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LotjaGi4g1v0264300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0264300
Transcript ID LotjaGi4g1v0264300.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DnaJ-like protein; TAIR: AT2G26890.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4IVL6|GRV2_ARATH DnaJ homolog subfamily C GRV2; TrEMBL-Plants: tr|I1K1B1|I1K1B1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0264300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:62838622..62856655) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GAAGAATTTCCAGCATCTTTATCTTAAAAAATATCTTAATTCGTAATAAGTCCCAACTGTTAAGCTGTCACGACCTTAAC GAATAAGACATCGCCACGTCACGTCACGTCACCCATGATCACTCTAAACGGTGCGTTTTGTTCATCCCCTTTCTCCCCTG CATCGTTCTTCTCCCTCCCTCTCCAATTTCTGCTACTCCTTCAACTCCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAC CACCATCTCTCTGCTCCGATTCGATTCTCCACAATCTTCCCCAATTCCCAATCCATCAACCTTCACCTTCCCCTTCCTAA CTCGAATCGAAAACTCCGCATTGGATGAAACCAATCGTTGAACCATAGCTAGGGTTCGATTCGATCGAACACCAAAAACC GCATTTCAGTCACAGAACTGGGGGCGAATCAGTCTCGAAGCCCCGCGGCTTCATCGTCGCAGGGACTCTGGTTCTTCCTC CGCTTCCACAATGCGCCACGTGTCCACACCCTCGCTCATCTCCCCACTTTCGAGTCCGTGAGCCGCTACGCCTCCGATCT CAACCGCCCCGTCCCGCTCCCCCCGCCGGTCGTCATGGACGGCGCCGGCAACATCTCCGTCGCTCCCAGTCTAGCACCTC CGCCGCTCGAGGAGCCTGAGTATCTGGCTCGGTACATGGTTGTCAAGCACTCGTGGCGCGGACGATACAAGCGGATTCTC TGCATCTCCAGCGTCGCTGTTGTTACTCTTGACCCTTCCACGCTTGCTGTTACAAACTCCTACGATGTTGCCAGTGATTT CGAGGGCGCCGCGCCTATCATTGGACGCGATGACAACTCCAATGAGTTCAACCTTAGCGTGCGGACCGATGGCCGCGGGA AGTTTAAGGGTATGAAATTCTCGTCGAGGTATAGGGCGAGTATTTTGACGGAGCTGCATCGGATACGGTGGAACCGGTTG 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ACCTCAACCGTCTAATTCTAAATCTCCTCCATCCACGTCTGATATAAACGGAAAGCAAGATCAGTTTCTATAGTACGAAA CCATATATCTATCCAAAGCCTATACTAGTAACTCACCTGTATAGTACACTGTACAGTTTTGTTGTCTACATGCTCCTGGG TTGGTTTTTGGGAAGCATTTGCAATTTTCTTTTAAGAGTTCTTCGTTTGTGTAAAGAGGGATTCCCCACCTTCCATCCCT CACTTTTCTCCTTGTAAATTGGATGGTGTATTTACTAATTTTTGCTACAAAATAGTGAGGTGATTTTGCCCATCTTGTGT