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LotjaGi4g1v0264300.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0264300
Transcript ID LotjaGi4g1v0264300.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description DnaJ-like protein; TAIR: AT2G26890.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4IVL6|GRV2_ARATH DnaJ homolog subfamily C GRV2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2Q0L8|A0A0B2Q0L8_GLYSO DnaJ like subfamily C member 13; Found in the gene: LotjaGi4g1v0264300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:62841772..62855974) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTAATACATTTATATTATGTAAGCTGATTTTAGTTAGAAGGGTTATGTCAAATTTTGAGAATTTTTACTAGATGTTTGCA GGCTGTTACTGTTCGTCCTTTATCTTCTGTGAGTGCTCTTGTCCGGTTTGCCGAAGAGCCCCAGATGTTTGCAGTTGAAT TTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTAAGCCTTCTTTATGATACTCTAGTTGTGATTTATTATTCTATAAACTTTCTCATC CACATGTCATTAATTGTAGGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGTTCGTGATGTTTTGCAAACTG AAGTAGGTAGATGTATCTCATCTTGGTTAAGAATTGTTCTATGATTGTATTTGTACATTGAAACATGATGATATATTGTG TGTAATCTCACGAATTCAAGTGCACCCAAATGTATGTCACTAAATGGTCTGGCTCAAACATAAGATTAAGTTTTTTAAAC TAAAACCGAACACGCTCTCAGTCTTGTTAATCGATGTTGAACTGAACCTGTTCTTGAACTGAAGGCAGTTATGTCTAATG GTATTGTTATAGAAAAAAAGCATTTCTTATTGGAAAATGCAGTGTAAAGTGCATGTTTGACATATGGTGATGTTTTTTTA TAGGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATCCTCCCTGTGGGAGAGTTTA TTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAACATTTAGCAGCTGCTGCCA AAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAATAAGGGAGTTCAATGCCTGT ATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGATCACTATGCTTCCTGCAGC 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0264300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTTGCAGTTGAATTTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGT TCGTGATGTTTTGCAAACTGAAGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATC CTCCCTGTGGGAGAGTTTATTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAA CATTTAGCAGCTGCTGCCAAAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAAT AAGGGAGTTCAATGCCTGTATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGA