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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0318600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0318600.3 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT3G43300.3 HOPM interactor 7; Swiss-Prot: sp|F4IXW2|BIG5_ARATH Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SIY4|A0A0B2SIY4_GLYSO Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0318600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69604475..69621356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTGGTGGTGCCGCCGGTGGTTTTCTCACTCGAGCATTCGATTCTATGCTCAAGGAGTGTTCTGGCAAGAAGTTTCC TGAACTTCAGAAAGCTATTCAGAATTTCACAGGTTTTTAACCCTAGATCCCTCTTTCATTTCCTCAATCATCGCAATTTC AATCTGTATTTTGATATTTTAGTGTTCAATTGGTGTCAATAGTTACGATGCTGTTGATTGATGTTATTGAGTTTTGTTTC CTGCTTTGTTTTCGTTACAGATATCACGAAAGAGGCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAGCTGCACCGTCAC CTGAATCCGCGAGGTAAAATCATGTTTGATGGATTATCCTTGTTTTGTGAAATGAGATCGGATTTCTGTTAATGGACCTG GTTCGTATTGATTTATACATTTGAATTATTATGATTTGGTACTAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAAC CAGAAGCAGATCAGTCACATAAGGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGA GCTGATGCAGAACTTGTTTTAAATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGA TTGTCTTCATGTATGTGCATGCTTTCTTGACTCTACTCAATAAGTTGTTTAAACATTGGTTCTAGCGATTGTGATTTGTA ATCATACTAAATTGGTAAAAGCTTACTTATTCTGGCTAATTCCTGTTAATACAGAAACTTATTGCGTATGACCATTTAGA GGGAGATCCTGGGTTAGATGGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTGTGCAGTTGTATCGACA ATTCATCACCTGACAGGTATGCAAATCACTTCATATAGGCAACCTGACTAGATATGTGTTTCTTGTCACACCTATTCATT 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0318600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGGTGGTGCCGCCGGTGGTTTTCTCACTCGAGCATTCGATTCTATGCTCAAGGAGTGTTCTGGCAAGAAGTTTCC TGAACTTCAGAAAGCTATTCAGAATTTCACAGATATCACGAAAGAGGCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAG CTGCACCGTCACCTGAATCCGCGAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAACCAGAAGCAGATCAGTCACAT AAGGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGAGCTGATGCAGAACTTGTTTT AAATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGATTGTCTTCATAAACTTATTG CGTATGACCATTTAGAGGGAGATCCTGGGTTAGATGGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTG TGCAGTTGTATCGACAATTCATCACCTGACAGTACTATTCTCCAAGTGCTGAAGGTACTTCTTACTGCTGTAGCTTCTGC AAAATTCCGAGTACATGGCGAACCTTTGTTGGGAGTTATCAGAGTATGCTATAATATTGCTCTGAATAGCAAGAGTCCTA TAAACCAAGCAACATCAAAGGCAATGCTGACCCAGATGATCAGCATCGTTTTCAGGAGAATGGAAACTAATCCCGTTGAA ACTTCATCTGGTTCTGGTGGACACACAATTACAAAAGCTGCTTCAACAGAGAATTTAAACACAAAATCTGATGAAACTTC TGTGGGAGAGTCAAATGAAAAAGAAATGACTTTAGGTGATGCACTTAGTCAAGCCAAGGATGCATCCCCAACATCTCTTG AGGAACTTCAAAATCTTGCCGGGGGTGCTGATATCAAGGGCCTTGAAGCTGTACTCGACAAGGCTGTGCATACCGAAGAT