GTAATCTCAATTGATGAAGCTAAGCCGGCCAAAACCCAATAATTTTCATCATTTCGACCCAGCCTAGCTTGCTAAAAATG ATACTTTTGATTAAAGTGTTTAATCCATATTAAAGATATCAGCTAGTTTTACATCGAAGCTCTAACTCGGGTTAAAGTTG ATACTTGAGTTGGATGATTTACTTATAATATATAAATTTAATGTTGAATAATTTACTTAATATTTTAGAACAACTTCTTC CTTTACAAAGTTACTTTGAGTAGTTTCTTTTAAAAGTACTTCTCATTCCAACATGAAAATCTACCGAAGTTTCCATATAT ACACACGTGTCATAAAAGCAAGGTAGCTTAATGAGCAGCCATAGTTCAACAAACTAACCTAACCATGATTGAGCCTCATA ATCATAAAAAGAGATGTAGTTGGGCAAATGAAGG 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0264300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGACGGCGCCGGCAACATCTCCGTCGCTCCCAGTCTAGCACCTCCGCCGCTCGAGGAGCCTGAGTATCTGGCTCGGTA CATGGTTGTCAAGCACTCGTGGCGCGGACGATACAAGCGGATTCTCTGCATCTCCAGCGTCGCTGTTGTTACTCTTGACC CTTCCACGCTTGCTGTTACAAACTCCTACGATGTTGCCAGTGATTTCGAGGGCGCCGCGCCTATCATTGGACGCGATGAC AACTCCAATGAGTTCAACCTTAGCGTGCGGACCGATGGCCGCGGGAAGTTTAAGGGTATGAAATTCTCGTCGAGGTATAG GGCGAGTATTTTGACGGAGCTGCATCGGATACGGTGGAACCGGTTGGCGCCGGTGGCTGAGTTCCCGGTGCTTCATCTCC GGCGACGGGCTTCTCAGTGGCTTCCTTTTAAATTGAAAGTAACTTATGTCGGTGTAGAACTTATTGACACAAAATCTGGT GACCTTCGTTGGTGCTTGGATTTTAGAGACATGGATTCCCCTGCAATTATTCTTCTCTCTGATGCTTTTGGAAAGAAAAA TGTTGACCATGGTAGCGGATTTGTTCTTTGCCCCTTGTATGGAAGGAAATCTAAAGCTTTCCAAGCTGCTTCTGGGTGCA CGAACTCGGCTATTATCTCGAATTTGACAAAAACTGCTAAATCCACTGTTGGCGTGTCCTTGTCTGTGGAAACTTCTCAG ACTCTATCCATTTCTGAGTATATAAAACAAAGGGCAAAAGAGGCAGTTGGTGCCGAAGATACCCCGTTGGGGGGTTGGTC TGTTACACGATTGCGTTCTGCTGCCCATGGAACTCTAAATGTTCCGGGATTAAGCTTAGGAGTTGGCCCAAAAGGAGGAC TAGGTGATCATGGCGATTCTGTATCTCGACAGCTCATTCTAACTAAGGTTTCACTAGTGGAAAGGCGTCCTGAGAACTAT GAAGCTGTTACTGTTCGTCCTTTATCTTCTGTGAGTGCTCTTGTCCGGTTTGCCGAAGAGCCCCAGATGTTTGCAGTTGA ATTTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGTTCGTGATGTTTTGC AAACTGAAGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATCCTCCCTGTGGGAGA GTTTATTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAACATTTAGCAGCTGC TGCCAAAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAATAAGGGAGTTCAATG CCTGTATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGATCACTATGCTTCCT