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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0318600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0318600.2 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT3G43300.3 HOPM interactor 7; Swiss-Prot: sp|F4IXW2|BIG5_ARATH Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SIY4|A0A0B2SIY4_GLYSO Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0318600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69604475..69621356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTGGTGGTGCCGCCGGTGGTTTTCTCACTCGAGCATTCGATTCTATGCTCAAGGAGTGTTCTGGCAAGAAGTTTCC TGAACTTCAGAAAGCTATTCAGAATTTCACAGGTTTTTAACCCTAGATCCCTCTTTCATTTCCTCAATCATCGCAATTTC AATCTGTATTTTGATATTTTAGTGTTCAATTGGTGTCAATAGTTACGATGCTGTTGATTGATGTTATTGAGTTTTGTTTC CTGCTTTGTTTTCGTTACAGATATCACGAAAGAGGCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAGCTGCACCGTCAC CTGAATCCGCGAGGTAAAATCATGTTTGATGGATTATCCTTGTTTTGTGAAATGAGATCGGATTTCTGTTAATGGACCTG GTTCGTATTGATTTATACATTTGAATTATTATGATTTGGTACTAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAAC CAGAAGCAGATCAGTCACATAAGGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGA GCTGATGCAGAACTTGTTTTAAATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGA TTGTCTTCATGTATGTGCATGCTTTCTTGACTCTACTCAATAAGTTGTTTAAACATTGGTTCTAGCGATTGTGATTTGTA ATCATACTAAATTGGTAAAAGCTTACTTATTCTGGCTAATTCCTGTTAATACAGAAACTTATTGCGTATGACCATTTAGA GGGAGATCCTGGGTTAGATGGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTGTGCAGTTGTATCGACA ATTCATCACCTGACAGGTATGCAAATCACTTCATATAGGCAACCTGACTAGATATGTGTTTCTTGTCACACCTATTCATT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0318600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTATCCTTGTTTTGTGAATGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAACCAGAAGCAGATCAGTCACATAA GGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGAGCTGATGCAGAACTTGTTTTAA ATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGATTGTCTTCATAAACTTATTGCG TATGACCATTTAGAGGGAGATCCTGGGTTAGATGGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTGTG CAGTTGTATCGACAATTCATCACCTGACAGTACTATTCTCCAAGTGCTGAAGGTACTTCTTACTGCTGTAGCTTCTGCAA AATTCCGAGTACATGGCGAACCTTTGTTGGGAGTTATCAGAGTATGCTATAATATTGCTCTGAATAGCAAGAGTCCTATA AACCAAGCAACATCAAAGGCAATGCTGACCCAGATGATCAGCATCGTTTTCAGGAGAATGGAAACTAATCCCGTTGAAAC TTCATCTGGTTCTGGTGGACACACAATTACAAAAGCTGCTTCAACAGAGAATTTAAACACAAAATCTGATGAAACTTCTG TGGGAGAGTCAAATGAAAAAGAAATGACTTTAGGTGATGCACTTAGTCAAGCCAAGGATGCATCCCCAACATCTCTTGAG GAACTTCAAAATCTTGCCGGGGGTGCTGATATCAAGGGCCTTGAAGCTGTACTCGACAAGGCTGTGCATACCGAAGATGG TAAAAAAATAACACGTGGGATTGATTTGGAGAGCATGAGTATAGGACAACGTGACGCTTTGCTGGTGTTCCGAACTCTCT