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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0020800 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0020800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | p-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein, putative; TAIR: AT1G65780.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9HEH1|RENT1_NEUCR Regulator of nonsense transcripts 1 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2R102|A0A0B2R102_GLYSO TPR and ankyrin repeat-containing protein 1; Found in the gene: LotjaGi5g1v0020800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:3834178..3848253) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAACTTCATAAGTTGACCTGGTTTGTTCTCCAAAACTTCATAGATCAGGTTGAATTCACAACCTTAAGTAAAAGTTAA GGTTTTTAGATTCATTGAATAAATGATGTCTATTTATTCAATGAATCTAAAAAATTAAAATTTAACCGGAGGGTAGATGG TTGTTGTCAAAACTTAATCATCTAATTAAATGAATTTTGCTGTTAAAAAATAATAAACTCTTAAACTTTCTAAAAATAAA CGATTGAAAAAAATTCATATTCATACTCGTTCTGAAAAAAGTAAATTCATAGTGTACTCCTAAAATATATTTATGTAGTG CACCGTACAGCACCTCTTCATAGCGTTTTGATATATTTTTATTTTATTCAACGGTCGTGATTCGTTGATGGCAACAGTAT TATGCCTGTTTAATGCAAATACGTTGATAATTCGTTTTTGGCCCTAAAATATATGTAATTCGTTTTACCCCCAACATCTA TGGCACCGTCCACCGTCATCATCGCAGAACCTTCTGCTCCGGCGAACCCCCTCTGTCACCGTAGCAACCTCGGCCTACTC CCATCGAAAACCATATCACCACCGTGTTGAAACCCAGAGTGAGAGCGATAACGTACTCACTCTTCATCTTCTTCCGCTTC CAGATCTTGTCCTCTATGTGGATCGATGTTGCGCCAACGCTCCATAGCTCGGTGGCACGGCGCTGCTTCGCCCTCGAGAA TCTCTCCGGAGAATCTCGTATGTCGTGGCTGGAGAGGTCTTGTGAGAGGGTTTGATAGGGTTGAGGAACGGAGGATGCGA CGGCGGCGGCGGCTCTGCAAATGTAGGGTGGATAAAGGGTGTTCCTGGTAATTTCAAATGACTGTAGTAAGTCCTTTCTT ATAGTTTTCTAAACTTAAGGGCCAAATTTATAGATTAAACTTTCATGTTTATCGGTTTCTTTACCTGCTACAGCAGGTGA TTTTACACGTATAAGCAAAAGTAAAAAAAAACAAAAAATGATTAAAATCTTCAGAAGCACAGTGAAAATAAAAAAGACAC TGCTTACACCCCAAGTCTGAAAGTTCATTCATGCACACAACACACGTTGAAGCTTTTTGCAAATCCATTTCTTCTTCACT CTCTTTACTAAGCATTTTAAGGGTCTTTCTCAAAATGGGTTTTTGATCATCACTATTGAAAGCATTTTGGTTAGCAAACA TGAGTCGTGTTCCATCTTCAAGCACAACAAATGCTGATCCAGGCCTTACAGATTACATACTCTCTTGGTCCCTTGAAGAC ATTTGCAACGTTGATTTGTACAAAGACAAGGTTTGAAGTTTACTATACAGTATTGTGCTTGTTAAAGTTGAAACCTTTTC ACAATCAAATATATATTGTCACCCACAACAGTAGCAGCATATTTGCGTGTGTTTGGTTCATTGGGAAGGGACAAGTTATG ATTTTTTTATGGTGTTTCTACTAATACAAACATGCCAATAGCTTTGCTTCACCTCCAAATAAATTAGTGTTTGTAAAGTT