GGTAAAAAAATAACACGTGGGATTGATTTGGAGAGCATGAGTATAGGACAACGTGACGCTTTGCTGGTGTTCCGAACTCT CTGCAAGATGGGTATGAAGGAAGATAACGATGAAGTTACAACCAAGACAAGGATTTTGTCCCTTGAGCTTCTGCAGGGTT TGTTGGAGGGAGTTAGCCACTCATTTACAAAGAACTTCCATTTTATCGATTCAGTGAAGGCGTATCTTTCATATGCATTG TTGCGAGCTTCAGTTTCACAATCCCCTGTCATATTTCAGTATGCAACTGGAGTATTCTTGGTGCTCTTATTGCGATTCAG GGAGAGTCTCAAAGGTGAAATATGCATCTTCTTTCCGTTGATAGTTCTTAGACCACTGGATGGATTAGAATTTTCTGTCA ACCAAAAACTTAGTGTTCTTCGGATGCTAGAGAAAGTATGTAAGGATCCACAGCTGCTTGTTGACATCTTTGTGAATTAT GACTGTGATCTTGAGGCGCCAAACTTGTTTGAACGAATGGTTACAACTCTGTCCAGAATAGCACAAGGGACTCAAAATAC TGATCCGAATTCAGCTGCTGTTTCTCAAACTGCTTCAGTTAAAGGTTCATCACTTCAAGGCCTTGTGAGTGTGCTTAAAT CATTGGTTGACTGGGAACAATCACATCGGGAGCTGATAAAGTTAAAGAGTGATCAGCAAGAAGGGGTTTCAGCTGAAGAT TCTCTTGAAGTAAGATCCAGGGAGGATGTAACTAGTGATTTTGAGAAGGCTAAGGCTCATAAGTCAACATTGGAGGCTGC CATTGCTGAGTTCAACAGGAAGCCAATGAAAGGGGTGGAGTATCTAATATCAAATAAGTTGGTGGAAAACACACCTGCTT CAGTCGCTCAATTTTTGAAAAACACCCCAAATTTGGATAAGGCTACCATTGGTGACTATTTAGGCCAACATGAAGAGTTC CCCCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTAGATTCCATGAAATTTTCTGGGATGAAATTTCATACTGCAATCAGGGAGTTTCT TAAAGGGTTCCGACTTCCTGGGGAAGCTCAAAAGATAGATCGAATCATGGAAAAATTTGCAGAGAGATACTGTGCAGACA ATCCAGGCCTTTTTAAAAATGCAGATACAGCATACGTTCTTGCTTATGCTGTCATTATGTTAAATACTGACGCTCATAAC CCAATGGTATGGCCTAAGATGTCCAAGTCAGATTTTGTTCGTATGAATGCTAGAGATGATCCAGATGAATGTGCGCCTAG GGAACTACTGGAAGAGATCTATGATTCCATTGTTAAAGAAGAGATTAAAATGAAAGATGACACATCTTTTCTGGGAAAAA GCAGCAGACAGAAATCAGAAGGTGAAGAAGGACGCCTTGTCAGTATTCTTAACCTGGCACTCCCCAAAAGTAAGTCAGCA GGAGATGCCAAGTCTGAAAGTGAGGCTATCATTAAGAAAACACAAGCTATATTCAGGAATCAAGGGGTGAAACGAGGAGT TTTCTACACTGCCCAACAGATTGAACTTGTAAGGCCCATGGTAGATGCTGTTGGGTGGGCTCTGCTTGCTACTTTCTCTG TAACTATGGAGGAAGGTGAGAATAAGCCTCGTGTTGTTCTGTTGATGGAGGGTTTTAGAGCTGGAATACACATCACATTT GTACTTGGAATGGATACCATGCGCTATGCATTTTTAACATCTCTGGTCAGGTTCACTTTCCTGCATGCCCCAAGGGAAAT GCGTAGTAAAAATGTGGAAGCTTTACGGACACTGTTGGTTCTTTGTGACTCAGACATGAACGCCCTTCAAGACACATGGA ATGCAGTTCTAGAATGTGTTTCTCGCCTTGAATTTATAACAACAACTCCTGCAATTGCTGCCACTGTCATGCATGGATCA AATCAAATCTCCAAGGATTCTGTTGTTCAATCTCTGAGAGAGTTATCTGGGAAACCTGCTGAACAAGTTTTCATGAATAG TGTTAAACTACCTAGTGATTCAGTTGTGGAATTCTTCACGGCTCTCTGTGGTGTATCTGCTGAGGAGCTAAAACAAACCC CAGCTCGTGTTTTCAGCTTGCAAAAGCTTGTTGAAATTAGCTATTACAATATGGCTCGTATACGTATGGTCTGGGCCAGA ATCTGGTCTGTTCTAGCAAATCACTTTATATCAGCTGGGAGTCATCATGATGAAAAAATTGCTATGTATGCCATAGATTC TCTAAGACAACTTGGTATGAAGTATTTGGAGCGTGATGAGCTGGCCAATTTTACTTTCCAAAACGATATTCTCAAACCAT TTGTTGTTCTTATGCGGAATAGTCAAAGTGAATCCAAAAGGAGACTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGATGATAAAATCT AAGGTTGGGAGCATTAAGTCTGGGTGGCGTAGTGTATTTATGATTTTTACGGCTGCTGCAGATGATGAACTAGAATCAAT TGTTGAGAGTGCATTTGAAAATGTTGAGCAGGTCATCTTAGAACACTTTGATCAAGTAGCGGGAGACTGTTTCTTGGATT