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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0264300 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0264300.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DnaJ-like protein; TAIR: AT2G26890.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4IVL6|GRV2_ARATH DnaJ homolog subfamily C GRV2; TrEMBL-Plants: tr|I1K1B1|I1K1B1_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0264300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:62838966..62855974) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAAACCAATCGTTGAACCATAGCTAGGGTTCGATTCGATCGAACACCAAAAACCGCATTTCAGTCACAGAACTGGGGG CGAATCAGTCTCGAAGCCCCGCGGCTTCATCGTCGCAGGGACTCTGGTTCTTCCTCCGCTTCCACAATGCGCCACGTGTC CACACCCTCGCTCATCTCCCCACTTTCGAGTCCGTGAGCCGCTACGCCTCCGATCTCAACCGCCCCGTCCCGCTCCCCCC GCCGGTCGTCATGGACGGCGCCGGCAACATCTCCGTCGCTCCCAGTCTAGCACCTCCGCCGCTCGAGGAGCCTGAGTATC TGGCTCGGTACATGGTTGTCAAGCACTCGTGGCGCGGACGATACAAGCGGATTCTCTGCATCTCCAGCGTCGCTGTTGTT ACTCTTGACCCTTCCACGCTTGCTGTTACAAACTCCTACGATGTTGCCAGTGATTTCGAGGGCGCCGCGCCTATCATTGG ACGCGATGACAACTCCAATGAGTTCAACCTTAGCGTGCGGACCGATGGCCGCGGGAAGTTTAAGGGTATGAAATTCTCGT CGAGGTATAGGGCGAGTATTTTGACGGAGCTGCATCGGATACGGTGGAACCGGTTGGCGCCGGTGGCTGAGTTCCCGGTG CTTCATCTCCGGCGACGGGCTTCTCAGTGGCTTCCTTTTGTAAGTTACCTTGTTATGTTTAGTTCCTTTTTTTGCTGGGG TTCTTCTATTTTTGATAATTCAATGTTGATAGATAGTAAAAAAAAACAAAAGATTCTGTGAGGTTTATCTGACTTGTAAG TGAAGAATGGACACGCGTGCGTGTTGATTATGGGTTTCGTTTTTAGATTGCGATGGTTAAGAGGGTATGTTACTGTTTTG TAGTGTGTTCTTTCTTAATTTGAGGATGTGCATTGAGAGAAGATAGTGATCCTAACTCCTAAGGTTTTAAGTCGAAGGGA 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0264300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACGGCGCCGGCAACATCTCCGTCGCTCCCAGTCTAGCACCTCCGCCGCTCGAGGAGCCTGAGTATCTGGCTCGGTA CATGGTTGTCAAGCACTCGTGGCGCGGACGATACAAGCGGATTCTCTGCATCTCCAGCGTCGCTGTTGTTACTCTTGACC CTTCCACGCTTGCTGTTACAAACTCCTACGATGTTGCCAGTGATTTCGAGGGCGCCGCGCCTATCATTGGACGCGATGAC AACTCCAATGAGTTCAACCTTAGCGTGCGGACCGATGGCCGCGGGAAGTTTAAGGGTATGAAATTCTCGTCGAGGTATAG GGCGAGTATTTTGACGGAGCTGCATCGGATACGGTGGAACCGGTTGGCGCCGGTGGCTGAGTTCCCGGTGCTTCATCTCC GGCGACGGGCTTCTCAGTGGCTTCCTTTTAAATTGAAAGTAACTTATGTCGGTGTAGAACTTATTGACACAAAATCTGGT GACCTTCGTTGGTGCTTGGATTTTAGAGACATGGATTCCCCTGCAATTATTCTTCTCTCTGATGCTTTTGGAAAGAAAAA