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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0318600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0318600.1 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT3G43300.3 HOPM interactor 7; Swiss-Prot: sp|F4IXW2|BIG5_ARATH Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SIY4|A0A0B2SIY4_GLYSO Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0318600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69604109..69621815) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATAAGACTCTTCAAACGTGTAAAAAGCAATTCCCTGCATATGAAAAAAAAAAAGAATATTGCACTGTAGTTCCTTCCTCT TCCAAAATTGAGCTTCGTTCTAAATCTCAAACATAGTTTGGGCACTGGGTGAAGAAACACTCAAAGAGAAACAGATCTAC ACCTTTCATTCTCTCTTTTTCATCTTCCATCCATCTCTCAGATCTCTCTCGCCGGCATCGGATTCCGTCGCCGTCGGAAA ACTCACGATCTCGTTTCGATTTCGGATGATCTGGATTCACCTGCATTTCCTCCAATTTCGATTCCGGATTCAACACCGTC ATTGATCTGTGCGAGCATTTGATTGCTCGCAAGAGAGTGTGTGAAAATGGCTGGTGGTGCCGCCGGTGGTTTTCTCACTC GAGCATTCGATTCTATGCTCAAGGAGTGTTCTGGCAAGAAGTTTCCTGAACTTCAGAAAGCTATTCAGAATTTCACAGGT TTTTAACCCTAGATCCCTCTTTCATTTCCTCAATCATCGCAATTTCAATCTGTATTTTGATATTTTAGTGTTCAATTGGT GTCAATAGTTACGATGCTGTTGATTGATGTTATTGAGTTTTGTTTCCTGCTTTGTTTTCGTTACAGATATCACGAAAGAG GCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAGCTGCACCGTCACCTGAATCCGCGAGGTAAAATCATGTTTGATGGAT TATCCTTGTTTTGTGAAATGAGATCGGATTTCTGTTAATGGACCTGGTTCGTATTGATTTATACATTTGAATTATTATGA TTTGGTACTAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAACCAGAAGCAGATCAGTCACATAAGGCTTATAGTGG AAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGAGCTGATGCAGAACTTGTTTTAAATCCGCTCCGTC 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0318600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGGTGGTGCCGCCGGTGGTTTTCTCACTCGAGCATTCGATTCTATGCTCAAGGAGTGTTCTGGCAAGAAGTTTCC TGAACTTCAGAAAGCTATTCAGAATTTCACAGATATCACGAAAGAGGCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAG CTGCACCGTCACCTGAATCCGCGAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAACCAGAAGCAGATCAGTCACAT AAGGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGAGCTGATGCAGAACTTGTTTT AAATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGATTGTCTTCATAAACTTATTG CGTATGACCATTTAGAGGGAGATCCTGGGTTAGATGGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTG TGCAGTTGTATCGACAATTCATCACCTGACAGTACTATTCTCCAAGTGCTGAAGGTACTTCTTACTGCTGTAGCTTCTGC AAAATTCCGAGTACATGGCGAACCTTTGTTGGGAGTTATCAGAGTATGCTATAATATTGCTCTGAATAGCAAGAGTCCTA TAAACCAAGCAACATCAAAGGCAATGCTGACCCAGATGATCAGCATCGTTTTCAGGAGAATGGAAACTAATCCCAATTTC CAGGTTGAAACTTCATCTGGTTCTGGTGGACACACAATTACAAAAGCTGCTTCAACAGAGAATTTAAACACAAAATCTGA TGAAACTTCTGTGGGAGAGTCAAATGAAAAAGAAATGACTTTAGGTGATGCACTTAGTCAAGCCAAGGATGCATCCCCAA CATCTCTTGAGGAACTTCAAAATCTTGCCGGGGGTGCTGATATCAAGGGCCTTGAAGCTGTACTCGACAAGGCTGTGCAT