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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0177500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0177500.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Phospholipid-transporting ATPase; TAIR: AT1G59820.1 aminophospholipid ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9XIE6|ALA3_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1KXN1|I1KXN1_SOYBN Phospholipid-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0177500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:36256107..36288137) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAATAAAAAATAAAAAATAAAAAATATAATTAACACATGTCATGCCTTTATTGGTTGCATTTGAGACTGTTTTGAAAG TGTCTCAAATGAGACAATAGCCAAGAGGTCACCTAGTCACTGAGCAAGGTGTGCTAGTGCAGTTGTAACAATCTCAAATT TTTTTATTCACATTGAATTTTATTTCTTCCTTAATTTTTTTTAGTTCACCCTTTATGATCACATCCCAATTAAATTCAGA TAAAAATCTTTTCTGTTTTTTCCCCCAATCTTACCTTCATTTACCAAAAAGAAAAGTCTGCCGAATACGATGCACGCGAC ACGCTAACGAGGGAATTTGGTGCAGCAGAGAGGGAATATAGCAGTACTAGAAACGCGAACGCGGGTTTTTGTTTTGTAAA GGGAATAAAAACAAAAAAAATTCGGAAAATAGAAAGACGAGGGCAAAATTGGCAAACAGGAAATGGGGTGGTTGAATCTC TTGGTTTTAGCGTAGGAACGAACGAAGACCAACCCCAACTCGCGAGTCTGCGTTTCGTTCATATCATAATCATAATATTC GAAAAACGATTTTGAATTTGATTGGTTTTTTGAAGCTCCGGCGATTGCATGAAATAGGAGGAGGAAGGATGAAAGCATGG GATGGGATTCAATCTTCTTTCTCTTCTACTTCTAGATCGAGTTCCACCACCACCATGAGCCATCGAGCAACGTCTCAAAC GGTTCGACTCGGCCGAGTTCAACCCCAAGCCCCAACTCACCGCACCATCTTCTGCAACGATCGCGAAGCCAATCTCCCCG TCCGCTTCAAGGTTCTATTCCTTCCTTGATTTTCTTCAACTTCACCTTAAACAGTTTTTCTTCAATCTGTGTTTTGCGCT TCATTGATTGATGTTATTGCCCTAATTTTTCATATAAACTATGGTTTGATCTAATGGGAAAGCAATAAGATCGATTGTTA 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0177500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAAGCATGGGATGGGATTCAATCTTCTTTCTCTTCTACTTCTAGATCGAGTTCCACCACCACCATGAGCCATCGAGC AACGTCTCAAACGGTTCGACTCGGCCGAGTTCAACCCCAAGCCCCAACTCACCGCACCATCTTCTGCAACGATCGCGAAG CCAATCTCCCCGTCCGCTTCAAGGGAAATTCAATATCAACTACAAAATACAACTTTCTCACCTTTCTGCCAAAAGGATTA TTTGAACAGTTCAGGCGGGTGGCTAATCTCTACTTTCTTACAATCTCAATTTTGTCAACCACCCCAATTAGTCCTGTGTC TCCGATAACTAATGTGCTTCCACTATCTCTTGTGCTTCTCGTTTCTCTTATCAAGGAAGCTTTTGAGGACTGGAAGCGTT TTCAAAATGACATGACCATAAACAATAATGTGGTAGATGTTTTGCAAGATCAGAAGTGGGAGTCTATACCATGGAAAAAG TTACAGGTTGGAGACATTATCAAGGTGAAGCAGGATGGATTCTTTCCTGCAGATCTGCTTTTCTTGGCCAGTACAAATGC AGATGGTGTCTGCTACATTGAGACTGCTAATTTGGACGGAGAAACCAATTTGAAGATTAGGAAAGCACTGGAAAAGACTT GGGATTACCTGACTCCAGAGAAGGCGTCTGAGTTTAAAGGTGAAATTCAATGTGAGCAACCAAACAATTCATTGTATACC