TGTTGACCATGGTAGCGGATTTGTTCTTTGCCCCTTGTATGGAAGGAAATCTAAAGCTTTCCAAGCTGCTTCTGGGTGCA CGAACTCGGCTATTATCTCGAATTTGACAAAAACTGCTAAATCCACTGTTGGCGTGTCCTTGTCTGTGGAAACTTCTCAG ACTCTATCCATTTCTGAGTATATAAAACAAAGGGCAAAAGAGGCAGTTGGTGCCGAAGATACCCCGTTGGGGGGTTGGTC TGTTACACGATTGCGTTCTGCTGCCCATGGAACTCTAAATGTTCCGGGATTAAGCTTAGGAGTTGGCCCAAAAGGAGGAC TAGGTGATCATGGCGATTCTGTATCTCGACAGCTCATTCTAACTAAGGTTTCACTAGTGGAAAGGCGTCCTGAGAACTAT GAAGCTGTTACTGTTCGTCCTTTATCTTCTGTGAGTGCTCTTGTCCGGTTTGCCGAAGAGCCCCAGATGTTTGCAGTTGA ATTTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGTTCGTGATGTTTTGC AAACTGAAGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATCCTCCCTGTGGGAGA GTTTATTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAACATTTAGCAGCTGC TGCCAAAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAATAAGGGAGTTCAATG CCTGTATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGATCACTATGCTTCCT GCAGCACCAAATCTTCCTCCAGAGTCTCCTCCATTACCACCCCCTTCCCCAAAAGCTGCAGCAACTATTATGGGTTTTAT TTCATGTTTACGTAGACTACTTGCTTCAAGAAGTGCTGCTTCCCACGTGATGTCATTTCCTGCAGCAGTGGGAAGGATAA TGGGTTTACTCAGAAATGGTTCAGAAGGTGTAGCCTCTGAGGCTGCAGGGCTTGTTGCTGTACTCATTGGTGGTGGGCCT GGTGATGCAAATGTAGCAGATTCCAAAGGAGAGTGGCATGCTACCATTATGCATACAAAGTCAGTATTGTTTGCTAATCC TAGTTATATAATTATTCTTGTCAACAGAATAAAGCCCATATCCGTATCACCTTTACTTTCAATGGCTGTTGTTGAAGTGC TTGAGGCTATGATTTGTGATCCACATGGGGAGACTACCCAGTATACTGTTTTTGTTGAGTTGTTACGCCAAGTTGCTGGG TTGAAGCGTCGCTTGTTTGCACTGTTTGGCCACCCTGCTGAAAGTGTTAGAGAAACAGTAGCCGTAATAATGCGATCAAT TGCAGAAGAAGATGCTATTGCTGCAGAGTCCATGCGGGATGCTTCTCTGCGCGATGGTGCTTTATTGAGACACTTACTGC ACGCACTTTTTCTTCCTGCTGGTGAGCGGCGTGAAGTTAGTCGACAGCTTGTTGCTCTTTGGGCAGACTCCTATCAACCA GCTTTGGAGTTATTGTCTCGAATTCTGCCTCCTGGCCTTGTTGCTTATTTGCATACACGTTTTGATGGAGTTCTTGCTGA AGATACAAATCAAGAAGAGTCATCAACCAAGAAAAGAAAAAGGCGTTTACTTCAGCAAAGGAAAGGTCGCTTAGGGAAAG GATTAACCTCTCAAGATCAACCTTTCTCTTCAGCGCATAACTTTGGTGATTCTGATTTTGGTAGGCAGACGGTAGGTCCT CTTGTGGGCTCAGATAACTATCATAAAAATGTTTTGGACCCCAGTTCTGGACAGGCTTCAATTGTTCAATCTTCAATACC TCATATCAATGAAAATTTGACCAATGGATCTCCTACTGGAGAAGCACAAAATGGGTATTCGACTGTTGTGGCTTCAGCTA TTGTGGCATCAGATAACTCAAACGAAACTCAGGGATCTGATTTTTCAAATTCGGTTGATCCTGACAGCAATGTAGTTGGT TTGCAGAATGCAGACATTCCAGCTCCTGCTCAAGTTGTTGTGGAGAACACCCCTGTAGGATCTGGTCGGCTTCTAATGAA