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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi4g1v0264300 |
Transcript ID | LotjaGi4g1v0264300.3 |
Related isoforms 2 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | DnaJ-like protein; TAIR: AT2G26890.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4IVL6|GRV2_ARATH DnaJ homolog subfamily C GRV2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2Q0L8|A0A0B2Q0L8_GLYSO DnaJ like subfamily C member 13; Found in the gene: LotjaGi4g1v0264300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:62841772..62855974) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAATACATTTATATTATGTAAGCTGATTTTAGTTAGAAGGGTTATGTCAAATTTTGAGAATTTTTACTAGATGTTTGCA GGCTGTTACTGTTCGTCCTTTATCTTCTGTGAGTGCTCTTGTCCGGTTTGCCGAAGAGCCCCAGATGTTTGCAGTTGAAT TTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTAAGCCTTCTTTATGATACTCTAGTTGTGATTTATTATTCTATAAACTTTCTCATC CACATGTCATTAATTGTAGGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGTTCGTGATGTTTTGCAAACTG AAGTAGGTAGATGTATCTCATCTTGGTTAAGAATTGTTCTATGATTGTATTTGTACATTGAAACATGATGATATATTGTG TGTAATCTCACGAATTCAAGTGCACCCAAATGTATGTCACTAAATGGTCTGGCTCAAACATAAGATTAAGTTTTTTAAAC TAAAACCGAACACGCTCTCAGTCTTGTTAATCGATGTTGAACTGAACCTGTTCTTGAACTGAAGGCAGTTATGTCTAATG GTATTGTTATAGAAAAAAAGCATTTCTTATTGGAAAATGCAGTGTAAAGTGCATGTTTGACATATGGTGATGTTTTTTTA TAGGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATCCTCCCTGTGGGAGAGTTTA TTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAACATTTAGCAGCTGCTGCCA AAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAATAAGGGAGTTCAATGCCTGT ATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGATCACTATGCTTCCTGCAGC 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0264300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTTGCAGTTGAATTTAGTGATGGATGTCCCATCCATGTTTATGCAAGCACGTCTCGTGATAGCTTACTTGCAGCAGT TCGTGATGTTTTGCAAACTGAAGGTCAATGTGCCATACCTATATTGCCAAGACTGACGATGCCTGGACACCGTATTGATC CTCCCTGTGGGAGAGTTTATTTGCAATATGGTCAACAAAAACCTGTTGCTGATGTAGAAAGTGCATCTGTGCATCTGAAA CATTTAGCAGCTGCTGCCAAAGATGCTGTGGCTGAAGGCGGTTCAATTCCTGGATCTAGGGCTAAACTATGGCGTAGAAT AAGGGAGTTCAATGCCTGTATACCATATAGTGGTGTGCTTCCAAACATTGAAGTGCCTGAGGTTACTTTGATGGCCTTGA