GCGTAAATTGTCTCATCAGGTTTGCCAACAATAAAACATCACATCGAATTAGTTTGAAGGCTATTGCACTCTTGCGGATC TGTGAGGACCGTCTTGCAGAGGGCCTTATTCCTGGAGGCACTTTGATGCCTATTGATGCTACATTGGATGCGACTTTGGA TGTAACTGAGCATTATTGGTTCCCAATGCTGGCTGGTTTATCTGATCTGACATCAGATCATAGACCAGAGGTCAGAAGTT GTGCACTTGAAGTCTTATTTGATTTATTGAATGAAAGAGGTAGCAAGTTCTCTACACCATTTTGGGAGAATATTTTCCAT CGAGTCTTATTTCCAATTTTTGATCATGTGAGACATGCTGGAAAAGAGAGCTTTATTTCTACTGATGATGATTGGTTTCG TGAAACAAGCATACATTCGCTTCAGTTGCTTTGCAACCTTTTCAACACATTCTATAAGGAGGTTTGTTTTATGCTGCCGC CATTGCTGAGTTTGCTTTTAGATTGTGCCAAAAAGACAGATCAAACTGTGGTCTCAATATCTCTCGGTGCGTTGGTGCAT CTAATTGAAGTAGGTGGTCATCAATTTAGTGAAAGTGACTGGGACATGCTACTTAAAAGCATAAGAGATGCTGGATACAC AACGCAACCTTTAGAGTTGCTTAATACTTTGAGTGTTGAAAATATCAGAAACCATGGGGGCATTGTTAGGGATTCTGAGG ACAATGCAGATGACAGTGTTACCATTAAGTCTACTGACAGAGAGGTAGTGAGTGACCATCAACATGAGGTCAACAGTAAT GGGAACTTATCCCCACTTGCATCCTCAAATGCAAATGCTGATGGAGTTGAAGATTCAGTATCACAGACAAATATAGATCA GTCTGAAGGCCTTCCATCTCCATCAGGAAGAACTCCCAAGGCTGCAGATGGAGGAGGCCTCCAACGGAGTCAAACCTTAG GTCAGCGGATTATGGAAAATATCTTCCTTCGGAATCTTACTTCAAAATCTAAAGGCCGTGTATCTGATGCTTCACAACCA TCTTCCCCAGTAACGGTTATTGATACCGTAGAGCCTGATACCAAGAATGAAGAGAGTCCTTTGCTAGCAGCTATCAGGGG AAAGTGCATCACCCAATTATTGCTCCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGAAGAAATATTGGACAATGTTAAAAGCGCAAC AGAAGATTGCTGTAATGGACACTTTGTTGTCTTTGTTGGAGTTTGCTGCTTCATTTAACTCATCCACCAATCTAAGAACT CGCATGCACCAAATTCCTGATGAAAGGCCACCTATAAATCTTCTTCGTCAGGAACTAGCTGGTACTGGCATATATCTGGA CATCTTACAGAAGTCAACTTGTGGGTTTGAAACAAAGAAAGAAAAAAGTCCAGATTCAGTTGGATTTCAAGATGTTGATT CTAGGGAAGACAATGGCTCGAGTATTAAACATTCTGACGCGGAAGAGAAATTTGAAAGGGTAGCTGAGGAGAAACTGGTG TCTTTCTGTGAACAGGTGCTCAGGGAGGCATCTGACCTCCAGTCTAGTACTGGAGAAACCACTAACATGGATATTCATCG TGTCTTGGAACTTCGTGCTCCTATTATTATCAAGGTGATCCAAAGCATGTGTTCTATGAACAGTAAGATTTTCAGAAGAC ACCTAAGAGAACTCTATCCTTTGCTAACTAAACTTGTTTGCTGTGACCAGATGGATGTTCGAGGAGCTCTTGGTGATTTG TTTCAATCACAACTGAAAGCTCTTTTACCATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0318600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGGAAGGFLTRAFDSMLKECSGKKFPELQKAIQNFTDITKEASQRKQSEPNQAAPSPESASANETEDGAVTKPEADQSH KAYSGNITVILANAGNALEGADAELVLNPLRLAFETKSLKILEPALDCLHKLIAYDHLEGDPGLDGGKNVPLFTDILNMV CSCIDNSSPDSTILQVLKVLLTAVASAKFRVHGEPLLGVIRVCYNIALNSKSPINQATSKAMLTQMISIVFRRMETNPVE TSSGSGGHTITKAASTENLNTKSDETSVGESNEKEMTLGDALSQAKDASPTSLEELQNLAGGADIKGLEAVLDKAVHTED GKKITRGIDLESMSIGQRDALLVFRTLCKMGMKEDNDEVTTKTRILSLELLQGLLEGVSHSFTKNFHFIDSVKAYLSYAL LRASVSQSPVIFQYATGVFLVLLLRFRESLKGEICIFFPLIVLRPLDGLEFSVNQKLSVLRMLEKVCKDPQLLVDIFVNY DCDLEAPNLFERMVTTLSRIAQGTQNTDPNSAAVSQTASVKGSSLQGLVSVLKSLVDWEQSHRELIKLKSDQQEGVSAED SLEVRSREDVTSDFEKAKAHKSTLEAAIAEFNRKPMKGVEYLISNKLVENTPASVAQFLKNTPNLDKATIGDYLGQHEEF