GCAGCACCAAATCTTCCTCCAGAGTCTCCTCCATTACCACCCCCTTCCCCAAAAGCTGCAGCAACTATTATGGGTTTTAT TTCATGTTTACGTAGACTACTTGCTTCAAGAAGTGCTGCTTCCCACGTGATGTCATTTCCTGCAGCAGTGGGAAGGATAA TGGGTTTACTCAGAAATGGTTCAGAAGGTGTAGCCTCTGAGGCTGCAGGGCTTGTTGCTGTACTCATTGGTGGTGGGCCT GGTGATGCAAATGTAGCAGATTCCAAAGGAGAGTGGCATGCTACCATTATGCATACAAAGTCAGTATTGTTTGCTAATCC TAGTTATATAATTATTCTTGTCAACAGAATAAAGCCCATATCCGTATCACCTTTACTTTCAATGGCTGTTGTTGAAGTGC TTGAGGCTATGATTTGTGATCCACATGGGGAGACTACCCAGTATACTGTTTTTGTTGAGTTGTTACGCCAAGTTGCTGGG TTGAAGCGTCGCTTGTTTGCACTGTTTGGCCACCCTGCTGAAAGTGTTAGAGAAACAGTAGCCGTAATAATGCGATCAAT TGCAGAAGAAGATGCTATTGCTGCAGAGTCCATGCGGGATGCTTCTCTGCGCGATGGTGCTTTATTGAGACACTTACTGC ACGCACTTTTTCTTCCTGCTGGTGAGCGGCGTGAAGTTAGTCGACAGCTTGTTGCTCTTTGGGCAGACTCCTATCAACCA GCTTTGGAGTTATTGTCTCGAATTCTGCCTCCTGGCCTTGTTGCTTATTTGCATACACGTTTTGATGGAGTTCTTGCTGA AGATACAAATCAAGAAGAGTCATCAACCAAGAAAAGAAAAAGGCGTTTACTTCAGCAAAGGAAAGGTCGCTTAGGGAAAG GATTAACCTCTCAAGATCAACCTTTCTCTTCAGCGCATAACTTTGGTGATTCTGATTTTGGTAGGCAGACGGTAGGTCCT CTTGTGGGCTCAGATAACTATCATAAAAATGTTTTGGACCCCAGTTCTGGACAGGCTTCAATTGTTCAATCTTCAATACC TCATATCAATGAAAATTTGACCAATGGATCTCCTACTGGAGAAGCACAAAATGGGTATTCGACTGTTGTGGCTTCAGCTA TTGTGGCATCAGATAACTCAAACGAAACTCAGGGATCTGATTTTTCAAATTCGGTTGATCCTGACAGCAATGTAGTTGGT TTGCAGAATGCAGACATTCCAGCTCCTGCTCAAGTTGTTGTGGAGAACACCCCTGTAGGATCTGGTCGGCTTCTAATGAA TTGGCCTGAATTTTGGAGAGCTTTTGATCTTGATCACAATCGTGCAGACTTGATTTGGAATGAGCGTACCAGGCAAGAGT TGAGAGAATCTTTGCAAGCTGAAGTTCATAAACTAGATGTCGAGAAAGAGCGTACTGAAGATATTGTTCCAGGTGGTGTA ACCTTGGAAATGATAACAGGGGTTGAGAGTGTACCACAAATATCTTGGAACTACTCTGAATTTTGTGTTCGTTACCCGAG CTTGTCAAAAGAAGTTTGTGTGGGTCAGTATTATCTTCGTCTACTGCTTGAGAGTGGCAGTGGTGGCAGGGCTCAAGACT TCCCATTGCGTGATCCAGTTGCTTTCTTTAGAGCACTGTACCATCGTTTTTTGTGTGATGCAGACACAGGGCTTACTGTA GATGGTGCTGTTCCTGATGAGTTAGGTGCATCTGATGATTGGTGTGACATGGGTAGATTAGATGGTTTTGGCGGAGGTGG TGGGTCATCAGTGAGGGAGCTTTGTGCAAGGGCAATGGCAATTGTATATGAGCAGCATTACAAGACCATAGGCCCCTTTG AAGGTACAGCTCACACTACTGTTCTTTTGGATAGGACAGATGACAGAGCTTTGAGGAATCGACTTCTTTTGCTTCTAAAG