TCACTATGCTTCCTGCAGCACCAAATCTTCCTCCAGAGTCTCCTCCATTACCACCCCCTTCCCCAAAAGCTGCAGCAACT ATTATGGGTTTTATTTCATGTTTACGTAGACTACTTGCTTCAAGAAGTGCTGCTTCCCACGTGATGTCATTTCCTGCAGC AGTGGGAAGGATAATGGGTTTACTCAGAAATGGTTCAGAAGGTGTAGCCTCTGAGGCTGCAGGGCTTGTTGCTGTACTCA TTGGTGGTGGGCCTGGTGATGCAAATGTAGCAGATTCCAAAGGAGAGTGGCATGCTACCATTATGCATACAAAGTCAGTA TTGTTTGCTAATCCTAGTTATATAATTATTCTTGTCAACAGAATAAAGCCCATATCCGTATCACCTTTACTTTCAATGGC TGTTGTTGAAGTGCTTGAGGCTATGATTTGTGATCCACATGGGGAGACTACCCAGTATACTGTTTTTGTTGAGTTGTTAC GCCAAGTTGCTGGGTTGAAGCGTCGCTTGTTTGCACTGTTTGGCCACCCTGCTGAAAGTGTTAGAGAAACAGTAGCCGTA 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GTTCGTTACCCGAGCTTGTCAAAAGAAGTTTGTGTGGGTCAGTATTATCTTCGTCTACTGCTTGAGAGTGGCAGTGGTGG CAGGGCTCAAGACTTCCCATTGCGTGATCCAGTTGCTTTCTTTAGAGCACTGTACCATCGTTTTTTGTGTGATGCAGACA CAGGGCTTACTGTAGATGGTGCTGTTCCTGATGAGTTAGGTGCATCTGATGATTGGTGTGACATGGGTAGATTAGATGGT TTTGGCGGAGGTGGTGGGTCATCAGTGAGGGAGCTTTGTGCAAGGGCAATGGCAATTGTATATGAGCAGCATTACAAGAC CATAGGCCCCTTTGAAGGTACAGCTCACACTACTGTTCTTTTGGATAGGACAGATGACAGAGCTTTGAGGAATCGACTTC TTTTGCTTCTAAAGGCATTAATGAAGGTTTTATCAAATGTAGAGGCTTGTGTTCTAGTTGGAGGTTGTGTATTAGCCGTA GATCTGCTTACAGTGGTCCATGAAACTTCAGAGAGGACATCTATTCCCTTGCAATCAAATTTATTAGCAGCTACTGCTTT TATGGAACCACTTAAGGAGTGGATGTATATTGACAAAGATGGTGCTCAACTTGGGCCAGTGGAAAAAGATGCTATTAGAA GGTTATGGTCCAAAAAGGAAATTGATTGGACAACAAGGTGTTGGGCTTCTGGGATGCTAGATTGGAAGAAGTTGCGTGAT ATTCGTGAGCTTCGTTGGGCTCTTGCTCTTAGAGTTCCGGTCCTTACCCCACCCCAGGTTGGGGACACTGCTCTGTCCAT ATTGCATAGCATGGTGTCTGCACATTCAGATTTAGATGATGCTGGAGAGATTGTTACTCCAACTCCTAGAGTAAAACGAA TCTTATCAAGTCCACGCTGCCTTCCACATATTGCACAGGCCATTCTTTCTGGGGAACCAAGTATTGTTGAGGCAGCTGCT GCTTTGCTGAAGGCCATTGTCACCCGGAATCCCAAAGCGATGATACGTCTATACAGCACTGGTGCATTTTATTTTGCACT GGCTTATCCGGGGTCTAATCTACTTTCAATTGGGCAATTATTTGCTGTCACCCATGTCCATCAAGCATTTCATGGCGGTG AAGAGGCTGCAGTTTCGTCTTCATTGCCTTTGGCAAAACGCAGTGTTCTTGGTGGACTTCTCCCTGAATCTCTGTTGTAT GTATTGGATCGTAGTGGTCCAGCAGCATTTGCTGCAGCAATGGTCTCTGATTCTGACACTCCAGAGATAATATGGACTCA CAAAATGAGGGCAGAAAATCTAATTCGCCAGGTTTTGCAGCATCTTGGTGATTTTCCTCAAAAACTGTCGCAACACTGCC ATGCTTTATATGACTATGCCCCCATGCCTCCAGTGACATATCCCGAGCTGAGAGATGAAATGTGGTGTCACCGTTATTAT CTTAGGAACCTCTGTGATGAGATTCGTTTTCCAAATTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCTTTACTTGT AATGTGGCGTGAGGAGTTGACAAGAAAACCCATGGACCTTTCTGAAGAAGAAGCTTGCAAGATCCTTGAAATATCCTTGG