TTGGCCTGAATTTTGGAGAGCTTTTGATCTTGATCACAATCGTGCAGACTTGATTTGGAATGAGCGTACCAGGCAAGAGT TGAGAGAATCTTTGCAAGCTGAAGTTCATAAACTAGATGTCGAGAAAGAGCGTACTGAAGATATTGTTCCAGGTGGTGTA ACCTTGGAAATGATAACAGGGGTTGAGAGTGTACCACAAATATCTTGGAACTACTCTGAATTTTGTGTTCGTTACCCGAG CTTGTCAAAAGAAGTTTGTGTGGGTCAGTATTATCTTCGTCTACTGCTTGAGAGTGGCAGTGGTGGCAGGGCTCAAGACT TCCCATTGCGTGATCCAGTTGCTTTCTTTAGAGCACTGTACCATCGTTTTTTGTGTGATGCAGACACAGGGCTTACTGTA GATGGTGCTGTTCCTGATGAGTTAGGTGCATCTGATGATTGGTGTGACATGGGTAGATTAGATGGTTTTGGCGGAGGTGG TGGGTCATCAGTGAGGGAGCTTTGTGCAAGGGCAATGGCAATTGTATATGAGCAGCATTACAAGACCATAGGCCCCTTTG AAGGTACAGCTCACACTACTGTTCTTTTGGATAGGACAGATGACAGAGCTTTGAGGAATCGACTTCTTTTGCTTCTAAAG GCATTAATGAAGGTTTTATCAAATGTAGAGGCTTGTGTTCTAGTTGGAGGTTGTGTATTAGCCGTAGATCTGCTTACAGT GGTCCATGAAACTTCAGAGAGGACATCTATTCCCTTGCAATCAAATTTATTAGCAGCTACTGCTTTTATGGAACCACTTA AGGAGTGGATGTATATTGACAAAGATGGTGCTCAACTTGGGCCAGTGGAAAAAGATGCTATTAGAAGGTTATGGTCCAAA AAGGAAATTGATTGGACAACAAGGTGTTGGGCTTCTGGGATGCTAGATTGGAAGAAGTTGCGTGATATTCGTGAGCTTCG TTGGGCTCTTGCTCTTAGAGTTCCGGTCCTTACCCCACCCCAGGTTGGGGACACTGCTCTGTCCATATTGCATAGCATGG TGTCTGCACATTCAGATTTAGATGATGCTGGAGAGATTGTTACTCCAACTCCTAGAGTAAAACGAATCTTATCAAGTCCA CGCTGCCTTCCACATATTGCACAGGCCATTCTTTCTGGGGAACCAAGTATTGTTGAGGCAGCTGCTGCTTTGCTGAAGGC CATTGTCACCCGGAATCCCAAAGCGATGATACGTCTATACAGCACTGGTGCATTTTATTTTGCACTGGCTTATCCGGGGT CTAATCTACTTTCAATTGGGCAATTATTTGCTGTCACCCATGTCCATCAAGCATTTCATGGCGGTGAAGAGGCTGCAGTT TCGTCTTCATTGCCTTTGGCAAAACGCAGTGTTCTTGGTGGACTTCTCCCTGAATCTCTGTTGTATGTATTGGATCGTAG TGGTCCAGCAGCATTTGCTGCAGCAATGGTCTCTGATTCTGACACTCCAGAGATAATATGGACTCACAAAATGAGGGCAG AAAATCTAATTCGCCAGGTTTTGCAGCATCTTGGTGATTTTCCTCAAAAACTGTCGCAACACTGCCATGCTTTATATGAC TATGCCCCCATGCCTCCAGTGACATATCCCGAGCTGAGAGATGAAATGTGGTGTCACCGTTATTATCTTAGGAACCTCTG TGATGAGATTCGTTTTCCAAATTGGCCAATTGTTGAACATATCCTTGAAATATCCTTGGAGGATGTATCTAGTGATGATG TAAATAAAAGAACTTCTTCTGAGACTGCCGATGAAGCATCAAGCTTGTCAAAGCGGATTGAGAACATTGATGAAGAAAAA TTAAAGCGACAATATCGGAAACTTGCGATGAAATATCATCCTGACAAAAATCCTGAAGGAAGGGAGAGGTTTCTTGCCAT ACAGAAGGCCTATGAACGCCTGCAGGCTACTATGCAAGGATTGCAAGGTCCTCAGCCTTGGAGATTGCTGCTTTTGTTGA AGGGACAATGTATTTTATACAGAAGATATGGAGACATATTAGAGCCATTCAAATATGCTGGCTACCCCATGTTGCTGAGT GCTGTTACTGTTGATAAGGATGATAACAACTTTCTTTCTTTAGATAGAGCACCTCTCCTTGTTGCTGCATCAGAGCTTGT