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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0318600 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0318600.5 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein; TAIR: AT3G43300.3 HOPM interactor 7; Swiss-Prot: sp|F4IXW2|BIG5_ARATH Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 5; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SIY4|A0A0B2SIY4_GLYSO Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0318600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:69604734..69621356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GATATCACGAAAGAGGCTAGCCAGAGAAAGCAGAGTGAGCCTAATCAAGCTGCACCGTCACCTGAATCCGCGAGGTAAAA TCATGTTTGATGGATTATCCTTGTTTTGTGAAATGAGATCGGATTTCTGTTAATGGACCTGGTTCGTATTGATTTATACA TTTGAATTATTATGATTTGGTACTAGTGCGAACGAAACTGAAGATGGAGCGGTAACTAAACCAGAAGCAGATCAGTCACA TAAGGCTTATAGTGGAAATATCACAGTTATCTTAGCTAATGCTGGGAATGCGCTCGAAGGAGCTGATGCAGAACTTGTTT TAAATCCGCTCCGTCTTGCATTCGAGACGAAGAGCTTGAAAATCCTAGAACCGGCTTTAGATTGTCTTCATGTATGTGCA TGCTTTCTTGACTCTACTCAATAAGTTGTTTAAACATTGGTTCTAGCGATTGTGATTTGTAATCATACTAAATTGGTAAA AGCTTACTTATTCTGGCTAATTCCTGTTAATACAGAAACTTATTGCGTATGACCATTTAGAGGGAGATCCTGGGTTAGAT GGTGGTAAAAATGTCCCATTGTTTACAGACATTTTAAACATGGTGTGCAGTTGTATCGACAATTCATCACCTGACAGGTA TGCAAATCACTTCATATAGGCAACCTGACTAGATATGTGTTTCTTGTCACACCTATTCATTTTTAAGAATCAATATGCAG TACTATTCTCCAAGTGCTGAAGGTACTTCTTACTGCTGTAGCTTCTGCAAAATTCCGAGGTATGTTTATTCTAACGGAAG TAAATTGATTCATCTATTATGTATGTCTGCTGATGTAATGTCTATATGTGGACATACAGTCTGTGGTCATATAGTGTCTA AGTTTCTGTACTAGGTATCTTGCAATTTGTTGTGCATGGTAAATCAATAACTTTTCTGTATGTGTAAATTATTAATGTGA 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CCAGATTTTGAATTCTGACAGCAACATGGATATAGATAGCTTCTGCACATTAAACTAAATAAGTAAATACTAGCAATACC CACTAAGACATGATAATTTGAAAATAATTATGATGTCAATGCCTCTAAAATATTGGATTCCATTAAAGAATTACTGTCGG AATTTTTTCTCTTTTCTTTTCTTGGGGGAGGGTGGATGCCTTCTATTGTGATAAACTGATAACCCCTTTGTTTTGATTAG ATGGATGTTCGAGGAGCTCTTGGTGATTTGTTTCAATCACAACTGAAAGCTCTTTTACCATAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0318600.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGTGCAGTTGTATCGACAATTCATCACCTGACAGTACTATTCTCCAAGTGCTGAAGGTACTTCTTACTGCTGTAGC TTCTGCAAAATTCCGAGTACATGGCGAACCTTTGTTGGGAGTTATCAGAGTATGCTATAATATTGCTCTGAATAGCAAGA GTCCTATAAACCAAGCAACATCAAAGGCAATGCTGACCCAGATGATCAGCATCGTTTTCAGGAGAATGGAAACTAATCCC GTTGAAACTTCATCTGGTTCTGGTGGACACACAATTACAAAAGCTGCTTCAACAGAGAATTTAAACACAAAATCTGATGA AACTTCTGTGGGAGAGTCAAATGAAAAAGAAATGACTTTAGGTGATGCACTTAGTCAAGCCAAGGATGCATCCCCAACAT CTCTTGAGGAACTTCAAAATCTTGCCGGGGGTGCTGATATCAAGGGCCTTGAAGCTGTACTCGACAAGGCTGTGCATACC