GCATTTGGTTCTGTGGGAAGGGAAAAAGTTACCAACTTTGTATGATGTTTCTACTAATACCAACATGACATCAGTTTTGC TTCACCCCCATTTTTAAATAGCTTGTGAAATAGTGTTTGGTTCTGTGGGAAGGGGAAAGTTACAAACTTTGTATATTGTG TGGTTTGTAAAATTGCATTTGGTTCTGTGGGAAGGGGAAAGTTACAAACTTTGTAGGAAAGTTACAAACTTTGTATATTG TGTGGTTTGTAAATTTGCATTTGGTTCTGTGGAAGGGAAAAGTTACAGACTTTGTATGATGTTTCTACTAATACCATGCC ATTAGTTTGCTTCACCTCCATTATAATATACTGTGAAGTTACAAACTTTTGTATTGTCTGGTTTGGTGTGAAGGGAGAAG 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GGTCAGTGGCATAATGTTTGTGATAGGGAGAGACCCATCAGATTCTCGAACAGGGGCAGTTATTCAGTAATTTTATTAGT TGTTAAGTCAGTTTATTATTGTTAGGAGCAGTTTATTGTTGTTAGGAGCAGTTTATTGTTGTTAGGATGTTAAAAATAGG GAGTTTGAACCACATGGGGGATCATTCAAAAATTCTGTAGTTGTGGCTTTGGGTTTAGGGTGATTACTATGAATGCTTTT ATAAAATTCTTTGTTTATATTTTCTAGTAGTGATATTTTTCCTTCTTTTGCCTGGTCTGTAGTGTGGCTTGAGTCAAAAG AGAAGCTCAGTATAGGTGTAGTTTCTCCGTATGCTGCCCAAGTTGATGCTATTCAGGATGTACTTGGACAAAAGTATGAT AGGTATGAGGGATTTGATGTAAAGGTGAACACAATTGATGGCTTCCAGGGTGGAGAACAGGACATTATTATTTTATCAAC TGTGAGAACTAATGCCAGTGCGTCACTTAAGTTCATCTCCAATCACCAGAGGATTAATGTTTCTCTTACAAGGGCAAGGT AGAACTTAAGTTTGTATTTGATTTTGTTCATCCCCATTCCCCAGTCACATGAGGACTAATATTTCTCTTACAAAGGCAAA AGACCTATACAATAATGCTGGTGTTTGGATATTCAACAGGCACAACTTGTGGATTTTGGGAAATGAAAGGACCCTAGTAA GTCTGGAAAATGTTTGGAAAGATTTGGTCCTTGATGCAAAAAAGCGTGAATGTTTCTTTAATGCTGATGAAGACAAAGAT TTGGAAGAAAGCATTTTGGATGCCATGAAAGAGCTAAAACAACTTGATGACTTGCTTAATCCAGATAGTGTAATTTTCAG AAATTCCATGTGGAAGGTACTTGGATTATAAATCTTGTAAATTTACTTATTTATCATGTTCTTGATATCCTAATCATCTA 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TAGACTATGTCAGGCGGTAAAACATCATGTTGCTCGATTGATAAGGTGTGCAACCCCTACTTCAAACTATCTTTTTTTCT TTGTTTCTTTATTTCTTTCCATGTTTCTTTTTCAATATAAATAACATGAAAAATATTGTTTGAATTAGGCACGAGCTGGC TAAATTTGGAATAATCTCCTTTATAGTCTATCTTACCATTATTTGTCTGTGTGTATATATTTGACTTTTTGATGTGCTTC GGATTTATTAAAACTGAATAATATAATTATCATTGTATTTTATACATATCTTCAAACTATAATAGAACTTGTTGAAAGAT TTTTGTTATATTTCTATGTCCTTTTTTTACGCATTGATTGTGGAATTTGTTTTCATCAGGATAGAGAACTATTGTGAAAG TGGGAGTTCTGTAAAGCGTATGACTATATTGATGTGATGTTTAGCGAAAGACTATTCCAAGAAATGTTGTAGTTCTGTAA AAATACTATTTTCTATTTTTTTGTTATTTTTATAAAAATTAGTAGGCATCAATAAGCTTTTATTTGTATGAATAGCTTTA CAGATTGTTTTGTTTTCCCTATGGACGGAAGGTGGAATCAATAAACATGGTAAGTTCATGTGCTCATTTTTTCGTGTATG CTTTAATAGAGTTGTGTTGTTAGACTTTGATTTAATATTTTTTCTTATACTAATATTTTTTCTGTGAACACTTGATCAAA AGATTACGCACAAATTTGTGAAGTTATTTGGTTGTCAGATGCTATCTTTACTTCCTAATTTCTTTAACAAAGGCTAAAAA