CTGGTTAACATGTGCATCTTCTTCATTGAATGGTGAGGAGCTGGTAAGAGATGGAGGAGTACAACTTCTTGCAACCCTTC TTTCCCGTTGCATGTATGTTGTTCAGCCAACTACTCCTGGGAATGAACCATCTGCCGTTATTGTTACAAACATCATGCGG ACATTTGCAGTTCTAAGTCAATTTGAGGCTGCCAGGGCCGAGATACTTGAGTTTTCTGGATTAATTGAGGACATTGTGCA CTGCACTGAATTTGAGCTTGTACCTGCAGCTGTTGATGCTGCTCTACAAACTATTGCCAATGTTTCTGTTTCCTCTGAGT TGCAGGATGCTTTATTGAAGGCTGGTGTTTTATGGTACCTTTTGCCACTACTGCTTCAGTATGACTCAACTGCAGAAGAA TCTGACGCGAAAGAATCACACGGTGTTGGTGCTAGTGTTCAAATTGCAAAAAACATGCATGCCATTAGAGCTTGCCAGGC TCTGTCAAGGCTCTGTGGTTTGTGTGGTGATGGGAGTACAATACCTTATAATCAAGCAGCTGCTAATGCTCTGAGAGTTT TGCTAACTCCTAAGCTTTCTAGCATGTTGAAAGATCAAATGCCCAAAGATTTACTGTCCAAATTAAATGCTAACCTGGAG TCACCGGAGATTATCTGGAACTCTTCAACACGGGCAGAGCTGCTGAAATTTGTGGACCAGCAACGCGCAGCTCAAGGTCC TGATGGTTCATATGATATAAAAGAATCACATGACTTTGTCTATAAAGCACTATCAAGAGAATTATTCATTGGCAATGTTT ACTTGAGGGTCTACAACGATCAGCCAGATTTTGAAATTAGTGAACCCGAAGCTTTTTGTGTTTCTCTAATCGACTTCATA TCTTATCTTTTGCACAATCAATGTGTTGAAGATGTTGATCATAAGGTTGAAGAAACCAGTAATTTCATTCAGACTTCTGA GCATCTAAGCGAGGCTGTTGATGGACCTGTTAATGAACAGCAGGTCCTGGATAATTCCAGCATAATGTCTGATGAAAAAT CTACAGGGAAGGAAGAACTAGAGATGATTAAATATCTCCGTTCAGCACTGATCTCCCTTCAGAACCTTCTGACAAATAGT CCAAATTTGGCATCCATATTTTCTAATAAAGACAAGCTACTGCCTCTTTTTGAATGCTTTTCTGTGCCTGAAGCATCAAA CAGTAACATTCCTCAACTTTGCCTGGCAGTGCTGTCACTCTTAACTGCGCATGCTCCTTGTTTGCAAGCCATGGTTGCAG ATGGATCTAGTCTTCTGCTTTTATTACAAATGCTTCACTCAGTGCCTAGTTGTCGTGAAGGGTCTCTCCATGTTCTCTAT GCATTGGCAAGTACACCAGAACTGGCCTGGGCAGCTGCCAAGCACGGTGGTGTTGTTTACATTCTTCAATTGCTCTTGCC TTTGAAGGAAGAAATTCCACTCCAACAAAGAGCTATGGCAGCCTCCTTGCTGGGGAAGCTTGTTAGCCAGCCAATGCATG GACCAAGGGTTGCTATAACACTTGCAAGGTTCCTTCCAGATGGCCTTGTATCAATAATTAGGGATGGACCTGGTGAAGCT GTTGTAGTCGCCCTTGAGCAGACTACAGAGACACCAGAACTTGTATGGACGCCAGCAATGGCAGCTTCCTTATCTGCACA AATTTCCACTATGGCATCCGAGCTGTACCGTGAGCAGATGAAAGGTCGTGTTGTTGATTGGGATGTACCTGAGCAGGCAT CTGGACAGCAGGAAATGAGAGATGAGCCACAGGTTGGTGGCATCTATGTTCGGCTGTTCCTGAAGGATCCCAAATTTCCT CTGAGAAACCCCAAAAGATTCTTGGAAGGTCTTCTAGACCAGTATTTGTCATCCATTGCTGCCTCACATTATGAGGCCCA GGCTGTTGACCCTGAGCTTCCTTTGCTTCTGTCAGCTGCGCTTGTTTTATTACTACGCGTGCACCCTGCACTAGCAGATC ATGTTGGGTATCTTGGATATGTACCGAAACTAGTTTCTGCTGTTGCATTTGAGGGAAGGCGAGAAACAATGTCATCAGCT GAGGTAAATGACGGGAAGCATGCAGACAAAACATATGGCCCAGATAATGAATCAGCAGAGAACACACAAACTCCTCAAGA GCGTGTGCGCCTGAGTTGTTTGCGCGTCTTGCATCAACTGGCAGGTAGTACCACGTGTGCTGAAGCCATGGCAGCAACCA