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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0177500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0177500.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Phospholipid-transporting ATPase; TAIR: AT1G59820.1 aminophospholipid ATPase 3; Swiss-Prot: sp|Q9XIE6|ALA3_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 3; TrEMBL-Plants: tr|I1KXN1|I1KXN1_SOYBN Phospholipid-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0177500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:36256814..36287452) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACCACCACCATGAGCCATCGAGCAACGTCTCAAACGGTTCGACTCGGCCGAGTTCAACCCCAAGCCCCAACTCACCGCAC CATCTTCTGCAACGATCGCGAAGCCAATCTCCCCGTCCGCTTCAAGGTTCTATTCCTTCCTTGATTTTCTTCAACTTCAC CTTAAACAGTTTTTCTTCAATCTGTGTTTTGCGCTTCATTGATTGATGTTATTGCCCTAATTTTTCATATAAACTATGGT TTGATCTAATGGGAAAGCAATAAGATCGATTGTTAGTTCTAGATATGTATGTGAATTAAGCCAAGTGCGTAGTGATCGAT AGCTGTTTGGAACTTTGCTGTTACAATCTATAATGTTCATGATATTTCCCGTTAGCCGTCGTGAAACCCTAGATTTTCTT CCACTGTCCTTTCTACCTCCTTCTATTGCTGCCATCTTAGATATTTGCTTCTGTGGTCCATCCTCTATTCAACCAAACCC ACCATGTAGGTTTTAACTTAGTCAATGGTTGGAGTCTCGCTGCCCCTGTCATTGTCGATGGATGGATATGTATTCATACA CTGATTTCTGGGTTCTGTGCATATTTAGCCTTTCTTATGGCATGGGATTTCATGCTTCCACATTTTTGTTACTGCTGTCA CTGATGGTCTTCTCTAGTTGTTTTTTCTCAGATCTGGCCACTTTGATCTTATACGCCACCTTTAGTTGCTGTTTGGCTCC CTTGCGCTATGATTTTTCGTTGTTTCATTTCCACTTCTCTCCACCAGATGTTATCTGACCACTTTCTATGTCCACGGTGT AGTTTGGCTCTATCTTTGTTCCAAATGCGATTTGGCCTCATTTTTGTCCTAGTTGAGTTCAGTGTTGTCAATTAGCGGTT AAAGTGGCGCTATAGTGTAGTGCTCTGAGGGCTCACTGCTATTCCGCTATTTGCTGCTATTGCCCGCTATTTTCTTCTAT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0177500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi4g1v0177500.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSHRATSQTVRLGRVQPQAPTHRTIFCNDREANLPVRFKGNSISTTKYNFLTFLPKGLFEQFRRVANLYFLTISILSTTP ISPVSPITNVLPLSLVLLVSLIKEAFEDWKRFQNDMTINNNVVDVLQDQKWESIPWKKLQVGDIIKVKQDGFFPADLLFL ASTNADGVCYIETANLDGETNLKIRKALEKTWDYLTPEKASEFKGEIQCEQPNNSLYTFTGNLLIQKQTLPLSPNQILLR GCSLRNTEYIVGVVIFTGPETKVMMNSMNVPSKRSTLERKLDKLILALFATLFMMCFIGAIGSAIFVNKKYFYLHLDSSE EGSAQFNPRNRFLMIKFIQSTQFINKDLCMYHSETNTPALARTSNLNEELGQVEYIFSDKTGTLTRNLMEFFKCSIGGEI YGNGVTEIERGIAERNGMKIEENSSPTAAHERGFNFDDARLMRGAWRNEPNPDVCREFFRCLAICHTVLPEGDESPEKIR YQAASPDESALVIAAKHFGFFFYRRTPTMIYVRESHVEKMGKVQDVSYEILNVLEFNSTRKRQSVVCRYPDGRLVLYCKG ADNVIYERLADGSNDIKKITREHLEQFGSSGLRTLCLAYRELHPDVYESWNEKFIQAKSSLHDREKKLDEVAELIEKDLV LIGSTAIEDKLQEGVPACIETLQRAGIKIWVLTGDKVETAINIAYACNLINNEMKQFVISSETDAIREVEDRGDQVEIAR FIKEEVKKELKRCLEEAQSYFHSLSGPKLALVIDGKCLMYALDPSLRVMLLNFSLNCHAVVCCRVSPLQKAQVTSMVKKG AKKITLSIGDGANDVSMIQAAHVGVGISGMEGMQAVMASDFAIAQFRYLADLLLVHGRWSYLRICKVVIYFFYKNLTFTL TQFWFTFQTGFSGQRFYDDWFQSLYNVIFTALPVIIVGLFDKDVSASLSKKYPELYMEGIKNVFFKWKVVAIWAFFSVYQ SLIFYYYVSTSNLSAKNSAGKIFGLWDVSTMAFTCVVVTVNLRLLLICNSITRWHYISVGGSILSVYRVQRWFFPYDYQI IQEIHRHELDNTGRAQLLESQLTPAEARSYAISQLPREISKHTGFAFDSPGYESFFAAQLGVYAPPKAWDVARRASMKSR PKIGQHK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 64 | 64 | - | – | |