TTTACTGGAAACCTTTTAATTCAAAAGCAAACGCTTCCCCTCAGTCCAAACCAAATTTTGTTGCGAGGGTGCAGTCTCAG GAATACAGAGTATATTGTTGGGGTTGTTATTTTTACAGGACCTGAAACAAAGGTGATGATGAATTCAATGAATGTTCCTT CCAAAAGAAGTACATTGGAGAGGAAGCTTGATAAGCTCATACTAGCTCTATTTGCTACTCTCTTTATGATGTGTTTTATT GGAGCTATAGGCAGTGCTATCTTCGTAAACAAAAAATATTTTTACTTACATCTTGATTCATCAGAGGAAGGCTCAGCACA ATTCAATCCAAGAAACAGATTTTTGGTTTTTCTTCTGACTATGTTTACCCTTATCACCCTATACTCAACAATCATCCCCA TTTCACTTTATGTTTCCATAGAGATGATCAAATTTATTCAGTCAACTCAATTTATCAACAAGGATTTGTGCATGTACCAT AGTGAAACCAATACCCCTGCATTAGCTCGAACTTCAAATCTGAATGAAGAACTTGGGCAGGTGGAGTACATTTTCTCTGA CAAAACTGGGACTCTAACAAGAAACTTAATGGAGTTCTTCAAGTGTTCAATTGGAGGCGAAATCTATGGGAATGGTGTGA CTGAAATTGAGAGGGGAATAGCAGAGCGCAATGGCATGAAAATTGAGGAAAATAGCTCTCCCACTGCTGCGCATGAGAGG GGTTTTAATTTTGATGATGCTAGGCTTATGAGAGGAGCTTGGAGGAATGAGCCTAATCCTGATGTCTGCAGGGAATTCTT CAGATGCCTTGCTATATGTCATACTGTACTTCCTGAGGGCGATGAGTCCCCTGAGAAGATCAGGTATCAAGCTGCATCAC CTGATGAGTCTGCTTTGGTTATTGCTGCGAAGCACTTTGGTTTCTTCTTCTACAGGCGCACACCAACCATGATATATGTT CGTGAATCTCATGTAGAGAAGATGGGTAAAGTTCAAGATGTATCTTATGAGATTTTAAATGTGCTCGAGTTTAATAGTAC AAGGAAGCGTCAGTCTGTTGTTTGTCGTTATCCAGATGGAAGGCTTGTACTATACTGTAAGGGTGCTGATAATGTAATCT ACGAGAGACTAGCTGATGGTAGTAATGATATCAAGAAAATCACTAGGGAGCATCTAGAACAATTTGGATCCTCTGGACTA CGTACATTATGCCTGGCCTACAGAGAATTGCATCCTGATGTTTATGAAAGCTGGAATGAGAAGTTTATCCAGGCCAAGTC TTCTCTACATGATCGTGAAAAGAAATTAGATGAGGTGGCAGAACTCATAGAAAAAGATCTCGTTTTAATTGGTAGCACTG CAATAGAAGACAAGCTTCAAGAAGGAGTGCCTGCTTGCATTGAAACTCTTCAAAGAGCTGGTATTAAAATTTGGGTTCTA ACAGGGGACAAGGTTGAAACAGCAATTAACATAGCCTATGCATGCAATTTAATAAACAATGAGATGAAGCAATTTGTTAT CAGTTCAGAAACTGATGCAATTAGAGAAGTTGAAGACAGGGGTGACCAAGTGGAGATTGCACGATTTATTAAGGAAGAAG TGAAAAAAGAACTGAAAAGGTGCCTTGAGGAAGCACAGAGCTATTTTCACTCCTTATCTGGACCAAAACTGGCACTTGTA ATTGATGGAAAGTGTCTAATGTATGCATTGGATCCAAGTTTAAGAGTGATGCTGCTGAATTTTAGTTTGAATTGTCATGC TGTTGTTTGCTGCCGAGTTTCTCCTTTACAGAAAGCGCAGGTCACAAGTATGGTTAAGAAAGGTGCAAAAAAAATAACTC TTAGTATTGGTGATGGAGCCAATGATGTAAGCATGATTCAAGCAGCTCATGTTGGTGTTGGCATAAGTGGAATGGAGGGA ATGCAAGCTGTGATGGCTAGTGATTTTGCCATTGCACAGTTCCGTTACCTTGCAGATTTGCTTCTTGTTCATGGCCGGTG GTCATATCTGCGAATATGCAAGGTGGTGATATACTTCTTTTACAAGAATCTCACATTTACTCTTACTCAGTTTTGGTTTA CTTTTCAAACTGGGTTCTCTGGTCAAAGATTTTATGATGATTGGTTTCAGTCATTATATAATGTTATTTTCACGGCACTT CCTGTGATCATTGTTGGACTATTTGACAAGGATGTCAGTGCATCTCTATCCAAGAAGTATCCTGAGCTATACATGGAGGG AATAAAAAATGTTTTCTTCAAATGGAAAGTTGTGGCTATATGGGCCTTTTTTTCTGTGTACCAGTCTCTCATATTCTACT ATTATGTGAGTACGTCAAATTTAAGTGCGAAAAACTCAGCAGGAAAGATATTTGGACTCTGGGATGTCAGTACAATGGCC