ACCGAAGATGGTAAAAAAATAACACGTGGGATTGATTTGGAGAGCATGAGTATAGGACAACGTGACGCTTTGCTGGTGTT CCGAACTCTCTGCAAGATGGGTATGAAGGAAGATAACGATGAAGTTACAACCAAGACAAGGATTTTGTCCCTTGAGCTTC TGCAGGGTTTGTTGGAGGGAGTTAGCCACTCATTTACAAAGAACTTCCATTTTATCGATTCAGTGAAGGCGTATCTTTCA TATGCATTGTTGCGAGCTTCAGTTTCACAATCCCCTGTCATATTTCAGTATGCAACTGGAGTATTCTTGGTGCTCTTATT GCGATTCAGGGAGAGTCTCAAAGGTGAAATATGCATCTTCTTTCCGTTGATAGTTCTTAGACCACTGGATGGATTAGAAT TTTCTGTCAACCAAAAACTTAGTGTTCTTCGGATGCTAGAGAAAGTATGTAAGGATCCACAGCTGCTTGTTGACATCTTT GTGAATTATGACTGTGATCTTGAGGCGCCAAACTTGTTTGAACGAATGGTTACAACTCTGTCCAGAATAGCACAAGGGAC TCAAAATACTGATCCGAATTCAGCTGCTGTTTCTCAAACTGCTTCAGTTAAAGGTTCATCACTTCAAGGCCTTGTGAGTG TGCTTAAATCATTGGTTGACTGGGAACAATCACATCGGGAGCTGATAAAGTTAAAGAGTGATCAGCAAGAAGGGGTTTCA GCTGAAGATTCTCTTGAAGTAAGATCCAGGGAGGATGTAACTAGTGATTTTGAGAAGGCTAAGGCTCATAAGTCAACATT GGAGGCTGCCATTGCTGAGTTCAACAGGAAGCCAATGAAAGGGGTGGAGTATCTAATATCAAATAAGTTGGTGGAAAACA CACCTGCTTCAGTCGCTCAATTTTTGAAAAACACCCCAAATTTGGATAAGGCTACCATTGGTGACTATTTAGGCCAACAT GAAGAGTTCCCCCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTAGATTCCATGAAATTTTCTGGGATGAAATTTCATACTGCAATCAG GGAGTTTCTTAAAGGGTTCCGACTTCCTGGGGAAGCTCAAAAGATAGATCGAATCATGGAAAAATTTGCAGAGAGATACT GTGCAGACAATCCAGGCCTTTTTAAAAATGCAGATACAGCATACGTTCTTGCTTATGCTGTCATTATGTTAAATACTGAC GCTCATAACCCAATGGTATGGCCTAAGATGTCCAAGTCAGATTTTGTTCGTATGAATGCTAGAGATGATCCAGATGAATG TGCGCCTAGGGAACTACTGGAAGAGATCTATGATTCCATTGTTAAAGAAGAGATTAAAATGAAAGATGACACATCTTTTC TGGGAAAAAGCAGCAGACAGAAATCAGAAGGTGAAGAAGGACGCCTTGTCAGTATTCTTAACCTGGCACTCCCCAAAAGT AAGTCAGCAGGAGATGCCAAGTCTGAAAGTGAGGCTATCATTAAGAAAACACAAGCTATATTCAGGAATCAAGGGGTGAA ACGAGGAGTTTTCTACACTGCCCAACAGATTGAACTTGTAAGGCCCATGGTAGATGCTGTTGGGTGGGCTCTGCTTGCTA CTTTCTCTGTAACTATGGAGGAAGGTGAGAATAAGCCTCGTGTTGTTCTGTTGATGGAGGGTTTTAGAGCTGGAATACAC ATCACATTTGTACTTGGAATGGATACCATGCGCTATGCATTTTTAACATCTCTGGTCAGGTTCACTTTCCTGCATGCCCC AAGGGAAATGCGTAGTAAAAATGTGGAAGCTTTACGGACACTGTTGGTTCTTTGTGACTCAGACATGAACGCCCTTCAAG ACACATGGAATGCAGTTCTAGAATGTGTTTCTCGCCTTGAATTTATAACAACAACTCCTGCAATTGCTGCCACTGTCATG CATGGATCAAATCAAATCTCCAAGGATTCTGTTGTTCAATCTCTGAGAGAGTTATCTGGGAAACCTGCTGAACAAGTTTT CATGAATAGTGTTAAACTACCTAGTGATTCAGTTGTGGAATTCTTCACGGCTCTCTGTGGTGTATCTGCTGAGGAGCTAA AACAAACCCCAGCTCGTGTTTTCAGCTTGCAAAAGCTTGTTGAAATTAGCTATTACAATATGGCTCGTATACGTATGGTC TGGGCCAGAATCTGGTCTGTTCTAGCAAATCACTTTATATCAGCTGGGAGTCATCATGATGAAAAAATTGCTATGTATGC CATAGATTCTCTAAGACAACTTGGTATGAAGTATTTGGAGCGTGATGAGCTGGCCAATTTTACTTTCCAAAACGATATTC TCAAACCATTTGTTGTTCTTATGCGGAATAGTCAAAGTGAATCCAAAAGGAGACTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGATG ATAAAATCTAAGGTTGGGAGCATTAAGTCTGGGTGGCGTAGTGTATTTATGATTTTTACGGCTGCTGCAGATGATGAACT AGAATCAATTGTTGAGAGTGCATTTGAAAATGTTGAGCAGGTCATCTTAGAACACTTTGATCAAGTAGCGGGAGACTGTT