GTGTTGGAACACCTCAGGTTGTTCCAGTGCTAATGAAAGCTATAGGGTGGCAAGGCGGAAGCATTTTAGCTCTTGAGACC CTAAAACGACTTGTGGTTGCTGGAAACCGAGCTAGGGATGCTCTTGTTGCTCAAGGACTTAAAGTTGGTCTTGTTGAAGT ACTTCTTGGTCTTCTTGATTGGAGAGCCGGGGGCAGGAATGGATTTTGTTCCCAGATGAAGTGGAATGAATCTGAAGCAT CAATTGGCAGGGTGCTGGCAATTGAGGTCTTGCATGCCTTTGCCACTGAAGGGGCCCATTGTACTAAAGTGCGGGAACTA TTGAATAATTCTGATGTTTGGAGTGCGTACAAAGACCAGAGGCATGATCTGTTCCTTCCTTCAAATGCTCAATCTGCAGC TGCTGGAATCGCCGGTCTAATTGAGAATTCATCGTCATCGAGACTCACTTACGCCCTCACAGCTCCTCCACCTCAACCGT CTAATTCTAAATCTCCTCCATCCACGTCTGATATAAACGGAAAGCAAGATCAGTTTCTATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0264300.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDGAGNISVAPSLAPPPLEEPEYLARYMVVKHSWRGRYKRILCISSVAVVTLDPSTLAVTNSYDVASDFEGAAPIIGRDD NSNEFNLSVRTDGRGKFKGMKFSSRYRASILTELHRIRWNRLAPVAEFPVLHLRRRASQWLPFKLKVTYVGVELIDTKSG DLRWCLDFRDMDSPAIILLSDAFGKKNVDHGSGFVLCPLYGRKSKAFQAASGCTNSAIISNLTKTAKSTVGVSLSVETSQ TLSISEYIKQRAKEAVGAEDTPLGGWSVTRLRSAAHGTLNVPGLSLGVGPKGGLGDHGDSVSRQLILTKVSLVERRPENY EAVTVRPLSSVSALVRFAEEPQMFAVEFSDGCPIHVYASTSRDSLLAAVRDVLQTEGQCAIPILPRLTMPGHRIDPPCGR VYLQYGQQKPVADVESASVHLKHLAAAAKDAVAEGGSIPGSRAKLWRRIREFNACIPYSGVLPNIEVPEVTLMALITMLP AAPNLPPESPPLPPPSPKAAATIMGFISCLRRLLASRSAASHVMSFPAAVGRIMGLLRNGSEGVASEAAGLVAVLIGGGP GDANVADSKGEWHATIMHTKSVLFANPSYIIILVNRIKPISVSPLLSMAVVEVLEAMICDPHGETTQYTVFVELLRQVAG LKRRLFALFGHPAESVRETVAVIMRSIAEEDAIAAESMRDASLRDGALLRHLLHALFLPAGERREVSRQLVALWADSYQP ALELLSRILPPGLVAYLHTRFDGVLAEDTNQEESSTKKRKRRLLQQRKGRLGKGLTSQDQPFSSAHNFGDSDFGRQTVGP LVGSDNYHKNVLDPSSGQASIVQSSIPHINENLTNGSPTGEAQNGYSTVVASAIVASDNSNETQGSDFSNSVDPDSNVVG LQNADIPAPAQVVVENTPVGSGRLLMNWPEFWRAFDLDHNRADLIWNERTRQELRESLQAEVHKLDVEKERTEDIVPGGV TLEMITGVESVPQISWNYSEFCVRYPSLSKEVCVGQYYLRLLLESGSGGRAQDFPLRDPVAFFRALYHRFLCDADTGLTV DGAVPDELGASDDWCDMGRLDGFGGGGGSSVRELCARAMAIVYEQHYKTIGPFEGTAHTTVLLDRTDDRALRNRLLLLLK ALMKVLSNVEACVLVGGCVLAVDLLTVVHETSERTSIPLQSNLLAATAFMEPLKEWMYIDKDGAQLGPVEKDAIRRLWSK KEIDWTTRCWASGMLDWKKLRDIRELRWALALRVPVLTPPQVGDTALSILHSMVSAHSDLDDAGEIVTPTPRVKRILSSP RCLPHIAQAILSGEPSIVEAAAALLKAIVTRNPKAMIRLYSTGAFYFALAYPGSNLLSIGQLFAVTHVHQAFHGGEEAAV SSSLPLAKRSVLGGLLPESLLYVLDRSGPAAFAAAMVSDSDTPEIIWTHKMRAENLIRQVLQHLGDFPQKLSQHCHALYD YAPMPPVTYPELRDEMWCHRYYLRNLCDEIRFPNWPIVEHILEISLEDVSSDDVNKRTSSETADEASSLSKRIENIDEEK