GCAAGATGGGTATGAAGGAAGATAACGATGAAGTTACAACCAAGACAAGGATTTTGTCCCTTGAGCTTCTGCAGGGTTTG TTGGAGGGAGTTAGCCACTCATTTACAAAGAACTTCCATTTTATCGATTCAGTGAAGGCGTATCTTTCATATGCATTGTT GCGAGCTTCAGTTTCACAATCCCCTGTCATATTTCAGTATGCAACTGGAGTATTCTTGGTGCTCTTATTGCGATTCAGGG AGAGTCTCAAAGGTGAAATATGCATCTTCTTTCCGTTGATAGTTCTTAGACCACTGGATGGATTAGAATTTTCTGTCAAC CAAAAACTTAGTGTTCTTCGGATGCTAGAGAAAGTATGTAAGGATCCACAGCTGCTTGTTGACATCTTTGTGAATTATGA CTGTGATCTTGAGGCGCCAAACTTGTTTGAACGAATGGTTACAACTCTGTCCAGAATAGCACAAGGGACTCAAAATACTG ATCCGAATTCAGCTGCTGTTTCTCAAACTGCTTCAGTTAAAGGTTCATCACTTCAAGGCCTTGTGAGTGTGCTTAAATCA TTGGTTGACTGGGAACAATCACATCGGGAGCTGATAAAGTTAAAGAGTGATCAGCAAGAAGGGGTTTCAGCTGAAGATTC TCTTGAAGTAAGATCCAGGGAGGATGTAACTAGTGATTTTGAGAAGGCTAAGGCTCATAAGTCAACATTGGAGGCTGCCA TTGCTGAGTTCAACAGGAAGCCAATGAAAGGGGTGGAGTATCTAATATCAAATAAGTTGGTGGAAAACACACCTGCTTCA GTCGCTCAATTTTTGAAAAACACCCCAAATTTGGATAAGGCTACCATTGGTGACTATTTAGGCCAACATGAAGAGTTCCC CCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTAGATTCCATGAAATTTTCTGGGATGAAATTTCATACTGCAATCAGGGAGTTTCTTA AAGGGTTCCGACTTCCTGGGGAAGCTCAAAAGATAGATCGAATCATGGAAAAATTTGCAGAGAGATACTGTGCAGACAAT CCAGGCCTTTTTAAAAATGCAGATACAGCATACGTTCTTGCTTATGCTGTCATTATGTTAAATACTGACGCTCATAACCC AATGGTATGGCCTAAGATGTCCAAGTCAGATTTTGTTCGTATGAATGCTAGAGATGATCCAGATGAATGTGCGCCTAGGG AACTACTGGAAGAGATCTATGATTCCATTGTTAAAGAAGAGATTAAAATGAAAGATGACACATCTTTTCTGGGAAAAAGC AGCAGACAGAAATCAGAAGGTGAAGAAGGACGCCTTGTCAGTATTCTTAACCTGGCACTCCCCAAAAGTAAGTCAGCAGG AGATGCCAAGTCTGAAAGTGAGGCTATCATTAAGAAAACACAAGCTATATTCAGGAATCAAGGGGTGAAACGAGGAGTTT TCTACACTGCCCAACAGATTGAACTTGTAAGGCCCATGGTAGATGCTGTTGGGTGGGCTCTGCTTGCTACTTTCTCTGTA ACTATGGAGGAAGGTGAGAATAAGCCTCGTGTTGTTCTGTTGATGGAGGGTTTTAGAGCTGGAATACACATCACATTTGT ACTTGGAATGGATACCATGCGCTATGCATTTTTAACATCTCTGGTCAGGTTCACTTTCCTGCATGCCCCAAGGGAAATGC GTAGTAAAAATGTGGAAGCTTTACGGACACTGTTGGTTCTTTGTGACTCAGACATGAACGCCCTTCAAGACACATGGAAT GCAGTTCTAGAATGTGTTTCTCGCCTTGAATTTATAACAACAACTCCTGCAATTGCTGCCACTGTCATGCATGGATCAAA TCAAATCTCCAAGGATTCTGTTGTTCAATCTCTGAGAGAGTTATCTGGGAAACCTGCTGAACAAGTTTTCATGAATAGTG TTAAACTACCTAGTGATTCAGTTGTGGAATTCTTCACGGCTCTCTGTGGTGTATCTGCTGAGGAGCTAAAACAAACCCCA GCTCGTGTTTTCAGCTTGCAAAAGCTTGTTGAAATTAGCTATTACAATATGGCTCGTATACGTATGGTCTGGGCCAGAAT CTGGTCTGTTCTAGCAAATCACTTTATATCAGCTGGGAGTCATCATGATGAAAAAATTGCTATGTATGCCATAGATTCTC TAAGACAACTTGGTATGAAGTATTTGGAGCGTGATGAGCTGGCCAATTTTACTTTCCAAAACGATATTCTCAAACCATTT GTTGTTCTTATGCGGAATAGTCAAAGTGAATCCAAAAGGAGACTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGATGATAAAATCTAA GGTTGGGAGCATTAAGTCTGGGTGGCGTAGTGTATTTATGATTTTTACGGCTGCTGCAGATGATGAACTAGAATCAATTG TTGAGAGTGCATTTGAAAATGTTGAGCAGGTCATCTTAGAACACTTTGATCAAGTAGCGGGAGACTGTTTCTTGGATTGC