AGGATGTATCTAGTGATGATGTAAATAAAAGAACTTCTTCTGAGACTGCCGATGAAGCATCAAGCTTGTCAAAGCGGATT GAGAACATTGATGAAGAAAAATTAAAGCGACAATATCGGAAACTTGCGATGAAATATCATCCTGACAAAAATCCTGAAGG AAGGGAGAGGTTTCTTGCCATACAGAAGGCCTATGAACGCCTGCAGGCTACTATGCAAGGATTGCAAGGTCCTCAGCCTT GGAGATTGCTGCTTTTGTTGAAGGGACAATGTATTTTATACAGAAGATATGGAGACATATTAGAGCCATTCAAATATGCT GGCTACCCCATGTTGCTGAGTGCTGTTACTGTTGATAAGGATGATAACAACTTTCTTTCTTTAGATAGAGCACCTCTCCT TGTTGCTGCATCAGAGCTTGTCTGGTTAACATGTGCATCTTCTTCATTGAATGGTGAGGAGCTGGTAAGAGATGGAGGAG TACAACTTCTTGCAACCCTTCTTTCCCGTTGCATGTATGTTGTTCAGCCAACTACTCCTGGGAATGAACCATCTGCCGTT ATTGTTACAAACATCATGCGGACATTTGCAGTTCTAAGTCAATTTGAGGCTGCCAGGGCCGAGATACTTGAGTTTTCTGG ATTAATTGAGGACATTGTGCACTGCACTGAATTTGAGCTTGTACCTGCAGCTGTTGATGCTGCTCTACAAACTATTGCCA ATGTTTCTGTTTCCTCTGAGTTGCAGGATGCTTTATTGAAGGCTGGTGTTTTATGGTACCTTTTGCCACTACTGCTTCAG TATGACTCAACTGCAGAAGAATCTGACGCGAAAGAATCACACGGTGTTGGTGCTAGTGTTCAAATTGCAAAAAACATGCA TGCCATTAGAGCTTGCCAGGCTCTGTCAAGGCTCTGTGGTTTGTGTGGTGATGGGAGTACAATACCTTATAATCAAGCAG CTGCTAATGCTCTGAGAGTTTTGCTAACTCCTAAGCTTTCTAGCATGTTGAAAGATCAAATGCCCAAAGATTTACTGTCC AAATTAAATGCTAACCTGGAGTCACCGGAGATTATCTGGAACTCTTCAACACGGGCAGAGCTGCTGAAATTTGTGGACCA GCAACGCGCAGCTCAAGGTCCTGATGGTTCATATGATATAAAAGAATCACATGACTTTGTCTATAAAGCACTATCAAGAG AATTATTCATTGGCAATGTTTACTTGAGGGTCTACAACGATCAGCCAGATTTTGAAATTAGTGAACCCGAAGCTTTTTGT GTTTCTCTAATCGACTTCATATCTTATCTTTTGCACAATCAATGTGTTGAAGATGTTGATCATAAGGTTGAAGAAACCAG TAATTTCATTCAGACTTCTGAGCATCTAAGCGAGGCTGTTGATGGACCTGTTAATGAACAGCAGGTCCTGGATAATTCCA GCATAATGTCTGATGAAAAATCTACAGGGAAGGAAGAACTAGAGATGATTAAATATCTCCGTTCAGCACTGATCTCCCTT CAGAACCTTCTGACAAATAGTCCAAATTTGGCATCCATATTTTCTAATAAAGACAAGCTACTGCCTCTTTTTGAATGCTT TTCTGTGCCTGAAGCATCAAACAGTAACATTCCTCAACTTTGCCTGGCAGTGCTGTCACTCTTAACTGCGCATGCTCCTT GTTTGCAAGCCATGGTTGCAGATGGATCTAGTCTTCTGCTTTTATTACAAATGCTTCACTCAGTGCCTAGTTGTCGTGAA GGGTCTCTCCATGTTCTCTATGCATTGGCAAGTACACCAGAACTGGCCTGGGCAGCTGCCAAGCACGGTGGTGTTGTTTA CATTCTTCAATTGCTCTTGCCTTTGAAGGAAGAAATTCCACTCCAACAAAGAGCTATGGCAGCCTCCTTGCTGGGGAAGC TTGTTAGCCAGCCAATGCATGGACCAAGGGTTGCTATAACACTTGCAAGGTTCCTTCCAGATGGCCTTGTATCAATAATT AGGGATGGACCTGGTGAAGCTGTTGTAGTCGCCCTTGAGCAGACTACAGAGACACCAGAACTTGTATGGACGCCAGCAAT GGCAGCTTCCTTATCTGCACAAATTTCCACTATGGCATCCGAGCTGTACCGTGAGCAGATGAAAGGTCGTGTTGTTGATT