GAAGATGGTAAAAAAATAACACGTGGGATTGATTTGGAGAGCATGAGTATAGGACAACGTGACGCTTTGCTGGTGTTCCG AACTCTCTGCAAGATGGGTATGAAGGAAGATAACGATGAAGTTACAACCAAGACAAGGATTTTGTCCCTTGAGCTTCTGC AGGGTTTGTTGGAGGGAGTTAGCCACTCATTTACAAAGAACTTCCATTTTATCGATTCAGTGAAGGCGTATCTTTCATAT GCATTGTTGCGAGCTTCAGTTTCACAATCCCCTGTCATATTTCAGTATGCAACTGGAGTATTCTTGGTGCTCTTATTGCG ATTCAGGGAGAGTCTCAAAGGTGAAATATGCATCTTCTTTCCGTTGATAGTTCTTAGACCACTGGATGGATTAGAATTTT CTGTCAACCAAAAACTTAGTGTTCTTCGGATGCTAGAGAAAGTATGTAAGGATCCACAGCTGCTTGTTGACATCTTTGTG AATTATGACTGTGATCTTGAGGCGCCAAACTTGTTTGAACGAATGGTTACAACTCTGTCCAGAATAGCACAAGGGACTCA AAATACTGATCCGAATTCAGCTGCTGTTTCTCAAACTGCTTCAGTTAAAGGTTCATCACTTCAAGGCCTTGTGAGTGTGC TTAAATCATTGGTTGACTGGGAACAATCACATCGGGAGCTGATAAAGTTAAAGAGTGATCAGCAAGAAGGGGTTTCAGCT GAAGATTCTCTTGAAGTAAGATCCAGGGAGGATGTAACTAGTGATTTTGAGAAGGCTAAGGCTCATAAGTCAACATTGGA GGCTGCCATTGCTGAGTTCAACAGGAAGCCAATGAAAGGGGTGGAGTATCTAATATCAAATAAGTTGGTGGAAAACACAC CTGCTTCAGTCGCTCAATTTTTGAAAAACACCCCAAATTTGGATAAGGCTACCATTGGTGACTATTTAGGCCAACATGAA GAGTTCCCCCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTAGATTCCATGAAATTTTCTGGGATGAAATTTCATACTGCAATCAGGGA GTTTCTTAAAGGGTTCCGACTTCCTGGGGAAGCTCAAAAGATAGATCGAATCATGGAAAAATTTGCAGAGAGATACTGTG CAGACAATCCAGGCCTTTTTAAAAATGCAGATACAGCATACGTTCTTGCTTATGCTGTCATTATGTTAAATACTGACGCT CATAACCCAATGGTATGGCCTAAGATGTCCAAGTCAGATTTTGTTCGTATGAATGCTAGAGATGATCCAGATGAATGTGC GCCTAGGGAACTACTGGAAGAGATCTATGATTCCATTGTTAAAGAAGAGATTAAAATGAAAGATGACACATCTTTTCTGG GAAAAAGCAGCAGACAGAAATCAGAAGGTGAAGAAGGACGCCTTGTCAGTATTCTTAACCTGGCACTCCCCAAAAGTAAG TCAGCAGGAGATGCCAAGTCTGAAAGTGAGGCTATCATTAAGAAAACACAAGCTATATTCAGGAATCAAGGGGTGAAACG AGGAGTTTTCTACACTGCCCAACAGATTGAACTTGTAAGGCCCATGGTAGATGCTGTTGGGTGGGCTCTGCTTGCTACTT TCTCTGTAACTATGGAGGAAGGTGAGAATAAGCCTCGTGTTGTTCTGTTGATGGAGGGTTTTAGAGCTGGAATACACATC ACATTTGTACTTGGAATGGATACCATGCGCTATGCATTTTTAACATCTCTGGTCAGGTTCACTTTCCTGCATGCCCCAAG GGAAATGCGTAGTAAAAATGTGGAAGCTTTACGGACACTGTTGGTTCTTTGTGACTCAGACATGAACGCCCTTCAAGACA CATGGAATGCAGTTCTAGAATGTGTTTCTCGCCTTGAATTTATAACAACAACTCCTGCAATTGCTGCCACTGTCATGCAT GGATCAAATCAAATCTCCAAGGATTCTGTTGTTCAATCTCTGAGAGAGTTATCTGGGAAACCTGCTGAACAAGTTTTCAT GAATAGTGTTAAACTACCTAGTGATTCAGTTGTGGAATTCTTCACGGCTCTCTGTGGTGTATCTGCTGAGGAGCTAAAAC AAACCCCAGCTCGTGTTTTCAGCTTGCAAAAGCTTGTTGAAATTAGCTATTACAATATGGCTCGTATACGTATGGTCTGG GCCAGAATCTGGTCTGTTCTAGCAAATCACTTTATATCAGCTGGGAGTCATCATGATGAAAAAATTGCTATGTATGCCAT AGATTCTCTAAGACAACTTGGTATGAAGTATTTGGAGCGTGATGAGCTGGCCAATTTTACTTTCCAAAACGATATTCTCA AACCATTTGTTGTTCTTATGCGGAATAGTCAAAGTGAATCCAAAAGGAGACTAATTGTTGATTGCATTGTTCAGATGATA AAATCTAAGGTTGGGAGCATTAAGTCTGGGTGGCGTAGTGTATTTATGATTTTTACGGCTGCTGCAGATGATGAACTAGA