TGTATTCTGGACAAAGAATTCTATTATGTAACAGTTACTTATCTTTTTATTTCTATGTGTGTTCTTTCATTTTAATTTCT GTATAATTCTTTTGATCACTAAATATTTATTCTTAAATTTATGTTTTATTTCTTCTTATCACTGTTTTGGATAGGCTACT TTCATGGTAGTGTTTTTTTTACATCTAATTTGTTGATCAGTATTTAGACTCTGCTTGATTTTTAATTGATGAAATTGTCT AATATTTATTGATCTTCACCCCTGATAAGATAATATTAATAACTGCTTAATTTTTTACCCATAAATTGGTGTATCCAAAG TGAACTGCATGGTAATTCTTCCATGAGATAATAATTTTCATGTTGTTTCAGTTTTAGAAATTATGCAATGGTGTTGAAGT TACACTACTTTGAGTCTTTAATTCTAGTAATCATTATAGTATAACGTGAGCAAGTCTGTTGAATACTTGAAATAATTTGA TTCTCGTGTACTTTCACTTATTGGATTGATATCTGAGATTAATAGATCACGTTTTGTATGCAGATCCATATGTGGTAGCA ATGTCTCTGCTGAAAGTAGTCCTATTGAGGAAGATGTTGTTGATGTTGATACATCAATTCAGTTTAAGAATATACCAGAT TCTTTTATTAATCTTCCAGCCAACTCATACCCACTTGTGATAACATTTCAGAAGTTTCTAATGATGTTTGATGGGACTTT GGGGAATTCATATTTTGAAAGATTTAGTGACCTATGTTCTCATTCCCCAAACATTGGTGTAAAATCTGCTGCTTTAGAGA CCTTCATAAGGAAGAAGGAGGTGACTTATGACAGGTTTGATTCATTATATTGGCCACGTTTCAATTCCCTATATACTAGA ACACTAGATCCATCTAGAGTGTTCTCTGAAATCATGTCTCATATAAAAGGGGGTATGCAAGCACTTGAGCATGATGACTG TAAGCTAAGTCGTGAGAGTTATGTTTCCTTATCTGAAAACCGAGTATCAAGTTTGAGCAAACACAAAAGAGAGATGATAT ATAATATTTACCAAAGTTATGAAAATATGAAGATGGTCCGAGGGGATTTTGATTTGGCTGATATTGTAGCTGATCTTCAT CTTAGACTCAGAACTAAAAGATATGAGGGTGATGAGCTTCATTTTGTATATATTGATGAGGTGCAGGATCTAACCATGAG CCAAATTGCTTTGTTTAAGTATGTATGCTCAAATGTAGCAGAGGGTTTTGTTTTCTGCGGGGATACTGCACAAACAATAG CAAGGGGAATTGATTTTAGATTCCAGGATATAAAATCTCTCTTTTACAACAAGTTTGTTCTGGAATCCAGGAAAAGTTCA TATAATCAGGGAAATGAAAAAGGACTAGTTTCAGATACTTTTTTATTGAATCAAAACTTTCGGACTCATGCTGGAGTGCT GAAATTATCCCAGAGCATTATTAAGCTTCTTTCTCATTTTTTTCCTCATTCTATTGATGCTCTGAAGCCTGAGACCAGCT TCATTTATGGGGAAGCACCAGTTGTTCTTGAATGTGGAAATAGGGAAAATGCAATTGTAACTATTTTTGGAAATAGTGGA AATGTGGATGGGAAAGTTGTTGGCTTTGGAGCAGAGCAAGTAATTTTGGTGCGTGATGATTCGGCGCGGAAGGAAATTTT AAAGTATGTAGGGAAACAAGCTCTTGTTCTAACCATTTTAGAGTGCAAAGGCCTCGAGTTTCAGGTTGTTAAAAGATCAT GATATCTAATTTATATTCTGTTATTCTTTATGTCTTTTTTGTGATGGTATTCATTGTTCTTTCCCAGGATGTGTTGCTCT ACAACTTTTTTGGCGCTTCACCTTTGAAAAATCGCTGGAGGGTGATTTATGAGTACAGGACTGAAGAAGATATGCTGGAA CCTGCAGAATCAAAGTCTTATTCAAGTTTCAGTGATTCCAAACACAATATTTTGTGCTCTGAACTCAAGCAGCTTTATGT TTCAATAACTCGTACAAGACAGAGATTGTGGATATGTGAGAATACAGATGAGTTCTCAAAACCTATGTTTGACTATTGGA AAAAGAAGGGTCTTGTACAAATCAAAGAACTGGATGATTCTCTTGCCCAGGCAATGAAAGTTGCAAGTTGTCCAGAAGAA