TTCACATGCGTCGTAGTAACCGTCAACTTGCGTCTACTTTTGATTTGTAATTCAATCACAAGATGGCACTATATTAGTGT TGGTGGAAGTATATTAGCTTGGTTTCTTTTTATTTTTATATATTCAGGGATTTCCACTCCTTATGATCGACAGGAGAATA TTTATTTTGTCATATATGTCTTGATGAGTACCCTCTATTTCTACCTCACACTGCTACTAGTTCCTGTTTCTGCACTTTTC TGTGACTTTGTTTACCAAGGGGTTCAAAGATGGTTTTTCCCCTATGATTATCAGATTATTCAAGAAATTCATAGGCATGA GCTTGATAACACTGGCCGGGCACAACTGCTGGAGAGTCAGCTTACGCCAGCTGAGGCAAGGAGCTATGCTATATCTCAAC TCCCTCGTGAGATATCAAAGCACACCGGGTTTGCTTTTGATTCACCTGGGTACGAGTCATTTTTCGCTGCACAGCTTGGA GTATATGCACCACCAAAGGCTTGGGACGTTGCAAGAAGAGCTAGCATGAAATCTCGGCCCAAGATTGGGCAACATAAGTA A
Protein sequence (LotjaGi4g1v0177500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKAWDGIQSSFSSTSRSSSTTTMSHRATSQTVRLGRVQPQAPTHRTIFCNDREANLPVRFKGNSISTTKYNFLTFLPKGL FEQFRRVANLYFLTISILSTTPISPVSPITNVLPLSLVLLVSLIKEAFEDWKRFQNDMTINNNVVDVLQDQKWESIPWKK LQVGDIIKVKQDGFFPADLLFLASTNADGVCYIETANLDGETNLKIRKALEKTWDYLTPEKASEFKGEIQCEQPNNSLYT FTGNLLIQKQTLPLSPNQILLRGCSLRNTEYIVGVVIFTGPETKVMMNSMNVPSKRSTLERKLDKLILALFATLFMMCFI GAIGSAIFVNKKYFYLHLDSSEEGSAQFNPRNRFLVFLLTMFTLITLYSTIIPISLYVSIEMIKFIQSTQFINKDLCMYH SETNTPALARTSNLNEELGQVEYIFSDKTGTLTRNLMEFFKCSIGGEIYGNGVTEIERGIAERNGMKIEENSSPTAAHER GFNFDDARLMRGAWRNEPNPDVCREFFRCLAICHTVLPEGDESPEKIRYQAASPDESALVIAAKHFGFFFYRRTPTMIYV RESHVEKMGKVQDVSYEILNVLEFNSTRKRQSVVCRYPDGRLVLYCKGADNVIYERLADGSNDIKKITREHLEQFGSSGL RTLCLAYRELHPDVYESWNEKFIQAKSSLHDREKKLDEVAELIEKDLVLIGSTAIEDKLQEGVPACIETLQRAGIKIWVL TGDKVETAINIAYACNLINNEMKQFVISSETDAIREVEDRGDQVEIARFIKEEVKKELKRCLEEAQSYFHSLSGPKLALV IDGKCLMYALDPSLRVMLLNFSLNCHAVVCCRVSPLQKAQVTSMVKKGAKKITLSIGDGANDVSMIQAAHVGVGISGMEG MQAVMASDFAIAQFRYLADLLLVHGRWSYLRICKVVIYFFYKNLTFTLTQFWFTFQTGFSGQRFYDDWFQSLYNVIFTAL PVIIVGLFDKDVSASLSKKYPELYMEGIKNVFFKWKVVAIWAFFSVYQSLIFYYYVSTSNLSAKNSAGKIFGLWDVSTMA FTCVVVTVNLRLLLICNSITRWHYISVGGSILAWFLFIFIYSGISTPYDRQENIYFVIYVLMSTLYFYLTLLLVPVSALF CDFVYQGVQRWFFPYDYQIIQEIHRHELDNTGRAQLLESQLTPAEARSYAISQLPREISKHTGFAFDSPGYESFFAAQLG VYAPPKAWDVARRASMKSRPKIGQHK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 86 | 86 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 36 | 36 | - | – | |
| Pfam | 47 | 111 | 65 | 5.3E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 59 | 1134 | 1076 | 5.23E-48 | ||
| TIGRFAM | 60 | 1142 | 1083 | 0.0 | ||
| CDD | 62 | 1014 | 953 | 0.0 | – | |
| Phobius | 87 | 103 | 17 | - | – | |
| Phobius | 104 | 108 | 5 | - | – | |
| Phobius | 109 | 128 | 20 | - | – | |
| Gene3D | 126 | 287 | 162 | 4.3E-7 | – | |
| Phobius | 129 | 305 | 177 | - | – | |
| Pfam | 142 | 382 | 241 | 4.0E-9 | – | |
