGGGGGAGACAAGGGAGCCCATGGGCCGAGGAGCAAGACACCAAGAGATCTCGACGCCA CATCTTAACCCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTTATGGGTCACATCTCTTATAACCTCTCCCTCTCACCTTGACTTCTCCG ATGTGGGACTTGACTCCAACACTTGATTCCAACAATCTCCCCCTCAAGTGTGAGACCCTCAACCACATCACCCATGGTCC ACTCGTCTGGTCCCACGAACCATCGCTGATACCACTTGTTGGGGAGAGCCACGACGAGGACCCGTGGGGCAAGGTCGAGG GGAAACACCAAGGAGATCTTGGACACCACATCTTAACCCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTCATGGGTCACATCTCTTATA AAGTCTTCTCCTCACCCATACTTAACCAATGTGGGACTCTAACTCCGCACTTAAATTCTCAACACTCTCCCCCTCAAGTG CGAGTCACCTCCACAATATCATGGCCCCCCTCCACAGAAGCATATCCACCCTTGCACCGCTGTTCACTTCACCGCATCAA CGGAACCCGCCGCCTAGCCACACTGCTAGGAAGACTTTCAACACAAGGAGCCGTTATGGTCCCACGAACCATCGGCTCTG ATACCAATTGTTGGGGGAGACAGGGGAGCCATACCAATTGTTGGGGGAGACAGGGGAGCCCATGGGCTGAGGAGCAAGAC ACCAAGAGATCTCGACGCCACATCTTAACCCAAAACCTTAAGGCATTAGGTTTATGGGTCACATCTCTTATAAAATCTCC CTCTCACCTTGACTTCTCCGATGTGGGACTTGACTCCAACACTTGATTCCAACAGCCCATATATTCGTAGTCAAATCCTT GACCAAGGCCTTTTGAATACCCACCTTTGAAGCGACAAGGATCAGAGACTTAGCCAACGAAACAGACAGAACTGCACCTA CAACTTGATACACATCTACAAATATGATAGCCTCCATGGTCTTCTTCCTAGATGAGAATCTTACGAACCCAAACGAAATT TCTGACGTTGTTCCTTCAGCTGTTGAAAAAATACATTCGTCAACTTTCCCATATGCTTGAAACGACATCGAACATGGTGA TACCTTGTCCTAAAAAACAACGACTTACATGAATGATGAGATGCAATCTACCCCAAAACTTTTCCCATCACCATCCTTAT CAAGCTCACGTTCACCGTCCTTATCTATTATTTCCTCCACCGATCGTTGTTCCTCACCACCACAGGCCGATGCCAGATCA GCCACAGAGCCATAAAGGTCCTATTTCATGGTTGTGTGTCAACGAAATAGAAGAAGAAAATGGCATCTTGACACATATTG TGAAAGGAAGGACCAATAGGAGTAAGGTACAAATAATTGGTTTGAGGCCAAATTGGGTTGGTGGCCTGGACCTGAAACCT ATCCTCTAATGTGCTGAAACAACTGTCGTCGCCTTGGGAAGAGGAAGAGAAGACTGGTTTTCTGTAACTAAGATCGTGAA TGAGAATAAAGCTTAGAGAAGAAGAGGAGCGAAGGAGTGAGTCTGATGTGTGGTGGTTAGTGCTAAGACCAAGCCGCCCC AACCCTGATCGGCCATCGCCGCTTAGCAGGAACAAGAGGGTTTGAAACCCTAGCACAACACCATGCGAGGATTGCCTAAT GTTTCATTTCCACATTACGCTTTCTTAAAACACATACGTATCCAAAAATCCTTAAATCTTACTAGCATTGGTTCTTTTGT TATCCATTAACTACACATTAATGTGCCTTATCAATAGGCTATATGTTTTCCTCCCAGATTCTGCTATTTCACATGACATT AAAAAGCATTACATCACACGATTCAATATATTAAATGAGAAATCATATTTATTAAAAATAAAATATAAGAATGAGATACT AATTATTCCAAAACCAACAATGTTGTCTGGTCATTCGTTGCTACATGTTGTGCATTTCAGAATTATCCTTTCCTCTCATA CATGCTTTGACTAAAAAAATATGGACCGCTGAATTTTTCTATCCTTTATGGCTTGAATGGACTACGTAAAAGTCATTTCA TAACGCCTGGGGAACGCAAGTTTGATCCAGGATTGGAGAGGAGAGGTGGAAGAAATTAAAAGGCTCGGGATGGATTTATG AGTCTTTGTGTGAGCCGTATGCGGTGAGAGTCGCACGTACAGTAACGAGGGTGTTCGCGTCTATACGTGTAGTGTGGTGG