TCACTATGCTTCCTGCAGCACCAAATCTTCCTCCAGAGTCTCCTCCATTACCACCCCCTTCCCCAAAAGCTGCAGCAACT ATTATGGGTTTTATTTCATGTTTACGTAGACTACTTGCTTCAAGAAGTGCTGCTTCCCACGTGATGTCATTTCCTGCAGC AGTGGGAAGGATAATGGGTTTACTCAGAAATGGTTCAGAAGGTGTAGCCTCTGAGGCTGCAGGGCTTGTTGCTGTACTCA TTGGTGGTGGGCCTGGTGATGCAAATGTAGCAGATTCCAAAGGAGAGTGGCATGCTACCATTATGCATACAAAGTCAGTA TTGTTTGCTAATCCTAGTTATATAATTATTCTTGTCAACAGAATAAAGCCCATATCCGTATCACCTTTACTTTCAATGGC TGTTGTTGAAGTGCTTGAGGCTATGATTTGTGATCCACATGGGGAGACTACCCAGTATACTGTTTTTGTTGAGTTGTTAC GCCAAGTTGCTGGGTTGAAGCGTCGCTTGTTTGCACTGTTTGGCCACCCTGCTGAAAGTGTTAGAGAAACAGTAGCCGTA 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GTTCGTTACCCGAGCTTGTCAAAAGAAGTTTGTGTGGGTCAGTATTATCTTCGTCTACTGCTTGAGAGTGGCAGTGGTGG CAGGGCTCAAGACTTCCCATTGCGTGATCCAGTTGCTTTCTTTAGAGCACTGTACCATCGTTTTTTGTGTGATGCAGACA CAGGGCTTACTGTAGATGGTGCTGTTCCTGATGAGTTAGGTGCATCTGATGATTGGTGTGACATGGGTAGATTAGATGGT TTTGGCGGAGGTGGTGGGTCATCAGTGAGGGAGCTTTGTGCAAGGGCAATGGCAATTGTATATGAGCAGCATTACAAGAC CATAGGCCCCTTTGAAGGTACAGCTCACACTACTGTTCTTTTGGATAGGACAGATGACAGAGCTTTGAGGAATCGACTTC TTTTGCTTCTAAAGGCATTAATGAAGGTTTTATCAAATGTAGAGGCTTGTGTTCTAGTTGGAGGTTGTGTATTAGCCGTA GATCTGCTTACAGTGGTCCATGAAACTTCAGAGAGGACATCTATTCCCTTGCAATCAAATTTATTAGCAGCTACTGCTTT TATGGAACCACTTAAGGAGTGGATGTATATTGACAAAGATGGTGCTCAACTTGGGCCAGTGGAAAAAGATGCTATTAGAA GGTTATGGTCCAAAAAGGAAATTGATTGGACAACAAGGTGTTGGGCTTCTGGGATGCTAGATTGGAAGAAGTTGCGTGAT ATTCGTGAGCTTCGTTGGGCTCTTGCTCTTAGAGTTCCGGTCCTTACCCCACCCCAGGTTGGGGACACTGCTCTGTCCAT ATTGCATAGCATGGTGTCTGCACATTCAGATTTAGATGATGCTGGAGAGATTGTTACTCCAACTCCTAGAGTAAAACGAA TCTTATCAAGTCCACGCTGCCTTCCACATATTGCACAGGCCATTCTTTCTGGGGAACCAAGTATTGTTGAGGCAGCTGCT GCTTTGCTGAAGGCCATTGTCACCCGGAATCCCAAAGCGATGATACGTCTATACAGCACTGGTGCATTTTATTTTGCACT GGCTTATCCGGGGTCTAATCTACTTTCAATTGGGCAATTATTTGCTGTCACCCATGTCCATCAAGCATTTCATGGCGGTG AAGAGGCTGCAGTTTCGTCTTCATTGCCTTTGGCAAAACGCAGTGTTCTTGGTGGACTTCTCCCTGAATCTCTGTTGTAT GTATTGGATCGTAGTGGTCCAGCAGCATTTGCTGCAGCAATGGTCTCTGATTCTGACACTCCAGAGATAATATGGACTCA CAAAATGAGGGCAGAAAATCTAATTCGCCAGGTTTTGCAGCATCTTGGTGATTTTCCTCAAAAACTGTCGCAACACTGCC ATGCTTTATATGACTATGCCCCCATGCCTCCAGTGACATATCCCGAGCTGAGAGATGAAATGTGGTGTCACCGTTATTAT CTTAGGAACCTCTGTGATGAGATTCGTTTTCCAAATTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCTTTACTTGT AATGTGGCGTGAGGAGTTGACAAGAAAACCCATGGACCTTTCTGAAGAAGAAGCTTGCAAGATCCTTGAAATATCCTTGG AGGATGTATCTAGTGATGATGTAAATAAAAGAACTTCTTCTGAGACTGCCGATGAAGCATCAAGCTTGTCAAAGCGGATT GAGAACATTGATGAAGAAAAATTAAAGCGACAATATCGGAAACTTGCGATGAAATATCATCCTGACAAAAATCCTGAAGG AAGGGAGAGGTTTCTTGCCATACAGAAGGCCTATGAACGCCTGCAGGCTACTATGCAAGGATTGCAAGGTCCTCAGCCTT GGAGATTGCTGCTTTTGTTGAAGGGACAATGTATTTTATACAGAAGATATGGAGACATATTAGAGCCATTCAAATATGCT GGCTACCCCATGTTGCTGAGTGCTGTTACTGTTGATAAGGATGATAACAACTTTCTTTCTTTAGATAGAGCACCTCTCCT TGTTGCTGCATCAGAGCTTGTCTGGTTAACATGTGCATCTTCTTCATTGAATGGTGAGGAGCTGGTAAGAGATGGAGGAG TACAACTTCTTGCAACCCTTCTTTCCCGTTGCATGTATGTTGTTCAGCCAACTACTCCTGGGAATGAACCATCTGCCGTT ATTGTTACAAACATCATGCGGACATTTGCAGTTCTAAGTCAATTTGAGGCTGCCAGGGCCGAGATACTTGAGTTTTCTGG ATTAATTGAGGACATTGTGCACTGCACTGAATTTGAGCTTGTACCTGCAGCTGTTGATGCTGCTCTACAAACTATTGCCA ATGTTTCTGTTTCCTCTGAGTTGCAGGATGCTTTATTGAAGGCTGGTGTTTTATGGTACCTTTTGCCACTACTGCTTCAG TATGACTCAACTGCAGAAGAATCTGACGCGAAAGAATCACACGGTGTTGGTGCTAGTGTTCAAATTGCAAAAAACATGCA TGCCATTAGAGCTTGCCAGGCTCTGTCAAGGCTCTGTGGTTTGTGTGGTGATGGGAGTACAATACCTTATAATCAAGCAG CTGCTAATGCTCTGAGAGTTTTGCTAACTCCTAAGCTTTCTAGCATGTTGAAAGATCAAATGCCCAAAGATTTACTGTCC AAATTAAATGCTAACCTGGAGTCACCGGAGATTATCTGGAACTCTTCAACACGGGCAGAGCTGCTGAAATTTGTGGACCA GCAACGCGCAGCTCAAGGTCCTGATGGTTCATATGATATAAAAGAATCACATGACTTTGTCTATAAAGCACTATCAAGAG AATTATTCATTGGCAATGTTTACTTGAGGGTCTACAACGATCAGCCAGATTTTGAAATTAGTGAACCCGAAGCTTTTTGT GTTTCTCTAATCGACTTCATATCTTATCTTTTGCACAATCAATGTGTTGAAGATGTTGATCATAAGGTTGAAGAAACCAG TAATTTCATTCAGACTTCTGAGCATCTAAGCGAGGCTGTTGATGGACCTGTTAATGAACAGCAGGTCCTGGATAATTCCA GCATAATGTCTGATGAAAAATCTACAGGGAAGGAAGAACTAGAGATGATTAAATATCTCCGTTCAGCACTGATCTCCCTT CAGAACCTTCTGACAAATAGTCCAAATTTGGCATCCATATTTTCTAATAAAGACAAGCTACTGCCTCTTTTTGAATGCTT TTCTGTGCCTGAAGCATCAAACAGTAACATTCCTCAACTTTGCCTGGCAGTGCTGTCACTCTTAACTGCGCATGCTCCTT GTTTGCAAGCCATGGTTGCAGATGGATCTAGTCTTCTGCTTTTATTACAAATGCTTCACTCAGTGCCTAGTTGTCGTGAA GGGTCTCTCCATGTTCTCTATGCATTGGCAAGTACACCAGAACTGGCCTGGGCAGCTGCCAAGCACGGTGGTGTTGTTTA CATTCTTCAATTGCTCTTGCCTTTGAAGGAAGAAATTCCACTCCAACAAAGAGCTATGGCAGCCTCCTTGCTGGGGAAGC TTGTTAGCCAGCCAATGCATGGACCAAGGGTTGCTATAACACTTGCAAGGTTCCTTCCAGATGGCCTTGTATCAATAATT