| SUPERFAMILY | 142 | 286 | 145 | 1.18E-17 | ||
| PANTHER | 221 | 1223 | 1003 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 221 | 1223 | 1003 | 0.0 | ||
| TMHMM | 306 | 328 | 23 | - | – | |
| Phobius | 306 | 329 | 24 | - | – | |
| Phobius | 330 | 353 | 24 | - | – | |
| Phobius | 354 | 378 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 356 | 378 | 23 | - | – | |
| Phobius | 379 | 914 | 536 | - | – | |
| SFLD | 407 | 907 | 501 | 0.0 | – | |
| SFLD | 407 | 907 | 501 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 413 | 898 | 486 | 1.05E-33 | ||
| PRINTS | 425 | 439 | 15 | 2.0E-5 | – | |
| ProSitePatterns | 427 | 433 | 7 | - | ||
| SUPERFAMILY | 431 | 703 | 273 | 2.03E-23 | ||
| Pfam | 523 | 616 | 94 | 4.5E-11 | – | |
| Gene3D | 555 | 689 | 135 | 3.4E-19 | ||
| Gene3D | 690 | 896 | 207 | 4.1E-55 | ||
| TIGRFAM | 829 | 935 | 107 | 1.5E-31 | ||
| PRINTS | 856 | 875 | 20 | 2.0E-5 | – | |
| Pfam | 884 | 1134 | 251 | 4.4E-80 | ||
| Phobius | 915 | 933 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 915 | 934 | 20 | - | – | |
| Phobius | 934 | 952 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 949 | 968 | 20 | - | – | |
| Phobius | 953 | 972 | 20 | - | – | |
| Phobius | 973 | 992 | 20 | - | – | |
| Phobius | 993 | 1016 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 997 | 1016 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1017 | 1035 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1036 | 1055 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 1036 | 1055 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1056 | 1061 | 6 | - | – | |
| Phobius | 1062 | 1084 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 1062 | 1084 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1085 | 1095 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 1094 | 1116 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1096 | 1125 | 30 | - | – | |
| Phobius | 1126 | 1226 | 101 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
| Molecular function | Magnesium ion binding | Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Phospholipid transport | The directed movement of phospholipids into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. Phospholipids are any lipids containing phosphoric acid as a mono- or diester. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
Expression pattern of LotjaGi4g1v0177500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…