GCATTAATGAAGGTTTTATCAAATGTAGAGGCTTGTGTTCTAGTTGGAGGTTGTGTATTAGCCGTAGATCTGCTTACAGT GGTCCATGAAACTTCAGAGAGGACATCTATTCCCTTGCAATCAAATTTATTAGCAGCTACTGCTTTTATGGAACCACTTA AGGAGTGGATGTATATTGACAAAGATGGTGCTCAACTTGGGCCAGTGGAAAAAGATGCTATTAGAAGGTTATGGTCCAAA AAGGAAATTGATTGGACAACAAGGTGTTGGGCTTCTGGGATGCTAGATTGGAAGAAGTTGCGTGATATTCGTGAGCTTCG TTGGGCTCTTGCTCTTAGAGTTCCGGTCCTTACCCCACCCCAGGTTGGGGACACTGCTCTGTCCATATTGCATAGCATGG TGTCTGCACATTCAGATTTAGATGATGCTGGAGAGATTGTTACTCCAACTCCTAGAGTAAAACGAATCTTATCAAGTCCA CGCTGCCTTCCACATATTGCACAGGCCATTCTTTCTGGGGAACCAAGTATTGTTGAGGCAGCTGCTGCTTTGCTGAAGGC CATTGTCACCCGGAATCCCAAAGCGATGATACGTCTATACAGCACTGGTGCATTTTATTTTGCACTGGCTTATCCGGGGT CTAATCTACTTTCAATTGGGCAATTATTTGCTGTCACCCATGTCCATCAAGCATTTCATGGCGGTGAAGAGGCTGCAGTT TCGTCTTCATTGCCTTTGGCAAAACGCAGTGTTCTTGGTGGACTTCTCCCTGAATCTCTGTTGTATGTATTGGATCGTAG TGGTCCAGCAGCATTTGCTGCAGCAATGGTCTCTGATTCTGACACTCCAGAGATAATATGGACTCACAAAATGAGGGCAG AAAATCTAATTCGCCAGGTTTTGCAGCATCTTGGTGATTTTCCTCAAAAACTGTCGCAACACTGCCATGCTTTATATGAC TATGCCCCCATGCCTCCAGTGACATATCCCGAGCTGAGAGATGAAATGTGGTGTCACCGTTATTATCTTAGGAACCTCTG TGATGAGATTCGTTTTCCAAATTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCTTTACTTGTAATGTGGCGTGAGG AGTTGACAAGAAAACCCATGGACCTTTCTGAAGAAGAAGCTTGCAAGATCCTTGAAATATCCTTGGAGGATGTATCTAGT GATGATGTAAATAAAAGAACTTCTTCTGAGACTGCCGATGAAGCATCAAGCTTGTCAAAGCGGATTGAGAACATTGATGA AGAAAAATTAAAGCGACAATATCGGAAACTTGCGATGAAATATCATCCTGACAAAAATCCTGAAGGAAGGGAGAGGTTTC TTGCCATACAGAAGGCCTATGAACGCCTGCAGGCTACTATGCAAGGATTGCAAGGTCCTCAGCCTTGGAGATTGCTGCTT TTGTTGAAGGGACAATGTATTTTATACAGAAGATATGGAGACATATTAGAGCCATTCAAATATGCTGGCTACCCCATGTT GCTGAGTGCTGTTACTGTTGATAAGGATGATAACAACTTTCTTTCTTTAGATAGAGCACCTCTCCTTGTTGCTGCATCAG AGCTTGTCTGGTTAACATGTGCATCTTCTTCATTGAATGGTGAGGAGCTGGTAAGAGATGGAGGAGTACAACTTCTTGCA ACCCTTCTTTCCCGTTGCATGTATGTTGTTCAGCCAACTACTCCTGGGAATGAACCATCTGCCGTTATTGTTACAAACAT CATGCGGACATTTGCAGTTCTAAGTCAATTTGAGGCTGCCAGGGCCGAGATACTTGAGTTTTCTGGATTAATTGAGGACA TTGTGCACTGCACTGAATTTGAGCTTGTACCTGCAGCTGTTGATGCTGCTCTACAAACTATTGCCAATGTTTCTGTTTCC