TTGGGCCTACCCACCCTATTTGTTCCATGATCTATGGGTCTACTGGAGCTACCCACTTCGATCAATTAGCCAAGATTTTA ACCGGATACAAAATCACCGGCGCTCGATCTAGTGGTATTTTTATGGGGATTCTATCTATCGCTTAGGATCCCTATTCAAG ATGCTTTTCACCACTTATATTAAACCAAATAATAAACAAATCACAAAACTTACGTAAGAATGAAGAAAAAGATTATAAAA AAAAGTTGTTAGGAGAACTATATCCAATGAAACTAAATAAAAAAATTGAACAATATAACGATTTCTACTAATATGACTTG CAATGATATATTGAGGAAGAGATATTATATCATTTCATCAACAATTTTCAACTGAGTTTAGTGTATATCAAGAGTCAAGG AAAACCTGAGAATCTAGAAAATATTTTGCCACTGAAGACAATGGAATAATAAAGTTGTTAAACAAATATATTTTAGGCGA TTTTTTTTATTTCATGATTTCAATAATTAATGTTGGTTACAATCAAAATTTTAAGTTTGAAATCTACTTGATATTGTTAT TTTGATTAAGTATCACTCTACTTATTTTTTGTCAAAATGTTGTATATTGTTATTTTTGTATTTTTTGCCTTGTATGCCTC AAAGGCGTTTCTCGGGAATGTTGTACTCTTTTTTTCTTCACTAGGGTTTTTCTCACTCGGTTTTTCCTAGGATGGTTTTA ATGAGGCACGTTCCTTGGAAATGGTCTTTGGGGTGGTTTGTTAGGTGGGGTTTAAGTTATTTGTCATATTTATGAGAGAG TTGTTATCATGATTTTACTCATTCATCATTATATATAAGGTTAAAAACTATAACCGTCCCTGAACTTTGAGCGAGATTTG AAAACTATCCCTCGCCGGAAAATTATCTGAAAACCATCCTCAGACTTTCAAAAACAAATTGGACCCATCCCTCCGACCAC CTTAGGTCCTGCCAATGTGCTTATGTAGAGCCTATAATCCTATGTGGCACCGCCACATCAATTAAAGAATCTAGTTGGGA TATTTTTTATTTTGATTTAAATTATCCTAATTAAATTATATAAATTTCAATCAAACAATTTTTTTTAACCTAAACAAATT TAAAACTACTTTTTCAAAAACCAAATTAAAACTAATTAACAACAAATCTTCTCTTTAAAAAAAAAAAACACATCATCTTC CAGAAAAAAATTTCACGCTTCTCACTTCATCTCCTTCACCCACCATCCTCCACCCACCCACTCATCCCCATCGCTAACCC GCCACCCACCAAGAACCCAGGGTCGTGAAGAAGTGGCGAAACAGATCGGGATGCAGCGGCGAAACATTCGGATCTATTGA AAGAGGAGGAACAGATCGAGAATCAGGGTCGAAGTCCTCGCTGCTATGAACCCCACCTTCGAGTTCTTCAAGCAGTACGA TAGGGCTGGATTTGGTGCAATTTTGCTACTTTGGGTTTCAACTTTACAGATCTGGGTTTGATTATTGCATTGGGACTTGG TGATGCTTCCAAAATTTGCTCTGCAATCTCCATCACTTGCCCTTTTCTGCACAGCTATGGCAAATATCCTCGATCGAGTG TTTCAAATTGCACATTTAATACATACAACAACTAACCCACTTTGATTTTATTTAATCTAAAGGTTGGCAATTCGGTGCAC CGAGTCTTCAGTTTTAGATTTTGTGGGTTTCATTTTCGTTTGGTGTGAAGGGTGTGTTTGATTGGATTTATTCGAGGTGT GATAGGTTTTCTAGGTGGGGGATAGTGTGGGTTGGGGTTGTTTCAGTGTTGGGGGGCGATTTCTGGGTGTTGGGTGCAGT GGGTTTGGAGTTTTGGGTTTGCAGATGAAGAGGTAGAGAAGAAGAAGACGTAGGCTCATTAATTGACGTGGACAGCCACG TAAGCAACTGGCCGGACCTGAGGCTGCCAGAGGGACGGGTCAAATTTGTTTTTGAAAGTCTGAGGATGGTTTTCAGATAT TTTTTGGGCGAGGGACGGTTTTTAAATCTCGCTTAAAGTTCAGGGACGGTTATAGTTTTTAACCCTTATATATATAAATA TATATCCTTTGTTTTCAAAAAAAAAAAAACTTTGTATTGTTCTTCTATGAATGAGAAATCATATATCAACAGGGTAATCT TCTTTTCCACCTTGAGTTCAAGTTAATCTTGAAATAATATTTTATTCTGCTACATGTTCTCTTCTCCATTTATGAGTTGC