TCTTGGATTGCGTAAATTGTCTCATCAGGTTTGCCAACAATAAAACATCACATCGAATTAGTTTGAAGGCTATTGCACTC TTGCGGATCTGTGAGGACCGTCTTGCAGAGGGCCTTATTCCTGGAGGCACTTTGATGCCTATTGATGCTACATTGGATGC GACTTTGGATGTAACTGAGCATTATTGGTTCCCAATGCTGGCTGGTTTATCTGATCTGACATCAGATCATAGACCAGAGG TCAGAAGTTGTGCACTTGAAGTCTTATTTGATTTATTGAATGAAAGAGGTAGCAAGTTCTCTACACCATTTTGGGAGAAT ATTTTCCATCGAGTCTTATTTCCAATTTTTGATCATGTGAGACATGCTGGAAAAGAGAGCTTTATTTCTACTGATGATGA TTGGTTTCGTGAAACAAGCATACATTCGCTTCAGTTGCTTTGCAACCTTTTCAACACATTCTATAAGGAGGTTTGTTTTA TGCTGCCGCCATTGCTGAGTTTGCTTTTAGATTGTGCCAAAAAGACAGATCAAACTGTGGTCTCAATATCTCTCGGTGCG TTGGTGCATCTAATTGAAGTAGGTGGTCATCAATTTAGTGAAAGTGACTGGGACATGCTACTTAAAAGCATAAGAGATGC TGGATACACAACGCAACCTTTAGAGTTGCTTAATACTTTGAGTGTTGAAAATATCAGAAACCATGGGGGCATTGTTAGGG ATTCTGAGGACAATGCAGATGACAGTGTTACCATTAAGTCTACTGACAGAGAGGTAGTGAGTGACCATCAACATGAGGTC AACAGTAATGGGAACTTATCCCCACTTGCATCCTCAAATGCAAATGCTGATGGAGTTGAAGATTCAGTATCACAGACAAA TATAGATCAGTCTGAAGGCCTTCCATCTCCATCAGGAAGAACTCCCAAGGCTGCAGATGGAGGAGGCCTCCAACGGAGTC AAACCTTAGGTCAGCGGATTATGGAAAATATCTTCCTTCGGAATCTTACTTCAAAATCTAAAGGCCGTGTATCTGATGCT TCACAACCATCTTCCCCAGTAACGGTTATTGATACCGTAGAGCCTGATACCAAGAATGAAGAGAGTCCTTTGCTAGCAGC TATCAGGGGAAAGTGCATCACCCAATTATTGCTCCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGAAGAAATATTGGACAATGTTAA AAGCGCAACAGAAGATTGCTGTAATGGACACTTTGTTGTCTTTGTTGGAGTTTGCTGCTTCATTTAACTCATCCACCAAT CTAAGAACTCGCATGCACCAAATTCCTGATGAAAGGCCACCTATAAATCTTCTTCGTCAGGAACTAGCTGGTACTGGCAT ATATCTGGACATCTTACAGAAGTCAACTTGTGGGTTTGAAACAAAGAAAGAAAAAAGTCCAGATTCAGTTGGATTTCAAG ATGTTGATTCTAGGGAAGACAATGGCTCGAGTATTAAACATTCTGACGCGGAAGAGAAATTTGAAAGGGTAGCTGAGGAG AAACTGGTGTCTTTCTGTGAACAGGTGCTCAGGGAGGCATCTGACCTCCAGTCTAGTACTGGAGAAACCACTAACATGGA TATTCATCGTGTCTTGGAACTTCGTGCTCCTATTATTATCAAGGTGATCCAAAGCATGTGTTCTATGAACAGTAAGATTT TCAGAAGACACCTAAGAGAACTCTATCCTTTGCTAACTAAACTTGTTTGCTGTGACCAGATGGATGTTCGAGGAGCTCTT GGTGATTTGTTTCAATCACAACTGAAAGCTCTTTTACCATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0318600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGGAAGGFLTRAFDSMLKECSGKKFPELQKAIQNFTDITKEASQRKQSEPNQAAPSPESASANETEDGAVTKPEADQSH KAYSGNITVILANAGNALEGADAELVLNPLRLAFETKSLKILEPALDCLHKLIAYDHLEGDPGLDGGKNVPLFTDILNMV CSCIDNSSPDSTILQVLKVLLTAVASAKFRVHGEPLLGVIRVCYNIALNSKSPINQATSKAMLTQMISIVFRRMETNPNF QVETSSGSGGHTITKAASTENLNTKSDETSVGESNEKEMTLGDALSQAKDASPTSLEELQNLAGGADIKGLEAVLDKAVH TEDGKKITRGIDLESMSIGQRDALLVFRTLCKMGMKEDNDEVTTKTRILSLELLQGLLEGVSHSFTKNFHFIDSVKAYLS YALLRASVSQSPVIFQYATGVFLVLLLRFRESLKGEICIFFPLIVLRPLDGLEFSVNQKLSVLRMLEKVCKDPQLLVDIF VNYDCDLEAPNLFERMVTTLSRIAQGTQNTDPNSAAVSQTASVKGSSLQGLVSVLKSLVDWEQSHRELIKLKSDQQEGVS AEDSLEVRSREDVTSDFEKAKAHKSTLEAAIAEFNRKPMKGVEYLISNKLVENTPASVAQFLKNTPNLDKATIGDYLGQH