AGGGATGGACCTGGTGAAGCTGTTGTAGTCGCCCTTGAGCAGACTACAGAGACACCAGAACTTGTATGGACGCCAGCAAT GGCAGCTTCCTTATCTGCACAAATTTCCACTATGGCATCCGAGCTGTACCGTGAGCAGATGAAAGGTCGTGTTGTTGATT GGGATGTACCTGAGCAGGCATCTGGACAGCAGGAAATGAGAGATGAGCCACAGGTTGGTGGCATCTATGTTCGGCTGTTC CTGAAGGATCCCAAATTTCCTCTGAGAAACCCCAAAAGATTCTTGGAAGGTCTTCTAGACCAGTATTTGTCATCCATTGC TGCCTCACATTATGAGGCCCAGGCTGTTGACCCTGAGCTTCCTTTGCTTCTGTCAGCTGCGCTTGTTTTATTACTACGCG TGCACCCTGCACTAGCAGATCATGTTGGGTATCTTGGATATGTACCGAAACTAGTTTCTGCTGTTGCATTTGAGGGAAGG CGAGAAACAATGTCATCAGCTGAGGTAAATGACGGGAAGCATGCAGACAAAACATATGGCCCAGATAATGAATCAGCAGA GAACACACAAACTCCTCAAGAGCGTGTGCGCCTGAGTTGTTTGCGCGTCTTGCATCAACTGGCAGGTAGTACCACGTGTG CTGAAGCCATGGCAGCAACCAGTGTTGGAACACCTCAGGTTGTTCCAGTGCTAATGAAAGCTATAGGGTGGCAAGGCGGA AGCATTTTAGCTCTTGAGACCCTAAAACGACTTGTGGTTGCTGGAAACCGAGCTAGGGATGCTCTTGTTGCTCAAGGACT TAAAGTTGGTCTTGTTGAAGTACTTCTTGGTCTTCTTGATTGGAGAGCCGGGGGCAGGAATGGATTTTGTTCCCAGATGA AGTGGAATGAATCTGAAGCATCAATTGGCAGGGTGCTGGCAATTGAGGTCTTGCATGCCTTTGCCACTGAAGGGGCCCAT TGTACTAAAGTGCGGGAACTATTGAATAATTCTGATGTTTGGAGTGCGTACAAAGACCAGAGGCATGATCTGTTCCTTCC TTCAAATGCTCAATCTGCAGCTGCTGGAATCGCCGGTCTAATTGAGAATTCATCGTCATCGAGACTCACTTACGCCCTCA CAGCTCCTCCACCTCAACCGTCTAATTCTAAATCTCCTCCATCCACGTCTGATATAAACGGAAAGCAAGATCAGTTTCTA TAG 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0264300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MFAVEFSDGCPIHVYASTSRDSLLAAVRDVLQTEGQCAIPILPRLTMPGHRIDPPCGRVYLQYGQQKPVADVESASVHLK HLAAAAKDAVAEGGSIPGSRAKLWRRIREFNACIPYSGVLPNIEVPEVTLMALITMLPAAPNLPPESPPLPPPSPKAAAT IMGFISCLRRLLASRSAASHVMSFPAAVGRIMGLLRNGSEGVASEAAGLVAVLIGGGPGDANVADSKGEWHATIMHTKSV LFANPSYIIILVNRIKPISVSPLLSMAVVEVLEAMICDPHGETTQYTVFVELLRQVAGLKRRLFALFGHPAESVRETVAV IMRSIAEEDAIAAESMRDASLRDGALLRHLLHALFLPAGERREVSRQLVALWADSYQPALELLSRILPPGLVAYLHTRFD GVLAEDTNQEESSTKKRKRRLLQQRKGRLGKGLTSQDQPFSSAHNFGDSDFGRQTVGPLVGSDNYHKNVLDPSSGQASIV QSSIPHINENLTNGSPTGEAQNGYSTVVASAIVASDNSNETQGSDFSNSVDPDSNVVGLQNADIPAPAQVVVENTPVGSG RLLMNWPEFWRAFDLDHNRADLIWNERTRQELRESLQAEVHKLDVEKERTEDIVPGGVTLEMITGVESVPQISWNYSEFC VRYPSLSKEVCVGQYYLRLLLESGSGGRAQDFPLRDPVAFFRALYHRFLCDADTGLTVDGAVPDELGASDDWCDMGRLDG FGGGGGSSVRELCARAMAIVYEQHYKTIGPFEGTAHTTVLLDRTDDRALRNRLLLLLKALMKVLSNVEACVLVGGCVLAV