ATCAATTGTTGAGAGTGCATTTGAAAATGTTGAGCAGGTCATCTTAGAACACTTTGATCAAGTAGCGGGAGACTGTTTCT TGGATTGCGTAAATTGTCTCATCAGGTTTGCCAACAATAAAACATCACATCGAATTAGTTTGAAGGCTATTGCACTCTTG CGGATCTGTGAGGACCGTCTTGCAGAGGGCCTTATTCCTGGAGGCACTTTGATGCCTATTGATGCTACATTGGATGCGAC TTTGGATGTAACTGAGCATTATTGGTTCCCAATGCTGGCTGGTTTATCTGATCTGACATCAGATCATAGACCAGAGGTCA GAAGTTGTGCACTTGAAGTCTTATTTGATTTATTGAATGAAAGAGGTAGCAAGTTCTCTACACCATTTTGGGAGAATATT TTCCATCGAGTCTTATTTCCAATTTTTGATCATGTGAGACATGCTGGAAAAGAGAGCTTTATTTCTACTGATGATGATTG GTTTCGTGAAACAAGCATACATTCGCTTCAGTTGCTTTGCAACCTTTTCAACACATTCTATAAGGAGGTTTGTTTTATGC TGCCGCCATTGCTGAGTTTGCTTTTAGATTGTGCCAAAAAGACAGATCAAACTGTGGTCTCAATATCTCTCGGTGCGTTG GTGCATCTAATTGAAGTAGGTGGTCATCAATTTAGTGAAAGTGACTGGGACATGCTACTTAAAAGCATAAGAGATGCTGG ATACACAACGCAACCTTTAGAGTTGCTTAATACTTTGAGTGTTGAAAATATCAGAAACCATGGGGGCATTGTTAGGGATT CTGAGGACAATGCAGATGACAGTGTTACCATTAAGTCTACTGACAGAGAGGTAGTGAGTGACCATCAACATGAGGTCAAC AGTAATGGGAACTTATCCCCACTTGCATCCTCAAATGCAAATGCTGATGGAGTTGAAGATTCAGTATCACAGACAAATAT AGATCAGTCTGAAGGCCTTCCATCTCCATCAGGAAGAACTCCCAAGGCTGCAGATGGAGGAGGCCTCCAACGGAGTCAAA CCTTAGGTCAGCGGATTATGGAAAATATCTTCCTTCGGAATCTTACTTCAAAATCTAAAGGCCGTGTATCTGATGCTTCA CAACCATCTTCCCCAGTAACGGTTATTGATACCGTAGAGCCTGATACCAAGAATGAAGAGAGTCCTTTGCTAGCAGCTAT CAGGGGAAAGTGCATCACCCAATTATTGCTCCTTGGTGCAATTGATGGTATTCAGAAGAAATATTGGACAATGTTAAAAG CGCAACAGAAGATTGCTGTAATGGACACTTTGTTGTCTTTGTTGGAGTTTGCTGCTTCATTTAACTCATCCACCAATCTA AGAACTCGCATGCACCAAATTCCTGATGAAAGGCCACCTATAAATCTTCTTCGTCAGGAACTAGCTGGTACTGGCATATA TCTGGACATCTTACAGAAGTCAACTTGTGGGTTTGAAACAAAGAAAGAAAAAAGTCCAGATTCAGTTGGATTTCAAGATG TTGATTCTAGGGAAGACAATGGCTCGAGTATTAAACATTCTGACGCGGAAGAGAAATTTGAAAGGGTAGCTGAGGAGAAA CTGGTGTCTTTCTGTGAACAGGTGCTCAGGGAGGCATCTGACCTCCAGTCTAGTACTGGAGAAACCACTAACATGGATAT TCATCGTGTCTTGGAACTTCGTGCTCCTATTATTATCAAGGTGATCCAAAGCATGTGTTCTATGAACAGTAAGATTTTCA GAAGACACCTAAGAGAACTCTATCCTTTGCTAACTAAACTTGTTTGCTGTGACCAGATGGATGTTCGAGGAGCTCTTGGT GATTTGTTTCAATCACAACTGAAAGCTCTTTTACCATAG
Protein sequence (LotjaGi4g1v0318600.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVCSCIDNSSPDSTILQVLKVLLTAVASAKFRVHGEPLLGVIRVCYNIALNSKSPINQATSKAMLTQMISIVFRRMETNP VETSSGSGGHTITKAASTENLNTKSDETSVGESNEKEMTLGDALSQAKDASPTSLEELQNLAGGADIKGLEAVLDKAVHT EDGKKITRGIDLESMSIGQRDALLVFRTLCKMGMKEDNDEVTTKTRILSLELLQGLLEGVSHSFTKNFHFIDSVKAYLSY ALLRASVSQSPVIFQYATGVFLVLLLRFRESLKGEICIFFPLIVLRPLDGLEFSVNQKLSVLRMLEKVCKDPQLLVDIFV NYDCDLEAPNLFERMVTTLSRIAQGTQNTDPNSAAVSQTASVKGSSLQGLVSVLKSLVDWEQSHRELIKLKSDQQEGVSA EDSLEVRSREDVTSDFEKAKAHKSTLEAAIAEFNRKPMKGVEYLISNKLVENTPASVAQFLKNTPNLDKATIGDYLGQHE EFPLAVMHAYVDSMKFSGMKFHTAIREFLKGFRLPGEAQKIDRIMEKFAERYCADNPGLFKNADTAYVLAYAVIMLNTDA