TCTGAGTTGCAGGATGCTTTATTGAAGGCTGGTGTTTTATGGTACCTTTTGCCACTACTGCTTCAGTATGACTCAACTGC AGAAGAATCTGACGCGAAAGAATCACACGGTGTTGGTGCTAGTGTTCAAATTGCAAAAAACATGCATGCCATTAGAGCTT GCCAGGCTCTGTCAAGGCTCTGTGGTTTGTGTGGTGATGGGAGTACAATACCTTATAATCAAGCAGCTGCTAATGCTCTG AGAGTTTTGCTAACTCCTAAGCTTTCTAGCATGTTGAAAGATCAAATGCCCAAAGATTTACTGTCCAAATTAAATGCTAA CCTGGAGTCACCGGAGATTATCTGGAACTCTTCAACACGGGCAGAGCTGCTGAAATTTGTGGACCAGCAACGCGCAGCTC AAGGTCCTGATGGTTCATATGATATAAAAGAATCACATGACTTTGTCTATAAAGCACTATCAAGAGAATTATTCATTGGC AATGTTTACTTGAGGGTCTACAACGATCAGCCAGATTTTGAAATTAGTGAACCCGAAGCTTTTTGTGTTTCTCTAATCGA CTTCATATCTTATCTTTTGCACAATCAATGTGTTGAAGATGTTGATCATAAGGTTGAAGAAACCAGTAATTTCATTCAGA CTTCTGAGCATCTAAGCGAGGCTGTTGATGGACCTGTTAATGAACAGCAGGTCCTGGATAATTCCAGCATAATGTCTGAT GAAAAATCTACAGGGAAGGAAGAACTAGAGATGATTAAATATCTCCGTTCAGCACTGATCTCCCTTCAGAACCTTCTGAC AAATAGTCCAAATTTGGCATCCATATTTTCTAATAAAGACAAGCTACTGCCTCTTTTTGAATGCTTTTCTGTGCCTGAAG CATCAAACAGTAACATTCCTCAACTTTGCCTGGCAGTGCTGTCACTCTTAACTGCGCATGCTCCTTGTTTGCAAGCCATG GTTGCAGATGGATCTAGTCTTCTGCTTTTATTACAAATGCTTCACTCAGTGCCTAGTTGTCGTGAAGGGTCTCTCCATGT TCTCTATGCATTGGCAAGTACACCAGAACTGGCCTGGGCAGCTGCCAAGCACGGTGGTGTTGTTTACATTCTTCAATTGC TCTTGCCTTTGAAGGAAGAAATTCCACTCCAACAAAGAGCTATGGCAGCCTCCTTGCTGGGGAAGCTTGTTAGCCAGCCA ATGCATGGACCAAGGGTTGCTATAACACTTGCAAGGTTCCTTCCAGATGGCCTTGTATCAATAATTAGGGATGGACCTGG TGAAGCTGTTGTAGTCGCCCTTGAGCAGACTACAGAGACACCAGAACTTGTATGGACGCCAGCAATGGCAGCTTCCTTAT CTGCACAAATTTCCACTATGGCATCCGAGCTGTACCGTGAGCAGATGAAAGGTCGTGTTGTTGATTGGGATGTACCTGAG CAGGCATCTGGACAGCAGGAAATGAGAGATGAGCCACAGGTTGGTGGCATCTATGTTCGGCTGTTCCTGAAGGATCCCAA ATTTCCTCTGAGAAACCCCAAAAGATTCTTGGAAGGTCTTCTAGACCAGTATTTGTCATCCATTGCTGCCTCACATTATG AGGCCCAGGCTGTTGACCCTGAGCTTCCTTTGCTTCTGTCAGCTGCGCTTGTTTTATTACTACGCGTGCACCCTGCACTA GCAGATCATGTTGGGTATCTTGGATATGTACCGAAACTAGTTTCTGCTGTTGCATTTGAGGGAAGGCGAGAAACAATGTC ATCAGCTGAGGTAAATGACGGGAAGCATGCAGACAAAACATATGGCCCAGATAATGAATCAGCAGAGAACACACAAACTC CTCAAGAGCGTGTGCGCCTGAGTTGTTTGCGCGTCTTGCATCAACTGGCAGGTAGTACCACGTGTGCTGAAGCCATGGCA