LKRQYRKLAMKYHPDKNPEGRERFLAIQKAYERLQATMQGLQGPQPWRLLLLLKGQCILYRRYGDILEPFKYAGYPMLLS AVTVDKDDNNFLSLDRAPLLVAASELVWLTCASSSLNGEELVRDGGVQLLATLLSRCMYVVQPTTPGNEPSAVIVTNIMR TFAVLSQFEAARAEILEFSGLIEDIVHCTEFELVPAAVDAALQTIANVSVSSELQDALLKAGVLWYLLPLLLQYDSTAEE SDAKESHGVGASVQIAKNMHAIRACQALSRLCGLCGDGSTIPYNQAAANALRVLLTPKLSSMLKDQMPKDLLSKLNANLE SPEIIWNSSTRAELLKFVDQQRAAQGPDGSYDIKESHDFVYKALSRELFIGNVYLRVYNDQPDFEISEPEAFCVSLIDFI SYLLHNQCVEDVDHKVEETSNFIQTSEHLSEAVDGPVNEQQVLDNSSIMSDEKSTGKEELEMIKYLRSALISLQNLLTNS PNLASIFSNKDKLLPLFECFSVPEASNSNIPQLCLAVLSLLTAHAPCLQAMVADGSSLLLLLQMLHSVPSCREGSLHVLY ALASTPELAWAAAKHGGVVYILQLLLPLKEEIPLQQRAMAASLLGKLVSQPMHGPRVAITLARFLPDGLVSIIRDGPGEA VVVALEQTTETPELVWTPAMAASLSAQISTMASELYREQMKGRVVDWDVPEQASGQQEMRDEPQVGGIYVRLFLKDPKFP LRNPKRFLEGLLDQYLSSIAASHYEAQAVDPELPLLLSAALVLLLRVHPALADHVGYLGYVPKLVSAVAFEGRRETMSSA EVNDGKHADKTYGPDNESAENTQTPQERVRLSCLRVLHQLAGSTTCAEAMAATSVGTPQVVPVLMKAIGWQGGSILALET LKRLVVAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGLLDWRAGGRNGFCSQMKWNESEASIGRVLAIEVLHAFATEGAHCTKVREL LNNSDVWSAYKDQRHDLFLPSNAQSAAAGIAGLIENSSSSRLTYALTAPPPQPSNSKSPPSTSDINGKQDQFL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 15 | 2535 | 2521 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 748 | 800 | 53 | - | – | |
| MobiDBLite | 771 | 791 | 21 | - | – | |
| Coils | 935 | 955 | 21 | - | – | |
| Pfam | 1176 | 1226 | 51 | 3.8E-14 | ||
| SMART | 1501 | 1559 | 59 | 6.0E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 1502 | 1584 | 83 | 12.811 | ||
| Gene3D | 1503 | 1557 | 55 | 3.2E-13 | ||
| CDD | 1514 | 1554 | 41 | 5.57057E-13 | ||
| Pfam | 1515 | 1555 | 41 | 3.5E-11 | ||
| SUPERFAMILY | 1516 | 1555 | 40 | 1.7E-12 | ||
| Gene3D | 1593 | 1845 | 253 | 7.8E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 1615 | 2105 | 491 | 1.43E-22 | ||
| Gene3D | 1969 | 2171 | 203 | 2.9E-7 | ||
| MobiDBLite | 2318 | 2334 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 2318 | 2345 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 2524 | 2553 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 2538 | 2553 | 16 | - | – | |
| Coils | 2553 | 2553 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0264300.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…