| Pfam | 25 | 89 | 65 | 4.8E-24 | ||
| SUPERFAMILY | 37 | 1019 | 983 | 7.19E-39 | ||
| TIGRFAM | 38 | 1027 | 990 | 0.0 | ||
| CDD | 40 | 966 | 927 | 0.0 | – | |
| Phobius | 65 | 81 | 17 | - | – | |
| Phobius | 82 | 86 | 5 | - | – | |
| Phobius | 87 | 106 | 20 | - | – | |
| Gene3D | 104 | 265 | 162 | 3.8E-7 | – | |
| Phobius | 107 | 283 | 177 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 120 | 264 | 145 | 1.05E-17 | ||
| Pfam | 120 | 311 | 192 | 1.7E-8 | – | |
| PANTHER | 199 | 334 | 136 | 0.0 | ||
| PANTHER | 199 | 334 | 136 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 284 | 306 | 23 | - | – | |
| Phobius | 284 | 307 | 24 | - | – | |
| Phobius | 308 | 834 | 527 | - | – | |
| PANTHER | 334 | 1025 | 692 | 0.0 | ||
| PANTHER | 334 | 1025 | 692 | 0.0 | – | |
| SFLD | 359 | 859 | 501 | 0.0 | – | |
| SFLD | 359 | 859 | 501 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 365 | 850 | 486 | 8.71E-34 | ||
| PRINTS | 377 | 391 | 15 | 1.7E-5 | – | |
| ProSitePatterns | 379 | 385 | 7 | - | ||
| SUPERFAMILY | 383 | 655 | 273 | 1.77E-23 | ||
| Pfam | 475 | 568 | 94 | 4.1E-11 | – | |
| Gene3D | 507 | 641 | 135 | 3.1E-19 | ||
| Gene3D | 642 | 848 | 207 | 3.6E-55 | ||
| TIGRFAM | 781 | 887 | 107 | 1.4E-31 | ||
| PRINTS | 808 | 827 | 20 | 1.7E-5 | – | |
| Phobius | 835 | 855 | 21 | - | – | |
| Pfam | 836 | 1029 | 194 | 1.0E-68 | ||
| TMHMM | 843 | 862 | 20 | - | – | |
| Phobius | 856 | 866 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 867 | 886 | 20 | - | – | |
| Phobius | 867 | 885 | 19 | - | – | |
| Phobius | 886 | 904 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 901 | 920 | 20 | - | – | |
| Phobius | 905 | 924 | 20 | - | – | |
| Phobius | 925 | 944 | 20 | - | – | |
| Phobius | 945 | 968 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 949 | 968 | 20 | - | – | |
| Phobius | 969 | 987 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 983 | 1005 | 23 | - | – | |
| Phobius | 988 | 1006 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1007 | 1127 | 121 | - | – | |
| PANTHER | 1028 | 1124 | 97 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1028 | 1124 | 97 | 0.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
| Molecular function | Magnesium ion binding | Interacting selectively and non-covalently with magnesium (Mg) ions. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Phospholipid transport | The directed movement of phospholipids into, out of or within a cell, or between cells, by means of some agent such as a transporter or pore. Phospholipids are any lipids containing phosphoric acid as a mono- or diester. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
Expression pattern of LotjaGi4g1v0177500.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…