HNPMVWPKMSKSDFVRMNARDDPDECAPRELLEEIYDSIVKEEIKMKDDTSFLGKSSRQKSEGEEGRLVSILNLALPKSK SAGDAKSESEAIIKKTQAIFRNQGVKRGVFYTAQQIELVRPMVDAVGWALLATFSVTMEEGENKPRVVLLMEGFRAGIHI TFVLGMDTMRYAFLTSLVRFTFLHAPREMRSKNVEALRTLLVLCDSDMNALQDTWNAVLECVSRLEFITTTPAIAATVMH GSNQISKDSVVQSLRELSGKPAEQVFMNSVKLPSDSVVEFFTALCGVSAEELKQTPARVFSLQKLVEISYYNMARIRMVW ARIWSVLANHFISAGSHHDEKIAMYAIDSLRQLGMKYLERDELANFTFQNDILKPFVVLMRNSQSESKRRLIVDCIVQMI KSKVGSIKSGWRSVFMIFTAAADDELESIVESAFENVEQVILEHFDQVAGDCFLDCVNCLIRFANNKTSHRISLKAIALL RICEDRLAEGLIPGGTLMPIDATLDATLDVTEHYWFPMLAGLSDLTSDHRPEVRSCALEVLFDLLNERGSKFSTPFWENI FHRVLFPIFDHVRHAGKESFISTDDDWFRETSIHSLQLLCNLFNTFYKEVCFMLPPLLSLLLDCAKKTDQTVVSISLGAL VHLIEVGGHQFSESDWDMLLKSIRDAGYTTQPLELLNTLSVENIRNHGGIVRDSEDNADDSVTIKSTDREVVSDHQHEVN SNGNLSPLASSNANADGVEDSVSQTNIDQSEGLPSPSGRTPKAADGGGLQRSQTLGQRIMENIFLRNLTSKSKGRVSDAS QPSSPVTVIDTVEPDTKNEESPLLAAIRGKCITQLLLLGAIDGIQKKYWTMLKAQQKIAVMDTLLSLLEFAASFNSSTNL RTRMHQIPDERPPINLLRQELAGTGIYLDILQKSTCGFETKKEKSPDSVGFQDVDSREDNGSSIKHSDAEEKFERVAEEK LVSFCEQVLREASDLQSSTGETTNMDIHRVLELRAPIIIKVIQSMCSMNSKIFRRHLRELYPLLTKLVCCDQMDVRGALG DLFQSQLKALLP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1605 | 1605 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1605 | 1605 | 0.0 | – | |
| Pfam | 14 | 78 | 65 | 4.9E-14 | ||
| MobiDBLite | 80 | 118 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 80 | 108 | 29 | - | – | |
| Pfam | 179 | 330 | 152 | 1.3E-37 | ||
| Gene3D | 406 | 496 | 91 | 4.0E-29 | – | |
| ProSiteProfiles | 415 | 602 | 188 | 42.61 | ||
| Coils | 416 | 436 | 21 | - | – | |
| SMART | 419 | 604 | 186 | 1.6E-83 | ||
| SUPERFAMILY | 419 | 609 | 191 | 6.93E-72 | ||
| CDD | 422 | 604 | 183 | 4.63991E-75 | ||
| Pfam | 423 | 604 | 182 | 2.8E-69 | ||
| Gene3D | 497 | 614 | 118 | 1.4E-46 | ||
| SUPERFAMILY | 756 | 1606 | 851 | 4.71E-23 | ||
| Pfam | 916 | 998 | 83 | 2.6E-26 | ||
| Pfam | 1070 | 1135 | 66 | 4.1E-7 | ||
| MobiDBLite | 1267 | 1332 | 66 | - | – | |
| MobiDBLite | 1277 | 1316 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1480 | 1511 | 32 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity | Stimulates the exchange of guanyl nucleotides associated with the GTPase ARF. Under normal cellular physiological conditions, the concentration of GTP is higher than that of GDP, favoring the replacement of GDP by GTP in association with the GTPase. | ||
| Biological process | Regulation of ARF protein signal transduction | Any process that modulates the frequency, rate or extent of ARF protein signal transduction. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0318600.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…