GTAAATTGTCTCATCAGGTTTGCCAACAATAAAACATCACATCGAATTAGTTTGAAGGCTATTGCACTCTTGCGGATCTG TGAGGACCGTCTTGCAGAGGGCCTTATTCCTGGAGGCACTTTGATGCCTATTGATGCTACATTGGATGCGACTTTGGATG TAACTGAGCATTATTGGTTCCCAATGCTGGCTGGTTTATCTGATCTGACATCAGATCATAGACCAGAGGTCAGAAGTTGT GCACTTGAAGTCTTATTTGATTTATTGAATGAAAGAGGTAGCAAGTTCTCTACACCATTTTGGGAGAATATTTTCCATCG AGTCTTATTTCCAATTTTTGATCATGTGAGACATGCTGGAAAAGAGAGCTTTATTTCTACTGATGATGATTGGTTTCGTG AAACAAGCATACATTCGCTTCAGTTGCTTTGCAACCTTTTCAACACATTCTATAAGGAGGTTTGTTTTATGCTGCCGCCA TTGCTGAGTTTGCTTTTAGATTGTGCCAAAAAGACAGATCAAACTGTGGTCTCAATATCTCTCGGTGCGTTGGTGCATCT AATTGAAGTAGGTGGTCATCAATTTAGTGAAAGTGACTGGGACATGCTACTTAAAAGCATAAGAGATGCTGGATACACAA CGCAACCTTTAGAGTTGCTTAATACTTTGAGTGTTGAAAATATCAGAAACCATGGGGGCATTGTTAGGGATTCTGAGGAC AATGCAGATGACAGTGTTACCATTAAGTCTACTGACAGAGAGGTAGTGAGTGACCATCAACATGAGGTCAACAGTAATGG GAACTTATCCCCACTTGCATCCTCAAATGCAAATGCTGATGGAGTTGAAGATTCAGTATCACAGACAAATATAGATCAGT CTGAAGGCCTTCCATCTCCATCAGGAAGAACTCCCAAGGCTGCAGATGGAGGAGGCCTCCAACGGAGTCAAACCTTAGGT CAGCGGATTATGGAAAATATCTTCCTTCGGAATCTTACTTCAAAATCTAAAGGCCGTGTATCTGATGCTTCACAACCATC TTCCCCAGTAACGGTTATTGATACCGTAGAGCCTGATACCAAGAATGAAGAGAGTCCTTTGCTAGCAGCTATCAGGGGAA AGTGCATCACCCAATTATTGCTCCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGAAGAAATATTGGACAATGTTAAAAGCGCAACAG AAGATTGCTGTAATGGACACTTTGTTGTCTTTGTTGGAGTTTGCTGCTTCATTTAACTCATCCACCAATCTAAGAACTCG CATGCACCAAATTCCTGATGAAAGGCCACCTATAAATCTTCTTCGTCAGGAACTAGCTGGTACTGGCATATATCTGGACA TCTTACAGAAGTCAACTTGTGGGTTTGAAACAAAGAAAGAAAAAAGTCCAGATTCAGTTGGATTTCAAGATGTTGATTCT AGGGAAGACAATGGCTCGAGTATTAAACATTCTGACGCGGAAGAGAAATTTGAAAGGGTAGCTGAGGAGAAACTGGTGTC TTTCTGTGAACAGGTGCTCAGGGAGGCATCTGACCTCCAGTCTAGTACTGGAGAAACCACTAACATGGATATTCATCGTG TCTTGGAACTTCGTGCTCCTATTATTATCAAGGTGATCCAAAGCATGTGTTCTATGAACAGTAAGATTTTCAGAAGACAC CTAAGAGAACTCTATCCTTTGCTAACTAAACTTGTTTGCTGTGACCAGATGGATGTTCGAGGAGCTCTTGGTGATTTGTT TCAATCACAACTGAAAGCTCTTTTACCATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0318600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDYPCFVNANETEDGAVTKPEADQSHKAYSGNITVILANAGNALEGADAELVLNPLRLAFETKSLKILEPALDCLHKLIA YDHLEGDPGLDGGKNVPLFTDILNMVCSCIDNSSPDSTILQVLKVLLTAVASAKFRVHGEPLLGVIRVCYNIALNSKSPI NQATSKAMLTQMISIVFRRMETNPVETSSGSGGHTITKAASTENLNTKSDETSVGESNEKEMTLGDALSQAKDASPTSLE ELQNLAGGADIKGLEAVLDKAVHTEDGKKITRGIDLESMSIGQRDALLVFRTLCKMGMKEDNDEVTTKTRILSLELLQGL LEGVSHSFTKNFHFIDSVKAYLSYALLRASVSQSPVIFQYATGVFLVLLLRFRESLKGEICIFFPLIVLRPLDGLEFSVN QKLSVLRMLEKVCKDPQLLVDIFVNYDCDLEAPNLFERMVTTLSRIAQGTQNTDPNSAAVSQTASVKGSSLQGLVSVLKS LVDWEQSHRELIKLKSDQQEGVSAEDSLEVRSREDVTSDFEKAKAHKSTLEAAIAEFNRKPMKGVEYLISNKLVENTPAS