EEFPLAVMHAYVDSMKFSGMKFHTAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADNPGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTD AHNPMVWPKMSKSDFVRMNARDDPDECAPRELLEEIYDSIVKEEIKMKDDTSFLGKSSRQKSEGEEGRLVSILNLALPKS KSAGDAKSESEAIIKKTQAIFRNQGVKRGVFYTAQQIELVRPMVDAVGWALLATFSVTMEEGENKPRVVLLMEGFRAGIH ITFVLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPREMRSKNVEALRTLLVLCDSDMNALQDTWNAVLECVSRLEFITTTPAIAATVM HGSNQISKDSVVQSLRELSGKPAEQVFMNSVKLPSDSVVEFFTALCGVSAEELKQTPARVFSLQKLVEISYYNMARIRMV WARIWSVLANHFISAGSHHDEKIAMYAIDSLRQLGMKYLERDELANFTFQNDILKPFVVLMRNSQSESKRRLIVDCIVQM IKSKVGSIKSGWRSVFMIFTAAADDELESIVESAFENVEQVILEHFDQVAGDCFLDCVNCLIRFANNKTSHRISLKAIAL LRICEDRLAEGLIPGGTLMPIDATLDATLDVTEHYWFPMLAGLSDLTSDHRPEVRSCALEVLFDLLNERGSKFSTPFWEN IFHRVLFPIFDHVRHAGKESFISTDDDWFRETSIHSLQLLCNLFNTFYKEVCFMLPPLLSLLLDCAKKTDQTVVSISLGA LVHLIEVGGHQFSESDWDMLLKSIRDAGYTTQPLELLNTLSVENIRNHGGIVRDSEDNADDSVTIKSTDREVVSDHQHEV NSNGNLSPLASSNANADGVEDSVSQTNIDQSEGLPSPSGRTPKAADGGGLQRSQTLGQRIMENIFLRNLTSKSKGRVSDA SQPSSPVTVIDTVEPDTKNEESPLLAAIRGKCITQLLLLGAIDGIQKKYWTMLKAQQKIAVMDTLLSLLEFAASFNSSTN LRTRMHQIPDERPPINLLRQELAGTGIYLDILQKSTCGFETKKEKSPDSVGFQDVDSREDNGSSIKHSDAEEKFERVAEE KLVSFCEQVLREASDLQSSTGETTNMDIHRVLELRAPIIIKVIQSMCSMNSKIFRRHLRELYPLLTKLVCCDQMDVRGAL GDLFQSQLKALLP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 1766 | 1763 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 1766 | 1763 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 37 | 78 | 42 | - | – | |
| MobiDBLite | 37 | 67 | 31 | - | – | |
| Pfam | 43 | 236 | 194 | 2.1E-27 | ||
| MobiDBLite | 241 | 269 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 241 | 279 | 39 | - | – | |
| Pfam | 340 | 491 | 152 | 1.5E-37 | ||
| Gene3D | 567 | 657 | 91 | 4.5E-29 | – | |
| ProSiteProfiles | 576 | 763 | 188 | 42.61 | ||
| Coils | 577 | 597 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 580 | 770 | 191 | 7.85E-72 | ||
| SMART | 580 | 765 | 186 | 1.6E-83 | ||
| CDD | 583 | 765 | 183 | 5.048E-75 | ||
| Pfam | 584 | 765 | 182 | 3.2E-69 | ||
| Gene3D | 658 | 775 | 118 | 1.6E-46 | ||
| SUPERFAMILY | 917 | 1767 | 851 | 6.02E-23 | ||
| Pfam | 1077 | 1159 | 83 | 2.9E-26 | ||
| Pfam | 1231 | 1296 | 66 | 4.6E-7 | ||
| MobiDBLite | 1428 | 1493 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 1438 | 1477 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1641 | 1672 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with the GTPase ARF. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Regulation of ARF protein signal transduction | Any process that modulates the frequency, rate or extent of ARF protein signal transduction. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0318600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…