GGGATGTACCTGAGCAGGCATCTGGACAGCAGGAAATGAGAGATGAGCCACAGGTTGGTGGCATCTATGTTCGGCTGTTC CTGAAGGATCCCAAATTTCCTCTGAGAAACCCCAAAAGATTCTTGGAAGGTCTTCTAGACCAGTATTTGTCATCCATTGC TGCCTCACATTATGAGGCCCAGGCTGTTGACCCTGAGCTTCCTTTGCTTCTGTCAGCTGCGCTTGTTTTATTACTACGCG TGCACCCTGCACTAGCAGATCATGTTGGGTATCTTGGATATGTACCGAAACTAGTTTCTGCTGTTGCATTTGAGGGAAGG CGAGAAACAATGTCATCAGCTGAGGTAAATGACGGGAAGCATGCAGACAAAACATATGGCCCAGATAATGAATCAGCAGA GAACACACAAACTCCTCAAGAGCGTGTGCGCCTGAGTTGTTTGCGCGTCTTGCATCAACTGGCAGGTAGTACCACGTGTG CTGAAGCCATGGCAGCAACCAGTGTTGGAACACCTCAGGTTGTTCCAGTGCTAATGAAAGCTATAGGGTGGCAAGGCGGA AGCATTTTAGCTCTTGAGACCCTAAAACGACTTGTGGTTGCTGGAAACCGAGCTAGGGATGCTCTTGTTGCTCAAGGACT TAAAGTTGGTCTTGTTGAAGTACTTCTTGGTCTTCTTGATTGGAGAGCCGGGGGCAGGAATGGATTTTGTTCCCAGATGA AGTGGAATGAATCTGAAGCATCAATTGGCAGGGTGCTGGCAATTGAGGTCTTGCATGCCTTTGCCACTGAAGGGGCCCAT TGTACTAAAGTGCGGGAACTATTGAATAATTCTGATGTTTGGAGTGCGTACAAAGACCAGAGGCATGATCTGTTCCTTCC TTCAAATGCTCAATCTGCAGCTGCTGGAATCGCCGGTCTAATTGAGAATTCATCGTCATCGAGACTCACTTACGCCCTCA CAGCTCCTCCACCTCAACCGTCTAATTCTAAATCTCCTCCATCCACGTCTGATATAAACGGAAAGCAAGATCAGTTTCTA TAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0264300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFAVEFSDGCPIHVYASTSRDSLLAAVRDVLQTEGQCAIPILPRLTMPGHRIDPPCGRVYLQYGQQKPVADVESASVHLK HLAAAAKDAVAEGGSIPGSRAKLWRRIREFNACIPYSGVLPNIEVPEVTLMALITMLPAAPNLPPESPPLPPPSPKAAAT IMGFISCLRRLLASRSAASHVMSFPAAVGRIMGLLRNGSEGVASEAAGLVAVLIGGGPGDANVADSKGEWHATIMHTKSV LFANPSYIIILVNRIKPISVSPLLSMAVVEVLEAMICDPHGETTQYTVFVELLRQVAGLKRRLFALFGHPAESVRETVAV IMRSIAEEDAIAAESMRDASLRDGALLRHLLHALFLPAGERREVSRQLVALWADSYQPALELLSRILPPGLVAYLHTRFD GVLAEDTNQEESSTKKRKRRLLQQRKGRLGKGLTSQDQPFSSAHNFGDSDFGRQTVGPLVGSDNYHKNVLDPSSGQASIV QSSIPHINENLTNGSPTGEAQNGYSTVVASAIVASDNSNETQGSDFSNSVDPDSNVVGLQNADIPAPAQVVVENTPVGSG RLLMNWPEFWRAFDLDHNRADLIWNERTRQELRESLQAEVHKLDVEKERTEDIVPGGVTLEMITGVESVPQISWNYSEFC VRYPSLSKEVCVGQYYLRLLLESGSGGRAQDFPLRDPVAFFRALYHRFLCDADTGLTVDGAVPDELGASDDWCDMGRLDG FGGGGGSSVRELCARAMAIVYEQHYKTIGPFEGTAHTTVLLDRTDDRALRNRLLLLLKALMKVLSNVEACVLVGGCVLAV DLLTVVHETSERTSIPLQSNLLAATAFMEPLKEWMYIDKDGAQLGPVEKDAIRRLWSKKEIDWTTRCWASGMLDWKKLRD IRELRWALALRVPVLTPPQVGDTALSILHSMVSAHSDLDDAGEIVTPTPRVKRILSSPRCLPHIAQAILSGEPSIVEAAA