TGGAAGTCACATGGCAAAAAGGTTGCTTTGCTTCCATAATCAACTATTATTTTCGTTATGATTTCATAGTACTGAATTAA ATTAGTTTATCCTACACTTTTTACTTTAGCTCGAAGTCTAGTTCAATGATGATACATCGGGTTCTTATTATAGTTTGATT TGCAACTTACAATATATGTGTACCTCAGATTACATTATGCTATATTATCTATGGAATATGGATCCCTTCTATCTATCTAC TTTTTCCCTCTAAATGACACATTATCATTTTGACCCCTTCTTTGCAGCTATATTATCAAAATAACTTTGAAATGGCGACA ATGTGTTTTGAAAGAGCAGGAGACTCTTATTGGGAGAAAAAGTCTAAAGCTGCTGGTCTTTGGACAACTGCAAAACGTTT GCTTGATGAGGATGCAAATGCAATCCTTAGAGAAGCGGCTAAAATTTTTGAAGACATAGGAATGGCGAATTCTGCTGCCC AATGTTTTTCTGATTTAGGAGAATTTGAAAGTGCTGGTATGAACTTGAGCTTTGGTACCTAAGTGTTAAATTTTGTGTTA TTTGATAATAAATATTTAGTAGCATTAGAGCTTTATATATGTGTCTATTAGGTATTAAGAAATCATTTTACAACACAAAA AACAAGTTTATCTTGAACGGTAATATCCTGTGTTCATTGGCTGAGGTTACCCAGGCTGTAGACTGGAACTTGCTCAACCA CAGTGAATAAGGAAGAATGCTTTTGTTTTGTTCTTTTGCTAATGAGTATTTCTTATCCTCTTTTTTATTTGTCTTCATAA ATTTAACTATTTAGGGATAATAGGATCTCATCATGTCCCTTTTAAGAAAATATAAACAGAACTGGCGCCTGATAAGACTT TGGATGAAGTAGTTTTAAAATTAGTTAGGTTGTTAAAGTTGTAACTGCAGGGCTTTAGTTGAATTAGTTAGAGAGGGGAA GAAAAAGGGAAATTCTGAATTTTTAGTGTATAAGATTGTAGAGAGGGGAAGCTCCTGAAATAAAAAATCTCTTCTTTTCT GTTAGTGTTTTAGCCATCAATAACAGATTTCTGTTCATTCTTTCTCTCTTTACAAATTTCCTCTTTCTTGTGTTTATGCA CTCTTATATTAAGGGTAAATGTTGATGTTAGGAACTTGTACTATGTAAGTTCACTCTTGTTTCTGCTTTCAGGGAGGCTT TATTTGCAAACATGTGAAGAGCCTGATTTGAAAAGAGCAGGGGATTGCTTTGATTTAGCTGGATGTTATGAAGACGCAGC TGATGCTTATGCTAGAGGCAGTTTTTTCTCAGATTGTTTGGCGGTTTGTGCAAAAGGAAGATTGTTTGACATTGGCTTCT CTTACATTCAACATTGGAAACAAAACGAAAATGCTGACCATGGTATGGTTAAAAGTCTTGATCTCAACACAATAGAACAA AAATTCCTGGAAAGTTGTGCTCATCATAGTTATCTTGATCATAAAGATACCATTTCCATGATGAAATATGTTGGGTCTTT TCATACAATGGGTTCGAAGCGTGTCTTCTTACGATCATTGAATTTACTGGACGAGCTTCTTGTGTTAGAAGAGGAATCAG GGAACATTCTGGAGGCAGTAGACATTGCTATGCAGATGGGTGATATTCAACGTGAGGCTGGTCTTCTTGAAAAAGCTGGT AGATTCGAGGAAGCTTTTGAACTTCTGCTTTGCTATGTACTTGCAAATTCCCTGTGGTCTTCAGGTAGCAAAGGGTGGCC TGTAAAGAAGTTTGCACAGAAGGCTGAGCTTTTGGAAAGAGCATTATCATTTGCAAAGAAAGAGTCAGACAGCTTTTATC AGCTTGCATCTATGGAAGCTGAAGTATTATCAAATGATCATAATCACCTTTCTAAAACAATGATTCATTTGAAATCTTCC CGCGAGCATAAGAGTATCAGAGGTGAAATATTATGTTTGTGGCAACTTTTGGACGCCCATAGTCATCGGAACAGCTCTAA ATACGTTTGGCAAGGTAATGAGATTAATGATGTTGAGAGAATGATTTTGAAGGAGAATCAGGTTTCTGTGGAGACATTGT TTCATTGTTGGACAAGTTGGAAGGATAACATTGTTCATATATTGGAATGTCTTCCAAGTTTTGAATCCCAGAACACTTAT CAGCTTAGCAGTTATGGAAAATTTGCATTGAATTATTTGGGTGTTCGGAAGCTAACTTGTAATCTGAACGGGATTTACTC