VAQFLKNTPNLDKATIGDYLGQHEEFPLAVMHAYVDSMKFSGMKFHTAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADN PGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTDAHNPMVWPKMSKSDFVRMNARDDPDECAPRELLEEIYDSIVKEEIKMKDDTSFLGKS SRQKSEGEEGRLVSILNLALPKSKSAGDAKSESEAIIKKTQAIFRNQGVKRGVFYTAQQIELVRPMVDAVGWALLATFSV TMEEGENKPRVVLLMEGFRAGIHITFVLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPREMRSKNVEALRTLLVLCDSDMNALQDTWN AVLECVSRLEFITTTPAIAATVMHGSNQISKDSVVQSLRELSGKPAEQVFMNSVKLPSDSVVEFFTALCGVSAEELKQTP ARVFSLQKLVEISYYNMARIRMVWARIWSVLANHFISAGSHHDEKIAMYAIDSLRQLGMKYLERDELANFTFQNDILKPF VVLMRNSQSESKRRLIVDCIVQMIKSKVGSIKSGWRSVFMIFTAAADDELESIVESAFENVEQVILEHFDQVAGDCFLDC VNCLIRFANNKTSHRISLKAIALLRICEDRLAEGLIPGGTLMPIDATLDATLDVTEHYWFPMLAGLSDLTSDHRPEVRSC ALEVLFDLLNERGSKFSTPFWENIFHRVLFPIFDHVRHAGKESFISTDDDWFRETSIHSLQLLCNLFNTFYKEVCFMLPP LLSLLLDCAKKTDQTVVSISLGALVHLIEVGGHQFSESDWDMLLKSIRDAGYTTQPLELLNTLSVENIRNHGGIVRDSED NADDSVTIKSTDREVVSDHQHEVNSNGNLSPLASSNANADGVEDSVSQTNIDQSEGLPSPSGRTPKAADGGGLQRSQTLG QRIMENIFLRNLTSKSKGRVSDASQPSSPVTVIDTVEPDTKNEESPLLAAIRGKCITQLLLLGAIDGIQKKYWTMLKAQQ KIAVMDTLLSLLEFAASFNSSTNLRTRMHQIPDERPPINLLRQELAGTGIYLDILQKSTCGFETKKEKSPDSVGFQDVDS REDNGSSIKHSDAEEKFERVAEEKLVSFCEQVLREASDLQSSTGETTNMDIHRVLELRAPIIIKVIQSMCSMNSKIFRRH LRELYPLLTKLVCCDQMDVRGALGDLFQSQLKALLP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 22 | 1709 | 1688 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 22 | 1709 | 1688 | 0.0 | – | |
| Pfam | 49 | 182 | 134 | 6.7E-27 | ||
| MobiDBLite | 184 | 222 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 184 | 212 | 29 | - | – | |
| Pfam | 283 | 434 | 152 | 1.5E-37 | ||
| Gene3D | 510 | 600 | 91 | 4.3E-29 | – | |
| ProSiteProfiles | 519 | 706 | 188 | 42.61 | ||
| Coils | 520 | 540 | 21 | - | – | |
| SMART | 523 | 708 | 186 | 1.6E-83 | ||
| SUPERFAMILY | 523 | 713 | 191 | 7.59E-72 | ||
| CDD | 526 | 708 | 183 | 4.92157E-75 | ||
| Pfam | 527 | 708 | 182 | 3.0E-69 | ||
| Gene3D | 601 | 718 | 118 | 1.5E-46 | ||
| SUPERFAMILY | 860 | 1710 | 851 | 5.5E-23 | ||
| Pfam | 1020 | 1102 | 83 | 2.8E-26 | ||
| Pfam | 1174 | 1239 | 66 | 4.5E-7 | ||
| MobiDBLite | 1371 | 1436 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 1381 | 1420 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1584 | 1615 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with the GTPase ARF. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Regulation of ARF protein signal transduction | Any process that modulates the frequency, rate or extent of ARF protein signal transduction. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0318600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…