DLLTVVHETSERTSIPLQSNLLAATAFMEPLKEWMYIDKDGAQLGPVEKDAIRRLWSKKEIDWTTRCWASGMLDWKKLRD IRELRWALALRVPVLTPPQVGDTALSILHSMVSAHSDLDDAGEIVTPTPRVKRILSSPRCLPHIAQAILSGEPSIVEAAA ALLKAIVTRNPKAMIRLYSTGAFYFALAYPGSNLLSIGQLFAVTHVHQAFHGGEEAAVSSSLPLAKRSVLGGLLPESLLY VLDRSGPAAFAAAMVSDSDTPEIIWTHKMRAENLIRQVLQHLGDFPQKLSQHCHALYDYAPMPPVTYPELRDEMWCHRYY LRNLCDEIRFPNWPIVEHVEFLQSLLVMWREELTRKPMDLSEEEACKILEISLEDVSSDDVNKRTSSETADEASSLSKRI ENIDEEKLKRQYRKLAMKYHPDKNPEGRERFLAIQKAYERLQATMQGLQGPQPWRLLLLLKGQCILYRRYGDILEPFKYA GYPMLLSAVTVDKDDNNFLSLDRAPLLVAASELVWLTCASSSLNGEELVRDGGVQLLATLLSRCMYVVQPTTPGNEPSAV IVTNIMRTFAVLSQFEAARAEILEFSGLIEDIVHCTEFELVPAAVDAALQTIANVSVSSELQDALLKAGVLWYLLPLLLQ YDSTAEESDAKESHGVGASVQIAKNMHAIRACQALSRLCGLCGDGSTIPYNQAAANALRVLLTPKLSSMLKDQMPKDLLS KLNANLESPEIIWNSSTRAELLKFVDQQRAAQGPDGSYDIKESHDFVYKALSRELFIGNVYLRVYNDQPDFEISEPEAFC VSLIDFISYLLHNQCVEDVDHKVEETSNFIQTSEHLSEAVDGPVNEQQVLDNSSIMSDEKSTGKEELEMIKYLRSALISL QNLLTNSPNLASIFSNKDKLLPLFECFSVPEASNSNIPQLCLAVLSLLTAHAPCLQAMVADGSSLLLLLQMLHSVPSCRE GSLHVLYALASTPELAWAAAKHGGVVYILQLLLPLKEEIPLQQRAMAASLLGKLVSQPMHGPRVAITLARFLPDGLVSII RDGPGEAVVVALEQTTETPELVWTPAMAASLSAQISTMASELYREQMKGRVVDWDVPEQASGQQEMRDEPQVGGIYVRLF LKDPKFPLRNPKRFLEGLLDQYLSSIAASHYEAQAVDPELPLLLSAALVLLLRVHPALADHVGYLGYVPKLVSAVAFEGR RETMSSAEVNDGKHADKTYGPDNESAENTQTPQERVRLSCLRVLHQLAGSTTCAEAMAATSVGTPQVVPVLMKAIGWQGG SILALETLKRLVVAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGLLDWRAGGRNGFCSQMKWNESEASIGRVLAIEVLHAFATEGAH CTKVRELLNNSDVWSAYKDQRHDLFLPSNAQSAAAGIAGLIENSSSSRLTYALTAPPPQPSNSKSPPSTSDINGKQDQFL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 2222 2222 0.0
MobiDBLite 406 458 53 -
MobiDBLite 429 449 21 -
Coils 593 613 21 -
Pfam 834 884 51 3.2E-14
SMART 1188 1246 59 6.0E-11
ProSiteProfiles 1189 1271 83 12.811
Gene3D 1190 1244 55 2.8E-13
CDD 1201 1241 41 4.88572E-13
Pfam 1202 1242 41 3.0E-11
SUPERFAMILY 1203 1242 40 1.44E-12
Gene3D 1280 1532 253 6.6E-8
SUPERFAMILY 1302 1820 519 6.51E-22
Gene3D 1656 1858 203 2.5E-7
SUPERFAMILY 1746 2106 361 1.73E-6
MobiDBLite 2005 2021 17 -
MobiDBLite 2005 2032 28 -
MobiDBLite 2211 2240 30 -
MobiDBLite 2225 2240 16 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0264300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…