TTTGCTCGTCCCTGATGCTAACTGGGTTAGAAATTTGGGTGATACATATCTAAAGAAGAATGGAAGGCTAGTTTCTGTTG ATACTCATTCATTAGTTTCTTCTGCTAAGAGCTATTGGAGTTCAGAACTTCTTTCTGTCGGCATGACAGTTTTGCGCAAC CTTGAAGCACTATACAAGTTTTCAGTGGATAAAAACCTGTCTTATTTTGGGCAGTTTCAGACTCTGTTGCATATCTATGA AGTCTCAAAATTTCTTAGATCCAAATGTTCTATCCACAACCATAGTAACATGAAGACTTTGGAAAATTTTCGCAGACTTT CAATTGACCGTATATTTACGTACATGGTTCCCATGGACTGGGAAGAATCTATGGACACGGTCAGTAACATGAAGACTTTG GAAAATTTTCGCAGACTTTCAATTGACCGTATATTTACGTACATGGTTCCCATGGACTGGGAAGAATCTATGGACACGGT CTTTCTTAGGACCACTGGGGCTTTTCAGGATTTGGTGAAAGAGACCATCGACGAGAACATTGGGCTGAGAAAGAGGCTAA CCTTTGGTCAAATTGGAAGGGTGGCGTTGGCAGTTATGAGTCTTGGTAAAACTAGTCTGCAAAATGAAATGTATGAGAAA ATTTTGACCACAGTTGAAGGGAACAAACCCTGGGAAAATTTCATTCAGTGCTTGCAGCGGAGTTCAACTCAAGAAATTTC ACAAATAAATGATTCATTTGCTGAGCTGAATCCCATGTTTAGTCTTTATAAAGCTTTGGAGAATAATTTCAATGTGAGTC AGATAATGGAAATTGATTATCTATCTCCTACTTGTTTTATGTATCTGGTTGAACGGCTTCTGCTCTTTGTATCATGCCGG GATGGGTGCATGTTTGCTACTAAGTCATCTTTCATTGAATGGTTTATTTACGAGGATGAAAATTCACTTCCAAATTTGAG TTTAACTCCAGGTATGAAGGAAGCGCAAAGGTTCATTGCGCATGTCCTCATAGGGTTAATTTATAAGCCTCATAGTACCG ATAATTGGTTCAGGGAGTGTGACTCAGATGTGAGGAATCATGTACCTCGTTTTTTCCTGAGATTGGTTATGTCACTGTGC TTGCTTCACCTCAGCACAGGCGAGTATTCAGAGAAACTTCGCGATTGTTTGCAATTGAGAAGTATTAACTTTCTACTGCC AGTGGCATTTTGTGATGTTCTTAAGAAAGGAACGGGAGACCTGGGTTTAGACGCCATTGCTGAGGCCTTTAAAGAGGTGG GCAATGACTTGGTTATTGTCAAGGTAGACAACAGTTCTTCAGAAATTGTTTGTCCAGATGCTGAGTTTGTAGATTTCAAG GTCTGCCAGCGAAAAGAGCTCATATTGCGTAGGTTGCTTTTACATGGAATGGCGGGCGAATTTAGGAAACTTCTGTTGCT AAAGGACAGCTTGGAAGACTTCCTTTTAACAATGAATACGGAGTCGACTGATTCCTATGAGATGAAGGCCACAAGTTTAA AAGTAAGTCAAATGCTTTTTGCAGATTAAATACAAAGTTAAAATAGACTTCTATCATTTATTTTGTGTTCTTACTTCATT TTGTTTCTCTCTCAGGGTTTGTTGGTTCCCTGCATTAAGTTTATGACGAACTTATGTAGTGGCGGTTTACCTCTCGATCT CACACATCTGGATTACGATGGATACAAACTTGATATTGTGGAGAAGGAGAGCTTTCTTGATGAAATGAAACAATTTTCTT CCGCGTTGAATGTGAGAAATGAGACGTAAGTATAATAGTTAGAATACATTTCAAAAAAAAAAAGTATAATAGTTAGAATA GTTTTAATTTCTGTTTTATGGAATTGATTAATTTGGTCATGCACCTTGTTTTTTTATTCTTTTTCAGGGATTCAAAGACT GAAGAACTTGCTAAAACTATTCTTGCAAGATGTCCAAAAAGTAATCTCTTGCAAAATGTTTCAGAGGATTGCCATGGAAA GCAGAAGAAAAACAAACCTAGAAAGGGAGGGAGAAAGAGCAAGAAGTGAAGAAGACAATTTATTTGTTTTCCTGACTTGA ATTTGATGAAAAATATTTATGTGTATTTCATTCATAATACTTGACTAGACTACAATATATATAGACTAACAAAGAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0020800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTCGTGTTCCATCTTCAAGCACAACAAATGCTGATCCAGGCCTTACAGATTACATACTCTCTTGGTCCCTTGAAGA