GCAACCAGTGTTGGAACACCTCAGGTTGTTCCAGTGCTAATGAAAGCTATAGGGTGGCAAGGCGGAAGCATTTTAGCTCT TGAGACCCTAAAACGACTTGTGGTTGCTGGAAACCGAGCTAGGGATGCTCTTGTTGCTCAAGGACTTAAAGTTGGTCTTG TTGAAGTACTTCTTGGTCTTCTTGATTGGAGAGCCGGGGGCAGGAATGGATTTTGTTCCCAGATGAAGTGGAATGAATCT GAAGCATCAATTGGCAGGGTGCTGGCAATTGAGGTCTTGCATGCCTTTGCCACTGAAGGGGCCCATTGTACTAAAGTGCG GGAACTATTGAATAATTCTGATGTTTGGAGTGCGTACAAAGACCAGAGGCATGATCTGTTCCTTCCTTCAAATGCTCAAT CTGCAGCTGCTGGAATCGCCGGTCTAATTGAGAATTCATCGTCATCGAGACTCACTTACGCCCTCACAGCTCCTCCACCT CAACCGTCTAATTCTAAATCTCCTCCATCCACGTCTGATATAAACGGAAAGCAAGATCAGTTTCTATAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0264300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDGAGNISVAPSLAPPPLEEPEYLARYMVVKHSWRGRYKRILCISSVAVVTLDPSTLAVTNSYDVASDFEGAAPIIGRDD NSNEFNLSVRTDGRGKFKGMKFSSRYRASILTELHRIRWNRLAPVAEFPVLHLRRRASQWLPFKLKVTYVGVELIDTKSG DLRWCLDFRDMDSPAIILLSDAFGKKNVDHGSGFVLCPLYGRKSKAFQAASGCTNSAIISNLTKTAKSTVGVSLSVETSQ TLSISEYIKQRAKEAVGAEDTPLGGWSVTRLRSAAHGTLNVPGLSLGVGPKGGLGDHGDSVSRQLILTKVSLVERRPENY EAVTVRPLSSVSALVRFAEEPQMFAVEFSDGCPIHVYASTSRDSLLAAVRDVLQTEGQCAIPILPRLTMPGHRIDPPCGR VYLQYGQQKPVADVESASVHLKHLAAAAKDAVAEGGSIPGSRAKLWRRIREFNACIPYSGVLPNIEVPEVTLMALITMLP AAPNLPPESPPLPPPSPKAAATIMGFISCLRRLLASRSAASHVMSFPAAVGRIMGLLRNGSEGVASEAAGLVAVLIGGGP GDANVADSKGEWHATIMHTKSVLFANPSYIIILVNRIKPISVSPLLSMAVVEVLEAMICDPHGETTQYTVFVELLRQVAG LKRRLFALFGHPAESVRETVAVIMRSIAEEDAIAAESMRDASLRDGALLRHLLHALFLPAGERREVSRQLVALWADSYQP ALELLSRILPPGLVAYLHTRFDGVLAEDTNQEESSTKKRKRRLLQQRKGRLGKGLTSQDQPFSSAHNFGDSDFGRQTVGP LVGSDNYHKNVLDPSSGQASIVQSSIPHINENLTNGSPTGEAQNGYSTVVASAIVASDNSNETQGSDFSNSVDPDSNVVG LQNADIPAPAQVVVENTPVGSGRLLMNWPEFWRAFDLDHNRADLIWNERTRQELRESLQAEVHKLDVEKERTEDIVPGGV TLEMITGVESVPQISWNYSEFCVRYPSLSKEVCVGQYYLRLLLESGSGGRAQDFPLRDPVAFFRALYHRFLCDADTGLTV DGAVPDELGASDDWCDMGRLDGFGGGGGSSVRELCARAMAIVYEQHYKTIGPFEGTAHTTVLLDRTDDRALRNRLLLLLK ALMKVLSNVEACVLVGGCVLAVDLLTVVHETSERTSIPLQSNLLAATAFMEPLKEWMYIDKDGAQLGPVEKDAIRRLWSK KEIDWTTRCWASGMLDWKKLRDIRELRWALALRVPVLTPPQVGDTALSILHSMVSAHSDLDDAGEIVTPTPRVKRILSSP