PLAVMHAYVDSMKFSGMKFHTAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADNPGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTDAHN PMVWPKMSKSDFVRMNARDDPDECAPRELLEEIYDSIVKEEIKMKDDTSFLGKSSRQKSEGEEGRLVSILNLALPKSKSA GDAKSESEAIIKKTQAIFRNQGVKRGVFYTAQQIELVRPMVDAVGWALLATFSVTMEEGENKPRVVLLMEGFRAGIHITF VLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPREMRSKNVEALRTLLVLCDSDMNALQDTWNAVLECVSRLEFITTTPAIAATVMHGS NQISKDSVVQSLRELSGKPAEQVFMNSVKLPSDSVVEFFTALCGVSAEELKQTPARVFSLQKLVEISYYNMARIRMVWAR IWSVLANHFISAGSHHDEKIAMYAIDSLRQLGMKYLERDELANFTFQNDILKPFVVLMRNSQSESKRRLIVDCIVQMIKS KVGSIKSGWRSVFMIFTAAADDELESIVESAFENVEQVILEHFDQVAGDCFLDCVNCLIRFANNKTSHRISLKAIALLRI CEDRLAEGLIPGGTLMPIDATLDATLDVTEHYWFPMLAGLSDLTSDHRPEVRSCALEVLFDLLNERGSKFSTPFWENIFH RVLFPIFDHVRHAGKESFISTDDDWFRETSIHSLQLLCNLFNTFYKEVCFMLPPLLSLLLDCAKKTDQTVVSISLGALVH LIEVGGHQFSESDWDMLLKSIRDAGYTTQPLELLNTLSVENIRNHGGIVRDSEDNADDSVTIKSTDREVVSDHQHEVNSN GNLSPLASSNANADGVEDSVSQTNIDQSEGLPSPSGRTPKAADGGGLQRSQTLGQRIMENIFLRNLTSKSKGRVSDASQP SSPVTVIDTVEPDTKNEESPLLAAIRGKCITQLLLLGAIDGIQKKYWTMLKAQQKIAVMDTLLSLLEFAASFNSSTNLRT RMHQIPDERPPINLLRQELAGTGIYLDILQKSTCGFETKKEKSPDSVGFQDVDSREDNGSSIKHSDAEEKFERVAEEKLV SFCEQVLREASDLQSSTGETTNMDIHRVLELRAPIIIKVIQSMCSMNSKIFRRHLRELYPLLTKLVCCDQMDVRGALGDL FQSQLKALLP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 4 | 1763 | 1760 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 1763 | 1760 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 37 | 67 | 31 | - | – | |
| MobiDBLite | 37 | 78 | 42 | - | – | |
| Pfam | 43 | 236 | 194 | 2.0E-27 | ||
| MobiDBLite | 238 | 266 | 29 | - | – | |
| MobiDBLite | 238 | 276 | 39 | - | – | |
| Pfam | 337 | 488 | 152 | 1.5E-37 | ||
| Gene3D | 564 | 654 | 91 | 4.5E-29 | – | |
| ProSiteProfiles | 573 | 760 | 188 | 42.61 | ||
| Coils | 574 | 594 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 577 | 767 | 191 | 7.85E-72 | ||
| SMART | 577 | 762 | 186 | 1.6E-83 | ||
| CDD | 580 | 762 | 183 | 4.35807E-75 | ||
| Pfam | 581 | 762 | 182 | 3.2E-69 | ||
| Gene3D | 655 | 772 | 118 | 1.6E-46 | ||
| SUPERFAMILY | 914 | 1764 | 851 | 6.02E-23 | ||
| Pfam | 1074 | 1156 | 83 | 2.9E-26 | ||
| Pfam | 1228 | 1293 | 66 | 4.6E-7 | ||
| MobiDBLite | 1425 | 1490 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 1435 | 1474 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1638 | 1669 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with the GTPase ARF. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Regulation of ARF protein signal transduction | Any process that modulates the frequency, rate or extent of ARF protein signal transduction. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0318600.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…