AATTTTACACCCTCTTAAGAGTTCCATTGCAATTCAAGTCAATTGACGTTGCAATGCATACAACCACAATATTTCCTAAG TTTTCATTTGCAACACCTCCACATCAACGCCATTATGGATGAACAAAAAATATGCGTTATTTTATTCTTAAAAATGTGTT CAACACCAATTCTCTTACGGATTCCCTCAATTTGACATCAATATTCTGACACAAACCATAGTTTAACACCAAGAGGCCGG TGTAAATTGTGATTAGTAACATATCTATTCTTGTAACACTCGGAGCCGATTAGGGCGGGGAGTGAACGCCGGTAGAATGA GGCATGGACGAGGAGCGGCTTCTAATAAAGCTTCTACGATGAGAGGTACATGGATGAATCGATCTCGCACCCGAACAAAT CATGCATATAACTTATTTAGTTTTAATTTCTAAGGACACTCGTGATCGCTGTAAAAAATGATTATAAACTTTACTTATAA TATATAAGTTATTGTTCACATGTTCAAAAATCAAGACTCAATAATTTATGAGCATAGTGCGTCTCACACCATTTCAATTT TCAAAGGTGGTGCATGTTAAGTAAGAGGGCCATGAAGAGACAGTTTAACACAAATAATTGATTTGTAAAAGAGAATACTT TAATGAAAATATATAATATGCAATATCATTTATCAATCTTATTTGTATTTTTAAAATTGTAGGGAGGGCGCAATTGTATC TATGACTTTGATTGTGGGAGCCAATCTTCTTGATGGTACATAGTTAATTAATTTGTTTTCTAGTTTTTATTTGTGAAGTT GACTCTAGCTTCTAACATTTTAAAACTAGAAGTATTATTTAAATGCTATTCTATATTTCATTAAGTTTGTTTGTACCAAT TTTCCAGGTTTAAAAAAGTCAGGAATAAGCGTTTCCCTTATTATGGGAATTATGGGAGTGCGGTTCATAATATCACCTAT ACTGGGTATTTTGATTGTTAAGGTTGCGCATTATTGGGGATTTGTCGGGTCGTATTCATTGTATCAATTTGTTCTTATGC TTCAATATGCATTGCCACCTGCAACAGCTATAGGTAAGATGACTTTCTTAAACTTTTCTTCAATGATGTAAGGCTTATTC AACATGATATGTTTCAAAACTGTTGTACCTTATATTATATTTTCAATTAAAATCTAATGTATTTAAAGTTTTCTAGCTTG CATGCATATTGTATTAAGTTCCAATTTTACATGGGTTCCTTTGCTTTAGTAGTTGCTTATACATGAAATATGGTTGTATC TTATGTCACGTTTTTATTGGATAACTGCACAAATATTTTTGTTTTGCTTCATCTTACCTTAATTATGCTTATGACATGTT GCTTTATGTTAGTCCATTATCTAACATTTTTATGGTTTGTAAACATTCAATAGCTTTCTTACTCTTATCATTATCGTTCA TGAACATGACATTTAAATATTACACTAAGCCATAACTTATTGGTCAATATTTGAGAAAGGGAGAAGAAATTTTTTCCTTG TTTTGGTCCAAAAGTATGCTCAATTTGTACCTAAACTAACATCTAATTTATTTCTTTCATAAGTCAAGTCTAGTTTTTTT TTTCTTCTTAATTATATTTCTACTTTAAAAGGCAGACTTTGCATGTAATATTGGTCATCTTAACTTGGTAGGGACGATTG CTCAGTTGCTTGGAATTGTTGAGAGTGAATGCTCTTTTATCATGATATGGACATACACTGCTGCTACATTTAGCCTCACC CTTTGGTGTACCTTGTTCATGTGGATGCTGGAGTGACGTTTACGCTAAAATATATCGGCTCCCTCTTCCCAAATGCAAAA TATAATATATGACCAGTTTTTTTTTTGGAGAATGAGTAAACATTATTGTAATGGTTTCATAACAATTTGAAGCATATGTT CAATTGTGGTTGCTTTTTAGCTTTTGAGGAGAGATGTCTATCCATTATTTTTTATTTTTTTTGTTTTTTCTCCCCTTATG ATGCAGTTTTAATGTTTCTATCTTTAGATCGCTATATTATTTTTTTCTAAAAAAGATAAAGTTATAGTTAA