ALLKAIVTRNPKAMIRLYSTGAFYFALAYPGSNLLSIGQLFAVTHVHQAFHGGEEAAVSSSLPLAKRSVLGGLLPESLLY VLDRSGPAAFAAAMVSDSDTPEIIWTHKMRAENLIRQVLQHLGDFPQKLSQHCHALYDYAPMPPVTYPELRDEMWCHRYY LRNLCDEIRFPNWPIVEHVEFLQSLLVMWREELTRKPMDLSEEEACKILEISLEDVSSDDVNKRTSSETADEASSLSKRI ENIDEEKLKRQYRKLAMKYHPDKNPEGRERFLAIQKAYERLQATMQGLQGPQPWRLLLLLKGQCILYRRYGDILEPFKYA GYPMLLSAVTVDKDDNNFLSLDRAPLLVAASELVWLTCASSSLNGEELVRDGGVQLLATLLSRCMYVVQPTTPGNEPSAV IVTNIMRTFAVLSQFEAARAEILEFSGLIEDIVHCTEFELVPAAVDAALQTIANVSVSSELQDALLKAGVLWYLLPLLLQ YDSTAEESDAKESHGVGASVQIAKNMHAIRACQALSRLCGLCGDGSTIPYNQAAANALRVLLTPKLSSMLKDQMPKDLLS KLNANLESPEIIWNSSTRAELLKFVDQQRAAQGPDGSYDIKESHDFVYKALSRELFIGNVYLRVYNDQPDFEISEPEAFC VSLIDFISYLLHNQCVEDVDHKVEETSNFIQTSEHLSEAVDGPVNEQQVLDNSSIMSDEKSTGKEELEMIKYLRSALISL QNLLTNSPNLASIFSNKDKLLPLFECFSVPEASNSNIPQLCLAVLSLLTAHAPCLQAMVADGSSLLLLLQMLHSVPSCRE GSLHVLYALASTPELAWAAAKHGGVVYILQLLLPLKEEIPLQQRAMAASLLGKLVSQPMHGPRVAITLARFLPDGLVSII RDGPGEAVVVALEQTTETPELVWTPAMAASLSAQISTMASELYREQMKGRVVDWDVPEQASGQQEMRDEPQVGGIYVRLF LKDPKFPLRNPKRFLEGLLDQYLSSIAASHYEAQAVDPELPLLLSAALVLLLRVHPALADHVGYLGYVPKLVSAVAFEGR RETMSSAEVNDGKHADKTYGPDNESAENTQTPQERVRLSCLRVLHQLAGSTTCAEAMAATSVGTPQVVPVLMKAIGWQGG SILALETLKRLVVAGNRARDALVAQGLKVGLVEVLLGLLDWRAGGRNGFCSQMKWNESEASIGRVLAIEVLHAFATEGAH CTKVRELLNNSDVWSAYKDQRHDLFLPSNAQSAAAGIAGLIENSSSSRLTYALTAPPPQPSNSKSPPSTSDINGKQDQFL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 2222 | 2222 | 0.0 | – | |
MobiDBLite | 406 | 458 | 53 | - | – | |
MobiDBLite | 429 | 449 | 21 | - | – | |
Coils | 593 | 613 | 21 | - | – | |
Pfam | 834 | 884 | 51 | 3.2E-14 | ||
SMART | 1188 | 1246 | 59 | 6.0E-11 | ||
ProSiteProfiles | 1189 | 1271 | 83 | 12.811 | ||
Gene3D | 1190 | 1244 | 55 | 2.8E-13 | ||
CDD | 1201 | 1241 | 41 | 4.88572E-13 | ||
Pfam | 1202 | 1242 | 41 | 3.0E-11 | ||
SUPERFAMILY | 1203 | 1242 | 40 | 1.44E-12 | ||
Gene3D | 1280 | 1532 | 253 | 6.6E-8 | ||
SUPERFAMILY | 1302 | 1820 | 519 | 6.51E-22 | ||
Gene3D | 1656 | 1858 | 203 | 2.5E-7 | ||
SUPERFAMILY | 1746 | 2106 | 361 | 1.73E-6 | ||
MobiDBLite | 2005 | 2021 | 17 | - | – | |
MobiDBLite | 2005 | 2032 | 28 | - | – | |
MobiDBLite | 2211 | 2240 | 30 | - | – | |
MobiDBLite | 2225 | 2240 | 16 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0264300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…