RCLPHIAQAILSGEPSIVEAAAALLKAIVTRNPKAMIRLYSTGAFYFALAYPGSNLLSIGQLFAVTHVHQAFHGGEEAAV SSSLPLAKRSVLGGLLPESLLYVLDRSGPAAFAAAMVSDSDTPEIIWTHKMRAENLIRQVLQHLGDFPQKLSQHCHALYD YAPMPPVTYPELRDEMWCHRYYLRNLCDEIRFPNWPIVEHVEFLQSLLVMWREELTRKPMDLSEEEACKILEISLEDVSS DDVNKRTSSETADEASSLSKRIENIDEEKLKRQYRKLAMKYHPDKNPEGRERFLAIQKAYERLQATMQGLQGPQPWRLLL LLKGQCILYRRYGDILEPFKYAGYPMLLSAVTVDKDDNNFLSLDRAPLLVAASELVWLTCASSSLNGEELVRDGGVQLLA TLLSRCMYVVQPTTPGNEPSAVIVTNIMRTFAVLSQFEAARAEILEFSGLIEDIVHCTEFELVPAAVDAALQTIANVSVS SELQDALLKAGVLWYLLPLLLQYDSTAEESDAKESHGVGASVQIAKNMHAIRACQALSRLCGLCGDGSTIPYNQAAANAL RVLLTPKLSSMLKDQMPKDLLSKLNANLESPEIIWNSSTRAELLKFVDQQRAAQGPDGSYDIKESHDFVYKALSRELFIG NVYLRVYNDQPDFEISEPEAFCVSLIDFISYLLHNQCVEDVDHKVEETSNFIQTSEHLSEAVDGPVNEQQVLDNSSIMSD EKSTGKEELEMIKYLRSALISLQNLLTNSPNLASIFSNKDKLLPLFECFSVPEASNSNIPQLCLAVLSLLTAHAPCLQAM VADGSSLLLLLQMLHSVPSCREGSLHVLYALASTPELAWAAAKHGGVVYILQLLLPLKEEIPLQQRAMAASLLGKLVSQP MHGPRVAITLARFLPDGLVSIIRDGPGEAVVVALEQTTETPELVWTPAMAASLSAQISTMASELYREQMKGRVVDWDVPE QASGQQEMRDEPQVGGIYVRLFLKDPKFPLRNPKRFLEGLLDQYLSSIAASHYEAQAVDPELPLLLSAALVLLLRVHPAL ADHVGYLGYVPKLVSAVAFEGRRETMSSAEVNDGKHADKTYGPDNESAENTQTPQERVRLSCLRVLHQLAGSTTCAEAMA ATSVGTPQVVPVLMKAIGWQGGSILALETLKRLVVAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGLLDWRAGGRNGFCSQMKWNES EASIGRVLAIEVLHAFATEGAHCTKVRELLNNSDVWSAYKDQRHDLFLPSNAQSAAAGIAGLIENSSSSRLTYALTAPPP QPSNSKSPPSTSDINGKQDQFL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 15 2564 2550 0.0
MobiDBLite 748 800 53 -
MobiDBLite 771 791 21 -
Coils 935 955 21 -
Pfam 1176 1226 51 3.8E-14
SMART 1530 1588 59 6.0E-11
ProSiteProfiles 1531 1613 83 12.811
Gene3D 1532 1586 55 3.2E-13
CDD 1543 1583 41 5.63402E-13
Pfam 1544 1584 41 3.5E-11
SUPERFAMILY 1545 1584 40 1.7E-12
Gene3D 1622 1874 253 7.9E-8
SUPERFAMILY 1644 2161 518 2.54E-21
Gene3D 1998 2200 203 2.9E-7
MobiDBLite 2347 2374 28 -
MobiDBLite 2347 2363 17 -
MobiDBLite 2553 2582 30 -
MobiDBLite 2567 2582 16 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0264300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…