CDS sequence (LotjaGi4g1v0140700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTCTGGAACTTGTTCGTGGTGGCACTGATGCCAGTGTTGGAGACACTCTTGGTTACTCTCCTTGGTGCATTGAT GGCTACTGAACGTTTCAACTTCCTGCGAGGAGTTGAAGCCAAGAATTGTTTGAACAGTCTTGTGTTTTATGTGTTCACTC CGGCGCTGCTCATTGCCGAATTGGCCAAAACAATCACTTTTGACCAATTAGTTGAAATGTGGTTTATGGTGGTGAATATC TTGTTAACATTCATAGTTGGCTCTGTTTTGGGTTGGATGCTTAACAAAATGGCTAGAACCCCTAAACACCTTCGAGGCCT TGTTAGTGGTTGCTGTGCTGCTGGGAATTTGGGGAATTTGCCTATTATTATTGTCCCAGCAGTTTGTAAAGAGAGCGACA GTCCATTTGGAGATACATCCACCTGCTCAACTTATGGGGAAGCTTACGCATCCATTTCTATGGGAGTATCTTCACTTTTG ACGTTCTCATATTTGTATATCCTCATGGAGTCAAGTGTGGATAGGGACACTCAAAATATGAATACGATTGATGCCACAAC CAGCACTACACATTTTACTACAACACCAGAAATATTTCCGGCAAATGTCAAGGAACCATTGCTTCCTTCAACAAACTTTT CGAGCACAGACAATCTTTCAATTCAACATGAGTCACCACATGATAAAAATGAGAGCAAGGTGTCAATTTTGAATCATATT ACATGGCCCATTACAAAATGTTTTGGATATGTGAAGATGGAGAAACTGTTTACACCAATAACAATTGCAGGGATTATTGG ATTTACCATTGGAGCAGTCACCCCGATGCAAAATCTCATGGTTGGTGATAGTGCCCCTCTTCGTGTCATCATCAATTCTG CATCTTTAGTGGGGGCGGGGAGTGAACGCCGGTAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0140700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFWNLFVVALMPVLETLLVTLLGALMATERFNFLRGVEAKNCLNSLVFYVFTPALLIAELAKTITFDQLVEMWFMVVNI LLTFIVGSVLGWMLNKMARTPKHLRGLVSGCCAAGNLGNLPIIIVPAVCKESDSPFGDTSTCSTYGEAYASISMGVSSLL TFSYLYILMESSVDRDTQNMNTIDATTSTTHFTTTPEIFPANVKEPLLPSTNFSSTDNLSIQHESPHDKNESKVSILNHI TWPITKCFGYVKMEKLFTPITIAGIIGFTIGAVTPMQNLMVGDSAPLRVIINSASLVGAGSERR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 299 | 299 | 4.6E-113 | – | |
| PANTHER | 1 | 299 | 299 | 4.6E-113 | – | |
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 4 | 26 | 23 | - | – | |
| Phobius | 6 | 26 | 21 | - | – | |
| Pfam | 10 | 298 | 289 | 9.5E-38 | ||
| Phobius | 27 | 46 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 43 | 62 | 20 | - | – | |
| Phobius | 47 | 67 | 21 | - | – | |
| Phobius | 68 | 72 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 72 | 94 | 23 | - | – | |
| Phobius | 73 | 94 | 22 | - | – | |
| Phobius | 95 | 105 | 11 | - | – | |
| Phobius | 106 | 128 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 106 | 128 | 23 | - | – | |
| Phobius | 129 | 147 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 148 | 170 | 23 | - | – | |
| Phobius | 148 | 168 | 21 | - | – | |
| Phobius | 169 | 255 | 87 | - | – | |
| Phobius | 256 | 274 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 256 | 278 | 23 | - | – | |
| Phobius | 275 | 304 | 30 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0140700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…