CATTTGCAACGTTGATTTGTACAAAGACAAGGTGAAATGTATTGATCTAAAATTCAAGTCTGTTGATCATTATTTTGGGT CCTATGTGTATCCATTATTGGAAGAAACTCGAACACAGTTGTGCTCGAGTATGGAAATGTTACAAAGTTTGCCTTTTGCC CAAGTAATTTCTCTTCAAGAGGCACCTGATAAGAGGAAGGGGTTGCTCTACAATGTTGGAATTGATAGATGGAGAAATAG GTCTCCTGGTCATGGAAGTGAAATGTATAAACCATTGACTGGGGATGTTTTTGTTATGGCTGATTTTAAGCCTGAAATTG TCAATGATTTACAAAGGTCGGGAAAGATGTGGACTTTAGTAGTGTCAGCTGGGGTTGTAGAGGAGGAGACCAAGGATGAT AATGCAGACCTTATGTCTTCTTTCAAAATTCTTTCATCTAAAGATATTGACCTCGATGAAGTAGGGCAGAAGTCCATGTT TATGATATTTTTGACAAATATAACCCCCAATAGAAGAATATGGGAAGCCTTGCATATGCCGCGAAATTCAAAGCTAATCC AGAAAATTTTATGTGCTGGTGATGTGGTTGAGAAAAATTGTGATTACTGCCATCTGCAGACTGATGCACTAAGCGATGAC GCAACATATCAAAAGTTATCATCTGATTTGAATGACTCCCAGAAACATGCAATTTCTGCTTGCCTTTCTTCCTCTCAATG CAATCATCATTCCACTGTGGATCTTATCTGGGGTCCCCCGGGAACTGGAAAAACAAAGACATTGGGCACTCTGCTTTTTG CCCTGCTGAAGATGAACTGTAGGACTCTTGTTTGCACACCCACTAATGTTGCCATTAAAGAAGTTGCATCTCGTGTCTTA AGCTTTGTGAGGTCATCCTTTGACAGAAATTCTCATGATTTCTTCTGTCCATTAGGAGACATACTTTTATTTGGGAATCA TGAGAAACTAAAAGTTGGGGAGGAAATCAAAGATATTTATTTGGACTATCGCGTCGAACAGCTTTCGATGTGCTTTAGAC CTCCTACTGGTTGGAGATATTGTTTTGGTTCAATGATTGATCTTCTTGAAAACTGTGTTTCACACTATCATAAATTCATT GAAAAGGAGTTGAGAATGAAACGAGCGAATTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0020800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSRVPSSSTTNADPGLTDYILSWSLEDICNVDLYKDKVKCIDLKFKSVDHYFGSYVYPLLEETRTQLCSSMEMLQSLPFA QVISLQEAPDKRKGLLYNVGIDRWRNRSPGHGSEMYKPLTGDVFVMADFKPEIVNDLQRSGKMWTLVVSAGVVEEETKDD NADLMSSFKILSSKDIDLDEVGQKSMFMIFLTNITPNRRIWEALHMPRNSKLIQKILCAGDVVEKNCDYCHLQTDALSDD ATYQKLSSDLNDSQKHAISACLSSSQCNHHSTVDLIWGPPGTGKTKTLGTLLFALLKMNCRTLVCTPTNVAIKEVASRVL SFVRSSFDRNSHDFFCPLGDILLFGNHEKLKVGEEIKDIYLDYRVEQLSMCFRPPTGWRYCFGSMIDLLENCVSHYHKFI EKELRMKRAN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 19 | 398 | 380 | 5.1E-159 | – | |
| PANTHER | 19 | 398 | 380 | 5.1E-159 | – | |
| Gene3D | 171 | 409 | 239 | 4.4E-27 | – | |
| SUPERFAMILY | 246 | 391 | 146 | 3.58E-18 | ||
| CDD | 250 | 334 | 85 | 1.30533E-14 | – | |
| Pfam | 250 | 369 | 120 | 3.0E-15 | ||
| Coils | 399 | 410 | 12 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0020800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…